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March 30, 2022 02:54
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| Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides pHis3_01 Peptides pHis3_02 Peptides pHis3_03 Peptides SMC1_01 Peptides SMC1_02 Peptides SMC1_03 Razor + unique peptides pHis3_01 Razor + unique peptides pHis3_02 Razor + unique peptides pHis3_03 Razor + unique peptides SMC1_01 Razor + unique peptides SMC1_02 Razor + unique peptides SMC1_03 Unique peptides pHis3_01 Unique peptides pHis3_02 Unique peptides pHis3_03 Unique peptides SMC1_01 Unique peptides SMC1_02 Unique peptides SMC1_03 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Sequence coverage pHis3_01 [%] Sequence coverage pHis3_02 [%] Sequence coverage pHis3_03 [%] Sequence coverage SMC1_01 [%] Sequence coverage SMC1_02 [%] Sequence coverage SMC1_03 [%] Intensity Intensity pHis3_01 Intensity pHis3_02 Intensity pHis3_03 Intensity SMC1_01 Intensity SMC1_02 Intensity SMC1_03 LFQ intensity pHis3_01 LFQ intensity pHis3_02 LFQ intensity pHis3_03 LFQ intensity SMC1_01 LFQ intensity SMC1_02 LFQ intensity SMC1_03 MS/MS count pHis3_01 MS/MS count pHis3_02 MS/MS count pHis3_03 MS/MS count SMC1_01 MS/MS count SMC1_02 MS/MS count SMC1_03 MS/MS count Peptide sequences Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions Taxonomy IDs | |
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ADELISVGEK;AGNREPPSTPSTLPK;APKPSTLANYYENLVK;APPPFRPENAIK;AQELAEATR;AQELAEATRK;ATVSPDKAK;AVLDLLR;DPFDIFASTASK;EFEAIKER;EMEEAIEQR;EVDKLQETDTANYEAMK;FIDLVESK;FKEHVSGTK;FLEIGVELK;FLEIGVELKK;FQQVDVSVK;FTTVSQSELYK;FTWESYR;GHVYIDPNEAK;HMEHAALHAEQDAEVR;KAELEAAKK;KFIDLVESK;KLDHTER;KLIQGSTEGLVSVGAVAR;KVELPLLQK;LATLPAPLDLSAWDIEK;LDMIAQK;LEEEAHRR;LELWHEAYR;LIQGSTEGLVSVGAVAR;LLELSNVLHDVDSFNNASYMEK;LLKDGLHQYK;LLKDGLHQYKK;LLNLDAK;LLNLDAKPTR;LLNLDAKPTRK;LYSTNPR;MITEVNAK;NLVMVYDDYLK;NNALLEITYSGVVKK;QAALQSLHDFITAR;QHLDAANYQQSK;QQLENLLVK;QREMEEAIEQR;RADELISVGEK;RAPKPSTLANYYENLVK;RAQELAEATRK;RKEEIANAER;RRYEEAIAR;RYEEAIAR;SGNNLVDLSDADTLQR;SIEDVFHLMK;SLDLDTIK;SLDLDTIKQVIIAEVSK;SLLQAAVEDYVSITIDHESAK;TAGGSSPATPATPATPATPTPSSGPK;TAGGSSPATPATPATPATPTPSSGPKK;TMHFCLK;TYFSQYIAPLRDVIMR;TYSSTIFLSAISTQLDEIPSIGYDPHLR;VFFVSGDPLLHTTAWK;VFFVSGDPLLHTTAWKK;VFVAASQK;VTFAKDPFDIFASTASK;WATPSTVEPVVFK;YEEAIAR 97 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| YCL042W YCL042W 1 1 1 YCL042W pep chromosome:R64-1-1:III:50584:50943:1 gene:YCL042W transcript:YCL042W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; epitope-tagged protein localizes to the cytoplasm [Source: 1 1 1 1 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 7.6 7.6 7.6 13.36 119 119 0.0044843 1.6736 0 7.6 7.6 0 7.6 0 124350000 0 19346000 86370000 0 18633000 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 3 ILDAALAPR 146 4232 True 4406 15980;15981;15982 16091;16092;16093 16091 -1 | |
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| YCL044C YCL044C 1 1 1 YCL044C pep chromosome:R64-1-1:III:47111:48364:-1 gene:YCL044C transcript:YCL044C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MGR1 description:Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex; i-AAA degrades 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 2.4 2.4 2.4 47.156 417 417 0.0080175 1.4615 0 2.4 0 0 0 0 853140 0 853140 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 DIADFPTLNR 148 1166 True 1219 4749 4777 4777 -1 | |
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| YCR034W YCR034W 1 1 1 YCR034W pep chromosome:R64-1-1:III:190592:191635:1 gene:YCR034W transcript:YCR034W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Fatty acid elongase, involved in sphingolipid biosynthesis; acts on fatty acids of up to 24 ca 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 2.9 2.9 2.9 40.002 347 347 0 4.412 2.9 0 2.9 2.9 2.9 0 58308000 20846000 0 18389000 11218000 7854900 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 4 VNEYVNVDLK 161 11281 True 11812 43259;43260;43261;43262 43558;43559;43560;43561 43560 -1 | |
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| YCR057C YCR057C 10 10 10 YCR057C pep chromosome:R64-1-1:III:220457:223228:-1 gene:YCR057C transcript:YCR057C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PWP2 description:Conserved 90S pre-ribosomal component; essential for proper endonucleolytic 1 10 10 10 6 4 9 4 3 4 6 4 9 4 3 4 6 4 9 4 3 4 9.8 9.8 9.8 103.98 923 923 0 22.935 6.9 4.3 8.8 4.3 3.3 4.3 149740000 20207000 13186000 80862000 10756000 4273600 20454000 8984700 7547400 8500500 6332800 6161100 8286000 5 4 8 4 3 4 28 FILTTSK;FSNLLGTVYR;GQISIFNIEDAK;HFFYANQAK;IWSIFGR;LFALASGR;LLAVGFTSGEFR;NMALNGTLEFLNSK;NMALNGTLEFLNSKK;VSVFDLINNK 165 2327;2614;3231;3493;4849;5673;6082;7665;7666;11464 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2413;2710;3349;3628;5053;5913;6332;8052;8053;11999 8816;9840;9841;9842;9843;9844;12170;12171;12172;12173;12174;13233;18336;21599;21600;21601;21602;21603;21604;23217;23218;29261;29262;29263;43990;43991;43992;43993;43994;43995 8863;9893;9894;9895;9896;9897;12258;12259;12260;12261;12262;13324;18456;21730;21731;21732;21733;21734;21735;23358;23359;29446;29447;29448;44297;44298;44299;44300;44301;44302 8863;9895;12260;13324;18456;21730;23358;29446;29447;44301 -1 | |
