keiono

#!/bin/bash

####################################
# System checker script for Mac
####################################

# Target Cytoscape version for this script
CYTOSCAPE_VERSION="3.3.0"

# Supported Mac OS versions

keiono

#!/bin/bash

####################################
# System checker script for Linux
####################################

# Target Cytoscape version for this script
CYTOSCAPE_VERSION="3.3.0"

# Supported Distributions

keiono

#!/bin/bash
####################################
# System checker script for Linux
####################################

# Target Cytoscape version for this script
CYTOSCAPE_VERSION="3.3.0"

APP_STORE_URL="apps.cytoscape.org"

keiono

VISUALIZED FEB 6-7 NYC

（これはグループ内プレゼンのためのメモ書きですがせっかくなのでシェア。とりあえず記憶がはっきりしているうちに...)

Introduction

VISUALIZEDと言う名前の通り、可視化系のコンファレンス。技術詳細よりメタな話多め。たまにはこういうのもいいか。「公開データで社会的善を為す」的な考えの人も多い印象。その中で「データによる扇動」というダークサイドとせめぎ合ってる感じ（あくまで私感）。

テック系コンファレンスだがデザイナー系の人も多いらしく、スキニージーンズな男性やおしゃれな女性率高め。

keiono

Network export from Cytoscape 3.

keiono

// Use Gists to store code you would like to remember later on
console.log(window); // log the "window" object to the console

keiono

keiono

{
  "format_version" : "1.0",
  "generated_by" : "cytoscape-3.1.0",
  "target_cytoscapejs_version" : "~2.1",
  "data" : {
    "selected" : true,
    "__Annotations" : [ "" ],
    "shared_name" : "galFiltered.sif(1)",
    "SUID" : 765,
    "name" : "galFiltered.sif(1)"

keiono

{
  "format_version" : "1.0",
  "generated_by" : "cytoscape-3.1.1",
  "target_cytoscapejs_version" : "~2.1",
  "data" : {
    "selected" : true,
    "__Annotations" : [ ],
    "shared_name" : "galFiltered.sif",
    "SUID" : 528,
    "name" : "Yeast Sample"

keiono

{
  "format_version" : "1.0",
  "generated_by" : "cytoscape-3.1.1",
  "target_cytoscapejs_version" : "~2.1",
  "data" : {
    "selected" : true,
    "KEGG_PATHWAY_ID" : "path:hsa00100",
    "KEGG_PATHWAY_IMAGE" : "http://www.kegg.jp/kegg/pathway/hsa/hsa00100.png",
    "__Annotations" : [ ],
    "SUID" : 52,