gistfile1.txt

.
├── README.md
├── Vagrantfile
└── salt
    ├── minion
    └── roots
        ├── pillar
        │   └── top.sls
        └── salt
            └── base
                ├── nginx
                │   ├── init.sls
                │   └── nginx.conf
                ├── php-fpm
                │   └── init.sls
                └── top.sls

gistfile2.txt

.
├── README.md
├── Vagrantfile
└── salt
    ├── minion
    └── roots
        ├── pillar
        │   └── top.sls
        └── salt
            ├── base
            │   ├── nginx
            │   │   ├── init.sls
            │   │   └── nginx.conf
            │   └── php-fpm
            │       └── init.sls
            └── top.sls

gistfile3.yml

file_roots:
  base:
    - /srv/salt/base
  dev:
    - /srv/salt/dev
    - /srv/salt/base
  prod:
    - /srv/salt/prod
    - /srv/salt/base