Simon Wagner simonwagner

## .gitconfig
#This will the fixup command to git
#git fixup $commit will use your current index to fixup the specified commit
#This is done by doing git commit --fixup $commit and then using rebase with autosquash
#Based upon http://stackoverflow.com/a/21148981/460564

[alias]
    fixup = "!sh -c '(git diff-files --quiet || (echo Unstaged changes, please commit or stash with --keep-index; exit 1)) && COMMIT=$(git rev-parse $1) && git commit --fixup=$COMMIT && git rebase -i --autosquash $COMMIT~1' -"

## ale2csv.py
#!/usr/bin/env python
from collections import OrderedDict
from itertools import dropwhile, izip
import csv
import argparse
import os.path

argparser = argparse.ArgumentParser()
argparser.add_argument("ale_file", metavar="ALE", type=argparse.FileType(mode="rb"))
argparser.add_argument("csv_file", metavar="CSV", type=argparse.FileType(mode="wb"), nargs="?", default=None)

## git-graph.py
import sys
import os
import fnmatch
from itertools import chain
from inspect import getframeinfo, stack
import math
from collections import OrderedDict

import pygit2 as git
import cairocffi as cairo

## gist:209f14446989f4c9d617f02778ca5b97
convert -endian LSB -depth 32 -define quantum:format=floating-point -size 512x512 -alpha on rgba:/tmp/rgba.dat /tmp/rgb.tiff

## git-submodule-replay
#!/bin/sh

#Replay commits from submodule in main git repository
#For each commit in the submodule in range, create a commit in the
#main repository that adds the commit of the submodule with the same
#commit message as the submodule

SUBMODULE=$1
RANGE=$2

## nrange.cpp
#include <iostream>
#include <limits>
#include <functional>
#include <chrono>

using namespace std;

#define likely(x)    __builtin_expect (!!(x), 1)
#define unlikely(x)  __builtin_expect (!!(x), 0)

## epidemiologie_WS13
#Epidemiologie

> Epidemionlogie befasst sich mit der Untersuchung der Verteulung von Krankheiten und deren Einflussfakturen in menschlichen Bevölkerungsgruppen und deren Umsetzung zur Kontrole des Gesundheitswesens

##Klassische Epidemiologie
* Risikofaktoren im Zusammenhang mit dem gehäuften Auftreten einer Krankheit mit Hilfe einer gezielten Untersuchung
* Anlässe
    * geographische Unterschiede
    * Auftreten von Clustern (meistens nur bei relativ seltenen Erkrankungen)
    * zeitliche Veränderungen

## bug_matching.py
#!/usr/bin/env python

"""
Test case for a bug in networkx.algorithms.maximal_matching version 1.8.1

It seems that depending on the order of the nodes in the edges ( (a,b) vs (b,a) )
maximal_matching does return different results.
"""

import networkx as nx

## Makefile
TARGET = program
CXXFLAGS += -g -std=c++11

.PHONY: default all clean

default: $(TARGET)
all: default

SOURCES = $(wildcard **/*.cpp) $(wildcard *.cpp)
OBJECTS = $(patsubst %.cpp, %.o, $(SOURCES))

## lock.cpp
#include <cstdint>
#ifdef MAKE_IT_WORK
	#undef _GLIBCXX_USE_CLOCK_MONOTONIC //if this is undefined, the 'correct' clock will be used
#endif
#include <mutex>

extern "C" {

	using mutex = std::recursive_timed_mutex;
	#This will the fixup command to git
	#git fixup $commit will use your current index to fixup the specified commit
	#This is done by doing git commit --fixup $commit and then using rebase with autosquash
	#Based upon http://stackoverflow.com/a/21148981/460564

	[alias]
	fixup = "!sh -c '(git diff-files --quiet \|\| (echo Unstaged changes, please commit or stash with --keep-index; exit 1)) && COMMIT=$(git rev-parse $1) && git commit --fixup=$COMMIT && git rebase -i --autosquash $COMMIT~1' -"
	#!/usr/bin/env python
	from collections import OrderedDict
	from itertools import dropwhile, izip
	import csv
	import argparse
	import os.path

	argparser = argparse.ArgumentParser()
	argparser.add_argument("ale_file", metavar="ALE", type=argparse.FileType(mode="rb"))
	argparser.add_argument("csv_file", metavar="CSV", type=argparse.FileType(mode="wb"), nargs="?", default=None)
	import sys
	import os
	import fnmatch
	from itertools import chain
	from inspect import getframeinfo, stack
	import math
	from collections import OrderedDict

	import pygit2 as git
	import cairocffi as cairo
	#!/bin/sh

	#Replay commits from submodule in main git repository
	#For each commit in the submodule in range, create a commit in the
	#main repository that adds the commit of the submodule with the same
	#commit message as the submodule

	SUBMODULE=$1
	RANGE=$2
	#include <iostream>
	#include <limits>
	#include <functional>
	#include <chrono>

	using namespace std;

	#define likely(x) __builtin_expect (!!(x), 1)
	#define unlikely(x) __builtin_expect (!!(x), 0)
	#Epidemiologie

	> Epidemionlogie befasst sich mit der Untersuchung der Verteulung von Krankheiten und deren Einflussfakturen in menschlichen Bevölkerungsgruppen und deren Umsetzung zur Kontrole des Gesundheitswesens

	##Klassische Epidemiologie
	* Risikofaktoren im Zusammenhang mit dem gehäuften Auftreten einer Krankheit mit Hilfe einer gezielten Untersuchung
	* Anlässe
	* geographische Unterschiede
	* Auftreten von Clustern (meistens nur bei relativ seltenen Erkrankungen)
	* zeitliche Veränderungen
	#!/usr/bin/env python

	"""
	Test case for a bug in networkx.algorithms.maximal_matching version 1.8.1

	It seems that depending on the order of the nodes in the edges ( (a,b) vs (b,a) )
	maximal_matching does return different results.
	"""

	import networkx as nx
	TARGET = program
	CXXFLAGS += -g -std=c++11

	.PHONY: default all clean

	default: $(TARGET)
	all: default

	SOURCES = $(wildcard */.cpp) $(wildcard *.cpp)
	OBJECTS = $(patsubst %.cpp, %.o, $(SOURCES))
	#include <cstdint>
	#ifdef MAKE_IT_WORK
	#undef _GLIBCXX_USE_CLOCK_MONOTONIC //if this is undefined, the 'correct' clock will be used
	#endif
	#include <mutex>

	extern "C" {

	using mutex = std::recursive_timed_mutex;