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May 10, 2016 00:18
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| ##fileformat=VCFv4.1 | |
| ##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed"> | |
| ##pipeline_version=DVDS_v1.4.7.4 | |
| ##resource_version=v1.0.13 | |
| ##FILTER=<ID=INDEL_SPECIFIC_FILTERS,Description="QD < 2.0 || ReadPosRankSum < -20.0 || InbreedingCoeff < -0.8 || FS > 200.0"> | |
| ##FILTER=<ID=LowQual,Description="Low quality"> | |
| ##FILTER=<ID=VQSRTrancheSNP99.00to99.90,Description="Truth sensitivity tranche level for SNP model at VQS Lod: -11.8399 <= x < -0.3411"> | |
| ##FILTER=<ID=VQSRTrancheSNP99.90to100.00+,Description="Truth sensitivity tranche level for SNP model at VQS Lod < -24069.3954"> | |
| ##FILTER=<ID=VQSRTrancheSNP99.90to100.00,Description="Truth sensitivity tranche level for SNP model at VQS Lod: -24069.3954 <= x < -11.8399"> | |
| ##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed"> | |
| ##GATKCommandLine=<ID=ApplyRecalibration,CommandLineOptions="analysis_type=ApplyRecalibration input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null phone_home=NO_ET gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/nfs/env/prod/content/genomes/reference/hs37d5/raw/hs37d5.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false input=[(RodBinding name=input source=/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2015-06-17.11-55-04.Stanford_Atheletes_24ACE.ACE2_Exome/per_submitted_sample/01_16_DVDS_v1.4.7.4_ACE/01_16.gatk.raw.vcf)] recal_file=(RodBinding name=recal_file source=/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2015-06-17.11-55-04.Stanford_Atheletes_24ACE.ACE2_Exome/per_submitted_sample/01_16_DVDS_v1.4.7.4_ACE/01_16.gatk.VQSR.tmp.snp.recal) tranches_file=/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2015-06-17.11-55-04.Stanford_Atheletes_24ACE.ACE2_Exome/per_submitted_sample/01_16_DVDS_v1.4.7.4_ACE/01_16.gatk.VQSR.tmp.snp.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub ts_filter_level=99.0 lodCutoff=null ignore_filter=null excludeFiltered=false mode=SNP filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false",Date="Fri Jun 19 21:08:58 PDT 2015",Epoch=1434773338278,Version=2014.2-3.1.7-7-gb0ce0a5> | |
| ##GATKCommandLine=<ID=CombineVariants,CommandLineOptions="analysis_type=CombineVariants input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null phone_home=NO_ET gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/nfs/env/prod/content/genomes/reference/hs37d5/raw/hs37d5.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=[(RodBindingCollection [(RodBinding name=variant source=/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2015-06-17.11-55-04.Stanford_Atheletes_24ACE.ACE2_Exome/per_submitted_sample/01_16_DVDS_v1.4.7.4_ACE/01_16.gatk.VQSR.indel.hardfilter.vcf)]), (RodBindingCollection [(RodBinding name=variant2 source=/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2015-06-17.11-55-04.Stanford_Atheletes_24ACE.ACE2_Exome/per_submitted_sample/01_16_DVDS_v1.4.7.4_ACE/01_16.gatk.VQSR.snp.hardfilter.vcf)])] out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub genotypemergeoption=UNSORTED filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED multipleallelesmergetype=BY_TYPE rod_priority_list=null printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false excludeNonVariants=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 suppressCommandLineHeader=false mergeInfoWithMaxAC=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false",Date="Fri Jun 19 21:11:33 PDT 2015",Epoch=1434773493551,Version=2014.2-3.1.7-7-gb0ce0a5> | |
| ##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed"> | |
| ##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities"> | |
| ##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership"> | |
| ##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?"> | |
| ##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions"> | |
| ##INFO=<ID=END,Number=1,Type=Integer,Description="Stop position of the interval"> | |
| ##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias"> | |
| ##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes"> | |
| ##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation"> | |
| ##INFO=<ID=MLEAC,Number=A,Type=Integer,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts (not necessarily the same as the AC), for each ALT allele, in the same order as listed"> | |
| ##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency (not necessarily the same as the AF), for each ALT allele, in the same order as listed"> | |
| ##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads"> | |
| ##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities"> | |
