Regex capture numbers with length 0

CaptureOneDigitNumbers.regex

Pattern: ((?<=\D|^)\d(?=\D|\n))  // DO NOT forget () or $1 won't capture
Replace/Capture (VsCode): $1

Before:
4
2 4 0 6 0 7 0 13 0 0 0 8 0 0 16 12
0 0 0 8 0 0 12 0 9 0 0 16 0 0 0 6
0 0 0 11 0 4 0 0 0 7 12 0 0 3 13 0
0 0 14 15 0 0 0 0 2 0 0 11 0 8 0 0
5 0 1 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 6 0
4 0 8 3 0 0 0 0 13 2 16 1 0 11 14 0
0 0 9 0 0 13 0 1 0 8 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 9 2 5 0 0 14 0 0 0 4 7
0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 6 12 0 0 3 4
0 3 13 0 14 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 13 10 8 0 2 0
0 0 16 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 5 0 14
11 0 0 0 16 0 0 7 0 0 0 3 14 0 0 0
0 14 0 0 0 0 0 12 0 5 0 0 15 0 11 1
12 0 0 0 0 5 0 0 7 9 1 2 0 16 0 0
0 0 0 13 0 0 0 2 8 0 0 0 4 7 0 5

After:
 4
 2  4  0  6  0  7  0 13  0  0  0  8  0  0 16 12
 0  0  0  8  0  0 12  0  9  0  0 16  0  0  0  6
 0  0  0 11  0  4  0  0  0  7 12  0  0  3 13  0
 0  0 14 15  0  0  0  0  2  0  0 11  0  8  0  0
 5  0  1  0  0  0 10  0  0  0  0  0  0  0  6  0
 4  0  8  3  0  0  0  0 13  2 16  1  0 11 14  0
 0  0  9  0  0 13  0  1  0  8  0  0  0  0  0  0
 0  0  0  0  0  9  2  5  0  0 14  0  0  0  4  7
 0  0  0  0  0  0  8  0  0  0  6 12  0  0  3  4
 0  3 13  0 14  0  0 10  0  0  0  0  0  0  0  0
 0  0  0  0  0  0  0  0  1  0 13 10  8  0  2  0
 0  0 16  0  0  0  0  0  0  0  0  0  9  5  0 14
11  0  0  0 16  0  0  7  0  0  0  3 14  0  0  0
 0 14  0  0  0  0  0 12  0  5  0  0 15  0 11  1
12  0  0  0  0  5  0  0  7  9  1  2  0 16  0  0
 0  0  0 13  0  0  0  2  8  0  0  0  4  7  0  5
 
Add comma after a number but do not bevore space (aka. parse numbers as coordinate)
Pattern: (\d)(?!(\D|\n)) // ?! is negative Lookahead
Replace: $1,

Before:
p cnf 224 38
121
112 212 222
121 211 221
123 213 223
122 212 222
124 214 224
111 121 221
113 123 223
112 122 222
114 124 224
111 121 211
113 123 213
112 122 212
114 124 214
-111 -112
-111 -113
-111 -114
-112 -113
-112 -114
-113 -114
-121 -122
-121 -123
-121 -124
-122 -123
-122 -124
-123 -124
-211 -212
-211 -213
-211 -214
-212 -213
-212 -214
-213 -214
-221 -222
-221 -223
-221 -224
-222 -223
-222 -224
-223 -224

After:
p cnf 2,2,4 3,8
1,2,1
1,1,2 2,1,2 2,2,2
1,2,1 2,1,1 2,2,1
1,2,3 2,1,3 2,2,3
1,2,2 2,1,2 2,2,2
1,2,4 2,1,4 2,2,4
1,1,1 1,2,1 2,2,1
1,1,3 1,2,3 2,2,3
1,1,2 1,2,2 2,2,2
1,1,4 1,2,4 2,2,4
1,1,1 1,2,1 2,1,1
1,1,3 1,2,3 2,1,3
1,1,2 1,2,2 2,1,2
1,1,4 1,2,4 2,1,4
-1,1,1 -1,1,2
-1,1,1 -1,1,3
-1,1,1 -1,1,4
-1,1,2 -1,1,3
-1,1,2 -1,1,4
-1,1,3 -1,1,4
-1,2,1 -1,2,2
-1,2,1 -1,2,3
-1,2,1 -1,2,4
-1,2,2 -1,2,3
-1,2,2 -1,2,4
-1,2,3 -1,2,4
-2,1,1 -2,1,2
-2,1,1 -2,1,3
-2,1,1 -2,1,4
-2,1,2 -2,1,3
-2,1,2 -2,1,4
-2,1,3 -2,1,4
-2,2,1 -2,2,2
-2,2,1 -2,2,3
-2,2,1 -2,2,4
-2,2,2 -2,2,3
-2,2,2 -2,2,4
-2,2,3 -2,2,4