Skip to content

Instantly share code, notes, and snippets.

@pgsin

pgsin/proteinGroups.txt

Created Mar 11, 2020
Star
Embed
What would you like to do?
Learn more about clone URLs
Download ZIP
Protein groups from SMC1 interactomics tutorial
Raw
proteinGroups.txt
This file has been truncated, but you can view the full file.
Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides pHis3_01 Peptides pHis3_02 Peptides pHis3_03 Peptides SMC1_01 Peptides SMC1_02 Peptides SMC1_03 Razor + unique peptides pHis3_01 Razor + unique peptides pHis3_02 Razor + unique peptides pHis3_03 Razor + unique peptides SMC1_01 Razor + unique peptides SMC1_02 Razor + unique peptides SMC1_03 Unique peptides pHis3_01 Unique peptides pHis3_02 Unique peptides pHis3_03 Unique peptides SMC1_01 Unique peptides SMC1_02 Unique peptides SMC1_03 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Sequence coverage pHis3_01 [%] Sequence coverage pHis3_02 [%] Sequence coverage pHis3_03 [%] Sequence coverage SMC1_01 [%] Sequence coverage SMC1_02 [%] Sequence coverage SMC1_03 [%] Intensity Intensity pHis3_01 Intensity pHis3_02 Intensity pHis3_03 Intensity SMC1_01 Intensity SMC1_02 Intensity SMC1_03 LFQ intensity pHis3_01 LFQ intensity pHis3_02 LFQ intensity pHis3_03 LFQ intensity SMC1_01 LFQ intensity SMC1_02 LFQ intensity SMC1_03 MS/MS count pHis3_01 MS/MS count pHis3_02 MS/MS count pHis3_03 MS/MS count SMC1_01 MS/MS count SMC1_02 MS/MS count SMC1_03 MS/MS count Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions Taxonomy IDs
CON__P00761 CON__P00761 5 5 5 1 5 5 5 4 4 4 4 3 4 4 4 4 4 3 4 4 4 4 4 3 4 32.9 32.9 32.9 24.409 231 231 0 118.51 29.4 29.4 25.1 28.6 25.1 29.4 3464200000 406930000 444450000 1285900000 590390000 301420000 435160000 478880000 1512100000 363480000 784760000 1308500000 290940000 7 7 6 6 5 6 37 + 0 4179;5798;6722;8745;10839 True;True;True;True;True 4349;4350;6040;7002;9173;11359 15895;15896;15897;15898;15899;15900;15901;15902;15903;15904;15905;15906;15907;22209;22210;22211;22212;22213;22214;22215;22216;22217;22218;22219;25639;25640;25641;25642;33365;33366;33367;33368;33369;33370;33371;41718;41719 16004;16005;16006;16007;16008;16009;16010;16011;16012;16013;16014;16015;16016;22339;22340;22341;22342;22343;22344;22345;22346;22347;22348;22349;25793;25794;25795;25796;33565;33566;33567;33568;33569;33570;33571;41981;41982 16007;22342;25793;33566;41982 0 94 -1
CON__P02533;CON__A2A4G1;CON__P08727;CON__P19001;CON__P08730-1;CON__Q9QWL7;CON__Q04695;CON__P19012;CON__P05784;CON__Q3ZAW8;CON__Q9Z2K1;CON__Q148H6;CON__Q7Z3Y7;CON__Q99456;CON__O76014;CON__Q7Z3Y8;CON__REFSEQ:XP_986630;CON__Q7Z3Y9;CON__O76013;CON__Q497I4;CON__O76015;CON__A2AB72;CON__Q6IFX2;CON__Q7Z3Z0;CON__Q14532;CON__Q92764;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;CON__Q15323;CON__A2A5Y0;CON__Q9UE12;CON__Q14525;CON__Q2M2I5 CON__P02533;CON__A2A4G1;CON__P08727;CON__P19001;CON__P08730-1;CON__Q9QWL7;CON__Q04695;CON__P19012 6;4;3;3;3;3;3;3;2;2;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 ;;;;;;; 32 6 1 1 3 1 0 0 1 2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 10.8 3.2 3.2 51.621 472 472;456;400;403;437;433;432;456;423;474;469;464;486;494;471;459;476;468;467;455;456;453;452;450;448;425;420;416;416;416;404;525 0 10.212 5.3 2.3 0 0 1.5 5.5 6027700 0 0 0 0 0 6027700 0 0 0 0 0 6027700 0 0 0 0 0 1 1 + 1 692;4691;5447;5563;5565;11591 True;False;False;False;False;False 732;4888;5681;5800;5802;12137 2880;17823;17824;20941;21384;21386;44784 2890;17938;17939;21068;21511;21513;45090 2890;17938;21068;21511;21513;45090 -1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1
CON__P02538;CON__Q8VED5;CON__Q5XKE5;CON__O95678;CON__P19013 CON__P02538 7;1;1;1;1 2;0;0;0;0 1;0;0;0;0 5 7 2 1 1 4 0 2 0 7 0 1 0 0 0 2 0 0 0 0 0 1 16.3 4.8 1.8 60.044 564 564;531;535;551;594 0 7.0978 2.1 8.5 0 3.7 0 16.3 52734000 0 3404200 0 0 0 49329000 0 0 0 0 0 49329000 0 1 0 0 0 2 3 + 2 340;746;3299;4641;7644;8949;9347 True;False;False;False;False;True;False 358;787;3419;4837;8025;9389;9804 1506;1507;3111;3112;3113;12497;17677;29298;29299;29300;29301;29302;34119;35855;35856 1509;1510;3122;3123;3124;12583;17792;29481;29482;29483;29484;29485;34324;36065;36066 1510;3124;12583;17792;29481;34324;36065 -1;-1;-1;-1;-1
CON__P04259 CON__P04259 7 5 1 1 7 5 1 1 3 0 2 0 7 0 1 0 0 0 5 0 0 0 0 0 1 16.3 12.6 3 59.998 564 564 0 25.206 2.1 5.5 0 3.7 0 16.3 77999000 0 1364300 0 0 0 76635000 0 0 0 0 0 76635000 0 1 0 0 0 5 6 + 3 746;859;3299;4641;7644;8948;9347 False;True;True;True;False;True;True 787;902;3419;4837;8025;9388;9804 3111;3112;3113;3578;12497;17677;29298;29299;29300;29301;29302;34118;35855;35856 3122;3123;3124;3591;12583;17792;29481;29482;29483;29484;29485;34323;36065;36066 3124;3591;12583;17792;29481;34323;36065 -1
CON__P04264;CON__Q8BGZ7;CON__P50446;CON__Q922U2;CON__Q5XQN5 CON__P04264 15;1;1;1;1 15;1;1;1;1 11;1;1;1;1 5 15 15 11 5 8 0 9 12 4 5 8 0 9 12 4 3 6 0 7 8 2 26.7 26.7 21.3 66.017 644 644;551;553;580;601 0 136.75 9 14 0 20.3 23.1 7.6 404370000 57835000 98988000 0 83368000 121980000 42201000 128190000 204540000 0 149930000 359680000 64932000 6 10 0 10 12 5 43 + 4 122;2430;2644;2748;2946;9095;9120;9191;9293;9294;9337;10342;10436;11774;11939 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 127;2515;2738;2843;3051;9541;9567;9641;9749;9750;9794;10842;10943;12333;12502 512;9225;9226;9227;9228;9229;9969;9970;10416;11172;11173;11174;34798;34799;34800;34892;35195;35196;35197;35198;35199;35200;35201;35202;35203;35617;35618;35619;35620;35621;35622;35815;39680;39992;39993;39994;39995;45612;45613;46206;46207;46208;46209 513;9272;9273;9274;9275;9276;10022;10023;10480;11249;11250;11251;35006;35007;35008;35100;35403;35404;35405;35406;35407;35408;35409;35410;35411;35825;35826;35827;35828;35829;35830;36023;39917;40229;40230;40231;40232;45926;45927;45928;46523;46524;46525;46526 513;9276;10022;10480;11249;35008;35100;35409;35826;35827;36023;39917;40231;45928;46526 -1;-1;-1;-1;-1
CON__P08779 CON__P08779 8 4 3 1 8 4 3 3 2 0 0 1 3 0 2 0 0 0 3 0 1 0 0 0 2 16.5 11.2 8.9 51.267 473 473 0 19.772 5.3 4.2 0 0 1.5 9.3 39317000 0 6184600 0 0 0 33132000 0 0 0 0 0 33132000 0 2 0 0 0 3 5 + 5 691;1060;4691;5447;5563;5565;9995;11591 True;True;True;False;False;False;True;False 731;1108;4888;5681;5800;5802;10484;12137 2879;4399;17823;17824;20941;21384;21386;38334;44784 2889;4423;17938;17939;21068;21511;21513;38566;45090 2889;4423;17938;21068;21511;21513;38566;45090 1 239 -1
CON__P13645;CON__P02535-1 CON__P13645 9;3 8;3 5;1 2 9 8 5 4 2 0 2 4 0 4 2 0 2 3 0 1 2 0 2 3 0 20.6 20.6 16.4 59.51 593 593;570 0 36.409 6.2 7.8 0 6.6 11 0 39776000 10246000 7401600 0 6774100 15355000 0 0 23051000 0 0 43774000 0 4 2 0 2 3 0 11 + 6 466;3311;3325;5447;5563;5565;7987;9527;11591 True;True;True;True;False;True;True;True;True 493;3432;3446;5681;5800;5802;8391;9995;12137 2027;2028;12560;12561;12597;20941;21384;21386;30643;30644;36534;44784 2033;2034;12646;12647;12683;21068;21511;21513;30833;30834;36750;45090 2034;12647;12683;21068;21511;21513;30833;36750;45090 2;3 306;321 -1;-1
CON__P35527 CON__P35527 14 14 13 1 14 14 13 6 6 0 4 13 0 6 6 0 4 13 0 6 6 0 4 12 0 30.7 30.7 30.7 62.129 623 623 0 60.046 10.3 9.1 0 9.8 29.5 0 243390000 50601000 38868000 0 42036000 111890000 0 82186000 128690000 0 114690000 246260000 0 6 6 0 5 16 0 33 + 7 2647;2947;2969;4213;5563;5564;7267;8014;8117;8163;8950;9724;10337;10358 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2741;3052;3075;4385;4386;5800;5801;7618;8419;8525;8574;9390;10199;10200;10837;10858;10859 9979;9980;9981;9982;11175;11241;11242;11243;16010;16011;21384;21385;27851;30731;30732;31082;31083;31217;31218;31219;34120;34121;37268;37269;37270;37271;37272;39638;39639;39640;39728;39729;39730;39731 10032;10033;10034;10035;11252;11318;11319;11320;16119;16120;21511;21512;28024;30921;30922;31275;31276;31411;31412;31413;34325;34326;37490;37491;37492;37493;37494;39874;39875;39876;39965;39966;39967;39968 10033;11252;11318;16119;21511;21512;28024;30922;31276;31412;34325;37493;39876;39967 4;5;6 157;245;326 -1
CON__P35908v2;CON__P35908;CON__Q3TTY5 CON__P35908v2;CON__P35908 9;9;1 8;8;1 6;6;1 ; 3 9 8 6 3 5 0 9 3 3 2 4 0 8 2 2 1 2 0 6 2 0 19.6 17.7 14.4 65.432 639 639;645;707 0 41.319 5.2 8.8 0 19.6 5.5 5.2 130750000 17823000 25807000 0 63615000 6605700 16899000 21594000 49093000 0 132740000 25198000 20241000 2 4 0 9 2 2 19 + 8 746;2430;2930;2968;3329;3534;7644;9335;9748 True;False;True;True;True;True;True;True;True 787;2515;3035;3074;3450;3671;8025;9792;10224 3111;3112;3113;9225;9226;9227;9228;9229;11108;11109;11110;11240;12605;13461;29298;29299;29300;29301;29302;35805;35806;35807;35808;37360 3122;3123;3124;9272;9273;9274;9275;9276;11185;11186;11187;11317;12691;13550;29481;29482;29483;29484;29485;36013;36014;36015;36016;37582 3124;9276;11187;11317;12691;13550;29481;36014;37582 -1;-1;-1
CON__Q3MHH8 CON__Q3MHH8 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 2 2 2 57.407 511 511 0.0015444 2.4331 2 0 0 2 2 2 14173000 6108300 0 0 2241400 1409000 4414600 0 0 0 0 0 4414600 1 0 0 1 1 1 4 + 9 10578 True 11086 40514;40515;40516;40517 40757;40758;40759;40760 40760 -1
CON__Q6IFZ6 CON__Q6IFZ6 2 1 1 1 2 1 1 1 1 0 2 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 4.5 2.4 2.4 61.358 572 572 1 -2 2.1 2.1 0 4.5 2.1 2.1 1003600 0 0 0 1003600 0 0 0 0 0 2064500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 10 2430;7251 False;True 2515;7599 9225;9226;9227;9228;9229;27787 9272;9273;9274;9275;9276;27960 9276;27960 7 1 -1
Q0140 Q0140 3 3 3 Q0140 pep chromosome:R64-1-1:Mito:48901:50097:1 gene:Q0140 transcript:Q0140_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VAR1 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit; mitochondrially-encoded; polym 1 3 3 3 0 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 11.8 11.8 11.8 47.123 398 398 0 8.556 0 4.5 7.3 0 0 0 28720000 0 9976700 18743000 0 0 0 0 0 11044000 0 0 0 0 1 1 0 0 0 2 11 6455;7179;12173 True;True;True 6725;7510;12739 24665;27504;47119 24814;27676;47446 24814;27676;47446 -1
Q0250 Q0250 1 1 1 Q0250 pep chromosome:R64-1-1:Mito:73758:74513:1 gene:Q0250 transcript:Q0250_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:COX2 description:Subunit II of cytochrome c oxidase (Complex IV); Complex IV is the terminal member o 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 6.8 6.8 6.8 28.567 251 251 0.00081235 2.9585 0 0 6.8 0 0 6.8 20364000 0 0 14368000 0 0 5995900 0 0 0 0 0 5995900 0 0 1 0 0 1 2 12 6149 True 6404 23604;23605 23745;23746 23745 -1
REV__YBR160W REV__YBR160W 1 1 1 YBR160W pep chromosome:R64-1-1:II:560078:560974:1 gene:YBR160W transcript:YBR160W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC28 description:Cyclin-dependent kinase (CDK) catalytic subunit; master regulator of mitotic 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 34.061 298 298 0.0072833 1.8555 0 0 0 0 0 0 29921000 0 15816000 0 0 0 14105000 0 0 0 0 0 14105000 0 1 0 0 0 1 2 + 13 52 True 54 219;220 220;221 220 -1
REV__YBR213W REV__YBR213W 1 1 1 YBR213W pep chromosome:R64-1-1:II:650368:651192:1 gene:YBR213W transcript:YBR213W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MET8 description:Bifunctional dehydrogenase and ferrochelatase; involved in the biosynthesis of 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 31.917 274 274 0.0023006 2.3777 0 0 0 0 0 0 3558100 0 0 0 3558100 0 0 0 0 0 7319500 0 0 0 0 0 1 0 0 1 + 14 6791 True 7074 25957 26114 26114 -1
REV__YDR081C REV__YDR081C 2 2 2 YDR081C pep chromosome:R64-1-1:IV:607304:610081:-1 gene:YDR081C transcript:YDR081C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PDC2 description:Transcription factor for thiamine-regulated genes; required for expression of 1 2 2 2 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 103.94 925 925 0.0059215 2.0109 0 0 0 0 0 0 5767400 0 0 0 0 1945600 3821800 0 0 0 0 6432800 0 0 0 0 0 1 1 2 + 15 4821;4822 True;True 5023;5024 18331;18332 18448;18449 18448;18449 -1
REV__YER037W REV__YER037W 1 1 1 YER037W pep chromosome:R64-1-1:V:225889:226854:1 gene:YER037W transcript:YER037W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PHM8 description:Lysophosphatidic acid (LPA) phosphatase, nucleotidase; principle and physiologi 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 37.718 321 321 1 -2 0 0 0 0 0 0 4182200 4182200 0 0 0 0 0 5462700 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 + + 16 11962 True 12525 46288 46606 46606 8 248 -1
REV__YER110C REV__YER110C 1 1 1 YER110C pep chromosome:R64-1-1:V:378762:382103:-1 gene:YER110C transcript:YER110C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KAP123 description:Karyopherin beta; mediates nuclear import of ribosomal proteins prior to ass 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 122.6 1113 1113 0.0045181 2.2042 0 0 0 0 0 0 4829200 0 4829200 0 0 0 0 0 10475000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 + 17 5487 True 5723 21136 21263 21263 -1
REV__YER145C REV__YER145C 2 2 2 YER145C pep chromosome:R64-1-1:V:460526:461740:-1 gene:YER145C transcript:YER145C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FTR1 description:High affinity iron permease; involved in the transport of iron across the plas 1 2 2 2 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 45.722 404 404 0.00087642 3.7198 0 0 0 0 0 0 10745000 2968200 0 7706200 0 70376 0 0 0 0 0 232690 0 1 0 1 0 1 0 3 + 18 5283;8332 True;True 5504;8749 20183;31828;31829 20307;32024;32025 20307;32024 -1
REV__YFL026W REV__YFL026W 1 1 1 YFL026W pep chromosome:R64-1-1:VI:82580:83875:1 gene:YFL026W transcript:YFL026W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:STE2 description:Receptor for alpha-factor pheromone; seven transmembrane-domain GPCR that intera 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 47.848 431 431 1 -2 0 0 0 0 0 0 3446300 0 0 0 0 0 3446300 0 0 0 0 0 3446300 0 0 0 0 0 1 1 + + 19 10547 True 11055 40406 40647 40647 9 361 -1
REV__YFL041W REV__YFL041W 2 2 2 YFL041W pep chromosome:R64-1-1:VI:49139:51007:1 gene:YFL041W transcript:YFL041W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FET5 description:Multicopper oxidase; integral membrane protein with similarity to Fet3p; may hav 1 2 2 2 1 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 0 1 2 0 0 0 0 70.879 622 622 0.0066079 1.9339 0 0 0 0 0 0 123760000 9289500 55291000 0 7937900 51242000 0 0 150780000 0 0 138570000 0 1 2 0 1 3 0 7 + 20 3337;8512 True;True 3459;8936 12636;12637;12638;12639;32461;32462;32463 12722;12723;12724;12725;32657;32658;32659 12723;32658 -1
REV__YGL049C REV__YGL049C 2 2 2 YGL049C pep chromosome:R64-1-1:VII:406860:409604:-1 gene:YGL049C transcript:YGL049C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TIF4632 description:Translation initiation factor eIF4G; subunit of the mRNA cap-binding prot 1 2 2 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 0 103.9 914 914 0.0030534 2.3137 0 0 0 0 0 0 134300000 0 0 73631000 0 7862900 52808000 0 0 0 0 0 52808000 0 0 1 0 1 2 4 + 21 6913;7110 True;True 7201;7418 26448;27154;27155;27156 26608;27316;27317;27318 26608;27317 -1
REV__YHR099W REV__YHR099W 1 1 1 YHR099W pep chromosome:R64-1-1:VIII:302761:313995:1 gene:YHR099W transcript:YHR099W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRA1 description:Subunit of SAGA and NuA4 histone acetyltransferase complexes; interacts with 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 433.17 3744 3744 1 -2 0 0 0 0 0 0 4486700 0 4486700 0 0 0 0 0 9732400 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 + + 22 7073 True 7378 27049 27211 27211 10 1789 -1
REV__YHR119W REV__YHR119W 2 2 2 YHR119W pep chromosome:R64-1-1:VIII:346043:349285:1 gene:YHR119W transcript:YHR119W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SET1 description:Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex; COMPASS m 1 2 2 2 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 123.91 1080 1080 0.001609 2.8629 0 0 0 0 0 0 88513000 33278000 0 55235000 0 0 0 0 0 32547000 0 0 0 1 0 1 0 0 0 2 + 23 5206;5229 True;True 5424;5447 19931;20002 20055;20126 20055;20126 -1
REV__YIL014W REV__YIL014W 1 1 1 YIL014W pep chromosome:R64-1-1:IX:326103:327995:1 gene:YIL014W transcript:YIL014W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MNT3 description:Alpha-1,3-mannosyltransferase; adds the fourth and fifth alpha-1,3-linked mann 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 72.409 630 630 1 -2 0 0 0 0 0 0 3437300 3437300 0 0 0 0 0 4489700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + + 24 5788 True 6030 22174 22304 22304 11 185 -1
REV__YIL149C REV__YIL149C 2 2 2 YIL149C pep chromosome:R64-1-1:IX:63028:68067:-1 gene:YIL149C transcript:YIL149C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MLP2 description:Myosin-like protein associated with the nuclear envelope; nuclear basket protei 1 2 2 2 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 195.14 1679 1679 0.0038139 2.3106 0 0 0 0 0 0 35403000 13943000 0 21460000 0 0 0 0 0 12645000 0 0 0 1 0 1 0 0 0 2 + 25 3611;10916 True;True 3754;11438 13788;41961 13879;42225 13879;42225 -1
REV__YKL023W REV__YKL023W 1 1 1 YKL023W pep chromosome:R64-1-1:XI:393721:394554:1 gene:YKL023W transcript:YKL023W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; predicted by computational methods to be involved in mRNA 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 32.293 277 277 0.0086894 1.8085 0 0 0 0 0 0 5261500 0 0 0 5261500 0 0 0 0 0 10824000 0 0 0 0 0 1 0 0 1 + 26 6512 True 6788 24870 25020 25020 -1
REV__YKL105C REV__YKL105C 2 2 2 YKL105C pep chromosome:R64-1-1:XI:239185:242583:-1 gene:YKL105C transcript:YKL105C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEG2 description:Eisosome component; likely plays only a minor role in eisosome assembly; show 1 2 2 2 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 125.59 1132 1132 0.0093458 1.7493 0 0 0 0 0 0 2380600 0 0 130680 0 2249900 0 0 0 77005 0 0 0 0 0 1 0 1 0 2 + 27 9307;11224 True;True 9763;11761 35666;43239 35874;43536 35874;43536 -1
REV__YKR054C REV__YKR054C 1 1 1 YKR054C pep chromosome:R64-1-1:XI:535647:547925:-1 gene:YKR054C transcript:YKR054C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DYN1 description:Cytoplasmic heavy chain dynein; microtubule motor protein; member of the AAA+ 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 471.34 4092 4092 1 -2 0 0 0 0 0 0 2826500 0 0 0 0 2826500 0 0 0 0 0 9345500 0 0 0 0 0 1 0 1 + + 28 10551 True 11059 40414 40655 40655 12 1336 -1
REV__YMR294W REV__YMR294W 1 1 1 YMR294W pep chromosome:R64-1-1:XIII:856966:858087:1 gene:YMR294W transcript:YMR294W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:JNM1 description:Component of the yeast dynactin complex; consisting of Nip100p, Jnm1p, and A 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 43.607 373 373 0.0052474 2.1432 0 0 0 0 0 0 97124000 51001000 0 0 0 0 46123000 0 0 0 0 0 46123000 1 0 0 0 0 1 2 + 29 5032 True 5241 19179;19180 19302;19303 19302 -1
REV__YPR085C REV__YPR085C 1 1 1 YPR085C pep chromosome:R64-1-1:XVI:708497:709828:-1 gene:YPR085C transcript:YPR085C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ASA1 description:Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling; telomere len 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 50.562 443 443 0.0079942 1.8178 0 0 0 0 0 0 5852700 5852700 0 0 0 0 0 7644600 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 + 30 1299 True 1352 5224 5255 5255 -1
REV__YPR179C REV__YPR179C 1 1 1 YPR179C pep chromosome:R64-1-1:XVI:893797:895764:-1 gene:YPR179C transcript:YPR179C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HDA3 description:Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex; possibly tetrameric trichos 1 1 1 1 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 75.462 655 655 1 -2 0 0 0 0 0 0 40719000 0 0 37163000 0 3556300 0 0 0 0 0 11758000 0 0 0 1 0 1 0 2 + + 31 11414 True 11951 44088;44089 44387;44388 44387 13 31 -1
YAL003W YAL003W 7 7 7 YAL003W pep chromosome:R64-1-1:I:142174:143160:1 gene:YAL003W transcript:YAL003W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EFB1 description:Translation elongation factor 1 beta; stimulates nucleotide exchange to regener 1 7 7 7 6 6 5 6 6 6 6 6 5 6 6 6 6 6 5 6 6 6 46.6 46.6 46.6 22.627 206 206 0 34.047 41.3 41.7 36.4 41.7 41.7 41.7 2766000000 635580000 322890000 664070000 268900000 185110000 689480000 793050000 451050000 495890000 487720000 461970000 624840000 9 10 9 7 9 10 54 32 48;190;324;836;8271;9113;11778 True;True;True;True;True;True;True 50;200;340;341;878;8688;9559;9560;12337 212;835;836;837;838;1430;1431;1432;1433;1434;1435;1436;1437;1438;1439;1440;1441;3466;3467;3468;3469;3470;3471;31627;31628;31629;31630;31631;31632;34854;34855;34856;34857;34858;34859;34860;34861;34862;34863;34864;34865;34866;34867;34868;45618;45619;45620;45621;45622;45623;45624;45625;45626;45627;45628 213;837;838;839;840;1433;1434;1435;1436;1437;1438;1439;1440;1441;1442;1443;1444;3479;3480;3481;3482;3483;3484;31823;31824;31825;31826;31827;31828;35062;35063;35064;35065;35066;35067;35068;35069;35070;35071;35072;35073;35074;35075;35076;45933;45934;45935;45936;45937;45938;45939;45940;45941;45942;45943 213;839;1443;3481;31828;35068;45935 14;15 139;148 -1
YAL005C;YBL075C YAL005C 46;13 10;0 10;0 YAL005C pep chromosome:R64-1-1:I:139503:141431:-1 gene:YAL005C transcript:YAL005C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSA1 description:ATPase involved in protein folding and NLS-directed nuclear transport; member 2 46 10 10 36 32 27 29 28 31 9 6 7 5 6 7 9 6 7 5 6 7 76.9 24.8 24.8 69.656 642 642;649 0 93.716 63.4 52.2 52.3 56.4 53.9 45.5 1195700000 510640000 70893000 331480000 57245000 39510000 185940000 367590000 218980000 225490000 212470000 167540000 223870000 10 7 10 7 8 9 51 33 756;848;849;922;1068;1326;1354;1355;2006;2209;2218;3421;3780;4155;4156;4730;5304;5627;5922;5953;6660;6905;6906;6937;6938;6997;7146;7445;7446;7456;7803;7804;7817;7925;8087;8840;9070;9396;9523;10252;10253;10386;10511;10642;10886;11356 False;False;False;True;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;True;True;False;True;True;False;True;False;True;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False 797;891;892;965;1116;1381;1412;1413;2082;2291;2300;3547;3929;4325;4326;4927;5526;5864;6171;6204;6938;7193;7194;7225;7226;7286;7462;7463;7816;7817;7818;7829;7830;8200;8201;8202;8203;8216;8325;8494;9273;9514;9858;9991;10750;10751;10888;11018;11150;11406;11893 3170;3171;3172;3173;3174;3175;3176;3177;3178;3521;3522;3523;3524;3525;3526;3527;3528;3529;3530;3531;3532;3533;3534;3535;3847;3848;4418;4419;4420;4421;4422;4423;4424;5327;5449;5450;5451;5452;7661;7662;8439;8440;8441;8442;8443;8444;8466;8467;8468;8469;12993;12994;12995;12996;14378;14379;15774;15775;15776;15777;15778;15779;15780;15781;15782;15783;15784;15785;15786;15787;15788;15789;15790;15791;15792;15793;15794;17982;17983;17984;17985;17986;17987;17988;17989;17990;17991;17992;20267;20268;20269;20270;20271;20272;21601;21602;21603;21604;21605;21606;21607;21608;21609;21610;21611;21612;22708;22709;22710;22711;22712;22713;22714;22715;22716;22717;22718;22719;22851;22852;22853;25414;25415;25416;25417;25418;25419;25420;25421;26413;26414;26415;26416;26417;26418;26419;26420;26421;26422;26423;26542;26543;26544;26545;26546;26547;26548;26549;26550;26551;26552;26746;27312;27313;27314;27315;27316;27317;27318;27319;27320;27321;27322;27323;27324;27325;27326;28586;28587;28588;28589;28590;28591;28592;28593;28594;28595;28596;28597;28598;28637;28638;28639;28640;28641;28642;28643;28644;28645;28646;28647;28648;28649;28650;28651;29983;29984;29985;29986;29987;29988;29989;29990;29991;29992;29993;29994;29995;29996;29997;30045;30046;30047;30048;30049;30050;30051;30052;30404;30405;30406;30407;30408;30409;31000;33730;33731;33732;33733;33734;33735;34695;34696;34697;34698;34699;34700;34701;36042;36043;36044;36045;36046;36521;36522;39338;39339;39340;39341;39342;39343;39827;40260;40261;40262;40263;40700;41854;41855;41856;41857;43811;43812;43813;43814;43815;43816;43817;43818;43819;43820 3181;3182;3183;3184;3185;3186;3187;3188;3189;3534;3535;3536;3537;3538;3539;3540;3541;3542;3543;3544;3545;3546;3547;3548;3862;3863;4443;4444;4445;4446;4447;4448;4449;5359;5484;5485;5486;5487;7703;7704;8482;8483;8484;8485;8486;8487;8509;8510;8511;8512;13080;13081;13082;13083;14477;14478;15882;15883;15884;15885;15886;15887;15888;15889;15890;15891;15892;15893;15894;15895;15896;15897;15898;15899;15900;15901;15902;18098;18099;18100;18101;18102;18103;18104;18105;18106;18107;18108;20392;20393;20394;20395;20396;20397;20398;21728;21729;21730;21731;21732;21733;21734;21735;21736;21737;21738;21739;21740;22843;22844;22845;22846;22847;22848;22849;22850;22851;22852;22853;22854;22986;22987;22988;25568;25569;25570;25571;25572;25573;25574;25575;26572;26573;26574;26575;26576;26577;26578;26579;26580;26581;26582;26702;26703;26704;26705;26706;26707;26708;26709;26710;26711;26712;26907;27478;27479;27480;27481;27482;27483;27484;27485;27486;27487;27488;27489;27490;27491;27492;28764;28765;28766;28767;28768;28769;28770;28771;28772;28773;28774;28775;28776;28816;28817;28818;28819;28820;28821;28822;28823;28824;28825;28826;28827;28828;28829;28830;28831;30170;30171;30172;30173;30174;30175;30176;30177;30178;30179;30180;30181;30182;30183;30184;30233;30234;30235;30236;30237;30238;30239;30240;30593;30594;30595;30596;30597;30598;31192;33931;33932;33933;33934;33935;33936;34903;34904;34905;34906;34907;34908;34909;36253;36254;36255;36256;36257;36737;36738;39574;39575;39576;39577;39578;39579;40064;40501;40502;40503;40504;40943;42118;42119;42120;42121;44110;44111;44112;44113;44114;44115;44116;44117;44118;44119 3185;3537;3548;3862;4445;5359;5484;5486;7704;8484;8509;13080;14477;15884;15900;18103;20394;21740;22844;22987;25574;26579;26581;26702;26708;26907;27481;28767;28776;28825;30178;30180;30234;30594;31192;33935;34909;36254;36738;39574;39578;40064;40501;40943;42121;44110 16;17;18;19;20 59;85;120;125;407 -1;-1
YAL012W YAL012W 4 4 4 YAL012W pep chromosome:R64-1-1:I:130799:131983:1 gene:YAL012W transcript:YAL012W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CYS3 description:Cystathionine gamma-lyase; catalyzes one of the two reactions involved in the t 1 4 4 4 2 1 3 1 0 0 2 1 3 1 0 0 2 1 3 1 0 0 17.8 17.8 17.8 42.542 394 394 0 7.2033 7.9 2.8 15 2.8 0 0 115030000 49002000 628210 64853000 545180 0 0 0 0 38214000 0 0 0 2 1 3 1 0 0 7 34 1075;1575;4699;10813 True;True;True;True 1123;1638;4896;11332 4451;4452;4453;6263;17858;17859;41611 4476;4477;4478;6299;17974;17975;41874 4477;6299;17974;41874 -1
YAL016W YAL016W 1 1 1 YAL016W pep chromosome:R64-1-1:I:124879:126786:1 gene:YAL016W transcript:YAL016W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TPD3 description:Regulatory subunit A of the heterotrimeric PP2A complex; the heterotrimeric pro 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1.7 1.7 1.7 70.907 635 635 0.0022953 2.3459 1.7 0 0 0 1.7 0 5184800 3885800 0 0 0 1299000 0 0 0 0 0 4295000 0 1 0 0 0 1 0 2 35 2451 True 2536 9296;9297 9343;9344 9343 -1
YAL019W YAL019W 8 8 8 YAL019W pep chromosome:R64-1-1:I:114919:118314:1 gene:YAL019W transcript:YAL019W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FUN30 description:Snf2p family member with ATP-dependent chromatin remodeling activity; has a ro 1 8 8 8 4 2 3 3 1 4 4 2 3 3 1 4 4 2 3 3 1 4 9 9 9 128.51 1131 1131 0 12.17 4.2 2.4 3.3 4.2 0.8 5.4 96979000 26072000 8431600 29574000 9254000 907450 22739000 26450000 21499000 22503000 18219000 0 22876000 4 2 3 3 1 4 17 36 808;3463;6135;6720;7449;8262;10429;11489 True;True;True;True;True;True;True;True 849;3594;6388;7000;7822;8679;10934;12030 3354;13175;23554;23555;23556;25632;28615;31601;31602;39969;39970;39971;44385;44386;44387;44388;44389 3366;13264;23695;23696;23697;25786;28793;31797;31798;40206;40207;40208;44691;44692;44693;44694;44695 3366;13264;23696;25786;28793;31798;40208;44695 -1
YAL021C YAL021C 4 4 4 YAL021C pep chromosome:R64-1-1:I:110846:113359:-1 gene:YAL021C transcript:YAL021C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCR4 description:Component of the CCR4-NOT transcriptional complex; CCR4-NOT is involved in reg 1 4 4 4 1 0 3 1 0 0 1 0 3 1 0 0 1 0 3 1 0 0 6.5 6.5 6.5 94.669 837 837 0 14.474 0.8 0 5.6 0.8 0 0 28951000 4956100 0 19541000 4453100 0 0 0 0 11515000 0 0 0 1 0 3 1 0 0 5 37 2323;6991;10015;10042 True;True;True;True 2407;7280;10505;10533 8854;26726;38399;38400;38484 8899;26887;38631;38632;38716 8899;26887;38631;38716 -1
YAL023C YAL023C 2 2 2 YAL023C pep chromosome:R64-1-1:I:106272:108551:-1 gene:YAL023C transcript:YAL023C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PMT2 description:Protein O-mannosyltransferase of the ER membrane; transfers mannose residues f 1 2 2 2 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 2.9 2.9 2.9 86.869 759 759 0.00080972 2.9222 0 0 0 1.6 0 1.3 1354800 0 0 0 1354800 0 0 0 0 0 2787000 0 0 0 0 0 1 0 1 2 38 1084;1175 True;True 1133;1226 4477;4792 4502;4818 4502;4818 -1
YAL025C YAL025C 10 10 10 YAL025C pep chromosome:R64-1-1:I:100225:101145:-1 gene:YAL025C transcript:YAL025C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MAK16 description:Essential nuclear protein; constituent of 66S pre-ribosomal particles; requir 1 10 10 10 6 5 9 6 6 5 6 5 9 6 6 5 6 5 9 6 6 5 33.3 33.3 33.3 35.695 306 306 0 45.463 23.2 19.3 33 22.2 22.5 19.3 697360000 125820000 52300000 302790000 72598000 30764000 113090000 149010000 116940000 115710000 194450000 124590000 119660000 6 5 10 6 6 5 38 39 321;550;3722;4198;5513;6808;7413;8546;8762;8937 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 337;581;3868;4370;5749;7093;7094;7783;8970;9193;9376 1420;1421;2404;2405;2406;14137;14138;14139;14140;14141;15971;21218;26018;26019;26020;26021;26022;26023;28451;28452;28453;28454;28455;32584;32585;32586;33441;33442;33443;33444;33445;33446;34062;34063;34064;34065;34066;34067 1423;1424;2411;2412;2413;14234;14235;14236;14237;14238;16080;21345;26175;26176;26177;26178;26179;26180;28629;28630;28631;28632;28633;32780;32781;32782;33641;33642;33643;33644;33645;33646;34265;34266;34267;34268;34269;34270 1423;2412;14236;16080;21345;26179;28633;32782;33645;34269 21 119 -1
YAL035W YAL035W 56 56 56 YAL035W pep chromosome:R64-1-1:I:76427:79435:1 gene:YAL035W transcript:YAL035W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FUN12 description:Translation initiation factor eIF5B; GTPase that promotes Met-tRNAiMet binding t 1 56 56 56 35 31 31 39 30 34 35 31 31 39 30 34 35 31 31 39 30 34 55.9 55.9 55.9 112.27 1002 1002 0 323.31 38.4 30 40.9 40.4 32.3 42.3 9709300000 1644400000 1217000000 3037800000 1337300000 566780000 1905900000 2150300000 2478700000 1975300000 2400800000 1909200000 2154100000 41 39 40 48 37 38 243 40 55;192;527;528;666;952;1571;3238;3266;3328;3437;3700;3701;3724;3972;4516;4517;4548;4815;4963;4964;5076;5383;5384;5677;6095;6096;6317;8270;8379;8392;8400;8457;8510;8605;8617;8822;8823;9021;9138;9444;9445;9731;10277;10646;10647;10648;10887;11047;11141;11142;11345;11403;11645;12363;12364 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 57;202;556;557;704;997;1634;3354;3355;3384;3449;3563;3846;3847;3870;4132;4709;4710;4742;5016;5017;5169;5170;5286;5611;5612;5917;6346;6347;6578;8687;8797;8810;8821;8879;8934;9029;9041;9255;9256;9464;9586;9908;9909;10207;10776;11154;11155;11156;11407;11574;11675;11676;11882;11940;12194;12937;12938 229;230;231;232;233;844;845;846;847;2295;2296;2297;2298;2299;2300;2301;2302;2303;2304;2305;2306;2786;2787;3982;3983;3984;3985;3986;6252;12239;12240;12241;12242;12243;12244;12245;12246;12247;12248;12367;12368;12369;12370;12604;13043;14067;14068;14069;14070;14071;14072;14073;14074;14075;14076;14077;14078;14143;14144;14145;14146;14147;15108;17196;17197;17198;17199;17200;17343;17344;17345;17346;17347;17348;17349;17350;17351;17352;17353;17354;18303;18304;18305;18306;18307;18308;18309;18310;18311;18312;18313;18314;18880;18881;18882;18883;18884;18885;19394;19395;19396;19397;19398;19399;20632;20633;20634;20635;21782;21783;21784;21785;21786;21787;23403;23404;23405;23406;23407;23408;24156;24157;24158;31625;31626;31971;31972;31973;31974;31975;31976;31977;31978;31979;31980;31981;32018;32019;32056;32057;32058;32059;32060;32061;32062;32063;32064;32237;32238;32239;32240;32241;32242;32451;32452;32782;32783;32784;32818;32819;32820;33659;33660;33661;33662;33663;33664;33665;33666;33667;34519;34520;34521;34522;34523;34978;34979;34980;36224;36225;36226;36227;36228;36229;36230;36231;36232;36233;36234;37296;37297;37298;37299;37300;37301;39436;39437;40714;40715;40716;40717;40718;40719;40720;40721;40722;40723;40724;40725;40726;40727;40728;41858;42509;42894;42895;42896;42897;42898;42899;42900;42901;42902;42903;42904;42905;42906;42907;42908;42909;43767;43768;43769;43770;44051;44052;45009;45010;45011;45012;45013;45014;47815;47816 230;231;232;233;234;846;847;848;849;2302;2303;2304;2305;2306;2307;2308;2309;2310;2311;2312;2313;2795;2796;3997;3998;3999;4000;4001;6288;12324;12325;12326;12327;12328;12329;12330;12331;12332;12333;12452;12453;12454;12455;12690;13131;14162;14163;14164;14165;14166;14167;14168;14169;14170;14171;14172;14173;14174;14240;14241;14242;14243;14244;15215;17310;17311;17312;17313;17314;17457;17458;17459;17460;17461;17462;17463;17464;17465;17466;17467;17468;18420;18421;18422;18423;18424;18425;18426;18427;18428;18429;18430;18431;19002;19003;19004;19005;19006;19007;19517;19518;19519;19520;19521;19522;20759;20760;20761;20762;21911;21912;21913;21914;21915;21916;23540;23541;23542;23543;23544;23545;24304;24305;24306;31821;31822;32167;32168;32169;32170;32171;32172;32173;32174;32175;32176;32177;32214;32215;32252;32253;32254;32255;32256;32257;32258;32259;32260;32433;32434;32435;32436;32437;32438;32647;32648;32979;32980;32981;33015;33016;33017;33859;33860;33861;33862;33863;33864;33865;33866;33867;34726;34727;34728;34729;34730;35186;35187;35188;36436;36437;36438;36439;36440;36441;36442;36443;36444;36445;36446;37518;37519;37520;37521;37522;37523;39672;39673;40957;40958;40959;40960;40961;40962;40963;40964;40965;40966;40967;40968;40969;40970;40971;42122;42804;43191;43192;43193;43194;43195;43196;43197;43198;43199;43200;43201;43202;43203;43204;43205;43206;44066;44067;44068;44069;44350;44351;45319;45320;45321;45322;45323;45324;48147;48148 234;847;2304;2309;2796;3998;6288;12327;12452;12690;13131;14168;14174;14244;15215;17310;17313;17466;18420;19004;19005;19520;20759;20762;21913;23540;23542;24305;31822;32171;32215;32257;32436;32648;32979;33015;33862;33863;34726;35187;36443;36446;37522;39672;40961;40965;40970;42122;42804;43196;43204;44066;44350;45321;48147;48148 22;23;24 625;667;880 -1
YAL036C YAL036C 20 20 20 YAL036C pep chromosome:R64-1-1:I:75043:76152:-1 gene:YAL036C transcript:YAL036C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RBG1 description:Member of the DRG family of GTP-binding proteins; associates with translating ri 1 20 20 20 12 10 12 13 10 12 12 10 12 13 10 12 12 10 12 13 10 12 66.9 66.9 66.9 40.701 369 369 0 90.756 48.8 38.8 40.4 45 36.6 43.1 873320000 111400000 76798000 352760000 85660000 49120000 197580000 167630000 157690000 192190000 171190000 158560000 192670000 13 11 12 13 11 13 73 41 318;879;1024;1771;1862;2958;3081;3251;3660;4468;4553;4554;6777;7336;8183;8415;9331;9973;10149;10493 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 334;922;1072;1838;1933;3064;3190;3368;3806;4659;4747;4748;4749;7060;7701;8594;8836;9787;10462;10645;11000 1415;1416;1417;3642;3643;3644;3645;3646;3647;3648;4306;6994;6995;7268;7269;7270;7271;7272;11212;11213;11214;11215;11216;11217;11648;12297;12298;12299;12300;12301;13941;13942;13943;13944;13945;13946;17020;17021;17022;17370;17371;17372;17373;17374;17375;17376;17377;17378;17379;17380;17381;17382;17383;17384;17385;17386;17387;17388;25894;28127;28128;31293;31294;32112;35786;35787;35788;35789;38274;38933;38934;38935;38936;38937;38938;40209;40210 1418;1419;1420;3655;3656;3657;3658;3659;3660;3661;4328;7034;7035;7309;7310;7311;7312;7313;11289;11290;11291;11292;11293;11294;11730;12382;12383;12384;12385;12386;14032;14033;14034;14035;14036;14037;17134;17135;17136;17484;17485;17486;17487;17488;17489;17490;17491;17492;17493;17494;17495;17496;17497;17498;17499;17500;17501;17502;26051;28301;28302;31488;31489;32308;35994;35995;35996;35997;38506;39168;39169;39170;39171;39172;39173;40450;40451 1420;3660;4328;7035;7309;11289;11730;12384;14037;17135;17491;17499;26051;28301;31488;32308;35996;38506;39170;40451 25 116 -1
YAL038W YAL038W 43 43 41 YAL038W pep chromosome:R64-1-1:I:71786:73288:1 gene:YAL038W transcript:YAL038W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC19 description:Pyruvate kinase; functions as a homotetramer in glycolysis to convert phosphoeno 1 43 43 41 33 35 36 33 35 33 33 35 36 33 35 33 31 35 34 32 34 32 89 89 87 54.544 500 500 0 323.31 80.6 82.6 79 80.4 82 79.2 23799000000 3850700000 2179800000 9775200000 2112500000 1192400000 4688300000 4877900000 3963100000 6579000000 4056700000 3608500000 4721200000 52 51 61 53 54 51 322 42 78;147;206;250;344;403;404;1948;2061;2856;2857;2864;3225;3385;3414;3415;3908;3909;4185;4186;4197;4416;4433;5057;5303;6812;6813;7199;7368;7512;8615;8834;8835;9398;9801;9938;10147;10148;10462;10463;10569;11559;12271 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 80;81;153;154;216;261;362;428;429;2022;2138;2957;2958;2965;3339;3340;3341;3510;3540;3541;4066;4067;4068;4356;4357;4358;4369;4603;4620;5267;5525;7098;7099;7536;7537;7735;7889;7890;9039;9267;9268;9860;9861;9862;10282;10427;10642;10643;10644;10969;10970;11077;12102;12103;12842 306;307;308;309;310;311;312;313;314;315;316;317;318;319;320;321;322;638;639;640;641;642;643;644;645;646;647;648;649;650;651;652;653;654;655;883;884;885;886;1098;1099;1100;1101;1519;1520;1521;1522;1523;1757;1758;1759;1760;1761;1762;1763;1764;1765;1766;7477;7867;7868;7869;7870;7871;7872;7873;7874;10836;10837;10838;10839;10840;10841;10842;10843;10844;10845;10846;10847;10848;10849;10850;10851;10852;10853;10854;10855;10856;10876;10877;10878;10879;10880;10881;12170;12171;12172;12173;12174;12175;12176;12177;12178;12179;12180;12181;12182;12183;12184;12185;12186;12187;12835;12836;12837;12838;12839;12953;12954;12955;12956;12957;12958;12959;12960;12961;12962;12963;12964;12965;12966;12967;14858;14859;14860;14861;14862;14863;14864;14865;14866;14867;14868;14869;14870;14871;14872;14873;14874;14875;14876;14877;14878;14879;15927;15928;15929;15930;15931;15932;15933;15934;15935;15936;15937;15938;15964;15965;15966;15967;15968;15969;15970;16787;16788;16853;16854;16855;16856;19276;19277;19278;19279;19280;19281;19282;19283;19284;19285;20254;20255;20256;20257;20258;20259;20260;20261;20262;20263;20264;20265;20266;26030;26031;26032;26033;26034;26035;26036;26037;26038;26039;26040;26041;27577;27578;27579;27580;27581;27582;27583;27584;27585;27586;27587;27588;27589;27590;28263;28264;28265;28266;28267;28268;28269;28270;28271;28857;28858;28859;28860;28861;28862;28863;28864;28865;28866;32813;32814;32815;32816;33712;33713;33714;33715;33716;33717;33718;33719;33720;36048;36049;36050;36051;36052;36053;36054;36055;36056;36057;36058;36059;36060;36061;37598;37599;37600;38145;38146;38147;38148;38149;38925;38926;38927;38928;38929;38930;38931;38932;40082;40083;40084;40085;40086;40087;40088;40089;40090;40091;40092;40093;40094;40482;40483;40484;44647;44648;44649;44650;44651;44652;44653;47465;47466;47467;47468;47469;47470;47471;47472;47473;47474 307;308;309;310;311;312;313;314;315;316;317;318;319;320;321;322;323;639;640;641;642;643;644;645;646;647;648;649;650;651;652;653;654;655;656;885;886;887;888;1100;1101;1102;1103;1522;1523;1524;1525;1526;1763;1764;1765;1766;1767;1768;1769;1770;1771;1772;7518;7909;7910;7911;7912;7913;7914;7915;7916;10904;10905;10906;10907;10908;10909;10910;10911;10912;10913;10914;10915;10916;10917;10918;10919;10920;10921;10922;10923;10924;10925;10926;10927;10947;10948;10949;10950;10951;10952;12255;12256;12257;12258;12259;12260;12261;12262;12263;12264;12265;12266;12267;12268;12269;12270;12271;12272;12922;12923;12924;12925;12926;13040;13041;13042;13043;13044;13045;13046;13047;13048;13049;13050;13051;13052;13053;13054;14962;14963;14964;14965;14966;14967;14968;14969;14970;14971;14972;14973;14974;14975;14976;14977;14978;14979;14980;14981;14982;14983;16036;16037;16038;16039;16040;16041;16042;16043;16044;16045;16046;16047;16073;16074;16075;16076;16077;16078;16079;16899;16900;16965;16966;16967;16968;19399;19400;19401;19402;19403;19404;19405;19406;19407;19408;20379;20380;20381;20382;20383;20384;20385;20386;20387;20388;20389;20390;20391;26187;26188;26189;26190;26191;26192;26193;26194;26195;26196;26197;26198;27750;27751;27752;27753;27754;27755;27756;27757;27758;27759;27760;27761;27762;27763;28438;28439;28440;28441;28442;28443;28444;28445;28446;29038;29039;29040;29041;29042;29043;29044;29045;29046;29047;33010;33011;33012;33013;33913;33914;33915;33916;33917;33918;33919;33920;33921;36259;36260;36261;36262;36263;36264;36265;36266;36267;36268;36269;36270;36271;36272;37827;37828;37829;38376;38377;38378;38379;38380;39160;39161;39162;39163;39164;39165;39166;39167;40320;40321;40322;40323;40324;40325;40326;40327;40328;40329;40330;40331;40332;40725;40726;40727;44953;44954;44955;44956;44957;44958;44959;47796;47797;47798;47799;47800;47801;47802;47803;47804;47805 314;640;886;1100;1525;1768;1769;7518;7911;10908;10921;10948;12258;12925;13041;13050;14970;14980;16038;16042;16079;16899;16968;19403;20387;26189;26197;27757;28445;29038;33011;33913;33919;36263;37827;38378;39160;39165;40322;40329;40726;44959;47801 26;27;28;29;30;31;32;33;34;35 50;109;126;209;261;300;304;330;348;368 -1
YAL042W YAL042W 1 1 1 YAL042W pep chromosome:R64-1-1:I:61316:62563:1 gene:YAL042W transcript:YAL042W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERV46 description:Protein localized to COPII-coated vesicles; forms a complex with Erv41p; involve 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 2.7 2.7 2.7 46.235 415 415 0.0086269 1.7601 0 0 0 0 2.7 2.7 5383900 0 0 0 0 2326200 3057800 0 0 0 0 0 3057800 0 0 0 0 1 1 2 43 9719 True 10193 37245;37246 37466;37467 37467 -1
YAL059W YAL059W 2 2 2 YAL059W pep chromosome:R64-1-1:I:36509:37147:1 gene:YAL059W transcript:YAL059W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ECM1 description:Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export; associates 1 2 2 2 0 2 0 0 1 0 0 2 0 0 1 0 0 2 0 0 1 0 10.8 10.8 10.8 23.891 212 212 0 6.0989 0 10.8 0 0 4.2 0 5945600 0 4902900 0 0 1042700 0 0 10635000 0 0 0 0 0 2 0 0 1 0 3 44 1792;10000 True;True 1859;10489 7055;38349;38350 7095;38581;38582 7095;38581 -1
YBL002W;YDR224C YBL002W;YDR224C 14;10 14;10 14;10 YBL002W pep chromosome:R64-1-1:II:236492:236887:1 gene:YBL002W transcript:YBL002W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HTB2 description:Histone H2B; core histone protein required for chromatin assembly and chromoso 2 14 14 14 11 9 11 10 10 9 11 9 11 10 10 9 11 9 11 10 10 9 78.6 78.6 78.6 14.237 131 131;131 0 97.439 61.8 52.7 64.9 58 56.5 55.7 16029000000 3218500000 810270000 4960800000 1170800000 581280000 5287200000 1992400000 1356700000 3804800000 1951300000 2671300000 4518600000 16 9 18 15 15 15 88 45 655;1743;2032;3491;3787;5025;5338;5339;5987;8384;9363;9543;11270;11473 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 693;1810;2109;3625;3936;5234;5563;5564;6238;8802;9822;9823;10011;10012;11807;12012 2754;2755;6895;6896;6897;6898;6899;7743;7744;7745;7746;7747;7748;13276;13277;13278;13279;13280;14393;14394;19150;19151;19152;19153;19154;19155;19156;19157;19158;19159;20408;20409;20410;20411;22961;22962;22963;22964;22965;31991;31992;31993;31994;31995;31996;31997;31998;31999;32000;35917;35918;35919;35920;35921;35922;35923;35924;35925;35926;35927;35928;35929;35930;35931;35932;35933;36597;36598;36599;36600;36601;43418;43419;43420;43421;43422;43423;43424;43425;43426;43427;43428;43429;43430;43431;44301;44302;44303;44304 2763;2764;6935;6936;6937;6938;6939;7785;7786;7787;7788;7789;7790;13365;13366;13367;13368;13369;14492;14493;19273;19274;19275;19276;19277;19278;19279;19280;19281;19282;20535;20536;20537;20538;23096;23097;23098;23099;23100;32187;32188;32189;32190;32191;32192;32193;32194;32195;32196;36127;36128;36129;36130;36131;36132;36133;36134;36135;36136;36137;36138;36139;36140;36141;36142;36143;36814;36815;36816;36817;36818;43716;43717;43718;43719;43720;43721;43722;43723;43724;43725;43726;43727;43728;43729;44607;44608;44609;44610 2764;6938;7789;13368;14493;19280;20536;20538;23099;32194;36140;36814;43718;44607 36 63 -1;-1