| ##INFO=<ID=NEGATIVE_TRAIN_SITE,Number=0,Type=Flag,Description="This variant was used to build the negative training set of bad variants"> | |
| ##INFO=<ID=POSITIVE_TRAIN_SITE,Number=0,Type=Flag,Description="This variant was used to build the positive training set of good variants"> | |
| ##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth"> | |
| ##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)"> | |
| ##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)"> | |
| ##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias"> | |
| ##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat"> | |
| ##INFO=<ID=VQSLOD,Number=1,Type=Float,Description="Log odds ratio of being a true variant versus being false under the trained gaussian mixture model"> | |
| ##INFO=<ID=culprit,Number=1,Type=String,Description="The annotation which was the worst performing in the Gaussian mixture model, likely the reason why the variant was filtered out"> | |
| ##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants"> | |
| ##contig=<ID=1,length=249250621> | |
| ##contig=<ID=2,length=243199373> | |
| ##contig=<ID=3,length=198022430> | |
| ##contig=<ID=4,length=191154276> | |
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| ##contig=<ID=7,length=159138663> | |
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| ##reference=hs37d5.fa | |
| ##source=SelectVariants | |
| ##samtoolsVersion=0.1.18 (r982:295) | |
| ##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Raw read depth"> | |
| ##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases"> | |
| ##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Integer,Description="Root-mean-square mapping quality of covering reads"> | |
| ##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability of all samples being the same"> | |
| ##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele frequency (assuming HWE)"> | |
| ##INFO=<ID=AC1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele count (no HWE assumption)"> | |
| ##INFO=<ID=G3,Number=3,Type=Float,Description="ML estimate of genotype frequencies"> | |
| ##INFO=<ID=HWE,Number=1,Type=Float,Description="Chi^2 based HWE test P-value based on G3"> | |
| ##INFO=<ID=CLR,Number=1,Type=Integer,Description="Log ratio of genotype likelihoods with and without the constraint"> | |
| ##INFO=<ID=UGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable unconstrained genotype configuration in the trio"> | |
| ##INFO=<ID=CGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable constrained genotype configuration in the trio"> | |
| ##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias"> | |
| ##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL."> | |
| ##INFO=<ID=PC2,Number=2,Type=Integer,Description="Phred probability of the nonRef allele frequency in group1 samples being larger (,smaller) than in group2."> | |
| ##INFO=<ID=PCHI2,Number=1,Type=Float,Description="Posterior weighted chi^2 P-value for testing the association between group1 and group2 samples."> | |
| ##INFO=<ID=QCHI2,Number=1,Type=Integer,Description="Phred scaled PCHI2."> | |
| ##INFO=<ID=PR,Number=1,Type=Integer,Description="# permutations yielding a smaller PCHI2."> | |
| ##INFO=<ID=VDB,Number=1,Type=Float,Description="Variant Distance Bias"> | |
| ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype"> | |
| ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality"> | |
| ##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Float,Description="Likelihoods for RR,RA,AA genotypes (R=ref,A=alt)"> | |
| ##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="# high-quality bases"> | |
| ##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value"> | |
| ##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="List of Phred-scaled genotype likelihoods"> | |
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| ##INFO=<ID=SF,Number=.,Type=String,Description="Source File (index to sourceFiles, f when filtered)"> | |
| ##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes"> | |
| ##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes"> | |
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| ##ApplyRecalibration="analysis_type input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=hs37d5.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableRandomization=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 enable_experimental_downsampling=false baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false unsafe=null num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false input=[(RodBinding name=input source=3_01.gatk.raw.vcf)] recal_file=(RodBinding name=recal_file source=3_01.gatk.VQSR.tmp.snp.recal) tranches_file=3_01.gatk.VQSR.tmp.snp.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub ts_filter_level=99.0 ignore_filter=null mode=SNP filter_mismatching_base_and_quals=false" | |
