gistfile1.txt

mcmc convergence diagnostics
https://github.com/brendano/conplot

~/myutil % grep totalLL log|awk '{print $2}' | conplot
-2.87e+06                                 o                                         
                                      oooo                                      
                                     o    oooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
                                                                                
                                  oooo                                          
-2.93e+06                         ooooo                                             
                           oooo                                                 
                        ooo                                                     
                     ooo                                                        
                   ooo                                                          
-2.98e+06            oo                                                             
               oo                                                               
             oo                                                                 
            o                                                                   
          oo                                                                    
-3.04e+06    oo                                                                     
        oo                                                                      
       oo                                                                       
       o                                                                        
      o                                                                         
-3.1e+06 o                                                                         
                                                                             237
~/myutil % grep wordConc log|awk '{print $2}' | conplot
561.7    o                                                                      
                                                                                
      o                                                                         
                                                                                
                                                                                
514.7                                                                           
           o                                                                    
                                                                                
                                                                                
              o                                                                 
467.6                                                                           
                                                                                
                o                                                               
                   o                                                            
                      o                                                         
420.5                                                                           
                        o                                                       
                           o o  o  o                                            
                                     o                                          
                                        o  o o  o o  o  o o  o    o  o o        
373.4                                                          o          o o  o
                                                                              29
~/myutil % grep docConc log|awk '{print $2}' | conplot 
3.618                                             o  o  o o  o o  o  o o  o o   
                                        o  o o  o                              o
                                o  o o                                          
                             o                                                  
                        o  o                                                    
2.954                 o                                                         
                   o                                                            
                                                                                
                o                                                               
                                                                                
 2.29         o                                                                 
                                                                                
           o                                                                    
                                                                                
                                                                                
1.626                                                                           
         o                                                                      
                                                                                
                                                                                
                                                                                
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