フォルダ内のファイルのMD5を計算して、ハッシュ値とファイル名を記録する。同じハッシュ値（コピーされたファイル）があれば、ファイル名をカンマ区切りで追記する。

gistfile1.rb

require 'digest/md5'
hash = Hash.new {}
Dir.glob('*') do |f|
  digest = Digest::MD5.file(f).to_s
  if hash[digest] == nil then
    hash.store(digest, f)
  else
    hash.store(digest, hash[digest] + ", " + f)
  end
end
hash.keys.each{|k|
  puts k + ", " + hash[k]
}