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| YCR095C YCR095C 1 1 1 YCR095C pep chromosome:R64-1-1:III:288170:289258:-1 gene:YCR095C transcript:YCR095C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OCA4 description:Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus; S. cerev 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3 3 3 41.647 362 362 0.00083963 2.7212 3 3 0 3 3 0 7606000 2893800 2570300 0 1354300 787640 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 1 0 4 LLTLINQIETK 173 6265 True 6525 23833;23834;23835;23836 23979;23980;23981;23982 23980 -1 | |
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| YDR064W YDR064W 12 12 12 YDR064W pep chromosome:R64-1-1:IV:579458:580452:1 gene:YDR064W transcript:YDR064W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS13 description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mammali 1 12 12 12 8 9 8 8 8 11 8 9 8 8 8 11 8 9 8 8 8 11 66.2 66.2 66.2 17.029 151 151 0 48.646 45 53 45.7 57.6 48.3 61.6 9109300000 1486999999.9999998 822130000 3267199999.9999995 742510000 355310000 2435200000 435970000 286130000 415740000 298140000 344940000 407280000 11 11 12 10 8 14 66 DAHGVTQAR;FRLILIESR;GISSSAIPYSR;GLTPSQIGVLLR;KGLTPSQIGVLLR;LILIESR;LSSESVIEQIVK;NAPAWFK;SNGLAPEIPEDLYYLIK;SNGLAPEIPEDLYYLIKK;TVAVLPPNWK;YESATASALVN 254 1063;2578;3030;3152;5039;5946;6667;7298;9322;9323;10597;11861 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1113;2674;3140;3266;5249;6196;6946;7663;9781;9782;11102;12417 4384;4385;4386;4387;4388;9738;9739;11418;11419;11420;11868;11869;11870;11871;11872;19126;19127;19128;19129;19130;19131;19132;19133;19134;19135;22670;22671;22672;22673;22674;25299;25300;25301;25302;25303;27823;35496;35497;35498;35499;35500;35501;35502;35503;35504;35505;35506;35507;35508;35509;35510;35511;35512;35513;35514;35515;40311;40312;40313;40314;40315;40316;45614;45615;45616 4411;4412;4413;4414;4415;9791;9792;11502;11503;11504;11956;11957;11958;11959;11960;19250;19251;19252;19253;19254;19255;19256;19257;19258;19259;22806;22807;22808;22809;22810;25454;25455;25456;25457;25458;27999;35707;35708;35709;35710;35711;35712;35713;35714;35715;35716;35717;35718;35719;35720;35721;35722;35723;35724;35725;35726;40556;40557;40558;40559;40560;40561;40562;40563;40564;45931;45932;45933 4413;9791;11502;11960;19255;22808;25454;27999;35708;35718;40557;45931 -1 | |
| YDR067C YDR067C 2 2 2 YDR067C pep chromosome:R64-1-1:IV:582791:583465:-1 gene:YDR067C transcript:YDR067C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OCA6 description:Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus; S. cerevi 1 2 2 2 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 11.2 11.2 11.2 26.024 224 224 0.00083264 2.6743 0 0 3.6 0 7.6 0 3247500 0 0 1707200 0 1540300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 2 EINLPFLR;TLVTPLQFSTVQPNLYR 255 1720;10332 True;True 1789;10828 6799;39373 6841;39611 6841;39611 -1 | |
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| YDR296W YDR296W 2 2 2 YDR296W pep chromosome:R64-1-1:IV:1055212:1055892:1 gene:YDR296W transcript:YDR296W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MHR1 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; also involved in homol 1 2 2 2 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 8.4 8.4 8.4 26.894 226 226 0.00086207 2.9478 4.4 4 0 4 0 0 4814500 1177100 1832100 0 1805300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 2 FRPASWFEK;VFENATPAEK 306 2580;10869 True;True 2676;11387 9747;9748;41562 9800;9801;41855 9800;41855 -1 | |
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| YDR483W YDR483W 2 2 2 YDR483W pep chromosome:R64-1-1:IV:1421157:1422485:1 gene:YDR483W transcript:YDR483W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KRE2 description:Alpha1,2-mannosyltransferase of the Golgi; involved in protein mannosylation 1 2 2 2 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 6.8 6.8 6.8 51.386 442 442 0 5.0235 3.8 0 2.9 0 0 2.9 14133000 2611100 0 8452600 0 0 3069100 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 3 TTMDYITPSFANK;WGDAPVHSIAAALFLPK 352 10559;11702 True;True 11061;12254 40123;40124;45038 40367;40368;45353 40367;45353 -1 | |
| YDR487C YDR487C 1 1 1 YDR487C pep chromosome:R64-1-1:IV:1428354:1428980:-1 gene:YDR487C transcript:YDR487C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RIB3 description:3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase (DHBP synthase); required for 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 8.2 8.2 8.2 22.567 208 208 0 6.3035 8.2 8.2 0 8.2 0 0 5680400 1571000 1971400 0 2137900 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 2 HGIPLISIEELAQYLKK 353 3514 True 3652 13336;13337;13338 13427;13428;13429 13427 -1 | |
| YDR490C YDR490C 2 2 2 YDR490C pep chromosome:R64-1-1:IV:1431968:1434268:-1 gene:YDR490C transcript:YDR490C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PKH1 description:Serine/threonine protein kinase; involved in sphingolipid-mediated signalin 1 2 2 2 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 3.8 3.8 3.8 86.251 766 766 0.00085106 2.862 2.7 1 2.7 2.7 0 2.7 15020000 3415800 2265900 3274300 1458500 0 4605000 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 1 5 LINGLPDR;YYASQIIDAVDSLHNIGIIHR 354 5957;12293 True;True 6207;12861 22718;47296;47297;47298;47299 22854;47626;47627;47628;47629 22854;47628 -1 | |
