Baseado em uma resposta a uma questão que fiz no Yahoo! Respostas.

modos.js

var moedas = [0.01, 0.05, 0.10, 0.25, 0.50, 1.00, 2.00, 5.00, 10.00, 20.00, 50.00, 100.00];
var valor = 4.10 ;
function modos(troco,maior_moeda){
	if(maior_moeda < 0){
		return 1;
	}
	var contador = 0;
	while(troco >= 0 ){
		contador = contador + modos(troco, maior_moeda -1);
		troco = troco  - moedas[maior_moeda];
	}
	return contador;
}
console.log(modos(valor,12));