YDR225W;YBL003C YDR225W;YBL003C 10;10 10;10 9;9 YDR225W pep chromosome:R64-1-1:IV:915530:915928:1 gene:YDR225W transcript:YDR225W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HTA1 description:Histone H2A; core histone protein required for chromatin assembly and chromoso 2 10 10 9 5 4 6 7 8 7 5 4 6 7 8 7 4 4 6 6 7 6 62.9 62.9 62.9 13.989 132 132;132 0 76.084 34.8 34.8 57.6 35.6 56.1 34.1 9490200000 2256200000 368970000 2416800000 866040000 691210000 2891000000 2349700000 1238400000 1441100000 1742800000 2426200000 2931300000 9 9 13 13 13 13 70 46 254;3619;3621;3622;4061;6195;6196;7370;7371;8508 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 265;3762;3764;3765;4227;6452;6453;7737;7738;8932 1107;1108;1109;1110;13807;13808;13809;13810;13812;13813;13814;13815;13816;13817;13818;13819;13820;13821;13822;13823;13824;13825;13826;13827;13828;13829;15441;15442;15443;15444;23763;23764;23765;23766;23767;23768;23769;23770;23771;23772;23773;23774;23775;23776;23777;28273;28274;28275;28276;28277;28278;28279;28280;28281;28282;28283;28284;28285;28286;28287;28288;28289;28290;28291;28292;28293;28294;28295;28296;32438;32439 1109;1110;1111;1112;13898;13899;13900;13901;13903;13904;13905;13906;13907;13908;13909;13910;13911;13912;13913;13914;13915;13916;13917;13918;13919;13920;15549;15550;15551;15552;23905;23906;23907;23908;23909;23910;23911;23912;23913;23914;23915;23916;23917;23918;23919;28448;28449;28450;28451;28452;28453;28454;28455;28456;28457;28458;28459;28460;28461;28462;28463;28464;28465;28466;28467;28468;28469;28470;28471;32634;32635 1109;13900;13903;13918;15549;23907;23919;28464;28470;32635 -1;-1
YBL004W YBL004W 25 25 25 YBL004W pep chromosome:R64-1-1:II:227636:235117:1 gene:YBL004W transcript:YBL004W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP20 description:Component of the small-subunit (SSU) processome; SSU processome is involved i 1 25 25 25 10 6 13 8 6 5 10 6 13 8 6 5 10 6 13 8 6 5 13.3 13.3 13.3 287.56 2493 2493 0 49.818 5.5 3 7.4 4 3.4 3.2 258420000 38285000 22509000 117560000 30504000 14609000 34953000 40190000 53223000 61788000 60450000 51938000 46524000 10 6 11 8 6 5 46 47 350;361;906;2142;2313;2605;2664;3566;3758;3826;4224;4280;4317;4634;5506;6561;6573;6831;8154;8913;9097;10208;11297;11340;12141 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 369;381;949;2222;2397;2699;2758;3704;3705;3906;3977;4397;4456;4494;4830;5742;6837;6850;7118;8565;9349;9543;10704;11834;11877;12705 1561;1562;1563;1599;3748;8198;8814;8815;8816;8817;8818;8819;9859;9860;9861;10046;13582;13583;13584;14280;14530;14531;14532;14533;16035;16036;16265;16266;16394;16395;17656;17657;21196;21197;25061;25062;25106;26128;31204;33978;34806;39167;39168;39169;43568;43569;43729;47015 1564;1565;1566;1602;3762;8240;8859;8860;8861;8862;8863;8864;9910;9911;9912;10099;13671;13672;13673;14378;14629;14630;14631;14632;16144;16145;16374;16375;16503;16504;17771;17772;21323;21324;25211;25212;25256;26285;31397;34180;35014;39402;39403;39404;43867;43868;44028;47342 1564;1602;3762;8240;8861;9910;10099;13673;14378;14631;16145;16374;16504;17772;21324;25212;25256;26285;31397;34180;35014;39403;43868;44028;47342 37 2012 -1
YBL006C YBL006C 2 2 2 YBL006C pep chromosome:R64-1-1:II:216587:217129:-1 gene:YBL006C transcript:YBL006C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LDB7 description:Component of the RSC chromatin remodeling complex; interacts with Rsc3p, Rsc3 1 2 2 2 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 28.9 28.9 28.9 19.792 180 180 0 4.3987 15.6 0 0 0 0 13.3 18798000 5849100 0 0 0 0 12949000 0 0 0 0 0 12949000 1 0 0 0 0 1 2 48 51;11513 True;True 53;12055 218;44470 219;44776 219;44776 -1
YBL007C YBL007C 19 19 19 YBL007C pep chromosome:R64-1-1:II:212632:216366:-1 gene:YBL007C transcript:YBL007C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SLA1 description:Cytoskeletal protein binding protein; required for assembly of the cortical a 1 19 19 19 9 5 7 8 9 10 9 5 7 8 9 10 9 5 7 8 9 10 23.6 23.6 23.6 135.85 1244 1244 0 105.65 12 9.1 8.8 9.5 10.7 14.2 959520000 174490000 53817000 305430000 117730000 99458000 208600000 188990000 184710000 214030000 209910000 286130000 220470000 9 6 7 8 10 11 51 49 979;1858;3635;3691;3797;3798;6061;8776;8870;8965;9125;9368;9756;9939;10109;10110;10700;11106;11107 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1025;1928;3779;3837;3947;3948;6312;9207;9306;9405;9572;9828;10232;10428;10601;10602;11211;11637;11638 4085;4086;4087;4088;4089;7254;7255;7256;13862;13863;13864;14039;14040;14041;14042;14043;14044;14438;14439;14440;14441;14442;14443;14444;23255;33484;33828;34169;34170;34171;34917;34918;35943;35944;37384;38150;38151;38152;38768;38769;41010;42769;42770;42771;42772;42773;42774;42775;42776;42777;42778 4101;4102;4103;4104;4105;7295;7296;7297;13953;13954;13955;14134;14135;14136;14137;14138;14139;14537;14538;14539;14540;14541;14542;14543;23391;33684;34029;34375;34376;34377;35125;35126;36153;36154;37606;38381;38382;38383;39003;39004;41257;43064;43065;43066;43067;43068;43069;43070;43071;43072;43073 4105;7296;13954;14137;14537;14542;23391;33684;34029;34377;35126;36153;37606;38381;39003;39004;41257;43064;43070 -1
YBL011W YBL011W 2 2 2 YBL011W pep chromosome:R64-1-1:II:203538:205817:1 gene:YBL011W transcript:YBL011W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SCT1 description:Glycerol 3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase; dual sub 1 2 2 2 0 1 1 2 1 0 0 1 1 2 1 0 0 1 1 2 1 0 3.7 3.7 3.7 85.693 759 759 0.00084034 3.2611 0 2.4 2.4 3.7 2.4 0 10742000 0 1728400 4472800 3342600 1198600 0 0 0 0 6876000 0 0 0 1 1 2 1 0 5 50 968;9934 True;True 1013;10423 4040;4041;4042;4043;38131 4056;4057;4058;4059;38362 4056;38362 -1
YBL016W YBL016W 3 2 2 YBL016W pep chromosome:R64-1-1:II:192451:193512:1 gene:YBL016W transcript:YBL016W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FUS3 description:Mitogen-activated serine/threonine protein kinase involved in mating; phosphoa 1 3 2 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 9.6 7.4 7.4 40.772 353 353 0.0015601 2.5438 2.8 0 0 0 0 6.8 3697700 916370 0 0 0 0 2781300 0 0 0 0 0 2781300 1 0 0 0 0 1 2 51 664;1296;10853 True;True;False 702;1349;11373 2784;5220;41754 2793;5251;42017 2793;5251;42017 -1
YBL022C YBL022C 2 2 2 YBL022C pep chromosome:R64-1-1:II:177874:181275:-1 gene:YBL022C transcript:YBL022C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PIM1 description:ATP-dependent Lon protease; involved in degradation of misfolded proteins in 1 2 2 2 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1.8 1.8 1.8 127.11 1133 1133 0.00081633 2.9771 0.8 1.8 0 0 0.8 0 5969600 2087700 2821800 0 0 1060100 0 0 6120900 0 0 0 0 1 2 0 0 1 0 4 52 3735;4290 True;True 3881;4466 14192;16308;16309;16310 14290;16417;16418;16419 14290;16418 -1
YBL024W YBL024W 21 21 21 YBL024W pep chromosome:R64-1-1:II:172534:174588:1 gene:YBL024W transcript:YBL024W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NCL1 description:S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA: m5C-methyltransferase; methylates cyto 1 21 21 21 1 14 1 14 4 5 1 14 1 14 4 5 1 14 1 14 4 5 47.8 47.8 47.8 77.878 684 684 0 67.937 3.2 29.1 2 34.6 8.8 12.4 196620000 3373100 69107000 12687000 72071000 10173000 29212000 0 163200000 0 121490000 41161000 27574000 1 15 1 15 4 5 41 53 1083;2486;3480;3606;3616;4199;4256;4560;4789;6428;6715;6718;6951;7384;7532;7973;8996;9946;9974;10287;11714 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1132;2572;3614;3749;3759;4371;4430;4755;4990;6697;6698;6995;6998;7239;7753;7910;8377;9439;10435;10463;10786;12270 4475;4476;9397;9398;9399;9400;13256;13769;13770;13771;13772;13773;13774;13800;15972;15973;15974;16170;17396;17397;18222;18223;24581;24582;24583;24584;25619;25620;25628;26588;28336;28928;28929;30573;34429;38173;38275;39469;39470;39471;45350 4500;4501;9445;9446;9447;9448;13345;13860;13861;13862;13863;13864;13865;13891;16081;16082;16083;16279;17511;17512;18339;18340;24730;24731;24732;24733;25773;25774;25782;26748;28513;29111;29112;30763;34635;38405;38507;39705;39706;39707;45664 4500;9447;13345;13862;13891;16082;16279;17512;18339;24730;25773;25782;26748;28513;29112;30763;34635;38405;38507;39706;45664 38 224 -1
YBR084C-A;YBL027W YBR084C-A;YBL027W 22;22 22;22 22;22 YBR084C-A pep chromosome:R64-1-1:II:414186:415261:-1 gene:YBR084C-A transcript:YBR084C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL19A description:Ribosomal 60S subunit protein L19A; rpl19a and rpl19b single null mut 2 22 22 22 15 14 16 14 13 15 15 14 16 14 13 15 15 14 16 14 13 15 51.3 51.3 51.3 21.704 189 189;189 0 132.83 44.4 48.1 47.6 43.9 39.7 40.7 12838000000 2100300000 1382500000 4465600000 1058700000 668540000 3161800000 2481800000 2705300000 2423700000 2903900000 2590900000 2818200000 20 18 19 17 16 19 109 54 530;531;576;966;1064;1079;1761;1762;3632;3633;3841;3842;4979;5421;5462;5463;6487;6488;8467;8542;8544;11718 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 559;560;608;1011;1112;1127;1828;1829;3775;3776;3998;3999;5185;5654;5698;5699;6763;6764;8889;8966;8968;12274 2310;2311;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318;2319;2497;2498;2499;2500;2501;2502;2503;2504;4032;4033;4034;4035;4408;4461;4462;6951;6952;6953;6954;6955;6956;6957;6958;6959;6960;13852;13853;13854;13855;13856;13857;13858;14605;14606;14607;14608;14609;14610;14611;18937;20833;20834;20835;20836;20837;20838;20839;20840;20841;20842;20843;20844;21051;21052;21053;21054;21055;21056;21057;21058;21059;21060;21061;21062;21063;24786;24787;24788;24789;24790;24791;24792;24793;24794;24795;24796;24797;24798;24799;32277;32278;32279;32280;32281;32282;32572;32573;32577;32578;45364;45365;45366;45367;45368;45369;45370;45371;45372;45373;45374;45375 2317;2318;2319;2320;2321;2322;2323;2324;2325;2326;2504;2505;2506;2507;2508;2509;2510;2511;4048;4049;4050;4051;4432;4486;4487;6991;6992;6993;6994;6995;6996;6997;6998;6999;7000;13943;13944;13945;13946;13947;13948;13949;14704;14705;14706;14707;14708;14709;14710;19059;20960;20961;20962;20963;20964;20965;20966;20967;20968;20969;20970;20971;21178;21179;21180;21181;21182;21183;21184;21185;21186;21187;21188;21189;21190;24935;24936;24937;24938;24939;24940;24941;24942;24943;24944;24945;24946;24947;24948;32473;32474;32475;32476;32477;32478;32768;32769;32773;32774;45678;45679;45680;45681;45682;45683;45684;45685;45686;45687;45688;45689 2318;2326;2509;4049;4432;4487;6991;6996;13944;13947;14704;14710;19059;20967;21178;21184;24937;24948;32476;32769;32773;45684 -1;-1
YBL030C;YBR085W YBL030C 16;5 16;5 14;3 YBL030C pep chromosome:R64-1-1:II:163041:163997:-1 gene:YBL030C transcript:YBL030C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PET9 description:Major ADP/ATP carrier of the mitochondrial inner membrane; exchanges cytosoli 2 16 16 14 9 11 11 6 6 8 9 11 11 6 6 8 7 10 10 6 5 7 47.8 47.8 43.4 34.426 318 318;307 0 51.392 30.2 39.3 39.6 23.6 20.8 28 622110000 73498000 64961000 340050000 18369000 15308000 109920000 101950000 103970000 155030000 59145000 66828000 123010000 9 13 9 6 6 8 51 55 2838;2920;4768;5023;6217;7191;8774;9891;9954;10334;10490;11179;11882;11917;11968;11969 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2937;3025;4968;5231;5232;6474;7528;9205;10377;10443;10834;10997;11714;12444;12480;12531;12532 10778;11081;11082;11083;11084;18163;19141;19142;19143;19144;19145;19146;19147;19148;23830;23831;23832;23833;23834;27563;27564;27565;27566;33480;33481;33482;37976;37977;37978;38212;38213;38214;38215;38216;39634;39635;40203;43048;45964;45965;45966;45967;45968;46112;46113;46114;46115;46312;46313;46314;46315;46316;46317 10846;11158;11159;11160;11161;18280;19264;19265;19266;19267;19268;19269;19270;19271;23972;23973;23974;23975;23976;27736;27737;27738;27739;33680;33681;33682;38207;38208;38209;38444;38445;38446;38447;38448;39870;39871;40444;43345;46280;46281;46282;46283;46284;46429;46430;46431;46432;46631;46632;46633;46634;46635;46636 10846;11158;18280;19266;23972;27738;33680;38208;38444;39870;40444;43345;46281;46432;46633;46636 39 29 -1;-1
YBL036C YBL036C 4 4 4 YBL036C pep chromosome:R64-1-1:II:150447:151220:-1 gene:YBL036C transcript:YBL036C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative non-specific single-domain racemase; based on structural similarity; binds pyridoxal 1 4 4 4 0 3 1 0 2 0 0 3 1 0 2 0 0 3 1 0 2 0 21.4 21.4 21.4 29.123 257 257 0 8.6995 0 16.3 5.1 0 10.9 0 18654000 0 9295100 4785900 0 4573200 0 0 20162000 0 0 0 0 0 2 1 0 2 0 5 56 1628;4066;9697;11422 True;True;True;True 1691;4232;10170;11959 6451;6452;15453;37153;44112;44113 6487;6488;15561;37372;44411;44412 6487;15561;37372;44412 -1
YBL037W YBL037W 4 4 4 YBL037W pep chromosome:R64-1-1:II:147209:150286:1 gene:YBL037W transcript:YBL037W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:APL3 description:Alpha-adaptin; large subunit of the clathrin associated protein complex (AP-2) 1 4 4 4 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 4.8 4.8 4.8 115.01 1025 1025 0 13.231 1 1.3 0 2.5 1 1 5919600 904460 788270 0 2124300 1058600 1044000 0 0 0 4369900 0 0 1 1 0 2 1 1 6 57 3161;5262;5588;8702 True;True;True;True 3273;5483;5825;9128 11958;11959;20103;21468;33185;33186 12043;12044;20227;21595;33384;33385 12043;20227;21595;33385 -1
YBL038W YBL038W 3 3 3 YBL038W pep chromosome:R64-1-1:II:146187:146885:1 gene:YBL038W transcript:YBL038W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL16 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; homologous to bacteria 1 3 3 3 0 0 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 13.8 13.8 13.8 26.518 232 232 0 4.9645 0 0 0 12.1 0 8.2 5988200 0 0 0 2849800 0 3138400 0 0 0 5862400 0 0 0 0 0 2 0 1 3 58 270;4305;6469 True;True;True 283;4481;6741 1185;16355;24722 1187;16464;24871 1187;16464;24871 -1
YBL039C YBL039C 15 15 15 YBL039C pep chromosome:R64-1-1:II:143989:145728:-1 gene:YBL039C transcript:YBL039C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:URA7 description:Major CTP synthase isozyme (see also URA8); catalyzes the ATP-dependent trans 1 15 15 15 5 5 11 6 4 8 5 5 11 6 4 8 5 5 11 6 4 8 35.6 35.6 35.6 64.71 579 579 0 39.804 14.2 10.5 27.6 15 8.8 22.8 442570000 49049000 15228000 254150000 36112000 14797000 73234000 54220000 50201000 134600000 73519000 57833000 72928000 5 5 11 6 4 8 39 59 2299;3350;3401;4916;5841;6983;7120;7278;7279;7520;9239;10723;11210;12134;12320 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2382;3472;3526;5122;6085;7272;7431;7636;7637;7898;9692;11237;11745;12698;12893 8758;8759;12684;12685;12686;12902;12903;12904;18726;18727;18728;22384;22385;22386;22387;22388;26694;26695;26696;26697;26698;26699;27212;27928;27929;27930;28895;35432;41185;41186;41187;41188;43157;43158;43159;47001;47666;47667;47668 8803;8804;12770;12771;12772;12989;12990;12991;18847;18848;18849;22517;22518;22519;22520;22521;26855;26856;26857;26858;26859;26860;27375;28101;28102;28103;29078;35640;41437;41438;41439;41440;43454;43455;43456;47328;47998;47999;48000 8804;12771;12991;18848;22519;26858;27375;28101;28103;29078;35640;41438;43456;47328;47998 -1
YBL045C YBL045C 3 3 3 YBL045C pep chromosome:R64-1-1:II:134143:135516:-1 gene:YBL045C transcript:YBL045C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:COR1 description:Core subunit of the ubiquinol-cytochrome c reductase complex; the ubiquinol-c 1 3 3 3 0 0 3 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 3 0 0 0 7.9 7.9 7.9 50.227 457 457 0 5.9042 0 0 7.9 0 0 0 8255300 0 0 8255300 0 0 0 0 0 4864400 0 0 0 0 0 3 0 0 0 3 60 28;7989;9190 True;True;True 30;8393;9640 100;30647;35194 100;30837;35402 100;30837;35402 -1
YBL046W YBL046W 1 1 1 YBL046W pep chromosome:R64-1-1:II:132424:133749:1 gene:YBL046W transcript:YBL046W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PSY4 description:Regulatory subunit of protein phosphatase PP4; presence of Psy4p in the PP4 co 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.8 1.8 1.8 50.655 441 441 0.009299 1.6925 0 1.8 0 0 0 0 32408000 0 32408000 0 0 0 0 0 70299000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 61 1767 True 1834 6978 7018 7018 -1
YBL052C YBL052C 2 2 2 YBL052C pep chromosome:R64-1-1:II:119379:121874:-1 gene:YBL052C transcript:YBL052C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SAS3 description:Histone acetyltransferase catalytic subunit of NuA3 complex; acetylates histo 1 2 2 2 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 3.2 3.2 3.2 97.581 831 831 0.0059084 1.9823 0 0 1.6 0 1.7 1.6 5487500 0 0 2226900 0 1422800 1837800 0 0 0 0 4704400 0 0 0 0 0 1 0 1 62 7594;7649 True;True 7973;8030 29136;29137;29320 29319;29320;29503 29320;29503 -1
YBL054W YBL054W 1 1 1 YBL054W pep chromosome:R64-1-1:II:117589:119166:1 gene:YBL054W transcript:YBL054W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TOD6 description:PAC motif binding protein involved in rRNA and ribosome biogenesis; subunit of 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 2.9 2.9 2.9 59.225 525 525 0.0022901 2.3153 0 0 0 2.9 0 0 1229700 0 0 0 1229700 0 0 0 0 0 2529600 0 0 0 0 0 1 0 0 1 63 7854 True 8254 30176 30364 30364 -1
YBL057C YBL057C 1 1 1 YBL057C pep chromosome:R64-1-1:II:112801:113427:-1 gene:YBL057C transcript:YBL057C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PTH2 description:One of two mitochondrially-localized peptidyl-tRNA hydrolases; negatively reg 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 6.2 6.2 6.2 22.435 208 208 0.0015962 2.7703 0 6.2 0 0 0 0 2036800 0 2036800 0 0 0 0 0 4418100 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 64 936 True 979 3911 3926 3926 -1
YBL061C YBL061C 6 6 6 YBL061C pep chromosome:R64-1-1:II:105316:107406:-1 gene:YBL061C transcript:YBL061C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SKT5 description:Activator of Chs3p (chitin synthase III) during vegetative growth; recruits C 1 6 6 6 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 11.4 11.4 11.4 77.066 696 696 0 10.981 5.2 3 1.1 1.7 3.7 2 29084000 3611700 5649700 4371300 3795400 5039600 6616000 0 0 0 0 16663000 0 1 2 1 1 2 1 8 65 615;792;5844;7776;8711;9102 True;True;True;True;True;True 650;833;6088;8172;9138;9548 2613;2614;3311;22393;29894;33225;33226;33227;34816 2620;2621;3323;22526;30081;33424;33425;33426;35024 2620;3323;22526;30081;33424;35024 -1
YBL064C YBL064C 3 3 3 YBL064C pep chromosome:R64-1-1:II:100371:101156:-1 gene:YBL064C transcript:YBL064C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRX1 description:Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity; has a role 1 3 3 3 1 2 0 1 1 1 1 2 0 1 1 1 1 2 0 1 1 1 14.9 14.9 14.9 29.495 261 261 0 12.385 4.6 8.8 0 4.6 4.2 6.1 17261000 4710000 3428000 0 3708200 1448100 3967100 0 0 0 0 0 3967100 1 2 0 1 1 1 6 66 2288;4470;5951 True;True;True 2370;4661;6202 8715;8716;8717;17026;22848;22849 8760;8761;8762;17140;22983;22984 8761;17140;22984 -1
YBL068W YBL068W 6 5 4 YBL068W pep chromosome:R64-1-1:II:92414:93394:1 gene:YBL068W transcript:YBL068W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRS4 description:5-phospho-ribosyl-1(alpha)-pyrophosphate synthetase, synthesizes PRPP; which is 1 6 5 4 0 4 2 2 3 1 0 4 2 1 2 1 0 3 1 0 1 0 23.6 23.6 18.7 35.72 326 326 0 17.261 0 18.4 9.8 8 10.1 4.9 66498000 0 11663000 36601000 7265800 3563700 7404200 0 19891000 26975000 0 0 0 0 4 2 1 2 1 10 67 5137;5628;5901;6114;7205;10774 True;False;True;True;True;True 5349;5865;6148;6365;7544;11290 19612;21613;21614;22619;22620;22621;22622;22623;23479;23480;27608;41435 19735;21741;21742;22754;22755;22756;22757;22758;23619;23620;27781;41695 19735;21741;22757;23620;27781;41695 -1
YBL069W;YBL068W-A YBL069W;YBL068W-A 2;1 2;1 2;1 YBL069W pep chromosome:R64-1-1:II:90741:92030:1 gene:YBL069W transcript:YBL069W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:AST1 description:Lipid raft associated protein; interacts with the plasma membrane ATPase Pma1p a 2 2 2 2 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 4.7 4.7 4.7 48.348 429 429;78 0 8.379 0 2.8 1.9 2.8 0 0 28688000 0 4958500 21790000 1939500 0 0 0 0 0 3989900 0 0 0 1 1 1 0 0 3 68 5992;11521 True;True 6243;12063 22984;44495;44496 23119;44801;44802 23119;44802 -1;-1
YER102W;YBL072C YER102W;YBL072C 18;18 18;18 18;18 YER102W pep chromosome:R64-1-1:V:363100:363702:1 gene:YER102W transcript:YER102W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS8B description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mammalia 2 18 18 18 13 14 10 14 13 12 13 14 10 14 13 12 13 14 10 14 13 12 63.5 63.5 63.5 22.489 200 200;200 0 120.74 61.5 62.5 46.5 62.5 54 55 9976300000 1461800000 1220000000 3281500000 1239000000 555120000 2219000000 2264100000 1782000000 1938300000 2444700000 1908300000 2755000000 17 18 16 20 17 16 104 69 45;46;555;556;1025;1026;2217;3743;3917;3920;3921;5036;5257;6971;6972;7960;8437;8537 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 47;48;586;587;1073;1074;2299;3889;4076;4079;4080;5245;5478;7260;7261;8363;8858;8961 194;195;196;197;198;199;200;201;202;203;204;205;206;207;208;209;2424;2425;2426;2427;2428;2429;4307;4308;4309;8463;8464;8465;14214;14215;14216;14217;14218;14219;14220;14221;14222;14223;14224;14225;14901;14902;14903;14904;14905;14906;14907;14911;14912;14913;14914;14915;14916;14917;14918;14919;14920;14921;14922;14923;14924;14925;19187;19188;19189;19190;19191;19192;20097;26655;26656;26657;26658;26659;26660;26661;26662;26663;26664;26665;26666;26667;26668;26669;30535;30536;30537;30538;30539;30540;30541;30542;30543;30544;32166;32167;32168;32169;32170;32171;32172;32173;32174;32560 194;195;196;197;198;199;200;201;202;203;204;205;206;207;208;209;210;2431;2432;2433;2434;2435;2436;4329;4330;4331;8506;8507;8508;14312;14313;14314;14315;14316;14317;14318;14319;14320;14321;14322;14323;15005;15006;15007;15008;15009;15010;15011;15015;15016;15017;15018;15019;15020;15021;15022;15023;15024;15025;15026;15027;15028;15029;19310;19311;19312;19313;19314;19315;20221;26815;26816;26817;26818;26819;26820;26821;26822;26823;26824;26825;26826;26827;26828;26829;30725;30726;30727;30728;30729;30730;30731;30732;30733;30734;32362;32363;32364;32365;32366;32367;32368;32369;32370;32756 197;208;2431;2434;4329;4330;8508;14313;15006;15016;15020;19312;20221;26818;26826;30727;32363;32756 -1;-1
YBL076C YBL076C 30 30 30 YBL076C pep chromosome:R64-1-1:II:81043:84261:-1 gene:YBL076C transcript:YBL076C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ILS1 description:Cytoplasmic isoleucine-tRNA synthetase; target of the G1-specific inhibitor rev 1 30 30 30 3 24 3 21 5 8 3 24 3 21 5 8 3 24 3 21 5 8 31.9 31.9 31.9 122.98 1072 1072 0 122.53 4.3 27.6 3.7 25.2 7.3 10.5 466050000 11379000 234890000 17267000 124860000 11077000 66583000 9059200 497140000 9884600 273260000 24995000 80263000 3 26 3 22 6 10 70 70 535;591;1081;2095;2151;2296;2414;2415;2860;3158;3292;4214;5825;6065;6989;6990;7231;7513;7588;8010;9007;9796;9797;10005;11136;11186;11280;11918;11946;11977 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 565;623;1129;2174;2231;2378;2499;2500;2961;3270;3412;4387;6068;6316;7278;7279;7575;7891;7967;8415;9450;10277;10278;10494;11670;11721;11817;12481;12509;12540 2333;2334;2545;2546;4465;4466;4467;7994;7995;8214;8215;8216;8745;8746;8747;8748;9173;9174;9175;9176;10862;11949;11950;12469;16012;22307;22308;22309;22310;23277;26719;26720;26721;26722;26723;26724;26725;27707;27708;28867;28868;28869;28870;28871;28872;28873;28874;28875;29119;29120;30715;34476;34477;37579;37580;37581;38359;38360;42882;42883;43077;43485;43486;46116;46117;46118;46226;46227;46228;46335 2340;2341;2552;2553;4490;4491;4492;8036;8037;8256;8257;8258;8790;8791;8792;8793;9220;9221;9222;9223;10933;12034;12035;12555;16121;22438;22439;22440;22441;23413;26880;26881;26882;26883;26884;26885;26886;27880;27881;29048;29049;29050;29051;29052;29053;29054;29055;29056;29302;29303;30905;34683;34684;37808;37809;37810;38591;38592;43179;43180;43374;43783;43784;46433;46434;46435;46543;46544;46545;46655 2341;2552;4492;8037;8258;8792;9220;9222;10933;12034;12555;16121;22440;23413;26880;26886;27880;29055;29303;30905;34684;37808;37810;38591;43179;43374;43784;46434;46544;46655 40 769 -1
YBL079W YBL079W 1 1 1 YBL079W pep chromosome:R64-1-1:II:75259:79767:1 gene:YBL079W transcript:YBL079W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NUP170 description:Subunit of inner ring of nuclear pore complex (NPC); contributes to NPC assemb 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.8 0.8 0.8 169.47 1502 1502 0.0015674 2.6038 0 0.8 0 0 0 0 1746400 0 1746400 0 0 0 0 0 3788300 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 71 5771 True 6013 22086 22216 22216 -1
YBL085W YBL085W 6 6 4 YBL085W pep chromosome:R64-1-1:II:63876:66818:1 gene:YBL085W transcript:YBL085W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BOI1 description:Protein implicated in polar growth; functionally redundant with Boi2p; interacts 1 6 6 4 3 2 1 2 3 1 3 2 1 2 3 1 2 2 0 1 2 0 7.8 7.8 6 109.29 980 980 0 18.816 4.3 2.7 0.9 2.2 3.5 0.8 39708000 11881000 3330200 6763200 2806300 3775400 11152000 0 0 0 0 12483000 0 3 2 1 2 3 1 12 72 2248;3131;8919;10031;11295;12014 True;True;True;True;True;True 2330;3242;9355;10521;11832;12577 8567;8568;11868;11869;11870;33989;33990;38445;43564;46532;46533;46534 8612;8613;11952;11953;11954;34191;34192;38677;43863;46853;46854;46855 8613;11954;34191;38677;43863;46854 -1
YER117W;YBL087C YER117W;YBL087C 10;10 10;10 10;10 YER117W pep chromosome:R64-1-1:V:396769:397653:1 gene:YER117W transcript:YER117W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL23B description:Ribosomal 60S subunit protein L23B; homologous to mammalian ribosomal protein 2 10 10 10 8 10 7 9 8 8 8 10 7 9 8 8 8 10 7 9 8 8 53.3 53.3 53.3 14.473 137 137;137 0 42.465 40.9 53.3 40.9 47.4 47.4 46.7 4553400000 710700000 400020000 1596600000 573700000 245320000 1027000000 1037500000 420690000 1471500000 608910000 414840000 1247100000 19 17 14 24 14 16 104 73 1590;4651;5381;6426;6427;6458;6459;7723;10829;11348 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1653;4847;4848;5609;6692;6693;6694;6695;6696;6728;6729;6730;6731;8110;11349;11885 6314;6315;6316;17692;17693;17694;17695;17696;17697;17698;17699;17700;17701;17702;17703;17704;17705;17706;17707;17708;17709;17710;17711;17712;17713;17714;17715;20621;20622;20623;20624;20625;20626;20627;20628;24542;24543;24544;24545;24546;24547;24548;24549;24550;24551;24552;24553;24554;24555;24556;24557;24558;24559;24560;24561;24562;24563;24564;24565;24566;24567;24568;24569;24570;24571;24572;24573;24574;24575;24576;24577;24578;24579;24580;24680;24681;24682;24683;24684;24685;24686;24687;24688;24689;24690;24691;24692;24693;24694;24695;24696;24697;29620;29621;29622;29623;29624;29625;29626;41685;41686;41687;41688;43777;43778;43779;43780 6350;6351;6352;17807;17808;17809;17810;17811;17812;17813;17814;17815;17816;17817;17818;17819;17820;17821;17822;17823;17824;17825;17826;17827;17828;17829;17830;20748;20749;20750;20751;20752;20753;20754;20755;24690;24691;24692;24693;24694;24695;24696;24697;24698;24699;24700;24701;24702;24703;24704;24705;24706;24707;24708;24709;24710;24711;24712;24713;24714;24715;24716;24717;24718;24719;24720;24721;24722;24723;24724;24725;24726;24727;24728;24729;24829;24830;24831;24832;24833;24834;24835;24836;24837;24838;24839;24840;24841;24842;24843;24844;24845;24846;29804;29805;29806;29807;29808;29809;29810;41948;41949;41950;41951;44076;44077;44078;44079 6352;17827;20748;24711;24713;24837;24845;29805;41948;44079 41;42;43 23;57;59 -1;-1
YBL091C YBL091C 9 9 9 YBL091C pep chromosome:R64-1-1:II:47363:48628:-1 gene:YBL091C transcript:YBL091C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MAP2 description:Methionine aminopeptidase; catalyzes the cotranslational removal of N-terminal 1 9 9 9 5 7 4 7 4 5 5 7 4 7 4 5 5 7 4 7 4 5 32.8 32.8 32.8 47.518 421 421 0 57.642 13.5 24.2 14 23.5 12.1 18.8 298410000 58631000 60092000 42998000 54460000 19119000 63113000 98486000 106010000 49484000 76090000 68557000 60366000 5 10 5 8 4 6 38 74 2083;3474;5105;6326;7428;7638;8668;9979;12127 True;True;True;True;True;True;True;True;True 2161;3606;5315;6587;6588;7798;8019;9093;10468;12691 7956;7957;7958;13214;13215;13216;13217;13218;13219;19504;19505;19506;24174;24175;24176;24177;24178;24179;24180;24181;24182;24183;24184;28508;28509;29286;29287;29288;33031;33032;33033;33034;38282;46973;46974;46975;46976;46977 7998;7999;8000;13303;13304;13305;13306;13307;13308;19627;19628;19629;24322;24323;24324;24325;24326;24327;24328;24329;24330;24331;24332;28686;28687;29469;29470;29471;33229;33230;33231;33232;38514;47300;47301;47302;47303;47304 8000;13306;19629;24325;28686;29469;33231;38514;47301 44;45 130;135 -1
YBL092W YBL092W 12 12 12 YBL092W pep chromosome:R64-1-1:II:45978:46370:1 gene:YBL092W transcript:YBL092W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL32 description:Ribosomal 60S subunit protein L32; overexpression disrupts telomeric silencing; 1 12 12 12 7 10 7 10 8 10 7 10 7 10 8 10 7 10 7 10 8 10 62.3 62.3 62.3 14.771 130 130 0 64.806 47.7 62.3 45.4 56.9 51.5 55.4 6078800000 504730000 638300000 2368700000 662880000 544820000 1359400000 883490000 1323800000 1467000000 1342800000 1500900000 1360400000 10 16 9 14 14 13 76 75 813;1272;2472;2592;3006;7840;8213;10068;10069;10265;10752;10790 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 854;855;1324;1325;2558;2686;3113;8240;8627;10559;10560;10561;10763;11267;11308 3391;3392;3393;5111;5112;5113;5114;5115;5116;5117;5118;5119;5120;5121;5122;5123;5124;5125;5126;5127;9358;9810;9811;9812;9813;9814;9815;9816;9817;9818;11361;11362;11363;11364;11365;11366;30136;30137;30138;30139;30140;30141;31403;31404;31405;31406;31407;31408;38601;38602;38603;38604;38605;38606;38607;38608;38609;38610;39392;39393;39394;39395;41344;41345;41346;41347;41348;41349;41350;41351;41352;41353;41354;41525;41526;41527 3403;3404;3405;5140;5141;5142;5143;5144;5145;5146;5147;5148;5149;5150;5151;5152;5153;5154;5155;5156;5157;9405;9861;9862;9863;9864;9865;9866;9867;9868;9869;11440;11441;11442;11443;11444;11445;30324;30325;30326;30327;30328;30329;31599;31600;31601;31602;31603;31604;38834;38835;38836;38837;38838;38839;38840;38841;38842;38843;39628;39629;39630;39631;41604;41605;41606;41607;41608;41609;41610;41611;41612;41613;41614;41788;41789;41790 3405;5157;9405;9865;11443;30329;31604;38835;38838;39630;41608;41790 46 87 -1
YBL099W YBL099W 17 17 17 YBL099W pep chromosome:R64-1-1:II:37053:38690:1 gene:YBL099W transcript:YBL099W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ATP1 description:Alpha subunit of the F1 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase; which is a la 1 17 17 17 5 8 9 6 9 11 5 8 9 6 9 11 5 8 9 6 9 11 35.2 35.2 35.2 58.607 545 545 0 66.983 13 19.4 21.1 16.1 20 24.8 645230000 30927000 56899000 259150000 46080000 47795000 204380000 65376000 104770000 159860000 112450000 160970000 170300000 5 8 9 6 9 11 48 76 667;735;903;1844;3045;4010;4217;5735;8282;8608;9388;9754;9960;9961;10127;11201;11624 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 705;776;946;1913;3154;4173;4390;5976;8699;9032;9850;10230;10449;10450;10620;11736;12173 2788;2789;2790;2791;3056;3728;3729;7212;11517;15253;15254;15255;15256;15257;16021;16022;16023;16024;16025;21968;21969;31671;32790;32791;32792;32793;36016;36017;37381;37382;38228;38229;38230;38231;38232;38819;38820;38821;38822;38823;38824;43132;44917;44918;44919;44920;44921;44922 2797;2798;2799;2800;3067;3742;3743;7252;11596;15360;15361;15362;15363;15364;16130;16131;16132;16133;16134;22098;22099;31867;32987;32988;32989;32990;36227;36228;37603;37604;38460;38461;38462;38463;38464;39054;39055;39056;39057;39058;39059;43429;45225;45226;45227;45228;45229;45230 2797;3067;3743;7252;11596;15361;16133;22099;31867;32990;36227;37604;38460;38463;39054;43429;45225 -1
YBL101C YBL101C 3 3 3 YBL101C pep chromosome:R64-1-1:II:24946:28299:-1 gene:YBL101C transcript:YBL101C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ECM21 description:Protein involved in regulating endocytosis of plasma membrane proteins; identi 1 3 3 3 2 0 1 1 1 1 2 0 1 1 1 1 2 0 1 1 1 1 4.1 4.1 4.1 123.61 1117 1117 0 4.1017 3.1 0 1 1.1 1.1 1.1 23146000 5375900 0 8097300 2319800 2258800 5094600 7021900 0 0 0 0 0 2 0 1 1 1 0 5 77 3484;5824;9623 True;True;True 3618;6067;10094 13264;22303;22304;22305;22306;36859 13353;22434;22435;22436;22437;37078 13353;22435;37078 -1
YBL105C YBL105C 9 9 9 YBL105C pep chromosome:R64-1-1:II:14241:17696:-1 gene:YBL105C transcript:YBL105C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PKC1 description:Protein serine/threonine kinase; essential for cell wall remodeling during grow 1 9 9 9 4 4 7 4 4 1 4 4 7 4 4 1 4 4 7 4 4 1 7.8 7.8 7.8 131.48 1151 1151 0 24.56 4.3 2.7 5.6 2.7 3.4 1 92327000 16587000 8627700 48133000 7639200 4778800 6561500 20028000 24912000 14688000 15198000 25431000 0 4 4 7 4 4 1 24 78 1058;1294;3799;5394;7000;7563;8924;11515;12240 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1106;1347;3949;5622;7289;7941;9361;12057;12810 4397;5213;14445;14446;20660;20661;20662;20663;20664;26750;26751;26752;26753;29006;29007;29008;29009;29010;34013;44476;44477;44478;47351;47352 4421;5244;14544;14545;20787;20788;20789;20790;20791;26911;26912;26913;26914;29189;29190;29191;29192;29193;34215;44782;44783;44784;47681;47682 4421;5244;14545;20787;26912;29191;34215;44782;47681 -1
YDR001C;YBR001C YDR001C;YBR001C 1;1 1;1 1;1 YDR001C pep chromosome:R64-1-1:IV:450220:452475:-1 gene:YDR001C transcript:YDR001C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NTH1 description:Neutral trehalase, degrades trehalose; required for thermotolerance and may m 2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1.2 1.2 1.2 85.878 751 751;780 0.0015625 2.5622 0 0 1.2 0 0 0 5124300 0 0 5124300 0 0 0 0 0 3019500 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 79 3658 True 3804 13938 14029 14029 -1;-1
YBR003W YBR003W 2 2 2 YBR003W pep chromosome:R64-1-1:II:242809:244230:1 gene:YBR003W transcript:YBR003W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:COQ1 description:Hexaprenyl pyrophosphate synthetase; catalyzes the first step in ubiquinone (c 1 2 2 2 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 5.3 5.3 5.3 52.559 473 473 0 8.4293 2.7 2.7 2.5 0 0 0 5264100 1555700 1127100 2581200 0 0 0 0 2444900 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 3 80 7032;8694 True;True 7325;9120 26870;33145;33146 27031;33344;33345 27031;33344 -1
YNL030W;YBR009C YNL030W;YBR009C 13;13 13;13 13;13 YNL030W pep chromosome:R64-1-1:XIV:576727:577038:1 gene:YNL030W transcript:YNL030W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HHF2 description:Histone H4; core histone protein required for chromatin assembly and chromoso 2 13 13 13 10 9 13 10 9 10 10 9 13 10 9 10 10 9 13 10 9 10 61.2 61.2 61.2 11.368 103 103;103 0 64.83 46.6 46.6 61.2 56.3 46.6 60.2 12708000000 1967600000 710510000 5395700000 1039500000 1021900000 2572700000 2518200000 1854100000 2675300000 2209400000 3078600000 3034300000 15 11 19 15 14 14 88 81 1352;1353;1451;1452;4364;4626;4627;5341;5342;8907;8908;10736;10737 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1410;1411;1511;1512;4543;4822;4823;5566;5567;9343;9344;11250;11251 5434;5435;5436;5437;5438;5439;5440;5441;5442;5443;5444;5445;5446;5447;5448;5795;5796;5797;5798;5799;5800;5801;5802;5803;5804;5805;5806;16556;16557;16558;16559;16560;16561;16562;16563;16564;16565;16566;16567;16568;16569;16570;17629;17630;17631;17632;17633;17634;17635;20420;20421;20422;20423;20424;20425;20426;20427;20428;20429;20430;20431;33955;33956;33957;33958;33959;33960;33961;33962;33963;33964;33965;33966;33967;41243;41244;41245;41246;41247;41248;41249;41250;41251;41252;41253;41254;41255;41256;41257;41258;41259;41260 5469;5470;5471;5472;5473;5474;5475;5476;5477;5478;5479;5480;5481;5482;5483;5830;5831;5832;5833;5834;5835;5836;5837;5838;5839;5840;5841;16666;16667;16668;16669;16670;16671;16672;16673;16674;16675;16676;16677;16678;16679;16680;17744;17745;17746;17747;17748;17749;17750;20547;20548;20549;20550;20551;20552;20553;20554;20555;20556;20557;20558;34157;34158;34159;34160;34161;34162;34163;34164;34165;34166;34167;34168;34169;41496;41497;41498;41499;41500;41501;41502;41503;41504;41505;41506;41507;41508;41509;41510;41511;41512;41513;41514 5471;5478;5834;5841;16676;17745;17750;20550;20555;34157;34167;41499;41514 -1;-1
YNL031C;YBR010W YNL031C;YBR010W 7;7 7;7 7;7 YNL031C pep chromosome:R64-1-1:XIV:575640:576050:-1 gene:YNL031C transcript:YNL031C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HHT2 description:Histone H3; core histone protein required for chromatin assembly, part of he 2 7 7 7 6 5 6 6 4 6 6 5 6 6 4 6 6 5 6 6 4 6 53.7 53.7 53.7 15.356 136 136;136 0 29.884 44.1 43.4 50.7 44.1 41.2 50.7 7641700000 917210000 710620000 3555000000 512860000 229910000 1716100000 896770000 1147300000 1976900000 814280000 1417400000 2112900000 8 8 9 8 5 6 44 82 1703;1704;2572;8717;9681;9682;12097 True;True;True;True;True;True;True 1768;1769;2661;9144;10154;10155;12660 6736;6737;6738;6739;6740;6741;6742;6743;6744;9694;9695;9696;9697;9698;9699;9700;9701;9702;9703;9704;9705;9706;9707;9708;33252;33253;33254;37090;37091;37092;37093;37094;37095;37096;37097;37098;37099;46840;46841;46842;46843;46844;46845;46846 6776;6777;6778;6779;6780;6781;6782;6783;6784;9744;9745;9746;9747;9748;9749;9750;9751;9752;9753;9754;9755;9756;9757;9758;33451;33452;33453;37309;37310;37311;37312;37313;37314;37315;37316;37317;37318;47166;47167;47168;47169;47170;47171;47172 6780;6783;9758;33452;37311;37318;47170 -1;-1
YBR011C YBR011C 7 7 7 YBR011C pep chromosome:R64-1-1:II:257112:257975:-1 gene:YBR011C transcript:YBR011C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IPP1 description:Cytoplasmic inorganic pyrophosphatase (PPase); homodimer that catalyzes the r 1 7 7 7 3 2 4 2 1 5 3 2 4 2 1 5 3 2 4 2 1 5 38 38 38 32.299 287 287 0 25.906 17.1 10.1 20.9 10.1 5.9 27.9 100590000 13564000 9492800 38491000 6089300 3478700 29477000 0 0 23814000 0 0 28345000 3 2 3 2 1 4 15 83 3003;4899;5690;6355;9019;11075;11887 True;True;True;True;True;True;True 3110;5103;5931;6620;9462;11602;12450 11352;11353;11354;11355;11356;18653;18654;21833;24269;24270;34514;34515;34516;42619;42620;45981;45982 11431;11432;11433;11434;11435;18774;18775;21963;24417;24418;34721;34722;34723;42914;42915;46297;46298 11431;18775;21963;24418;34721;42915;46297 -1
YBR017C YBR017C 2 2 2 YBR017C pep chromosome:R64-1-1:II:270947:273703:-1 gene:YBR017C transcript:YBR017C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KAP104 description:Transportin or cytosolic karyopherin beta 2; functions in the rg-nuclear lo 1 2 2 2 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 2.5 2.5 2.5 103.68 918 918 0 5.5554 0 0 1.3 1.2 0 0 12292000 0 0 10528000 1763900 0 0 0 0 6203900 0 0 0 0 0 1 1 0 0 2 84 2357;7873 True;True 2441;8273 8957;30219 9003;30407 9003;30407 -1
YBR025C YBR025C 23 23 23 YBR025C pep chromosome:R64-1-1:II:290681:291865:-1 gene:YBR025C transcript:YBR025C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OLA1 description:P-loop ATPase with similarity to human OLA1 and bacterial YchF; identified as 1 23 23 23 18 20 17 18 18 15 18 20 17 18 18 15 18 20 17 18 18 15 71.3 71.3 71.3 44.174 394 394 0 146.69 56.6 62.4 60.7 55.1 67.5 55.1 4732000000 692720000 577790000 1980600000 518480000 273950000 688470000 1005300000 1132600000 1095300000 992420000 927390000 833100000 24 24 22 25 20 19 134 85 239;683;1027;1029;1050;2189;2823;3066;4212;5378;6050;6173;6557;6644;6645;8214;8215;9690;9776;9950;11158;11274;12296 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 250;722;723;1075;1077;1098;2269;2922;3175;4384;5606;6301;6430;6833;6922;6923;8628;8629;10163;10253;10439;11692;11811;12869 1034;1035;1036;1037;1038;1039;2849;2850;4310;4311;4312;4313;4314;4315;4317;4318;4319;4366;4367;4368;4369;4370;4371;4372;4373;4374;4375;4376;8350;8351;8352;8353;8354;8355;10690;10691;10692;10693;10694;10695;10696;10697;10698;10699;11587;11588;11589;11590;11591;11592;11593;11594;11595;11596;11597;11598;15999;16000;16001;16002;16003;16004;16005;16006;16007;16008;16009;20610;20611;20612;20613;23202;23203;23204;23205;23206;23207;23687;23688;23689;25038;25039;25040;25361;25362;25363;25364;25365;25366;25367;25368;25369;25370;25371;31409;31410;31411;31412;31413;31414;31415;37121;37122;37123;37124;37125;37126;37452;37453;37454;37455;37456;37457;38188;38189;38190;38191;38192;38193;38194;38195;38196;38197;38198;38199;42946;43457;43458;43459;43460;43461;43462;43463;47582;47583;47584 1036;1037;1038;1039;1040;1041;2859;2860;4332;4333;4334;4335;4336;4337;4339;4340;4341;4389;4390;4391;4392;4393;4394;4395;4396;4397;4398;4399;8393;8394;8395;8396;8397;8398;10758;10759;10760;10761;10762;10763;10764;10765;10766;10767;11669;11670;11671;11672;11673;11674;11675;11676;11677;11678;11679;11680;16108;16109;16110;16111;16112;16113;16114;16115;16116;16117;16118;20737;20738;20739;20740;23338;23339;23340;23341;23342;23343;23828;23829;23830;25188;25189;25190;25515;25516;25517;25518;25519;25520;25521;25522;25523;25524;25525;31605;31606;31607;31608;31609;31610;31611;37340;37341;37342;37343;37344;37345;37674;37675;37676;37677;37678;37679;38420;38421;38422;38423;38424;38425;38426;38427;38428;38429;38430;38431;43243;43755;43756;43757;43758;43759;43760;43761;47914;47915;47916 1038;2860;4336;4340;4399;8397;10762;11675;16111;20737;23341;23828;25189;25517;25521;31606;31610;37344;37677;38429;43243;43755;47915 47;48 341;350 -1
YBR028C YBR028C 5 5 5 YBR028C pep chromosome:R64-1-1:II:294425:296002:-1 gene:YBR028C transcript:YBR028C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YPK3 description:AGC kinase; phosphorylated by cAMP-dependent protein kinase (PKA) in a TORC1- 1 5 5 5 4 2 3 4 2 3 4 2 3 4 2 3 4 2 3 4 2 3 11.4 11.4 11.4 59.591 525 525 0 14.348 9.3 5.5 5.5 9.3 5.5 7.2 112230000 17367000 8156700 51534000 10757000 6068500 18344000 18065000 19103000 29212000 16970000 30813000 17116000 4 3 3 4 2 3 19 86 6172;6659;7124;10584;11243 True;True;True;True;True 6429;6937;7438;11092;11780 23682;23683;23684;23685;23686;25408;25409;25410;25411;25412;25413;27248;27249;40533;43309;43310;43311;43312;43313 23823;23824;23825;23826;23827;25562;25563;25564;25565;25566;25567;27413;27414;40776;43607;43608;43609;43610;43611 23826;25562;27414;40776;43610 -1
YBR029C YBR029C 2 2 2 YBR029C pep chromosome:R64-1-1:II:296369:297742:-1 gene:YBR029C transcript:YBR029C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDS1 description:Phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase); an enzyme th 1 2 2 2 1 1 1 2 1 0 1 1 1 2 1 0 1 1 1 2 1 0 4.2 4.2 4.2 51.822 457 457 0.0015699 2.6086 1.5 1.5 1.5 4.2 1.5 0 631780000 121600000 123450000 180130000 131620000 74975000 0 0 0 0 0 247890000 0 1 1 1 2 1 0 6 87 1753;5935 True;True 1820;6186 6926;22785;22786;22787;22788;22789 6966;22920;22921;22922;22923;22924 6966;22920 -1
