Убирает вообще все паренты в проекте

unParentAll.jsx

for(var i = 1; i < app.project.items.length; i++){
    app.beginUndoGroup("Unparent All");

    if(app.project.items[i] instanceof CompItem){
        unParentComp(app.project.items[i])
    }
    app.endUndoGroup();
}

function unParentComp(_comp){
    //эта  функция пройдется по всем слоям композиции и уберет все паренты
    for(var l = 1; l <= _comp.layers.length; l++){
        thisLayer = _comp.layers[l];
        if(thisLayer.parent) thisLayer.parent = null;
    }
}