| YDR494W YDR494W 6 6 6 YDR494W pep chromosome:R64-1-1:IV:1436930:1438015:1 gene:YDR494W transcript:YDR494W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSM28 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit; genetic interactions 1 6 6 6 2 0 3 1 1 5 2 0 3 1 1 5 2 0 3 1 1 5 21.3 21.3 21.3 41.215 361 361 0 16.687 5.5 0 10.5 3 3 16.3 151940000 10646000 0 73485000 3011800 3287600 61511000 6067800 0 14126000 0 0 15106000 2 0 3 1 1 5 12 EPQLQNLLIEEDPEDFHR;KLVYDVCSGMKPISELQQ;LVNFTLDSLKK;LVQNSQVVR;SPNLGILK;VHDFTLNTPNFGK 355 1929;5199;6851;6866;9395;10979 True;True;True;True;True;True 2005;5417;7138;7153;9858;11500 7389;19758;26072;26073;26074;26075;26076;26120;26121;26122;35795;41973 7432;19883;26232;26233;26234;26235;26236;26281;26282;26283;36007;42269 7432;19883;26233;26282;36007;42269 -1 | |
| YDR496C YDR496C 16 16 16 YDR496C pep chromosome:R64-1-1:IV:1441433:1443403:-1 gene:YDR496C transcript:YDR496C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PUF6 description:Pumilio-homology domain protein; binds the 3 UTR of ASH1 mRNA and represse 1 16 16 16 6 5 9 8 8 10 6 5 9 8 8 10 6 5 9 8 8 10 25.6 25.6 25.6 75.105 656 656 0 55.905 14 8.1 14.8 14.6 13.1 17.5 799290000 67696000 34673000 354400000 79120000 42706000 220700000 35275000 35456000 50435000 37834000 33747000 51110000 7 5 9 9 8 11 49 ALKNHAEK;DCISDLVLK;EFWGSEYAVFR;EKLSNEIWELSKDCISDLVLK;ETHKDLTIEK;FYVLATSAYGK;GSTGFQILHAAMR;HREGAYVVEDLFVLYATHEQR;ITTDESNKGSQLLAK;IVQTLVK;LSNEIWELSK;NLIGTITASVEK;QTIINELHGSLR;QTIINELHGSLRK;VCESSIEKR;VIPLKNVQGLGVPFAEK 356 508;1099;1631;1762;1998;2767;3312;3637;4733;4810;6631;7612;8325;8326;10774;11049 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 538;1151;1697;1831;2076;2868;3435;3784;4932;5013;6910;7993;8742;8743;11288;11577 2170;4505;4506;6429;6430;6431;6432;6433;6933;6934;6935;6936;6937;7600;7601;7602;7603;10455;10456;10457;12494;13798;17885;17886;17887;17888;17889;17890;17891;17892;18161;18162;18163;18164;18165;25168;29012;29013;29014;29015;29016;31570;31571;31572;41191;41192;41193;41194;42288 2177;4533;4534;6467;6468;6469;6470;6471;6975;6976;6977;6978;6979;7644;7645;7646;7647;10524;10525;10526;12583;13891;18004;18005;18006;18007;18008;18009;18010;18011;18280;18281;18282;18283;18284;25323;29197;29198;29199;29200;29201;31767;31768;31769;41455;41456;41457;41458;42586 2177;4534;6470;6977;7644;10526;12583;13891;18005;18282;25323;29198;31767;31769;41458;42586 -1 | |
| YDR500C YDR500C 4 3 3 YDR500C pep chromosome:R64-1-1:IV:1450198:1450853:-1 gene:YDR500C transcript:YDR500C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL37B description:Ribosomal 60S subunit protein L37B; required for processing of 27SB pre-r 1 4 3 3 4 2 2 1 1 2 3 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 44.3 33 33 9.8682 88 88 0 8.5399 44.3 23.9 23.9 12.5 12.5 23.9 522860000 59297000 29797000 240730000 43026000 31083000 118930000 48010000 0 0 60677000 63834000 0 4 1 1 2 2 1 11 FKNGFQTGSAK;GKGTPSFGKR;SHNWAAK;TCSSCGYPSAK 357 2371;3048;8939;9905 True;False;True;True 2457;3158;9380;10390 8959;8960;8961;8962;8963;8964;8965;8966;8967;11492;11493;11494;11495;33959;37764 9007;9008;9009;9010;9011;9012;9013;9014;9015;11577;11578;11579;11580;34165;37997 9008;11578;34165;37997 -1 | |
| YDR502C YDR502C 17 3 3 YDR502C pep chromosome:R64-1-1:IV:1453310:1454464:-1 gene:YDR502C transcript:YDR502C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SAM2 description:S-adenosylmethionine synthetase; catalyzes transfer of the adenosyl group o 1 17 3 3 7 11 10 12 7 9 2 2 0 2 0 2 2 2 0 2 0 2 31.8 7 7 42.255 384 384 0 5.539 23.4 22.7 24.2 28.9 15.9 20.6 32481000 6080300 7212800 0 6722300 0 12466000 3440200 6722500 0 6095200 0 0 2 2 0 2 0 2 8 ARLDYQQIVR;DMLDENTK;DMLDENTKYFIQPSGR;FVIGGPQGDAGLTGR;FVIGGPQGDAGLTGRK;IGYDDSAK;IIVDAYGGASSVGGGAFSGKDYSK;KIIVDAYGGASSVGGGAFSGK;KIIVDAYGGASSVGGGAFSGKDYSK;LDYQQIVR;LNMAMADAR;LNMAMADARR;NFDLRPGVLVK;SLVAAGLCK;SLVAAGLCKR;TQVTVEYEDDNGRWVPK;YFIQPSGR 358 758;1328;1329;2705;2706;4046;4157;5079;5080;5629;6365;6366;7366;9269;9270;10455;11880 True;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;True;False 800;1385;1386;1387;1388;2801;2802;4212;4328;5289;5290;5867;6630;6631;7736;9723;9724;10956;12436 3161;5331;5332;5333;5334;5335;5336;5337;5338;5339;5340;5341;10188;10189;10190;10191;10192;10193;10194;10195;10196;10197;10198;15311;15734;15735;19276;19277;19278;19279;21464;21465;21466;24163;24164;24165;24166;24167;24168;24169;28116;28117;28118;28119;28120;28121;28122;28123;35301;35302;35303;35304;35305;39802;39803;39804;39805;45686;45687;45688;45689 3173;5368;5369;5370;5371;5372;5373;5374;5375;5376;5377;5378;10244;10245;10246;10247;10248;10249;10250;10251;10252;10253;10254;10255;10256;10257;10258;15421;15845;15846;19400;19401;19402;19403;21594;21595;21596;24312;24313;24314;24315;24316;24317;24318;28295;28296;28297;28298;28299;28300;28301;28302;35509;35510;35511;35512;35513;40044;40045;40046;40047;46004;46005;46006;46007 3173;5369;5376;10249;10255;15421;15846;19401;19403;21596;24316;24318;28302;35511;35513;40044;46004 176 224 -1 | |
