Created
October 15, 2020 04:59
-
-
Save r-ryantm/6c9cc2af55b6b3b9f2291cd77cf58ec0 to your computer and use it in GitHub Desktop.
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
/nix/store/jprcwmpn8hcnh56fj4ssi7j2ydh8rvj1-deepTools-3.5.0 | |
├── bin | |
│ ├── alignmentSieve | |
│ ├── bamCompare | |
│ ├── bamCoverage | |
│ ├── bamPEFragmentSize | |
│ ├── bigwigCompare | |
│ ├── computeGCBias | |
│ ├── computeMatrix | |
│ ├── computeMatrixOperations | |
│ ├── correctGCBias | |
│ ├── deeptools | |
│ ├── estimateReadFiltering | |
│ ├── estimateScaleFactor | |
│ ├── multiBamSummary | |
│ ├── multiBigwigSummary | |
│ ├── plotCorrelation | |
│ ├── plotCoverage | |
│ ├── plotEnrichment | |
│ ├── plotFingerprint | |
│ ├── plotHeatmap | |
│ ├── plotPCA | |
│ └── plotProfile | |
├── lib | |
│ └── python3.8 | |
│ └── site-packages | |
│ ├── deeptools | |
│ │ ├── alignmentSieve.py | |
│ │ ├── bamCompare.py | |
│ │ ├── bamCoverage.py | |
│ │ ├── bamHandler.py | |
│ │ ├── bamPEFragmentSize.py | |
│ │ ├── bigwigCompare.py | |
│ │ ├── cm.py | |
│ │ ├── computeGCBias.py | |
│ │ ├── computeMatrixOperations.py | |
│ │ ├── computeMatrix.py | |
│ │ ├── correctGCBias.py | |
│ │ ├── correlation_heatmap.py | |
│ │ ├── correlation.py | |
│ │ ├── countReadsPerBin.py | |
│ │ ├── deepBlue.py | |
│ │ ├── deeptools_list_tools.py | |
│ │ ├── estimateReadFiltering.py | |
│ │ ├── getFragmentAndReadSize.py | |
│ │ ├── getRatio.py | |
│ │ ├── getScaleFactor.py | |
│ │ ├── getScorePerBigWigBin.py | |
│ │ ├── heatmapper.py | |
│ │ ├── heatmapper_utilities.py | |
│ │ ├── __init__.py | |
│ │ ├── mapReduce.py | |
│ │ ├── misc.py | |
│ │ ├── multiBamSummary.py | |
│ │ ├── multiBigwigSummary.py | |
│ │ ├── parserCommon.py | |
│ │ ├── plotCorrelation.py | |
│ │ ├── plotCoverage.py | |
│ │ ├── plotEnrichment.py | |
│ │ ├── plotFingerprint.py | |
│ │ ├── plotHeatmap.py | |
│ │ ├── plotPCA.py | |
│ │ ├── plotProfile.py | |
│ │ ├── __pycache__ | |
│ │ │ ├── alignmentSieve.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── bamCompare.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── bamCoverage.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── bamHandler.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── bamPEFragmentSize.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── bigwigCompare.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── cm.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── computeGCBias.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── computeMatrix.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── computeMatrixOperations.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── correctGCBias.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── correlation.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── correlation_heatmap.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── countReadsPerBin.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── deepBlue.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── deeptools_list_tools.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── estimateReadFiltering.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── getFragmentAndReadSize.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── getRatio.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── getScaleFactor.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── getScorePerBigWigBin.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── heatmapper.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── heatmapper_utilities.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── __init__.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── mapReduce.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── misc.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── multiBamSummary.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── multiBigwigSummary.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── parserCommon.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── plotCorrelation.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── plotCoverage.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── plotEnrichment.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── plotFingerprint.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── plotHeatmap.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── plotPCA.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── plotProfile.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── SES_scaleFactor.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── sumCoveragePerBin.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── utilities.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── _version.cpython-38.pyc | |
│ │ │ ├── writeBedGraph_bam_and_bw.cpython-38.pyc | |
│ │ │ └── writeBedGraph.cpython-38.pyc | |
│ │ ├── SES_scaleFactor.py | |
│ │ ├── sumCoveragePerBin.py | |
│ │ ├── utilities.py | |
│ │ ├── _version.py | |
│ │ ├── writeBedGraph_bam_and_bw.py | |
│ │ └── writeBedGraph.py | |
│ └── deepTools-3.5.0.dist-info | |
│ ├── direct_url.json | |
│ ├── INSTALLER | |
│ ├── LICENSE.txt | |
│ ├── METADATA | |
│ ├── RECORD | |
│ ├── top_level.txt | |
│ ├── WHEEL | |
│ └── zip-safe | |
└── nix-support | |
└── propagated-build-inputs | |
8 directories, 114 files |
Sign up for free
to join this conversation on GitHub.
Already have an account?
Sign in to comment