No Windows eu recomendo o uso de algum bash ao invés do CMD, qualquer um que "emule um linux" vai ter o comando SSH, por exemplo o Git Bash que vem junto com o Git.
Caso ainda prefira o Putty, sem problemas.
Você pode baixar o Putty aqui: http://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/download.html