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February 9, 2025 13:56
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(partial) EasyBuild log for failed build of /dev/shm/branfosj/tmp-up-EL8/eb-s7xgf7n6/files_pr22125/o/OpenBLAS/OpenBLAS-0.3.29-GCC-14.2.0.eb (PR(s) #22125)
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gcc -O2 -ftree-vectorize -march=native -fno-math-errno -g -O2 -DMAX_STACK_ALLOC=2048 -DEXPRECISION -m128bit-long-double -fopenmp -Wall -m64 -DF_INTERFACE_GFORT -fPIC -DSMP_SERVER -DUSE_OPENMP -DNO_WARMUP -DMAX_CPU_NUMBER=112 -DMAX_PARALLEL_NUMBER=1 -DBUILD_SINGLE=1 -DBUILD_DOUBLE=1 -DBUILD_COMPLEX=1 -DBUILD_COMPLEX16=1 -DVERSION="0.3.29" -msse3 -mssse3 -msse4.1 -mavx -mavx2 -mavx2 -UASMNAME -UASMFNAME -UNAME -UCNAME -UCHAR_NAME -UCHAR_CNAME -DASMNAME= -DASMFNAME=_ -DNAME=_ -DCNAME= -DCHAR_NAME="_" -DCHAR_CNAME="" -DNO_AFFINITY -I. -DHAVE_LAPACK_CONFIG_H -I../include -c -o lapacke_zpftrf_work.o lapacke_zpftrf_work.c | |
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make[3]: Leaving directory '/dev/shm/branfosj/build-up-EL8/OpenBLAS/0.3.29/GCC-14.2.0/OpenBLAS-0.3.29/lapack-netlib/LAPACKE/src' | |
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make[3]: Entering directory '/dev/shm/branfosj/build-up-EL8/OpenBLAS/0.3.29/GCC-14.2.0/OpenBLAS-0.3.29/lapack-netlib/LAPACKE/utils' | |
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make[1]: Leaving directory '/dev/shm/branfosj/build-up-EL8/OpenBLAS/0.3.29/GCC-14.2.0/OpenBLAS-0.3.29/lapack-netlib' | |
make[1]: Entering directory '/dev/shm/branfosj/build-up-EL8/OpenBLAS/0.3.29/GCC-14.2.0/OpenBLAS-0.3.29/exports' | |
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-Wl,--whole-archive ../libopenblas_prescottp-r0.3.29.a -Wl,--no-whole-archive \ | |
-Wl,-soname,libopenblas.so.0 -lm -lpthread -lgfortran -lm -lpthread -lgfortran | |
gcc -O2 -ftree-vectorize -march=native -fno-math-errno -g -O2 -DSMALL_MATRIX_OPT -DMAX_STACK_ALLOC=2048 -DEXPRECISION -m128bit-long-double -fopenmp -Wall -m64 -DF_INTERFACE_GFORT -fPIC -DSMP_SERVER -DUSE_OPENMP -DNO_WARMUP -DMAX_CPU_NUMBER=112 -DMAX_PARALLEL_NUMBER=1 -DBUILD_SINGLE=1 -DBUILD_DOUBLE=1 -DBUILD_COMPLEX=1 -DBUILD_COMPLEX16=1 -DVERSION=\"0.3.29\" -msse3 -mssse3 -msse4.1 -mavx -mavx2 -mavx2 -UASMNAME -UASMFNAME -UNAME -UCNAME -UCHAR_NAME -UCHAR_CNAME -DASMNAME= -DASMFNAME=_ -DNAME=_ -DCNAME= -DCHAR_NAME=\"_\" -DCHAR_CNAME=\"\" -DNO_AFFINITY -I.. -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/Python/3.13.1-GCCcore-14.2.0/lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/Python/3.13.1-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/GCCcore/14.2.0/lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/GCCcore/14.2.0/lib -w -o linktest linktest.c ../libopenblas_prescottp-r0.3.29.so -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/Python/3.13.1-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/OpenSSL/3/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/libffi/3.4.5-GCCcore-14.2.0/lib64/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/libffi/3.4.5-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/XZ/5.6.3-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/SQLite/3.47.2-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/Tcl/8.6.16-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/libreadline/8.2-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/ncurses/6.5-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/bzip2/1.0.8-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/binutils/2.42-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/zlib/1.3.1-GCCcore-14.2.0/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/GCCcore/14.2.0/lib/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/14.2.0 