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gistfile1.js

$(function() {
    $('a.page-scroll').bind('click', function(event) {
        var $anchor = $(this);
        $('html, body').stop().animate({
            scrollTop: $($anchor.attr('href')).offset().top
        }, 1500, 'easeInOutExpo');
        event.preventDefault();
    });
});

// Highlight the top nav as scrolling occurs
$('body').scrollspy({
    target: '.navbar-fixed-top'
})

// Closes the Responsive Menu on Menu Item Click
$('.navbar-collapse ul li a').click(function() {
    $('.navbar-toggle:visible').click();
});

$(function() {
    $('a.page-scroll').bind('click', function(event) {

        var $anchor = $(this);
        var $topmenu = $('.navbar-fixed-top').height();

        $('html, body').stop().animate({
            scrollTop: $($anchor.attr('href')).offset().top - $topmenu
        }, 1500, 'easeInOutExpo');
        event.preventDefault();
    });
});

// Highlight the top nav as scrolling occurs
$('body').scrollspy({
    target: '.navbar-fixed-top'
});

// Closes the Responsive Menu on Menu Item Click
$('.navbar-collapse ul li a').click(function() {
    $('.navbar-toggle:visible').click();
}); 

Tente colocar o primeiro operando entre parênteses: ($($anchor.attr('href')).offset().top). Ficando assim: ($($anchor.attr('href')).offset().top) - $topmenu.

Ou então, ao invés de atribuir o var $topmenu = $('.navbar-fixed-top').height();, passe um literal inteiro para a subtração. Ex.: scrollTop: $($anchor.attr('href')).offset().top - 130

Aí, você vai testando até encontrar o valor correto. Ou tente inspecionar a altura do .navbar-fixed-top e acrescente uns 40px. =]