コメントのとおりですが、コミット用にステージされていないファイルの変更や、Gitの管理下におかれていないファイルがあると、コミットを拒否する pre-commit スクリプトです。 ちょっと厳しすぎる気もしますが……

pre-commit

#!/bin/sh
#
# A simple script to reject commit when there is an unstaged changes
# or an untracked file.
#
# To enable this script, copy this into .git/hooks in your working dir.

if `git status |grep -q 'Changes not staged for commit:'`
then
    echo '[!!ERROR!!] Threre is a modified but unstaged file!'
    exit 1;
fi
if `git status |grep -q 'Untracked files:'`
then
    echo '[!!ERROR!!] There is an untracked file!'
    exit 1;
fi