c2w reply

Een vergelijkbaar systeem voor R bestaat al veel langer die het combineert met LaTeX: Sweave (zie bv. [0]). En het tellen van het aantal woorden in LaTeX is geen probleem. Knitr is hier een uitbreiding op en kan in meerdere formaten uitvoer geven [1].

En LaTeX is ook bekend onder chemici, en heeft pakketen om chemische structuren te tekenen [2], en R heeft pakketen om te rekenen aan structuren [3].

0.http://www.r-bloggers.com/getting-started-with-sweave-r-latex-eclipse-statet-texlipse/
1.http://yihui.name/knitr/
2.http://ctan.org/pkg/chemfig
3.http://cran.r-project.org/web/packages/rcdk/index.html