Skip to content

Instantly share code, notes, and snippets.

@lisphilar
Last active March 29, 2021 16:00
Show Gist options
  • Save lisphilar/bedc2ec0b5f804f76d2f0a6282649757 to your computer and use it in GitHub Desktop.
Save lisphilar/bedc2ec0b5f804f76d2f0a6282649757 to your computer and use it in GitHub Desktop.
Model validation with version CovsirPhy 2.18.0-alpha, 3-9, 10-90 timepoints
Rt ID 10points 30points 50points 70points 90points
16.82 SIR_0 0.314717171 0.011034311 0.002520616 0.014469204 0.071081207
1.26 SIR_1 0.036655539 0.026937078 0.010028279 0.004636733 0.00658943
1.27 SIR_2 0.026461041 0.029392914 0.017846351 0.003072677 0.005037168
0.33 SIR_3 0.276617151 0.253496242 0.196360671 0.165957108 0.146362221
1.12 SIR_4 0.00707242 0.008105819 0.007531385 0.005787905 0.004439467
1.17 SIR_5 0.026529002 0.018423443 0.009383501 0.000955472 0.001082645
0.26 SIR_6 0.233857566 0.238233356 0.184701796 0.156115626 0.137751618
0.23 SIR_7 0.339147737 0.196061042 0.152094141 0.128733656 0.113700299
0.03 SIR-D_0 0.4898103 0.2825895 0.219077539 0.185003154 0.16316033
0.55 SIR-D_1 0.1644708 0.110807908 0.08775205 0.075678841 0.068050384
1.23 SIR-D_2 0.041794008 0.027040867 0.008613109 0.005327365 0.009092661
0.78 SIR-D_3 0.047153267 0.053267379 0.038872161 0.038291827 0.037976011
1.61 SIR-D_4 0.096439884 0.047866665 0.007874365 0.005330446 0.006165847
0.67 SIR-D_5 0.408941694 0.347980414 0.271211457 0.230615772 0.20461145
0.06 SIR-D_6 0.316725836 0.187375314 0.148554228 0.128371705 0.115631698
2.65 SIR-D_7 0.163944455 0.051435197 0.007054101 0.011399528 0.02067276
0.67 SIR-F_0 0.032583663 0.038177261 0.04233819 0.039256879 0.041715067
0.12 SIR-F_1 0.177642849 0.171174539 0.157091675 0.151668186 0.138398404
0.55 SIR-F_2 0.064105622 0.074132896 0.073918853 0.074921265 0.074868095
0.12 SIR-F_3 0.044749617 0.042606836 0.040103787 0.038796407 0.038413957
0.22 SIR-F_4 0.075916663 0.060296269 0.057577321 0.056393524 0.055915912
1.31 SIR-F_5 0.015690917 0.015784556 0.015295354 0.039972572 0.010730861
0.28 SIR-F_6 0.080174505 0.029287923 0.026762864 0.027477579 0.026287064
0.66 SIR-F_7 0.042191162 0.04922289 0.043610253 0.048207939 0.044843721
ID 3points 10points 90points
SIR_0 0.098646456 0.314717171 0.071081207
SIR_1 0.018087396 0.036655539 0.00658943
SIR_2 0.013371474 0.026461041 0.005037168
SIR_3 0.080841275 0.276617151 0.146362221
SIR_4 0.004325347 0.00707242 0.004439467
SIR_5 0.014197155 0.026529002 0.001082645
SIR_6 0.067972453 0.233857566 0.137751618
SIR_7 0.112235914 0.339147737 0.113700299
SIR-D_0 0.412214355 0.4898103 0.16316033
SIR-D_1 0.057163033 0.1644708 0.068050384
SIR-D_2 0.021998966 0.041794008 0.009092661
SIR-D_3 0.026072044 0.047153267 0.037976011
SIR-D_4 0.041477735 0.096439884 0.006165847
SIR-D_5 0.112830345 0.408941694 0.20461145
SIR-D_6 0.350529974 0.316725836 0.115631698
