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    MacでNintendo Switch用のSDカードをマウントしてしまうと不要な隠しファイルやフラグが立ってしまいNintendo Switchで使えなくなるのを解消する。
下の方で引用している記事を参考にしてどうになかったので、残しておく。
MacにNintendo SwitchのSDカードをマウントしてバックアップを取ったが、Switchに刺しても認識されなくなった。
任天堂ではWindowsでのみ扱うことを推奨している。
一度Macにマウントして使ってしまうと、Windowsで扱ったりしてももう戻せない。
次の手順でSDカードのフラグや不要なファイルを削除すればなんとかなる。

MacにSDカードをマウント

このとき、Finderを絶対開かない。


次のコマンドでSDカードの内容をNintendo Switchが想定している状態に戻す。
sudo chflags -R arch /Volumes/Untitled/
sudo chflags -R noarch /Volumes/Untitled/Nintendo/
sudo mdutil -i off /Volumes/Untitled/
sudo mdutil -E /Volumes/Untitled/
dot_clean -m /Volumes/Untitled/

（このステップは不要またはMacでもできるかも）Windowsに挿して、隠しファイルになっているFinderの以下のフォルダを削除

.Trashes ※ゴミ箱
.Spotlight-V* ※Spotlightのキャッシュ
rm -rf .Trashes .Spotlight-V* でもよさそうだけど試していない。


Nintendo Switchに刺すと認識される。


以下、この記事の内容をアーカイブしたいので持ってきただけ。
from: https://www.reddit.com/r/NintendoSwitch/comments/emjvdf/how_to_transfer_sd_card_data_using_macos/
How to transfer SD card data using macOS

If you're using windows, just follow Nintendo's advice, but if you're using macOS / OSX you end up with annoying error messages telling you your card is corrupt. It took me ages to figure this out, so I thought I'd share. I read this post and was convinced it might not be possible, but I just upgraded my 128GB card to a 256GB without losing (or having to re-download) any content. Hope this helps someone here.
Steps are as follows:

Backup the Nintendo folder from your original SD card. You can just drag and drop it to your Desktop, but just to be on the safe side I ran Disk Utility and selected File -> New Image -> Image from "disk2s1". Your SD card may be named differently.
Format the new SD card in the Switch
Eject the old SD card and insert the new SD card into your mac
Copy contents of the Nintendo folder from your copy onto the new SD card (if you did it via an image, then double-click on your image file to mount it, then copy from there). Select Replace all files if prompted.
Wait for ages for the data to copy...
Close all Finder windows then run Terminal
From the Terminal, run the following commands (After formatting my SD card was called "Untitled", if yours isn't called then, then adjust accordingly). These commands will require your admin password.

sudo chflags -R arch /Volumes/Untitled/
sudo chflags -R noarch /Volumes/Untitled/Nintendo/
sudo mdutil -i off /Volumes/Untitled/
sudo mdutil -E /Volumes/Untitled/
dot_clean -m /Volumes/Untitled/
You're now done, eject the SD card and it should work in the Switch.
If you want to know what the commands do, in order they:

Set the archive bit ON for the SD Card
Set the archive bit OFF for the Nintendo folder
Stop macOS from indexing the SD Card
Removes hidden files added by Finder
Another way to remove hidden files added by Finder - running both won't cause any harm