| ##CombineVariants="analysis_type input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=hs37d5.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableRandomization=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 enable_experimental_downsampling=false baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false unsafe=null num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false variant=[(RodBinding name=variant source=3_01.gatk.VQSR.indel.hardfilter.vcf), (RodBinding name=variant2 source=3_01.gatk.VQSR.snp.hardfilter.vcf)] out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub genotypemergeoption=UNSORTED filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED multipleallelesmergetype=BY_TYPE rod_priority_list=null printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 suppressCommandLineHeader=false mergeInfoWithMaxAC=false filter_mismatching_base_and_quals=false" | |
| ##SelectVariants="analysis_type input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=hs37d5.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableRandomization=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 enable_experimental_downsampling=false baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false unsafe=null num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false variant=(RodBinding name=variant source=3_01.chromosome_1.recal.tmp.all.gatk.vcf) discordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) concordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sample_name=[] sample_expressions=null sample_file=null exclude_sample_name=[] exclude_sample_file=[] select_expressions=[] excludeNonVariants=true excludeFiltered=false regenotype=false restrictAllelesTo=ALL keepOriginalAC=false mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_fraction=0.0 remove_fraction_genotypes=0.0 selectTypeToInclude=[] keepIDs=null fullyDecode=false forceGenotypesDecode=false justRead=false maxIndelSize=2147483647 ALLOW_NONOVERLAPPING_COMMAND_LINE_SAMPLES=false filter_mismatching_base_and_quals=false" | |
| ##UnifiedGenotyper="analysis_type input_file=[3_01.chromosome_1.recal.bam] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=[1.bed] excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=hs37d5.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableRandomization=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 enable_experimental_downsampling=false baq=CALCULATE_AS_NECESSARY baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false unsafe=null num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false genotype_likelihoods_model=BOTH pcr_error_rate=1.0E-4 computeSLOD=false annotateNDA=false pair_hmm_implementation=ORIGINAL min_base_quality_score=17 max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 min_indel_fraction_per_sample=0.25 indel_heterozygosity=1.25E-4 indelGapContinuationPenalty=10 indelGapOpenPenalty=45 indelHaplotypeSize=80 indelDebug=false ignoreSNPAlleles=false allReadsSP=false ignoreLaneInfo=false reference_sample_calls=(RodBinding name= source=UNBOUND) reference_sample_name=null sample_ploidy=2 min_quality_score=1 max_quality_score=40 site_quality_prior=20 min_power_threshold_for_calling=0.95 min_reference_depth=100 exclude_filtered_reference_sites=false heterozygosity=0.001 genotyping_mode=DISCOVERY output_mode=EMIT_VARIANTS_ONLY standard_min_confidence_threshold_for_calling=50.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=10.0 alleles=(RodBinding name= source=UNBOUND) max_alternate_alleles=6 p_nonref_model=EXACT_INDEPENDENT contamination_fraction_to_filter=0.05 logRemovedReadsFromContaminationFiltering=null exactcallslog=null dbsnp=(RodBinding name=dbsnp source=dbsnp_137.b37.reformatted.vcf) comp=[] out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub debug_file=null metrics_file=null annotation=[] excludeAnnotation=[] filter_mismatching_base_and_quals=false" | |
| ##VariantFiltration="analysis_type input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=hs37d5.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableRandomization=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 enable_experimental_downsampling=false baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false unsafe=null num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false variant=(RodBinding name=variant source=3_01.gatk.VQSR.indel.vcf) mask=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub filterExpression=[QD < 2.0 || ReadPosRankSum < -20.0 || InbreedingCoeff < -0.8 || FS > 200.0] filterName=[INDEL_SPECIFIC_FILTERS] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskExtension=0 maskName=Mask missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false invalidatePreviousFilters=false filter_mismatching_base_and_quals=false" | |
| ##source_20140617.1=vcf-merge(r731) /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_01.ACE_Exome.v2.18.4/3_01.gatk.VQSR.vcf.gz /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_01.ACE_Exome.v2.18.4/3_01.pileup.raw.vcf.gz | |
| ##sourceFiles_20140617.1=0:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_01.ACE_Exome.v2.18.4/3_01.gatk.VQSR.vcf.gz,1:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_01.ACE_Exome.v2.18.4/3_01.pileup.raw.vcf.gz | |
| ##source_20140520.1=vcf-merge(r731) /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-06-15.15-37-27.Euan_Atheletes_project_16_samples_high_coverage_12GB_ACE_research.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_03.ACE_Exome.v2.18.4/3_03.gatk.VQSR.vcf.gz /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-06-15.15-37-27.Euan_Atheletes_project_16_samples_high_coverage_12GB_ACE_research.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_03.ACE_Exome.v2.18.4/3_03.pileup.raw.vcf.gz | |
| ##sourceFiles_20140520.1=0:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-06-15.15-37-27.Euan_Atheletes_project_16_samples_high_coverage_12GB_ACE_research.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_03.ACE_Exome.v2.18.4/3_03.gatk.VQSR.vcf.gz,1:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-06-15.15-37-27.Euan_Atheletes_project_16_samples_high_coverage_12GB_ACE_research.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_03.ACE_Exome.v2.18.4/3_03.pileup.raw.vcf.gz | |
| ##source_20140618.1=vcf-merge(r731) /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_05.ACE_Exome.v2.18.4/3_05.gatk.VQSR.vcf.gz /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_05.ACE_Exome.v2.18.4/3_05.pileup.raw.vcf.gz | |
| ##sourceFiles_20140618.1=0:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_05.ACE_Exome.v2.18.4/3_05.gatk.VQSR.vcf.gz,1:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-16.21-26-58.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_05.ACE_Exome.v2.18.4/3_05.pileup.raw.vcf.gz | |
| ##source_20140626.1=vcf-merge(r731) /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-25.14-38-00.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_68_10_03.ACE_Exome.v2.18.4/3_68_10_03.gatk.VQSR.vcf.gz /hpc/ops/data/Data/ana/WES/2014-07-25.14-38-00.Euan_Atheletes_project_34_samples_low_coverage_5_GB_ACE_research24plex.ACE_Exome/per_submitted_sample/3_68_10_03.ACE_Exome.v2.18.4/3_68_10_03.pileup.raw.vcf.gz | |
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| ##sourceFiles_20160218.1=0:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2016-03-16.13-38-35.Ashley24_ACE3_5Gave.ACE2_Exome/per_submitted_sample/s05_10_DVDS_v1.4.7.5_ACE/s05_10.gatk.VQSR.vcf.gz,1:/hpc/ops/data/Data/ana/WES/2016-03-16.13-38-35.Ashley24_ACE3_5Gave.ACE2_Exome/per_submitted_sample/s05_10_DVDS_v1.4.7.5_ACE/s05_10.pileup.raw.vcf.gz | |
| ##bcftools_mergeVersion=1.3.1-4-ge3ef8da+htslib-1.3.1-12-g0454d47 | |
| ##bcftools_mergeCommand=merge -l vcf_links.txt -O z -m none | |
| ##bcftools_normVersion=1.3.1-4-ge3ef8da+htslib-1.3.1-12-g0454d47 | |
| ##bcftools_normCommand=norm -O z -f /share/PI/euan/apps/bcbio/genomes/Hsapiens/GRCh37/seq/GRCh37.fa -m - tmp2.vcf.gz | |
| ##bcftools_viewVersion=1.3+htslib-1.3 | |
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| 2 1098305 . A G 248.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.701;Dels=0;FQ=141;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=1.261;PV4=0.72,8.7e-08,1,0.29;QD=11.61;ReadPosRankSum=-1.061;SF=0,1;VDB=0.0216;VQSLOD=9.32;culprit=FS;set=variant2;DP=62;DP4=6,7,10,8;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1156774 . C T 137.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=0.741;Dels=0;FQ=53;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=57;MQRankSum=-0.365;PV4=1,1,0.22,1;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.568;SF=0,1;VDB=0.004;VQSLOD=2.95;culprit=MQ;set=variant2;DP=20;DP4=1,3,2,4;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:85:10:196,0,85:4,6 0/1:83:.:137,0,80:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1157020 . T G 42.48 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=0.358;Dels=0;FQ=15.7;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.358;PV4=0.4,0.018,1,1;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.358;SF=0,1;VDB=0.0137;VQSLOD=4.53;culprit=QD;set=variant2;DP=10;DP4=1,1,3,0;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1168797 . C T 378.