Skip to content

Instantly share code, notes, and snippets.

@kyu999

kyu999/アミノ酸配列周期性.md

Last active August 30, 2015 09:25
Show Gist options
  • Save kyu999/c60242beb3d29a966773 to your computer and use it in GitHub Desktop.
Save kyu999/c60242beb3d29a966773 to your computer and use it in GitHub Desktop.
Download ZIP
アミノ酸配列周期性
Raw
アミノ酸配列周期性.md

アミノ酸配列の周期性分析

手法1

  1. 文字列配列を一定の基準に従い写像する。 * 分子量 * 疎水度 * 等電点 * その他
  2. フーリエ変換、ウェーブレット変換、単変量時系列解析にかける

手法2

  1. 文字列配列を疎なベクトルへ変換する。e.g. [[0, 0, 0, 1], [1, 0, 0, 0]]
  2. 多変量時系列解析を行う。VARモデルやグレンジャー因果性検証
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment