Rodar apenas uma vez

db.js

var rodando = false;
var minhaFunc = function(){
  if(rodando)
    return; // Já está rodando
    
  rodando = true;
  db.query('select 1 + 1 as result', function(err, result){
    rodando = false;
    
    if(err)
      throw err;
      
    console.log(result);
  });
};

// Rodar essa função a cada segundo
setInterval(minhaFunc, 1000);