YBR031W YBR031W 25 25 2 YBR031W pep chromosome:R64-1-1:II:300166:301254:1 gene:YBR031W transcript:YBR031W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL4A description:Ribosomal 60S subunit protein L4A; N-terminally acetylated; homologous to mam 1 25 25 2 19 21 21 22 20 19 19 21 21 22 20 19 1 2 2 2 2 1 75.1 75.1 4.4 39.092 362 362 0 273.53 71 70.7 61 71 70.7 67.1 31947000000 5629500000 4462600000 10138000000 3685900000 2140900000 5890900000 6706400000 8690800000 6567900000 7698700000 7028600000 6770900000 32 41 34 37 34 35 213 88 237;920;2729;2730;2986;3237;4160;4161;4162;4495;5251;5652;7974;8037;8092;8509;8969;9540;10143;10144;10258;10925;11009;11059;11900 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 248;963;2823;2824;3092;3353;4330;4331;4332;4688;5471;5890;8378;8442;8499;8933;9409;9410;10008;10637;10638;10756;11447;11535;11586;12463 1023;1024;1025;1026;1027;1028;1029;1030;1031;1032;3826;3827;3828;3829;3830;3831;3832;3833;3834;10307;10308;10309;10310;10311;10312;10313;10314;10315;10316;10317;10318;10319;10320;10321;10322;10323;10324;10325;10326;10327;11283;11284;11285;11286;11287;11288;11289;11290;11291;11292;12230;12231;12232;12233;12234;12235;12236;12237;12238;15819;15820;15821;15822;15823;15824;15825;15826;15827;15828;15829;15830;15831;15832;15833;15834;15835;15836;15837;15838;15839;17121;17122;17123;17124;17125;17126;17127;17128;17129;17130;17131;17132;20082;21686;21687;21688;21689;21690;21691;30574;30575;30576;30577;30578;30579;30580;30581;30582;30583;30584;30585;30586;30587;30588;30589;30590;30818;31020;31021;31022;31023;32440;32441;32442;32443;32444;32445;32446;32447;32448;32449;32450;34186;34187;34188;34189;34190;34191;34192;34193;34194;36583;36584;36585;36586;36587;38888;38889;38890;38891;38892;38893;38894;38895;38896;38897;38898;38899;38900;38901;38902;38903;38904;38905;38906;39370;39371;39372;39373;39374;39375;39376;39377;39378;41981;41982;41983;41984;41985;42360;42361;42547;42548;42549;42550;42551;42552;42553;42554;42555;42556;42557;42558;46014;46015;46016;46017;46018;46019;46020;46021;46022;46023;46024;46025;46026;46027;46028;46029;46030;46031;46032;46033 1025;1026;1027;1028;1029;1030;1031;1032;1033;1034;3840;3841;3842;3843;3844;3845;3846;3847;3848;10365;10366;10367;10368;10369;10370;10371;10372;10373;10374;10375;10376;10377;10378;10379;10380;10381;10382;10383;10384;10385;11362;11363;11364;11365;11366;11367;11368;11369;11370;11371;12315;12316;12317;12318;12319;12320;12321;12322;12323;15928;15929;15930;15931;15932;15933;15934;15935;15936;15937;15938;15939;15940;15941;15942;15943;15944;15945;15946;15947;15948;17235;17236;17237;17238;17239;17240;17241;17242;17243;17244;17245;17246;20206;21815;21816;21817;21818;21819;21820;30764;30765;30766;30767;30768;30769;30770;30771;30772;30773;30774;30775;30776;30777;30778;30779;30780;31010;31212;31213;31214;31215;32636;32637;32638;32639;32640;32641;32642;32643;32644;32645;32646;34392;34393;34394;34395;34396;34397;34398;34399;34400;36799;36800;36801;36802;36803;39123;39124;39125;39126;39127;39128;39129;39130;39131;39132;39133;39134;39135;39136;39137;39138;39139;39140;39141;39606;39607;39608;39609;39610;39611;39612;39613;39614;42245;42246;42247;42248;42249;42655;42656;42842;42843;42844;42845;42846;42847;42848;42849;42850;42851;42852;42853;46330;46331;46332;46333;46334;46335;46336;46337;46338;46339;46340;46341;46342;46343;46344;46345;46346;46347;46348;46349;46350 1032;3840;10369;10378;11364;12321;15929;15939;15948;17235;20206;21818;30769;31010;31212;32646;34400;36800;39125;39132;39613;42247;42656;42853;46334 49 93 -1
YBR039W YBR039W 7 7 7 YBR039W pep chromosome:R64-1-1:II:315575:316510:1 gene:YBR039W transcript:YBR039W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ATP3 description:Gamma subunit of the F1 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase; F1F0 ATP sy 1 7 7 7 2 4 4 4 3 5 2 4 4 4 3 5 2 4 4 4 3 5 32.2 32.2 32.2 34.35 311 311 0 65.412 12.9 19.6 24.8 17 17 18.3 183840000 14442000 20761000 85911000 18078000 9614500 35035000 28165000 40431000 43458000 35534000 36005000 34939000 2 4 4 4 3 5 22 89 3609;4589;4640;5233;7319;7647;10185 True;True;True;True;True;True;True 3752;4785;4836;5451;7683;8028;10681 13785;17509;17510;17511;17512;17513;17672;17673;17674;17675;17676;20013;20014;28070;28071;29310;29311;29312;29313;29314;39071;39072 13876;17624;17625;17626;17627;17628;17787;17788;17789;17790;17791;20137;20138;28244;28245;29493;29494;29495;29496;29497;39306;39307 13876;17624;17789;20137;28244;29493;39307 50 77 -1
YDR025W;YBR048W YDR025W;YBR048W 17;17 17;17 17;17 YDR025W pep chromosome:R64-1-1:IV:491515:492324:1 gene:YDR025W transcript:YDR025W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS11A description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mammal 2 17 17 17 15 14 13 11 14 12 15 14 13 11 14 12 15 14 13 11 14 12 71.8 71.8 71.8 17.749 156 156;156 0 72.914 67.3 65.4 64.7 59.6 63.5 60.9 15956000000 2998600000 1512900000 5464500000 1398500000 1186000000 3396000000 3335200000 3459300000 3306700000 3555900000 3823300000 3132100000 21 18 19 17 20 20 115 90 189;1007;1049;3073;3581;4376;4986;7320;7321;7977;8323;8474;9683;9918;9919;11467;11483 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 199;1054;1097;3182;3723;4555;5192;7684;7685;8381;8740;8896;10156;10405;10406;12006;12024 821;822;823;824;825;826;827;828;829;830;831;832;833;834;4208;4209;4210;4211;4212;4213;4214;4215;4216;4217;4218;4363;4364;4365;11626;11627;11628;11629;11630;11631;11632;11633;11634;11635;11636;13650;13651;13652;13653;13654;13655;13656;13657;13658;13659;13660;16613;16614;16615;16616;16617;18969;28072;28073;28074;28075;28076;30595;30596;30597;30598;30599;30600;30601;30602;30603;30604;30605;30606;31792;31793;31794;31795;31796;32315;32316;32317;32318;37100;37101;37102;37103;37104;37105;38078;38079;38080;38081;38082;38083;38084;38085;38086;38087;38088;38089;38090;44276;44277;44278;44279;44280;44281;44282;44283;44284;44285;44286;44287;44366;44367;44368 823;824;825;826;827;828;829;830;831;832;833;834;835;836;4228;4229;4230;4231;4232;4233;4234;4235;4236;4237;4238;4386;4387;4388;11708;11709;11710;11711;11712;11713;11714;11715;11716;11717;11718;13739;13740;13741;13742;13743;13744;13745;13746;13747;13748;13749;16723;16724;16725;16726;16727;19091;28246;28247;28248;28249;28250;30785;30786;30787;30788;30789;30790;30791;30792;30793;30794;30795;30796;31988;31989;31990;31991;31992;32511;32512;32513;32514;37319;37320;37321;37322;37323;37324;38309;38310;38311;38312;38313;38314;38315;38316;38317;38318;38319;38320;38321;44581;44582;44583;44584;44585;44586;44587;44588;44589;44590;44591;44592;44672;44673;44674 834;4232;4388;11709;13744;16724;19091;28248;28250;30792;31988;32514;37323;38310;38318;44588;44673 -1;-1
YBR049C YBR049C 1 1 1 YBR049C pep chromosome:R64-1-1:II:334386:336818:-1 gene:YBR049C transcript:YBR049C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:REB1 description:RNA polymerase I enhancer binding protein; DNA binding protein that binds to 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1.9 1.9 1.9 91.873 810 810 0.00082102 3.0405 0 0 0 0 1.9 0 538330 0 0 0 0 538330 0 0 0 0 0 1779900 0 0 0 0 0 1 0 1 91 5614 True 5851 21568 21695 21695 -1
YBR060C YBR060C 3 3 3 YBR060C pep chromosome:R64-1-1:II:360652:362514:-1 gene:YBR060C transcript:YBR060C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ORC2 description:Subunit of the origin recognition complex (ORC); ORC directs DNA replication 1 3 3 3 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 4.5 4.5 4.5 71.237 620 620 0 4.8476 1.8 0 2.7 1.8 2.6 0 8277900 2869600 0 3876700 1072800 458810 0 0 0 0 2206900 0 0 1 0 1 1 1 0 4 92 8725;8726;12355 True;True;True 9152;9153;12928 33288;33289;47789;47790 33487;33488;48121;48122 33487;33488;48122 -1
YBR065C YBR065C 1 1 1 YBR065C pep chromosome:R64-1-1:II:368584:369678:-1 gene:YBR065C transcript:YBR065C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ECM2 description:Pre-mRNA splicing factor; facilitates the cooperative formation of U2/U6 heli 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 5.8 5.8 5.8 40.924 364 364 0 4.6419 0 0 0 0 5.8 0 1764000 0 0 0 0 1764000 0 0 0 0 0 5832400 0 0 0 0 0 1 0 1 93 5810 True 6053 22262 22393 22393 -1
YBR069C YBR069C 1 1 1 YBR069C pep chromosome:R64-1-1:II:376574:378433:-1 gene:YBR069C transcript:YBR069C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TAT1 description:Amino acid transporter for valine, leucine, isoleucine, and tyrosine; low-aff 1 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 3.1 3.1 3.1 68.757 619 619 0 4.1826 0 3.1 0 3.1 0 0 4076800 0 2406500 0 1670300 0 0 0 0 0 3436100 0 0 0 1 0 1 0 0 2 94 1139 True 1190 4651;4652 4677;4678 4677 -1
YBR072W YBR072W 2 2 2 YBR072W pep chromosome:R64-1-1:II:382030:382674:1 gene:YBR072W transcript:YBR072W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HSP26 description:Small heat shock protein (sHSP) with chaperone activity; forms hollow, sphere 1 2 2 2 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 15.9 15.9 15.9 23.879 214 214 0 11.08 0 0 15.9 0 0 0 29535000 0 0 29535000 0 0 0 0 0 17404000 0 0 0 0 0 2 0 0 0 2 95 9767;11150 True;True 10243;11684 37412;42925 37634;43222 37634;43222 -1
YBR073W YBR073W 4 4 4 YBR073W pep chromosome:R64-1-1:II:383112:385988:1 gene:YBR073W transcript:YBR073W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RDH54 description:DNA-dependent ATPase; DNA recombination/repair translocase, supercoils DNA an 1 4 4 4 0 2 0 2 2 0 0 2 0 2 2 0 0 2 0 2 2 0 4.8 4.8 4.8 107.94 958 958 0 8.4545 0 2.6 0 2.5 3.4 0 10531000 0 4333800 0 2948700 3248900 0 0 0 0 0 10742000 0 0 2 0 2 2 0 6 96 1420;7784;9091;9753 True;True;True;True 1479;8180;9536;10229 5674;29912;34772;34773;34774;37380 5709;30099;34980;34981;34982;37602 5709;30099;34981;37602 -1
YBR078W YBR078W 2 2 2 YBR078W pep chromosome:R64-1-1:II:393123:394742:1 gene:YBR078W transcript:YBR078W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ECM33 description:GPI-anchored protein of unknown function; possible role in apical bud growth; 1 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 5.8 5.8 5.8 43.768 429 429 0 25.493 3.5 3.5 3.5 5.8 3.5 5.8 82195000 7502000 4755400 24175000 7578000 4964000 33220000 0 0 0 14699000 0 34109000 1 1 1 2 1 2 8 97 11040;11399 True;True 11567;11936 42486;42487;42488;42489;42490;42491;44039;44040 42781;42782;42783;42784;42785;42786;44338;44339 42784;44339 -1
YBR079C YBR079C 67 67 67 YBR079C pep chromosome:R64-1-1:II:395383:398277:-1 gene:YBR079C transcript:YBR079C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPG1 description:eIF3a subunit of the eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3); subun 1 67 67 67 49 36 40 40 39 44 49 36 40 40 39 44 49 36 40 40 39 44 63.4 63.4 63.4 110.34 964 964 0 323.31 54.3 42.2 45.5 46.5 42.1 49.5 6622200000 1469000000 679090000 2027200000 552260000 478920000 1415900000 1801000000 1333500000 1369100000 1271400000 1367300000 1422300000 59 41 43 47 50 49 289 98 90;258;414;672;681;711;712;889;934;1368;1622;1904;2040;2315;2373;2424;2425;2570;2694;2701;2991;3634;4939;5043;5171;5199;5362;5570;5632;5695;6011;6169;6220;6221;6249;6250;6251;7009;7134;7719;7749;8054;8170;8336;8351;8460;8469;8471;8535;8601;8648;8967;9027;9192;9193;9276;9913;9914;10423;10756;10771;10955;10956;10981;11565;11766;11936 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 93;270;439;710;719;751;752;932;977;1426;1685;1975;1976;2117;2399;2457;2509;2510;2659;2788;2795;3097;3777;3778;5145;5252;5384;5417;5589;5807;5869;5870;5936;6262;6424;6425;6478;6479;6508;6509;6510;7298;7448;7449;8105;8106;8145;8459;8581;8753;8768;8882;8891;8893;8959;9025;9073;9407;9470;9471;9642;9643;9730;10400;10401;10926;11271;11272;11287;11480;11481;11507;12111;12325;12499 372;373;374;1125;1126;1127;1128;1129;1808;2816;2817;2818;2845;2949;2950;2951;2952;3687;3901;3902;3903;3904;5486;5487;5488;5489;5490;5491;6429;7370;7371;7372;7373;7374;7375;7770;7771;7772;7773;7774;7775;8826;8827;8828;8829;9003;9004;9210;9211;9212;9213;9687;9688;9689;9690;9691;9692;10168;10169;10170;10171;10172;10198;11312;11313;11314;13859;13860;13861;18807;19214;19215;19216;19217;19218;19219;19220;19221;19757;19897;20527;20528;20529;20530;20531;20532;20533;20534;20535;21404;21405;21406;21407;21408;21409;21410;21411;21412;21623;21624;21625;21626;21627;21628;21629;21843;23051;23052;23053;23054;23055;23056;23057;23660;23661;23662;23663;23664;23665;23843;23844;23845;23846;23932;23933;23934;23935;23936;23937;23938;23939;23940;23941;23942;23943;23944;26770;26771;26772;26773;26774;26775;27268;27269;27270;27271;27272;29589;29590;29591;29592;29593;29594;29595;29596;29597;29598;29599;29806;29807;30863;30864;30865;30866;30867;30868;30869;30870;30871;31243;31244;31245;31246;31247;31248;31249;31250;31843;31884;31885;32254;32255;32256;32257;32258;32259;32260;32261;32262;32263;32286;32287;32288;32289;32290;32293;32294;32558;32772;32773;32774;32775;32951;32952;32953;32954;34173;34174;34175;34176;34177;34178;34179;34545;34546;34547;34548;34549;34550;34551;34552;34553;35204;35205;35206;35207;35208;35209;35210;35211;35212;35536;35537;35538;35539;35540;35541;38052;38053;38054;38055;38056;38057;38058;38059;38060;38061;38062;38063;38064;38065;39948;39949;39950;39951;41366;41367;41368;41369;41370;41371;41372;41373;41429;41430;42165;42166;42167;42168;42169;42170;42171;42172;42173;42174;42262;42263;42264;42265;44681;44682;44683;44684;44685;44686;44687;45580;45581;45582;45583;45584;45585;45586;46194;46195;46196;46197;46198 373;374;375;1127;1128;1129;1130;1131;1814;2825;2826;2827;2854;2959;2960;2961;2962;3700;3916;3917;3918;3919;5521;5522;5523;5524;5525;5526;6465;7411;7412;7413;7414;7415;7416;7812;7813;7814;7815;7816;7817;8871;8872;8873;8874;9049;9050;9257;9258;9259;9260;9737;9738;9739;9740;9741;9742;10222;10223;10224;10225;10226;10252;11391;11392;11393;13950;13951;13952;18928;19337;19338;19339;19340;19341;19342;19343;19344;19880;20021;20654;20655;20656;20657;20658;20659;20660;20661;20662;21531;21532;21533;21534;21535;21536;21537;21538;21539;21751;21752;21753;21754;21755;21756;21757;21973;23187;23188;23189;23190;23191;23192;23193;23801;23802;23803;23804;23805;23806;23985;23986;23987;23988;24077;24078;24079;24080;24081;24082;24083;24084;24085;24086;24087;24088;24089;26931;26932;26933;26934;26935;26936;27433;27434;27435;27436;27437;29773;29774;29775;29776;29777;29778;29779;29780;29781;29782;29783;29993;29994;31055;31056;31057;31058;31059;31060;31061;31062;31063;31438;31439;31440;31441;31442;31443;31444;31445;32039;32080;32081;32450;32451;32452;32453;32454;32455;32456;32457;32458;32459;32482;32483;32484;32485;32486;32489;32490;32754;32969;32970;32971;32972;33149;33150;33151;33152;34379;34380;34381;34382;34383;34384;34385;34752;34753;34754;34755;34756;34757;34758;34759;34760;35412;35413;35414;35415;35416;35417;35418;35419;35420;35744;35745;35746;35747;35748;35749;38283;38284;38285;38286;38287;38288;38289;38290;38291;38292;38293;38294;38295;38296;40185;40186;40187;40188;41626;41627;41628;41629;41630;41631;41632;41633;41689;41690;42460;42461;42462;42463;42464;42465;42466;42467;42468;42469;42557;42558;42559;42560;44987;44988;44989;44990;44991;44992;44993;45894;45895;45896;45897;45898;45899;45900;46511;46512;46513;46514;46515 373;1131;1814;2826;2854;2960;2962;3700;3917;5522;6465;7412;7812;8873;9050;9257;9260;9738;10225;10252;11391;13952;18928;19341;19880;20021;20658;21539;21757;21973;23191;23804;23985;23988;24077;24079;24089;26935;27437;29776;29994;31060;31440;32039;32081;32456;32482;32489;32754;32971;33152;34382;34753;35412;35417;35747;38285;38292;40186;41629;41690;42465;42469;42560;44992;45898;46514 51;52;53;54;55;56;57;58 267;429;576;616;672;780;901;909 -1
YBR080C YBR080C 10 10 10 YBR080C pep chromosome:R64-1-1:II:398614:400890:-1 gene:YBR080C transcript:YBR080C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC18 description:AAA ATPase and SNARE disassembly chaperone; required for vesicular transport 1 10 10 10 1 4 4 3 1 3 1 4 4 3 1 3 1 4 4 3 1 3 15.7 15.7 15.7 84.055 758 758 0 23.159 1.6 5.4 7.1 4.7 1.6 4.2 63312000 3715700 7781400 26654000 7555200 3089900 14516000 0 0 17033000 0 0 13188000 1 3 4 3 1 3 15 99 960;2633;2850;3148;4831;6025;6527;7453;7656;12343 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1005;2727;2950;3259;5033;6276;6803;7826;8037;12916 4014;9935;9936;9937;10821;11910;11911;18367;23128;24910;28625;28626;28627;28628;29336;47758 4030;9986;9987;9988;10889;11994;11995;18484;23264;25060;28803;28804;28805;28806;29519;48090 4030;9988;10889;11994;18484;23264;25060;28803;29519;48090 -1
YBR084W YBR084W 28 28 28 YBR084W pep chromosome:R64-1-1:II:411054:413981:1 gene:YBR084W transcript:YBR084W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MIS1 description:Mitochondrial C1-tetrahydrofolate synthase; involved in interconversion betwee 1 28 28 28 12 12 17 16 12 22 12 12 17 16 12 22 12 12 17 16 12 22 28.7 28.7 28.7 106.22 975 975 0 89.368 18.1 15.9 22.9 21.7 16.2 27.8 998760000 96924000 63196000 364910000 91045000 54696000 327990000 143730000 170850000 189210000 202060000 227850000 241120000 11 12 16 18 13 22 92 100 604;1434;1479;1763;1924;2832;3585;3929;3930;4169;4170;4605;5131;6074;6379;6380;6865;6866;7338;7363;8146;8200;9590;9605;10056;10536;12187;12356 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 638;1494;1539;1830;1997;2931;3728;4088;4089;4339;4340;4801;5342;6325;6645;6646;7152;7153;7703;7730;8556;8613;10059;10074;10547;11043;12755;12929 2580;2581;2582;5740;5741;5742;5743;5744;5745;5746;5900;6961;7419;10743;10744;10745;13692;13693;13694;13695;13696;14955;14956;14957;14958;15860;15861;15862;15863;15864;15865;15866;17563;17564;17565;17566;17567;17568;19591;23309;23310;24350;24351;24352;24353;24354;24355;24356;24357;26245;26246;26247;28133;28134;28135;28136;28137;28138;28243;28244;31179;31180;31181;31182;31183;31364;31365;31366;31367;36735;36736;36737;36738;36739;36740;36741;36793;36794;36795;36796;38564;38565;38566;38567;40366;40367;40368;47167;47168;47169;47791;47792;47793;47794;47795 2587;2588;2589;5775;5776;5777;5778;5779;5780;5781;5935;7001;7460;10811;10812;10813;13783;13784;13785;13786;13787;15059;15060;15061;15062;15969;15970;15971;15972;15973;15974;15975;17678;17679;17680;17681;17682;17683;19714;23446;23447;24498;24499;24500;24501;24502;24503;24504;24505;26403;26404;26405;28307;28308;28309;28310;28311;28312;28418;28419;31372;31373;31374;31375;31376;31559;31560;31561;31562;36953;36954;36955;36956;36957;36958;36959;37012;37013;37014;37015;38797;38798;38799;38800;40607;40608;40609;47496;47497;47498;48123;48124;48125;48126;48127 2587;5780;5935;7001;7460;10811;13787;15060;15062;15969;15970;17681;19714;23447;24499;24504;26403;26405;28311;28419;31373;31561;36957;37015;38800;40607;47497;48123 -1
YBR086C YBR086C 6 6 6 YBR086C pep chromosome:R64-1-1:II:420201:423041:-1 gene:YBR086C transcript:YBR086C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IST2 description:Cortical ER protein involved in ER-plasma membrane tethering; one of 6 protei 1 6 6 6 3 3 0 4 1 1 3 3 0 4 1 1 3 3 0 4 1 1 10.1 10.1 10.1 105.85 946 946 0 27.845 4.5 4.8 0 6.4 1.8 2.2 57262000 12351000 20223000 0 14264000 952250 9471100 26737000 38623000 0 23983000 0 0 3 3 0 4 1 1 12 101 4435;6263;6376;9521;11431;12299 True;True;True;True;True;True 4622;6522;6642;9989;11968;12872 16861;16862;23971;23972;23973;24338;24339;36517;36518;36519;44150;47592 16974;16975;24116;24117;24118;24486;24487;36733;36734;36735;44454;47924 16974;24118;24487;36733;44454;47924 -1
YBR087W YBR087W 5 5 5 YBR087W pep chromosome:R64-1-1:II:423765:424829:1 gene:YBR087W transcript:YBR087W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RFC5 description:Subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C); RF-C is a DNA binding 1 5 5 5 3 0 4 0 1 2 3 0 4 0 1 2 3 0 4 0 1 2 17.2 17.2 17.2 39.941 354 354 0 10.069 9.6 0 14.4 0 3.1 9 142090000 18363000 0 87708000 0 1432100 34583000 26309000 0 48951000 0 0 34989000 3 0 4 0 1 2 10 102 336;1089;3772;9285;9639 True;True;True;True;True 354;1139;3921;9741;10111 1491;1492;4503;4504;14349;35584;35585;35586;36951;36952 1494;1495;4528;4529;14448;35792;35793;35794;37170;37171 1495;4529;14448;35792;37171 -1
YBR089C-A YBR089C-A 4 4 4 YBR089C-A pep chromosome:R64-1-1:II:426190:426489:-1 gene:YBR089C-A transcript:YBR089C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NHP6B description:High-mobility group (HMG) protein; binds to and remodels nucleosomes; 1 4 4 4 1 4 1 2 1 1 1 4 1 2 1 1 1 4 1 2 1 1 40.4 40.4 40.4 11.476 99 99 0 13.636 13.1 40.4 13.1 26.3 13.1 13.1 76961000 3560100 29508000 11776000 18753000 6119300 7244800 0 52554000 0 50030000 0 0 1 4 1 2 1 1 10 103 561;8649;8862;11950 True;True;True;True 593;9074;9298;12513 2442;2443;32955;33805;33806;33807;33808;33809;33810;46236 2449;2450;33153;34006;34007;34008;34009;34010;34011;46553 2449;33153;34006;46553 -1
YBR102C YBR102C 7 7 7 YBR102C pep chromosome:R64-1-1:II:445062:447323:-1 gene:YBR102C transcript:YBR102C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EXO84 description:Exocyst subunit with dual roles in exocytosis and spliceosome assembly; subu 1 7 7 7 0 2 3 4 3 3 0 2 3 4 3 3 0 2 3 4 3 3 13 13 13 85.537 753 753 0 28.718 0 3.5 5.4 7.6 5.4 5.6 56288000 0 3899100 31914000 5628800 3769300 11077000 0 11782000 0 9762600 9691100 12341000 0 2 2 4 3 2 13 104 631;924;2761;5839;6537;6705;10686 True;True;True;True;True;True;True 668;967;2859;6083;6813;6985;11197 2677;3851;3852;10473;10474;10475;10476;22377;22378;24940;25574;25575;25576;25577;40931 2685;3866;3867;10539;10540;10541;10542;22510;22511;25090;25728;25729;25730;25731;41178 2685;3866;10540;22510;25090;25729;41178 -1
YBR109C YBR109C 1 1 1 YBR109C pep chromosome:R64-1-1:II:457919:458362:-1 gene:YBR109C transcript:YBR109C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CMD1 description:Calmodulin; Ca2+ binding protein that regulates Ca2+ independent processes (m 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 6.1 6.1 6.1 16.135 147 147 0.0037651 2.2355 0 0 6.1 0 0 0 13242000 0 0 13242000 0 0 0 0 0 7803000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 105 3710 True 3856 14109 14206 14206 -1
YPR080W;YBR118W YPR080W;YBR118W 59;59 59;59 59;59 YPR080W pep chromosome:R64-1-1:XVI:700594:701970:1 gene:YPR080W transcript:YPR080W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TEF1 description:Translational elongation factor EF-1 alpha; in the GTP-bound active form, bin 2 59 59 59 48 37 47 47 39 45 48 37 47 47 39 45 48 37 47 47 39 45 86.5 86.5 86.5 50.032 458 458;458 0 323.31 80.6 69.7 83 84.9 71 81.7 183390000000 38825000000 19608000000 54889000000 20284000000 15789000000 33994000000 42320000000 31646000000 31526000000 32942000000 33224000000 31670000000 141 105 135 144 111 144 780 106 1032;1126;1127;1160;1161;1689;2024;2182;2183;2184;2215;2446;2555;2556;2744;3055;3216;3217;3443;4021;4022;5176;5177;5367;6474;7058;7385;7738;7739;8023;8031;8033;8045;8256;8257;8258;8405;8506;8507;8938;8993;9752;9784;10178;10179;10339;10340;10341;10719;10720;10721;10934;11768;11769;11903;11904;11905;12261;12262 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1080;1176;1177;1211;1212;1754;2101;2262;2263;2264;2297;2531;2644;2645;2838;2839;3164;3330;3331;3571;4184;4185;4186;5389;5390;5595;6746;7359;7360;7754;8130;8131;8132;8133;8428;8436;8438;8450;8672;8673;8674;8675;8826;8930;8931;9377;9436;10228;10263;10264;10674;10675;10839;10840;10841;11230;11231;11232;11233;11234;11235;11457;11458;12327;12328;12466;12467;12468;12832;12833 4328;4617;4618;4724;4725;4726;4727;4728;4729;4730;4731;4732;6642;6643;6644;6645;6646;6647;6648;6649;6650;6651;6652;6653;6654;6655;6656;6657;6658;6659;6660;6661;6662;6663;6664;6665;6666;6667;6668;6669;6670;6671;6672;6673;6674;6675;6676;6677;6678;6679;6680;6681;6682;6683;6684;6685;6686;6687;6688;7721;7722;8327;8328;8329;8330;8331;8332;8333;8334;8335;8336;8337;8338;8339;8340;8341;8342;8343;8458;8459;8460;8461;9273;9274;9275;9276;9617;9618;9619;9620;9621;9622;9623;9624;9625;9626;9627;9628;9629;9630;9631;9632;9633;9634;9635;9636;9637;9638;9639;9640;9641;9642;9643;10363;10364;10365;10366;10367;10368;10369;10370;10371;10372;10373;10374;10375;10376;10377;10378;10379;10380;10381;10382;10383;10384;10385;10386;10387;10388;10389;10390;10391;10392;10393;10394;10395;10396;10397;11553;11554;11555;12120;12121;12122;12123;12124;12125;12126;12127;12128;12129;12130;12131;12132;12133;13058;13059;13060;13061;13062;13063;15276;15277;15278;15279;15280;15281;15282;15283;15284;15285;15286;15287;15288;15289;19783;19784;19785;19786;19787;19788;20559;20560;24732;24733;26989;26990;26991;26992;26993;26994;26995;26996;26997;26998;26999;27000;27001;27002;27003;27004;27005;28337;28338;28339;28340;28341;28342;28343;28344;29714;29715;29716;29717;29718;29719;29720;29721;29722;29723;29724;29725;29726;29727;29728;29729;29730;29731;29732;29733;29734;29735;29736;29737;29738;29739;29740;29741;29742;29743;29744;29745;29746;29747;29748;29749;29750;29751;29752;29753;29754;29755;29756;29757;29758;29759;29760;29761;29762;29763;29764;29765;30770;30800;30801;30802;30803;30804;30805;30806;30809;30810;30811;30812;30813;30835;30836;31565;31566;31567;31568;31569;31570;31571;31572;31573;31574;31575;31576;31577;31578;31579;31580;31581;31582;31583;31584;31585;31586;31587;31588;31589;31590;31591;31592;32076;32077;32078;32428;32429;32430;32431;32432;32433;32434;32435;32436;32437;34068;34069;34070;34071;34277;34278;34279;34280;34281;34282;34283;34284;34285;34286;34287;34288;34289;34290;34291;34292;34293;34294;34295;34296;34297;34298;34299;34300;34301;34302;34303;34304;34305;34306;34307;34308;34309;34310;34311;34312;34313;34314;34315;34316;34317;34318;34319;34320;34321;34322;34323;34324;34325;34326;34327;34328;34329;34330;34331;34332;34333;34334;34335;34336;34337;34338;34339;34340;34341;34342;34343;34344;34345;34346;34347;34348;34349;34350;34351;34352;34353;34354;34355;34356;34357;34358;34359;34360;34361;34362;34363;34364;34365;34366;34367;34368;34369;34370;34371;34372;34373;34374;34375;34376;34377;34378;34379;34380;34381;34382;34383;34384;34385;34386;34387;34388;34389;34390;34391;34392;34393;34394;34395;34396;34397;34398;34399;34400;34401;34402;34403;34404;34405;34406;34407;34408;34409;34410;34411;34412;34413;34414;34415;34416;34417;34418;34419;34420;34421;34422;34423;34424;37371;37372;37373;37374;37375;37376;37377;37378;37379;37500;37501;37502;37503;37504;37505;37506;37507;37508;37509;37510;37511;37512;37513;37514;37515;37516;37517;37518;37519;37520;37521;37522;37523;37524;37525;37526;37527;37528;39050;39051;39052;39053;39054;39055;39056;39057;39058;39059;39651;39652;39653;39654;39655;39656;39657;39658;39659;39660;39661;39662;39663;39664;39665;39666;39667;39668;39669;39670;39671;39672;39673;39674;39675;39676;39677;39678;39679;41089;41090;41091;41092;41093;41094;41095;41096;41097;41098;41099;41100;41101;41102;41103;41104;41105;41106;41107;41108;41109;41110;41111;41112;41113;41114;41115;41116;41117;41118;41119;41120;41121;41122;41123;41124;41125;41126;41127;41128;41129;41130;41131;41132;41133;41134;41135;41136;41137;41138;41139;41140;41141;41142;41143;41144;41145;41146;41147;41148;41149;41150;41151;41152;41153;41154;41155;41156;41157;41158;41159;41160;41161;41162;41163;41164;41165;41166;41167;41168;41169;41170;41171;41172;41173;41174;41175;41176;41177;41178;42010;42011;42012;42013;42014;42015;42016;42017;42018;42019;42020;42021;42022;42023;42024;42025;42026;42027;42028;42029;42030;42031;42032;42033;42034;42035;42036;42037;42038;42039;42040;42041;42042;42043;42044;42045;42046;42047;42048;42049;42050;42051;42052;42053;42054;42055;42056;42057;42058;42059;42060;42061;42062;42063;42064;42065;42066;42067;42068;42069;42070;42071;42072;42073;45588;45589;45590;45591;45592;45593;45594;45595;45596;45597;45598;45599;45600;45601;45602;46037;46038;46039;46040;46041;46042;46043;46044;46045;46046;46047;46048;46049;46050;46051;46052;46053;46054;46055;46056;46057;46058;46059;46060;46061;46062;46063;46064;46065;46066;46067;47418;47419;47420;47421;47422;47423;47424;47425;47426;47427;47428;47429;47430;47431;47432;47433;47434;47435;47436;47437;47438;47439 4350;4643;4644;4750;4751;4752;4753;4754;4755;4756;4757;4758;6678;6679;6680;6681;6682;6683;6684;6685;6686;6687;6688;6689;6690;6691;6692;6693;6694;6695;6696;6697;6698;6699;6700;6701;6702;6703;6704;6705;6706;6707;6708;6709;6710;6711;6712;6713;6714;6715;6716;6717;6718;6719;6720;6721;6722;6723;6724;6725;6726;6727;6728;7763;7764;8370;8371;8372;8373;8374;8375;8376;8377;8378;8379;8380;8381;8382;8383;8384;8385;8386;8501;8502;8503;8504;9320;9321;9322;9323;9666;9667;9668;9669;9670;9671;9672;9673;9674;9675;9676;9677;9678;9679;9680;9681;9682;9683;9684;9685;9686;9687;9688;9689;9690;9691;9692;10421;10422;10423;10424;10425;10426;10427;10428;10429;10430;10431;10432;10433;10434;10435;10436;10437;10438;10439;10440;10441;10442;10443;10444;10445;10446;10447;10448;10449;10450;10451;10452;10453;10454;10455;10456;10457;10458;10459;10460;10461;11634;11635;11636;12205;12206;12207;12208;12209;12210;12211;12212;12213;12214;12215;12216;12217;12218;13146;13147;13148;13149;13150;13151;15384;15385;15386;15387;15388;15389;15390;15391;15392;15393;15394;15395;15396;15397;19906;19907;19908;19909;19910;19911;20686;20687;24881;24882;27151;27152;27153;27154;27155;27156;27157;27158;27159;27160;27161;27162;27163;27164;27165;27166;27167;28514;28515;28516;28517;28518;28519;28520;28521;29898;29899;29900;29901;29902;29903;29904;29905;29906;29907;29908;29909;29910;29911;29912;29913;29914;29915;29916;29917;29918;29919;29920;29921;29922;29923;29924;29925;29926;29927;29928;29929;29930;29931;29932;29933;29934;29935;29936;29937;29938;29939;29940;29941;29942;29943;29944;29945;29946;29947;29948;29949;29950;30960;30990;30991;30992;30993;30994;30995;30996;30997;30998;31001;31002;31003;31004;31005;31027;31028;31761;31762;31763;31764;31765;31766;31767;31768;31769;31770;31771;31772;31773;31774;31775;31776;31777;31778;31779;31780;31781;31782;31783;31784;31785;31786;31787;31788;32272;32273;32274;32624;32625;32626;32627;32628;32629;32630;32631;32632;32633;34271;34272;34273;34274;34483;34484;34485;34486;34487;34488;34489;34490;34491;34492;34493;34494;34495;34496;34497;34498;34499;34500;34501;34502;34503;34504;34505;34506;34507;34508;34509;34510;34511;34512;34513;34514;34515;34516;34517;34518;34519;34520;34521;34522;34523;34524;34525;34526;34527;34528;34529;34530;34531;34532;34533;34534;34535;34536;34537;34538;34539;34540;34541;34542;34543;34544;34545;34546;34547;34548;34549;34550;34551;34552;34553;34554;34555;34556;34557;34558;34559;34560;34561;34562;34563;34564;34565;34566;34567;34568;34569;34570;34571;34572;34573;34574;34575;34576;34577;34578;34579;34580;34581;34582;34583;34584;34585;34586;34587;34588;34589;34590;34591;34592;34593;34594;34595;34596;34597;34598;34599;34600;34601;34602;34603;34604;34605;34606;34607;34608;34609;34610;34611;34612;34613;34614;34615;34616;34617;34618;34619;34620;34621;34622;34623;34624;34625;34626;34627;34628;34629;34630;37593;37594;37595;37596;37597;37598;37599;37600;37601;37722;37723;37724;37725;37726;37727;37728;37729;37730;37731;37732;37733;37734;37735;37736;37737;37738;37739;37740;37741;37742;37743;37744;37745;37746;37747;37748;37749;37750;37751;37752;37753;37754;37755;37756;37757;39285;39286;39287;39288;39289;39290;39291;39292;39293;39294;39887;39888;39889;39890;39891;39892;39893;39894;39895;39896;39897;39898;39899;39900;39901;39902;39903;39904;39905;39906;39907;39908;39909;39910;39911;39912;39913;39914;39915;39916;41337;41338;41339;41340;41341;41342;41343;41344;41345;41346;41347;41348;41349;41350;41351;41352;41353;41354;41355;41356;41357;41358;41359;41360;41361;41362;41363;41364;41365;41366;41367;41368;41369;41370;41371;41372;41373;41374;41375;41376;41377;41378;41379;41380;41381;41382;41383;41384;41385;41386;41387;41388;41389;41390;41391;41392;41393;41394;41395;41396;41397;41398;41399;41400;41401;41402;41403;41404;41405;41406;41407;41408;41409;41410;41411;41412;41413;41414;41415;41416;41417;41418;41419;41420;41421;41422;41423;41424;41425;41426;41427;41428;41429;41430;42274;42275;42276;42277;42278;42279;42280;42281;42282;42283;42284;42285;42286;42287;42288;42289;42290;42291;42292;42293;42294;42295;42296;42297;42298;42299;42300;42301;42302;42303;42304;42305;42306;42307;42308;42309;42310;42311;42312;42313;42314;42315;42316;42317;42318;42319;42320;42321;42322;42323;42324;42325;42326;42327;42328;42329;42330;42331;42332;42333;42334;42335;42336;42337;42338;42339;42340;42341;42342;42343;42344;42345;42346;42347;42348;42349;42350;42351;42352;42353;42354;42355;42356;42357;42358;42359;42360;42361;42362;42363;42364;42365;45902;45903;45904;45905;45906;45907;45908;45909;45910;45911;45912;45913;45914;45915;45916;46354;46355;46356;46357;46358;46359;46360;46361;46362;46363;46364;46365;46366;46367;46368;46369;46370;46371;46372;46373;46374;46375;46376;46377;46378;46379;46380;46381;46382;46383;46384;47749;47750;47751;47752;47753;47754;47755;47756;47757;47758;47759;47760;47761;47762;47763;47764;47765;47766;47767;47768;47769;47770 4350;4643;4644;4754;4757;6692;7763;8372;8380;8382;8501;9322;9676;9679;10456;11636;12207;12211;13149;15386;15396;19910;19911;20686;24882;27160;28515;29922;29941;30960;30992;31002;31028;31763;31775;31784;32274;32624;32631;34273;34598;37598;37757;39285;39292;39888;39900;39904;41337;41406;41428;42328;45906;45915;46356;46360;46384;47750;47761 59;60;61;62;63;64 102;155;199;274;292;408 -1;-1
YBR121C YBR121C 54 54 53 YBR121C pep chromosome:R64-1-1:II:481364:483367:-1 gene:YBR121C transcript:YBR121C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GRS1 description:Cytoplasmic and mitochondrial glycyl-tRNA synthase; ligates glycine to the co 1 54 54 53 38 45 34 39 31 33 38 45 34 39 31 33 38 44 34 38 31 33 73.9 73.9 72.6 75.338 667 667 0 297.51 55.8 69.7 55.8 61.2 49 56.2 7969900000 1125500000 1347400000 2663300000 1046900000 455410000 1331300000 1332900000 2576700000 1775300000 2082800000 1593300000 1476000000 45 64 43 57 43 38 290 107 76;95;180;379;933;1086;1087;1226;1227;1297;1333;1494;1962;2116;2513;2614;2670;3176;3177;3178;3338;3459;3832;3836;3837;4194;4909;5608;5636;6072;6160;7280;7372;7373;8216;8217;8741;8923;9497;9498;9778;9808;10101;10478;10564;10610;10879;10930;10931;11284;11285;11470;11471;11919 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 78;98;187;188;402;976;1135;1136;1137;1277;1278;1350;1388;1554;2037;2196;2601;2708;2764;3289;3290;3291;3460;3588;3987;3991;3992;3993;3994;4366;5114;5845;5874;6323;6415;7638;7639;7739;7740;8630;8631;9169;9360;9964;9965;10257;10289;10593;10985;11072;11118;11399;11452;11453;11454;11821;11822;12009;12010;12482 301;302;391;392;393;394;395;396;397;398;399;400;767;768;769;770;771;772;773;774;775;776;1668;1669;3888;3889;3890;3891;3892;3893;3894;3895;3896;3897;3898;3899;3900;4489;4490;4491;4492;4493;4494;4495;4496;4497;4498;4499;4500;4951;4952;4953;5221;5222;5360;5361;5362;5943;5944;5945;5946;5947;5948;5949;5950;7518;7519;8075;8076;8077;8078;8079;8080;8081;8082;8083;9461;9462;9463;9464;9465;9466;9467;9468;9884;10067;10068;10069;10070;10071;10072;10073;10074;12004;12005;12006;12007;12008;12009;12010;12011;12640;12641;13131;13132;13133;13134;13135;13136;13137;14562;14563;14564;14565;14566;14567;14568;14576;14577;14578;14579;14580;14581;14582;14583;14584;14585;14586;14587;14588;14589;14590;14591;14592;15956;15957;18704;18705;18706;21543;21544;21545;21546;21547;21548;21549;21550;21551;21552;21553;21637;21638;23302;23303;23634;23635;23636;23637;23638;27931;27932;27933;27934;27935;27936;27937;28297;28298;28299;28300;28301;28302;28303;28304;28305;28306;28307;28308;28309;28310;28311;28312;28313;31416;31417;31418;31419;31420;31421;31422;31423;33349;33350;33351;33352;33353;33354;33355;33356;33357;33358;33359;34010;34011;34012;36414;36415;36416;36417;36418;36419;36420;36421;36422;36423;36424;36425;36426;36427;36428;36429;36430;37479;37480;37481;37482;37483;37636;37637;37638;37639;37640;37641;38716;38717;38718;38719;38720;38721;38722;38723;40152;40153;40154;40155;40156;40157;40466;40600;40601;40602;40603;40604;41828;41829;41830;41996;41997;41998;41999;42000;42001;42002;42003;43496;43497;43498;43499;43500;43501;43502;43503;43504;43505;43506;43507;43508;43509;43510;43511;43512;44295;44296;44297;46119;46120;46121;46122;46123;46124 302;303;392;393;394;395;396;397;398;399;400;401;768;769;770;771;772;773;774;775;776;777;1672;1673;3903;3904;3905;3906;3907;3908;3909;3910;3911;3912;3913;3914;3915;4514;4515;4516;4517;4518;4519;4520;4521;4522;4523;4524;4525;4978;4979;4980;5252;5253;5395;5396;5397;5978;5979;5980;5981;5982;5983;5984;5985;7559;7560;8117;8118;8119;8120;8121;8122;8123;8124;8125;9509;9510;9511;9512;9513;9514;9515;9516;9935;10120;10121;10122;10123;10124;10125;10126;10127;12089;12090;12091;12092;12093;12094;12095;12096;12726;12727;13219;13220;13221;13222;13223;13224;13225;14661;14662;14663;14664;14665;14666;14667;14675;14676;14677;14678;14679;14680;14681;14682;14683;14684;14685;14686;14687;14688;14689;14690;14691;16065;16066;18825;18826;18827;21670;21671;21672;21673;21674;21675;21676;21677;21678;21679;21680;21765;21766;23438;23439;23775;23776;23777;23778;23779;28104;28105;28106;28107;28108;28109;28110;28111;28472;28473;28474;28475;28476;28477;28478;28479;28480;28481;28482;28483;28484;28485;28486;28487;28488;28489;28490;31612;31613;31614;31615;31616;31617;31618;31619;33549;33550;33551;33552;33553;33554;33555;33556;33557;33558;33559;34212;34213;34214;36628;36629;36630;36631;36632;36633;36634;36635;36636;36637;36638;36639;36640;36641;36642;36643;36644;37701;37702;37703;37704;37705;37865;37866;37867;37868;37869;37870;38949;38950;38951;38952;38953;38954;38955;38956;40391;40392;40393;40394;40395;40396;40709;40843;40844;40845;40846;40847;42091;42092;42093;42260;42261;42262;42263;42264;42265;42266;42267;43794;43795;43796;43797;43798;43799;43800;43801;43802;43803;43804;43805;43806;43807;43808;43809;43810;44600;44601;44602;46436;46437;46438;46439;46440;46441 302;394;771;1673;3909;4515;4522;4978;4980;5253;5396;5984;7560;8117;9514;9935;10126;12089;12090;12096;12727;13225;14664;14675;14684;16066;18826;21671;21765;23438;23778;28107;28472;28484;31612;31619;33553;34213;36631;36635;37703;37870;38952;40394;40709;40845;42093;42260;42266;43794;43807;44600;44602;46436 65;66;67;68 187;210;330;452 -1
YBR122C YBR122C 1 1 1 YBR122C pep chromosome:R64-1-1:II:483970:484503:-1 gene:YBR122C transcript:YBR122C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL36 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; overproduction suppre 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 6.2 6.2 6.2 20.09 177 177 0.0015337 2.3854 0 0 6.2 0 0 0 5081700 0 0 5081700 0 0 0 0 0 2994400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 108 7076 True 7381 27055 27217 27217 -1
YBR126C YBR126C 1 1 1 YBR126C pep chromosome:R64-1-1:II:488905:490392:-1 gene:YBR126C transcript:YBR126C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TPS1 description:Synthase subunit of trehalose-6-P synthase/phosphatase complex; synthesizes t 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4.4 4.4 4.4 56.147 495 495 0.00084531 3.3148 4.4 4.4 4.4 4.4 4.4 4.4 59969000 6045800 1837800 29576000 2796300 2813500 16900000 0 0 0 0 0 16900000 1 1 1 1 1 1 6 109 2737 True 2831 10335;10336;10337;10338;10339;10340 10393;10394;10395;10396;10397;10398 10393 -1
YBR127C YBR127C 37 37 37 YBR127C pep chromosome:R64-1-1:II:491269:492822:-1 gene:YBR127C transcript:YBR127C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VMA2 description:Subunit B of V1 peripheral membrane domain of vacuolar H+-ATPase; electrogeni 1 37 37 37 21 22 32 21 24 33 21 22 32 21 24 33 21 22 32 21 24 33 84.3 84.3 84.3 57.749 517 517 0 323.31 57.1 63.4 77.9 61.1 66.2 80.1 8716600000 594210000 432010000 4399200000 550230000 309600000 2431300000 913240000 1055400000 2408400000 1029000000 1323700000 2025900000 27 27 48 30 29 45 206 110 393;394;750;917;971;1169;2237;3062;3254;3466;3709;3943;4259;4260;4501;4518;4906;4975;4996;5145;5340;5514;6456;7502;8065;8162;8686;10063;10064;10583;10659;10660;10696;10936;11312;11885;12191 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 418;419;791;960;1016;1220;2319;3171;3371;3597;3598;3855;4103;4433;4434;4694;4711;5110;5111;5181;5202;5357;5565;5750;6726;7878;7879;8471;8573;9111;9112;10554;10555;11091;11168;11169;11170;11207;11460;11849;12448;12759 1710;1711;1712;1713;3132;3133;3134;3135;3136;3137;3800;3801;3802;3803;3804;3805;3806;3807;3808;3809;3810;3811;4047;4048;4049;4050;4773;4774;4775;8534;8535;8536;11569;11570;11571;11572;11573;11574;11575;11576;11577;12309;12310;12311;12312;12313;12314;13184;13185;13186;13187;13188;13189;13190;13191;13192;13193;13194;14101;14102;14103;14104;14105;14106;14107;14108;15005;15006;15007;15008;15009;15010;15011;15012;16175;16176;16177;16178;16179;17142;17143;17144;17145;17146;17147;17201;17202;17203;17204;18687;18688;18689;18690;18691;18692;18693;18694;18695;18926;19006;19007;19008;19009;19646;20412;20413;20414;20415;20416;20417;20418;20419;21219;21220;21221;21222;21223;21224;24666;24667;24668;24669;24670;24671;24672;24673;24674;24675;24676;24677;28810;28811;28812;28813;28814;28815;28816;28817;28818;28819;30912;30913;31216;33111;33112;33113;33114;33115;33116;38589;38590;38591;38592;38593;38594;38595;38596;40524;40525;40526;40527;40528;40529;40530;40531;40532;40769;40770;40771;40772;40773;40774;40775;40776;40777;40987;40988;40989;40990;40991;40992;40993;40994;40995;42076;42077;42078;42079;42080;42081;42082;42083;42084;43618;43619;43620;43621;43622;43623;43624;45978;45979;47177;47178;47179;47180;47181;47182 1714;1715;1716;1717;3143;3144;3145;3146;3147;3148;3814;3815;3816;3817;3818;3819;3820;3821;3822;3823;3824;3825;4063;4064;4065;4066;4799;4800;4801;8577;8578;8579;11651;11652;11653;11654;11655;11656;11657;11658;11659;12394;12395;12396;12397;12398;12399;13273;13274;13275;13276;13277;13278;13279;13280;13281;13282;13283;14198;14199;14200;14201;14202;14203;14204;14205;15111;15112;15113;15114;15115;15116;15117;15118;16284;16285;16286;16287;16288;17256;17257;17258;17259;17260;17261;17315;17316;17317;17318;18808;18809;18810;18811;18812;18813;18814;18815;18816;19048;19128;19129;19130;19131;19769;20539;20540;20541;20542;20543;20544;20545;20546;21346;21347;21348;21349;21350;21351;24815;24816;24817;24818;24819;24820;24821;24822;24823;24824;24825;24826;28990;28991;28992;28993;28994;28995;28996;28997;28998;28999;31104;31105;31410;33310;33311;33312;33313;33314;33315;38822;38823;38824;38825;38826;38827;38828;38829;40767;40768;40769;40770;40771;40772;40773;40774;40775;41012;41013;41014;41015;41016;41017;41018;41019;41020;41234;41235;41236;41237;41238;41239;41240;41241;41242;42368;42369;42370;42371;42372;42373;42374;42375;42376;43917;43918;43919;43920;43921;43922;43923;46294;46295;47506;47507;47508;47509;47510;47511 1714;1717;3145;3817;4066;4801;8579;11658;12394;13280;14198;15114;16286;16287;17260;17315;18808;19048;19131;19769;20539;21347;24817;28994;31104;31410;33310;38827;38828;40767;41013;41016;41235;42373;43920;46295;47510 69;70;71;72;73 108;161;308;337;391 -1
YBR142W YBR142W 21 21 21 YBR142W pep chromosome:R64-1-1:II:528317:530638:1 gene:YBR142W transcript:YBR142W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MAK5 description:Essential nucleolar protein; putative DEAD-box RNA helicase required for maint 1 21 21 21 12 9 7 12 12 10 12 9 7 12 12 10 12 9 7 12 12 10 39.1 39.1 39.1 87.047 773 773 0 95.013 27.2 16 15.7 21.7 18.4 16.3 754300000 236940000 62045000 189460000 87000000 54656000 124200000 213010000 168490000 163150000 176320000 166090000 152530000 14 9 8 12 12 10 65 111 264;869;2389;2426;2427;3102;4083;5498;6024;6451;7894;8223;9078;10220;10295;10734;11396;11829;11924;12158;12159 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 276;912;2473;2511;2512;3211;4249;5734;6275;6721;8294;8637;9522;10716;10795;11248;11933;12388;12487;12722;12723 1154;3616;9067;9068;9069;9070;9071;9072;9073;9214;9215;9216;9217;9218;9219;9220;9221;9222;11729;11730;15529;15530;15531;15532;15533;15534;21176;21177;21178;21179;21180;21181;23127;24660;30284;30285;30286;30287;30288;31453;31454;31455;34736;34737;39207;39511;41236;44018;44019;44020;44021;45773;45774;45775;45776;45777;46138;46139;47052;47053;47054;47055;47056;47057;47058 1156;3629;9113;9114;9115;9116;9117;9118;9119;9261;9262;9263;9264;9265;9266;9267;9268;9269;11811;11812;15637;15638;15639;15640;15641;15642;21303;21304;21305;21306;21307;21308;23263;24809;30473;30474;30475;30476;30477;31649;31650;31651;34944;34945;39443;39747;41489;44317;44318;44319;44320;46089;46090;46091;46092;46093;46455;46456;47379;47380;47381;47382;47383;47384;47385 1156;3629;9117;9262;9267;11811;15637;21304;23263;24809;30475;31651;34944;39443;39747;41489;44318;46089;46456;47379;47384 -1
YBR143C YBR143C 25 25 25 YBR143C pep chromosome:R64-1-1:II:530869:532182:-1 gene:YBR143C transcript:YBR143C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SUP45 description:Polypeptide release factor (eRF1) in translation termination; mutant form ac 1 25 25 25 9 13 16 13 10 15 9 13 16 13 10 15 9 13 16 13 10 15 61.1 61.1 61.1 49.005 437 437 0 128.9 25.6 34.6 42.6 29.5 26.3 37.8 1395900000 210220000 119310000 578930000 136220000 59335000 291880000 321350000 232000000 306030000 223300000 216100000 294390000 11 14 18 15 11 15 84 112 1252;2126;2695;2696;3202;3252;5202;5230;5344;6038;6084;6742;6920;6994;7047;7184;7426;7495;8847;9576;10791;11139;11566;12312;12313 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1303;2206;2789;2790;3316;3369;5420;5448;5570;6289;6335;7022;7208;7283;7342;7343;7517;7796;7871;9282;10045;11309;11673;12112;12885;12886 5036;5037;8129;10173;10174;10175;10176;10177;10178;12077;12302;12303;19906;20003;20004;20005;20449;20450;20451;20452;20453;20454;20455;23169;23170;23171;23172;23173;23174;23359;25713;25714;25715;25716;25717;25718;26463;26464;26465;26730;26731;26732;26733;26734;26920;26921;26922;26923;26924;26925;26926;26927;26928;26929;26930;27528;27529;27530;27531;27532;28501;28789;28790;28791;28792;33758;36701;41528;41529;41530;42891;44688;44689;47628;47629;47630;47631;47632;47633;47634;47635;47636;47637;47638 5064;5065;8171;10227;10228;10229;10230;10231;10232;12162;12387;12388;20030;20127;20128;20129;20576;20577;20578;20579;20580;20581;20582;23305;23306;23307;23308;23309;23310;23496;25867;25868;25869;25870;25871;25872;26623;26624;26625;26891;26892;26893;26894;26895;27082;27083;27084;27085;27086;27087;27088;27089;27090;27091;27092;27700;27701;27702;27703;27704;28679;28969;28970;28971;28972;33959;36919;41791;41792;41793;43188;44994;44995;47960;47961;47962;47963;47964;47965;47966;47967;47968;47969;47970 5065;8171;10228;10232;12162;12388;20030;20128;20577;23309;23496;25868;26625;26892;27085;27700;28679;28970;33959;36919;41793;43188;44995;47960;47969 74 1 -1
YBR154C YBR154C 6 6 6 YBR154C pep chromosome:R64-1-1:II:548362:549009:-1 gene:YBR154C transcript:YBR154C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPB5 description:RNA polymerase subunit ABC27; common to RNA polymerases I, II, and III; conta 1 6 6 6 3 2 4 4 3 3 3 2 4 4 3 3 3 2 4 4 3 3 35.8 35.8 35.8 25.079 215 215 0 40.642 12.6 13 31.2 30.7 16.7 23.3 231150000 34759000 9228500 80804000 38775000 8424000 59159000 57849000 57780000 29100000 44586000 44431000 46064000 3 2 4 4 3 3 19 113 107;3452;3453;6062;6912;10088 True;True;True;True;True;True 111;3581;3582;6313;7200;10580 457;458;459;460;461;13097;13098;13099;13100;13101;13102;23256;23257;23258;26445;26446;26447;38691;38692 458;459;460;461;462;13185;13186;13187;13188;13189;13190;23392;23393;23394;26605;26606;26607;38924;38925 458;13185;13190;23392;26606;38925 -1
YBR159W YBR159W 3 3 3 YBR159W pep chromosome:R64-1-1:II:558685:559728:1 gene:YBR159W transcript:YBR159W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IFA38 description:Microsomal beta-keto-reductase; contains oleate response element (ORE) sequen 1 3 3 3 0 1 2 1 0 0 0 1 2 1 0 0 0 1 2 1 0 0 10.7 10.7 10.7 38.708 347 347 0 5.3332 0 4.9 5.8 4.9 0 0 19499000 0 1655800 15954000 1888900 0 0 0 0 9401000 0 0 0 0 1 1 1 0 0 3 114 2924;4832;11906 True;True;True 3029;5034;12469 11099;18368;46068;46069 11176;18485;46385;46386 11176;18485;46386 -1
YBR160W;YPL031C YBR160W 6;1 6;1 6;1 YBR160W pep chromosome:R64-1-1:II:560078:560974:1 gene:YBR160W transcript:YBR160W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC28 description:Cyclin-dependent kinase (CDK) catalytic subunit; master regulator of mitotic 2 6 6 6 2 4 3 3 1 4 2 4 3 3 1 4 2 4 3 3 1 4 20.8 20.8 20.8 34.061 298 298;305 0 12.2 6.4 17.1 8.1 13.4 5.4 11.7 217720000 8119300 29672000 95895000 23758000 8970200 51301000 0 57781000 65890000 44972000 0 52401000 2 4 3 3 1 4 17 115 456;3002;4577;5783;6124;11001 True;True;True;True;True;True 483;3109;4773;6025;6375;11527 1988;11347;11348;11349;11350;11351;17469;17470;22155;22156;22157;22158;22159;23503;23504;42330;42331 1994;11426;11427;11428;11429;11430;17584;17585;22285;22286;22287;22288;22289;23643;23644;42625;42626 1994;11430;17584;22288;23644;42626 -1;-1
YBR164C YBR164C 2 2 2 YBR164C pep chromosome:R64-1-1:II:567875:568426:-1 gene:YBR164C transcript:YBR164C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARL1 description:Soluble GTPase with a role in regulation of membrane traffic; regulates potas 1 2 2 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 18.6 18.6 18.6 20.434 183 183 0 14.219 0 0 18.6 0 0 18.6 37845000 0 0 23183000 0 0 14662000 0 0 12883000 0 0 15440000 0 0 2 0 0 2 4 116 2878;8105 True;True 2980;8513 10945;10946;31060;31061 11021;11022;31253;31254 11021;31254 -1
YBR169C YBR169C 7 2 2 YBR169C pep chromosome:R64-1-1:II:573915:575996:-1 gene:YBR169C transcript:YBR169C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSE2 description:Member of Hsp110 subclass of the heat shock protein 70 (HSP70) family; serves 1 7 2 2 4 3 5 1 2 3 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 10.2 2.9 2.9 77.62 693 693 0.0093123 1.7147 7.5 5.6 7.2 2.3 2.3 3.5 27834000 4626300 0 23208000 0 0 0 0 0 13675000 0 0 0 1 0 1 0 0 0 2 117 1610;3741;4318;9732;11938;12037;12199 True;False;True;False;False;False;False 1673;3887;4495;10208;12501;12600;12768 6384;14209;14210;14211;16396;37302;37303;37304;46200;46201;46202;46203;46204;46205;46630;46631;46632;46633;46634;47211 6420;14307;14308;14309;16505;37524;37525;37526;46517;46518;46519;46520;46521;46522;46951;46952;46953;46954;46955;47540 6420;14307;16505;37524;46522;46954;47540 -1
YBR172C YBR172C 5 5 5 YBR172C pep chromosome:R64-1-1:II:579150:581372:-1 gene:YBR172C transcript:YBR172C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SMY2 description:GYF domain protein; involved in COPII vesicle formation; interacts with the S 1 5 5 5 3 3 1 2 2 0 3 3 1 2 2 0 3 3 1 2 2 0 9.2 9.2 9.2 81.396 740 740 0 16.677 5 4.9 2.6 3.2 3.2 0 47972000 14543000 10974000 8212300 9797700 4445100 0 16091000 17125000 0 21835000 22601000 0 3 3 1 2 2 0 11 118 5553;9611;10473;10600;11543 True;True;True;True;True 5790;10080;10980;11108;12085 21363;36808;36809;36810;40133;40134;40135;40136;40580;40581;44570 21490;37027;37028;37029;40371;40372;40373;40374;40823;40824;44876 21490;37027;40373;40823;44876 -1
YPL090C;YBR181C YPL090C;YBR181C 26;26 26;26 26;26 YPL090C pep chromosome:R64-1-1:XVI:377291:378395:-1 gene:YPL090C transcript:YPL090C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS6A description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mamma 2 26 26 26 21 16 23 20 21 19 21 16 23 20 21 19 21 16 23 20 21 19 67.4 67.4 67.4 26.996 236 236;236 0 199.77 58.5 52.5 66.9 61.9 61 57.2 13479000000 2593000000 1641400000 4109900000 1672700000 962380000 2499700000 3219400000 3286800000 2952700000 3224100000 2981200000 2806700000 28 31 32 33 25 30 179 119 1525;1595;1596;2080;2232;2233;2804;2883;2884;4050;4051;4588;4623;4624;4938;5039;5040;5062;5063;6383;7149;7985;8148;8164;10046;10047 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1585;1658;1659;2158;2314;2315;2903;2985;2986;4216;4217;4784;4819;4820;5144;5248;5249;5272;5273;6649;7466;7467;8389;8558;8559;8575;10537;10538 6063;6064;6065;6066;6067;6068;6325;6326;6327;6328;6329;6330;6331;6332;6333;6334;6335;6336;7943;8505;8506;8507;8508;8509;8510;8511;8512;8513;8514;8515;8516;8517;8518;8519;8520;8521;8522;8523;8524;10627;10628;10629;10630;10631;10632;10633;10634;10635;10636;10637;10638;10639;10640;10641;10642;10643;10960;10961;10962;10963;10964;10965;10966;10967;15388;15389;15390;15391;15392;15393;15394;15395;15396;15397;15398;15399;15400;15401;15402;15403;17506;17507;17508;17615;17616;17617;17618;17619;17620;17621;17622;18804;18805;18806;19197;19198;19199;19200;19201;19202;19203;19204;19205;19206;19302;19303;19304;19305;19306;19307;19308;19309;19310;19311;19312;19313;19314;19315;19316;19317;19318;19319;19320;19321;19322;19323;24369;24370;24371;24372;24373;24374;24375;27330;27331;27332;27333;27334;27335;27336;27337;27338;27339;30637;30638;30639;30640;30641;31185;31186;31220;31221;31222;31223;31224;38510;38511;38512;38513;38514;38515;38516;38517;38518;38519;38520;38521;38522;38523;38524;38525;38526;38527;38528;38529;38530;38531;38532;38533 6099;6100;6101;6102;6103;6104;6361;6362;6363;6364;6365;6366;6367;6368;6369;6370;6371;6372;7985;8548;8549;8550;8551;8552;8553;8554;8555;8556;8557;8558;8559;8560;8561;8562;8563;8564;8565;8566;8567;10694;10695;10696;10697;10698;10699;10700;10701;10702;10703;10704;10705;10706;10707;10708;10709;10710;10711;11036;11037;11038;11039;11040;11041;11042;11043;15496;15497;15498;15499;15500;15501;15502;15503;15504;15505;15506;15507;15508;15509;15510;15511;17621;17622;17623;17730;17731;17732;17733;17734;17735;17736;17737;18925;18926;18927;19320;19321;19322;19323;19324;19325;19326;19327;19328;19329;19425;19426;19427;19428;19429;19430;19431;19432;19433;19434;19435;19436;19437;19438;19439;19440;19441;19442;19443;19444;19445;19446;24517;24518;24519;24520;24521;24522;24523;27496;27497;27498;27499;27500;27501;27502;27503;27504;27505;27506;27507;30827;30828;30829;30830;30831;31378;31379;31414;31415;31416;31417;31418;38743;38744;38745;38746;38747;38748;38749;38750;38751;38752;38753;38754;38755;38756;38757;38758;38759;38760;38761;38762;38763;38764;38765;38766 6103;6365;6370;7985;8554;8565;10699;11039;11042;15498;15501;17623;17730;17735;18926;19320;19325;19429;19444;24523;27502;30827;31378;31418;38746;38762 75;76 1;63 -1;-1
YBR189W YBR189W 25 25 1 YBR189W pep chromosome:R64-1-1:II:604508:605508:1 gene:YBR189W transcript:YBR189W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS9B description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mammali 1 25 25 1 18 14 17 16 20 18 18 14 17 16 20 18 1 1 1 1 1 1 67.7 67.7 8.2 22.298 195 195 0 102.89 64.1 56.9 62.6 56.4 64.6 58.5 9957500000 1270600000 783020000 4220900000 567360000 658350000 2457300000 1696400000 1779600000 2421800000 1636600000 1668100000 2244800000 25 20 23 18 22 22 130 120 1307;3554;3555;4621;4937;5174;5175;5497;5653;5654;5670;5671;5672;5723;5724;6559;8206;8551;8565;8593;8594;10907;10908;11050;11051 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1361;3692;3693;4817;5143;5387;5388;5733;5891;5892;5909;5910;5911;5964;5965;6835;8619;8620;8975;8989;9017;9018;11428;11429;11577;11578 5245;5246;5247;5248;5249;5250;5251;13550;13551;13552;13553;13554;13555;13556;13557;13558;13559;13560;17609;17610;17611;17612;17613;18794;18795;18796;18797;18798;18799;18800;18801;18802;18803;19763;19764;19765;19766;19767;19768;19769;19770;19771;19772;19773;19774;19775;19776;19777;19778;19779;19780;19781;19782;21172;21173;21174;21175;21692;21693;21694;21695;21696;21697;21698;21699;21700;21701;21702;21703;21704;21705;21706;21751;21752;21753;21754;21755;21756;21757;21758;21759;21760;21928;21929;21930;21931;21932;21933;25047;25048;25049;25050;25051;31380;31381;31382;31383;31384;31385;31386;31387;31388;31389;31390;32612;32613;32614;32615;32616;32617;32618;32619;32677;32678;32679;32739;32740;32741;32742;32743;41925;41926;41927;41928;41929;41930;41931;41932;42512;42513;42514;42515 5276;5277;5278;5279;5280;5281;5282;13639;13640;13641;13642;13643;13644;13645;13646;13647;13648;13649;17724;17725;17726;17727;17728;18915;18916;18917;18918;18919;18920;18921;18922;18923;18924;19886;19887;19888;19889;19890;19891;19892;19893;19894;19895;19896;19897;19898;19899;19900;19901;19902;19903;19904;19905;21299;21300;21301;21302;21821;21822;21823;21824;21825;21826;21827;21828;21829;21830;21831;21832;21833;21834;21835;21880;21881;21882;21883;21884;21885;21886;21887;21888;21889;22058;22059;22060;22061;22062;22063;25197;25198;25199;25200;25201;31575;31576;31577;31578;31579;31580;31581;31582;31583;31584;31585;31586;32808;32809;32810;32811;32812;32813;32814;32815;32874;32875;32876;32936;32937;32938;32939;32940;42189;42190;42191;42192;42193;42194;42195;42196;42807;42808;42809;42810 5280;13639;13645;17724;18923;19889;19898;21302;21825;21830;21880;21885;21889;22061;22063;25199;31586;32809;32874;32936;32939;42189;42194;42808;42810 77 147 -1
YBR191W YBR191W 16 16 3 YBR191W pep chromosome:R64-1-1:II:606270:607140:1 gene:YBR191W transcript:YBR191W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL21A description:Ribosomal 60S subunit protein L21A; homologous to mammalian ribosomal protei 1 16 16 3 14 11 10 12 14 12 14 11 10 12 14 12 3 3 2 2 2 3 68.8 68.8 14.4 18.242 160 160 0 58.422 65 55.6 50 57.5 68.1 59.4 10267000000 2022300000 1460200000 2320300000 1155600000 1063700000 2245000000 2358600000 2936000000 1678500000 2787200000 3232900000 2321800000 16 14 12 16 17 16 91 121 626;717;718;1051;3527;4848;5091;6401;8560;8597;9652;10152;10550;10990;10991;11738 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 662;757;758;1099;3663;5051;5301;6667;8984;9021;10124;10648;11058;11516;11517;12295 2658;2659;2660;2966;2967;2968;2969;2970;2971;2972;2973;2974;2975;2976;2977;2978;2979;2980;2981;2982;4377;4378;4379;4380;4381;4382;13429;13430;13431;13432;13433;13434;13435;13436;13437;18436;18437;18438;18439;18440;18441;18442;18443;18444;18445;18446;19455;19456;19457;24438;24439;24440;24441;24442;24443;32650;32651;32652;32653;32654;32655;32656;32759;32760;32761;36988;36989;36990;36991;36992;36993;38957;38958;38959;38960;40411;40412;40413;42302;42303;42304;42305;42306;42307;45453;45454;45455;45456;45457;45458;45459;45460;45461 2665;2666;2667;2976;2977;2978;2979;2980;2981;2982;2983;2984;2985;2986;2987;2988;2989;2990;2991;2992;4400;4401;4402;4403;4404;4405;13518;13519;13520;13521;13522;13523;13524;13525;13526;18554;18555;18556;18557;18558;18559;18560;18561;18562;18563;18564;19578;19579;19580;24586;24587;24588;24589;24590;24591;32846;32847;32848;32849;32850;32851;32852;32956;32957;32958;37207;37208;37209;37210;37211;37212;39192;39193;39194;39195;40652;40653;40654;42597;42598;42599;42600;42601;42602;45767;45768;45769;45770;45771;45772;45773;45774;45775 2665;2978;2983;4404;13524;18560;19579;24590;32852;32958;37209;39193;40652;42598;42602;45771 -1
YBR195C YBR195C 2 2 2 YBR195C pep chromosome:R64-1-1:II:610614:611882:-1 gene:YBR195C transcript:YBR195C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MSI1 description:Subunit of chromatin assembly factor I (CAF-1); chromatin assembly by CAF-1 a 1 2 2 2 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 4.5 4.5 4.5 47.364 422 422 0.001548 2.4846 2.8 0 0 1.7 0 0 2053800 1354800 0 0 698970 0 0 1769600 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 122 6318;6405 True;True 6579;6671 24159;24450 24307;24598 24307;24598 -1
YBR196C YBR196C 8 8 8 YBR196C pep chromosome:R64-1-1:II:612236:613900:-1 gene:YBR196C transcript:YBR196C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PGI1 description:Glycolytic enzyme phosphoglucose isomerase; catalyzes the interconversion of 1 8 8 8 2 1 7 3 0 5 2 1 7 3 0 5 2 1 7 3 0 5 22.6 22.6 22.6 61.298 554 554 0 94.016 4.5 1.8 20.9 10.8 0 17.3 268720000 29846000 7294400 145970000 21549000 0 64065000 47048000 0 66230000 59946000 0 60165000 3 1 8 3 0 5 20 123 634;982;3219;5567;7720;7733;9408;10083 True;True;True;True;True;True;True;True 671;1028;3333;5804;8107;8123;9872;10575 2685;2686;4093;12137;12138;12139;21397;21398;21399;21400;29600;29601;29602;29603;29604;29605;29676;36088;38657;38658 2693;2694;4109;12222;12223;12224;21524;21525;21526;21527;29784;29785;29786;29787;29788;29789;29860;36299;38890;38891 2693;4109;12222;21525;29785;29860;36299;38890 -1
YBR198C YBR198C 4 4 4 YBR198C pep chromosome:R64-1-1:II:616127:618523:-1 gene:YBR198C transcript:YBR198C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TAF5 description:Subunit (90 kDa) of TFIID and SAGA complexes; involved in RNA polymerase II t 1 4 4 4 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 6.6 6.6 6.6 88.967 798 798 0.00085106 3.4113 4.3 3.4 1.9 2.4 0.9 2.4 36176000 10048000 7260400 8948400 2913100 1342000 5663900 13124000 0 0 0 0 0 2 2 1 1 1 1 8 124 5852;9399;10350;10706 True;True;True;True 6096;9863;10850;11217 22416;22417;22418;36062;39712;41041;41042;41043 22549;22550;22551;36273;39949;41289;41290;41291 22551;36273;39949;41291 -1
YBR205W YBR205W 2 2 2 YBR205W pep chromosome:R64-1-1:II:633622:634836:1 gene:YBR205W transcript:YBR205W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KTR3 description:Putative alpha-1,2-mannosyltransferase; involved in O- and N-linked protein gl 1 2 2 2 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 6.9 6.9 6.9 47.482 404 404 0.00522 2.0982 6.9 0 0 4.7 0 4.7 20737000 9004600 0 0 2068500 0 9663600 11762000 0 0 0 0 0 2 0 0 1 0 1 4 125 7846;12035 True;True 8246;12598 30158;46626;46627;46628 30346;46947;46948;46949 30346;46947 -1
YGL062W;YBR218C YGL062W;YBR218C 8;8 8;8 8;8 YGL062W pep chromosome:R64-1-1:VII:385196:388732:1 gene:YGL062W transcript:YGL062W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PYC1 description:Pyruvate carboxylase isoform; cytoplasmic enzyme that converts pyruvate to ox 2 8 8 8 4 1 2 2 0 2 4 1 2 2 0 2 4 1 2 2 0 2 9.7 9.7 9.7 130.1 1178 1178;1180 0 39.442 5.2 1 2 3.4 0 1.9 53937000 15293000 1077500 16742000 4207000 0 16618000 0 0 9865100 0 0 0 3 1 2 2 0 2 10 126 1072;2814;3561;5221;6501;7325;9907;10941 True;True;True;True;True;True;True;True 1120;2913;3699;5439;6777;7689;10394;11465 4435;10668;13576;13577;19974;24841;28080;38040;38041;42098;42099 4460;10736;13665;13666;20098;24991;28254;38271;38272;42390;42391 4460;10736;13665;20098;24991;28254;38272;42391 -1;-1
YBR221C YBR221C 9 9 9 YBR221C pep chromosome:R64-1-1:II:665153:666253:-1 gene:YBR221C transcript:YBR221C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PDB1 description:E1 beta subunit of the pyruvate dehydrogenase (PDH) complex; PDH is an evolut 1 9 9 9 8 5 3 7 4 4 8 5 3 7 4 4 8 5 3 7 4 4 27.9 27.9 27.9 40.053 366 366 0 32.027 27.6 16.7 18 24.6 13.7 17.8 219300000 67163000 42753000 25500000 32507000 22100000 29277000 64208000 92271000 42930000 61575000 65692000 38036000 8 5 3 7 4 4 31 127 1680;1822;3239;5437;9090;11337;11569;11570;12022 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1745;1891;3356;5671;9535;11874;12115;12116;12585 6618;6619;6620;6621;7153;7154;7155;7156;7157;12249;12250;12251;12252;20900;34770;34771;43710;43711;43712;43713;43714;43715;44701;44702;44703;44704;44705;46562;46563;46564;46565 6654;6655;6656;6657;7193;7194;7195;7196;7197;12334;12335;12336;12337;21027;34978;34979;44009;44010;44011;44012;44013;44014;45007;45008;45009;45010;45011;46883;46884;46885;46886 6657;7194;12337;21027;34978;44013;45007;45010;46884 -1
YBR227C YBR227C 2 2 2 YBR227C pep chromosome:R64-1-1:II:673572:675134:-1 gene:YBR227C transcript:YBR227C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MCX1 description:Non-proteolytic ATPase of the AAA family; stimulates incorporation of the pyr 1 2 2 2 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 6.5 6.5 6.5 57.945 520 520 0 5.7343 4 2.5 0 4 2.5 0 20577000 12469000 4264600 0 2705000 1138600 0 0 0 0 0 3764700 0 1 1 0 1 1 0 4 128 1497;3021 True;True 1557;3129 5960;5961;11412;11413 5995;5996;11491;11492 5995;11491 -1
YBR233W YBR233W 3 3 3 YBR233W pep chromosome:R64-1-1:II:683428:684669:1 gene:YBR233W transcript:YBR233W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PBP2 description:RNA binding protein; has similarity to mammalian heterogeneous nuclear RNP K p 1 3 3 3 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 1 14.3 14.3 14.3 45.782 413 413 0 14.303 6.3 0 8 6.3 6.3 1.9 31612000 7348000 0 15467000 3984400 2229000 2583900 0 0 9113900 0 0 0 1 0 1 1 1 0 4 129 4440;9119;9687 True;True;True 4627;9566;10160 16879;16880;34889;34890;34891;37117 16992;16993;35097;35098;35099;37336 16992;35097;37336 -1
YBR234C YBR234C 1 1 1 YBR234C pep chromosome:R64-1-1:II:685438:686592:-1 gene:YBR234C transcript:YBR234C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARC40 description:Subunit of the ARP2/3 complex; ARP2/3 is required for the motility and integ 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 5.5 5.5 5.5 42.474 384 384 0.0015748 2.664 0 0 5.5 0 0 5.5 21789000 0 0 13439000 0 0 8350400 0 0 0 0 0 8350400 0 0 1 0 0 1 2 130 7366 True 7733 28256;28257 28431;28432 28431 -1
YBR236C YBR236C 2 2 2 YBR236C pep chromosome:R64-1-1:II:690383:691693:-1 gene:YBR236C transcript:YBR236C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ABD1 description:Methyltransferase; catalyzes the transfer of a methyl group from S-adenosylme 1 2 2 2 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 6.7 6.7 6.7 50.34 436 436 0.00085324 3.4576 0 3 0 0 3.7 0 4308500 0 2649700 0 0 1658800 0 0 5747700 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 2 131 4020;11488 True;True 4183;12029 15275;44384 15383;44690 15383;44690 -1
YBR245C YBR245C 15 15 14 YBR245C pep chromosome:R64-1-1:II:708150:711539:-1 gene:YBR245C transcript:YBR245C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ISW1 description:ATPase subunit of imitation-switch (ISWI) class chromatin remodelers; with Io 1 15 15 14 10 9 6 4 6 2 10 9 6 4 6 2 9 8 6 3 5 2 16.2 16.2 15.5 131.1 1129 1129 0 39.699 11.8 10.5 5.1 4.8 8.3 2.9 201450000 57890000 33861000 59492000 21774000 14263000 14171000 69489000 46682000 51661000 45270000 48506000 28633000 10 9 6 4 6 3 38 132 111;1080;1196;1944;2722;3740;3876;4125;4478;4499;4569;6588;6936;7862;12049 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 116;1128;1247;2018;2816;3886;4033;4293;4669;4692;4765;6865;7224;8262;12612 478;479;480;481;482;4463;4464;4855;4856;7472;7473;10278;10279;10280;10281;14208;14735;14736;14737;14738;15702;17051;17052;17053;17054;17055;17140;17433;25174;25175;25176;26538;26539;26540;26541;30192;46677;46678 479;480;481;482;483;4488;4489;4881;4882;7513;7514;10332;10333;10334;10335;14306;14837;14838;14839;14840;15810;17165;17166;17167;17168;17169;17254;17548;25324;25325;25326;26698;26699;26700;26701;30380;47000;47001 482;4488;4882;7514;10335;14306;14837;15810;17169;17254;17548;25325;26699;30380;47001 -1
YBR247C YBR247C 9 9 9 YBR247C pep chromosome:R64-1-1:II:713004:714455:-1 gene:YBR247C transcript:YBR247C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ENP1 description:Protein associated with U3 and U14 snoRNAs; required for pre-rRNA processing 1 9 9 9 4 4 1 4 1 2 4 4 1 4 1 2 4 4 1 4 1 2 18.8 18.8 18.8 55.136 483 483 0 23.087 6.8 7.9 1.4 10.4 1.7 3.3 48440000 16384000 8777400 7472500 5039200 2114100 8652500 16898000 17463000 0 12062000 0 13037000 4 5 1 4 1 2 17 133 1129;1580;1643;1857;2344;4258;5121;11303;12095 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1179;1643;1707;1927;2428;4432;5331;11840;12658 4620;4621;6276;6277;6489;7251;7252;7253;8909;8910;8911;16174;19554;43589;43590;46835 4646;4647;6312;6313;6525;7292;7293;7294;8954;8955;8956;8957;16283;19677;43888;43889;47160 4646;6312;6525;7292;8957;16283;19677;43888;47160 78 479 -1
YBR249C YBR249C 3 3 3 YBR249C pep chromosome:R64-1-1:II:716882:717994:-1 gene:YBR249C transcript:YBR249C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARO4 description:3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate (DAHP) synthase; catalyzes the fi 1 3 3 3 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 15.7 15.7 15.7 39.749 370 370 0 12.782 0 7.8 0 7.8 0 0 4852800 0 2807400 0 2045400 0 0 0 0 0 4207600 0 0 0 0 0 1 0 0 1 134 1799;3137;4316 True;True;True 1866;3248;4493 7071;11890;16393 7111;11974;16502 7111;11974;16502 -1
YBR263W YBR263W 8 7 7 YBR263W pep chromosome:R64-1-1:II:736264:737736:1 gene:YBR263W transcript:YBR263W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SHM1 description:Mitochondrial serine hydroxymethyltransferase; converts serine to glycine plus 1 8 7 7 3 4 5 5 2 2 3 3 4 5 1 1 3 3 4 5 1 1 20.8 19.4 19.4 53.686 490 490 0 24.571 8.2 10 14.1 14.7 3.7 5.1 123410000 15508000 15749000 59241000 21759000 3999700 7148200 27923000 41104000 27080000 37979000 0 0 3 3 4 5 1 1 17 135 470;942;2812;2907;6334;11153;11854;12386 True;True;False;True;True;True;True;True 497;985;2911;3010;6598;11687;12413;12961 2040;3935;3936;3937;10661;10662;10663;10664;11034;24212;24213;42932;42933;42934;42935;45840;47917;47918;47919;47920;47921 2046;3950;3951;3952;10729;10730;10731;10732;11110;24360;24361;43229;43230;43231;43232;46156;48249;48250;48251;48252;48253 2046;3950;10730;11110;24361;43232;46156;48253 -1
YBR264C YBR264C 1 1 1 YBR264C pep chromosome:R64-1-1:II:737770:738369:-1 gene:YBR264C transcript:YBR264C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YPT10 description:Rab family GTP-binding protein; contains the PEST signal sequence specific f 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 6 6 6 21.834 199 199 0.0079768 1.8124 0 0 6 0 0 0 3865700 0 0 3865700 0 0 0 0 0 2277800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 136 4142 True 4311 15746 15854 15854 -1
YBR279W YBR279W 3 3 3 YBR279W pep chromosome:R64-1-1:II:761257:762594:1 gene:YBR279W transcript:YBR279W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PAF1 description:Component of the Paf1p complex involved in transcription elongation; binds to 1 3 3 3 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 1 10.8 10.8 10.8 51.8 445 445 0 5.6294 7.6 0 0 0 0 3.1 9394000 6138800 0 0 0 0 3255300 8018300 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 137 5426;6320;6356 True;True;True 5659;6581;6621 20860;24161;24271 20987;24309;24419 20987;24309;24419 79 194 -1
YBR282W YBR282W 1 1 1 YBR282W pep chromosome:R64-1-1:II:768240:768680:1 gene:YBR282W transcript:YBR282W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL27 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; homolog of human Bcl-2 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 6.2 6.2 6.2 16.492 146 146 0.0015516 2.5021 0 0 6.2 0 0 6.2 18000000 0 0 12290000 0 0 5709400 0 0 0 0 0 5709400 0 0 1 0 0 1 2 138 2269 True 2351 8650;8651 8695;8696 8695 -1
YBR288C YBR288C 6 6 6 YBR288C pep chromosome:R64-1-1:II:778012:779463:-1 gene:YBR288C transcript:YBR288C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:APM3 description:Mu3-like subunit of the clathrin associated protein complex (AP-3); functions 1 6 6 6 4 1 3 2 2 3 4 1 3 2 2 3 4 1 3 2 2 3 17 17 17 54.837 483 483 0 50.343 11.8 3.1 9.9 7 5.4 9.5 159810000 37210000 7163000 66073000 11036000 4401600 33921000 40348000 0 41400000 28850000 0 33561000 4 1 3 2 2 2 14 139 2358;2840;3319;8344;9671;9865 True;True;True;True;True;True 2442;2939;3440;8761;10144;10348 8958;8959;8960;8961;10785;12578;12579;12580;12581;12582;12583;31861;37069;37880;37881 9004;9005;9006;9007;10853;12664;12665;12666;12667;12668;12669;32057;37288;38110;38111 9007;10853;12664;32057;37288;38111 -1
YCL009C YCL009C 8 8 8 YCL009C pep chromosome:R64-1-1:III:104619:105548:-1 gene:YCL009C transcript:YCL009C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ILV6 description:Regulatory subunit of acetolactate synthase; acetolactate synthase catalyzes 1 8 8 8 4 1 5 2 0 3 4 1 5 2 0 3 4 1 5 2 0 3 42.7 42.7 42.7 33.986 309 309 0 14.599 30.7 5.2 33 11 0 16.2 155990000 26589000 1835000 89532000 8935300 0 29095000 38280000 0 34516000 26270000 0 35897000 4 1 5 3 0 3 16 140 1784;3488;3489;4655;5276;8124;11501;11631 True;True;True;True;True;True;True;True 1851;3622;3623;4852;5497;8534;12043;12180 7026;7027;7028;13271;13272;13273;13274;17731;17732;20159;20160;20161;31109;31110;44432;44948 7066;7067;7068;13360;13361;13362;13363;17846;17847;20283;20284;20285;31302;31303;44738;45256 7067;13362;13363;17846;20284;31302;44738;45256 -1
YCL011C YCL011C 8 8 8 YCL011C pep chromosome:R64-1-1:III:102075:103358:-1 gene:YCL011C transcript:YCL011C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GBP2 description:Poly(A+) RNA-binding protein; key surveillance factor for the selective expo 1 8 8 8 4 6 4 5 1 5 4 6 4 5 1 5 4 6 4 5 1 5 30 30 30 48.728 427 427 0 37.805 15.7 20.6 16.4 18.3 2.8 23 253650000 28226000 38209000 87684000 21904000 3916900 73706000 47137000 67867000 54744000 44452000 0 73554000 4 8 4 5 1 5 27 141 315;1837;2185;2908;7715;8481;8786;10324 True;True;True;True;True;True;True;True 331;1906;2265;3011;3012;8101;8903;9217;10824 1400;1401;1402;1403;7187;7188;7189;8344;11035;11036;11037;11038;11039;11040;29576;29577;29578;29579;29580;32335;33515;33516;33517;33518;33519;39610 1403;1404;1405;1406;7227;7228;7229;8387;11111;11112;11113;11114;11115;11116;11117;29760;29761;29762;29763;29764;32531;33715;33716;33717;33718;33719;39846 1405;7228;8387;11115;29761;32531;33715;39846 80 272 -1
YCL014W YCL014W 5 5 5 YCL014W pep chromosome:R64-1-1:III:96281:101191:1 gene:YCL014W transcript:YCL014W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BUD3 description:Guanine nucleotide exchange factor (GEF) for Cdc42p; activates Cdc42p in early 1 5 5 5 2 4 1 2 0 0 2 4 1 2 0 0 2 4 1 2 0 0 3.2 3.2 3.2 184.72 1636 1636 0 10.69 1.2 2.8 0.7 1.5 0 0 19315000 1389800 7047900 5605500 5271900 0 0 0 13323000 0 12810000 0 0 2 3 1 2 0 0 8 142 1300;2904;4294;7458;10966 True;True;True;True;True 1353;3007;4470;7832;11491 5225;5226;11025;16316;16317;28654;42217;42218;42219 5256;5257;11101;16425;16426;28834;42512;42513;42514 5257;11101;16426;28834;42513 -1
YCL016C YCL016C 2 2 2 YCL016C pep chromosome:R64-1-1:III:94621:95763:-1 gene:YCL016C transcript:YCL016C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DCC1 description:Subunit of a complex with Ctf8p and Ctf18p; shares some components with Replic 1 2 2 2 0 2 0 0 1 0 0 2 0 0 1 0 0 2 0 0 1 0 9.7 9.7 9.7 44.073 380 380 0 12.076 0 9.7 0 0 5.8 0 4658600 0 3543500 0 0 1115100 0 0 7686400 0 0 0 0 0 2 0 0 1 0 3 143 6013;9068 True;True 6264;9512 23060;23061;34691 23196;23197;34899 23197;34899 -1
YCL017C YCL017C 1 1 1 YCL017C pep chromosome:R64-1-1:III:92777:94270:-1 gene:YCL017C transcript:YCL017C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NFS1 description:Cysteine desulfurase; involved in iron-sulfur cluster (Fe/S) biogenesis and in 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 3.4 3.4 3.4 54.466 497 497 0.00085179 3.4148 0 0 3.4 0 3.4 3.4 21784000 0 0 12358000 0 2897600 6528300 0 0 0 0 0 6528300 0 0 1 0 1 1 3 144 8983 True 9426 34252;34253;34254 34458;34459;34460 34460 -1
YCL028W YCL028W 4 4 4 YCL028W pep chromosome:R64-1-1:III:70150:71367:1 gene:YCL028W transcript:YCL028W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RNQ1 description:[PIN(+)] prion; an infectious protein conformation that is generally an ordered 1 4 4 4 2 3 4 2 0 3 2 3 4 2 0 3 2 3 4 2 0 3 18.3 18.3 18.3 42.579 405 405 0 23.669 8.4 12.1 18.3 9.9 0 14.1 235100000 13900000 14588000 113910000 4502300 0 88192000 19417000 31390000 56709000 27273000 0 69056000 2 3 4 2 0 4 15 145 35;3745;6810;7059 True;True;True;True 37;3892;7096;7361;7362 143;144;145;14237;14238;14239;14240;26025;26026;26027;26028;27006;27007;27008;27009 143;144;145;14335;14336;14337;14338;26182;26183;26184;26185;27168;27169;27170;27171 144;14336;26185;27171 81 1 -1
YCL030C YCL030C 2 2 2 YCL030C pep chromosome:R64-1-1:III:65934:68333:-1 gene:YCL030C transcript:YCL030C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HIS4 description:Multifunctional enzyme containing phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase; phosphor 1 2 2 2 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 3.8 3.8 3.8 87.72 799 799 0 3.7808 2.3 0 0 0 1.5 2.3 10272000 3346300 0 0 0 909810 6016000 0 0 0 0 0 6016000 1 0 0 0 0 1 2 146 4208;6835 True;True 4380;7122 15994;26137;26138 16103;26294;26295 16103;26294 -1
YCL031C YCL031C 6 6 6 YCL031C pep chromosome:R64-1-1:III:64675:65568:-1 gene:YCL031C transcript:YCL031C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RRP7 description:Essential protein involved in rRNA processing and ribosome biogenesis; protein 1 6 6 6 3 1 2 2 2 5 3 1 2 2 2 5 3 1 2 2 2 5 23.9 23.9 23.9 34.47 297 297 0 13.162 13.1 4.7 9.4 7.7 8.4 19.2 175280000 32180000 6307400 46865000 14013000 12198000 63715000 43237000 0 36115000 37150000 0 45688000 3 1 3 2 2 4 15 147 2705;3010;4348;5154;7477;9482 True;True;True;True;True;True 2799;3117;4527;5366;7852;9948 10207;10208;10209;11376;11377;11378;16509;19690;19691;28719;28720;28721;28722;36363;36364;36365 10261;10262;10263;11455;11456;11457;16619;19813;19814;28899;28900;28901;28902;36576;36577;36578 10261;11456;16619;19813;28900;36578 -1
YCL037C YCL037C 12 12 12 YCL037C pep chromosome:R64-1-1:III:57374:58678:-1 gene:YCL037C transcript:YCL037C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SRO9 description:Cytoplasmic RNA-binding protein; shuttles between nucleus and cytoplasm and is 1 12 12 12 6 9 6 10 5 5 6 9 6 10 5 5 6 9 6 10 5 5 35.9 35.9 35.9 48.059 434 434 0 76.236 18.7 32.7 19.6 32.7 23.3 20.7 960050000 148970000 212750000 212260000 165450000 60454000 160150000 243060000 340890000 158440000 333960000 220590000 184620000 8 12 8 11 7 6 52 148 800;801;1144;1651;5538;5539;6548;8428;8674;9170;9892;11685 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 841;842;1195;1715;5775;5776;6824;8849;9099;9620;10378;12241 3323;3324;3325;3326;4664;4665;4666;4667;6528;6529;6530;21315;21316;21317;21318;21319;21320;21321;21322;21323;21324;21325;21326;21327;21328;21329;24999;25000;25001;25002;25003;32143;32144;32145;32146;32147;32148;32149;32150;32151;32152;33063;33064;33065;33066;33067;33068;35116;35117;37979;45228;45229 3335;3336;3337;3338;4690;4691;4692;4693;6564;6565;6566;21442;21443;21444;21445;21446;21447;21448;21449;21450;21451;21452;21453;21454;21455;21456;25149;25150;25151;25152;25153;32339;32340;32341;32342;32343;32344;32345;32346;32347;32348;33262;33263;33264;33265;33266;33267;35324;35325;38210;45540;45541;45542 3335;3337;4690;6565;21448;21455;25150;32346;33266;35324;38210;45542 82;83 260;308 -1
YCL042W YCL042W 1 1 1 YCL042W pep chromosome:R64-1-1:III:50584:50943:1 gene:YCL042W transcript:YCL042W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; epitope-tagged protein localizes to the cytoplasm [Source: 1 1 1 1 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 7.6 7.6 7.6 13.36 119 119 0.0058824 1.9525 0 7.6 7.6 0 7.6 0 124310000 0 19326000 86351000 0 18629000 0 0 0 0 0 61595000 0 0 1 1 0 1 0 3 149 4257 True 4431 16171;16172;16173 16280;16281;16282 16280 -1
YCL043C YCL043C 9 9 9 YCL043C pep chromosome:R64-1-1:III:48653:50221:-1 gene:YCL043C transcript:YCL043C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PDI1 description:Protein disulfide isomerase; multifunctional oxidoreductase of the ER lumen, e 1 9 9 9 6 4 3 5 6 8 6 4 3 5 6 8 6 4 3 5 6 8 23.2 23.2 23.2 58.226 522 522 0 28.29 14.6 10.7 10.9 12.5 14.6 19.7 349430000 99954000 20030000 93196000 29006000 25212000 82029000 96788000 51023000 72676000 76326000 82987000 74179000 9 5 5 6 7 7 39 150 96;330;585;1954;3436;5306;9197;9198;9483 True;True;True;True;True;True;True;True;True 99;348;617;2029;3562;5529;9647;9648;9949 401;1464;1465;1466;1467;1468;1469;1470;1471;1472;1473;2530;2531;2532;2533;7491;13037;13038;13039;13040;13041;13042;20293;20294;20295;35220;35221;35222;35223;35224;35225;35226;35227;35228;35229;35230;35231;35232;35233;36366 402;1467;1468;1469;1470;1471;1472;1473;1474;1475;1476;2537;2538;2539;2540;7532;13125;13126;13127;13128;13129;13130;20419;20420;20421;35428;35429;35430;35431;35432;35433;35434;35435;35436;35437;35438;35439;35440;35441;36579 402;1471;2540;7532;13125;20419;35428;35435;36579 -1
YCL050C YCL050C 9 9 9 YCL050C pep chromosome:R64-1-1:III:37836:38801:-1 gene:YCL050C transcript:YCL050C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:APA1 description:AP4A phosphorylase; bifunctional diadenosine 5,5-P1,P4-tetraphosphate phos 1 9 9 9 2 1 6 4 3 4 2 1 6 4 3 4 2 1 6 4 3 4 44.9 44.9 44.9 36.492 321 321 0 18.431 10 4.7 35.5 21.5 10 16.5 175570000 10900000 8197800 91700000 11455000 8271400 45047000 19335000 0 46888000 18219000 30374000 49414000 2 1 6 4 3 4 20 151 563;1693;2351;2749;3267;4724;6125;8676;9075 True;True;True;True;True;True;True;True;True 595;1758;2435;2844;3385;4921;6376;9101;9519 2445;2446;2447;2448;6697;8938;8939;8940;10417;12371;12372;17955;23505;33072;34721;34722;34723;34724;34725;34726 2452;2453;2454;2455;6737;8984;8985;8986;10481;12456;12457;18071;23645;33271;34929;34930;34931;34932;34933;34934 2452;6737;8985;10481;12457;18071;23645;33271;34934 -1
YCL054W YCL054W 5 5 5 YCL054W pep chromosome:R64-1-1:III:31449:33974:1 gene:YCL054W transcript:YCL054W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SPB1 description:AdoMet-dependent methyltransferase; involved in rRNA processing and 60S ribosom 1 5 5 5 2 3 2 4 3 1 2 3 2 4 3 1 2 3 2 4 3 1 6.9 6.9 6.9 96.484 841 841 0 30.343 4.4 5 3.6 5.8 5.8 1.9 83710000 8440200 15621000 25169000 18341000 9666600 6472000 22717000 39558000 0 26675000 25652000 0 2 3 2 4 3 1 15 152 1176;1988;2049;6145;10115 True;True;True;True;True 1227;2063;2126;6399;6400;10607 4793;4794;4795;4796;7601;7602;7817;7818;7819;7820;23595;23596;23597;23598;38777 4819;4820;4821;4822;7643;7644;7859;7860;7861;7862;23736;23737;23738;23739;39012 4822;7643;7860;23738;39012 84;85 229;663 -1
YCL059C YCL059C 7 7 7 YCL059C pep chromosome:R64-1-1:III:22429:23379:-1 gene:YCL059C transcript:YCL059C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KRR1 description:Nucleolar protein required for rRNA synthesis and ribosomal assembly; required 1 7 7 7 0 3 4 3 1 1 0 3 4 3 1 1 0 3 4 3 1 1 23.1 23.1 23.1 37.159 316 316 0 19.387 0 13 13.9 10.1 5.4 4.7 109130000 0 16650000 60305000 20548000 7794700 3830200 0 0 35535000 0 0 0 0 3 4 2 1 1 11 153 400;1794;4043;4358;7549;8579;11746 True;True;True;True;True;True;True 425;1861;4208;4537;7927;9003;12303 1733;1734;1735;7058;7059;7060;15358;16538;16539;28976;32701;45481 1739;1740;1741;7098;7099;7100;15466;16648;16649;29159;32898;45795 1741;7099;15466;16649;29159;32898;45795 -1
YCL064C YCL064C 17 17 17 YCL064C pep chromosome:R64-1-1:III:15798:16880:-1 gene:YCL064C transcript:YCL064C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CHA1 description:Catabolic L-serine (L-threonine) deaminase; catalyzes the degradation of both 1 17 17 17 12 10 11 9 6 10 12 10 11 9 6 10 12 10 11 9 6 10 62.5 62.5 62.5 39.301 360 360 0 111.68 51.4 35.3 49.4 32.8 18.1 43.1 903180000 107090000 111510000 390470000 70507000 31471000 192130000 211130000 225830000 182340000 147600000 118630000 167550000 11 10 12 9 6 10 58 154 770;3015;3059;4052;4297;4755;5136;5146;6670;6671;7916;9116;9461;9491;11931;11994;12315 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 811;3122;3123;3168;4218;4473;4954;5348;5358;6950;6951;8316;9563;9926;9957;12494;12557;12888 3222;11396;11397;11398;11399;11400;11562;11563;11564;11565;15404;15405;15406;16327;16328;16329;16330;16331;18104;18105;19610;19611;19647;19648;19649;19650;19651;25456;25457;25458;25459;25460;25461;30355;30356;30357;30358;30359;30360;34878;34879;34880;34881;34882;36291;36292;36389;46163;46164;46165;46166;46167;46409;46410;46411;47644;47645;47646;47647 3233;11475;11476;11477;11478;11479;11643;11644;11645;11646;15512;15513;15514;16436;16437;16438;16439;16440;18221;18222;19733;19734;19770;19771;19772;19773;19774;25610;25611;25612;25613;25614;25615;30544;30545;30546;30547;30548;30549;35086;35087;35088;35089;35090;36504;36505;36602;46480;46481;46482;46483;46484;46729;46730;46731;47976;47977;47978;47979 3233;11478;11643;15513;16436;18222;19734;19770;25611;25615;30546;35088;36504;36602;46482;46729;47977 86 46 -1
YCR002C YCR002C 6 6 6 YCR002C pep chromosome:R64-1-1:III:117380:118348:-1 gene:YCR002C transcript:YCR002C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC10 description:Component of the septin ring, required for cytokinesis; septins are GTP-bin 1 6 6 6 2 2 5 2 1 2 2 2 5 2 1 2 2 2 5 2 1 2 29.5 29.5 29.5 37.024 322 322 0 46.35 9.9 9.9 20.8 9.9 4 12.7 96363000 10361000 5769200 60575000 6690100 1911600 11056000 17575000 15199000 24962000 17767000 0 0 2 2 5 2 1 2 14 155 1850;6381;6764;8811;9716;11061 True;True;True;True;True;True 1919;6647;7045;9243;10190;11588 7228;24358;24359;24360;24361;25847;25848;25849;25850;25851;33622;37221;42560;42561 7268;24506;24507;24508;24509;26004;26005;26006;26007;26008;33822;37440;42855;42856 7268;24507;26005;33822;37440;42855 -1
YCR009C YCR009C 8 8 8 YCR009C pep chromosome:R64-1-1:III:130745:131542:-1 gene:YCR009C transcript:YCR009C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RVS161 description:Amphiphysin-like lipid raft protein; N-BAR domain protein that interacts w 1 8 8 8 2 2 7 4 2 5 2 2 7 4 2 5 2 2 7 4 2 5 33.2 33.2 33.2 30.25 265 265 0 42.958 10.6 8.3 30.9 17.4 7.5 23.4 253210000 7885900 6985500 94606000 10655000 5816700 127270000 30335000 34002000 68458000 31437000 37905000 47478000 2 2 7 4 2 5 22 156 1184;1885;2653;2917;5541;7944;10022;11433 True;True;True;True;True;True;True;True 1235;1956;2747;3022;5778;8345;10512;11970 4821;7325;9989;9990;9991;11071;11072;11073;11074;11075;21335;21336;30483;30484;30485;30486;38415;38416;44153;44154;44155;44156 4847;7366;10042;10043;10044;11148;11149;11150;11151;11152;21462;21463;30672;30673;30674;30675;38647;38648;44457;44458;44459;44460 4847;7366;10043;11151;21463;30674;38647;44459 -1
YCR012W YCR012W 33 33 33 YCR012W pep chromosome:R64-1-1:III:137746:138996:1 gene:YCR012W transcript:YCR012W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PGK1 description:3-phosphoglycerate kinase; catalyzes transfer of high-energy phosphoryl group 1 33 33 33 27 21 18 24 22 17 27 21 18 24 22 17 27 21 18 24 22 17 77.4 77.4 77.4 44.738 416 416 0 220.87 71.6 59.9 53.4 63.9 57.7 54.8 2779200000 811240000 264820000 676220000 321940000 295260000 409680000 965890000 501390000 557990000 591080000 851340000 613000000 32 23 20 25 24 17 141 157 33;34;205;299;410;472;513;769;1502;1870;1871;1880;2593;3382;3505;4635;4636;5190;6743;6744;9544;9545;10247;10733;10876;10877;10960;11226;11227;12029;12286;12352;12372 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 35;36;215;315;435;499;542;810;1562;1941;1942;1951;2687;3507;3639;4831;4832;5406;7023;7024;10013;10014;10745;11247;11396;11397;11485;11763;11764;12592;12857;12925;12946 138;139;140;141;142;881;882;1312;1313;1314;1801;1802;1803;2046;2047;2048;2049;2050;2051;2052;2209;2210;3213;3214;3215;3216;3217;3218;3219;3220;3221;5975;5976;5977;5978;7288;7289;7290;7291;7292;7293;7310;7311;7312;9819;9820;9821;9822;9823;12820;12821;12822;12823;12824;12825;12826;12827;12828;13330;13331;17658;17659;17660;17661;17662;17663;19858;19859;19860;19861;19862;19863;25719;25720;25721;25722;25723;25724;25725;25726;25727;25728;25729;25730;25731;36602;36603;36604;36605;36606;36607;36608;36609;36610;39312;39313;39314;39315;39316;39317;41230;41231;41232;41233;41234;41235;41817;41818;41819;41820;41821;41822;42185;42186;43244;43245;43246;43247;43248;43249;43250;43251;43252;43253;43254;46592;46593;46594;46595;46596;46597;47534;47535;47536;47537;47538;47780;47781;47782;47783;47784;47785;47845;47846 138;139;140;141;142;883;884;1314;1315;1316;1807;1808;1809;2052;2053;2054;2055;2056;2057;2058;2215;2216;3224;3225;3226;3227;3228;3229;3230;3231;3232;6010;6011;6012;6013;7329;7330;7331;7332;7333;7334;7351;7352;7353;9870;9871;9872;9873;9874;12907;12908;12909;12910;12911;12912;12913;12914;12915;13419;13420;17773;17774;17775;17776;17777;17778;19981;19982;19983;19984;19985;19986;25873;25874;25875;25876;25877;25878;25879;25880;25881;25882;25883;25884;25885;36819;36820;36821;36822;36823;36824;36825;36826;36827;39548;39549;39550;39551;39552;39553;41483;41484;41485;41486;41487;41488;42080;42081;42082;42083;42084;42085;42480;42481;43541;43542;43543;43544;43545;43546;43547;43548;43549;43550;43551;46913;46914;46915;46916;46917;46918;47866;47867;47868;47869;47870;48112;48113;48114;48115;48116;48117;48177;48178 139;142;883;1314;1809;2053;2216;3224;6011;7329;7334;7352;9870;12910;13419;17773;17777;19981;25874;25883;36822;36825;39553;41487;42080;42081;42480;43542;43550;46917;47869;48117;48178 -1
