Install basic packages for STA 580

installer

source("https://gist.githubusercontent.com/nutterb/23dee9325312d9a71ed5828df1ffd24a/raw/e6d1f2a05b774289246cf28f90902ece4763f92d/packages.R")

packages.R

setRepositories(ind = 1:2)

install.packages(
  c("abind", "acepack", "assertthat", "backports",  
    "base64enc", "BH", "BiocGenerics", "bitops",  
    "bookdown", "boot", "brew", "broom", "caTools", 
    "checkmate", "chron", "class", "cluster", "coda", 
    "codetools", "colorspace", "condformat", 
    "curl", "data.table", "DBI", "devtools", 
    "DiagrammeR", "dichromat", "digest", "doParallel", "dplyr", 
    "evaluate", "foreach", "foreign", "forestplot", "formatR", 
    "Formula", "gdata", "ggplot2", "git2r", "Gmisc", "gplots", 
    "graph", "gRbase",  
    "gridBase", "gridExtra", "gsubfn", "gtable", "gtools", 
    "highr", "Hmisc", "htmlTable", "htmltools", "htmlwidgets", 
    "httpuv", "httr", "HydeNet", "igraph", "influenceR", 
    "irlba", "iterators", "jsonlite", "KernSmooth", "knitr", 
    "labeling", "lattice", "latticeExtra", "lazyeval", 
    "lazyWeave", "lme4", "lmerTest", "lubridate", "magrittr", 
    "markdown", "MASS", "Matrix", "MatrixModels", "memoise", 
    "mgcv", "microbenchmark", "mime", "miniUI", 
    "minqa", "mnormt", "multcomp", "munsell", "mvtnorm", 
    "nlme", "nloptr", "NMF", "nnet", "openssl", "packrat", 
    "pixiedust", "pkgmaker", "PKI", "plyr", 
    "polspline", "proto", "psych", "quantreg", "R6", "RBGL", 
    "RColorBrewer", "Rcpp", "RcppArmadillo", "RcppEigen", 
    "RCurl", "readxl", "redcapAPI", "registry", "reshape2", 
    "rjags", "rJava", "RJSONIO", "rmarkdown", "rms", 
    "rngtools", "RODBC", "RODBCext", "roxygen2", "rpart", 
    "RSQLite", "rstudioapi", "sandwich", "scales", 
    "sendmailR", "shiny", "shinyjs", "SparseM", "spatial", 
    "sqldf", "stringi", 
    "stringr", "survival", "tableHTML", "TH.data", 
    "tibble", "tidyr", "translations", 
    "visNetwork", "whisker", "withr", "xlsx", "xlsxjars", 
    "XML", "xtable", "yaml", "zoo")
)