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;FQ=10.4;MQ=60;PV4=1,1,1,1;SF=1;VDB=0.0094;BaseQRankSum=1.01;Dels=0;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQRankSum=-0.61;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.69;VQSLOD=3.15;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=107;DP4=17,14,13,14;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=6;AC=3 GT:GQ:PL:DP:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. .:.:.:.:. 0/1:39:37,0,185:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1260344 . C T 359.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=2.832;Dels=0;FQ=170;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-1.599;PV4=1,6.1e-06,1,1;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.42;SF=0,1;VDB=0.0227;VQSLOD=7.01;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=106;DP4=11,17,10,14;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:49:581,0,627:29,24 0/1:99:.:197,0,255:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1260434 . C T 98.39 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.422;Dels=0;FQ=33;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.573;PV4=1,2.5e-05,1,1;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.573;SF=0,1;VDB=0.0109;VQSLOD=10.82;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=18;DP4=0,3,0,6;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:88:9:166,0,88:3,6 0/1:63:.:89,0,60:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1271121 . A G 55.37 PASS AC1=2;AF1=1;Dels=0;FQ=-36;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;QD=17.91;SF=0,1;VDB=0.0071;VQSLOD=20.7;culprit=FS;set=variant2;DP=6;DP4=0,0,2,1;AF=1;MLEAC=2;MLEAF=1;AN=4;AC=4 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 1/1:6:3:81,6,0:0,3 1/1:16:.:89,9,0:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1271174 . T C 134.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-1.67;Dels=0;FQ=40;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=56;MQRankSum=0.978;PV4=1,0.00057,1,0.41;QD=11.67;ReadPosRankSum=-1.67;SF=0,1;VDB=0.0193;VQSLOD=0.34;culprit=FS;set=variant2;DP=24;DP4=1,2,3,5;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1271355 . A G 112.89 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=2.383;Dels=0;FQ=47.5;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.633;PV4=1,2.8e-07,1,1;QD=17.78;ReadPosRankSum=2.383;SF=0,1;VDB=0.0008;VQSLOD=6.27;culprit=QD;set=variant2;DP=20;DP4=0,4,0,6;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:10:206,0,118:4,6 0/1:77:.:78,0,77:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1412457 . T A 220.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.358;Dels=0;FQ=59;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.234;PV4=1,0.0055,1,1;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.796;SF=0,1;VDB=0.0281;VQSLOD=8.84;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=36;DP4=6,0,12,0;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:18:387,0,162:6,12 0/1:89:.:112,0,86:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1417091 . G A 143.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-0.133;Dels=0;FQ=56;FS=2.158;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.133;PV4=1,2e-05,1,1;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.067;SF=0,1;VDB=0.0156;VQSLOD=8.52;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=28;DP4=3,1,5,4;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1417105 . C T 246.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.392;Dels=0;FQ=140;FS=3.261;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-2.513;PV4=0.47,2.6e-10,1,1;QD=10.81;ReadPosRankSum=2.585;SF=0,1;VDB=0.012;VQSLOD=3.76;culprit=MQRankSum;set=variant2;DP=66;DP4=11,4,10,7;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1417127 . C T 92.89 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.898;Dels=0;FQ=48;FS=0;HaplotypeScore=1.445;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.597;PV4=1,0.0017,1,1;QD=8.8;ReadPosRankSum=1.898;SF=0,1;VDB=0.0144;VQSLOD=6.19;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=32;DP4=6,4,4,2;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1417150 . G T 422.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-4.914;Dels=0;FQ=225;FS=2.721;HaplotypeScore=1.929;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-1.261;PV4=0.53,0.00013,1,0.13;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.813;SF=0,1;VDB=0.0404;VQSLOD=5.08;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=88;DP4=14,6,14,10;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:40:649,0,577:20,24 0/1:99:.:255,0,255:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1417164 . C T 175.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=0.048;Dels=0;FQ=112;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.625;PV4=1,0.0029,1,1;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.395;SF=0,1;VDB=0.0078;VQSLOD=9.2;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=34;DP4=4,4,5,4;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:17:270,0,192:8,9 0/1:99:.:139,0,160:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1417268 rs28909986 C T 265.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-4.594;DB;Dels=0;FQ=136;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.395;PV4=0.6,4.7e-07,1,0.34;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.395;SF=0,1;VDB=0.0355;VQSLOD=10.33;culprit=MQ;set=variant2;POSITIVE_TRAIN_SITE;DP=86;DP4=4,18,1,19;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=8;AC=4 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:28:426,0,399:14,16 0/1:99:.:163,0,209:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:13:145,0,203:8,5 0/1:84:.:81,0,169:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1417272 . C T 374.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=4.154;Dels=0;FQ=169;FS=1.329;HaplotypeScore=0.7887;MQ0=0;MQ=59;MQRankSum=-1.413;PV4=0.73,0.00071,1,1;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.242;SF=0,1;VDB=0.0144;VQSLOD=1.59;culprit=MQRankSum;set=variant2;DP=77;DP4=6,10,6,15;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1418462 . T G 44.48 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.231;Dels=0;FQ=14.4;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-1.231;PV4=1,0.00062,1,1;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.231;SF=0,1;VDB=0.0134;VQSLOD=5.76;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=10;DP4=0,2,0,3;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1460098 . G A 166.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-3.956;Dels=0;FQ=77;FS=8.921;HaplotypeScore=0.9993;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.647;PV4=0.13,1.6e-07,1,1;QD=8.92;ReadPosRankSum=0.503;SF=0,1;VDB=0.0078;VQSLOD=3.7;culprit=FS;set=variant2;DP=58;DP4=5,13,0,11;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1480643 . G A 66.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-2.017;Dels=0;FQ=40;FS=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.922;PV4=1,6.4e-06,1,1;QD=12.1;ReadPosRankSum=-0.421;SF=0,1;VDB=0.0309;VQSLOD=6.04;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=16;DP4=4,0,4,0;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:8:125,0,130:4,4 0/1:70:.:67,0,88:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1481383 . G A 175.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.615;Dels=0;FQ=85;FS=3.821;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.692;PV4=0.66,7.2e-09,1,1;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.429;SF=0,1;VDB=0.0244;VQSLOD=5.63;culprit=FS;set=variant2;DP=44;DP4=7,3,6,5;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1488251 rs28910609 A G 82.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.309;DB;Dels=0;FQ=44;FS=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.38;PV4=1,0.00017,1,1;QD=10.31;ReadPosRankSum=2.141;SF=0,1;VDB=0.0069;VQSLOD=6.09;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=24;DP4=7,0,5,0;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:12:152,0,217:7,5 0/1:74:.:71,0,111:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1488535 . G A 62.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-3;Dels=0;FQ=43;FS=4.775;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.211;PV4=0.6,2.6e-07,1,0.09;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.733;SF=0,1;VDB=0.0165;VQSLOD=1.38;culprit=QD;set=variant2;DP=38;DP4=5,7,1,5;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:19:113,0,264:12,7 0/1:73:.:70,0,242:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1488614 rs114401108 T C 208.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=3.367;DB;Dels=0;FQ=75;FS=4.559;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=59;MQRankSum=-0.903;PV4=0.36,5.1e-14,0.18,1;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.068;SF=0,1;VDB=0.0281;VQSLOD=3.55;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=50;DP4=4,7,2,11;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:23:373,0,306:11,14 0/1:99:.:102,0,193:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1507568 . G A 133.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-2.443;Dels=0;FQ=67;FS=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.311;PV4=1,0.00051,1,1;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.133;SF=0,1;VDB=0.0169;VQSLOD=3.3;culprit=FS;set=variant2;DP=36;DP4=9,1,8,0;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1545880 rs2280129 T G 395.