Пример организации поллинга UART в sam3x8e

polling_loop.c

...
while (1)
{
  //Если получили очередной байт из UART - прочитаем его в переменную received_data
  if ((UART->UART_SR & UART_SR_RXRDY) ==  UART_SR_RXRDY )
  {
    uint32_t received_data = UART->UART_RHR;
    ...
  }
  //Если готовы отправить очередной байт (зранится в data_to_transmit) через UART - запишем в регистр UART_THR  
  if ((UART->UART_SR & UART_SR_TXRDY) == UART_SR_TXRDY)
  {
    UART->UART_THR = data_to_transmit;          
  }
  //Делаем что-то ещё
  ...
}
...