EmacsでScalaのプロジェクトを編集して保存すると発生するバックアップファイルをsbtのcleanタスクで削除するためのbuild.sbtの設定例。

build.sbt.for.emacs

# Add the following line at the first line of build.sbt
import java.io.File

# The following lines may be added at anywhere in build.sbt 
def ls(dir:String) : Seq[File] = {
  new File(dir).listFiles.flatMap {
    case f if f.isDirectory => ls(f.getPath)
    case x => List(x)
  }
}

cleanFiles ++= ls(".").filter(_.getPath.endsWith("~"))