| YDR507C YDR507C 12 12 12 YDR507C pep chromosome:R64-1-1:IV:1462358:1465786:-1 gene:YDR507C transcript:YDR507C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GIN4 description:Protein kinase involved in bud growth and assembly of the septin ring; prop 1 12 12 12 7 5 2 0 3 1 7 5 2 0 3 1 7 5 2 0 3 1 15.5 15.5 15.5 129.86 1142 1142 0 36.138 9.4 6.6 2.7 0 3.2 2 72099000 22243000 15187000 14489000 0 10792000 9388000 8536800 8380400 0 0 12601000 0 6 5 3 0 3 1 18 AINGNSIPAIKDNTIGPWK;ESFTNLVDILK;FLGSSFNIDKELK;LDPGIMFSSPTEEVSPVEPK;LGETLGLGSTGK;LPFDEEDGNIR;LSTIVNQSSPTPASR;NINHLEVDIDNILR;QIEIDISDLEQELSK;TLYALLYR;TSSNFATLIDEIFEYEKYEQIRK;VVSDSNDGYESLILPK 359 364;1966;2421;5602;5762;6424;6682;7504;8113;10333;10523;11611 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 386;2043;2508;5839;6004;6695;6961;7881;8523;10829;11025;12160 1589;1590;7506;9159;9160;21373;21374;21375;21946;21947;24420;25343;25344;28636;30863;39374;40021;44663;44664 1593;1594;7550;9208;9209;21502;21503;21504;22077;22078;24570;25498;25499;28820;31059;39612;40265;44976;44977 1593;7550;9208;21504;22078;24570;25498;28820;31059;39612;40265;44977 -1 | |
| YDR508C YDR508C 4 4 4 YDR508C pep chromosome:R64-1-1:IV:1466453:1468444:-1 gene:YDR508C transcript:YDR508C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GNP1 description:High-affinity glutamine permease; also transports Leu, Ser, Thr, Cys, Met a 1 4 4 4 0 4 1 2 1 0 0 4 1 2 1 0 0 4 1 2 1 0 8.6 8.6 8.6 73.597 663 663 0 14.356 0 8.6 2.7 4.2 2 0 55904000 0 23300000 20623000 8632900 3347600 0 0 11402000 0 8106200 0 0 0 5 1 1 1 0 8 DSSSQLDNELNRK;NIFDEELLKQEDEEYKER;QIGSIEPENEVEYFEK;SSYITVDGIK 360 1432;7485;8119;9594 True;True;True;True 1494;7862;8529;10062 5722;5723;28584;28585;28586;28587;30870;36528;36529 5759;5760;28768;28769;28770;28771;31066;36748;36749 5760;28768;31066;36749 -1 | |
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| YEL032W YEL032W 10 10 10 YEL032W pep chromosome:R64-1-1:V:86937:89852:1 gene:YEL032W transcript:YEL032W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MCM3 description:Protein involved in DNA replication; component of the Mcm2-7 hexameric helicase c 1 10 10 10 6 3 3 2 0 3 6 3 3 2 0 3 6 3 3 2 0 3 16.8 16.8 16.8 107.52 971 971 0 44.458 10.6 4.2 4.3 5.1 0 5.1 86161000 22441000 7842200 41365000 5724000 0 8788400 10877000 0 10046000 7727300 0 0 5 3 3 2 0 2 15 DYTDATTTLTTR;FQEFLDTFTSYR;FVLNTASLAIATTGR;IIISLDDLR;IPTPAIYPTEDTEGNKLTTEYGYSTFIDHQR;ITVQEMPEMAPAGQLPR;SIDVILDDDLVDKTKPGDR;SLGAGGMNQSNSNTLIGFK;TLILGNTVYPLHAR;VIPQLTQEAINVIVK 370 1505;2535;2713;4114;4488;4740;8965;9170;10252;11050 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1567;2626;2809;4283;4681;4940;9406;9621;10746;11578 5979;5980;9525;10230;15559;15560;16993;16994;17927;34057;34918;34919;34920;34921;39085;39086;42289;42290 6017;6018;9576;10290;15669;15670;17109;17110;18046;34264;35126;35127;35128;35129;39322;39323;42587;42588 6018;9576;10290;15669;17110;18046;34264;35127;39322;42588 -1 | |
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| YEL060C YEL060C 2 2 2 YEL060C pep chromosome:R64-1-1:V:40046:41953:-1 gene:YEL060C transcript:YEL060C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRB1 description:Vacuolar proteinase B (yscB) with H3 N-terminal endopeptidase activity; serine p 1 2 2 2 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 69.621 635 635 0 5.6583 0 1.3 1.9 1.3 1.3 1.9 38992000 0 6604200 19286000 3558300 2689100 6854400 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 5 LNLGSFNK;SNGSGTMSDVVK 376 6355;9326 True;True 6620;9786 24125;24126;24127;35527;35528 24274;24275;24276;35738;35739 24276;35739 -1 | |
| YER002W YER002W 4 4 4 YER002W pep chromosome:R64-1-1:V:156803:157498:1 gene:YER002W transcript:YER002W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP16 description:Constituent of 66S pre-ribosomal particles; involved in 60S ribosomal subunit 1 4 4 4 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 2 2 15.6 15.6 15.6 26.901 231 231 0 25.792 14.7 14.7 14.7 14.7 10.4 9.5 101100000 11337000 8068200 53572000 8238000 5389700 14494000 6244800 8295600 9299600 7936600 0 8249200 3 3 3 3 2 2 16 DTTEETEVVK;KLEELASRPVIR;NFDADEDVNEIK;NFDADEDVNEIKAR 377 1454;5148;7363;7364 True;True;True;True 1516;5363;7733;7734 5796;5797;5798;5799;5800;5801;19556;19557;19558;19559;28105;28106;28107;28108;28109;28110 5833;5834;5835;5836;5837;5838;19680;19681;19682;19683;28284;28285;28286;28287;28288;28289 5836;19681;28286;28289 -1 | |
| YER006W YER006W 31 31 31 YER006W pep chromosome:R64-1-1:V:162723:164285:1 gene:YER006W transcript:YER006W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NUG1 description:GTPase that associates with nuclear 60S pre-ribosomes; required for export of 6 1 31 31 31 19 18 17 20 13 20 19 18 17 20 13 20 19 18 17 20 13 20 59.8 59.8 59.8 57.708 520 520 0 159.39 45.6 49.4 44.4 44.6 34.6 47.9 2027699999.9999998 421760000 225660000 528540000 286980000 133130000 431590000 61462000 61551000 50083000 65304000 53577000 44207000 21 19 20 21 15 21 117 ACPVGNEAGVTTSLR;AIDASKDQDTMME;ASSGAVNGTSFNR;EFDLDGLFSSLDK;EFDLDGLFSSLDKAIDASKDQDTMME;GGIPNLASAGLSVLNDWR;GGIPNLASAGLSVLNDWRDGK;HFLIHVAR;HIVDPYPAVLMLVK;ILDSPGICFPSENK;ILDSPGICFPSENKK;ILEEIEAK;ILEEIEAKK;ILGWVLPNTSAAASQQDKQNLSTINTGTK;KLSQTTTASALLESLK;KVEEAVLQSQGKR;LSQTTTASALLESLK;LYEIPPIPANDADTFTK;LYEIPPIPANDADTFTKHFLIHVAR;QAPIAANESTIVSEWSK;QAPIAANESTIVSEWSKEFDLDGLFSSLDK;QNLSTINTGTK;SDEMTESFKK;SIVVGVIGYPNVGK;SKKDPGIPSNFPYK;SKVEHEAELALLNALPAK;SSVINALLAR;SVIDASDVILYVLDAR;SVIDASDVILYVLDARDPESTR;TYSNNSNLKR;VEHEAELALLNALPAK 378 