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/GCCcore/14.2.0/lib/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/14.2.0/../../../../lib64 -L/lib/../lib64 -L/usr/lib/../lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/Python/3.13.1-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/OpenSSL/3/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/libffi/3.4.5-GCCcore-14.2.0/lib64 -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/libffi/3.4.5-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/XZ/5.6.3-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/SQLite/3.47.2-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/Tcl/8.6.16-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/libreadline/8.2-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/ncurses/6.5-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/bzip2/1.0.8-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/binutils/2.42-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/zlib/1.3.1-GCCcore-14.2.0/lib -L/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/GCCcore/14.2.0/lib/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/14.2.0/../../.. -lgfortran -lm -lgomp -lquadmath -lm -lpthread -lc && echo OK. | |
/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/binutils/2.42-GCCcore-14.2.0/bin/ld: ../libopenblas_prescottp-r0.3.29.so: undefined reference to `dgemm_incopy' | |
/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/binutils/2.42-GCCcore-14.2.0/bin/ld: ../libopenblas_prescottp-r0.3.29.so: undefined reference to `zgemm_incopy' | |
/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/binutils/2.42-GCCcore-14.2.0/bin/ld: ../libopenblas_prescottp-r0.3.29.so: undefined reference to `zgemm_itcopy' | |
/rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/binutils/2.42-GCCcore-14.2.0/bin/ld: ../libopenblas_prescottp-r0.3.29.so: undefined reference to `dgemm_itcopy' | |
collect2: error: ld returned 1 exit status | |
make[1]: *** [Makefile:208: ../libopenblas_prescottp-r0.3.29.so] Error 1 | |
make[1]: Leaving directory '/dev/shm/branfosj/build-up-EL8/OpenBLAS/0.3.29/GCC-14.2.0/OpenBLAS-0.3.29/exports' | |
make: *** [Makefile:144: shared] Error 2 | |
== 2025-02-09 13:56:40,319 run.py:603 WARNING Shell command FAILED (exit code 2, see output above): make -j 8 shared BINARY='64' CC='gcc' FC='gfortran' MAKE_NB_JOBS='-1' USE_OPENMP='1' USE_THREAD='1' CFLAGS='-O2 -ftree-vectorize -march=native -fno-math-errno -g' | |
== 2025-02-09 13:56:40,452 build_log.py:226 ERROR EasyBuild encountered an error (at easybuild/src/easybuild-framework/easybuild/base/exceptions.py:126 in __init__): shell command 'make ...' failed with exit code 2 in build step for OpenBLAS-0.3.29-GCC-14.2.0.eb (at easybuild/src/easybuild-framework/easybuild/framework/easyblock.py:4387 in run_all_steps) | |
== 2025-02-09 13:56:40,453 build_log.py:322 INFO ... (took 15 mins 12 secs) | |
== 2025-02-09 13:56:40,455 filetools.py:2049 INFO Removing lock /rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/.locks/_rds_projects_2017_branfosj-rse_easybuild_EL8-emr_software_OpenBLAS_0.3.29-GCC-14.2.0.lock... | |
== 2025-02-09 13:56:40,455 filetools.py:402 INFO Path /rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/.locks/_rds_projects_2017_branfosj-rse_easybuild_EL8-emr_software_OpenBLAS_0.3.29-GCC-14.2.0.lock successfully removed. | |
== 2025-02-09 13:56:40,455 filetools.py:2053 INFO Lock removed: /rds/projects/2017/branfosj-rse/easybuild/EL8-emr/software/.locks/_rds_projects_2017_branfosj-rse_easybuild_EL8-emr_software_OpenBLAS_0.3.29-GCC-14.2.0.lock | |
== 2025-02-09 13:56:40,457 easyblock.py:362 INFO Closing log for application name OpenBLAS version 0.3.29 |
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