Your next, and hoped the last, bio python library.
NextBiopy 中的 Next 有兩種涵意:第一,它想分析次世代定序技術(Next Generation Sequencing)的資料,此類資料龐大,在以往缺乏統一且有效的方式來讀取相關檔案;第二,Python 有一專門處理生物相關的套件 Biopython,但歷史久遠有許多包伏下,面對未來大資料的分析往往效能表現不理想,且 API 設計複雜,故希望藉次世界定序為出發點,逐一改善 Biopython 其他功能的效能表現與設計。
平常生資研究者往往專注在分析結果上,往往缺乏一個完整的時間改善分析流程與使用工具,以及與同仁交流技術的場所。藉由本次 Sprint 互相認識以及經驗分享,並對於 NextBiopy 架構如何設計才能更滿足多數研究者的需求。
NextBiopy 相較本次其他專案而言,為較初期的專案,加上研究者可能較缺乏開源協同開發的經驗,大部份的 issue 為解決跨版本、跨平台、CI、底層架構設計等問題。故本專案會藉由這次 Sprint 來讓參加者了解開源專案所需的基礎技術與建設。