80;305;826;1605;1606;2934;2935;3496;3549;4252;4253;4260;4261;4291;5184;5321;6660;6927;6928;8016;8017;8248;8705;9056;9088;9114;9585;9730;9731;10690;10838 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 83;321;869;1670;1671;3041;3042;3632;3690;3691;4428;4429;4436;4437;4468;5402;5547;6939;7215;7216;8421;8422;8664;9135;9501;9534;9562;10053;10207;10208;11200;11354 322;323;324;325;326;327;1341;1342;1343;1344;1345;3430;6340;6341;6342;6343;6344;6345;6346;11085;11086;11087;11088;11089;11090;13256;13257;13258;13259;13260;13468;13469;13470;13471;16059;16060;16061;16062;16063;16064;16065;16066;16096;16097;16098;16099;16100;16101;16197;16198;16199;16200;16201;19709;19710;19711;20245;25277;25278;25279;25280;25281;26337;26338;26339;26340;26341;26342;26343;30558;30559;30560;30561;30562;30563;30564;31316;32993;34400;34401;34402;34403;34404;34545;34546;34547;34548;34549;34664;34665;34666;34667;34668;34669;34670;34671;34672;34673;36495;36496;36497;37084;37085;37086;37087;37088;37089;37090;37091;37092;37093;37094;37095;40861;41392;41393 323;324;325;326;327;328;1345;1346;1347;1348;1349;3444;6378;6379;6380;6381;6382;6383;6384;11165;11166;11167;11168;11169;11170;13347;13348;13349;13350;13351;13559;13560;13561;13562;16170;16171;16172;16173;16174;16175;16176;16177;16207;16208;16209;16210;16211;16212;16308;16309;16310;16311;16312;19834;19835;19836;20373;25432;25433;25434;25435;25436;26498;26499;26500;26501;26502;26503;26504;26505;30751;30752;30753;30754;30755;30756;30757;31513;33194;34608;34609;34610;34611;34612;34753;34754;34755;34756;34757;34872;34873;34874;34875;34876;34877;34878;34879;34880;34881;36715;36716;36717;37314;37315;37316;37317;37318;37319;37320;37321;37322;37323;37324;37325;41122;41657;41658 328;1345;3444;6381;6384;11166;11167;13349;13561;16171;16176;16211;16212;16312;19834;20373;25432;26503;26505;30753;30757;31513;33194;34610;34754;34881;36717;37318;37323;41122;41657 184;185;186 378;518;519 -1 | |
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| YIL052C;YER056C-A YIL052C;YER056C-A 11;11 11;11 11;11 YIL052C pep chromosome:R64-1-1:IX:256226:257063:-1 gene:YIL052C transcript:YIL052C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL34B description:Ribosomal 60S subunit protein L34B; homologous to mammalian ribosomal prote 2 11 11 11 5 6 9 6 8 6 5 6 9 6 8 6 5 6 9 6 8 6 53.7 53.7 53.7 13.641 121 121;121 0 21.037 40.5 40.5 51.2 30.6 52.9 41.3 3688299999.9999995 681640000 491520000 1184000000 393050000 187970000 750110000 478000000 409600000 276370000 316330000 281710000 324780000 5 7 9 7 8 7 43 AFLIEEQK;AFLIEEQKIVK;AFLIEEQKIVKK;CGDCGSALQGISTLRPR;KVVKEQTEAAK;QYATVSK;RRNPYNTR;TPGGILR;VVKEQTEAAK;VVKEQTEAAKK;VVKTPGGILR 392 169;170;171;1024;5384;8382;8540;10402;11590;11591;11592 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 176;177;178;1074;5616;8803;8963;10903;12136;12137;12138 719;720;721;722;723;724;725;726;727;728;729;730;731;4279;4280;4281;4282;4283;20555;20556;20557;20558;20559;20560;31748;31749;31750;31751;31752;32321;32322;39619;39620;39621;39622;39623;44566;44567;44568;44569;44570;44571;44572 720;721;722;723;724;725;726;727;728;729;730;731;732;4303;4304;4305;4306;4307;20683;20684;20685;20686;20687;20688;31945;31946;31947;31948;31949;32519;32520;39859;39860;39861;39862;39863;44878;44879;44880;44881;44882;44883;44884 723;730;732;4303;20685;31945;32520;39859;44880;44881;44883 -1;-1 | |
| YER068W YER068W 2 2 2 YER068W pep chromosome:R64-1-1:V:293050:294813:1 gene:YER068W transcript:YER068W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MOT2 description:Ubiquitin-protein ligase subunit of the CCR4-NOT complex; with Ubc4p, ubiquitin 1 2 2 2 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 3.9 3.9 3.9 65.353 587 587 0 11.142 2.2 2.2 0 2.2 0 1.7 12944000 4763400 3133900 0 2314900 0 2731700 0 0 0 0 0 0 1 2 0 1 0 0 4 NSSDLLNQLINGR;YVTLSPEELK 393 7819;12279 True;True 8218;12846 29858;29859;29860;47222 30047;30048;30049;30050;47552 30048;47552 -1 | |
| YER070W;YIL066C YER070W;YIL066C 3;2 3;2 3;2 YER070W pep chromosome:R64-1-1:V:298950:301616:1 gene:YER070W transcript:YER070W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RNR1 description:Major isoform of large subunit of ribonucleotide-diphosphate reductase; the RNR 2 3 3 3 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 4.7 4.7 4.7 99.56 888 888;869 0 12.298 2.4 1.6 3.9 1.6 0 1.6 63355000 18639000 2778300 22556000 4433000 0 14949000 11894000 0 5957800 0 0 7681200 3 1 3 1 0 2 10 DLFPALWIPDLFMK;STGSYIAGTNGTSNGLIPMIR;VVEDLYR 394 1263;9635;11560 True;True;True 1318;10105;12102 5083;5084;5085;5086;5087;5088;5089;5090;36682;44405 5114;5115;5116;5117;5118;5119;5120;5121;36902;44716 5119;36902;44716 198 339 -1;-1 | |
| YER073W YER073W 3 3 3 YER073W pep chromosome:R64-1-1:V:304030:305592:1 gene:YER073W transcript:YER073W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ALD5 description:Mitochondrial aldehyde dehydrogenase; involved in regulation or biosynthesis of 1 3 3 3 1 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 5.4 5.4 5.4 56.692 520 520 0 5.2545 2.1 3.3 2.1 3.8 2.1 0 16764000 2121600 6384400 4605300 3070900 581280 0 0 0 0 0 0 0 1 2 1 2 1 0 7 ALFNLADLVEK;IAIDKPIR;WSIVEPEVR 395 481;3719;11752 True;True;True 510;3867;12304 2062;2063;2064;2065;14083;45189;45190 2069;2070;2071;2072;14183;45505;45506 2070;14183;45506 -1 | |
