Vou tentar explicar como o VSCode funciona e quais os prováveis motivos que podem gerar esse problema:
O VSCode funciona com um Typescript Server por trás, então independente da aplicação e do código que você está rodando ele vai passar por esse server para ser possível gerar esse IntelliSense, e sempre que você for rodar ele vai tentar pegar a lib de Tipagem para aquela lib, por exemplo, rodando uma aplicação Node com Express, esse Server vai tentar usar o @types/express
para gerar o IntelliSense dele.
E o primeiro problema pode ser com esse quesito, pois ele pode estar tentando pegar as tipagens das libs do seu projeto mas não está conseguindo encontrar, e isso você pode verificar reparando se sobre as libs que você faz import no projeto aparece um tracejado branco, e a mensagem de erro que apresenta quando você passa o mouse sobre ela diz que não conseguiu encontrar a tipagem. Para resolver isso tente executar o VSCode como Administrador, ou caso esteja no Linux tente dar permissão para o usuário ou pa