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=3.18;DB;Dels=0;FQ=130;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.377;POSITIVE_TRAIN_SITE;PV4=1,4e-13,1,1;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.485;SF=0,1;VDB=0.0264;VQSLOD=10.8;culprit=QD;set=variant2;DP=408;DP4=56,44,58,44;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=32;AC=16 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:26:482,0,243:9,17 0/1:99:.:164,0,158:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:41:675,0,595:23,22 0/1:99:.:174,0,255:. 0/1:99:22:168,0,357:14,8 0/1:98:.:95,0,228:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1545915 . G A 144.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.932;Dels=0;FQ=54;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.289;PV4=1,0.00028,1,0.16;QD=16.06;ReadPosRankSum=-1.134;SF=0,1;VDB=0.0267;VQSLOD=10.09;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=24;DP4=2,2,4,4;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:80:12:221,0,80:4,8 0/1:84:.:127,0,81:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1545942 rs28915683 G A 157.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=2.134;DB;Dels=0;FQ=94;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.36;PV4=1,8e-06,1,0.14;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.414;SF=0,1;VDB=0.0156;VQSLOD=17.83;culprit=QD;set=variant2;DP=56;DP4=9,9,5,5;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:28:252,0,451:18,10 0/1:99:.:121,0,255:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1545972 rs2280128 C G 528.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=2.374;DB;Dels=0;FQ=159;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.064;POSITIVE_TRAIN_SITE;PV4=1,1.9e-13,1,1;QD=17.47;ReadPosRankSum=0.866;SF=0,1;VDB=0.0267;VQSLOD=11.2;culprit=QD;set=variant2;DP=509;DP4=70,59,65,60;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=32;AC=16 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:36:657,0,384:15,21 0/1:99:.:186,0,233:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:58:915,0,888:32,32 0/1:99:.:200,0,255:. 0/1:99:13:127,0,236:8,5 0/1:81:.:78,0,173:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1546012 rs150384267 C CT 696.37 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=4.564;DB;FQ=217;FS=0;HaplotypeScore=61.2784;INDEL;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-0.116;PV4=0.79,1,1,0.26;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.543;SF=0,1;VDB=0.0404;set=variant;DP=114;DP4=14,14,13,16;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:57:1213,0,1142:26,27 0/1:99:.:255,0,255:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1546079 rs28915685 G A 356.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.676;DB;Dels=0;FQ=173;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=59;MQRankSum=-0.154;PV4=1,5.9e-06,0.14,0.48;QD=11.8;ReadPosRankSum=-0.088;SF=0,1;VDB=0.0264;VQSLOD=2.65;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=92;DP4=10,15,9,12;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1546297 . G A 649.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.183;Dels=0;FQ=225;FS=0;HaplotypeScore=1.9987;MQ0=0;MQ=58;MQRankSum=0.146;PV4=1,1,1,0.16;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.709;SF=0,1;VDB=0.027;VQSLOD=2.24;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;DP=173;DP4=20,19,22,21;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:90:1103,0,903:41,49 0/1:99:.:255,0,255:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1547014 . A C 437.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-3.132;Dels=0;FQ=202;FS=1.111;HaplotypeScore=0.9979;MQ0=0;MQ=59;MQRankSum=-1.227;PV4=0.78,1.1e-14,1,0.49;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.641;SF=0,1;VDB=0.0264;VQSLOD=1.23;culprit=MQRankSum;set=variant2;DP=103;DP4=9,15,9,18;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1547448 . CATGA C 202.37 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.092;FQ=159;FS=0;HaplotypeScore=4.3059;INDEL;MQ0=0;MQ=59;MQRankSum=1.381;PV4=1,0.12,0.11,0.11;QD=16.58;RPA=2,1;RU=ATGA;ReadPosRankSum=-1.256;SF=0,1;STR;VDB=0.0404;set=variant;DP=30;DP4=1,7,1,4;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:15:.,.,477:8,5 0/1:99:.:194,0,255:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1635894 . C T 116.39 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-1.589;Dels=0;FQ=17.1;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=1.589;PV4=1,7.3e-05,1,0.18;QD=21.47;ReadPosRankSum=-1.067;SF=0,1;VDB=0.0259;VQSLOD=8.16;culprit=QD;set=variant2;DP=16;DP4=2,0,6,0;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:55:8:200,0,55:2,6 0/1:47:.:91,0,44:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1636155 . C T 618.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=1.288;Dels=0;FQ=225;FS=3.049;HaplotypeScore=2.8494;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-1.525;PV4=0.36,1,1,1;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.587;SF=0,1;VDB=0.027;VQSLOD=0.925;culprit=MQRankSum;set=variant2;DP=160;DP4=21,14,20,22;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1636371 . C T 135.