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| YER080W YER080W 3 3 3 YER080W pep chromosome:R64-1-1:V:319963:321846:1 gene:YER080W transcript:YER080W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:AIM9 description:Protein of unknown function; the authentic, non-tagged protein is detected in h 1 3 3 3 0 2 1 2 2 1 0 2 1 2 2 1 0 2 1 2 2 1 5.9 5.9 5.9 72.413 627 627 0 12.641 0 4.3 2.2 3.8 3.8 2.2 20493000 0 5181900 6727300 2714800 2472100 3397300 0 0 0 2424900 3756800 0 0 2 1 1 2 1 7 IPYPLENENTLSYR;LITAVAPPVK;NLTVSLVNNVVPK 397 4496;5988;7654 True;True;True 4689;6238;8039 17029;17030;17031;17032;17033;22851;22852;29195 17145;17146;17147;17148;17149;22988;22989;29380 17145;22989;29380 -1 | |
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| YPR132W;YGR118W YPR132W;YGR118W 10;10 10;10 10;10 YPR132W pep chromosome:R64-1-1:XVI:794965:795767:1 gene:YPR132W transcript:YPR132W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS23B description:Ribosomal protein 28 (rp28) of the small (40S) ribosomal subunit; required 2 10 10 10 7 7 9 6 9 8 7 7 9 6 9 8 7 7 9 6 9 8 51.7 51.7 51.7 16.038 145 145;145 0 35.23 44.1 37.9 51.7 45.5 51.7 51 4537600000 605960000 426310000 1848799999.9999998 548760000 220360000 887430000 230850000 236550000 163660000 207630000 167380000 182980000 9 9 12 8 13 8 59 AKGDIPGVR;GDIPGVR;KVTAFVPNDGCLNFVDENDEVLLAGFGR;KVTAFVPNDGCLNFVDENDEVLLAGFGRK;LLGTAFK;RLLGTAFK;SSPFGGSSHAK;VSGVSLLALWK;VTAFVPNDGCLNFVDENDEVLLAGFGR;WAENNYK 543 410;2832;5364;5365;6161;8498;9558;11419;11468;11680 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 436;2934;5591;5592;6417;8921;10026;11954;12004;12230 1779;1780;1781;1782;1783;1784;1785;1786;10709;20421;20422;20423;20424;20425;20426;20427;20428;20429;20430;20431;20432;20433;20434;23513;23514;23515;23516;32196;32197;32198;32199;36374;36375;36376;36377;36378;36379;36380;36381;36382;36383;43832;43833;43834;43835;44010;44011;44012;44013;44014;44015;44016;44017;44018;44932;44933;44934;44935;44936 1786;1787;1788;1789;1790;1791;1792;1793;10780;20549;20550;20551;20552;20553;20554;20555;20556;20557;20558;20559;20560;20561;20562;23656;23657;23658;23659;32393;32394;32395;32396;36594;36595;36596;36597;36598;36599;36600;36601;36602;36603;44139;44140;44141;44142;44317;44318;44319;44320;44321;44322;44323;44324;44325;45246;45247;45248;45249;45250 1790;10780;20549;20558;23658;32396;36602;44140;44320;45246 -1;-1 | |
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| YGR124W YGR124W 4 4 2 YGR124W pep chromosome:R64-1-1:VII:739944:741662:1 gene:YGR124W transcript:YGR124W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ASN2 description:Asparagine synthetase; catalyzes the synthesis of L-asparagine from L-asparta 1 4 4 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 0 0 7.9 7.9 4.4 64.592 572 572 0 5.4391 3.5 4.4 4.4 4.4 1.7 3.5 47786000 9306600 6115600 11546000 5181100 1872800 13763000 0 0 0 0 0 0 2 1 1 1 1 2 8 LKFDAWFPQK;SSQSPETVYFASELK;STMAWGLEAR;YFTPDWLDEK 545 6029;9562;9654;11887 True;True;True;True 6279;10030;10124;12443 23019;36396;36397;36398;36759;45707;45708;45709;45710;45711;45712 23156;36616;36617;36618;36982;46026;46027;46028;46029;46030;46031 23156;36618;36982;46026 -1 | |
| YGR128C YGR128C 8 8 8 YGR128C pep chromosome:R64-1-1:VII:747950:750091:-1 gene:YGR128C transcript:YGR128C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP8 description:Nucleolar protein required for export of tRNAs from the nucleus; also copuri 1 8 8 8 3 5 4 5 2 2 3 5 4 5 2 2 3 5 4 5 2 2 16.8 16.8 16.8 80.19 713 713 0 38.644 4.6 12.6 10.5 9.3 2.8 6.3 137830000 10506000 34705000 48649000 11945000 3671000 28350000 14689000 22660000 13999000 23441000 0 13656000 3 5 3 5 2 2 20 ALPTYTMEYLDI;AYTGSDEFLSQYK;LSALQDNDITSFDDIFFK;LTFDYPIPSTNIITACNAEK;NGPNPTSSLEIINIDVGTNTLKDSLGK;NLLSLLR;PSLSQPFR;TLTFLLTHPLFPLSR 546 545;1012;6564;6721;7446;7621;7974;10318 True;True;True;True;True;True;True;True 576;577;1062;6840;7001;7821;8004;8378;10814 2367;2368;2369;4229;4230;4231;4232;24952;24953;24954;25544;25545;25546;28439;28440;28441;29056;30410;30411;30412;39335 2376;2377;2378;4252;4253;4254;4255;25107;25108;25109;25702;25703;25704;28620;28621;28622;29241;30603;30604;30605;39573 2378;4255;25108;25702;28621;29241;30604;39573 287 708 -1 | |
| YGR132C YGR132C 1 1 1 YGR132C pep chromosome:R64-1-1:VII:755589:756452:-1 gene:YGR132C transcript:YGR132C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PHB1 description:Subunit of the prohibitin complex (Phb1p-Phb2p); prohibitin is a 1.2 MDa rin 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 3.1 3.1 3.1 31.427 287 287 0 3.4061 3.1 3.1 3.1 0 3.1 3.1 16315000 3121500 2100400 4609100 0 2232100 4251600 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 1 5 VGDGLLLIR 547 10906 True 11426 41708;41709;41710;41711;41712 42004;42005;42006;42007;42008 42005 -1 | |
| YGR135W YGR135W 2 2 2 YGR135W pep chromosome:R64-1-1:VII:761392:762168:1 gene:YGR135W transcript:YGR135W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRE9 description:Alpha 3 subunit of the 20S proteasome; the only nonessential 20S subunit; may 1 2 2 2 0 1 1 2 0 0 0 1 1 2 0 0 0 1 1 2 0 0 10.1 10.1 10.1 28.714 258 258 0 3.7441 0 5 5 10.1 0 0 8734200 0 1266900 3956100 3511200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 2 0 0 4 IFKPQEIKDILVK;TYNEDIPVEILVR 548 3938;10683 True;True 4099;11193 14921;40840;40841;40842 15030;41101;41102;41103 15030;41103 -1 | |