SIR-D_7 0.062223423 0.163944455 0.02067276
SIR-F_0 0.021470057 0.032583663 0.041715067
SIR-F_1 0.113285431 0.177642849 0.138398404
SIR-F_2 0.044917419 0.064105622 0.074868095
SIR-F_3 0.034158827 0.044749617 0.038413957
SIR-F_4 0.054825168 0.075916663 0.055915912
SIR-F_5 0.010047915 0.015690917 0.010730861
SIR-F_6 0.058422401 0.080174505 0.026287064
SIR-F_7 0.027658059 0.042191162 0.044843721
Rt ID 3points 4points 5points 6points 7points 8points 9points
16.82 SIR_0 0.098646456 0.134232246 0.166875978 0.197491916 0.227961275 0.258210455 0.287987787
1.26 SIR_1 0.018087396 0.022158456 0.02543228 0.028120749 0.030641187 0.03297612 0.034780166
1.27 SIR_2 0.013371474 0.016344573 0.018463326 0.020474146 0.022041265 0.023529593 0.025093272
0.33 SIR_3 0.080841275 0.111818011 0.141418229 0.172471 0.20032178 0.235055236 0.252988966
1.12 SIR_4 0.004325347 0.00518324 0.005789091 0.006258505 0.006411784 0.006809977 0.006834451
1.17 SIR_5 0.014197155 0.016921171 0.019026672 0.020842044 0.022406226 0.023849637 0.025311642
0.26 SIR_6 0.067972453 0.093151421 0.119490265 0.141876335 0.168310961 0.187872268 0.208093918
0.23 SIR_7 0.112235914 0.158989719 0.200648016 0.246134157 0.260047452 0.318015287 0.348127873
0.03 SIR-D_0 0.412214355 0.554342836 0.599210904 0.584730876 0.584982785 0.547214405 0.515925703
0.55 SIR-D_1 0.057163033 0.07220803 0.088888696 0.105530008 0.117003809 0.134965985 0.147892447
1.23 SIR-D_2 0.021998966 0.026691983 0.030146876 0.033300112 0.036079398 0.038506638 0.040523043
0.78 SIR-D_3 0.026072044 0.030377449 0.033819654 0.036398528 0.039515331 0.041258599 0.044027924
1.61 SIR-D_4 0.041477735 0.051817648 0.060485255 0.068451797 0.075902281 0.082934249 0.090297117
0.67 SIR-D_5 0.112830345 0.15961919 0.200813639 0.246809987 0.300110754 0.335652363 0.370267994
0.06 SIR-D_6 0.350529974 0.435371835 0.445111083 0.406842725 0.377138218 0.353224306 0.333440969
2.65 SIR-D_7 0.062223423 0.079327805 0.094846991 0.109332984 0.123485873 0.13741257 0.151387137
0.67 SIR-F_0 0.021470057 0.025187178 0.027694113 0.02931797 0.030780116 0.031127159 0.032035428
0.12 SIR-F_1 0.113285431 0.132070686 0.139525204 0.149831415 0.157371937 0.164369913 0.174376845
0.55 SIR-F_2 0.044917419 0.051066447 0.055244318 0.058560209 0.060404349 0.062980108 0.063521823
0.12 SIR-F_3 0.034158827 0.038942658 0.041380937 0.043340324 0.044534413 0.045090918 0.044983465
0.22 SIR-F_4 0.054825168 0.062778839 0.067354963 0.072139914 0.068348063 0.074478086 0.079183225
1.31 SIR-F_5 0.010047915 0.011914938 0.012777425 0.014279461 0.015285965 0.014878871 0.015323334
0.28 SIR-F_6 0.058422401 0.063481307 0.068920337 0.073971315 0.077807471 0.077515773 0.079420101
0.66 SIR-F_7 0.027658059 0.032560617 0.035537751 0.037497584 0.038741167 0.040207707 0.040949954
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment