semi-automated image analysis with tracker (german)

image-analysis-guide.md

Auswertung einer Laue-Aufnahme mit dem Programm "Tracker"

Fabian Schmidt - Bonn, 08.12.2015

Veröffentlicht unter https://gist.github.com/kerel-fs/4c7c76b8c0a6fe491258.

Das Programm Tracker[1] eignet sich hervorragend zur Auswertung einer Laue-Aufnahme.

Installation

"Tracker" ist in Java geschrieben und unterstützt somit Windows, Linux und Mac OS X.

Möchte man es unter Linux nicht dauerhaft installieren (dazu benötigt es root-Rechte!), kann man es auch ohne Installation nutzen:

1. "Tracker" herunterladen:

   wget http://physlets.org/tracker/archives/tracker-4.91.jar
   

2. Java installieren (falls nötig)

   sudo apt-get install openjdk-8-jre
   

3. Programm starten

   java -jar tracker-4.91.jar
   

Nutzung

1. Bild laden

Der Rötgenfilm muss eingescannt vorliegen (jpg, png oder gif). Mit Datei-->Import-->Video das gescannte Bild laden.

2. Koordinatensystem festlegen

Mit Track-->Achsen-->sichtbar das Koordinatensystem anzeigen. Den Nullpunkt des Koordinatensystems in das Bildzentrum verschieben. Dann die Achsen solange drehen, bis sie den Achsen des Beugungsbildes entsprechen.

3. Maßstab festlegen

Mit Track-->Neu-->Kalibrierungswerkzeuge-->Kalibrierungsmaßstab einen neuen Maßstab erstellen. Im Bild erscheint nun ein Maßstab, diesen auf eine bekannte Länge ziehen (zB die Höhe des Films). Nun im Eingabefeld oben die wahre Länge des Maßstabs (zB 76 - die Höhe des Films in mm) festlegen.

4. Punkte vermessen

Mit Track-->Neu-->Punktmasse eine neue "Punktmasse" anlegen. Für "Punktmassen" kann ein "Weg" erfasst werden, die Wegpunkte sind die Beugungspunkte auf dem Rötgenfilm. Shift-Klick in das Bild, um dem Weg einen ersten Punkt hinzuzufügen (Punkte können später verschoben werden). Shift-Klick für jeden weiteren Punkt eines Weges.

Für jede Punkmasse kann ein Weg von bis zu 9 Datenpunkten angelegt werden. Es bietet sich an, logisch zusammenhängende Punkte ((2 4 2), (-2 -4 2), usw.) jeweils zu einem Weg zusammenzufassen.

5. Daten auslesen

Im rechten unteren Fenster werden die Koordinaten angezeigt. Durch einen Klick auf die Schaltfläche Daten kann man weitere Spalten anzeigen lassen (zB die y-Koordinate). Mit Auswahl-markieren-->Rechtsklick-->Kopiere ausgewählte Daten-->wie formatiert kopiert man die Daten in die Zwischenablage.

6. Daten in Tracker auswerten (optional)

Klicke dazu auf Daten, dann Definiere... Im oberen Teil des Dialogs kann man Konstanten eingeben (z.B. L = 11mm), im unteren Teil Funktionen definieren (z.B. z = sqrt(x*x+y*y+L*L)-L). Diese Funktionen stehen als weitere Spalten zur Verfügung, sie müssen für jede "Punktmasse" einzeln eingeben werden.

[1]: Tracker, http://physlets.org/tracker/