| YGR145W YGR145W 12 12 12 YGR145W pep chromosome:R64-1-1:VII:781767:783890:1 gene:YGR145W transcript:YGR145W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ENP2 description:Component of the SSU; required for pre-18S rRNA processing, biogenesis of the 1 12 12 12 4 4 8 6 5 3 4 4 8 6 5 3 4 4 8 6 5 3 22.2 22.2 22.2 81.733 707 707 0 129.68 7.5 7.9 13.6 12.6 10.9 6.9 264310000 25018000 14103000 134330000 35533000 12357000 42968000 14158000 10962000 21462000 17186000 12410000 18213000 4 4 9 6 5 3 31 HTDAENVDFTILSDDWTK;IIWLDNVGTENK;IWDRLDGK;KLNLTHLVGSR;LYLENNIDNRPFQVTTTSFR;SIKETEEGAAKR;SIQFQNK;SNESILR;SSGAVQKPK;STSANDVSVYQVSGTNVSR;TSEPSIIKDQGYGFDIKK;VNCDLYVGASGNELYR 549 3660;4162;4839;5175;6936;8998;9025;9317;9520;9671;10482;11269 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3807;4334;5043;5393;7224;9440;9467;9776;9986;10143;10984;11800 13872;13873;13874;15751;15752;15753;18313;18314;18315;19679;26372;26373;34179;34180;34181;34182;34183;34285;34286;35483;36233;36234;36819;36820;36821;36822;36823;39896;39897;39898;43198 13969;13970;13971;15862;15863;15864;18433;18434;18435;19804;26534;26535;34387;34388;34389;34390;34391;34493;34494;35693;36452;36453;37042;37043;37044;37045;37046;40140;40141;40142;43497 13969;15862;18433;19804;26534;34389;34494;35693;36452;37046;40142;43497 -1 | |
| YGR148C YGR148C 14 14 3 YGR148C pep chromosome:R64-1-1:VII:787312:787779:-1 gene:YGR148C transcript:YGR148C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL24B description:Ribosomal 60S subunit protein L24B; not essential for translation but may 1 14 14 3 9 8 10 10 12 11 9 8 10 10 12 11 1 1 2 2 3 1 47.1 47.1 12.9 17.547 155 155 0 60.663 40 40.6 46.5 41.9 47.1 41.9 5931499999.999999 1157500000 610730000 1662099999.9999998 297050000 478880000 1725199999.9999998 413880000 433970000 290090000 341850000 334420000 338220000 12 10 12 10 16 14 74 AQRPITGASLDLIK;AQRPITGASLDLIKER;GITEEVAK;GTLFVRGDSK;IAWTVLFR;IAWTVLFRK;KGITEEVAK;MKVEVDSFSGAK;RIAWTVLFR;RIAWTVLFRK;RSLKPEVR;SAGVQGSK;SLKPEVR;VEVDSFSGAK 550 738;739;3031;3337;3776;3777;5036;7101;8454;8455;8545;8622;9204;10853 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 780;781;3141;3460;3928;3929;5246;7420;7421;8877;8878;8968;9046;9656;11371 3049;3050;3051;3052;3053;3054;3055;3056;3057;3058;3059;3060;3061;3062;3063;3064;3065;3066;11421;11422;11423;12588;12589;12590;12591;12592;12593;14306;14307;14308;14309;14310;14311;14312;14313;14314;14315;19111;19112;19113;19114;19115;19116;19117;19118;27019;27020;27021;27022;27023;27024;27025;27026;27027;27028;27029;27030;32027;32028;32029;32030;32031;32032;32033;32335;32336;32337;32338;32646;32647;35030;35031;35032;41496;41497 3061;3062;3063;3064;3065;3066;3067;3068;3069;3070;3071;3072;3073;3074;3075;3076;3077;3078;11505;11506;11507;12677;12678;12679;12680;12681;12682;14407;14408;14409;14410;14411;14412;14413;14414;14415;14416;19235;19236;19237;19238;19239;19240;19241;19242;27189;27190;27191;27192;27193;27194;27195;27196;27197;27198;27199;27200;32224;32225;32226;32227;32228;32229;32230;32533;32534;32535;32536;32846;32847;35238;35239;35240;41788;41789 3063;3073;11505;12679;14408;14416;19242;27197;32228;32230;32536;32846;35240;41789 288 1 -1 | |
| YGR152C YGR152C 5 5 5 YGR152C pep chromosome:R64-1-1:VII:794674:795492:-1 gene:YGR152C transcript:YGR152C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSR1 description:GTP-binding protein of the Ras superfamily; required for bud site selection, 1 5 5 5 3 0 3 1 2 3 3 0 3 1 2 3 3 0 3 1 2 3 21.7 21.7 21.7 30.39 272 272 0 8.2615 12.1 0 12.5 4 8.5 14 100610000 16546000 0 38786000 7010200 8181700 30089000 7990500 0 8094100 0 11005000 9079600 4 0 2 1 2 4 13 IKDSDRVPMVLIGNK;LVVLGAGGVGK;QSLEELMELR;SNVDEVFVDLVR;VPFYETSALLR 551 4176;6894;8307;9365;11328 True;True;True;True;True 4348;7181;8724;9827;11859 15784;26237;31514;35660;35661;35662;35663;35664;43481;43482;43483;43484;43485 15895;26398;31711;35871;35872;35873;35874;35875;35876;43781;43782;43783;43784;43785 15895;26398;31711;35876;43784 -1 | |
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| YHR016C YHR016C 8 5 5 YHR016C pep chromosome:R64-1-1:VIII:136881:138455:-1 gene:YHR016C transcript:YHR016C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YSC84 description:Actin-binding protein; involved in bundling of actin filaments and endocyt 1 8 5 5 3 3 5 3 1 5 2 1 2 1 1 3 2 1 2 1 1 3 22.4 16.7 16.7 50.901 468 468 0 13.774 11.3 6.2 12.4 8.8 4.7 13.7 91586000 22808000 1462400 39316000 3933200 3284300 20782000 0 0 15322000 0 0 10841000 2 1 2 1 1 3 10 EGIFPANYVR;GINNPIPR;GLAIITVLK;GYSLGHGPTHPSNMSNVDDLSHK;SDSQNDWWTGR;SFVKPNQVFGADQVIPPYVLKR;SLKSETKK;SRYDDDYDDDGYGR 609 1648;3011;3071;3448;8747;8870;9205;9478 True;False;True;True;False;True;False;True 1714;3120;3181;3581;9178;9305;9657;9944 6493;11329;11330;11331;11332;11333;11559;11560;13068;33145;33146;33147;33148;33564;33565;33566;33567;33568;35033;36104 6531;11412;11413;11414;11415;11416;11644;11645;13159;33346;33347;33348;33349;33766;33767;33768;33769;33770;35241;36321 6531;11413;11645;13159;33348;33769;35241;36321 -1 | |
