StackOverflow respuesta, agregar el package correspondiente

Alumno.java

package stackHelp;

public class Alumno implements Comparable<Alumno>{
	
	private int idAlumno;
	private String nombre;
	
	public Alumno(int idAlumno, String nombre) {
		super();
		this.idAlumno = idAlumno;
		this.nombre = nombre;
	}

	public int getIdAlumno() {
		return idAlumno;
	}

	public String getNombre() {
		return nombre;
	}
	public void setNombre(String nombre) {
		this.nombre = nombre;
	}
	
	@Override
	public String toString() {
		return idAlumno+" "+nombre;
	}

	@Override
	public int compareTo(Alumno o) {
		return Integer.compare(idAlumno, o.getIdAlumno());
	}
	
}

Entrada.java

package stackHelp;

import java.util.ArrayList;
import java.util.Comparator;
import java.util.List;
import java.util.Map;

import java.util.stream.Collectors;

public class Entrada {

	public static void main(String[] args) {   
  
		List<Alumno> alumnos = new ArrayList<>();
		List<Modulo> modulos = new ArrayList<>();
		List<Nota> notas = new ArrayList<>();
		
		// Agregando mudulos y alumnos
		
		modulos.add(new Modulo(1,"Biología"));
		modulos.add(new Modulo(2,"Física"));
		modulos.add(new Modulo(3,"Química"));
		modulos.add(new Modulo(4,"Matemática"));
		
		alumnos.add(new Alumno(1,"Maria"));
		alumnos.add(new Alumno(2,"Mario"));
		alumnos.add(new Alumno(3,"Lorena"));
		alumnos.add(new Alumno(4,"Mariano"));
		alumnos.add(new Alumno(5,"Carlos"));
		alumnos.add(new Alumno(6,"Natalia"));

		// agregar notas notas
		// idAlumno, idModulo, nota
		notas.add(new Nota(3,2,5));
		notas.add(new Nota(3,4,6));
		notas.add(new Nota(4,1,10));
		notas.add(new Nota(2,1,8));
		notas.add(new Nota(2,3,9));
		notas.add(new Nota(3,1,7));
		notas.add(new Nota(5,4,8));
		notas.add(new Nota(6,2,7));
		notas.add(new Nota(1,1,8));
		notas.add(new Nota(1,2,7));
		notas.add(new Nota(1,3,6));
		
		Comparator<Nota> byModule = new Comparator<>() {
			@Override
			public int compare(Nota o1, Nota o2) {
				int dif = Integer.compare(o1.getIdModulo(), o2.getIdModulo());
				if(dif != 0) {
					return dif;
				}else {
					return Integer.compare(o1.getIdAlumno(), o2.getIdAlumno());
				}
			}
		};
		
		notas.sort(byModule);
    
		/*  // VERSION CON STREAM
		Map<Integer, String> mapaModulos ;
		Map<Integer, String> mapaAlumnos ;
		
		mapaAlumnos = alumnos.stream()
				.collect(Collectors
						.toMap(Alumno::getIdAlumno, Alumno::getNombre));
		
		mapaModulos = modulos.stream()
				.collect(Collectors
						.toMap(Modulo::getIdModulo, Modulo::getNombreModulo));
		
		for (int i = 0 ; i < notas.size() ; i++) {
			Nota nota = notas.get(i);
			System.out.println("MODULO = "+mapaModulos.get(nota.getIdModulo()) +" | ALUMNO = "+ mapaAlumnos.get( nota.getIdAlumno()));
		}
		*/
    
    /* VERSION ITERATIVA */
    // ordenando los arrays solo para la versión Iterativa
    alumnos.sort(null);
		modulos.sort(null);
    
		int indexNotas = 0;  // indice para recorrer el array de notas
		int indexAlumno = 0; // indice para recorrer el array de alumnos
		
		for(int modIndex = 0; modIndex < modulos.size(); modIndex++) { 
			Modulo temp = modulos.get(modIndex);
			while(indexNotas < notas.size() &&  notas.get(indexNotas).getIdModulo() == temp.getIdModulo()) {
        
				// si idAlumno == idAlumno indicado en Nota muestro el mensaje 
				if(alumnos.get(indexAlumno).getIdAlumno() == notas.get(indexNotas).getIdAlumno()) {

					System.out.println("MODULO = "+temp.getNombreModulo()+" | NOMBRE ALUMNO = "
							+alumnos.get(indexAlumno).getNombre()+" | NOTA = "+notas.get(indexNotas).getNota());

					// aumento el indice de notas
					indexNotas++;
				}
				// aumento el indice de alumnos 
				indexAlumno++;
			}
			// reinicio el indice de alumnos para buscar en el siguiete modulo
			indexAlumno = 0;
		}
	}
}

Modulo.java

package stackHelp;

public class Modulo implements Comparable<Modulo>{
	
	private int idModulo;
	private String nombreModulo;
	
	public Modulo(int idModulo, String nombreModulo) {
		super();
		this.idModulo = idModulo;
		this.nombreModulo = nombreModulo;
	}
	
	public String getNombreModulo() {
		return nombreModulo;
	}
	
	public void setNombreModulo(String nombreModulo) {
		this.nombreModulo = nombreModulo;
	}
	
	public int getIdModulo() {
		return idModulo;
	}
	
	@Override
	public String toString() {
		return "Modulo [ " + idModulo + ", " + nombreModulo + "]";
	}
	
	@Override
	public int compareTo(Modulo o) {
		return Integer.compare(this.idModulo, o.getIdModulo() );
	}
	
}

Nota.java

package stackHelp;

public class Nota {
	private int idAlumno;
	private int idModulo;
	private int nota;
	
	public Nota(int idAlumno, int idModulo, int nota) {
		super();
		this.idAlumno = idAlumno;
		this.idModulo = idModulo;
		this.nota = nota;
	}
	
	public int getIdAlumno() {
		return idAlumno;
	}
	public void setIdAlumno(int idAlumno) {
		this.idAlumno = idAlumno;
	}
	public int getIdModulo() {
		return idModulo;
	}
	public void setIdModulo(int idModulo) {
		this.idModulo = idModulo;
	}
	public int getNota() {
		return nota;
	}
	public void setNota(int nota) {
		this.nota = nota;
	}

	@Override
	public String toString() {
		return "Nota(" + idAlumno + ", " + idModulo + ")";
	}
	
}