Pour produire ce geojson, je suis d'abord parti du geojson des départements français simplifiés de france-geojson.
J'ai ensuite remplacé les départements de l'île de France par ceux du gist de @maximepvrt.
Enfin, pour les DOM, j'ai eu beaucoup de mal à effectuer une translation sur la carte sans créer de "déformation" (une déformation liée à la projection mercator, qui fait que si nous changeons de latitude, les formes paraissent allongées ou écrasées, par rapport à la forme dont nous avons l'habitude).
Je suis parti d'une carte de la France en format SVG et j'ai utilisé svg-to-json pour placer les contours des DOM au bon endroit et produire un geojson avec des formes aux dimensions et au positionnement désiré (NB: le positionnement de la web app ne fonctionnait pas, alors j'ai du rentrer le SCALE et mouseCoordinates à la main dans app.js).
J'ai fait tout ça pour une intégration dans Metabase qui loge sur un seul graphique.