Skip to content

Instantly share code, notes, and snippets.

@maksbotan
Last active January 25, 2021 09:08
Show Gist options
  • Star 0 You must be signed in to star a gist
  • Fork 0 You must be signed in to fork a gist
  • Save maksbotan/28a38c9133cbb4143f059a29406d6862 to your computer and use it in GitHub Desktop.
Save maksbotan/28a38c9133cbb4143f059a29406d6862 to your computer and use it in GitHub Desktop.
Как установить Python для курса по биоинформатике

Как установить Python для курса по биоинформатике

Наш курс включает в себя решения задач на практических занятиях, а также домашние задания. Для этого вам понадобится ноутбук с Python.

Если у вас уже установлен Python и вы уверены, что умеете им пользоваться, переходите сразу к разделам "Установка нужных библиотек" и "Дополнительные материалы".

Если у вас Mac — попробуйте адаптировать эту инструкцию для себя или обратитесь за помощью к организаторам курса. Если же у вас Linux, то вы скорее всего сами всё знаете. Если что-то всё же не получается, попросите помощи в нашем чате.

Установка Python

Мы будем пользоваться Python 3.8. Скачать его можно по этой ссылке. Запустите скачанный файл для установки.

Рекомендуем на первом экране нажать "Customize installation":

py1

и на следующем выбрать "Install for all users" и "Add Python to environment variables":

py2

Установка редактора

Теоретически, код на Python можно писать в любом текстовом редакторе, включая Блокнот. Однако решать задачу будет гораздо удобнее если установить специально для этого предназначенный.

Мы рекомендуем пользоваться Visual Studio Code. Скачать можно здесь.

Настройка VS Code

Нам понадобится установить расширение VS Code, включающее поддержку Python. Для этого нажмите нижнюю кнопку в левой панели (состоит из 4 квадратиков), введите в строке поиска "Python", выберите первое расширение (как на картинке ниже) и нажмите зеленую кнопку Install.

image

Создайте новый файл ("File" -> "New File") и сохраните его с расширением .py, например hello.py.

Если всё установлено правильно, в левом нижнем углу вы увидите надпись "Python 3.8.7 64-bit". Это значит, что VS Code "увидел" Python, который вы установили.

Запуск ваших программ

Напишите в этом новом файле такой код:

print("Hello, world!")

Теперь нажмите в любом месте правой кнопкой мыши и выберите пункт "Run Python File in Terminal". Внизу экрана вы увидите окно Terminal, в котором будет напечатана строка "Hello, world!".

Установка нужных библиотек

В наших заданиях нам понадобятся библиотеки numpy и biopython. Самый простой способ их установить — перейти в окно Terminal в VS Code и набрать там команду

pip3 install --user numpy biopython

Если эта команда не выведет никаких ошибок (красным текстом), значит вы готовы к нашему курсу!

Дополнительные материалы

Если вы ещё никогда не писали на Python или просто не уверены в своих знаниях, рекомендуем несколько хороших материалов.

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment