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@r-ryantm
Created March 4, 2020 23:10
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/nix/store/951in4d2pb8n2n61s7kjw5ha851f15dp-gromacs-2020.1
├── bin
│   ├── demux.pl
│   ├── gmx
│   ├── gmx-completion.bash
│   ├── gmx-completion-gmx.bash
│   ├── GMXRC
│   ├── GMXRC.bash
│   ├── GMXRC.csh
│   ├── GMXRC.zsh
│   └── xplor2gmx.pl
├── include
│   ├── gmxapi
│   │   ├── compat
│   │   │   ├── mdparams.h
│   │   │   └── tpr.h
│   │   ├── context.h
│   │   ├── exceptions.h
│   │   ├── gmxapicompat.h
│   │   ├── gmxapi.h
│   │   ├── gromacsfwd.h
│   │   ├── md
│   │   │   ├── mdmodule.h
│   │   │   └── mdsignals.h
│   │   ├── md.h
│   │   ├── session
│   │   │   └── resources.h
│   │   ├── session.h
│   │   ├── status.h
│   │   ├── system.h
│   │   └── version.h
│   └── gromacs
│   ├── math
│   │   └── vectypes.h
│   ├── restraint
│   │   └── restraintpotential.h
│   └── utility
│   ├── basedefinitions.h
│   ├── current_function.h
│   ├── gmxassert.h
│   └── real.h
├── lib
│   ├── libgmxapi.so -> libgmxapi.so.0
│   ├── libgmxapi.so.0 -> libgmxapi.so.0.1.0
│   ├── libgmxapi.so.0.1.0
│   ├── libgromacs.so -> libgromacs.so.5
│   ├── libgromacs.so.5 -> libgromacs.so.5.0.0
│   ├── libgromacs.so.5.0.0
│   └── pkgconfig
│   └── libgromacs.pc
└── share
├── cmake
│   ├── gmxapi
│   │   ├── gmxapi.cmake
│   │   ├── gmxapi-config.cmake
│   │   ├── gmxapi-config-version.cmake
│   │   └── gmxapi-release.cmake
│   └── gromacs
│   ├── gromacs-config.cmake
│   ├── gromacs-config-version.cmake
│   ├── gromacs-toolchain.cmake
│   ├── libgromacs.cmake
│   └── libgromacs-release.cmake
├── gromacs
│   ├── COPYING
│   ├── README_FreeEnergyModifications.txt
│   ├── README.tutor
│   ├── template
│   │   ├── cmake
│   │   │   └── FindGROMACS.cmake
│   │   ├── CMakeLists.txt
│   │   ├── Makefile.pkg
│   │   ├── README
│   │   └── template.cpp
│   └── top
│   ├── amber03.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
│   │   ├── aminoacids.r2b
│   │   ├── aminoacids.rtp
│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── dna.arn
│   │   ├── dna.hdb
│   │   ├── dna.r2b
│   │   ├── dna.rtp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── rna.arn
│   │   ├── rna.hdb
│   │   ├── rna.r2b
│   │   ├── rna.rtp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── urea.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── amber94.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
│   │   ├── aminoacids.r2b
│   │   ├── aminoacids.rtp
│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── dna.arn
│   │   ├── dna.hdb
│   │   ├── dna.r2b
│   │   ├── dna.rtp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── rna.arn
│   │   ├── rna.hdb
│   │   ├── rna.r2b
│   │   ├── rna.rtp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── urea.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── amber96.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
│   │   ├── aminoacids.r2b
│   │   ├── aminoacids.rtp
│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── dna.arn
│   │   ├── dna.hdb
│   │   ├── dna.r2b
│   │   ├── dna.rtp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── rna.arn
│   │   ├── rna.hdb
│   │   ├── rna.r2b
│   │   ├── rna.rtp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── urea.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── amber99.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
│   │   ├── aminoacids.r2b
│   │   ├── aminoacids.rtp
│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── dna.arn
│   │   ├── dna.hdb
│   │   ├── dna.r2b
│   │   ├── dna.rtp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── rna.arn
│   │   ├── rna.hdb
│   │   ├── rna.r2b
│   │   ├── rna.rtp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── urea.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── amber99sb.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
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│   │   ├── aminoacids.rtp
│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── dna.arn
│   │   ├── dna.hdb
│   │   ├── dna.r2b
│   │   ├── dna.rtp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── rna.arn
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│   │   ├── rna.r2b
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│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── urea.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── amber99sb-ildn.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
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│   │   ├── aminoacids.n.tdb
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│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
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│   │   ├── rna.arn
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│   │   ├── rna.r2b
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│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── urea.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── amberGS.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
│   │   ├── aminoacids.r2b
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│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── dna.arn
│   │   ├── dna.hdb
│   │   ├── dna.r2b
│   │   ├── dna.rtp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── rna.arn
│   │   ├── rna.hdb
│   │   ├── rna.r2b
│   │   ├── rna.rtp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── urea.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── atommass.dat
│   ├── atom_nom.tbl
│   ├── bonds.dlg
│   ├── ca-shift.dat
│   ├── cb-shift.dat
│   ├── charmm27.ff
│   │   ├── aminoacids.arn
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
│   │   ├── aminoacids.r2b
│   │   ├── aminoacids.rtp
│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── cmap.itp
│   │   ├── dna.arn
│   │   ├── dna.c.tdb
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│   │   ├── dna.n.tdb
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│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnabonded.itp
│   │   ├── ffnanonbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
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│   │   ├── rna.hdb
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│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   ├── tips3p.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── co-shift.dat
│   ├── defselection.dat
│   ├── dgsolv.dat
│   ├── edissoc.dat
│   ├── electroneg.dat
│   ├── elements.dat
│   ├── export.dlg
│   ├── ffG43a1.itp
│   ├── ffG43a2.itp
│   ├── ffG45a3.itp
│   ├── ffG53a5.itp
│   ├── ffG53a6.itp
│   ├── ffoplsaa.itp
│   ├── ffoplsaa-n.tst
│   ├── flexspce.itp
│   ├── flexspc.itp
│   ├── flexwat-ferguson.itp
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│   │   ├── aminoacids.c.tdb
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│   │   ├── ff_dum.itp
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│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
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│   │   ├── methanol216.gro
│   │   ├── methanol.itp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── gromos43a2.ff
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│   │   ├── ff_dum.itp
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│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   └── watermodels.dat
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│   │   ├── spce.itp
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│   │   ├── atomname2type.n2t
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│   │   ├── spce.itp
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│   │   ├── tip4p.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── gromos53a6.ff
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│   │   ├── ff_dum.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
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│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
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│   │   ├── tip4p.itp
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│   ├── gromos54a7.ff
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│   │   ├── aminoacids.hdb
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│   │   ├── dppc.itp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ff_dum.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── popc.itp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tmcl.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── ha-shift.dat
│   ├── ions.itp
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│   ├── oplsaa.ff
│   │   ├── 1propanol.itp
│   │   ├── aminoacids.c.tdb
│   │   ├── aminoacids.hdb
│   │   ├── aminoacids.n.tdb
│   │   ├── aminoacids.r2b
│   │   ├── aminoacids.rtp
│   │   ├── aminoacids.vsd
│   │   ├── atomname2type.n2t
│   │   ├── atomtypes.atp
│   │   ├── ethanol.itp
│   │   ├── ffbonded.itp
│   │   ├── ffnonbonded.itp
│   │   ├── forcefield.doc
│   │   ├── forcefield.itp
│   │   ├── ions.itp
│   │   ├── methanol.itp
│   │   ├── spce.itp
│   │   ├── spc.itp
│   │   ├── tip3p.itp
│   │   ├── tip4pew.itp
│   │   ├── tip4p.itp
│   │   ├── tip5pe.itp
│   │   ├── tip5p.itp
│   │   └── watermodels.dat
│   ├── phbres.dat
│   ├── ps.m2p
│   ├── random.dat
│   ├── README
│   ├── refi_aa.dat
│   ├── residues.dtd
│   ├── residues.xml
│   ├── residuetypes.dat
│   ├── sfactor.dat
│   ├── spc216.gro
│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── specbond.dat
│   ├── ss.map
│   ├── surface.dat
│   ├── sw.itp
│   ├── table6-10.xvg
│   ├── table6-11.xvg
│   ├── table6-12.xvg
│   ├── table6-8.xvg
│   ├── table6-9.xvg
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4p.gro
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.gro
│   ├── vdw-msms.dat
│   ├── vdwradii.dat
│   └── xlateat.dat
└── man
└── man1
├── gmx.1.gz
├── gmx-anaeig.1.gz
├── gmx-analyze.1.gz
├── gmx-angle.1.gz
├── gmx-awh.1.gz
├── gmx-bar.1.gz
├── gmx-bundle.1.gz
├── gmx-check.1.gz
├── gmx-chi.1.gz
├── gmx-cluster.1.gz
├── gmx-clustsize.1.gz
├── gmx-confrms.1.gz
├── gmx-convert-tpr.1.gz
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├── gmx-covar.1.gz
├── gmx-current.1.gz
├── gmx-density.1.gz
├── gmx-densmap.1.gz
├── gmx-densorder.1.gz
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├── gmx-dipoles.1.gz
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├── gmx-do_dssp.1.gz
├── gmx-dos.1.gz
├── gmx-dump.1.gz
├── gmx-dyecoupl.1.gz
├── gmx-editconf.1.gz
├── gmx-eneconv.1.gz
├── gmx-enemat.1.gz
├── gmx-energy.1.gz
├── gmx-extract-cluster.1.gz
├── gmx-filter.1.gz
├── gmx-freevolume.1.gz
├── gmx-gangle.1.gz
├── gmx-genconf.1.gz
├── gmx-genion.1.gz
├── gmx-genrestr.1.gz
├── gmx-grompp.1.gz
├── gmx-gyrate.1.gz
├── gmx-h2order.1.gz
├── gmx-hbond.1.gz
├── gmx-helix.1.gz
├── gmx-helixorient.1.gz
├── gmx-help.1.gz
├── gmx-hydorder.1.gz
├── gmx-insert-molecules.1.gz
├── gmx-lie.1.gz
├── gmx-make_edi.1.gz
├── gmx-make_ndx.1.gz
├── gmx-mdmat.1.gz
├── gmx-mdrun.1.gz
├── gmx-mindist.1.gz
├── gmx-mk_angndx.1.gz
├── gmx-msd.1.gz
├── gmx-nmeig.1.gz
├── gmx-nmens.1.gz
├── gmx-nmr.1.gz
├── gmx-nmtraj.1.gz
├── gmx-nonbonded-benchmark.1.gz
├── gmx-order.1.gz
├── gmx-pairdist.1.gz
├── gmx-pdb2gmx.1.gz
├── gmx-pme_error.1.gz
├── gmx-polystat.1.gz
├── gmx-potential.1.gz
├── gmx-principal.1.gz
├── gmx-rama.1.gz
├── gmx-rdf.1.gz
├── gmx-report-methods.1.gz
├── gmx-rms.1.gz
├── gmx-rmsdist.1.gz
├── gmx-rmsf.1.gz
├── gmx-rotacf.1.gz
├── gmx-rotmat.1.gz
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├── gmx-sigeps.1.gz
├── gmx-solvate.1.gz
├── gmx-sorient.1.gz
├── gmx-spatial.1.gz
├── gmx-spol.1.gz
├── gmx-tcaf.1.gz
├── gmx-traj.1.gz
├── gmx-trajectory.1.gz
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├── gmx-trjconv.1.gz
├── gmx-trjorder.1.gz
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├── gmx-vanhove.1.gz
├── gmx-velacc.1.gz
├── gmx-view.1.gz
├── gmx-wham.1.gz
├── gmx-wheel.1.gz
├── gmx-x2top.1.gz
└── gmx-xpm2ps.1.gz
37 directories, 584 files
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