YCR016W YCR016W 8 8 8 YCR016W pep chromosome:R64-1-1:III:143634:144506:1 gene:YCR016W transcript:YCR016W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localizes 1 8 8 8 5 5 4 5 5 3 5 5 4 5 5 3 5 5 4 5 5 3 26.6 26.6 26.6 33.593 290 290 0 16.996 23.8 19.3 22.1 16.9 14.5 15.5 208520000 30663000 24797000 71357000 25704000 15327000 40674000 45187000 43842000 49737000 41640000 43232000 56474000 5 5 4 4 4 3 25 158 2071;3262;3263;6093;8211;8856;8857;12136 True;True;True;True;True;True;True;True 2149;3379;3380;6344;8625;9292;9293;12700 7909;12346;12347;12348;12349;12350;12351;12352;12353;12354;23392;23393;23394;23395;23396;31401;33782;33783;33784;33785;33786;33787;33788;47004;47005;47006;47007 7951;12431;12432;12433;12434;12435;12436;12437;12438;12439;23529;23530;23531;23532;23533;31597;33983;33984;33985;33986;33987;33988;33989;47331;47332;47333;47334 7951;12433;12438;23532;31597;33983;33987;47331 -1
YCR027C YCR027C 2 2 2 YCR027C pep chromosome:R64-1-1:III:167370:167999:-1 gene:YCR027C transcript:YCR027C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RHB1 description:Putative Rheb-related GTPase; involved in regulating canavanine resistance a 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 12.4 12.4 12.4 23.338 209 209 0 11.447 5.3 5.3 7.2 7.2 12.4 7.2 31994000 2242600 1625200 13162000 2572800 5246300 7145000 0 0 0 0 17346000 0 1 1 1 1 2 1 7 159 2720;5561 True;True 2814;5798 10268;10269;10270;10271;21376;21377;21378 10322;10323;10324;10325;21503;21504;21505 10324;21505 -1
YCR028C-A YCR028C-A 1 1 1 YCR028C-A pep chromosome:R64-1-1:III:172950:173440:-1 gene:YCR028C-A transcript:YCR028C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RIM1 description:ssDNA-binding protein essential for mitochondrial genome maintenance; 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 11.1 11.1 11.1 15.386 135 135 0.00083682 3.2301 0 0 0 0 0 11.1 3578300 0 0 0 0 0 3578300 0 0 0 0 0 3578300 0 0 0 0 0 1 1 160 4057 True 4223 15430 15538 15538 -1
YCR030C YCR030C 18 18 18 YCR030C pep chromosome:R64-1-1:III:173826:176438:-1 gene:YCR030C transcript:YCR030C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SYP1 description:Negative regulator of WASP-Arp23 complex; involved in endocytic site formati 1 18 18 18 12 7 6 7 9 8 12 7 6 7 9 8 12 7 6 7 9 8 27 27 27 96.136 870 870 0 92.895 19.4 9.4 9.4 10.2 12.2 14.3 335680000 75999000 28897000 91012000 33074000 25324000 81380000 72100000 82519000 73564000 76378000 88748000 55415000 12 7 6 7 9 8 49 161 1095;2360;2408;2580;4100;5552;7303;7754;7992;8678;9470;10279;10398;10722;11120;11391;11537;12283 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1145;2444;2493;2670;4266;5789;7666;8150;8396;9103;9936;10778;10900;11236;11651;11928;12079;12854 4518;4519;8963;9152;9153;9154;9155;9156;9745;9746;15604;21361;21362;28020;29825;30652;33085;36323;36324;36325;36326;39446;39883;39884;39885;39886;39887;41179;41180;41181;41182;41183;41184;42808;42809;42810;42811;43987;43988;43989;44550;44551;44552;44553;44554;47522;47523;47524;47525 4543;4544;9009;9199;9200;9201;9202;9203;9795;9796;15712;21488;21489;28194;30012;30842;33284;36536;36537;36538;36539;39682;40120;40121;40122;40123;40124;41431;41432;41433;41434;41435;41436;43103;43104;43105;43106;44286;44287;44288;44856;44857;44858;44859;44860;47853;47854;47855;47856 4544;9009;9199;9795;15712;21489;28194;30012;30842;33284;36539;39682;40122;41434;43103;44286;44860;47853 -1
YCR031C YCR031C 14 14 1 YCR031C pep chromosome:R64-1-1:III:177500:178220:-1 gene:YCR031C transcript:YCR031C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS14A description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; required for ribos 1 14 14 1 14 14 12 14 14 12 14 14 12 14 14 12 1 1 0 1 1 1 76.6 76.6 5.1 14.536 137 137 0 130.46 76.6 76.6 71.5 76.6 76.6 75.2 11081000000 1810200000 1295300000 3847700000 1388500000 874450000 1864700000 2787500000 2427100000 2083100000 3344200000 2194400000 2035500000 26 24 19 27 24 20 140 162 108;1038;1359;2052;3878;3879;4054;4055;4885;4886;9428;10275;10482;11164 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 112;113;1086;1417;2129;4035;4036;4220;4221;5089;5090;9892;10774;10989;11698;11699 462;463;464;465;466;467;468;469;470;471;472;473;474;4338;4339;4340;4341;4342;4343;5460;5461;5462;5463;5464;5465;7827;7828;7829;7830;7831;7832;7833;7834;7835;7836;14744;14745;14746;14747;14748;14749;14750;14751;14752;14753;14754;14755;14756;14757;14758;14759;15411;15412;15413;15414;15415;15416;15417;15418;15419;15420;15421;15422;15423;15424;15425;15426;15427;18581;18582;18583;18584;18585;18586;18587;18588;18589;18590;18591;18592;18593;18594;18595;18596;18597;18598;18599;18600;18601;18602;18603;18604;18605;18606;18607;18608;18609;18610;18611;18612;18613;36146;36147;36148;36149;36150;39426;39427;39428;39429;39430;39431;39432;39433;39434;40174;40175;40176;40177;40178;40179;42958;42959;42960;42961;42962;42963;42964;42965;42966;42967;42968;42969;42970;42971;42972;42973 463;464;465;466;467;468;469;470;471;472;473;474;475;4360;4361;4362;4363;4364;4365;5495;5496;5497;5498;5499;5500;7869;7870;7871;7872;7873;7874;7875;7876;7877;7878;14846;14847;14848;14849;14850;14851;14852;14853;14854;14855;14856;14857;14858;14859;14860;14861;15519;15520;15521;15522;15523;15524;15525;15526;15527;15528;15529;15530;15531;15532;15533;15534;15535;18699;18700;18701;18702;18703;18704;18705;18706;18707;18708;18709;18710;18711;18712;18713;18714;18715;18716;18717;18718;18719;18720;18721;18722;18723;18724;18725;18726;18727;18728;18729;18730;18731;18732;18733;18734;36358;36359;36360;36361;36362;39662;39663;39664;39665;39666;39667;39668;39669;39670;40415;40416;40417;40418;40419;40420;43255;43256;43257;43258;43259;43260;43261;43262;43263;43264;43265;43266;43267;43268;43269;43270 466;4361;5498;7873;14850;14855;15521;15531;18704;18717;36362;39665;40415;43269 87 61 -1
YCR034W YCR034W 1 1 1 YCR034W pep chromosome:R64-1-1:III:190592:191635:1 gene:YCR034W transcript:YCR034W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Fatty acid elongase, involved in sphingolipid biosynthesis; acts on fatty acids of up to 24 ca 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 2.9 2.9 2.9 40.002 347 347 0 4.9842 2.9 0 2.9 2.9 2.9 0 58267000 20838000 0 18383000 11203000 7844100 0 0 0 0 0 25935000 0 1 0 1 1 1 0 4 163 11366 True 11903 43861;43862;43863;43864 44160;44161;44162;44163 44162 -1
YCR046C YCR046C 6 6 6 YCR046C pep chromosome:R64-1-1:III:209914:210423:-1 gene:YCR046C transcript:YCR046C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IMG1 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; required for respirati 1 6 6 6 3 4 2 3 1 3 3 4 2 3 1 3 3 4 2 3 1 3 36.1 36.1 36.1 19.393 169 169 0 15.316 19.5 23.7 13 23.7 6.5 23.1 64473000 11163000 8098600 17257000 6607700 1129000 20217000 16122000 14324000 12903000 13866000 0 18912000 3 4 2 2 1 3 15 164 3850;5665;8289;8407;8408;11415 True;True;True;True;True;True 4007;5904;8706;8828;8829;11952 14637;14638;14639;14640;14641;21735;21736;21737;31683;31684;31685;32084;32085;32086;32087;44090 14739;14740;14741;14742;14743;21864;21865;21866;31879;31880;31881;32280;32281;32282;32283;44389 14740;21864;31879;32280;32281;44389 -1
YCR047C YCR047C 3 3 3 YCR047C pep chromosome:R64-1-1:III:210718:211545:-1 gene:YCR047C transcript:YCR047C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BUD23 description:Methyltransferase that methylates residue G1575 of 18S rRNA; required for r 1 3 3 3 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 15.6 15.6 15.6 30.742 275 275 0 17.842 9.5 15.3 6.2 15.6 6.2 15.6 91286000 13985000 9457800 15675000 15591000 4792100 31785000 0 0 0 31696000 0 32162000 1 2 1 2 1 2 9 165 9538;10797;10798 True;True;True 10006;11316;11317 36578;36579;36580;36581;41558;41559;41560;41561;41562 36794;36795;36796;36797;41821;41822;41823;41824;41825 36794;41821;41823 -1
YCR052W YCR052W 2 2 2 YCR052W pep chromosome:R64-1-1:III:214994:216445:1 gene:YCR052W transcript:YCR052W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSC6 description:Component of the RSC chromatin remodeling complex; essential for mitotic grow 1 2 2 2 1 0 1 0 2 1 1 0 1 0 2 1 1 0 1 0 2 1 9.5 9.5 9.5 54.164 483 483 0 24.165 2.5 0 7 0 9.5 7 42668000 2372500 0 20440000 0 5808200 14047000 0 0 0 0 19204000 0 1 0 1 0 2 1 5 166 4925;11605 True;True 5131;12153 18758;18759;44863;44864;44865 18879;18880;45171;45172;45173 18879;45173 -1
YCR057C YCR057C 10 10 10 YCR057C pep chromosome:R64-1-1:III:220457:223228:-1 gene:YCR057C transcript:YCR057C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PWP2 description:Conserved 90S pre-ribosomal component; essential for proper endonucleolytic 1 10 10 10 6 3 9 4 3 4 6 3 9 4 3 4 6 3 9 4 3 4 9.8 9.8 9.8 103.98 923 923 0 26.248 6.9 3.5 8.8 4.3 3.3 4.3 148100000 20143000 11953000 80625000 10728000 4260500 20389000 30267000 27868000 29242000 21324000 20420000 27171000 5 3 8 4 3 4 27 167 2341;2632;3253;3518;4880;5711;6123;7726;7727;11548 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2425;2726;3370;3652;5084;5952;6374;8114;8115;12090 8904;9930;9931;9932;9933;9934;12304;12305;12306;12307;12308;13381;18572;21881;21882;21883;21884;21885;23501;23502;29646;29647;29648;44590;44591;44592;44593;44594;44595 8949;9981;9982;9983;9984;9985;12389;12390;12391;12392;12393;13470;18690;22011;22012;22013;22014;22015;23641;23642;29830;29831;29832;44896;44897;44898;44899;44900;44901 8949;9984;12392;13470;18690;22012;23641;29830;29831;44901 -1
YCR063W YCR063W 1 1 1 YCR063W pep chromosome:R64-1-1:III:228318:228791:1 gene:YCR063W transcript:YCR063W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BUD31 description:Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP; increases efficiency of fi 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 8.3 8.3 8.3 18.447 157 157 0.00081566 2.975 0 8.3 0 8.3 8.3 0 5912700 0 2397600 0 2385500 1129500 0 0 0 0 0 3734600 0 0 1 0 1 1 0 3 168 4229 True 4402 16067;16068;16069 16176;16177;16178 16176 -1
YCR071C YCR071C 2 2 2 YCR071C pep chromosome:R64-1-1:III:240103:240543:-1 gene:YCR071C transcript:YCR071C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IMG2 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; conserved in metazoa, 1 2 2 2 0 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 15.8 15.8 15.8 16.38 146 146 0.00082237 3.0479 0 0 15.8 0 8.2 0 14852000 0 0 13718000 0 1133900 0 0 0 8083200 0 0 0 0 0 2 0 1 0 3 169 7380;10128 True;True 7748;10621 28325;28326;38825 28502;28503;39060 28502;39060 -1
YCR072C YCR072C 1 1 1 YCR072C pep chromosome:R64-1-1:III:240805:242352:-1 gene:YCR072C transcript:YCR072C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSA4 description:WD-repeat protein involved in ribosome biogenesis; may interact with ribosom 1 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 2.1 2.1 2.1 57.025 515 515 0.00082988 3.1425 0 2.1 0 2.1 0 0 1820900 0 691940 0 1129000 0 0 0 0 0 2322500 0 0 0 1 0 1 0 0 2 170 7290 True 7653 27991;27992 28165;28166 28165 -1
YCR077C YCR077C 4 4 4 YCR077C pep chromosome:R64-1-1:III:250238:252628:-1 gene:YCR077C transcript:YCR077C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PAT1 description:Deadenylation-dependent mRNA-decapping factor; also required for faithful ch 1 4 4 4 1 1 0 0 2 0 1 1 0 0 2 0 1 1 0 0 2 0 6.9 6.9 6.9 88.51 796 796 0 15.649 1.1 1.4 0 0 4.4 0 10025000 2886400 1434100 0 0 5704800 0 0 0 0 0 18862000 0 1 1 0 0 2 0 4 171 4134;4690;8895;9484 True;True;True;True 4303;4887;9331;9950 15730;17822;33915;36367 15838;17937;34116;36580 15838;17937;34116;36580 -1
YCR087C-A YCR087C-A 1 1 1 YCR087C-A pep chromosome:R64-1-1:III:264006:264467:-1 gene:YCR087C-A transcript:YCR087C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein lo 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 7.2 7.2 7.2 17.738 153 153 0 9.0849 7.2 7.2 0 7.2 7.2 0 21905000 5843100 9671200 0 4113700 2277200 0 0 0 0 0 7529300 0 1 1 0 1 1 0 4 172 9343 True 9800 35831;35832;35833;35834 36039;36040;36041;36042 36040 -1
YCR088W YCR088W 5 5 5 YCR088W pep chromosome:R64-1-1:III:265068:266846:1 gene:YCR088W transcript:YCR088W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ABP1 description:Actin-binding protein of the cortical actin cytoskeleton; important for activ 1 5 5 5 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 11.1 11.1 11.1 65.575 592 592 0 16.138 2.7 5.1 4.7 4.7 4.1 4.7 44841000 3648400 4565000 23152000 3824800 704580 8945900 0 9902300 0 0 0 0 1 2 2 1 2 1 9 173 473;784;3293;4136;4667 True;True;True;True;True 500;825;3413;4305;4864 2053;2054;2055;3268;3269;3270;12470;12471;12472;15734;17755 2059;2060;2061;3279;3280;3281;12556;12557;12558;15842;17870 2060;3279;12557;15842;17870 -1
YCR093W YCR093W 20 20 20 YCR093W pep chromosome:R64-1-1:III:280117:286443:1 gene:YCR093W transcript:YCR093W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC39 description:Subunit of the CCR4-NOT1 core complex; this complex has multiple roles in th 1 20 20 20 8 7 11 11 7 6 8 7 11 11 7 6 8 7 11 11 7 6 13.6 13.6 13.6 240.28 2108 2108 0 50.945 6 4.8 7.2 7.7 5.3 4.9 334070000 62687000 19148000 139750000 36353000 19305000 56825000 72908000 51267000 81250000 56409000 63278000 76085000 8 6 10 11 7 5 47 174 880;1869;2333;3389;3396;4139;4148;5692;6016;6211;7263;7920;7956;8182;8461;9267;9477;9735;10929;11235 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 923;1940;2417;3514;3521;4308;4317;5933;6267;6468;7612;8320;8359;8593;8883;9721;9943;10211;11451;11772 3649;3650;3651;7287;8879;8880;12855;12856;12857;12891;15738;15739;15740;15760;21835;21836;21837;21838;23069;23817;27833;27834;27835;30369;30370;30371;30372;30526;31289;31290;31291;31292;32264;32265;32266;32267;32268;32269;35509;35510;35511;35512;36341;36342;36343;36344;36345;37310;41995;43290 3662;3663;3664;7328;8924;8925;12942;12943;12944;12978;15846;15847;15848;15868;21965;21966;21967;21968;23205;23959;28006;28007;28008;30558;30559;30560;30561;30716;31484;31485;31486;31487;32460;32461;32462;32463;32464;32465;35717;35718;35719;35720;36554;36555;36556;36557;36558;37532;42259;43588 3662;7328;8925;12943;12978;15848;15868;21965;23205;23959;28008;30559;30716;31487;32461;35717;36557;37532;42259;43588 -1
YCR095C YCR095C 1 1 1 YCR095C pep chromosome:R64-1-1:III:288170:289258:-1 gene:YCR095C transcript:YCR095C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OCA4 description:Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus; S. cerev 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3 3 3 41.647 362 362 0.00082305 3.0566 3 3 0 3 3 0 7582900 2886200 2563600 0 1350700 782360 0 0 0 0 0 2586700 0 1 1 0 1 1 0 4 175 6307 True 6568 24123;24124;24125;24126 24268;24269;24270;24271 24269 -1
YDL003W YDL003W 15 15 15 YDL003W pep chromosome:R64-1-1:IV:444683:446383:1 gene:YDL003W transcript:YDL003W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MCD1 description:Essential alpha-kleisin subunit of the cohesin complex; required for sister ch 1 15 15 15 0 0 0 10 12 3 0 0 0 10 12 3 0 0 0 10 12 3 31.8 31.8 31.8 63.289 566 566 0 65.715 0 0 0 20.5 26 6.5 210250000 0 0 0 77809000 70156000 62281000 0 0 0 151810000 219240000 83254000 0 0 0 10 12 3 25 176 1883;2635;3339;5388;5389;6968;7436;7437;8084;9406;9407;9476;10543;10563;11476 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1954;2729;3461;5616;5617;7257;7806;7807;8490;9870;9871;9942;11050;11071;12015 7318;9944;12642;20646;20647;20648;26646;28555;28556;28557;28558;30979;30980;36083;36084;36085;36086;36087;36339;36340;40385;40386;40387;40465;44315 7359;9995;12728;20773;20774;20775;26806;28733;28734;28735;28736;31171;31172;36294;36295;36296;36297;36298;36552;36553;40626;40627;40628;40708;44621 7359;9995;12728;20773;20774;26806;28733;28735;31172;36296;36297;36553;40628;40708;44621 88;89 196;373 -1
YDL007W YDL007W 12 12 12 YDL007W pep chromosome:R64-1-1:IV:438047:439360:1 gene:YDL007W transcript:YDL007W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPT2 description:ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome; one of six ATPase 1 12 12 12 6 8 5 4 5 5 6 8 5 4 5 5 6 8 5 4 5 5 37.5 37.5 37.5 48.828 437 437 0 45.254 19.5 29.5 18.5 17.4 19.5 15.8 264330000 31540000 37738000 118140000 16840000 11215000 48859000 45719000 54191000 55272000 59197000 43978000 54894000 6 8 5 4 5 5 33 177 899;2002;2965;3922;4201;4306;4804;7629;10426;10795;10796;12128 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 942;2077;3071;4081;4373;4482;5005;8010;10929;11314;11315;12692 3716;3717;3718;3719;3720;3721;7646;11230;14926;15976;15977;15978;15979;16356;18267;18268;18269;18270;29263;39954;39955;39956;39957;39958;39959;41551;41552;41553;41554;41555;41556;41557;46978 3729;3730;3731;3732;3733;3734;3735;7688;11307;15030;16085;16086;16087;16088;16465;18384;18385;18386;18387;29446;40191;40192;40193;40194;40195;40196;41814;41815;41816;41817;41818;41819;41820;47305 3733;7688;11307;15030;16088;16465;18387;29446;40194;41814;41817;47305 -1
YDL014W YDL014W 21 21 21 YDL014W pep chromosome:R64-1-1:IV:427364:428347:1 gene:YDL014W transcript:YDL014W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP1 description:Histone glutamine methyltransferase, modifies H2A at Q105 in nucleolus; compon 1 21 21 21 18 18 19 19 20 18 18 18 19 19 20 18 18 18 19 19 20 18 65.1 65.1 65.1 34.465 327 327 0 140.37 60.6 62.1 60.6 65.1 65.1 58.4 21117000000 3474000000 1660400000 8118800000 1988500000 1527700000 4347600000 6397500000 2467500000 5012600000 3032100000 3886600000 4688200000 42 37 46 41 39 43 248 178 603;1168;1379;1852;3067;3481;4101;4226;4227;4697;4698;5292;5453;5454;7169;7728;7729;9148;9149;11343;11663 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 637;1219;1437;1921;1922;3176;3615;4267;4268;4399;4400;4894;4895;5513;5687;5688;5689;5690;7497;7498;7499;8116;8117;8118;8119;9596;9597;9598;9599;11880;12212 2569;2570;2571;2572;2573;2574;2575;2576;2577;2578;2579;4762;4763;4764;4765;4766;4767;4768;4769;4770;4771;4772;5525;5526;5527;5528;5529;7233;7234;7235;7236;11599;11600;11601;11602;11603;11604;11605;11606;11607;11608;11609;13257;13258;13259;15605;15606;15607;15608;15609;15610;15611;15612;15613;15614;15615;15616;16041;16042;16043;16044;16045;16046;16047;16048;16049;16050;16051;16052;16053;16054;16055;16056;16057;16058;16059;16060;16061;16062;16063;16064;16065;17845;17846;17847;17848;17849;17850;17851;17852;17853;17854;17855;17856;17857;20207;20208;20209;20210;20211;20212;20213;20214;20215;20216;20217;20218;20219;20220;20959;20960;20961;20962;20963;20964;20965;20966;20967;20968;20969;20970;20971;20972;20973;20974;20975;20976;20977;20978;20979;20980;20981;20982;20983;20984;20985;20986;20987;20988;20989;20990;20991;20992;20993;20994;20995;20996;20997;20998;20999;21000;21001;27454;27455;27456;27457;27458;27459;27460;27461;27462;27463;27464;27465;27466;27467;27468;27469;27470;27471;27472;27473;27474;27475;27476;27477;27478;27479;27480;27481;27482;27483;27484;27485;27486;29649;29650;29651;29652;29653;29654;29655;29656;29657;29658;29659;29660;29661;29662;29663;29664;29665;29666;29667;29668;29669;29670;29671;35018;35019;35020;35021;35022;35023;35024;35025;35026;35027;35028;35029;35030;35031;35032;35033;35034;35035;35036;35037;35038;43738;43739;43740;43741;43742;43743;43744;43745;43746;43747;43748;43749;43750;43751;43752;43753;43754;45093;45094;45095;45096;45097 2576;2577;2578;2579;2580;2581;2582;2583;2584;2585;2586;4788;4789;4790;4791;4792;4793;4794;4795;4796;4797;4798;5560;5561;5562;5563;5564;7273;7274;7275;7276;11681;11682;11683;11684;11685;11686;11687;11688;11689;11690;11691;13346;13347;13348;15713;15714;15715;15716;15717;15718;15719;15720;15721;15722;15723;15724;16150;16151;16152;16153;16154;16155;16156;16157;16158;16159;16160;16161;16162;16163;16164;16165;16166;16167;16168;16169;16170;16171;16172;16173;16174;17960;17961;17962;17963;17964;17965;17966;17967;17968;17969;17970;17971;17972;17973;20331;20332;20333;20334;20335;20336;20337;20338;20339;20340;20341;20342;20343;20344;21086;21087;21088;21089;21090;21091;21092;21093;21094;21095;21096;21097;21098;21099;21100;21101;21102;21103;21104;21105;21106;21107;21108;21109;21110;21111;21112;21113;21114;21115;21116;21117;21118;21119;21120;21121;21122;21123;21124;21125;21126;21127;21128;27623;27624;27625;27626;27627;27628;27629;27630;27631;27632;27633;27634;27635;27636;27637;27638;27639;27640;27641;27642;27643;27644;27645;27646;27647;27648;27649;27650;27651;27652;27653;27654;27655;27656;27657;27658;29833;29834;29835;29836;29837;29838;29839;29840;29841;29842;29843;29844;29845;29846;29847;29848;29849;29850;29851;29852;29853;29854;29855;35226;35227;35228;35229;35230;35231;35232;35233;35234;35235;35236;35237;35238;35239;35240;35241;35242;35243;35244;35245;35246;44037;44038;44039;44040;44041;44042;44043;44044;44045;44046;44047;44048;44049;44050;44051;44052;44053;45404;45405;45406;45407;45408 2585;4791;5563;7273;11682;13347;15722;16159;16163;17962;17963;20335;21086;21117;27639;29836;29847;35228;35238;44042;45407 90;91;92;93;94;95 111;156;210;232;236;259 -1
YDL015C YDL015C 2 2 2 YDL015C pep chromosome:R64-1-1:IV:426002:426934:-1 gene:YDL015C transcript:YDL015C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TSC13 description:Enoyl reductase; catalyzes last step in each cycle of very long chain fatty 1 2 2 2 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 5.8 5.8 5.8 36.767 310 310 0.0015736 2.6276 5.8 3.2 0 0 0 0 9278400 5735000 3543400 0 0 0 0 7490900 0 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 3 179 174;4592 True;True 181;4788 746;17521;17522 747;17636;17637 747;17636 -1
YDL019C YDL019C 6 6 6 YDL019C pep chromosome:R64-1-1:IV:417663:421514:-1 gene:YDL019C transcript:YDL019C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OSH2 description:Member of an oxysterol-binding protein family with seven members; in S. cerev 1 6 6 6 3 3 2 0 0 0 3 3 2 0 0 0 3 3 2 0 0 0 4.9 4.9 4.9 145.79 1283 1283 0 8.7445 2.5 2.4 1.7 0 0 0 16058000 8437200 5027800 2593100 0 0 0 11020000 0 0 0 0 0 3 2 2 0 0 0 7 180 1679;3526;4664;8819;9254;11857 True;True;True;True;True;True 1744;3662;4861;9251;9708;12416 6617;13428;17752;33645;33646;33647;35487;45844 6653;13517;17867;33845;33846;33847;35695;46160 6653;13517;17867;33845;35695;46160 -1
YDL022W YDL022W 4 4 4 YDL022W pep chromosome:R64-1-1:IV:411825:413000:1 gene:YDL022W transcript:YDL022W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GPD1 description:NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase; key enzyme of glycerol synth 1 4 4 4 1 0 2 0 1 2 1 0 2 0 1 2 1 0 2 0 1 2 18.9 18.9 18.9 42.868 391 391 0 8.3214 9.7 0 4.6 0 4.6 7.2 49628000 14446000 0 21615000 0 2275300 11291000 0 0 0 0 0 11291000 1 0 2 0 1 2 6 181 2289;8658;11023;12149 True;True;True;True 2371;9083;11550;12713 8718;8719;32985;32986;42430;47034 8763;8764;33183;33184;42725;47361 8763;33183;42725;47361 -1
YDL029W YDL029W 6 6 6 YDL029W pep chromosome:R64-1-1:IV:399340:400638:1 gene:YDL029W transcript:YDL029W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARP2 description:Essential component of the Arp2/3 complex; Arp2/3 is a highly conserved actin 1 6 6 6 3 3 4 1 3 3 3 3 4 1 3 3 3 3 4 1 3 3 23.5 23.5 23.5 44.073 391 391 0 25.789 12 10.2 15.3 5.1 13.3 10.2 142360000 17111000 10485000 75352000 5835100 8852600 24721000 22996000 24985000 40107000 0 29007000 26391000 4 3 4 1 4 3 19 182 228;391;2025;3601;4338;7049 True;True;True;True;True;True 239;416;2102;3744;4515;7345 978;979;980;981;982;983;1708;7723;7724;13757;13758;13759;16462;16463;16464;16465;26932;26933 980;981;982;983;984;985;1712;7765;7766;13848;13849;13850;16571;16572;16573;16574;16575;27094;27095 984;1712;7766;13850;16572;27095 96 1 -1
YDL030W YDL030W 1 1 1 YDL030W pep chromosome:R64-1-1:IV:397537:399129:1 gene:YDL030W transcript:YDL030W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRP9 description:Subunit of the SF3a splicing factor complex; required for spliceosome assembly 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 3 3 3 63.029 530 530 0 3.7492 0 0 0 0 3 0 2171900 0 0 0 0 2171900 0 0 0 0 0 7180900 0 0 0 0 0 1 0 1 183 9268 True 9722 35513 35721 35721 -1
YDL031W YDL031W 16 16 16 YDL031W pep chromosome:R64-1-1:IV:394217:397204:1 gene:YDL031W transcript:YDL031W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DBP10 description:Putative ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box protein family; constitue 1 16 16 16 5 5 8 6 6 10 5 5 8 6 6 10 5 5 8 6 6 10 21.7 21.7 21.7 112.94 995 995 0 51.342 5.6 5.7 12.1 9.4 8.9 13.8 349120000 31527000 19121000 133510000 27359000 13997000 123600000 63261000 63119000 59105000 61672000 61910000 78422000 5 5 8 6 6 10 40 184 255;551;930;2023;3297;3374;3465;4823;4940;5663;7310;7610;7688;8902;10553;12057 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 266;582;973;2100;3417;3498;3596;5025;5146;5902;7674;7990;8074;9338;11061;12620 1111;2407;2408;2409;3863;3864;3865;3866;7719;7720;12492;12493;12788;12789;13182;13183;18333;18334;18335;18336;18337;18808;21732;28044;28045;28046;29196;29197;29474;29475;33929;33930;33931;33932;33933;40417;40418;40419;46696;46697 1113;2414;2415;2416;3878;3879;3880;3881;7761;7762;12578;12579;12875;12876;13271;13272;18450;18451;18452;18453;18454;18929;21861;28218;28219;28220;29379;29380;29658;29659;34130;34131;34132;34133;34134;40658;40659;40660;47019;47020 1113;2415;3878;7761;12579;12876;13272;18450;18929;21861;28219;29380;29658;34131;40658;47019 97 500 -1
YDL035C YDL035C 1 1 1 YDL035C pep chromosome:R64-1-1:IV:389172:392057:-1 gene:YDL035C transcript:YDL035C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GPR1 description:Plasma membrane G protein coupled receptor (GPCR); interacts with the heterot 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1.5 1.5 1.5 110.71 961 961 1 -2 0 0 0 0 1.5 0 23690000 0 0 0 0 23690000 0 0 0 0 0 78328000 0 0 0 0 0 1 0 1 + 185 7133 True 7447 27267 27432 27432 98 1 -1
YDL040C YDL040C 38 38 38 YDL040C pep chromosome:R64-1-1:IV:378874:381438:-1 gene:YDL040C transcript:YDL040C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NAT1 description:Subunit of protein N-terminal acetyltransferase NatA; NatA comprised of Nat1p 1 38 38 38 25 20 27 26 23 25 25 20 27 26 23 25 25 20 27 26 23 25 49.3 49.3 49.3 98.904 854 854 0 205.06 38.3 27.9 38.1 36.7 34.7 35.5 2685200000 353290000 168740000 1204700000 304620000 174350000 479430000 499180000 389170000 606860000 565110000 548020000 609010000 28 24 34 30 24 26 166 186 68;587;589;639;652;714;1006;1093;1162;1265;1266;1598;1920;1921;2047;2113;2277;3109;3419;3599;3608;4606;5161;5165;5505;5611;5698;6129;6586;6981;6982;8235;8327;9759;11781;12090;12263;12378 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 70;619;621;676;690;754;1052;1053;1143;1213;1316;1317;1661;1993;1994;2124;2193;2359;3218;3545;3742;3751;4802;5373;5377;5741;5848;5939;6380;6863;7270;7271;8650;8744;10235;12340;12653;12834;12953 275;276;277;278;279;280;281;282;283;2535;2539;2540;2541;2542;2543;2699;2700;2701;2746;2747;2748;2749;2750;2751;2954;2955;2956;2957;4201;4202;4203;4204;4205;4206;4207;4512;4513;4733;4734;4735;4736;4737;4738;4739;4740;4741;4742;5082;5083;5084;5085;5086;5087;5088;5089;5090;5091;5092;6342;7406;7407;7408;7409;7410;7411;7412;7413;7414;7415;7416;7805;7806;7807;7808;7809;7810;7811;8055;8056;8057;8682;8683;8684;8685;11763;11764;11765;11766;11767;11768;12981;12982;12983;12984;12985;12986;12987;13752;13753;13754;13755;13777;13778;13779;13780;13781;13782;13783;13784;17569;17570;19721;19722;19736;19737;19738;19739;19740;19741;21191;21192;21193;21194;21195;21558;21559;21846;23513;23514;23515;23516;23517;23518;23519;23520;23521;23522;23523;25168;25169;25170;25171;25172;26689;26690;26691;26692;26693;31489;31810;37390;37391;37392;37393;37394;37395;45635;45636;46808;47440;47441;47442;47443;47444;47445;47894;47895;47896;47897 276;277;278;279;280;281;282;283;284;2542;2546;2547;2548;2549;2550;2707;2708;2709;2755;2756;2757;2758;2759;2760;2964;2965;2966;2967;4221;4222;4223;4224;4225;4226;4227;4537;4538;4759;4760;4761;4762;4763;4764;4765;4766;4767;4768;5111;5112;5113;5114;5115;5116;5117;5118;5119;5120;5121;6378;7447;7448;7449;7450;7451;7452;7453;7454;7455;7456;7457;7847;7848;7849;7850;7851;7852;7853;8097;8098;8099;8727;8728;8729;8730;11846;11847;11848;11849;11850;11851;13068;13069;13070;13071;13072;13073;13074;13843;13844;13845;13846;13868;13869;13870;13871;13872;13873;13874;13875;17684;17685;19844;19845;19859;19860;19861;19862;19863;19864;21318;21319;21320;21321;21322;21685;21686;21976;23653;23654;23655;23656;23657;23658;23659;23660;23661;23662;23663;25318;25319;25320;25321;25322;26850;26851;26852;26853;26854;31685;32006;37612;37613;37614;37615;37616;37617;45950;45951;47133;47771;47772;47773;47774;47775;47776;48226;48227;48228;48229 280;2542;2548;2707;2760;2965;4223;4538;4766;5111;5119;6378;7448;7452;7847;8097;8730;11849;13069;13844;13868;17684;19845;19862;21322;21686;21976;23658;25318;26850;26853;31685;32006;37616;45950;47133;47775;48228 99 591 -1
YDL044C YDL044C 1 1 1 YDL044C pep chromosome:R64-1-1:IV:373967:375289:-1 gene:YDL044C transcript:YDL044C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MTF2 description:Mitochondrial protein that interacts with mitochondrial RNA polymerase; inter 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 3.9 3.9 3.9 51.192 440 440 0.0086331 1.7716 0 0 3.9 0 0 0 5139300 0 0 5139300 0 0 0 0 0 3028300 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 187 12259 True 12830 47413 47744 47744 -1
YDL051W YDL051W 5 5 5 YDL051W pep chromosome:R64-1-1:IV:363952:364779:1 gene:YDL051W transcript:YDL051W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LHP1 description:RNA binding protein required for maturation of tRNA and U6 snRNA; acts as a mo 1 5 5 5 2 2 3 3 3 1 2 2 3 3 3 1 2 2 3 3 3 1 28.4 28.4 28.4 32.104 275 275 0 15.113 8.4 8.4 12.4 12 17.1 3.6 64681000 6889500 10895000 17696000 19753000 5879200 3568400 10031000 26284000 11192000 34690000 20935000 0 2 2 3 3 3 1 14 188 5799;8577;8638;8843;10294 True;True;True;True;True 6041;9001;9062;9276;10794 22220;22221;22222;22223;22224;32699;32907;32908;32909;32910;33738;33739;33740;39510 22350;22351;22352;22353;22354;32896;33104;33105;33106;33107;33939;33940;33941;39746 22350;32896;33105;33941;39746 100 128 -1
YDL052C YDL052C 4 4 4 YDL052C pep chromosome:R64-1-1:IV:362672:363583:-1 gene:YDL052C transcript:YDL052C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SLC1 description:1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase; catalyzes the acylation of ly 1 4 4 4 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 3 2 21.5 21.5 21.5 33.887 303 303 0 11.037 9.2 9.2 9.2 9.2 17.5 9.9 120930000 16537000 30321000 29699000 16200000 9526200 18650000 28870000 61724000 19283000 34529000 25287000 0 2 3 2 2 3 2 14 189 582;4221;4328;4503 True;True;True;True 614;4394;4505;4696 2522;2523;2524;2525;2526;16032;16435;17151;17152;17153;17154;17155;17156;17157 2529;2530;2531;2532;2533;16141;16544;17265;17266;17267;17268;17269;17270;17271 2533;16141;16544;17271 -1
YDL053C YDL053C 6 6 6 YDL053C pep chromosome:R64-1-1:IV:361699:362256:-1 gene:YDL053C transcript:YDL053C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PBP4 description:Pbp1p binding protein; interacts strongly with Pab1p-binding protein 1 (Pbp1p 1 6 6 6 5 1 1 1 1 0 5 1 1 1 1 0 5 1 1 1 1 0 44.3 44.3 44.3 19.881 185 185 0 29.05 37.8 7.6 6.5 7.6 5.4 0 33595000 22212000 2600400 4184700 2110500 2486800 0 29013000 0 0 0 0 0 5 1 1 1 1 0 9 190 871;4990;5755;8425;10170;11540 True;True;True;True;True;True 914;5196;5996;8846;10666;12082 3619;18988;22031;22032;32137;39026;44560;44561;44562 3632;19110;22161;22162;32333;39261;44866;44867;44868 3632;19110;22162;32333;39261;44868 -1
YDL055C YDL055C 10 10 10 YDL055C pep chromosome:R64-1-1:IV:355674:356759:-1 gene:YDL055C transcript:YDL055C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PSA1 description:GDP-mannose pyrophosphorylase (mannose-1-phosphate guanyltransferase); synthe 1 10 10 10 5 5 7 6 5 6 5 5 7 6 5 6 5 5 7 6 5 6 39.9 39.9 39.9 39.565 361 361 0 81.856 20.5 20.2 26.9 21.9 20.5 29.9 612930000 50588000 69058000 242660000 41949000 31594000 177080000 97533000 152190000 154620000 105970000 111260000 105120000 5 6 8 7 6 7 39 191 2714;3136;4044;4417;5164;5475;5569;9709;9828;12021 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2808;3247;4209;4604;5376;5711;5806;10183;10309;12584 10240;11885;11886;11887;11888;11889;15359;15360;15361;15362;15363;15364;15365;16789;19726;19727;19728;19729;19730;19731;19732;19733;19734;19735;21093;21403;37194;37195;37196;37197;37198;37712;37713;37714;37715;37716;46559;46560;46561 10294;11969;11970;11971;11972;11973;15467;15468;15469;15470;15471;15472;15473;16901;19849;19850;19851;19852;19853;19854;19855;19856;19857;19858;21220;21530;37413;37414;37415;37416;37417;37941;37942;37943;37944;37945;46880;46881;46882 10294;11970;15471;16901;19853;21220;21530;37414;37942;46880 101 189 -1
YDL060W YDL060W 5 5 5 YDL060W pep chromosome:R64-1-1:IV:341619:343985:1 gene:YDL060W transcript:YDL060W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TSR1 description:Protein required for processing of 20S pre-rRNA in the cytoplasm; associates w 1 5 5 5 3 3 2 3 2 1 3 3 2 3 2 1 3 3 2 3 2 1 12.3 12.3 12.3 90.746 788 788 0 19.53 6.7 5.6 4.6 8.6 3.4 2.2 97809000 21921000 10458000 33577000 15746000 5340500 10766000 0 21152000 0 27493000 24089000 0 4 3 2 3 1 1 14 192 2439;4181;6875;7539;11914 True;True;True;True;True 2524;4352;7163;7917;12477 9255;15914;15915;15916;26270;26271;26272;26273;26274;26275;28943;28944;28945;46105;46106 9302;16023;16024;16025;26428;26429;26430;26431;26432;26433;29126;29127;29128;46422;46423 9302;16023;26431;29127;46423 -1
YDL061C YDL061C 2 1 1 YDL061C pep chromosome:R64-1-1:IV:340628:340798:-1 gene:YDL061C transcript:YDL061C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS29B description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mamma 1 2 1 1 1 0 1 1 2 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 37.5 17.9 17.9 6.7276 56 56 0.006555 1.8632 17.9 0 19.6 19.6 37.5 19.6 10076000 6113800 0 0 0 3962000 0 0 0 0 0 13100000 0 1 0 0 0 0 0 1 193 283;10864 False;True 296;11384 1225;1226;1227;1228;41783;41784 1227;1228;1229;1230;42046;42047 1227;42046 -1
YDL066W;YNL009W YDL066W 8;1 8;1 8;1 YDL066W pep chromosome:R64-1-1:IV:334835:336121:1 gene:YDL066W transcript:YDL066W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IDP1 description:Mitochondrial NADP-specific isocitrate dehydrogenase; catalyzes the oxidation 2 8 8 8 3 2 3 2 2 2 3 2 3 2 2 2 3 2 3 2 2 2 25 25 25 48.19 428 428;420 0 18.086 9.3 7.5 8.2 6.3 8.6 6.3 74212000 14547000 8987900 20939000 9287400 8024900 12426000 0 0 9867900 0 0 14896000 3 2 3 2 2 2 14 194 1260;2148;5988;6394;7556;8744;11190;11773 True;True;True;True;True;True;True;True 1311;2228;6239;6660;7934;9172;11725;12332 5069;8210;22966;22967;24413;28987;28988;28989;28990;28991;33363;33364;43095;45611 5097;8252;23101;23102;24561;29170;29171;29172;29173;29174;33563;33564;43392;45925 5097;8252;23101;24561;29171;33564;43392;45925 102 390 -1;-1
YDL074C YDL074C 7 7 7 YDL074C pep chromosome:R64-1-1:IV:324047:326149:-1 gene:YDL074C transcript:YDL074C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BRE1 description:E3 ubiquitin ligase; forms heterodimer with Rad6p to regulate K63 polyubiquit 1 7 7 7 1 2 1 2 3 3 1 2 1 2 3 3 1 2 1 2 3 3 10.7 10.7 10.7 80.691 700 700 0 13.71 1.7 2.7 2.4 2.6 4.4 4.1 50113000 3905100 3736900 6706800 25509000 4446200 5809900 0 8992900 0 0 0 4922800 1 1 1 2 3 2 10 195 197;3751;4109;6361;9376;9641;9903 True;True;True;True;True;True;True 207;3899;4276;6627;9837;10113;10390 856;857;14262;15644;15645;15646;15647;24285;35961;35962;36954;38026 858;859;14360;15752;15753;15754;15755;24433;36171;36172;37173;38257 858;14360;15755;24433;36172;37173;38257 -1
YDL075W YDL075W 12 1 1 YDL075W pep chromosome:R64-1-1:IV:322226:322988:1 gene:YDL075W transcript:YDL075W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL31A description:Ribosomal 60S subunit protein L31A; associates with karyopherin Sxm1p; loss 1 12 1 1 5 7 8 8 7 6 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 72.6 8 8 12.953 113 113 0.0015528 2.5082 46.9 53.1 62.8 63.7 60.2 46.9 435600000 73548000 24783000 192420000 0 41535000 103310000 90991000 0 121450000 0 85061000 0 2 1 2 0 3 1 9 196 248;2111;2112;3164;5531;5532;5891;5892;5896;7396;8555;8575 False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False 259;2191;2192;3276;5768;5769;6136;6137;6141;6142;7765;8979;8999 1088;1089;1090;8047;8048;8049;8050;8051;8052;8053;8054;11968;11969;21290;21291;21292;21293;21294;21295;21296;21297;21298;21299;21300;21301;21302;22580;22581;22582;22583;22584;22591;22592;22593;22594;22595;22596;22597;22598;22599;28375;28376;28377;28378;28379;32629;32630;32697 1090;1091;1092;8089;8090;8091;8092;8093;8094;8095;8096;12053;12054;21417;21418;21419;21420;21421;21422;21423;21424;21425;21426;21427;21428;21429;22715;22716;22717;22718;22719;22726;22727;22728;22729;22730;22731;22732;22733;22734;28552;28553;28554;28555;28556;32825;32826;32894 1091;8090;8094;12054;21421;21425;22715;22719;22729;28552;32826;32894 103 44 -1
YDL078C YDL078C 13 13 13 YDL078C pep chromosome:R64-1-1:IV:315357:316388:-1 gene:YDL078C transcript:YDL078C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MDH3 description:Peroxisomal malate dehydrogenase; catalyzes interconversion of malate and oxa 1 13 13 13 7 8 4 7 6 4 7 8 4 7 6 4 7 8 4 7 6 4 52.2 52.2 52.2 37.186 343 343 0 40.611 33.2 32.9 17.2 33.5 26.8 20.1 171100000 41746000 27437000 40723000 21932000 12213000 27049000 44365000 50360000 34163000 42662000 45373000 33660000 7 8 4 7 6 4 36 197 144;736;1615;2391;4387;6698;6699;7506;8897;8900;9342;11437;11613 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 150;777;1678;2476;4566;6978;6979;7883;9333;9336;9799;11974;12162 626;627;628;629;630;3057;3058;3059;3060;6394;9086;9087;9088;16657;16658;16659;16660;16661;16662;25549;25550;25551;25552;28832;28833;33918;33919;33920;33921;33924;35830;44162;44163;44164;44165;44882 627;628;629;630;631;3068;3069;3070;3071;6430;9132;9133;9134;16768;16769;16770;16771;16772;16773;25703;25704;25705;25706;29013;29014;34119;34120;34121;34122;34125;36038;44467;44468;44469;44470;45190 628;3070;6430;9132;16772;25704;25706;29013;34121;34125;36038;44470;45190 104 162 -1
YDL081C YDL081C 3 3 3 YDL081C pep chromosome:R64-1-1:IV:309802:310122:-1 gene:YDL081C transcript:YDL081C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPP1A description:Ribosomal stalk protein P1 alpha; involved in the interaction between transl 1 3 3 3 1 1 2 2 1 0 1 1 2 2 1 0 1 1 2 2 1 0 50.9 50.9 50.9 10.908 106 106 0 30.812 20.8 22.6 28.3 43.4 22.6 0 400100000 67202000 13095000 228780000 88370000 2650400 0 0 0 0 181790000 0 0 1 1 2 2 1 0 7 198 453;6308;9686 True;True;True 480;6569;10159 1979;24127;24128;24129;37114;37115;37116 1985;24272;24273;24274;37333;37334;37335 1985;24272;37335 -1
YDL082W YDL082W 15 1 1 YDL082W pep chromosome:R64-1-1:IV:308424:309388:1 gene:YDL082W transcript:YDL082W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL13A description:Ribosomal 60S subunit protein L13A; not essential for viability; homologous 1 15 1 1 13 11 11 13 11 14 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.8 14.6 14.6 22.554 199 199 0 9.9483 47.7 46.7 50.8 56.8 50.3 54.8 549000000 126170000 63014000 89731000 93008000 55278000 121800000 172070000 130890000 52868000 179920000 190660000 123850000 2 2 2 2 2 2 12 199 40;659;951;1760;2931;3771;7487;7806;8028;10196;10197;11063;11064;11192;11193 False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;False;False;False 42;697;996;1827;3036;3920;7863;8205;8433;10692;10693;11590;11591;11727;11728 168;169;170;171;172;2764;2765;2766;2767;2768;2769;3977;3978;3979;3980;3981;6946;6947;6948;6949;6950;11111;11112;11113;11114;14345;14346;14347;14348;28759;28760;28761;28762;28763;28764;28765;28766;28767;28768;28769;28770;29999;30000;30001;30002;30003;30004;30789;30790;30791;30792;30793;30794;39121;39122;39123;39124;39125;39126;39127;39128;39129;39130;39131;39132;39133;39134;39135;39136;39137;39138;42563;42564;42565;42566;42567;42568;42569;43099;43100;43101;43102;43103;43104;43105;43106;43107;43108;43109;43110 168;169;170;171;172;2773;2774;2775;2776;2777;2778;3992;3993;3994;3995;3996;6986;6987;6988;6989;6990;11188;11189;11190;11191;14444;14445;14446;14447;28939;28940;28941;28942;28943;28944;28945;28946;28947;28948;28949;28950;30186;30187;30188;30189;30190;30191;30979;30980;30981;30982;30983;30984;39356;39357;39358;39359;39360;39361;39362;39363;39364;39365;39366;39367;39368;39369;39370;39371;39372;39373;42858;42859;42860;42861;42862;42863;42864;43396;43397;43398;43399;43400;43401;43402;43403;43404;43405;43406;43407 169;2776;3993;6989;11189;14446;28945;30190;30980;39362;39369;42858;42864;43397;43402 -1
YMR143W;YDL083C YMR143W;YDL083C 17;17 17;17 17;17 YMR143W pep chromosome:R64-1-1:XIII:551928:552903:1 gene:YMR143W transcript:YMR143W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS16A description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mamm 2 17 17 17 10 12 11 10 11 10 10 12 11 10 11 10 10 12 11 10 11 10 80.4 80.4 80.4 15.847 143 143;143 0 74.132 65.7 67.8 58.7 65.7 60.1 51.7 7403900000 1217100000 604860000 2949900000 666540000 433670000 1531800000 2029300000 1375700000 1658900000 1283500000 1252700000 1364800000 13 15 18 13 15 15 89 200 201;2401;2402;2631;3133;3175;4945;5298;8728;8739;10344;11371;11573;11731;11732;12333;12334 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 211;2486;2487;2725;3244;3288;5151;5519;9155;9167;10844;11908;12119;12288;12289;12906;12907 869;870;871;9113;9114;9115;9116;9117;9118;9119;9120;9121;9122;9123;9124;9125;9126;9127;9128;9129;9130;9926;9927;9928;9929;11875;11876;11877;11878;11879;12000;12001;12002;12003;18816;20232;33295;33345;33346;33347;39682;39683;39684;39685;39686;43884;43885;43886;43887;43888;43889;43890;43891;43892;43893;44713;44714;44715;44716;44717;44718;44719;44720;44721;44722;44723;45422;45423;45424;45425;45426;45427;45428;45429;47711;47712;47713;47714;47715;47716;47717;47718;47719;47720;47721;47722;47723;47724;47725;47726;47727 871;872;873;9160;9161;9162;9163;9164;9165;9166;9167;9168;9169;9170;9171;9172;9173;9174;9175;9176;9177;9977;9978;9979;9980;11959;11960;11961;11962;11963;12085;12086;12087;12088;18937;20356;33494;33545;33546;33547;39919;39920;39921;39922;39923;44183;44184;44185;44186;44187;44188;44189;44190;44191;44192;45019;45020;45021;45022;45023;45024;45025;45026;45027;45028;45029;45736;45737;45738;45739;45740;45741;45742;45743;48043;48044;48045;48046;48047;48048;48049;48050;48051;48052;48053;48054;48055;48056;48057;48058;48059 872;9164;9173;9977;11963;12087;18937;20356;33494;33545;39921;44186;45024;45737;45742;48046;48056 -1;-1