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| YHR085W YHR085W 1 1 1 YHR085W pep chromosome:R64-1-1:VIII:276764:277768:1 gene:YHR085W transcript:YHR085W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IPI1 description:Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes; requir 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3.9 3.9 3.9 37.866 334 334 0.0094203 1.4066 0 3.9 0 0 0 0 970390 0 970390 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 KAVFIEQFLPIVR 633 4945 True 5151 18694 18817 18817 -1 | |
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| YIL105C YIL105C 4 4 4 YIL105C pep chromosome:R64-1-1:IX:167581:169641:-1 gene:YIL105C transcript:YIL105C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SLM1 description:Phosphoinositide PI4,5P(2) binding protein, forms a complex with Slm2p; acts 1 4 4 4 2 0 0 0 1 1 2 0 0 0 1 1 2 0 0 0 1 1 7 7 7 77.994 686 686 0 15.012 3.8 0 0 0 1.6 1.6 11288000 6322400 0 0 0 4966000 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 1 1 4 GYYVLTPNFLHEFK;LAQQQQQQQDPR;NSLTNTSILSR;YQFDPLTYEIK 692 3452;5508;7805;12159 True;True;True;True 3585;5744;8204;12723 13086;21067;29815;46761 13177;21195;30004;47090 13177;21195;30004;47090 -1 | |
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| YIL118W YIL118W 8 8 8 YIL118W pep chromosome:R64-1-1:IX:139752:140447:1 gene:YIL118W transcript:YIL118W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RHO3 description:Non-essential small GTPase of the Rho/Rac family of Ras-like proteins; involve 1 8 8 8 5 5 7 4 3 7 5 5 7 4 3 7 5 5 7 4 3 7 43.7 43.7 43.7 25.312 231 231 0 44.906 31.2 26.8 39.8 22.5 14.3 38.1 347400000 19615000 30309000 191850000 17859000 10786000 76985000 5788500 12830000 19260000 8539300 9746400 14104000 5 5 8 4 3 7 32 GVNEAFTEAAR;HITLSLWDTAGQEEFDRLR;LVLVALK;NLISYEEGLAMAK;SFLCGSASTSNKPIER;TSLLNVFTR;VALTAGPVATEVK;WVGEITDHCEGVK 694 3390;3548;6847;7615;8849;10508;10730;11768 True;True;True;True;True;True;True;True 3517;3689;7134;7997;9283;11010;11243;12320 12808;12809;12810;12811;12812;12813;13463;13464;13465;13466;13467;26059;26060;29026;29027;29028;29029;33496;33497;33498;33499;39975;39976;39977;39978;41027;41028;41029;41030;41031;45230;45231 12897;12898;12899;12900;12901;12902;13554;13555;13556;13557;13558;26219;26220;29211;29212;29213;29214;33698;33699;33700;33701;40219;40220;40221;40222;41291;41292;41293;41294;41295;45546;45547 12897;13557;26220;29213;33699;40221;41293;45547 -1 | |
| YIL125W YIL125W 5 5 5 YIL125W pep chromosome:R64-1-1:IX:122689:125733:1 gene:YIL125W transcript:YIL125W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KGD1 description:Subunit of the mitochondrial alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex; cataly 1 5 5 5 2 2 0 2 2 1 2 2 0 2 2 1 2 2 0 2 2 1 7.7 7.7 7.7 114.41 1014 1014 0 13.151 3.6 3.3 0 3.6 4 2.3 28968000 6091100 5247700 0 4939300 5119100 7571100 0 0 0 0 0 0 2 2 0 2 2 1 9 FGLEGLESVVPGIK;FLQLANEDPR;IEQLHPFPFAQLR;SLHLAEEDAFLKDVFQQS;YVNLSLVANPSHLESQDPVVLGR 695 2266;2447;3886;9188;12270 True;True;True;True;True 2350;2535;4046;9639;12837 8603;9250;14723;34993;47193;47194;47195;47196;47197 8649;9299;14829;35201;47523;47524;47525;47526;47527 8649;9299;14829;35201;47527 -1 | |
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| YJL006C YJL006C 2 2 2 YJL006C pep chromosome:R64-1-1:X:423138:424109:-1 gene:YJL006C transcript:YJL006C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CTK2 description:Beta subunit of C-terminal domain kinase I (CTDK-I); which phosphorylates both 1 2 2 2 1 2 1 0 1 1 1 2 1 0 1 1 1 2 1 0 1 1 13.3 13.3 13.3 37.904 323 323 0 5.9986 5.3 13.3 5.3 0 5.3 5.3 18884000 2831700 4650900 5624200 0 2428800 3348100 0 0 0 0 0 0 1 2 1 0 1 1 6 NAGPESGLPQIPDHLLNADPYITITR;PSTFESQLFFSRPFLSK 710 7272;7975 True;True 7636;8379 27722;30413;30414;30415;30416;30417 27897;30606;30607;30608;30609;30610 27897;30608 -1 | |
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| YJL012C YJL012C 15 15 15 YJL012C pep chromosome:R64-1-1:X:411234:413399:-1 gene:YJL012C transcript:YJL012C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VTC4 description:Vacuolar membrane polyphosphate polymerase; subunit of the vacuolar transporte 1 15 15 15 6 6 7 7 9 7 6 6 7 7 9 7 6 6 7 7 9 7 27.3 27.3 27.3 83.154 721 721 0 32.723 9 8.5 14.1 11.9 13.6 11.2 811200000 68600000 47772000 244320000 51132000 51704000 347680000 46723000 61482000 53364000 49437000 56248000 46656000 6 6 8 7 9 7 43 EGKKPMNEIENLEALASEIQYVMLK;FPYAVLEVK;GKYTVDQVFAK;GTTFDTQIR;ISLDTELTMVR;ISQLYDIAR;LDSKPFFKENYDELVVK;LLDSNNPPTQLDFEILEEELSDIIADVHDLAK;LNYTGFQK;TDIGVDWPFK;TGFILKPVFQVR;VKEVQEQVQHTVR;YTVDQVFAK;YWVHPDNITELK;YYEIVAFFDHYFNGDQISK 713 1652;2528;3066;3342;4622;4656;5618;6107;6416;9918;10033;11087;12235;12291;12294 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1718;2619;3176;3466;4818;4853;5855;6361;6685;10403;10521;11616;12801;12859;12862 6510;9502;9503;9504;9505;11536;11537;11538;11539;11540;12612;17475;17574;17575;17576;17577;17578;21429;21430;21431;21432;21433;21434;23321;24386;24387;37806;38225;38226;38227;38228;38229;38230;38231;42429;47068;47069;47070;47287;47288;47289;47290;47300 6548;9553;9554;9555;9556;11621;11622;11623;11624;11625;12701;17592;17691;17692;17693;17694;17695;21559;21560;21561;21562;21563;21564;23463;24536;24537;38039;38461;38462;38463;38464;38465;38466;38467;42727;47398;47399;47400;47617;47618;47619;47620;47630 6548;9556;11625;12701;17592;17693;21560;23463;24536;38039;38466;42727;47398;47617;47630 355 329 -1 | |
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