OpenCVSharpをインストールしたときに動作確認のために試すコード。公式サイトのコードをそのまま引用し、Matの処理だけ追記してます。

_sampleFirstOpenCVSharp.cs

//This code is quoted from the following URL
//http://schima.hatenablog.com/entry/2013/12/15/110513
using (var img = new IplImage(@"C:\OpenCv\Lena.png")) {

 //Matが使えないケースがたまにあるので、最初に確認しておきましょう
 Mat mat = new Mat(img);
 Cv2.ImShow("mat",mat);
 
 Cv.SetImageROI(img, new CvRect(200, 200, 180, 200));
 Cv.Not(img, img);
 Cv.ResetImageROI(img);

 using (new CvWindow(img)) {
  Cv.WaitKey();
 }
}