YDL084W YDL084W 18 18 18 YDL084W pep chromosome:R64-1-1:IV:305237:306577:1 gene:YDL084W transcript:YDL084W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SUB2 description:Component of the TREX complex required for nuclear mRNA export; member of the 1 18 18 18 10 11 9 11 9 10 10 11 9 11 9 10 10 11 9 11 9 10 48.4 48.4 48.4 50.308 446 446 0 59.98 31.6 33.9 26.9 35.9 24.9 31.4 1176400000 139060000 225230000 359120000 133870000 63431000 255670000 221330000 368260000 201860000 310760000 279270000 232820000 11 13 9 11 10 11 65 201 20;1130;1495;1788;1808;2467;2468;3093;3344;3732;3820;4445;6242;7603;8478;9963;9964;12044 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 22;1180;1555;1855;1876;2553;2554;3202;3466;3878;3971;4633;6501;7983;8900;10452;10453;12607 78;4622;4623;5951;5952;5953;5954;7044;7111;9344;9345;9346;9347;9348;11689;11690;11691;11692;11693;11694;12654;12655;12656;12657;12658;14172;14173;14174;14175;14176;14510;14511;14512;14513;16912;16913;16914;16915;16916;16917;16918;16919;16920;23905;29171;29172;29173;29174;32330;38236;38237;38238;38239;38240;38241;38242;38243;38244;46658;46659;46660;46661;46662;46663 78;4648;4649;5986;5987;5988;5989;7084;7151;9391;9392;9393;9394;9395;11771;11772;11773;11774;11775;11776;12740;12741;12742;12743;12744;14270;14271;14272;14273;14274;14609;14610;14611;14612;17025;17026;17027;17028;17029;17030;17031;17032;17033;24050;29354;29355;29356;29357;32526;38468;38469;38470;38471;38472;38473;38474;38475;38476;46980;46981;46982;46983;46984;46985;46986 78;4649;5988;7084;7151;9392;9394;11775;12740;14274;14610;17027;24050;29355;32526;38472;38475;46982 -1
YDL092W YDL092W 8 8 8 YDL092W pep chromosome:R64-1-1:IV:292781:293221:1 gene:YDL092W transcript:YDL092W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SRP14 description:Signal recognition particle (SRP) subunit; interacts with the RNA component o 1 8 8 8 3 4 4 5 5 2 3 4 4 5 5 2 3 4 4 5 5 2 64.4 64.4 64.4 16.43 146 146 0 55.389 31.5 40.4 40.4 52.1 47.9 17.1 270830000 42406000 44209000 69388000 56014000 31042000 27775000 62740000 80130000 52789000 105100000 79197000 48827000 3 5 4 6 5 3 26 202 646;777;779;2962;5933;5934;8803;11406 True;True;True;True;True;True;True;True 683;684;818;820;3068;6184;6185;9235;11943 2721;2722;2723;2724;2725;2726;2727;3241;3242;3243;3249;11226;22780;22781;22782;22783;22784;33594;33595;33596;33597;44062;44063;44064;44065;44066 2730;2731;2732;2733;2734;2735;2736;3252;3253;3254;3260;11303;22915;22916;22917;22918;22919;33794;33795;33796;33797;44361;44362;44363;44364;44365 2730;3254;3260;11303;22915;22916;33795;44364 -1
YDL095W YDL095W 1 1 1 YDL095W pep chromosome:R64-1-1:IV:287059:289512:1 gene:YDL095W transcript:YDL095W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PMT1 description:Protein O-mannosyltransferase of the ER membrane; transfers mannose from dolic 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 2.4 2.4 2.4 92.674 817 817 0 3.8242 2.4 0 0 2.4 2.4 0 5229000 2919200 0 0 1404700 905060 0 0 0 0 0 2992400 0 1 0 0 1 1 0 3 203 8161 True 8572 31213;31214;31215 31407;31408;31409 31407 -1
YDL097C YDL097C 2 2 2 YDL097C pep chromosome:R64-1-1:IV:285391:286695:-1 gene:YDL097C transcript:YDL097C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPN6 description:Essential, non-ATPase regulatory subunit of the 26S proteasome lid; required 1 2 2 2 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 5.1 5.1 5.1 49.773 434 434 0.0022918 2.317 0 2.3 2.8 0 0 0 5424500 0 817650 4606800 0 0 0 0 0 2714500 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 204 4131;9266 True;True 4300;9720 15722;35508 15830;35716 15830;35716 -1
YDL100C YDL100C 7 7 7 YDL100C pep chromosome:R64-1-1:IV:282112:283176:-1 gene:YDL100C transcript:YDL100C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GET3 description:Guanine nucleotide exchange factor for Gpa1p; amplifies G protein signaling; 1 7 7 7 1 2 3 3 1 5 1 2 3 3 1 5 1 2 3 3 1 5 22 22 22 39.353 354 354 0 17.426 4.5 6.5 11.9 11.6 4.5 15.5 223180000 6859800 11057000 101140000 18503000 4777400 80841000 0 0 71670000 36950000 0 69881000 1 2 4 3 1 5 16 205 2466;2639;3157;5438;7045;11161;12113 True;True;True;True;True;True;True 2552;2733;3269;5672;7340;11695;12677 9342;9343;9956;9957;11948;20901;26912;42949;42950;46900;46901;46902;46903;46904;46905;46906 9389;9390;10007;10008;12033;21028;27074;43246;43247;47226;47227;47228;47229;47230;47231;47232 9390;10008;12033;21028;27074;43247;47231 -1
YDL101C YDL101C 1 1 1 YDL101C pep chromosome:R64-1-1:IV:280307:281848:-1 gene:YDL101C transcript:YDL101C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DUN1 description:Cell-cycle checkpoint S/T protein kinase; required for transient G2/M arrest 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 3.7 3.7 3.7 58.632 513 513 0 7.2646 0 0 0 0 3.7 3.7 5640800 0 0 0 0 1260900 4379900 0 0 0 0 0 4379900 0 0 0 0 1 1 2 206 11442 True 11979 44181;44182 44486;44487 44487 -1
YDL102W YDL102W 1 1 1 YDL102W pep chromosome:R64-1-1:IV:276872:280165:1 gene:YDL102W transcript:YDL102W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:POL3 description:Catalytic subunit of DNA polymerase delta; required for chromosomal DNA replic 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1.3 1.3 1.3 124.62 1097 1097 0 5.3051 1.3 0 0 0 1.3 0 7910700 5293300 0 0 0 2617300 0 0 0 0 0 8653800 0 1 0 0 0 1 0 2 207 3028 True 3136 11436;11437 11515;11516 11516 -1
YDL112W YDL112W 1 1 1 YDL112W pep chromosome:R64-1-1:IV:258915:263225:1 gene:YDL112W transcript:YDL112W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRM3 description:2-O-ribose methyltransferase; catalyzes the ribose methylation of the guanosi 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 1 1 1 165.05 1436 1436 0 5.0737 0 0 0 0 1 1 2088800 0 0 0 0 458170 1630700 0 0 0 0 0 1630700 0 0 0 0 1 1 2 208 11506 True 12048 44449;44450 44755;44756 44756 -1
YDL122W YDL122W 4 4 4 YDL122W pep chromosome:R64-1-1:IV:242552:244981:1 gene:YDL122W transcript:YDL122W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UBP1 description:Ubiquitin-specific protease; removes ubiquitin from ubiquitinated proteins; cl 1 4 4 4 0 1 3 0 0 0 0 1 3 0 0 0 0 1 3 0 0 0 7.5 7.5 7.5 92.768 809 809 0 18.39 0 1.1 6.4 0 0 0 27565000 0 1283000 26282000 0 0 0 0 0 15487000 0 0 0 0 1 3 0 0 0 4 209 1864;5247;6347;9084 True;True;True;True 1935;5467;6612;9528 7274;20071;24244;34757 7315;20195;24392;34965 7315;20195;24392;34965 -1
YDL126C YDL126C 23 23 23 YDL126C pep chromosome:R64-1-1:IV:236157:238664:-1 gene:YDL126C transcript:YDL126C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC48 description:AAA ATPase; subunit of polyUb-selective segregase complex involved in ERAD, 1 23 23 23 14 12 11 12 10 9 14 12 11 12 10 9 14 12 11 12 10 9 34.9 34.9 34.9 91.995 835 835 0 100.59 22.5 20.4 17.6 19 18.7 16.5 789710000 148090000 77376000 206270000 156860000 49047000 152070000 211450000 180220000 189970000 161570000 194020000 182500000 14 15 12 14 13 12 80 210 6;7;878;897;900;2038;2039;2144;2281;2872;2974;2975;3230;3402;3405;4944;5336;5650;6655;7024;9429;10488;11686 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 7;8;921;940;943;2115;2116;2224;2363;2973;3080;3081;3346;3527;3530;5150;5561;5888;6933;7317;9893;10995;12242 31;32;33;34;35;36;37;38;39;40;3630;3631;3632;3633;3634;3635;3636;3637;3638;3639;3640;3641;3709;3710;3711;3712;3713;3722;3723;3724;7766;7767;7768;7769;8200;8201;8202;8203;8698;8699;8700;8701;8702;8703;10905;10906;11251;11252;11253;12202;12203;12204;12205;12905;12906;12907;12908;12909;12910;12922;12923;12924;12925;18815;20404;20405;21680;21681;21682;21683;25398;26843;36151;36152;36153;40196;45230;45231;45232;45233 31;32;33;34;35;36;37;38;39;40;3643;3644;3645;3646;3647;3648;3649;3650;3651;3652;3653;3654;3722;3723;3724;3725;3726;3736;3737;3738;7808;7809;7810;7811;8242;8243;8244;8245;8743;8744;8745;8746;8747;8748;10976;10977;11329;11330;11331;12287;12288;12289;12290;12992;12993;12994;12995;12996;12997;13009;13010;13011;13012;18936;20531;20532;21808;21809;21810;21811;21812;25552;27004;36363;36364;36365;40437;45543;45544;45545;45546 33;40;3651;3723;3738;7808;7811;8242;8748;10976;11329;11331;12289;12995;13012;18936;20532;21812;25552;27004;36365;40437;45543 105;106 285;560 -1
YDL130W YDL130W 1 1 1 YDL130W pep chromosome:R64-1-1:IV:229906:230527:1 gene:YDL130W transcript:YDL130W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPP1B description:Ribosomal protein P1 beta; component of the ribosomal stalk, which is involve 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 15.1 15.1 15.1 10.667 106 106 0 10.698 15.1 15.1 15.1 15.1 15.1 0 147480000 26710000 0 100340000 15559000 4871900 0 0 0 0 0 16108000 0 1 1 0 1 1 0 4 211 32 True 34 133;134;135;136;137 133;134;135;136;137 133 -1
YDL132W YDL132W 3 3 3 YDL132W pep chromosome:R64-1-1:IV:224304:226751:1 gene:YDL132W transcript:YDL132W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC53 description:Cullin; structural protein of SCF complexes (which also contain Skp1p, Cdc34p 1 3 3 3 3 0 1 1 0 0 3 0 1 1 0 0 3 0 1 1 0 0 5.4 5.4 5.4 93.943 815 815 0 12.707 5.4 0 1.7 1.5 0 0 12036000 8547400 0 1887500 1601000 0 0 11164000 0 0 0 0 0 3 0 0 1 0 0 4 212 3975;5961;6496 True;True;True 4135;6212;6772 15115;15116;22874;24830;24831 15222;15223;23009;24979;24980 15222;23009;24979 -1
YDL191W;YDL136W YDL191W;YDL136W 13;13 13;13 13;13 YDL191W pep chromosome:R64-1-1:IV:117664:118517:1 gene:YDL191W transcript:YDL191W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL35A description:Ribosomal 60S subunit protein L35A; homologous to mammalian ribosomal protei 2 13 13 13 8 8 10 10 9 10 8 8 10 10 9 10 8 8 10 10 9 10 55 55 55 13.909 120 120;120 0 104.03 49.2 42.5 47.5 54.2 42.5 43.3 4686000000 559550000 449380000 1450600000 588590000 471450000 1166400000 888310000 1196900000 1161000000 1052000000 1205600000 992640000 12 11 13 15 15 15 81 213 565;1957;1958;1959;2204;5277;5308;6708;8172;8466;9009;9131;9132 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 597;2032;2033;2034;2286;5498;5531;6988;8583;8888;9452;9579;9580 2451;2452;2453;2454;2455;2456;2457;2458;2459;2460;7496;7497;7498;7499;7500;7501;7502;7503;7504;7505;7506;7507;7508;7509;7510;8423;8424;8425;8426;8427;8428;20162;20163;20164;20165;20166;20167;20298;20299;20300;20301;20302;20303;20304;20305;20306;25595;25596;31259;31260;31261;31262;31263;31264;31265;31266;31267;31268;32276;34479;34480;34481;34482;34483;34938;34939;34940;34941;34942;34943;34944;34945;34946;34947;34948;34949;34950;34951;34952;34953;34954;34955 2458;2459;2460;2461;2462;2463;2464;2465;2466;2467;7537;7538;7539;7540;7541;7542;7543;7544;7545;7546;7547;7548;7549;7550;7551;8466;8467;8468;8469;8470;8471;20286;20287;20288;20289;20290;20291;20424;20425;20426;20427;20428;20429;20430;20431;20432;25749;25750;31454;31455;31456;31457;31458;31459;31460;31461;31462;31463;32472;34686;34687;34688;34689;34690;35146;35147;35148;35149;35150;35151;35152;35153;35154;35155;35156;35157;35158;35159;35160;35161;35162;35163 2460;7537;7545;7550;8470;20290;20431;25749;31455;32472;34687;35146;35160 -1;-1
YDL137W YDL137W 10 3 3 YDL137W pep chromosome:R64-1-1:IV:216529:217074:1 gene:YDL137W transcript:YDL137W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARF2 description:ADP-ribosylation factor; GTPase of the Ras superfamily involved in regulation 1 10 3 3 6 8 8 6 9 8 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 72.4 29.3 29.3 20.657 181 181 0 25.668 40.3 52.5 48.6 38.7 56.4 59.1 120750000 12904000 8955300 44714000 6528900 4561100 43086000 0 19464000 0 0 15042000 0 1 2 1 1 2 1 8 214 4341;5803;5835;6083;7177;7365;7583;7839;7910;8103 False;False;False;False;False;True;False;True;True;False 4518;4519;6046;6079;6334;7507;7508;7732;7962;8239;8310;8511 16473;16474;16475;16476;16477;16478;16479;16480;22235;22236;22237;22238;22239;22240;22241;22242;22243;22244;22245;22358;22359;22360;23353;23354;23355;23356;23357;23358;27496;27497;27498;27499;27500;28251;28252;28253;28254;28255;29099;29100;29101;29102;29103;29104;29105;30135;30338;30339;31051;31052;31053;31054;31055;31056;31057 16583;16584;16585;16586;16587;16588;16589;16590;22365;22366;22367;22368;22369;22370;22371;22372;22373;22374;22375;22491;22492;22493;23490;23491;23492;23493;23494;23495;27668;27669;27670;27671;27672;28426;28427;28428;28429;28430;29282;29283;29284;29285;29286;29287;29288;30323;30527;30528;31243;31244;31245;31246;31247;31248;31249;31250 16590;22369;22492;23490;27670;28429;29282;30323;30527;31247 107;108 22;110 -1
YDL140C YDL140C 20 19 19 YDL140C pep chromosome:R64-1-1:IV:205360:210561:-1 gene:YDL140C transcript:YDL140C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPO21 description:RNA polymerase II largest subunit B220; part of central core; phosphorylatio 1 20 19 19 7 10 6 8 7 10 7 9 6 7 6 9 7 9 6 7 6 9 14.5 14 14 191.61 1733 1733 0 93.732 4.8 6.4 4.3 5.5 6 8.2 185440000 29695000 25553000 46492000 21069000 11015000 51615000 45213000 50510000 34057000 40633000 40835000 41736000 7 9 6 7 6 9 44 215 59;216;461;1566;1669;1982;2073;2120;2180;2933;3565;3738;4024;4573;8189;10400;10707;11039;11321;12273 True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 61;226;488;1629;1733;2057;2151;2200;2260;3038;3703;3884;4188;4769;8600;10902;11218;11566;11858;12844 245;931;2006;2007;6242;6583;6584;6585;6586;7589;7590;7911;7912;7913;7914;7915;7916;8108;8109;8322;8323;11117;11118;13581;14199;14200;14201;15292;15293;17451;17452;17453;17454;31309;39891;41044;41045;41046;41047;41048;41049;42484;42485;43659;43660;43661;47485;47486 246;933;2012;2013;6278;6619;6620;6621;6622;7631;7632;7953;7954;7955;7956;7957;7958;8150;8151;8365;8366;11194;11195;13670;14297;14298;14299;15400;15401;17566;17567;17568;17569;31504;40128;41292;41293;41294;41295;41296;41297;42779;42780;43958;43959;43960;47816;47817 246;933;2012;6278;6621;7631;7956;8151;8365;11194;13670;14299;15400;17567;31504;40128;41297;42780;43959;47816 -1
YDL143W YDL143W 24 24 24 YDL143W pep chromosome:R64-1-1:IV:199996:201582:1 gene:YDL143W transcript:YDL143W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCT4 description:Subunit of the cytosolic chaperonin Cct ring complex; related to Tcp1p, requir 1 24 24 24 10 11 10 15 11 13 10 11 10 15 11 13 10 11 10 15 11 13 54 54 54 57.603 528 528 0 114.14 26.5 27.5 22.9 39.2 30.1 30.3 1017500000 167110000 117940000 285530000 110290000 77350000 259270000 222290000 265870000 207610000 214990000 265830000 207670000 13 12 12 16 13 13 79 216 1009;1101;1183;2816;3018;3019;3121;3129;3130;3824;4040;4601;4846;5865;5866;7768;7945;8296;8985;9140;9245;9760;11425;11516 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1056;1151;1234;2915;3126;3127;3231;3240;3241;3975;4205;4797;5049;6110;6111;8164;8346;8713;9428;9588;9698;10236;11962;12058 4223;4532;4533;4534;4535;4536;4820;10670;10671;11409;11410;11815;11816;11817;11861;11862;11863;11864;11865;11866;11867;14525;14526;14527;15339;15340;15341;15342;15343;15344;15345;17553;17554;17555;17556;17557;18423;18424;18425;18426;18427;18428;18429;18430;18431;18432;18433;18434;22468;22469;22470;22471;22472;22473;22474;22475;22476;22477;29866;29867;29868;29869;30487;30488;31705;31706;31707;34256;34257;34982;34983;35457;35458;35459;35460;35461;37396;44122;44123;44479 4243;4557;4558;4559;4560;4561;4562;4846;10738;10739;11488;11489;11899;11900;11901;11945;11946;11947;11948;11949;11950;11951;14624;14625;14626;15447;15448;15449;15450;15451;15452;15453;17668;17669;17670;17671;17672;18541;18542;18543;18544;18545;18546;18547;18548;18549;18550;18551;18552;22602;22603;22604;22605;22606;22607;22608;22609;22610;22611;30053;30054;30055;30056;30676;30677;31901;31902;31903;34462;34463;35190;35191;35665;35666;35667;35668;35669;37618;44421;44422;44785 4243;4559;4846;10738;11488;11489;11901;11947;11950;14625;15448;17669;18546;22603;22611;30053;30677;31901;34463;35190;35667;37618;44421;44785 -1
YDL145C YDL145C 26 26 26 YDL145C pep chromosome:R64-1-1:IV:194571:198176:-1 gene:YDL145C transcript:YDL145C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:COP1 description:Alpha subunit of COPI vesicle coatomer complex; complex surrounds transport v 1 26 26 26 14 12 17 12 11 16 14 12 17 12 11 16 14 12 17 12 11 16 31.2 31.2 31.2 135.61 1201 1201 0 114.51 18.6 14.9 21.8 14.2 14.2 19.3 927820000 149110000 72831000 367300000 79406000 54619000 204560000 196300000 160390000 206900000 161790000 194650000 197640000 14 12 18 13 12 17 86 217 992;1433;1599;1653;1874;2147;2336;2988;3016;3100;3418;3693;3996;5978;6462;7165;7553;7914;8325;9103;9596;10243;10758;10827;11825;12349 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1038;1493;1662;1717;1945;2227;2420;3094;3124;3209;3544;3839;4159;6229;6734;7491;7931;8314;8742;9549;10065;10741;11274;11347;12384;12922 4117;5739;6343;6344;6345;6346;6347;6533;6534;7300;8207;8208;8209;8886;8887;8888;8889;8890;11301;11401;11402;11403;11404;11405;11406;11720;11721;11722;12977;12978;12979;12980;14051;15193;15194;15195;15196;15197;22932;22933;22934;22935;22936;24702;24703;24704;24705;27431;27432;28982;28983;28984;30348;30349;31803;31804;31805;31806;31807;31808;34817;34818;34819;36760;36761;36762;36763;36764;36765;36766;36767;39293;39294;39295;39296;41375;41376;41377;41378;41379;41675;45763;45764;45765;47768;47769;47770 4133;5774;6379;6380;6381;6382;6383;6569;6570;7341;8249;8250;8251;8931;8932;8933;8934;8935;11380;11480;11481;11482;11483;11484;11485;11802;11803;11804;13064;13065;13066;13067;14146;15300;15301;15302;15303;15304;23067;23068;23069;23070;23071;24851;24852;24853;24854;27600;27601;29165;29166;29167;30537;30538;31999;32000;32001;32002;32003;32004;35025;35026;35027;36978;36979;36980;36981;36982;36983;36984;36985;39529;39530;39531;39532;41635;41636;41637;41638;41639;41938;46079;46080;46081;48100;48101;48102 4133;5774;6380;6570;7341;8250;8931;11380;11481;11804;13066;14146;15303;23067;24854;27601;29165;30537;31999;35026;36984;39530;41639;41938;46079;48102 109 736 -1
YDL148C YDL148C 20 20 20 YDL148C pep chromosome:R64-1-1:IV:188154:190586:-1 gene:YDL148C transcript:YDL148C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP14 description:Nucleolar protein; forms a complex with Noc4p that mediates maturation and n 1 20 20 20 12 8 13 11 9 10 12 8 13 11 9 10 12 8 13 11 9 10 29.9 29.9 29.9 94.301 810 810 0 108.18 22.1 11.4 21.5 15.7 14 16.3 595290000 101510000 40032000 252530000 61198000 28263000 111760000 113870000 114100000 127530000 123680000 108060000 112090000 13 8 13 12 8 11 65 218 300;1248;1249;2511;2658;2665;3737;3800;4339;5172;5658;7025;7558;7585;9297;9993;10156;10524;11940;12071 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 316;1299;1300;2599;2752;2759;3883;3950;4516;5385;5896;7318;7936;7964;9753;10482;10652;11031;12503;12634 1315;1316;1317;1318;1319;1320;5020;5021;5022;5023;5024;5025;9455;9456;9457;9458;9459;10016;10047;10048;14197;14198;14447;14448;14449;16466;16467;16468;19758;19759;19760;19761;21716;21717;21718;21719;21720;26844;26845;26846;28994;29110;29111;29112;29113;35626;35627;35628;35629;35630;38327;38328;38329;38330;38331;38332;38967;38968;38969;38970;40324;40325;46210;46740;46741;46742 1317;1318;1319;1320;1321;1322;5048;5049;5050;5051;5052;5053;9503;9504;9505;9506;9507;10069;10100;10101;14295;14296;14546;14547;14548;16576;16577;16578;19881;19882;19883;19884;21845;21846;21847;21848;21849;27005;27006;27007;29177;29293;29294;29295;29296;35834;35835;35836;35837;35838;38559;38560;38561;38562;38563;38564;39202;39203;39204;39205;40565;40566;46527;47065;47066;47067 1321;5049;5052;9504;10069;10101;14295;14547;16577;19882;21847;27007;29177;29293;35834;38562;39202;40565;46527;47066 -1
YDL153C YDL153C 10 10 10 YDL153C pep chromosome:R64-1-1:IV:181186:183018:-1 gene:YDL153C transcript:YDL153C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SAS10 description:Subunit of U3-containing Small Subunit (SSU) processome complex; involved in 1 10 10 10 4 3 4 2 4 2 4 3 4 2 4 2 4 3 4 2 4 2 21 21 21 70.259 610 610 0 45.968 7.9 10.2 7.4 6.6 9.5 5.4 92882000 17931000 8585800 32865000 6162400 12833000 14505000 27128000 0 0 0 38722000 0 4 3 2 2 4 1 16 219 368;983;2376;5477;10276;10421;10561;10576;10577;10601 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 389;1029;2460;5713;10775;10924;11069;11084;11085;11109 1616;1617;4094;4095;4096;9010;9011;21099;21100;21101;21102;39435;39946;40458;40511;40512;40513;40582;40583 1619;1620;4110;4111;4112;9056;9057;21226;21227;21228;21229;39671;40183;40701;40754;40755;40756;40825;40826 1620;4111;9057;21227;39671;40183;40701;40754;40755;40826 110 390 -1
YDL156W YDL156W 1 1 1 YDL156W pep chromosome:R64-1-1:IV:174918:176486:1 gene:YDL156W transcript:YDL156W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CMR1 description:Nuclear protein with a role in protein quality control; localizes to the intra 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 3.1 3.1 3.1 59.155 522 522 0.00087032 3.6481 0 0 0 3.1 3.1 3.1 8615600 0 0 0 1573900 1736500 5305300 0 0 0 0 0 5305300 0 0 0 1 1 1 3 220 6615 True 6892 25270;25271;25272 25424;25425;25426 25426 -1
YDL160C YDL160C 18 18 18 YDL160C pep chromosome:R64-1-1:IV:170410:171930:-1 gene:YDL160C transcript:YDL160C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DHH1 description:Cytoplasmic DEAD-box helicase, stimulates mRNA decapping; coordinates distinc 1 18 18 18 13 11 9 11 10 13 13 11 9 11 10 13 13 11 9 11 10 13 43.7 43.7 43.7 57.543 506 506 0 93.788 38.1 27.1 24.7 29.6 25.1 36.4 1134200000 259400000 102900000 391310000 125950000 66804000 187800000 303650000 217200000 252730000 219730000 237560000 175580000 14 12 9 13 12 13 73 221 1796;1860;2271;3058;3214;3215;3307;3912;4527;4720;5001;5135;6367;7630;9887;9905;9935;10401 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1863;1930;1931;2353;3167;3328;3329;3427;3428;4071;4720;4721;4917;5207;5347;6633;8011;10373;10392;10424;10903 7064;7065;7066;7067;7068;7259;7260;7261;7262;7263;7264;7265;7266;8655;8656;11559;11560;11561;12111;12112;12113;12114;12115;12116;12117;12118;12119;12536;12537;12538;12539;12540;12541;12542;14887;17248;17249;17250;17251;17252;17253;17254;17943;17944;19022;19023;19024;19025;19026;19607;19608;19609;24300;24301;24302;24303;24304;29264;29265;29266;29267;29268;29269;37969;37970;37971;37972;38033;38034;38035;38036;38132;38133;38134;39892 7104;7105;7106;7107;7108;7300;7301;7302;7303;7304;7305;7306;7307;8700;8701;11640;11641;11642;12196;12197;12198;12199;12200;12201;12202;12203;12204;12622;12623;12624;12625;12626;12627;12628;14991;17362;17363;17364;17365;17366;17367;17368;18059;18060;19145;19146;19147;19148;19149;19730;19731;19732;24448;24449;24450;24451;24452;29447;29448;29449;29450;29451;29452;38200;38201;38202;38203;38264;38265;38266;38267;38363;38364;38365;40129 7107;7305;8700;11641;12196;12203;12628;14991;17362;18060;19148;19732;24452;29451;38200;38266;38364;40129 111;112 59;120 -1
YDL165W YDL165W 2 2 2 YDL165W pep chromosome:R64-1-1:IV:164290:164865:1 gene:YDL165W transcript:YDL165W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC36 description:Component of the CCR4-NOT core complex, involved in mRNA decapping; this comp 1 2 2 2 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 11 11 11 22.362 191 191 0 18.544 0 7.3 0 11 0 0 12288000 0 4571600 0 7716500 0 0 0 0 0 15874000 0 0 0 1 0 2 0 0 3 222 581;11211 True;True 613;11746 2521;43160;43161 2528;43457;43458 2528;43457 -1
YDL166C YDL166C 2 2 2 YDL166C pep chromosome:R64-1-1:IV:163449:164042:-1 gene:YDL166C transcript:YDL166C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FAP7 description:Essential NTPase required for small ribosome subunit synthesis; mediates proc 1 2 2 2 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 12.7 12.7 12.7 22.723 197 197 0.0052083 2.0706 0 0 12.7 0 0 0 25061000 0 0 25061000 0 0 0 0 0 14767000 0 0 0 0 0 2 0 0 0 2 223 8159;9642 True;True 8570;10114 31210;36955 31404;37174 31404;37174 -1
YDL171C YDL171C 17 17 17 YDL171C pep chromosome:R64-1-1:IV:149203:155640:-1 gene:YDL171C transcript:YDL171C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLT1 description:NAD(+)-dependent glutamate synthase (GOGAT); synthesizes glutamate from gluta 1 17 17 17 5 4 4 11 8 3 5 4 4 11 8 3 5 4 4 11 8 3 12 12 12 238.1 2145 2145 0 90.839 3.6 2.8 3 7.8 5.2 3 420100000 21392000 14927000 44717000 165810000 144130000 29133000 57174000 109690000 59549000 423780000 231380000 51861000 5 4 4 11 8 3 35 224 366;493;1631;1633;2651;3159;3525;3774;5913;7855;7971;9416;9815;11359;11634;11883;11902 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 387;521;1694;1696;2745;3271;3661;3923;6160;8255;8375;9880;10296;11896;12183;12445;12465 1610;1611;1612;1613;2110;2111;2112;6456;6457;6458;6459;6463;9987;11951;13426;13427;14355;22665;30177;30178;30569;30570;36118;37654;37655;37656;37657;37658;43831;44958;44959;44960;45969;45970;46036 1613;1614;1615;1616;2116;2117;2118;6492;6493;6494;6495;6499;10040;12036;13515;13516;14454;22800;30365;30366;30759;30760;36329;37883;37884;37885;37886;37887;44130;45266;45267;45268;46285;46286;46353 1613;2118;6492;6499;10040;12036;13516;14454;22800;30365;30760;36329;37884;44130;45267;46285;46353 -1
YDL173W YDL173W 1 1 1 YDL173W pep chromosome:R64-1-1:IV:148191:149078:1 gene:YDL173W transcript:YDL173W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PAR32 description:Protein of unknown function; hyperphosphorylated upon rapamycin treatment in 1 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 3.4 3.4 3.4 31.886 295 295 0.00080841 2.919 0 3.4 0 3.4 0 0 29188000 0 21603000 0 7584300 0 0 0 0 0 15602000 0 0 0 1 0 1 0 0 2 225 2938 True 3043 11132;11133 11209;11210 11210 -1
YDL177C YDL177C 1 1 1 YDL177C pep chromosome:R64-1-1:IV:141209:141721:-1 gene:YDL177C transcript:YDL177C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; similar to the mouse IMPACT gene; YDL177C is not an esse 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 8.2 8.2 8.2 19.058 170 170 0.0086518 1.7843 0 8.2 0 0 0 0 897360 0 897360 0 0 0 0 0 1946500 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 226 1213 True 1264 4904 4930 4930 -1
YDL182W;YDL131W YDL182W;YDL131W 17;15 17;15 17;15 YDL182W pep chromosome:R64-1-1:IV:133437:134723:1 gene:YDL182W transcript:YDL182W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LYS20 description:Homocitrate synthase isozyme and functions in DNA repair; catalyzes the conde 2 17 17 17 11 9 7 10 5 5 11 9 7 10 5 5 11 9 7 10 5 5 52.1 52.1 52.1 47.098 428 428;440 0 81.961 33.4 27.1 22.7 39.3 14.7 15.7 413290000 150690000 87277000 64787000 69380000 17026000 24130000 121820000 206580000 49305000 158970000 74325000 33273000 12 11 7 10 4 3 47 227 348;349;450;451;2645;4567;5923;7135;7485;8436;8735;8791;9889;10681;10898;11013;12055 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 367;368;477;478;2739;4763;6172;7450;7860;7861;8857;9162;9223;10375;11192;11419;11539;12618 1554;1555;1556;1557;1558;1559;1560;1965;1966;1967;1968;1969;1970;1971;1972;9971;9972;9973;17426;17427;22720;22721;22722;22723;22724;22725;27273;27274;27275;28751;28752;28753;32165;33317;33318;33319;33542;33543;33544;37974;40914;41895;41896;42375;42376;42377;42378;42379;46693;46694 1557;1558;1559;1560;1561;1562;1563;1971;1972;1973;1974;1975;1976;1977;1978;10024;10025;10026;17541;17542;22855;22856;22857;22858;22859;22860;27438;27439;27440;28931;28932;28933;32361;33517;33518;33519;33742;33743;33744;38205;41161;42159;42160;42670;42671;42672;42673;42674;47016;47017 1557;1563;1974;1978;10025;17541;22856;27440;28933;32361;33519;33743;38205;41161;42159;42671;47016 113;114 255;330 -1;-1
YDL185W YDL185W 50 50 50 YDL185W pep chromosome:R64-1-1:IV:126787:130002:1 gene:YDL185W transcript:YDL185W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VMA1 description:Subunit A of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase; protein precursor 1 50 50 50 30 33 34 26 23 24 30 33 34 26 23 24 30 33 34 26 23 24 57.6 57.6 57.6 118.64 1071 1071 0 253.53 36 38.5 40.1 29.2 26.1 29.3 3376300000 616500000 377670000 1297800000 343080000 156240000 584970000 620470000 750000000 944040000 669400000 481570000 705910000 34 40 37 32 28 27 198 228 164;207;345;616;617;858;898;998;1157;1324;1467;1576;2013;2020;2057;2228;2229;2581;2598;2660;2769;3007;3276;3355;3383;4794;4974;5090;5472;5554;5800;6298;6391;6604;7142;7572;7762;7763;8616;8701;8772;9240;9871;10118;10637;10708;10717;11012;11202;12321 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 171;217;363;651;652;901;941;1044;1208;1379;1527;1639;2089;2097;2134;2310;2311;2671;2692;2754;2867;3114;3395;3477;3508;4995;5180;5300;5708;5791;6042;6043;6558;6559;6657;6881;7458;7951;8158;8159;9040;9127;9203;9693;10354;10610;10611;11145;11219;11228;11538;11737;12894 712;713;714;715;716;887;888;889;890;891;1524;1525;1526;2615;2616;2617;2618;2619;2620;2621;2622;2623;3575;3576;3577;3714;3715;4168;4169;4170;4171;4711;4712;5312;5313;5314;5315;5316;5317;5318;5319;5852;5853;5854;5855;5856;6264;7684;7685;7686;7687;7688;7704;7705;7854;7855;8495;8496;8497;8498;8499;8500;8501;9747;9748;9749;9830;9831;9832;9833;9834;9835;9836;9837;10018;10019;10020;10021;10022;10023;10024;10025;10026;10027;10502;10503;10504;10505;10506;10507;11367;11368;12414;12415;12416;12417;12418;12712;12713;12714;12715;12716;12829;18237;18238;18239;18240;18924;18925;19454;21083;21084;21085;21086;21364;22225;22226;22227;22228;22229;22230;24091;24092;24093;24094;24095;24096;24400;25227;25228;25229;25230;25231;25232;27305;27306;27307;29054;29055;29056;29057;29058;29059;29060;29061;29062;29063;29064;29065;29845;29846;29847;29848;29849;29850;29851;29852;29853;29854;29855;29856;32817;33184;33475;33476;33477;35433;37898;37899;37900;37901;37902;38784;38785;38786;38787;38788;38789;38790;38791;40682;40683;40684;40685;40686;40687;41050;41080;41081;41082;41083;42372;42373;42374;43133;43134;47669;47670;47671 713;714;715;716;717;889;890;891;892;893;1527;1528;1529;2622;2623;2624;2625;2626;2627;2628;2629;2630;3588;3589;3590;3727;3728;4188;4189;4190;4191;4737;4738;5344;5345;5346;5347;5348;5349;5350;5351;5887;5888;5889;5890;5891;6300;7726;7727;7728;7729;7730;7746;7747;7896;7897;8538;8539;8540;8541;8542;8543;8544;9797;9798;9799;9800;9881;9882;9883;9884;9885;9886;9887;9888;10071;10072;10073;10074;10075;10076;10077;10078;10079;10080;10568;10569;10570;10571;10572;10573;11446;11447;12500;12501;12502;12503;12504;12798;12799;12800;12801;12802;12916;18354;18355;18356;18357;19046;19047;19577;21210;21211;21212;21213;21491;22355;22356;22357;22358;22359;22360;24236;24237;24238;24239;24240;24241;24548;25381;25382;25383;25384;25385;25386;27470;27471;27472;27473;29237;29238;29239;29240;29241;29242;29243;29244;29245;29246;29247;29248;30032;30033;30034;30035;30036;30037;30038;30039;30040;30041;30042;30043;33014;33383;33675;33676;33677;35641;38128;38129;38130;38131;38132;39019;39020;39021;39022;39023;39024;39025;39026;40925;40926;40927;40928;40929;40930;41298;41328;41329;41330;41331;42667;42668;42669;43430;43431;48001;48002;48003 714;892;1527;2622;2629;3589;3728;4190;4737;5345;5890;6300;7729;7747;7897;8538;8543;9800;9887;10072;10572;11447;12501;12798;12916;18355;19047;19577;21213;21491;22358;24236;24548;25384;27473;29245;30034;30041;33014;33383;33676;35641;38129;39020;40925;41298;41330;42668;43430;48001 115;116;117;118 102;392;829;1062 -1
YDL192W YDL192W 11 11 4 YDL192W pep chromosome:R64-1-1:IV:116321:116866:1 gene:YDL192W transcript:YDL192W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARF1 description:ADP-ribosylation factor; GTPase of the Ras superfamily involved in regulation 1 11 11 4 7 9 10 7 7 10 7 9 10 7 7 10 2 3 3 2 0 3 72.4 72.4 37.6 20.529 181 181 0 145.52 48.1 52.5 72.4 46.4 43.1 56.4 1928200000 105100000 125740000 1014500000 112220000 53877000 516750000 190330000 272870000 475280000 281620000 227070000 462870000 9 9 12 8 9 14 61 229 4341;5803;5835;6083;7177;7304;7305;7583;7838;7911;8103 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4518;4519;6046;6079;6334;7507;7508;7667;7668;7669;7962;8238;8311;8511 16473;16474;16475;16476;16477;16478;16479;16480;22235;22236;22237;22238;22239;22240;22241;22242;22243;22244;22245;22358;22359;22360;23353;23354;23355;23356;23357;23358;27496;27497;27498;27499;27500;28021;28022;28023;28024;28025;28026;28027;28028;29099;29100;29101;29102;29103;29104;29105;30134;30340;30341;30342;30343;30344;31051;31052;31053;31054;31055;31056;31057 16583;16584;16585;16586;16587;16588;16589;16590;22365;22366;22367;22368;22369;22370;22371;22372;22373;22374;22375;22491;22492;22493;23490;23491;23492;23493;23494;23495;27668;27669;27670;27671;27672;28195;28196;28197;28198;28199;28200;28201;28202;29282;29283;29284;29285;29286;29287;29288;30322;30529;30530;30531;30532;30533;31243;31244;31245;31246;31247;31248;31249;31250 16590;22369;22492;23490;27670;28196;28202;29282;30322;30533;31247 107;108;119 22;110;134 -1
YDL195W YDL195W 7 7 7 YDL195W pep chromosome:R64-1-1:IV:107208:111029:1 gene:YDL195W transcript:YDL195W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC31 description:Component of the Sec13p-Sec31p complex of the COPII vesicle coat; COPII coat 1 7 7 7 5 2 4 4 3 3 5 2 4 4 3 3 5 2 4 4 3 3 7.1 7.1 7.1 138.72 1273 1273 0 62.172 5.4 2.7 4.1 4.1 3.4 3.8 99374000 28492000 5518200 34953000 8685600 5256300 16469000 26917000 18709000 21419000 16964000 17032000 20456000 6 2 4 4 3 3 22 230 375;1128;4625;6915;8341;10833;11080 True;True;True;True;True;True;True 398;1178;4821;7203;8758;11353;11607 1655;4619;17623;17624;17625;17626;17627;17628;26450;26451;26452;26453;31858;41699;41700;41701;41702;41703;41704;42645;42646;42647 1659;4645;17738;17739;17740;17741;17742;17743;26610;26611;26612;26613;32054;41962;41963;41964;41965;41966;41967;42940;42941;42942 1659;4645;17739;26610;32054;41965;42942 -1
YDL198C YDL198C 4 4 4 YDL198C pep chromosome:R64-1-1:IV:103649:104551:-1 gene:YDL198C transcript:YDL198C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GGC1 description:Mitochondrial GTP/GDP transporter; essential for mitochondrial genome mainten 1 4 4 4 3 3 2 1 1 1 3 3 2 1 1 1 3 3 2 1 1 1 18 18 18 33.215 300 300 0 30.061 15.7 13 12.3 7.3 7.3 7.3 65721000 10335000 19896000 13642000 9340400 4088700 8418800 21266000 35604000 0 19002000 0 0 3 4 2 2 1 1 13 231 2195;5766;7420;8659 True;True;True;True 2275;6007;7790;9084 8370;22068;22069;28484;28485;32987;32988;32989;32990;32991;32992;32993;32994 8413;22198;22199;28662;28663;33185;33186;33187;33188;33189;33190;33191;33192 8413;22199;28663;33190 -1
YDL201W YDL201W 7 7 7 YDL201W pep chromosome:R64-1-1:IV:99561:100421:1 gene:YDL201W transcript:YDL201W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRM8 description:Noncatalytic subunit of a tRNA methyltransferase complex; Trm8p and Trm82p comp 1 7 7 7 2 5 3 6 1 3 2 5 3 6 1 3 2 5 3 6 1 3 30.1 30.1 30.1 33.391 286 286 0 53.168 11.2 18.2 12.9 26.6 5.9 12.9 97181000 5479400 22855000 24228000 25144000 2631300 16843000 15234000 36961000 18773000 47209000 0 21400000 2 5 3 7 1 3 21 232 298;3533;3593;4182;4428;4429;11469 True;True;True;True;True;True;True 314;3670;3736;4353;4615;4616;12008 1311;13459;13460;13727;13728;15917;15918;15919;15920;15921;15922;16831;16832;16833;16834;16835;16836;16837;16838;44293;44294 1313;13548;13549;13818;13819;16026;16027;16028;16029;16030;16031;16943;16944;16945;16946;16947;16948;16949;16950;44598;44599 1313;13549;13818;16031;16943;16950;44599 -1
YDL208W YDL208W 11 11 11 YDL208W pep chromosome:R64-1-1:IV:87512:87982:1 gene:YDL208W transcript:YDL208W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NHP2 description:Protein related to mammalian high mobility group (HMG) proteins; nuclear protein 1 11 11 11 8 3 7 6 6 7 8 3 7 6 6 7 8 3 7 6 6 7 66 66 66 17.122 156 156 0 26.165 60.9 23.7 35.3 62.2 62.2 56.4 3478300000 511280000 636740000 965470000 426330000 360390000 578120000 921900000 1198300000 929250000 589490000 689710000 650290000 9 8 9 9 11 9 55 233 1983;3181;7211;7212;7213;7605;7606;8100;8101;8590;10682 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2058;3294;7551;7552;7553;7554;7985;7986;8508;8509;9014;11193 7591;12020;12021;12022;12023;27622;27623;27624;27625;27626;27627;27628;27629;27630;27631;27632;27633;27634;27635;27636;27637;27638;27639;27640;27641;27642;27643;27644;27645;27646;27647;29178;29179;29180;29181;29182;29183;29184;29185;29186;29187;29188;29189;31044;31045;31046;31047;31048;31049;32730;32731;32732;32733;40915;40916;40917;40918 7633;12105;12106;12107;12108;27795;27796;27797;27798;27799;27800;27801;27802;27803;27804;27805;27806;27807;27808;27809;27810;27811;27812;27813;27814;27815;27816;27817;27818;27819;27820;29361;29362;29363;29364;29365;29366;29367;29368;29369;29370;29371;29372;31236;31237;31238;31239;31240;31241;32927;32928;32929;32930;41162;41163;41164;41165 7633;12107;27795;27796;27816;29361;29369;31236;31241;32930;41163 120 24 -1
YDL212W YDL212W 1 1 1 YDL212W pep chromosome:R64-1-1:IV:78426:79058:1 gene:YDL212W transcript:YDL212W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SHR3 description:Endoplasmic reticulum packaging chaperone; required for incorporation of amino a 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 4.8 4.8 4.8 23.512 210 210 0.0086643 1.7879 4.8 4.8 4.8 0 4.8 4.8 46006000 12924000 6793800 15079000 0 5631700 5577100 0 0 0 0 0 5577100 1 1 1 0 1 1 5 234 6054 True 6305 23219;23220;23221;23222;23223 23355;23356;23357;23358;23359 23357 -1
YDL213C YDL213C 6 6 6 YDL213C pep chromosome:R64-1-1:IV:77289:77966:-1 gene:YDL213C transcript:YDL213C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP6 description:rRNA-binding protein required for 40S ribosomal subunit biogenesis; contains an 1 6 6 6 3 3 2 1 2 0 3 3 2 1 2 0 3 3 2 1 2 0 32.4 32.4 32.4 25.216 225 225 0 17.933 21.8 17.3 9.8 10.7 9.8 0 72842000 22531000 18095000 20377000 4119400 7720600 0 20010000 48670000 0 0 0 0 4 4 2 1 2 0 13 235 1224;2364;2994;7039;8567;10614 True;True;True;True;True;True 1275;2448;3100;7333;8991;11122 4943;4944;4945;4946;4947;4948;8971;8972;11321;26893;32681;40619;40620 4970;4971;4972;4973;4974;4975;9017;9018;11400;27054;32878;40862;40863 4974;9018;11400;27054;32878;40862 -1
YDL219W YDL219W 2 2 2 YDL219W pep chromosome:R64-1-1:IV:65242:65765:1 gene:YDL219W transcript:YDL219W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DTD1 description:D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase; functions in protein translation, may affect nonsense 1 2 2 2 0 1 2 1 1 1 0 1 2 1 1 1 0 1 2 1 1 1 12 12 12 16.745 150 150 0 8.0255 0 7.3 12 7.3 7.3 7.3 70890000 0 2906500 52834000 3644800 1581800 9923000 0 0 31132000 0 0 0 0 1 2 1 1 1 6 236 3947;11525 True;True 4107;12067 15026;44503;44504;44505;44506;44507 15132;44809;44810;44811;44812;44813 15132;44812 -1
YDL224C YDL224C 1 1 1 YDL224C pep chromosome:R64-1-1:IV:54397:56346:-1 gene:YDL224C transcript:YDL224C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:WHI4 description:Putative RNA binding protein; regulates the cell size requirement for passage t 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 2 2 2 70.689 649 649 0 5.0401 0 0 2 0 0 0 3803300 0 0 3803300 0 0 0 0 0 2241100 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 237 198 True 208 858 860 860 -1
YDL225W YDL225W 5 5 5 YDL225W pep chromosome:R64-1-1:IV:52445:54100:1 gene:YDL225W transcript:YDL225W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SHS1 description:Component of the septin ring that is required for cytokinesis; present at the en 1 5 5 5 1 4 2 2 0 0 1 4 2 2 0 0 1 4 2 2 0 0 10.3 10.3 10.3 62.629 551 551 0 11.495 3.1 8.9 3.4 3.8 0 0 30109000 2305500 7487700 16081000 4235100 0 0 0 12281000 0 12673000 0 0 1 4 2 2 0 0 9 238 2459;6725;7561;7580;9906 True;True;True;True;True 2544;7005;7939;7959;10393 9316;9317;25648;25649;28999;29091;38037;38038;38039 9363;9364;25802;25803;29182;29274;38268;38269;38270 9363;25802;29182;29274;38268 -1
YDL229W YDL229W 55 2 2 YDL229W pep chromosome:R64-1-1:IV:44065:45906:1 gene:YDL229W transcript:YDL229W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSB1 description:Cytoplasmic ATPase that is a ribosome-associated molecular chaperone; functions 1 55 2 2 45 45 39 39 44 45 2 2 0 2 2 2 2 2 0 2 2 2 72.9 5.5 5.5 66.601 613 613 0 27.044 70.1 69.8 62.6 62.8 67.7 71.1 712590000 190970000 127460000 0 105250000 60488000 228430000 279050000 210790000 0 187580000 252510000 240920000 3 1 0 3 2 3 12 239 15;755;931;1063;1939;2172;2173;2207;3708;3865;3866;3867;4157;4158;4159;4941;5157;5326;5704;5953;6289;6290;6711;6712;6713;7141;7284;7285;7286;7570;7800;7932;7933;7934;7935;8353;8485;8486;8612;9141;9142;9494;9621;9711;9712;9743;9744;10080;10084;10120;10387;11086;11087;11355;11599 False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;True 17;796;974;1111;2013;2252;2253;2289;3854;4022;4023;4024;4327;4328;4329;5147;5369;5549;5945;6204;6549;6550;6991;6992;6993;7457;7645;7646;7647;7648;7649;7948;7949;8196;8332;8333;8334;8335;8770;8907;8908;8909;9036;9589;9590;9960;10092;10185;10186;10219;10220;10572;10576;10613;10889;11613;11614;11615;11892;12146 68;3159;3160;3161;3162;3163;3164;3165;3166;3167;3168;3169;3867;3868;3869;3870;3871;3872;3873;3874;3875;3876;4402;4403;4404;4405;4406;4407;7457;7458;7459;7460;8292;8293;8294;8295;8296;8297;8298;8299;8300;8434;8435;8436;14095;14096;14097;14098;14099;14100;14702;14703;14704;14705;14706;14707;14708;14709;14710;14711;14712;14713;14714;14715;14716;14717;15795;15796;15797;15798;15799;15800;15801;15802;15803;15804;15805;15806;15807;15808;15809;15810;15811;15812;15813;15814;15815;15816;15817;15818;18809;19709;19710;19711;19712;20360;20361;20362;20363;20364;20365;20366;20367;21861;21862;21863;21864;21865;21866;21867;22851;22852;22853;24061;24062;24063;24064;24065;24066;24067;24068;24069;24070;24071;24072;24073;25610;25611;25612;25613;27301;27302;27303;27304;27953;27954;27955;27956;27957;27958;27959;27960;27961;27962;27963;27964;27965;27966;27967;27968;27969;27970;27971;27972;27973;27974;27975;27976;27977;27978;29032;29033;29034;29035;29036;29037;29038;29039;29040;29041;29042;29043;29044;29045;29046;29047;29048;29049;29050;29051;29973;29974;29975;30423;30424;30425;30426;30427;30428;30429;30430;30431;30432;30433;30434;30435;30436;30437;30438;30439;30440;30441;30442;30443;30444;30445;30446;31889;31890;31891;31892;31893;31894;31895;31896;31897;32341;32342;32343;32344;32345;32346;32347;32348;32349;32350;32351;32352;32353;32354;32355;32356;32357;32808;34984;34985;34986;34987;34988;34989;34990;34991;34992;34993;34994;34995;34996;34997;34998;34999;35000;35001;35002;35003;35004;35005;36392;36393;36394;36395;36396;36397;36398;36853;36854;36855;36856;36857;37200;37201;37202;37203;37204;37205;37206;37207;37208;37209;37210;37328;37329;37330;37331;37332;37333;37334;37335;37336;37337;37338;37339;37340;37341;37342;37343;37344;37345;37346;37347;37348;38642;38643;38644;38645;38646;38647;38648;38659;38660;38661;38662;38663;38664;38793;38794;38795;38796;38797;39828;39829;39830;39831;39832;39833;42661;42662;42663;42664;42665;42666;42667;42668;42669;42670;42671;42672;42673;42674;42675;42676;42677;42678;42679;42680;42681;42682;42683;42684;42685;42686;42687;42688;43799;43800;43801;43802;43803;43804;43805;43806;43807;43808;43809;43810;44823;44824;44825;44826;44827;44828 68;3170;3171;3172;3173;3174;3175;3176;3177;3178;3179;3180;3882;3883;3884;3885;3886;3887;3888;3889;3890;3891;4426;4427;4428;4429;4430;4431;7498;7499;7500;7501;8335;8336;8337;8338;8339;8340;8341;8342;8343;8477;8478;8479;14192;14193;14194;14195;14196;14197;14804;14805;14806;14807;14808;14809;14810;14811;14812;14813;14814;14815;14816;14817;14818;14819;15903;15904;15905;15906;15907;15908;15909;15910;15911;15912;15913;15914;15915;15916;15917;15918;15919;15920;15921;15922;15923;15924;15925;15926;15927;18930;19832;19833;19834;19835;20487;20488;20489;20490;20491;20492;20493;20494;21991;21992;21993;21994;21995;21996;21997;22986;22987;22988;24206;24207;24208;24209;24210;24211;24212;24213;24214;24215;24216;24217;24218;25764;25765;25766;25767;27466;27467;27468;27469;28127;28128;28129;28130;28131;28132;28133;28134;28135;28136;28137;28138;28139;28140;28141;28142;28143;28144;28145;28146;28147;28148;28149;28150;28151;28152;29215;29216;29217;29218;29219;29220;29221;29222;29223;29224;29225;29226;29227;29228;29229;29230;29231;29232;29233;29234;30160;30161;30162;30612;30613;30614;30615;30616;30617;30618;30619;30620;30621;30622;30623;30624;30625;30626;30627;30628;30629;30630;30631;30632;30633;30634;30635;32085;32086;32087;32088;32089;32090;32091;32092;32093;32537;32538;32539;32540;32541;32542;32543;32544;32545;32546;32547;32548;32549;32550;32551;32552;32553;33005;35192;35193;35194;35195;35196;35197;35198;35199;35200;35201;35202;35203;35204;35205;35206;35207;35208;35209;35210;35211;35212;35213;36605;36606;36607;36608;36609;36610;36611;37072;37073;37074;37075;37076;37419;37420;37421;37422;37423;37424;37425;37426;37427;37428;37429;37550;37551;37552;37553;37554;37555;37556;37557;37558;37559;37560;37561;37562;37563;37564;37565;37566;37567;37568;37569;37570;38875;38876;38877;38878;38879;38880;38881;38892;38893;38894;38895;38896;38897;39028;39029;39030;39031;39032;40065;40066;40067;40068;40069;40070;42956;42957;42958;42959;42960;42961;42962;42963;42964;42965;42966;42967;42968;42969;42970;42971;42972;42973;42974;42975;42976;42977;42978;42979;42980;42981;42982;42983;44098;44099;44100;44101;44102;44103;44104;44105;44106;44107;44108;44109;45130;45131;45132;45133;45134;45135;45136 68;3179;3885;4428;7498;8336;8343;8479;14192;14804;14809;14816;15906;15917;15927;18930;19834;20489;21995;22987;24210;24217;25764;25766;25767;27467;28128;28141;28149;29223;30162;30613;30617;30621;30633;32088;32537;32552;33005;35196;35202;36605;37075;37421;37423;37557;37567;38880;38893;39030;40070;42966;42983;44102;45131 121;122;123;124;125 89;124;470;471;522 -1
YDL237W YDL237W 2 2 2 YDL237W pep chromosome:R64-1-1:IV:30657:31829:1 gene:YDL237W transcript:YDL237W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:AIM6 description:Protein of unknown function; required for respiratory growth; YDL237W is not an 1 2 2 2 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 7.9 7.9 7.9 44.382 390 390 0 4.895 0 0 4.4 0 0 3.6 10326000 0 0 4188700 0 0 6137500 0 0 2468200 0 0 0 0 0 1 0 0 1 2 240 2131;4874 True;True 2211;5078 8143;18554 8185;18672 8185;18672 -1
YDR002W YDR002W 2 2 2 YDR002W pep chromosome:R64-1-1:IV:453045:453650:1 gene:YDR002W transcript:YDR002W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YRB1 description:Ran GTPase binding protein; involved in nuclear protein import and RNA export, 1 2 2 2 1 0 2 1 2 1 1 0 2 1 2 1 1 0 2 1 2 1 15.9 15.9 15.9 22.953 201 201 0 12.354 10.4 0 15.9 10.4 15.9 5.5 36169000 6893300 0 16426000 2944600 5087900 4817600 0 0 9776400 0 16725000 0 1 0 2 1 2 1 7 241 3812;10416 True;True 3963;10918 14492;14493;14494;14495;39924;39925;39926 14591;14592;14593;14594;40161;40162;40163 14594;40161 -1
YDR011W YDR011W 1 1 1 YDR011W pep chromosome:R64-1-1:IV:465919:470424:1 gene:YDR011W transcript:YDR011W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SNQ2 description:Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter; multidrug transporter 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.7 0.7 0.7 168.76 1501 1501 0.00083264 3.1904 0 0 0 0 0.7 0 525660 0 0 0 0 525660 0 0 0 0 0 1738000 0 0 0 0 0 1 0 1 242 1336 True 1391 5372 5407 5407 -1
YDR012W YDR012W 25 2 2 YDR012W pep chromosome:R64-1-1:IV:471853:472941:1 gene:YDR012W transcript:YDR012W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL4B description:Ribosomal 60S subunit protein L4B; homologous to mammalian ribosomal protein 1 25 2 2 19 20 21 21 19 19 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 75.1 4.4 4.4 39.062 362 362 0 4.5537 71 70.7 61 71 70.7 67.1 1028200000 245600000 78815000 250680000 138900000 97815000 216380000 312520000 0 142890000 300990000 314170000 223460000 2 1 3 3 2 2 13 243 237;920;2729;2730;2986;3237;4160;4161;4162;4495;5251;5652;7974;8037;8092;8509;8969;9540;10141;10142;10258;10925;11009;11059;11900 False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;True;True;False;False;False;False;False 248;963;2823;2824;3092;3353;4330;4331;4332;4688;5471;5890;8378;8442;8499;8933;9409;9410;10008;10635;10636;10756;11447;11535;11586;12463 1023;1024;1025;1026;1027;1028;1029;1030;1031;1032;3826;3827;3828;3829;3830;3831;3832;3833;3834;10307;10308;10309;10310;10311;10312;10313;10314;10315;10316;10317;10318;10319;10320;10321;10322;10323;10324;10325;10326;10327;11283;11284;11285;11286;11287;11288;11289;11290;11291;11292;12230;12231;12232;12233;12234;12235;12236;12237;12238;15819;15820;15821;15822;15823;15824;15825;15826;15827;15828;15829;15830;15831;15832;15833;15834;15835;15836;15837;15838;15839;17121;17122;17123;17124;17125;17126;17127;17128;17129;17130;17131;17132;20082;21686;21687;21688;21689;21690;21691;30574;30575;30576;30577;30578;30579;30580;30581;30582;30583;30584;30585;30586;30587;30588;30589;30590;30818;31020;31021;31022;31023;32440;32441;32442;32443;32444;32445;32446;32447;32448;32449;32450;34186;34187;34188;34189;34190;34191;34192;34193;34194;36583;36584;36585;36586;36587;38875;38876;38877;38878;38879;38880;38881;38882;38883;38884;38885;38886;38887;39370;39371;39372;39373;39374;39375;39376;39377;39378;41981;41982;41983;41984;41985;42360;42361;42547;42548;42549;42550;42551;42552;42553;42554;42555;42556;42557;42558;46014;46015;46016;46017;46018;46019;46020;46021;46022;46023;46024;46025;46026;46027;46028;46029;46030;46031;46032;46033 1025;1026;1027;1028;1029;1030;1031;1032;1033;1034;3840;3841;3842;3843;3844;3845;3846;3847;3848;10365;10366;10367;10368;10369;10370;10371;10372;10373;10374;10375;10376;10377;10378;10379;10380;10381;10382;10383;10384;10385;11362;11363;11364;11365;11366;11367;11368;11369;11370;11371;12315;12316;12317;12318;12319;12320;12321;12322;12323;15928;15929;15930;15931;15932;15933;15934;15935;15936;15937;15938;15939;15940;15941;15942;15943;15944;15945;15946;15947;15948;17235;17236;17237;17238;17239;17240;17241;17242;17243;17244;17245;17246;20206;21815;21816;21817;21818;21819;21820;30764;30765;30766;30767;30768;30769;30770;30771;30772;30773;30774;30775;30776;30777;30778;30779;30780;31010;31212;31213;31214;31215;32636;32637;32638;32639;32640;32641;32642;32643;32644;32645;32646;34392;34393;34394;34395;34396;34397;34398;34399;34400;36799;36800;36801;36802;36803;39110;39111;39112;39113;39114;39115;39116;39117;39118;39119;39120;39121;39122;39606;39607;39608;39609;39610;39611;39612;39613;39614;42245;42246;42247;42248;42249;42655;42656;42842;42843;42844;42845;42846;42847;42848;42849;42850;42851;42852;42853;46330;46331;46332;46333;46334;46335;46336;46337;46338;46339;46340;46341;46342;46343;46344;46345;46346;46347;46348;46349;46350 1032;3840;10369;10378;11364;12321;15929;15939;15948;17235;20206;21818;30769;31010;31212;32646;34400;36800;39110;39122;39613;42247;42656;42853;46334 49 93 -1
YDR019C YDR019C 3 3 3 YDR019C pep chromosome:R64-1-1:IV:484163:485365:-1 gene:YDR019C transcript:YDR019C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GCV1 description:T subunit of the mitochondrial glycine decarboxylase complex; glycine decarbo 1 3 3 3 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 11.5 11.5 11.5 44.468 400 400 0 11.354 0 0 9.2 0 0 7.8 35815000 0 0 23290000 0 0 12525000 0 0 13723000 0 0 0 0 0 1 0 0 2 3 244 912;9265;10437 True;True;True 955;9719;10944 3781;3782;35507;39996 3795;3796;35715;40233 3796;35715;40233 -1
YDR021W YDR021W 1 1 1 YDR021W pep chromosome:R64-1-1:IV:486804:488003:1 gene:YDR021W transcript:YDR021W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FAL1 description:Nucleolar protein required for maturation of 18S rRNA; member of the eIF4A sub 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 5.3 5.3 5.3 45.213 399 399 0 4.9857 0 0 5.3 0 0 5.3 26246000 0 0 14541000 0 0 11705000 0 0 0 0 0 11705000 0 0 1 0 0 1 2 245 7982 True 8386 30620;30621 30810;30811 30811 126 169 -1
YDR023W YDR023W 10 10 10 YDR023W pep chromosome:R64-1-1:IV:489508:490896:1 gene:YDR023W transcript:YDR023W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SES1 description:Cytosolic seryl-tRNA synthetase; class II aminoacyl-tRNA synthetase that amino 1 10 10 10 6 4 4 7 4 6 6 4 4 7 4 6 6 4 4 7 4 6 31.4 31.4 31.4 53.309 462 462 0 40.065 22.1 16.2 14.7 27.5 15.6 17.1 334070000 84938000 36216000 59481000 47808000 14328000 91297000 56116000 81275000 74470000 92305000 90732000 66668000 5 4 4 6 4 6 29 246 1104;1888;3914;4802;7158;7357;10538;10539;10975;12072 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1154;1959;4073;5003;7480;7481;7723;11045;11046;11500;12635 4543;4544;4545;7329;7330;14891;18263;18264;27388;27389;27390;27391;27392;28215;28216;28217;40373;40374;40375;42235;42236;42237;42238;42239;42240;46743;46744;46745;46746;46747;46748 4569;4570;4571;7370;7371;14995;18380;18381;27557;27558;27559;27560;27561;28390;28391;28392;40614;40615;40616;42530;42531;42532;42533;42534;42535;47068;47069;47070;47071;47072;47073 4569;7370;14995;18381;27560;28392;40614;40616;42534;47069 127 1 -1
YDR033W YDR033W 6 6 4 YDR033W pep chromosome:R64-1-1:IV:508147:509109:1 gene:YDR033W transcript:YDR033W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRH1 description:Protein that localizes primarily to the plasma membrane; also found at the nuc 1 6 6 4 3 5 4 4 5 5 3 5 4 4 5 5 3 4 4 3 3 4 17.5 17.5 10.9 36.19 320 320 0 26.643 10.3 15.3 10.9 15.3 12.2 15.3 993580000 76861000 94805000 428680000 92893000 60660000 239680000 139670000 191190000 283100000 183050000 185410000 207540000 3 6 5 5 5 7 31 247 696;697;2964;4462;5883;8021 True;True;True;True;True;True 736;737;3070;4653;6128;8426 2891;2892;2893;2894;2895;2896;2897;2898;2899;2900;2901;2902;2903;2904;2905;2906;2907;11229;16986;16987;16988;16989;22535;22536;22537;22538;22539;30761;30762;30763;30764;30765 2901;2902;2903;2904;2905;2906;2907;2908;2909;2910;2911;2912;2913;2914;2915;2916;2917;11306;17100;17101;17102;17103;22669;22670;22671;22672;22673;30951;30952;30953;30954;30955 2909;2912;11306;17102;22673;30952 -1
YDR035W YDR035W 1 1 1 YDR035W pep chromosome:R64-1-1:IV:521816:522928:1 gene:YDR035W transcript:YDR035W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARO3 description:3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate (DAHP) synthase; catalyzes the fir 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3.5 3.5 3.5 41.069 370 370 0.00084459 3.3142 0 3.5 0 0 0 0 787790 0 787790 0 0 0 0 0 1708800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 248 1798 True 1865 7070 7110 7110 -1
YDR036C YDR036C 1 1 1 YDR036C pep chromosome:R64-1-1:IV:523211:524713:-1 gene:YDR036C transcript:YDR036C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EHD3 description:3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase; member of a family of enoyl-CoA hydratase/ 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 5.6 5.6 5.6 56.288 500 500 1 -2 0 0 0 0 5.6 0 1161400 0 0 0 0 1161400 0 0 0 0 0 3840000 0 0 0 0 0 1 0 1 + 249 7509 True 7886 28850 29031 29031 128 301 -1
YDR037W YDR037W 34 34 34 YDR037W pep chromosome:R64-1-1:IV:525440:527215:1 gene:YDR037W transcript:YDR037W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KRS1 description:Lysyl-tRNA synthetase [Source:SGD;Acc:S000002444] 1 34 34 34 28 25 22 25 19 24 28 25 22 25 19 24 28 25 22 25 19 24 55.5 55.5 55.5 67.958 591 591 0 311.98 50.9 47.4 46.5 50.6 35.9 45.7 6521300000 1410600000 1167500000 1321400000 985120000 448430000 1188300000 1401000000 2303700000 927450000 2170000000 1400700000 1218800000 41 43 31 43 29 31 218 250 4;9;757;1385;1706;2064;2222;2307;2542;2853;2885;3770;4386;4450;4451;4928;5064;5067;5156;5321;5328;5517;6867;7159;8291;8498;9996;10157;10971;11447;11448;12033;12110;12111 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4;5;10;798;1443;1771;2141;2304;2390;2631;2954;2987;3919;4565;4639;4640;4641;4642;5134;5274;5277;5368;5544;5551;5753;5754;7154;7155;7482;7483;8708;8921;10485;10653;11496;11984;11985;11986;11987;12596;12673;12674;12675 20;21;22;23;24;25;26;27;28;44;45;46;47;3179;5552;5553;5554;5555;6749;6750;6751;6752;6753;6754;6755;6756;6757;6758;6759;6760;7883;7884;7885;7886;7887;8480;8481;8482;8483;8484;8783;8784;8785;8786;8787;8788;8789;8790;8791;8792;9568;9569;9570;9571;9572;9573;9574;9575;9576;9577;10827;10828;10829;10830;10831;10968;14344;16648;16649;16650;16651;16652;16653;16654;16655;16656;16943;16944;16945;16946;16947;16948;16949;16950;16951;16952;16953;16954;16955;16956;16957;16958;18765;18766;18767;19324;19325;19342;19343;19344;19345;19346;19347;19695;19696;19697;19698;19699;19700;19701;19702;19703;19704;19705;19706;19707;19708;20341;20342;20343;20344;20345;20346;20372;20373;21235;21236;21237;21238;21239;21240;21241;21242;21243;21244;26248;26249;27393;27394;27395;27396;27397;27398;27399;27400;27401;27402;31688;31689;31690;31691;32393;32394;32395;32396;32397;32398;32399;32400;32401;38335;38336;38337;38338;38339;38340;38341;38342;38971;38972;38973;38974;38975;38976;42231;44191;44192;44193;44194;44195;44196;44197;44198;44199;44200;44201;44202;44203;44204;44205;44206;44207;44208;44209;44210;44211;44212;44213;44214;44215;44216;46615;46616;46617;46618;46885;46886;46887;46888;46889;46890;46891;46892;46893;46894;46895;46896;46897;46898 20;21;22;23;24;25;26;27;28;44;45;46;47;3190;5587;5588;5589;5590;6789;6790;6791;6792;6793;6794;6795;6796;6797;6798;6799;6800;7925;7926;7927;7928;7929;8523;8524;8525;8526;8527;8828;8829;8830;8831;8832;8833;8834;8835;8836;8837;9616;9617;9618;9619;9620;9621;9622;9623;9624;9625;10895;10896;10897;10898;10899;11044;14443;16758;16759;16760;16761;16762;16763;16764;16765;16766;16767;17056;17057;17058;17059;17060;17061;17062;17063;17064;17065;17066;17067;17068;17069;17070;17071;18886;18887;18888;19447;19448;19465;19466;19467;19468;19469;19470;19818;19819;19820;19821;19822;19823;19824;19825;19826;19827;19828;19829;19830;19831;20467;20468;20469;20470;20471;20472;20473;20499;20500;21362;21363;21364;21365;21366;21367;21368;21369;21370;21371;26406;26407;27562;27563;27564;27565;27566;27567;27568;27569;27570;27571;31884;31885;31886;31887;32589;32590;32591;32592;32593;32594;32595;32596;32597;38567;38568;38569;38570;38571;38572;38573;38574;39206;39207;39208;39209;39210;39211;42526;44496;44497;44498;44499;44500;44501;44502;44503;44504;44505;44506;44507;44508;44509;44510;44511;44512;44513;44514;44515;44516;44517;44518;44519;44520;44521;46936;46937;46938;46939;47211;47212;47213;47214;47215;47216;47217;47218;47219;47220;47221;47222;47223;47224 22;47;3190;5587;6798;7928;8524;8833;9620;10898;11044;14443;16766;17058;17066;18886;19448;19469;19829;20472;20499;21366;26407;27568;31885;32590;38568;39210;42526;44500;44509;46936;47212;47220 129;130;131;132;133;134;135;136 26;215;239;400;447;471;472;559 -1
YDR040C;YDR039C;YDR038C YDR040C;YDR039C;YDR038C 2;2;2 2;2;2 2;2;2 YDR040C pep chromosome:R64-1-1:IV:535192:538467:-1 gene:YDR040C transcript:YDR040C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ENA1 description:P-type ATPase sodium pump; involved in Na+ and Li+ efflux to allow salt toler 3 2 2 2 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 2.7 2.7 2.7 120.36 1091 1091;1091;1091 0 10.923 0 1 1.6 0 1.6 0 8538000 0 1700400 5399400 0 1438200 0 0 0 0 0 4755400 0 0 1 1 0 1 0 3 251 7422;9845 True;True 7792;10327 28489;28490;37781 28667;28668;38011 28667;38011 -1;-1;-1
YDR041W YDR041W 1 1 1 YDR041W pep chromosome:R64-1-1:IV:539803:540414:1 gene:YDR041W transcript:YDR041W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSM10 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit; has similarity to E. co 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 5.9 5.9 5.9 23.424 203 203 0 4.5614 0 5.9 5.9 5.9 0 0 12506000 0 2559500 8458900 1487600 0 0 0 0 0 3060100 0 0 0 1 1 1 0 0 3 252 9319 True 9775 35714;35715;35716 35922;35923;35924 35922 -1
YDR049W YDR049W 8 8 8 YDR049W pep chromosome:R64-1-1:IV:553254:555152:1 gene:YDR049W transcript:YDR049W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VMS1 description:Component of a Cdc48p-complex involved in protein quality control; exhibits cy 1 8 8 8 4 2 1 3 3 1 4 2 1 3 3 1 4 2 1 3 3 1 18.7 18.7 18.7 72.733 632 632 0 30.663 9 5.9 3.8 7 7.3 3.3 57971000 23360000 5514200 8686700 7784800 4422400 8203200 0 13616000 0 14016000 14965000 0 4 2 1 3 3 1 14 253 676;3479;4992;5242;5808;7382;12193;12209 True;True;True;True;True;True;True;True 714;3613;5198;5462;6051;7750;12761;12778 2834;13255;18990;18991;18992;18993;20056;22260;28328;47184;47240;47241;47242;47243 2843;13344;19112;19113;19114;19115;20180;22391;28505;47513;47569;47570;47571;47572 2843;13344;19114;20180;22391;28505;47513;47570 -1
YDR050C YDR050C 4 4 4 YDR050C pep chromosome:R64-1-1:IV:555726:556472:-1 gene:YDR050C transcript:YDR050C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TPI1 description:Triose phosphate isomerase, abundant glycolytic enzyme; mRNA half-life is reg 1 4 4 4 4 1 2 0 2 1 4 1 2 0 2 1 4 1 2 0 2 1 27.8 27.8 27.8 26.795 248 248 0 16.061 27.8 8.1 16.1 0 13.7 3.6 131760000 56722000 7764100 35026000 0 12367000 19881000 47146000 0 43095000 0 45375000 0 4 1 2 0 2 1 10 254 788;1231;5268;11855 True;True;True;True 829;1282;5489;12414 3276;3277;3278;4961;4962;20125;20126;20127;45841;45842 3287;3288;3289;4988;4989;20249;20250;20251;46157;46158 3287;4988;20249;46157 -1
YDR051C YDR051C 1 1 1 YDR051C pep chromosome:R64-1-1:IV:557056:558060:-1 gene:YDR051C transcript:YDR051C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DET1 description:Acid phosphatase; involved in the non-vesicular transport of sterols in both 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 5.1 5.1 5.1 39.172 334 334 0 4.7481 0 0 0 5.1 0 5.1 3765200 0 0 0 1519700 0 2245500 0 0 0 0 0 2245500 0 0 0 1 0 1 2 255 3024 True 3132 11428;11429 11507;11508 11507 -1
YDR060W YDR060W 19 19 19 YDR060W pep chromosome:R64-1-1:IV:570649:573726:1 gene:YDR060W transcript:YDR060W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MAK21 description:Constituent of 66S pre-ribosomal particles; required for large (60S) ribosoma 1 19 19 19 11 10 11 12 10 13 11 10 11 12 10 13 11 10 11 12 10 13 27.8 27.8 27.8 116.68 1025 1025 0 80.087 15.6 14.9 17.7 18 13.9 19.8 993100000 180160000 80651000 318020000 97910000 47511000 268840000 216960000 196350000 173480000 211860000 211240000 203560000 12 10 12 14 10 15 73 256 185;773;844;1547;2443;2498;3080;3364;4484;4596;5697;5756;7822;7844;8859;9615;10411;10757;11229 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 195;814;887;1610;2528;2585;3189;3486;3487;4676;4792;5938;5997;8221;8244;9295;10084;10913;11273;11766 804;3232;3233;3234;3235;3236;3502;3503;6171;6172;9264;9265;9266;9267;9268;9269;9428;9429;9430;9431;9432;9433;11647;12742;12743;12744;12745;12746;12747;12748;12749;17082;17536;17537;17538;17539;21845;22033;22034;22035;22036;22037;22038;30059;30060;30153;30154;30155;33795;33796;33797;33798;33799;33800;36822;36823;36824;36825;36826;36827;36828;36829;39911;39912;39913;39914;41374;43263;43264;43265;43266;43267;43268;43269;43270 805;3243;3244;3245;3246;3247;3515;3516;6207;6208;9311;9312;9313;9314;9315;9316;9476;9477;9478;9479;9480;9481;11729;12828;12829;12830;12831;12832;12833;12834;12835;17196;17651;17652;17653;17654;21975;22163;22164;22165;22166;22167;22168;30247;30248;30341;30342;30343;33996;33997;33998;33999;34000;34001;37041;37042;37043;37044;37045;37046;37047;37048;40148;40149;40150;40151;41634;43561;43562;43563;43564;43565;43566;43567;43568 805;3247;3515;6207;9315;9477;11729;12832;17196;17651;21975;22163;30247;30342;34000;37047;40149;41634;43566 137;138 274;806 -1
YDR064W YDR064W 12 12 12 YDR064W pep chromosome:R64-1-1:IV:579458:580452:1 gene:YDR064W transcript:YDR064W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS13 description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mammali 1 12 12 12 8 9 8 8 9 11 8 9 8 8 9 11 8 9 8 8 9 11 66.2 66.2 66.2 17.029 151 151 0 56.472 45 53 45.7 57.6 55.6 61.6 9281500000 1486700000 821960000 3266400000 742330000 529360000 2434700000 2210800000 1509800000 2163500000 1551100000 1825100000 2101400000 11 11 12 10 10 14 68 257 1069;2597;3052;3173;5071;5986;6714;7348;9382;9383;10676;11947 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1117;2691;3161;3286;5281;6237;6994;7713;9843;9844;11187;12510 4425;4426;4427;4428;4429;9828;9829;11544;11545;11546;11547;11994;11995;11996;11997;11998;19363;19364;19365;19366;19367;19368;19369;19370;19371;19372;22956;22957;22958;22959;22960;25614;25615;25616;25617;25618;28178;35976;35977;35978;35979;35980;35981;35982;35983;35984;35985;35986;35987;35988;35989;35990;35991;35992;35993;35994;35995;40877;40878;40879;40880;40881;40882;46229;46230;46231 4450;4451;4452;4453;4454;9879;9880;11624;11625;11626;11627;11628;12079;12080;12081;12082;12083;19486;19487;19488;19489;19490;19491;19492;19493;19494;19495;23091;23092;23093;23094;23095;25768;25769;25770;25771;25772;28353;36187;36188;36189;36190;36191;36192;36193;36194;36195;36196;36197;36198;36199;36200;36201;36202;36203;36204;36205;36206;41121;41122;41123;41124;41125;41126;41127;41128;41129;46546;46547;46548 4453;9880;11628;12080;19495;23094;25769;28353;36189;36198;41124;46547 -1
YDR067C YDR067C 2 2 2 YDR067C pep chromosome:R64-1-1:IV:582791:583465:-1 gene:YDR067C transcript:YDR067C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OCA6 description:Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus; S. cerevi 1 2 2 2 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 11.2 11.2 11.2 26.024 224 224 0.00081833 3.005 0 0 3.6 0 7.6 0 3226400 0 0 1688300 0 1538100 0 0 0 0 0 5085300 0 0 0 1 0 1 0 2 258 1736;10409 True;True 1803;10911 6874;39909 6914;40146 6914;40146 -1
YDR071C YDR071C 7 7 7 YDR071C pep chromosome:R64-1-1:IV:588827:589402:-1 gene:YDR071C transcript:YDR071C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PAA1 description:Polyamine acetyltransferase; acetylates polyamines (e.g. putrescine, spermidi 1 7 7 7 2 2 6 4 3 2 2 2 6 4 3 2 2 2 6 4 3 2 43.5 43.5 43.5 21.947 191 191 0 42.519 15.2 15.2 38.7 26.7 19.9 15.2 169040000 7047200 4832400 120820000 12483000 4612100 19246000 13885000 16069000 57919000 22788000 14654000 25740000 2 2 7 6 3 2 22 259 775;832;1845;4817;5249;5993;7636 True;True;True;True;True;True;True 816;874;1914;5019;5469;6244;8017 3239;3456;7213;7214;18320;18321;18322;18323;18324;18325;20080;22985;22986;22987;22988;22989;22990;22991;29281;29282;29283;29284 3250;3469;7253;7254;18437;18438;18439;18440;18441;18442;20204;23120;23121;23122;23123;23124;23125;23126;29464;29465;29466;29467 3250;3469;7253;18440;20204;23122;29465 -1
YDR074W YDR074W 6 6 6 YDR074W pep chromosome:R64-1-1:IV:593893:596583:1 gene:YDR074W transcript:YDR074W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TPS2 description:Phosphatase subunit of the trehalose-6-P synthase/phosphatase complex; involve 1 6 6 6 3 0 1 0 2 2 3 0 1 0 2 2 3 0 1 0 2 2 9.3 9.3 9.3 102.98 896 896 0 8.9416 5.1 0 2.2 0 2.9 2.5 33682000 13172000 0 12872000 0 2326400 5310900 17205000 0 0 0 0 0 2 0 1 0 1 2 6 260 1783;1955;4152;8185;10010;10784 True;True;True;True;True;True 1850;2030;4322;8596;10499;11302 7025;7492;15771;31296;31297;38368;38369;41506 7065;7533;15879;31491;31492;38600;38601;41769 7065;7533;15879;31492;38601;41769 -1
YDR083W YDR083W 13 13 13 YDR083W pep chromosome:R64-1-1:IV:612073:613251:1 gene:YDR083W transcript:YDR083W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RRP8 description:Nucleolar S-adenosylmethionine-dependent rRNA methyltransferase; methylates ad 1 13 13 13 7 5 10 6 6 8 7 5 10 6 6 8 7 5 10 6 6 8 36 36 36 45.985 392 392 0 53.534 21.4 15.8 31.9 19.9 17.9 23.7 401760000 65694000 31168000 170550000 27985000 17908000 88455000 98354000 68965000 73670000 73995000 67996000 76164000 8 5 11 6 7 9 46 261 484;1967;2212;2213;2322;2609;4764;5088;5979;8287;9525;11799;11808 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 512;2042;2294;2295;2406;2703;4964;5298;6230;8704;9993;12358;12367 2086;2087;2088;2089;7540;7541;7542;8449;8450;8451;8452;8453;8454;8455;8852;8853;9868;9869;18148;18149;18150;18151;18152;19449;19450;22937;22938;31680;31681;36525;36526;36527;36528;36529;45695;45696;45697;45698;45699;45700;45701;45702;45722;45723;45724;45725 2092;2093;2094;2095;7582;7583;7584;8492;8493;8494;8495;8496;8497;8498;8897;8898;9919;9920;18265;18266;18267;18268;18269;19572;19573;23072;23073;31876;31877;36741;36742;36743;36744;36745;46010;46011;46012;46013;46014;46015;46016;46017;46018;46038;46039;46040;46041 2093;7584;8496;8498;8897;9919;18266;19572;23072;31876;36742;46016;46038 -1
YDR086C YDR086C 2 2 2 YDR086C pep chromosome:R64-1-1:IV:616928:617170:-1 gene:YDR086C transcript:YDR086C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSS1 description:Subunit of the Sec61p translocation complex (Sec61p-Sss1p-Sbh1p); this comple 1 2 2 2 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 1 1 22.5 22.5 22.5 8.9435 80 80 0 3.9534 0 22.5 12.5 0 12.5 12.5 56278000 0 20556000 12818000 0 7917900 14985000 0 44589000 0 0 0 0 0 2 1 0 1 1 5 262 1683;6854 True;True 1748;7141 6633;26185;26186;26187;26188 6669;26342;26343;26344;26345 6669;26343 -1
YDR087C YDR087C 6 6 6 YDR087C pep chromosome:R64-1-1:IV:617470:618306:-1 gene:YDR087C transcript:YDR087C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RRP1 description:Essential evolutionarily conserved nucleolar protein; necessary for biogenesi 1 6 6 6 4 0 5 3 2 3 4 0 5 3 2 3 4 0 5 3 2 3 27.3 27.3 27.3 33.202 278 278 0 61.623 17.3 0 27 13.7 7.9 16.5 230830000 19328000 0 162740000 12425000 6636400 29694000 20777000 0 61332000 25444000 40996000 49790000 4 0 7 3 2 3 19 263 4207;5334;5524;10484;11352;11745 True;True;True;True;True;True 4379;5559;5761;10991;11889;12302 15991;15992;15993;20395;20396;20397;21268;21269;21270;21271;40185;40186;40187;40188;40189;40190;43794;43795;45480 16100;16101;16102;20522;20523;20524;21395;21396;21397;21398;40426;40427;40428;40429;40430;40431;44093;44094;45794 16102;20523;21398;40429;44093;45794 -1
YDR091C YDR091C 31 31 31 YDR091C pep chromosome:R64-1-1:IV:626708:628534:-1 gene:YDR091C transcript:YDR091C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RLI1 description:Essential Fe-S protein; required for ribosome biogenesis, translation initiat 1 31 31 31 22 20 19 20 18 16 22 20 19 20 18 16 22 20 19 20 18 16 51 51 51 68.34 608 608 0 171.97 40.1 35.5 36.3 39.8 35.7 31.4 1857400000 338340000 189310000 626810000 194320000 135170000 373480000 450640000 387420000 377130000 415730000 402400000 396030000 23 20 19 20 20 16 118 264 200;343;662;1048;1180;1666;2177;2602;3249;3296;3727;3754;3825;4359;4360;4442;6112;6113;6348;6449;6491;6637;7075;7162;7693;7694;8024;8220;8477;9592;12276 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 210;361;700;1096;1231;1730;2257;2696;3366;3416;3873;3902;3976;4538;4539;4629;4630;6363;6364;6613;6719;6767;6915;7380;7488;8079;8080;8429;8634;8899;10061;12847 864;865;866;867;868;1513;1514;1515;1516;1517;1518;2776;2777;2778;2779;2780;4362;4814;6576;6577;6578;6579;6580;8309;8310;8311;8312;8313;9845;9846;9847;9848;9849;9850;12290;12291;12292;12293;12294;12295;12489;12490;12491;14155;14156;14157;14158;14159;14160;14269;14270;14528;14529;16540;16541;16542;16543;16544;16545;16546;16547;16548;16887;16888;16889;16890;16891;16892;16893;16894;16895;23471;23472;23473;23474;23475;23476;23477;23478;24245;24246;24247;24248;24653;24654;24812;24813;24814;24815;24816;24817;25340;25341;27054;27425;27426;27427;27428;29482;29483;29484;29485;29486;29487;30771;31431;31432;31433;31434;32326;32327;32328;32329;36746;36747;36748;36749;36750;47501 866;867;868;869;870;1516;1517;1518;1519;1520;1521;2785;2786;2787;2788;2789;4385;4840;6612;6613;6614;6615;6616;8352;8353;8354;8355;8356;9896;9897;9898;9899;9900;9901;12375;12376;12377;12378;12379;12380;12575;12576;12577;14252;14253;14254;14255;14256;14257;14367;14368;14627;14628;16650;16651;16652;16653;16654;16655;16656;16657;16658;17000;17001;17002;17003;17004;17005;17006;17007;17008;23611;23612;23613;23614;23615;23616;23617;23618;24393;24394;24395;24396;24802;24803;24961;24962;24963;24964;24965;24966;25494;25495;27216;27594;27595;27596;27597;29666;29667;29668;29669;29670;29671;30961;31627;31628;31629;31630;32522;32523;32524;32525;36964;36965;36966;36967;36968;47832 868;1521;2788;4385;4840;6616;8355;9900;12380;12575;14255;14368;14627;16650;16657;17004;23612;23616;24396;24803;24962;25494;27216;27594;29670;29671;30961;31628;32524;36966;47832 139 590 -1
YDR097C YDR097C 16 16 16 YDR097C pep chromosome:R64-1-1:IV:640109:643837:-1 gene:YDR097C transcript:YDR097C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MSH6 description:Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis; forms a complex 1 16 16 16 6 6 4 8 8 4 6 6 4 8 8 4 6 6 4 8 8 4 16.7 16.7 16.7 140.08 1242 1242 0 34.032 5.6 6.4 4.3 9.2 8.8 4 130290000 37157000 17651000 20379000 21786000 12050000 21268000 38782000 39455000 24212000 38063000 37176000 27067000 6 5 4 8 8 4 35 265 1259;1415;1727;1961;2529;4272;5657;5775;5869;7765;8372;9226;9281;9869;10472;11810 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1310;1474;1794;2036;2617;4448;5895;6017;6114;8161;8790;9677;9735;10352;10979;12369 5066;5067;5068;5667;6858;6859;7517;9520;9521;9522;9523;16232;21715;22102;22103;22104;22105;22106;22483;22484;22485;22486;29860;29861;29862;29863;31954;31955;31956;35364;35552;37892;37893;40131;40132;45733 5094;5095;5096;5702;6898;6899;7558;9568;9569;9570;9571;16341;21844;22232;22233;22234;22235;22236;22617;22618;22619;22620;30047;30048;30049;30050;32150;32151;32152;35572;35760;38122;38123;40369;40370;46049 5095;5702;6899;7558;9570;16341;21844;22235;22618;30048;32151;35572;35760;38123;40370;46049 -1
YDR098C YDR098C 1 1 1 YDR098C pep chromosome:R64-1-1:IV:644178:644930:-1 gene:YDR098C transcript:YDR098C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GRX3 description:Glutathione-dependent oxidoreductase; hydroperoxide and superoxide-radical re 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 5.2 5.2 5.2 28.261 250 250 0.0051929 2.0314 5.2 0 5.2 5.2 0 5.2 11179000 1656300 0 4689300 1136600 0 3696800 0 0 0 0 0 3696800 1 0 1 1 0 1 4 266 2263 True 2345 8621;8622;8623;8624 8666;8667;8668;8669 8666 -1
YDR101C YDR101C 3 3 3 YDR101C pep chromosome:R64-1-1:IV:655686:657467:-1 gene:YDR101C transcript:YDR101C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARX1 description:Nuclear export factor for the ribosomal pre-60S subunit; shuttling factor whi 1 3 3 3 0 1 0 1 1 2 0 1 0 1 1 2 0 1 0 1 1 2 4.9 4.9 4.9 65.212 593 593 0 9.8607 0 1.2 0 2.2 2.2 2.7 17593000 0 9074800 0 2277500 1381000 4859800 0 0 0 0 4566200 0 0 1 0 1 1 2 5 267 2409;5879;11861 True;True;True 2494;6124;12422 9157;9158;22517;22518;45879 9204;9205;22651;22652;46195 9204;22652;46195 -1
YDR110W YDR110W 1 1 1 YDR110W pep chromosome:R64-1-1:IV:676102:677802:1 gene:YDR110W transcript:YDR110W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FOB1 description:Nucleolar protein that binds the rDNA replication fork barrier site; required 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1.4 1.4 1.4 65.318 566 566 0.0051967 2.0478 0 0 1.4 0 0 0 2463700 0 0 2463700 0 0 0 0 0 1451800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 268 11092 True 11620 42705 43000 43000 -1
YDR116C YDR116C 2 2 2 YDR116C pep chromosome:R64-1-1:IV:682724:683581:-1 gene:YDR116C transcript:YDR116C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL1 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit [Source:SGD;Acc:S000002 1 2 2 2 0 1 2 1 1 1 0 1 2 1 1 1 0 1 2 1 1 1 13.7 13.7 13.7 30.996 285 285 0 8.4399 0 5.6 13.7 5.6 5.6 5.6 39472000 0 5039700 18657000 5219700 3384600 7170700 0 0 10994000 0 0 0 0 1 2 1 1 1 6 269 27;10635 True;True 29;11143 99;40676;40677;40678;40679;40680 99;40919;40920;40921;40922;40923 99;40921 -1
YDR117C YDR117C 8 8 8 YDR117C pep chromosome:R64-1-1:IV:683946:685643:-1 gene:YDR117C transcript:YDR117C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TMA64 description:Protein of unknown function that associates with ribosomes; has a putative R 1 8 8 8 2 3 2 4 1 2 2 3 2 4 1 2 2 3 2 4 1 2 17.9 17.9 17.9 63.991 565 565 0 42.904 4.6 6 5.5 10.8 3 5.5 79680000 9833600 15548000 25874000 11212000 3167200 14045000 0 0 19928000 18383000 0 0 2 3 2 4 1 2 14 270 590;6285;7906;8178;8398;9793;11123;11520 True;True;True;True;True;True;True;True 622;6544;8306;8589;8819;10274;11654;12062 2544;24047;30318;30319;31284;32054;37568;37569;37570;37571;37572;37573;42815;44494 2551;24192;30507;30508;31479;32250;37797;37798;37799;37800;37801;37802;43110;44800 2551;24192;30507;31479;32250;37798;43110;44800 -1
YDR120C YDR120C 15 15 15 YDR120C pep chromosome:R64-1-1:IV:691549:693261:-1 gene:YDR120C transcript:YDR120C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRM1 description:tRNA methyltransferase; two forms of protein are made by alternative translat 1 15 15 15 4 9 5 12 7 5 4 9 5 12 7 5 4 9 5 12 7 5 33.7 33.7 33.7 64.052 570 570 0 61.262 12.1 24.6 13.9 29.5 20 13.9 371010000 30048000 70676000 105650000 75312000 25812000 63507000 55821000 123830000 65946000 120600000 91841000 77744000 4 11 6 12 7 6 46 271 130;621;1584;1629;2029;2053;4366;4438;4439;5024;6632;7406;7950;7967;12303 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 136;656;1647;1692;2106;2130;4545;4625;4626;5233;6910;7775;8352;8353;8370;12876 555;2639;2640;6292;6293;6294;6453;7740;7837;7838;7839;7840;7841;7842;7843;7844;16572;16573;16574;16575;16576;16873;16874;16875;16876;16877;16878;19149;25325;25326;25327;25328;25329;25330;28419;28420;30506;30507;30508;30509;30510;30511;30512;30513;30514;30560;47608 556;2646;2647;6328;6329;6330;6489;7782;7879;7880;7881;7882;7883;7884;7885;7886;16682;16683;16684;16685;16686;16986;16987;16988;16989;16990;16991;19272;25479;25480;25481;25482;25483;25484;28596;28597;30696;30697;30698;30699;30700;30701;30702;30703;30704;30750;47940 556;2647;6329;6489;7782;7885;16685;16988;16990;19272;25481;28597;30699;30750;47940 140 197 -1
YDR127W YDR127W 20 20 20 YDR127W pep chromosome:R64-1-1:IV:704484:709250:1 gene:YDR127W transcript:YDR127W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARO1 description:Pentafunctional arom protein; catalyzes steps 2 through 6 in the biosynthesis 1 20 20 20 9 4 12 8 3 10 9 4 12 8 3 10 9 4 12 8 3 10 17.1 17.1 17.1 174.75 1588 1588 0 70.02 9.9 4.4 12.3 9 3.2 8.6 378160000 35772000 8373400 236210000 16924000 8869800 72016000 51128000 46217000 86033000 39479000 35063000 82308000 8 4 13 8 4 10 47 272 333;1832;2339;2340;2377;2480;2724;4244;4969;6087;6313;6842;7229;7298;7332;7431;10486;10487;11290;11964 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 351;1901;2423;2424;2461;2566;2818;4417;5175;6338;6574;7129;7572;7661;7697;7801;10993;10994;11827;12527 1482;7176;8897;8898;8899;8900;8901;8902;8903;9012;9384;9385;9386;10288;16126;18909;23367;23368;23369;23370;24148;24149;24150;26152;26153;27703;27704;28007;28008;28110;28111;28112;28515;28516;28517;40193;40194;40195;43533;43534;43535;43536;43537;43538;43539;43540;46293;46294 1485;7216;8942;8943;8944;8945;8946;8947;8948;9058;9432;9433;9434;10342;16235;19031;23504;23505;23506;23507;24295;24296;24297;26309;26310;27876;27877;28181;28182;28284;28285;28286;28693;28694;28695;40434;40435;40436;43831;43832;43833;43834;43835;43836;43837;43838;46611;46612 1485;7216;8946;8948;9058;9434;10342;16235;19031;23505;24295;26310;27877;28182;28285;28695;40435;40436;43837;46612 -1
YDR129C YDR129C 3 3 3 YDR129C pep chromosome:R64-1-1:IV:713340:715379:-1 gene:YDR129C transcript:YDR129C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SAC6 description:Fimbrin, actin-bundling protein; cooperates with Scp1p in organization and ma 1 3 3 3 0 0 2 2 1 1 0 0 2 2 1 1 0 0 2 2 1 1 9 9 9 71.772 642 642 0 11.742 0 0 4.5 6.5 2 4.5 23988000 0 0 12617000 4519700 1773900 5077000 0 0 0 9297600 0 0 0 0 2 2 1 1 6 273 5049;5995;10091 True;True;True 5259;6246;10583 19242;22996;22997;22998;38696;38697 19365;23131;23132;23133;38929;38930 19365;23132;38929 -1
YDR135C YDR135C 1 1 1 YDR135C pep chromosome:R64-1-1:IV:723004:727551:-1 gene:YDR135C transcript:YDR135C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YCF1 description:Vacuolar glutathione S-conjugate transporter; ABC-C transporter of the ATP-bi 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1.3 1.3 1.3 171.12 1515 1515 0.0037707 2.2368 0 0 0 1.3 0 0 1212100 0 0 0 1212100 0 0 0 0 0 2493500 0 0 0 0 0 1 0 0 1 274 115 True 120 496 497 497 -1
YDR141C YDR141C 6 6 6 YDR141C pep chromosome:R64-1-1:IV:734901:739997:-1 gene:YDR141C transcript:YDR141C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DOP1 description:Golgi-localized, leucine-zipper domain containing protein; involved in endoso 1 6 6 6 3 2 5 1 1 1 3 2 5 1 1 1 3 2 5 1 1 1 3.9 3.9 3.9 194.69 1698 1698 0 14.361 2 1.2 3 0.7 0.7 0.7 225480000 32389000 2493600 185300000 1275700 1259300 2758300 42124000 53670000 61109000 0 0 0 3 2 5 1 1 1 13 275 1334;4342;6261;6297;6530;9807 True;True;True;True;True;True 1389;4520;6520;6557;6806;10288 5363;5364;5365;5366;5367;16481;23969;24090;24913;24914;37633;37634;37635 5398;5399;5400;5401;5402;16591;24114;24235;25063;25064;37862;37863;37864 5399;16591;24114;24235;25064;37862 -1
YDR150W YDR150W 10 10 10 YDR150W pep chromosome:R64-1-1:IV:755628:763874:1 gene:YDR150W transcript:YDR150W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NUM1 description:Protein required for nuclear migration; component of the mitochondria-ER-corte 1 10 10 10 6 3 4 5 5 6 6 3 4 5 5 6 6 3 4 5 5 6 17.7 17.7 17.7 313.03 2748 2748 0 35.871 16.1 10.5 8.4 13.6 14 16.2 348550000 83120000 33106000 56506000 62113000 24969000 88738000 64733000 92372000 65403000 122630000 82819000 84790000 5 4 4 6 5 5 29 276 854;875;3979;4269;5187;5188;5816;5943;9030;9994 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 897;918;4140;4444;5403;5404;6059;6194;9474;10483 3550;3551;3552;3553;3554;3555;3556;3557;3623;3624;3625;15131;16223;19847;19848;19849;19850;19851;19852;19853;19854;19855;19856;22280;22281;22282;22283;22284;22825;34556;38333 3563;3564;3565;3566;3567;3568;3569;3570;3636;3637;3638;15238;16332;19970;19971;19972;19973;19974;19975;19976;19977;19978;19979;22411;22412;22413;22414;22415;22960;34763;38565 3563;3637;15238;16332;19973;19975;22411;22960;34763;38565 -1
YDR153C YDR153C 5 5 5 YDR153C pep chromosome:R64-1-1:IV:766736:767971:-1 gene:YDR153C transcript:YDR153C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ENT5 description:Protein containing an N-terminal epsin-like domain; involved in clathrin recr 1 5 5 5 5 2 3 1 2 4 5 2 3 1 2 4 5 2 3 1 2 4 16.3 16.3 16.3 47.321 411 411 0 50.242 16.3 7.8 10.7 4.1 7.3 13.4 146360000 41723000 13749000 47901000 10822000 2870000 29297000 36451000 29699000 27542000 27789000 23826000 28288000 6 3 3 2 2 3 19 277 876;2154;3194;4556;12260 True;True;True;True;True 919;2234;3308;4751;12831 3626;3627;8222;8223;8224;8225;8226;8227;8228;8229;8230;12057;12058;12059;17391;17392;47414;47415;47416;47417 3639;3640;8264;8265;8266;8267;8268;8269;8270;8271;8272;12142;12143;12144;17505;17506;47745;47746;47747;47748 3640;8268;12143;17505;47747 -1
YDR155C YDR155C 3 3 3 YDR155C pep chromosome:R64-1-1:IV:768512:769000:-1 gene:YDR155C transcript:YDR155C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CPR1 description:Cytoplasmic peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin); catalyzes the 1 3 3 3 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 24.7 24.7 24.7 17.39 162 162 0 9.0744 0 4.9 13 6.8 6.8 0 11271000 0 1685600 4585600 3113100 1887000 0 0 0 2702000 0 0 0 0 1 1 1 1 0 4 278 2910;6992;11132 True;True;True 3014;7281;11666 11042;11043;26727;42876 11119;11120;26888;43173 11119;26888;43173 -1
YDR158W YDR158W 7 7 7 YDR158W pep chromosome:R64-1-1:IV:770357:771454:1 gene:YDR158W transcript:YDR158W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HOM2 description:Aspartic beta semi-aldehyde dehydrogenase; catalyzes the second step in the co 1 7 7 7 1 3 2 3 0 1 1 3 2 3 0 1 1 3 2 3 0 1 24.4 24.4 24.4 39.543 365 365 0 18.727 3.8 10.1 6.8 12.3 0 6 41326000 2555900 7725100 17745000 7941200 0 5358400 0 13521000 0 19572000 0 0 0 3 2 3 0 1 9 279 1416;1951;1952;2337;4245;8377;11238 True;True;True;True;True;True;True 1475;2025;2026;2421;4418;8795;11775 5668;5669;7482;7483;7484;7485;8891;16127;31966;43295 5703;5704;7523;7524;7525;7526;8936;16236;32162;43593 5703;7524;7526;8936;16236;32162;43593 -1
YDR159W YDR159W 1 1 1 YDR159W pep chromosome:R64-1-1:IV:771877:775782:1 gene:YDR159W transcript:YDR159W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SAC3 description:mRNA export factor; required for biogenesis of the small ribosomal subunit; co 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.8 0.8 0.8 149.57 1301 1301 0.0008658 3.6077 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 185430000 5345700 5248300 111780000 3649900 5895400 53519000 0 0 0 0 0 53519000 1 1 1 1 1 1 6 280 2521 True 2609 9486;9487;9488;9489;9490;9491 9534;9535;9536;9537;9538;9539 9539 -1
YDR161W YDR161W 1 1 1 YDR161W pep chromosome:R64-1-1:IV:779043:780206:1 gene:YDR161W transcript:YDR161W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ACL4 description:Specific assembly chaperone for ribosomal protein Rpl4p; binds to an evolution 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 6.2 6.2 6.2 42.942 387 387 0 12.646 6.2 6.2 0 6.2 6.2 0 17633000 4455000 5345800 0 5363500 2468700 0 0 0 0 11033000 0 0 1 1 0 2 1 0 5 281 1916 True 1989 7393;7394;7395;7396;7397 7434;7435;7436;7437;7438 7438 -1
YDR164C YDR164C 17 17 17 YDR164C pep chromosome:R64-1-1:IV:782041:784215:-1 gene:YDR164C transcript:YDR164C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC1 description:Sm-like protein involved in docking and fusion of exocytic vesicles; binds to 1 17 17 17 7 6 9 7 9 5 7 6 9 7 9 5 7 6 9 7 9 5 30.1 30.1 30.1 83.479 724 724 0 67.231 13.4 11.9 14.2 13.3 16.6 10.1 355770000 67947000 30180000 79694000 31536000 28144000 118270000 98306000 79699000 65340000 73074000 83374000 77577000 7 7 7 7 9 6 43 282 1185;2412;2462;2740;3657;6845;7497;7790;7930;8009;8350;8787;9011;9061;10402;11076;12039 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1236;2497;2548;2834;3803;7132;7873;8186;8330;8414;8767;9218;9454;9505;10904;11603;12602 4822;4823;4824;9163;9335;10351;10352;10353;10354;13937;26156;26157;26158;28794;28795;28796;28797;28798;28799;29936;30418;30419;30420;30712;30713;30714;31881;31882;31883;33520;34488;34489;34490;34491;34665;34666;39893;39894;42621;42622;42623;42624;42625;42626;46637 4848;4849;4850;9210;9382;10409;10410;10411;10412;14028;26313;26314;26315;28974;28975;28976;28977;28978;28979;30123;30607;30608;30609;30902;30903;30904;32077;32078;32079;33720;34695;34696;34697;34698;34873;34874;40130;40131;42916;42917;42918;42919;42920;42921;46958 4850;9210;9382;10412;14028;26315;28975;30123;30608;30904;32079;33720;34698;34873;40131;42918;46958 -1