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-3.915;Dels=0;FQ=131;FS=1.423;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=59;MQRankSum=0.103;PV4=0.72,2.2e-05,1,1;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.927;SF=0,1;VDB=0.0253;VQSLOD=3.03;culprit=HaplotypeScore;set=variant2;DP=72;DP4=14,11,5,6;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1637108 . G A 113.89 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=0.101;Dels=0;FQ=90.8;FS=2.276;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.312;PV4=0.59,0.0019,1,0.42;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.101;SF=0,1;VDB=0.0261;VQSLOD=8.46;culprit=FS;set=variant2;DP=26;DP4=3,3,2,5;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1637531 rs1054249 A G 1703.39 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=0.021;DB;Dels=0;FQ=178;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.064;POSITIVE_TRAIN_SITE;PV4=1,1.6e-08,1,1;QD=15.23;ReadPosRankSum=2.011;SF=0,1;VDB=0.0098;VQSLOD=13.22;culprit=ReadPosRankSum;set=variant2;NEGATIVE_TRAIN_SITE;DP=20335;DP4=707,616,4548,3980;AF=1;MLEAC=2;MLEAF=1;AN=1040;AC=914 GT:GQ:DP:PL:AD 0/1:99:30:485,0,287:12,18 0/1:99:.:211,0,206:. 1/1:99:56:1598,120,0:0,56 1/1:99:.:255,163,0:. 1/1:78:37:1045,78,0:0,37 1/1:99:.:255,105,0:. 1/1:69:28:895,69,0:0,28 1/1:99:.:255,84,0:. 1/1:39:18:525,39,0:0,18 1/1:99:.:255,54,0:. 1/1:84:41:1141,84,0:0,41 1/1:99:.:255,117,0:. 1/1:96:41:1245,96,0:0,41 1/1:99:.:255,123,0:. 1/1:60:28:786,60,0:0,28 1/1:99:.:255,84,0:. 1/1:63:27:795,63,0:0,27 1/1:99:.:255,81,0:. 1/1:87:40:1146,87,0:0,40 1/1:99:.:255,120,0:. 0/1:99:37:395,0,465:20,17 0/1:99:.:178,0,255:. 1/1:99:45:1400,108,0:0,45 1/1:99:.:255,135,0:. 1/1:60:28:788,60,0:0,28 1/1:99:.:255,75,0:. 1/1:66:28:862,66,0:0,28 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| 2 1665775 rs184351296 G T 240.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-2.637;DB;Dels=0;FQ=50;FS=3.424;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=2.637;PV4=0.45,1.4e-07,1,0.19;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.466;SF=0,1;VDB=0.0267;VQSLOD=6.28;culprit=MQRankSum;set=variant2;DP=136;DP4=28,7,24,8;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=12;AC=6 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:99:11:152,0,202:6,5 0/1:80:.:77,0,117:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1665859 . G A 260.38 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-1.92;Dels=0;FQ=156;FS=1.617;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.363;PV4=0.7,5.5e-08,1,0.35;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.778;SF=0,1;VDB=0.0267;VQSLOD=12.06;culprit=QD;set=variant2;DP=52;DP4=6,5,9,5;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1665868 rs200276592 G A 140.38 PASS AC1=1;AF1=0.5003;BaseQRankSum=1.733;DB;Dels=0;FQ=4.77;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-1.271;PV4=0.47,4.7e-09,1,1;QD=19.28;ReadPosRankSum=0;SF=0,1;VDB=0.0098;VQSLOD=7.5;culprit=QD;set=variant2;DP=108;DP4=18,13,11,9;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=12;AC=6 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:48:10:221,0,48:2,8 0/1:33:.:118,0,30:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
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| 2 1680327 . C T 313.88 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-2.845;Dels=0;FQ=132;FS=1.7;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-1.364;PV4=0.67,7.4e-16,1,1;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.152;SF=0,1;VDB=0.0216;VQSLOD=3.96;culprit=FS;set=variant2;DP=70;DP4=2,12,5,15;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1680479 . A G 44.39 PASS AC1=1;AF1=0.5;BaseQRankSum=-1.754;Dels=0;FQ=31;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=-1.3;PV4=1,0.0015,1,0.07;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.3;SF=0,1;VDB=0.0092;VQSLOD=3.71;culprit=QD;set=variant2;DP=14;DP4=2,2,1,2;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. | |
| 2 1680545 rs115594029 G A 167.38 PASS AC1=1;AF1=0.5003;BaseQRankSum=1.733;DB;Dels=0;FQ=4.77;FS=0;HaplotypeScore=0;MQ0=0;MQ=60;MQRankSum=0.898;POSITIVE_TRAIN_SITE;PV4=0.38,0.025,1,1;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.898;SF=0,1;VDB=0.0193;VQSLOD=7.91;culprit=FS;set=variant2;DP=20;DP4=1,1,7,1;AF=0.5;MLEAC=1;MLEAF=0.5;AN=4;AC=2 GT:GQ:DP:PL:AD ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. 0/1:40:10:273,0,40:2,8 0/1:33:.:120,0,30:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:.:.:. ./.:.:. |
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