Voici la nouvelle bonne méthode (depuis QGIS 2.4) pour utiliser des SVG côté bureautique et côté serveur sans souci. C'est un peu complexe, mais on ne le fait qu'une fois
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Créer un répertoire ./share/svg/une_categorie/ quelque part sur votre système, par exemple un répertoire au-dessus des répertoires Lizmap. Par exemple : C:/chemin/vers/mes/dossiers/sig/share/svg/une_categorie
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Y mettre les fichiers SVG que vous souhaitez utiliser dans vos projets QGIS publiés avec Lizmap ou QGIS Server seul