YDR165W YDR165W 2 2 2 YDR165W pep chromosome:R64-1-1:IV:784871:786205:1 gene:YDR165W transcript:YDR165W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRM82 description:Catalytic subunit of a tRNA methyltransferase complex; Trm8p and Trm82p compr 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 9 9 9 50.487 444 444 0.00083333 3.1909 5.4 9 3.6 9 3.6 3.6 42920000 5217800 16720000 3417100 11792000 1869800 3903000 0 35833000 0 24694000 0 0 1 2 1 2 1 1 8 283 7712;11426 True;True 8098;11963 29556;29557;29558;44124;44125;44126;44127;44128 29740;29741;29742;44423;44424;44425;44426;44427 29741;44424 -1
YDR169C-A YDR169C-A 1 1 1 YDR169C-A pep chromosome:R64-1-1:IV:794574:794723:-1 gene:YDR169C-A transcript:YDR169C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; identified by fungal homology and RT-PCR [Source:S 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 26.5 26.5 26.5 5.5885 49 49 1 -2 0 0 0 0 0 26.5 4081400 0 0 0 0 0 4081400 0 0 0 0 0 4081400 0 0 0 0 0 1 1 + 284 7194 True 7531 27572 27745 27745 141;142;143 1;2;4 -1
YDR170C YDR170C 11 11 11 YDR170C pep chromosome:R64-1-1:IV:796193:802222:-1 gene:YDR170C transcript:YDR170C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC7 description:Guanine nucleotide exchange factor (GEF) for ADP ribosylation factors; involv 1 11 11 11 2 6 4 4 3 5 2 6 4 4 3 5 2 6 4 4 3 5 7.2 7.2 7.2 226.88 2009 2009 0 25.326 1.1 4 2 3.6 2.1 3.3 116810000 8246400 17325000 37040000 17100000 7834400 29263000 0 45887000 27420000 26021000 29651000 20771000 2 6 3 4 3 4 22 285 1062;1133;2372;3811;6411;6667;9409;9577;9880;11279;11465 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1110;1184;2456;3962;6677;6945;9873;10046;10363;11816;12004 4401;4636;4637;4638;9001;9002;14491;24467;24468;24469;25433;25434;36089;36090;36091;36092;36702;37924;43480;43481;43482;43483;43484;44273 4425;4662;4663;4664;9047;9048;14590;24615;24616;24617;25587;25588;36300;36301;36302;36303;36920;38154;43778;43779;43780;43781;43782;44578 4425;4663;9048;14590;24617;25588;36301;36920;38154;43782;44578 -1
YDR171W YDR171W 3 3 3 YDR171W pep chromosome:R64-1-1:IV:806621:807748:1 gene:YDR171W transcript:YDR171W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HSP42 description:Small heat shock protein (sHSP) with chaperone activity; forms barrel-shaped 1 3 3 3 1 1 0 2 2 2 1 1 0 2 2 2 1 1 0 2 2 2 18.9 18.9 18.9 42.816 375 375 0 46.538 6.1 6.7 0 12.3 12.8 12.8 70764000 36137000 2075200 0 5710200 3934200 22907000 47201000 0 0 0 0 0 2 1 0 2 2 2 9 286 3749;8932;9632 True;True;True 3896;9369;10103 14248;14249;34039;34040;34041;34042;36902;36903;36904 14346;14347;34241;34242;34243;34244;37121;37122;37123 14347;34244;37121 -1
YDR172W YDR172W 27 27 27 YDR172W pep chromosome:R64-1-1:IV:808324:810381:1 gene:YDR172W transcript:YDR172W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SUP35 description:Translation termination factor eRF3; has a role in mRNA deadenylation and dec 1 27 27 27 20 15 14 16 15 18 20 15 14 16 15 18 20 15 14 16 15 18 38.2 38.2 38.2 76.55 685 685 0 134.59 32.4 27 25.3 28.6 23.6 29.3 1939000000 491780000 189830000 528530000 217050000 136180000 375640000 522720000 521210000 330980000 442250000 460970000 359810000 24 16 19 19 16 20 114 287 342;997;1281;1380;2679;2704;3265;3376;3377;3567;4215;4216;5066;5075;6929;7035;7140;7291;7450;8165;8166;8853;9723;10180;11078;11926;12317 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 360;1043;1334;1438;2773;2798;3383;3501;3502;3706;3707;4388;4389;5276;5285;7217;7328;7456;7654;7823;8576;8577;9288;10197;10198;10676;11605;12489;12890 1512;4167;5154;5530;5531;5532;5533;5534;5535;10108;10206;12362;12363;12364;12365;12366;12801;12802;12803;12804;12805;13585;13586;13587;13588;13589;13590;13591;13592;16013;16014;16015;16016;16017;16018;16019;16020;19332;19333;19334;19335;19336;19337;19338;19339;19340;19341;19384;19385;19386;19387;19388;19389;19390;19391;19392;19393;26489;26490;26491;26492;26493;26876;26877;26878;26879;26880;27295;27296;27297;27298;27299;27300;27993;27994;27995;28616;28617;28618;28619;28620;31225;31226;31227;33773;37260;37261;37262;37263;37264;37265;37266;37267;39060;42632;42633;42634;42635;42636;42637;42638;42639;46141;46142;46143;46144;46145;46146;47651;47652;47653;47654;47655;47656;47657;47658 1515;4187;5184;5565;5566;5567;5568;5569;5570;10162;10260;12447;12448;12449;12450;12451;12888;12889;12890;12891;12892;13674;13675;13676;13677;13678;13679;13680;13681;16122;16123;16124;16125;16126;16127;16128;16129;19455;19456;19457;19458;19459;19460;19461;19462;19463;19464;19507;19508;19509;19510;19511;19512;19513;19514;19515;19516;26649;26650;26651;26652;26653;27037;27038;27039;27040;27041;27460;27461;27462;27463;27464;27465;28167;28168;28169;28794;28795;28796;28797;28798;31419;31420;31421;33974;37482;37483;37484;37485;37486;37487;37488;37489;39295;42927;42928;42929;42930;42931;42932;42933;42934;46458;46459;46460;46461;46462;46463;47983;47984;47985;47986;47987;47988;47989;47990 1515;4187;5184;5569;10162;10260;12451;12888;12892;13677;16122;16127;19461;19511;26652;27041;27464;28167;28798;31420;31421;33974;37485;39295;42927;46461;47989 144;145 276;491 -1
YDR174W YDR174W 7 7 7 YDR174W pep chromosome:R64-1-1:IV:812110:812850:1 gene:YDR174W transcript:YDR174W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HMO1 description:Chromatin associated high mobility group (HMG) family member; involved in comp 1 7 7 7 3 4 3 5 4 4 3 4 3 5 4 4 3 4 3 5 4 4 37.8 37.8 37.8 27.544 246 246 0 68.177 11 18.3 11 33.3 15.4 15.4 837860000 110740000 239990000 192610000 115640000 43178000 135710000 153170000 483900000 116090000 256500000 155790000 129610000 3 5 3 5 4 4 24 288 251;1428;5245;8094;8207;8691;11802 True;True;True;True;True;True;True 262;1487;5465;8502;8621;9117;12361 1102;5700;5701;5702;5703;5704;5705;20066;31030;31031;31032;31033;31034;31035;31391;33128;33129;33130;33131;33132;33133;33134;45706;45707 1104;5735;5736;5737;5738;5739;5740;20190;31222;31223;31224;31225;31226;31227;31587;33327;33328;33329;33330;33331;33332;33333;46022;46023 1104;5739;20190;31222;31587;33330;46023 -1
YDR182W YDR182W 1 1 1 YDR182W pep chromosome:R64-1-1:IV:827582:829057:1 gene:YDR182W transcript:YDR182W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC1 description:Putative mannose-ethanolamine phosphate phosphodiesterase; involved in GPI-anc 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 3.1 3.1 3.1 57.147 491 491 0.005891 1.96 3.1 3.1 0 0 0 0 4747300 3209500 1537800 0 0 0 0 0 3335700 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 289 8128 True 8538 31121;31122 31314;31315 31314 -1
YDR188W YDR188W 6 6 6 YDR188W pep chromosome:R64-1-1:IV:836421:838061:1 gene:YDR188W transcript:YDR188W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCT6 description:Subunit of the cytosolic chaperonin Cct ring complex; related to Tcp1p, essent 1 6 6 6 2 0 6 1 2 2 2 0 6 1 2 2 2 0 6 1 2 2 14.1 14.1 14.1 59.923 546 546 0 13.668 7 0 14.1 2.7 4.2 3.8 131670000 11082000 0 90166000 6827400 4604400 18991000 17693000 0 36716000 0 22172000 25239000 2 0 6 1 2 2 13 290 2347;3004;4108;7187;9305;10458 True;True;True;True;True;True 2431;3111;4275;7521;9761;10965 8918;8919;11357;11358;15642;15643;27546;35658;35659;40069;40070;40071;40072 8964;8965;11436;11437;15750;15751;27719;35866;35867;40307;40308;40309;40310 8964;11437;15751;27719;35866;40308 -1
YDR190C YDR190C 14 14 14 YDR190C pep chromosome:R64-1-1:IV:840604:841995:-1 gene:YDR190C transcript:YDR190C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RVB1 description:ATP-dependent DNA helicase, also known as pontin; member of the AAA+ and RuvB 1 14 14 14 1 6 9 9 6 7 1 6 9 9 6 7 1 6 9 9 6 7 38.9 38.9 38.9 50.452 463 463 0 89.303 2.2 14.7 26.6 24 17.1 21 265690000 8081200 24795000 120040000 33406000 18338000 61028000 0 59279000 63913000 62828000 74047000 54833000 1 6 9 9 6 7 38 291 475;1531;1756;2085;3122;5644;6183;9888;10231;10372;10376;10805;11408;11889 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 502;1591;1823;2163;3232;5882;6440;10374;10727;10874;10878;11324;11945;12452 2067;6089;6090;6091;6092;6931;6932;6933;6934;6935;7960;11818;11819;21662;21663;21664;23715;37973;39247;39248;39249;39250;39251;39252;39769;39770;39786;39787;39788;39789;41583;41584;41585;41586;41587;44069;45984;45985 2073;6125;6126;6127;6128;6971;6972;6973;6974;6975;8002;11902;11903;21790;21791;21792;23856;38204;39483;39484;39485;39486;39487;39488;40006;40007;40023;40024;40025;40026;41846;41847;41848;41849;41850;44368;46300;46301 2073;6126;6974;8002;11902;21790;23856;38204;39487;40006;40024;41849;44368;46300 -1
YDR194C YDR194C 17 17 17 YDR194C pep chromosome:R64-1-1:IV:845952:847946:-1 gene:YDR194C transcript:YDR194C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MSS116 description:Mitochondrial transcription elongation factor; DEAD-box protein; required f 1 17 17 17 10 3 12 8 9 13 10 3 12 8 9 13 10 3 12 8 9 13 37 37 37 76.268 664 664 0 50.235 23 9 28 19 21.1 29.2 740200000 99165000 30660000 264220000 43268000 61511000 241370000 152630000 73068000 177700000 113120000 181880000 183440000 10 3 12 8 12 12 57 292 1316;1678;2081;2150;2417;3186;3855;4351;4352;5527;7072;9374;9532;9850;10207;10343;11203 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1371;1743;2159;2230;2502;3299;3300;4012;4530;4531;5764;7377;9835;10000;10332;10703;10843;11738 5280;6611;6612;6613;6614;6615;6616;7944;8213;9181;9182;9183;12029;12030;12031;12032;12033;12034;14674;14675;14676;14677;14678;16515;16516;16517;16518;16519;16520;16521;16522;16523;16524;16525;21279;21280;27044;27045;27046;27047;27048;35959;36551;36552;37794;37795;37796;37797;39160;39161;39162;39163;39164;39165;39166;39681;43135;43136;43137;43138 5311;6647;6648;6649;6650;6651;6652;7986;8255;9228;9229;9230;12114;12115;12116;12117;12118;12119;14776;14777;14778;14779;14780;16625;16626;16627;16628;16629;16630;16631;16632;16633;16634;16635;21406;21407;27206;27207;27208;27209;27210;36169;36767;36768;38024;38025;38026;38027;39395;39396;39397;39398;39399;39400;39401;39918;43432;43433;43434;43435 5311;6652;7986;8255;9230;12118;14779;16627;16634;21407;27208;36169;36767;38025;39398;39918;43433 146 440 -1
YDR195W YDR195W 2 2 2 YDR195W pep chromosome:R64-1-1:IV:848599:850200:1 gene:YDR195W transcript:YDR195W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:REF2 description:RNA-binding protein; involved in the cleavage step of mRNA 3-end formation pr 1 2 2 2 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 6.9 6.9 6.9 59.818 533 533 0.00085543 3.4714 4.5 2.4 0 0 2.4 0 4109600 1220300 1706200 0 0 1183100 0 0 0 0 0 3911600 0 0 1 0 0 1 0 2 293 4702;7237 True;True 4899;7582 17869;17870;27725 17985;17986;27898 17986;27898 -1
YDR211W YDR211W 23 23 23 YDR211W pep chromosome:R64-1-1:IV:884727:886865:1 gene:YDR211W transcript:YDR211W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GCD6 description:Catalytic epsilon subunit of the translation initiation factor eIF2B; eIF2B is 1 23 23 23 16 5 14 10 4 11 16 5 14 10 4 11 16 5 14 10 4 11 32.9 32.9 32.9 81.16 712 712 0 93.154 24 7.2 23.7 16.9 8.6 17.3 612760000 107630000 35271000 284400000 39125000 20370000 125960000 125150000 75158000 137380000 107050000 103450000 101350000 15 5 14 10 4 11 59 294 595;1036;1506;1785;2496;3397;3575;3829;3830;3838;3910;4012;4593;6354;6503;7163;7367;7847;8963;10183;10184;10969;10970 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 627;628;1084;1566;1852;2583;3522;3717;3984;3985;3995;4069;4175;4789;6619;6779;7489;7734;8247;9403;10679;10680;11494;11495 2550;2551;2552;2553;2554;2555;4334;4335;4336;5991;5992;5993;7029;9423;9424;9425;12892;12893;13630;14556;14557;14558;14593;14594;14595;14596;14597;14880;14881;14882;14883;15259;15260;17523;17524;17525;17526;24266;24267;24268;24843;24844;24845;27429;28258;28259;28260;28261;28262;30159;30160;34167;39065;39066;39067;39068;39069;39070;42228;42229;42230 2557;2558;2559;2560;2561;2562;4356;4357;4358;6026;6027;6028;7069;9471;9472;9473;12979;12980;13719;14655;14656;14657;14692;14693;14694;14695;14696;14984;14985;14986;14987;15366;15367;17638;17639;17640;17641;24414;24415;24416;24993;24994;24995;27598;28433;28434;28435;28436;28437;30347;30348;34373;39300;39301;39302;39303;39304;39305;42523;42524;42525 2560;4357;6028;7069;9473;12980;13719;14655;14656;14692;14987;15367;17639;24416;24993;27598;28436;30348;34373;39304;39305;42523;42524 147 557 -1
YDR212W YDR212W 7 7 7 YDR212W pep chromosome:R64-1-1:IV:887232:888911:1 gene:YDR212W transcript:YDR212W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TCP1 description:Alpha subunit of chaperonin-containing T-complex; complex mediates protein fol 1 7 7 7 2 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 3 15.4 15.4 15.4 60.48 559 559 0 35.176 5.5 5.4 6.8 8.8 8.2 6.3 134780000 12047000 6949000 66161000 12923000 8731000 27974000 0 0 40390000 26577000 30041000 25402000 3 3 3 3 3 3 18 295 2607;2813;3679;3726;4129;4778;9503 True;True;True;True;True;True;True 2701;2912;3825;3872;4297;4978;9970 9864;9865;10665;10666;10667;14003;14004;14153;14154;15715;15716;15717;15718;18179;18180;18181;18182;36443 9915;9916;10733;10734;10735;14098;14099;14250;14251;15823;15824;15825;15826;18296;18297;18298;18299;36657 9915;10734;14099;14250;15825;18298;36657 -1
YDR214W YDR214W 2 2 2 YDR214W pep chromosome:R64-1-1:IV:892875:893927:1 gene:YDR214W transcript:YDR214W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:AHA1 description:Co-chaperone that binds Hsp82p and activates its ATPase activity; plays a role 1 2 2 2 1 0 2 0 1 0 1 0 2 0 1 0 1 0 2 0 1 0 5.1 5.1 5.1 39.435 350 350 0.0086831 1.7993 2.3 0 5.1 0 2.3 0 19732000 1632200 0 17467000 0 632970 0 0 0 10293000 0 0 0 1 0 2 0 1 0 4 296 6874;11143 True;True 7162;11677 26269;42910;42911;42912 26427;43207;43208;43209 26427;43207 -1
YDR227W YDR227W 1 1 1 YDR227W pep chromosome:R64-1-1:IV:917571:921647:1 gene:YDR227W transcript:YDR227W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SIR4 description:SIR protein involved in assembly of silent chromatin domains; silent informati 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.8 0.8 0.8 152.06 1358 1358 0.0037994 2.2899 0 0 0 0 0.8 0 194920 0 0 0 0 194920 0 0 0 0 0 644460 0 0 0 0 0 1 0 1 297 9275 True 9729 35535 35743 35743 -1
YDR229W YDR229W 1 1 1 YDR229W pep chromosome:R64-1-1:IV:924785:926146:1 gene:YDR229W transcript:YDR229W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IVY1 description:Phospholipid-binding protein that interacts with both Ypt7p and Vps33p; may pa 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 2.4 2.4 2.4 49.975 453 453 0 4.0051 0 2.4 0 0 0 0 1732000 0 1732000 0 0 0 0 0 3757000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 298 7876 True 8276 30225 30413 30413 -1
YDR233C YDR233C 5 5 5 YDR233C pep chromosome:R64-1-1:IV:929470:930357:-1 gene:YDR233C transcript:YDR233C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RTN1 description:Reticulon protein; involved in nuclear pore assembly and maintenance of tubul 1 5 5 5 3 4 3 2 3 2 3 4 3 2 3 2 3 4 3 2 3 2 20.3 20.3 20.3 32.916 295 295 0 27.432 10.8 16.6 10.8 6.8 10.8 6.8 166130000 34793000 26934000 57879000 11570000 14058000 20895000 41454000 53127000 32053000 37971000 39133000 25411000 3 4 3 2 3 2 17 299 5448;5853;7707;9944;10273 True;True;True;True;True 5682;6097;8093;10433;10772 20942;20943;20944;20945;22419;22420;22421;22422;22423;22424;29538;29539;29540;29541;29542;38161;39424 21069;21070;21071;21072;22552;22553;22554;22555;22556;22557;29722;29723;29724;29725;29726;38393;39660 21071;22553;29722;38393;39660 -1
YDR237W YDR237W 1 1 1 YDR237W pep chromosome:R64-1-1:IV:936615:937493:1 gene:YDR237W transcript:YDR237W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL7 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; MRPL7 produces both YmL 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 5.1 5.1 5.1 33.099 292 292 0.00087336 3.6865 0 0 0 0 5.1 0 5034100 0 0 0 0 5034100 0 0 0 0 0 16644000 0 0 0 0 0 1 0 1 300 10352 True 10852 39715 39952 39952 -1
YDR238C YDR238C 21 21 21 YDR238C pep chromosome:R64-1-1:IV:937895:940816:-1 gene:YDR238C transcript:YDR238C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC26 description:Essential beta-coat protein of the COPI coatomer; involved in ER-to-Golgi pr 1 21 21 21 11 11 11 11 10 12 11 11 11 11 10 12 11 11 11 11 10 12 26.7 26.7 26.7 109.02 973 973 0 89.809 15.2 14.8 12.1 14.4 15 14.4 725270000 125510000 67831000 273790000 62493000 45420000 150230000 157860000 162430000 154770000 150230000 163430000 112650000 13 13 12 11 10 13 72 301 455;630;2470;3250;4530;5916;6176;7312;7540;7671;7892;7893;9139;9505;9582;10434;10444;10592;11041;11286;11528 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 482;667;2556;3367;4724;6163;6433;7676;7918;8053;8292;8293;9587;9972;10051;10941;10951;11100;11568;11823;12070 1985;1986;1987;2674;2675;2676;9351;9352;9353;9354;12296;17261;17262;17263;22670;22671;23692;23693;28049;28050;28051;28052;28053;28054;28055;28056;28057;28058;28946;28947;28948;28949;28950;28951;29389;30276;30277;30278;30279;30280;30281;30282;30283;34981;36450;36451;36452;36453;36454;36716;36717;39989;39990;40019;40020;40021;40022;40561;40562;42492;43513;43514;43515;43516;43517;43518;44521;44522;44523;44524 1991;1992;1993;2682;2683;2684;9398;9399;9400;9401;12381;17375;17376;17377;22805;22806;23833;23834;28223;28224;28225;28226;28227;28228;28229;28230;28231;28232;29129;29130;29131;29132;29133;29134;29573;30465;30466;30467;30468;30469;30470;30471;30472;35189;36664;36665;36666;36667;36668;36669;36670;36934;36935;40226;40227;40256;40257;40258;40259;40804;40805;42787;43811;43812;43813;43814;43815;43816;44827;44828;44829;44830 1993;2683;9401;12381;17377;22806;23834;28230;29130;29573;30466;30472;35189;36667;36935;40226;40257;40805;42787;43812;44829 148 20 -1
YDR240C YDR240C 1 1 1 YDR240C pep chromosome:R64-1-1:IV:943674:945152:-1 gene:YDR240C transcript:YDR240C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SNU56 description:Component of U1 snRNP required for mRNA splicing via spliceosome; yeast spec 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 3 3 3 56.498 492 492 0.0008569 3.4891 0 0 0 3 0 0 1225100 0 0 0 1225100 0 0 0 0 0 2520300 0 0 0 0 0 1 0 0 1 302 3490 True 3624 13275 13364 13364 -1
YDR243C YDR243C 2 2 2 YDR243C pep chromosome:R64-1-1:IV:948518:950284:-1 gene:YDR243C transcript:YDR243C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRP28 description:RNA binding protein; involved in RNA isomerization at the 5 splice site and 1 2 2 2 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 3.1 3.1 3.1 66.641 588 588 0 4.3941 0 1.2 0 1.9 0 1.9 2634100 0 1134100 0 600450 0 899570 0 0 0 0 0 899570 0 1 0 1 0 1 3 303 314;10285 True;True 330;10784 1399;39465;39466 1402;39701;39702 1402;39701 -1
YDR251W YDR251W 4 4 4 YDR251W pep chromosome:R64-1-1:IV:960614:963106:1 gene:YDR251W transcript:YDR251W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PAM1 description:Essential protein of unknown function; exhibits variable expression during col 1 4 4 4 0 2 0 2 1 0 0 2 0 2 1 0 0 2 0 2 1 0 5.7 5.7 5.7 92.871 830 830 0 7.9244 0 2.7 0 3 1.3 0 11584000 0 6024100 0 3329800 2229700 0 0 13067000 0 0 0 0 0 2 0 2 1 0 5 304 638;6432;7143;11331 True;True;True;True 675;6702;7459;11868 2698;24591;24592;27308;43685 2706;24740;24741;27474;43984 2706;24740;27474;43984 -1
YDR266C YDR266C 4 4 4 YDR266C pep chromosome:R64-1-1:IV:1000104:1002023:-1 gene:YDR266C transcript:YDR266C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HEL2 description:RING finger ubiquitin ligase (E3); involved in ubiquitination and degradati 1 4 4 4 2 1 0 3 3 0 2 1 0 3 3 0 2 1 0 3 3 0 9.7 9.7 9.7 72.755 639 639 0 18.67 4.9 2.3 0 6.7 6.7 0 29396000 6996200 3335900 0 11376000 7688600 0 0 0 0 20380000 28442000 0 2 1 0 3 3 0 9 305 2246;2992;8871;10605 True;True;True;True 2328;3098;9307;11113 8559;8560;8561;11315;33829;33830;33831;40588;40589 8604;8605;8606;11394;34030;34031;34032;40831;40832 8605;11394;34031;40831 -1
YDR279W YDR279W 2 2 2 YDR279W pep chromosome:R64-1-1:IV:1019368:1020420:1 gene:YDR279W transcript:YDR279W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RNH202 description:Ribonuclease H2 subunit; required for RNase H2 activity; role in ribonucle 1 2 2 2 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 6.3 6.3 6.3 39.483 350 350 0.0015924 2.7566 2.9 3.4 0 0 2.9 0 6443200 1955100 3344200 0 0 1143900 0 0 0 0 0 3782200 0 1 1 0 0 1 0 3 306 3897;5974 True;True 4055;6225 14832;14833;22920 14936;14937;23055 14937;23055 -1
YDR292C YDR292C 9 9 9 YDR292C pep chromosome:R64-1-1:IV:1043146:1045011:-1 gene:YDR292C transcript:YDR292C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SRP101 description:Signal recognition particle (SRP) receptor alpha subunit; contain GTPase 1 9 9 9 6 4 3 5 2 1 6 4 3 5 2 1 6 4 3 5 2 1 20.9 20.9 20.9 69.277 621 621 0 51.186 13.5 9.8 8.9 11.1 6.1 2.6 135400000 35960000 22654000 32978000 20585000 12651000 10569000 40372000 51878000 24953000 40686000 0 0 6 4 3 6 2 1 22 307 568;3084;5494;6807;7441;7860;7942;9941;11074 True;True;True;True;True;True;True;True;True 600;3193;5730;7092;7811;8260;8343;10430;11601 2469;2470;2471;2472;2473;2474;2475;11654;11655;11656;11657;21166;26016;26017;28569;28570;30186;30187;30188;30476;38157;42618 2476;2477;2478;2479;2480;2481;2482;11736;11737;11738;11739;21293;26173;26174;28747;28748;30374;30375;30376;30665;38388;42913 2478;11737;21293;26173;28748;30376;30665;38388;42913 -1
YDR293C YDR293C 14 14 14 YDR293C pep chromosome:R64-1-1:IV:1045640:1049392:-1 gene:YDR293C transcript:YDR293C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSD1 description:Translational repressor with a role in polar growth and wall integrity; reg 1 14 14 14 4 5 4 5 5 4 4 5 4 5 5 4 4 5 4 5 5 4 17.2 17.2 17.2 139.95 1250 1250 0 74.713 5.4 6.4 5.4 6.9 8.3 5.2 234100000 45458000 43823000 45512000 43692000 15885000 39726000 52604000 72846000 49542000 65227000 57215000 65948000 4 6 4 6 5 4 29 308 534;1516;2359;3903;4555;4622;5787;6728;6833;7755;7824;9219;9664;11223 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 564;1576;2443;4061;4750;4818;6029;7008;7120;8151;8223;9670;10136;11760 2332;6032;8962;14847;17389;17390;17614;22172;22173;25656;26130;26131;29826;29827;30067;35326;35327;35328;35329;35330;35331;35332;35333;37030;37031;37032;37033;43236;43237;43238 2339;6068;9008;14951;17503;17504;17729;22302;22303;25810;26287;26288;30013;30014;30255;35534;35535;35536;35537;35538;35539;35540;35541;37249;37250;37251;37252;43533;43534;43535 2339;6068;9008;14951;17503;17729;22303;25810;26287;30013;30255;35541;37250;43535 -1
YDR294C YDR294C 3 3 3 YDR294C pep chromosome:R64-1-1:IV:1050459:1052228:-1 gene:YDR294C transcript:YDR294C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DPL1 description:Dihydrosphingosine phosphate lyase; regulates intracellular levels of sphin 1 3 3 3 2 3 1 2 1 1 2 3 1 2 1 1 2 3 1 2 1 1 9 9 9 65.565 589 589 0 5.6152 5.8 9 1.5 7.5 1.5 1.5 20688000 5268700 5922600 2189000 5115900 429910 1761700 10577000 9730100 0 9945800 0 0 2 3 1 2 1 1 10 309 3054;7923;11807 True;True;True 3163;8323;12366 11551;11552;30390;30391;30392;45717;45718;45719;45720;45721 11632;11633;30579;30580;30581;46033;46034;46035;46036;46037 11633;30580;46034 -1
YDR296W YDR296W 2 2 2 YDR296W pep chromosome:R64-1-1:IV:1055212:1055892:1 gene:YDR296W transcript:YDR296W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MHR1 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; also involved in homol 1 2 2 2 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 8.4 8.4 8.4 26.894 226 226 0.00086806 3.6197 4.4 4 0 4 0 0 4799800 1170700 1827900 0 1801200 0 0 0 0 0 3705200 0 0 0 1 0 1 0 0 2 310 2599;10951 True;True 2693;11475 9838;9839;42141 9889;9890;42433 9889;42433 -1
YDR299W YDR299W 4 4 4 YDR299W pep chromosome:R64-1-1:IV:1059627:1061231:1 gene:YDR299W transcript:YDR299W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BFR2 description:Component of the SSU and 90S preribosomes; involved in pre-18S rRNA processi 1 4 4 4 4 2 1 2 2 1 4 2 1 2 2 1 4 2 1 2 2 1 9.7 9.7 9.7 61.202 534 534 0 15.712 9.7 3.6 3.6 3.6 3.6 1.7 37199000 10201000 6940300 7060500 5186300 3242300 4569000 8856900 17079000 0 11831000 12002000 0 4 2 1 2 2 1 12 311 367;5716;11278;11531 True;True;True;True 388;5957;11815;12073 1614;1615;21903;21904;21905;21906;21907;43476;43477;43478;43479;44540 1617;1618;22033;22034;22035;22036;22037;43774;43775;43776;43777;44846 1618;22034;43777;44846 -1
YDR300C YDR300C 3 3 3 YDR300C pep chromosome:R64-1-1:IV:1061505:1062791:-1 gene:YDR300C transcript:YDR300C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRO1 description:Gamma-glutamyl kinase; catalyzes the first step in proline biosynthesis; re 1 3 3 3 2 0 2 0 1 0 2 0 2 0 1 0 2 0 2 0 1 0 10 10 10 47.162 428 428 0 7.2025 6.3 0 5.8 0 4.2 0 31801000 18867000 0 10319000 0 2614200 0 0 0 6080600 0 0 0 2 0 2 0 1 0 5 312 538;5209;10465 True;True;True 568;5427;10972 2349;2350;19938;19939;40099 2356;2357;20062;20063;40337 2357;20062;40337 -1
YDR303C YDR303C 6 6 6 YDR303C pep chromosome:R64-1-1:IV:1068729:1071386:-1 gene:YDR303C transcript:YDR303C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSC3 description:Component of the RSC chromatin remodeling complex; essential gene required 1 6 6 6 3 3 1 3 3 2 3 3 1 3 3 2 3 3 1 3 3 2 9.4 9.4 9.4 101.72 885 885 0 56.912 4.6 4.3 1.5 4.6 4.5 3.5 56991000 12353000 9491200 6577400 11404000 6916700 10248000 16465000 17579000 0 20198000 0 16189000 3 3 1 3 3 2 15 313 6168;6536;7805;8410;9546;12156 True;True;True;True;True;True 6423;6812;8204;8831;10015;12720 23657;23658;23659;24934;24935;24936;24937;24938;24939;29998;32099;36611;36612;47048;47049 23798;23799;23800;25084;25085;25086;25087;25088;25089;30185;32295;36828;36829;47375;47376 23799;25085;30185;32295;36828;47376 -1
YDR311W YDR311W 1 1 1 YDR311W pep chromosome:R64-1-1:IV:1085065:1086993:1 gene:YDR311W transcript:YDR311W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TFB1 description:Subunit of TFIIH and nucleotide excision repair factor 3 complexes; required 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 2.3 2.3 2.3 72.894 642 642 0 6.2519 0 0 0 0 0 2.3 3669000 0 0 0 0 0 3669000 0 0 0 0 0 3669000 0 0 0 0 0 1 1 314 4107 True 4274 15641 15749 15749 -1
YDR312W YDR312W 11 2 2 YDR312W pep chromosome:R64-1-1:IV:1087581:1088942:1 gene:YDR312W transcript:YDR312W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSF2 description:Protein required for ribosomal large subunit maturation; functionally redund 1 11 2 2 7 6 5 5 7 5 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 31.6 6.2 6.2 51.855 453 453 0 4.1505 26.3 18.5 12.1 17 18.1 12.4 4379600 4379600 0 0 0 0 0 5720600 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 315 1601;3717;6766;8602;9291;9292;10154;10495;10590;11043;11250 False;False;False;True;False;False;True;False;False;False;False 1664;3863;7047;9026;9747;9748;10650;11002;11098;11570;11787 6352;6353;6354;6355;14128;14129;14130;25858;25859;32776;35605;35606;35607;35608;35609;35610;35611;35612;35613;35614;35615;35616;38962;40217;40218;40219;40554;40555;40556;40557;42496;42497;42498;43347;43348;43349 6388;6389;6390;6391;14225;14226;14227;26015;26016;32973;35813;35814;35815;35816;35817;35818;35819;35820;35821;35822;35823;35824;39197;40458;40459;40460;40797;40798;40799;40800;42791;42792;42793;43645;43646;43647 6391;14227;26015;32973;35817;35820;39197;40458;40800;42792;43645 -1
YDR321W YDR321W 2 2 2 YDR321W pep chromosome:R64-1-1:IV:1108702:1109847:1 gene:YDR321W transcript:YDR321W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ASP1 description:Cytosolic L-asparaginase, involved in asparagine catabolism; catalyzes hydro 1 2 2 2 0 2 0 2 1 1 0 2 0 2 1 1 0 2 0 2 1 1 6 6 6 41.395 381 381 0 12.795 0 6 0 6 2.9 2.9 16240000 0 6431100 0 4139300 1720300 3949300 0 13929000 0 8535900 0 0 0 2 0 2 1 1 6 316 4313;10439 True;True 4490;10946 16380;16381;16382;16383;40000;40001 16489;16490;16491;16492;40237;40238 16490;40238 -1
YDR322W YDR322W 4 4 4 YDR322W pep chromosome:R64-1-1:IV:1110589:1111692:1 gene:YDR322W transcript:YDR322W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL35 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit [Source:SGD;Acc:S0000 1 4 4 4 3 1 3 2 0 2 3 1 3 2 0 2 3 1 3 2 0 2 13.4 13.4 13.4 42.825 367 367 0 8.3497 8.7 1.9 10.9 6.3 0 4.4 48572000 8145600 960860 27863000 2608600 0 8993100 8343500 0 15153000 6391600 0 11529000 3 2 3 2 0 2 12 317 2756;5707;6417;7256 True;True;True;True 2854;5948;6683;7604 10458;10459;10460;10461;10462;21870;24501;24502;24503;27801;27802 10523;10524;10525;10526;10527;10528;22000;24649;24650;24651;27974;27975 10527;22000;24650;27974 -1
YDR324C YDR324C 22 22 22 YDR324C pep chromosome:R64-1-1:IV:1114433:1116763:-1 gene:YDR324C transcript:YDR324C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP4 description:Subunit of U3-containing 90S preribosome and SSU processome complexes; invo 1 22 22 22 9 15 12 11 7 6 9 15 12 11 7 6 9 15 12 11 7 6 38 38 38 87.8 776 776 0 116.49 16.2 23.5 18.4 17.3 10.8 10.8 356860000 70117000 53047000 134420000 41932000 15041000 42299000 97743000 77201000 70386000 86895000 67945000 63978000 9 15 12 11 6 6 59 318 2707;2760;2795;2839;3835;3982;4882;5634;6204;6409;6792;6802;6947;7782;9029;9385;9600;10006;10405;10958;11328;12099 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2801;2858;2894;2938;3990;4143;5086;5872;6461;6675;7075;7086;7235;8178;9473;9847;10069;10495;10907;11483;11865;12662 10211;10212;10213;10214;10215;10216;10471;10472;10594;10595;10779;10780;10781;10782;10783;10784;14574;14575;15139;15140;15141;15142;18574;18575;21631;21632;23808;24462;24463;24464;25958;25996;26580;26581;29905;29906;29907;29908;34555;36001;36002;36003;36004;36005;36775;36776;36777;36778;38361;39901;39902;42176;42177;42178;42179;42180;43676;43677;43678;46849 10265;10266;10267;10268;10269;10270;10537;10538;10661;10662;10847;10848;10849;10850;10851;10852;14673;14674;15246;15247;15248;15249;18692;18693;21759;21760;23950;24610;24611;24612;26115;26153;26740;26741;30092;30093;30094;30095;34762;36212;36213;36214;36215;36216;36994;36995;36996;36997;38593;40138;40139;42471;42472;42473;42474;42475;43975;43976;43977;47175 10268;10537;10662;10847;14674;15247;18693;21760;23950;24611;26115;26153;26741;30094;34762;36212;36996;38593;40138;42471;43977;47175 -1
YDR337W YDR337W 5 5 5 YDR337W pep chromosome:R64-1-1:IV:1146319:1147179:1 gene:YDR337W transcript:YDR337W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPS28 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit [Source:SGD;Acc:S0000 1 5 5 5 1 1 2 1 1 5 1 1 2 1 1 5 1 1 2 1 1 5 24.8 24.8 24.8 33.057 286 286 0 10.126 6.3 6.3 10.5 6.3 6.3 24.8 64771000 1805600 1403600 25103000 1630400 1100700 33728000 0 0 27005000 0 0 21514000 1 1 2 1 1 4 10 319 837;3464;4396;5836;12180 True;True;True;True;True 879;3595;4577;6080;12747 3472;3473;13176;13177;13178;13179;13180;13181;16705;22361;47139 3485;3486;13265;13266;13267;13268;13269;13270;16816;22494;47466 3486;13270;16816;22494;47466 -1
YDR339C YDR339C 2 2 2 YDR339C pep chromosome:R64-1-1:IV:1149951:1150520:-1 gene:YDR339C transcript:YDR339C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FCF1 description:Putative PINc domain nuclease; required for early cleavages of 35S pre-rRNA 1 2 2 2 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 11.1 11.1 11.1 21.61 189 189 0 5.7981 6.3 4.8 4.8 0 0 0 30288000 2768800 2714300 24805000 0 0 0 3616500 0 0 0 0 0 2 1 1 0 0 0 4 320 1055;10260 True;True 1103;10758 4387;39383;39384 4410;4411;39619;39620 4410;39620 -1
YDR341C;YHR091C YDR341C 37;1 37;1 37;1 YDR341C pep chromosome:R64-1-1:IV:1151803:1153626:-1 gene:YDR341C transcript:YDR341C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YDR341C description:Arginyl-tRNA synthetase; the authentic, non-tagged protein is detected i 2 37 37 37 17 27 19 22 20 23 17 27 19 22 20 23 17 27 19 22 20 23 64.3 64.3 64.3 69.524 607 607;643 0 139.27 33.3 46.5 39.7 41.8 36.4 50.1 2366500000 328130000 462080000 641670000 291130000 135960000 507580000 437060000 789410000 512960000 530790000 493570000 513210000 21 31 20 26 22 26 146 321 313;833;834;1320;2591;2858;3370;4441;4460;4461;4632;5082;5214;5515;6194;6200;6378;6649;6650;6779;7064;7065;7182;7210;8008;8119;8427;8568;8773;9706;10158;11797;11798;11898;11930;12011;12045 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 329;875;876;1375;2685;2959;3493;4628;4651;4652;4828;5292;5432;5751;6451;6457;6644;6927;6928;7062;7368;7369;7514;7515;7550;8413;8527;8848;8992;9204;10180;10654;12356;12357;12461;12493;12574;12608 1394;1395;1396;1397;1398;3457;3458;3459;3460;3461;3462;3463;3464;5294;9801;9802;9803;9804;9805;9806;9807;9808;9809;10857;10858;10859;10860;12770;12771;16881;16882;16883;16884;16885;16886;16977;16978;16979;16980;16981;16982;16983;16984;16985;17645;17646;17647;17648;17649;17650;17651;19428;19429;19430;19431;19432;19433;19953;19954;19955;21225;21226;21227;21228;23757;23758;23759;23760;23761;23762;23789;23790;23791;23792;23793;24345;24346;24347;24348;24349;25384;25385;25386;25900;27020;27021;27022;27023;27024;27516;27517;27518;27519;27520;27521;27522;27523;27524;27525;27526;27621;30708;30709;30710;30711;31085;31086;31087;31088;32139;32140;32141;32142;32682;33478;33479;37187;37188;38977;45687;45688;45689;45690;45691;45692;45693;45694;46012;46159;46160;46161;46162;46518;46519;46520;46521;46522;46523;46524;46525;46526;46664;46665;46666;46667;46668 1397;1398;1399;1400;1401;3470;3471;3472;3473;3474;3475;3476;3477;5325;9852;9853;9854;9855;9856;9857;9858;9859;9860;10928;10929;10930;10931;12857;12858;16994;16995;16996;16997;16998;16999;17091;17092;17093;17094;17095;17096;17097;17098;17099;17760;17761;17762;17763;17764;17765;17766;19551;19552;19553;19554;19555;19556;20077;20078;20079;21352;21353;21354;21355;23899;23900;23901;23902;23903;23904;23931;23932;23933;23934;23935;24493;24494;24495;24496;24497;25538;25539;25540;26057;27182;27183;27184;27185;27186;27688;27689;27690;27691;27692;27693;27694;27695;27696;27697;27698;27794;30898;30899;30900;30901;31278;31279;31280;31281;32335;32336;32337;32338;32879;33678;33679;37406;37407;39212;46002;46003;46004;46005;46006;46007;46008;46009;46328;46476;46477;46478;46479;46839;46840;46841;46842;46843;46844;46845;46846;46847;46987;46988;46989;46990;46991 1397;3470;3475;5325;9854;10931;12857;16996;17093;17098;17761;19556;20078;21354;23901;23934;24496;25538;25540;26057;27182;27186;27695;27794;30900;31278;32336;32879;33678;37407;39212;46002;46006;46328;46477;46843;46988 149;150 64;478 -1;-1
YDR342C;YDR343C YDR342C;YDR343C 4;3 4;3 4;3 YDR342C pep chromosome:R64-1-1:IV:1154216:1155928:-1 gene:YDR342C transcript:YDR342C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HXT7 description:High-affinity glucose transporter; member of the major facilitator superfam 2 4 4 4 0 0 4 0 0 3 0 0 4 0 0 3 0 0 4 0 0 3 11.9 11.9 11.9 62.734 570 570;570 0 30.644 0 0 11.9 0 0 9.5 263450000 0 0 187110000 0 0 76339000 0 0 102980000 0 0 83614000 0 0 4 0 0 3 7 322 2819;5499;10840;12109 True;True;True;True 2918;5735;11360;12672 10679;10680;21182;41720;41721;46883;46884 10747;10748;21309;41983;41984;47209;47210 10747;21309;41984;47210 -1;-1
YDR345C YDR345C 7 7 6 YDR345C pep chromosome:R64-1-1:IV:1162957:1164660:-1 gene:YDR345C transcript:YDR345C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HXT3 description:Low affinity glucose transporter of the major facilitator superfamily; expr 1 7 7 6 2 5 6 6 3 3 2 5 6 6 3 3 2 4 6 5 3 3 16.9 16.9 14.8 62.557 567 567 0 38.016 5.5 13.4 14.8 13.4 7.9 9.2 536380000 21460000 79085000 231460000 116300000 28142000 59938000 78136000 233610000 95868000 163010000 89419000 68144000 2 5 7 7 4 4 29 323 41;2817;2818;7207;8727;10816;12164 True;True;True;True;True;True;True 43;2916;2917;7546;9154;11335;12728 173;10672;10673;10674;10675;10676;10677;10678;27610;27611;33290;33291;33292;33293;33294;41617;41618;41619;41620;41621;41622;41623;41624;41625;47072;47073;47074;47075;47076 173;10740;10741;10742;10743;10744;10745;10746;27783;27784;33489;33490;33491;33492;33493;41880;41881;41882;41883;41884;41885;41886;41887;41888;47399;47400;47401;47402;47403 173;10741;10744;27783;33491;41885;47403 -1
YDR346C YDR346C 4 4 4 YDR346C pep chromosome:R64-1-1:IV:1167214:1168659:-1 gene:YDR346C transcript:YDR346C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SVF1 description:Protein with a potential role in cell survival pathways; required for the d 1 4 4 4 1 0 3 1 2 3 1 0 3 1 2 3 1 0 3 1 2 3 14.1 14.1 14.1 54.367 481 481 0 16.391 4.2 0 11.9 4.2 6.4 11.9 123870000 4468200 0 59218000 2633200 4513600 53036000 0 0 35315000 0 0 52614000 1 0 3 1 2 3 10 324 2957;3864;7600;9644 True;True;True;True 3063;4021;7980;10116 11210;11211;14700;14701;29161;29162;29163;29164;29165;36962 11287;11288;14802;14803;29344;29345;29346;29347;29348;37181 11288;14803;29344;37181 -1
YDR347W YDR347W 2 2 2 YDR347W pep chromosome:R64-1-1:IV:1169178:1170143:1 gene:YDR347W transcript:YDR347W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRP1 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit; MRP1 exhibits genetic 1 2 2 2 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 7.8 7.8 7.8 36.728 321 321 0 6.4309 3.4 4.4 0 0 0 0 2600100 1425000 1175100 0 0 0 0 0 2549000 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 325 5850;10750 True;True 6094;11265 22412;41342 22545;41602 22545;41602 -1
YDR356W YDR356W 7 7 7 YDR356W pep chromosome:R64-1-1:IV:1186107:1188941:1 gene:YDR356W transcript:YDR356W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SPC110 description:Inner plaque spindle pole body (SPB) component; ortholog of human kendrin; 1 7 7 7 1 2 2 2 2 4 1 2 2 2 2 4 1 2 2 2 2 4 9.6 9.6 9.6 111.78 944 944 0 53.161 1.4 3.1 2.3 2.4 3.1 6.6 139870000 2842600 3345300 14000000 101740000 2676300 15267000 0 11916000 0 0 0 10608000 1 2 2 2 2 4 13 326 4672;5555;5757;6509;7036;10710;11198 True;True;True;True;True;True;True 4869;5792;5998;6785;7329;11221;11733 17761;21365;22039;22040;22041;24865;24866;26881;26882;26883;41054;41055;43129 17876;21492;22169;22170;22171;25015;25016;27042;27043;27044;41302;41303;43426 17876;21492;22169;25016;27042;41303;43426 -1
YDR361C YDR361C 7 7 7 YDR361C pep chromosome:R64-1-1:IV:1195412:1196263:-1 gene:YDR361C transcript:YDR361C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BCP1 description:Essential protein involved in nuclear export of Mss4p; Mss4p is a lipid kin 1 7 7 7 3 3 5 4 1 6 3 3 5 4 1 6 3 3 5 4 1 6 39.6 39.6 39.6 32.661 283 283 0 47.16 18.4 15.9 26.9 24.4 8.5 34.6 232020000 34803000 11867000 54825000 32159000 3847600 94516000 53061000 47427000 50287000 45784000 0 67618000 3 3 5 4 1 6 22 327 4732;5085;5434;6000;8246;9015;11162 True;True;True;True;True;True;True 4929;5295;5668;6251;8661;9458;11696 17998;17999;18000;18001;19439;19440;19441;19442;20890;20891;23015;31525;31526;31527;31528;31529;34505;42951;42952;42953;42954;42955 18114;18115;18116;18117;19562;19563;19564;19565;21017;21018;23150;31721;31722;31723;31724;31725;34712;43248;43249;43250;43251;43252 18114;19562;21017;23150;31722;34712;43249 -1
YDR365C YDR365C 15 15 15 YDR365C pep chromosome:R64-1-1:IV:1204497:1206383:-1 gene:YDR365C transcript:YDR365C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ESF1 description:Nucleolar protein involved in pre-rRNA processing; depletion causes severel 1 15 15 15 8 10 8 8 4 6 8 10 8 8 4 6 8 10 8 8 4 6 29.3 29.3 29.3 72.409 628 628 0 61.615 17.4 22.5 17.2 19.3 7 9.6 533950000 84925000 117970000 159160000 66925000 18214000 86765000 105990000 171650000 99528000 159720000 106210000 102170000 8 10 8 7 4 6 43 328 285;1823;2133;2375;3697;4790;4791;5193;6819;6820;8013;9334;9570;10808;10809 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 299;1892;2213;2459;3843;4991;4992;5409;7105;7106;8418;9791;10039;11327;11328 1248;1249;1250;1251;1252;7158;7159;8155;8156;8157;8158;8159;8160;9009;14061;14062;14063;18224;18225;18226;18227;18228;18229;18230;18231;19868;26062;26063;26064;30727;30728;30729;30730;35800;35801;35802;35803;35804;36679;36680;36681;36682;41597;41598;41599 1250;1251;1252;1253;1254;7198;7199;8197;8198;8199;8200;8201;8202;9055;14156;14157;14158;18341;18342;18343;18344;18345;18346;18347;18348;19991;26219;26220;26221;30917;30918;30919;30920;36008;36009;36010;36011;36012;36896;36897;36898;36899;41860;41861;41862 1252;7198;8197;9055;14158;18346;18347;19991;26219;26221;30919;36010;36899;41860;41862 -1
YDR377W YDR377W 2 2 2 YDR377W pep chromosome:R64-1-1:IV:1228611:1228916:1 gene:YDR377W transcript:YDR377W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ATP17 description:Subunit f of the F0 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase; F1F0 ATP syn 1 2 2 2 0 0 2 0 1 2 0 0 2 0 1 2 0 0 2 0 1 2 19.8 19.8 19.8 11.312 101 101 0.0015564 2.5307 0 0 19.8 0 8.9 19.8 66190000 0 0 34578000 0 1589900 30022000 0 0 19660000 0 0 30737000 0 0 2 0 1 3 6 329 3768;9299 True;True 3917;9755 14340;14341;14342;35643;35644 14438;14439;14440;14441;35851;35852 14440;35851 -1
YDR381W YDR381W 11 11 11 YDR381W pep chromosome:R64-1-1:IV:1236558:1238004:1 gene:YDR381W transcript:YDR381W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YRA1 description:Nuclear polyadenylated RNA-binding protein; required for export of poly(A)+ 1 11 11 11 7 9 8 8 9 6 7 9 8 8 9 6 7 9 8 8 9 6 42.9 42.9 42.9 24.955 226 226 0 48.856 34.1 33.2 34.1 31.9 42 27.4 1060100000 142190000 125640000 354840000 94835000 78571000 263990000 189120000 269030000 218560000 201320000 224730000 275140000 8 11 9 10 11 8 57 330 1204;1627;2518;3264;6397;6590;8708;9188;9200;9201;11283 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1255;1690;2606;3381;3382;6663;6867;9134;9638;9650;9651;11820 4870;4871;4872;4873;6448;6449;6450;9479;9480;9481;12355;12356;12357;12358;12359;12360;12361;24420;24421;24422;24423;24424;24425;25178;25179;33201;33202;33203;33204;33205;33206;33207;33208;33209;33210;33211;35187;35188;35189;35190;35191;35192;35237;35238;35239;35240;35241;35242;35243;35244;35245;35246;35247;35248;43491;43492;43493;43494;43495 4896;4897;4898;4899;6484;6485;6486;9527;9528;9529;12440;12441;12442;12443;12444;12445;12446;24568;24569;24570;24571;24572;24573;25328;25329;33400;33401;33402;33403;33404;33405;33406;33407;33408;33409;33410;35395;35396;35397;35398;35399;35400;35445;35446;35447;35448;35449;35450;35451;35452;35453;35454;35455;35456;43789;43790;43791;43792;43793 4898;6485;9529;12441;24568;25328;33406;35397;35446;35448;43791 151 121 -1
YDR382W YDR382W 1 1 1 YDR382W pep chromosome:R64-1-1:IV:1239492:1239824:1 gene:YDR382W transcript:YDR382W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPP2B description:Ribosomal protein P2 beta; a component of the ribosomal stalk, which is inv 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 22.7 22.7 22.7 11.05 110 110 0.00085763 3.5055 0 0 22.7 0 0 22.7 30798000 0 0 21431000 0 0 9366800 0 0 0 0 0 9366800 0 0 1 0 0 1 2 331 969 True 1014 4044;4045 4060;4061 4061 -1
YOR133W;YDR385W YOR133W;YDR385W 61;61 61;61 61;61 YOR133W pep chromosome:R64-1-1:XV:575098:577626:1 gene:YOR133W transcript:YOR133W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EFT1 description:Elongation factor 2 (EF-2), also encoded by EFT2; catalyzes ribosomal transloc 2 61 61 61 48 46 54 53 49 53 48 46 54 53 49 53 48 46 54 53 49 53 79.8 79.8 79.8 93.288 842 842;842 0 323.31 71.1 67.6 72.9 72.9 69.8 74.5 37501000000 7383000000 3385900000 11696000000 4232400000 2440700000 8362900000 9439000000 6536400000 7747400000 7985700000 6785200000 8580000000 83 77 86 96 83 86 511 332 103;137;139;181;223;520;521;891;954;955;1010;1457;1603;1616;1674;2028;2461;2655;2663;2718;2949;3271;3368;3544;4230;4231;4394;4395;4540;4541;4544;4545;4546;4677;4869;4902;4991;5046;5141;5691;5763;6962;7190;7288;7745;7746;8085;8221;8472;8511;9282;9668;9722;9987;10145;10694;10793;10937;11558;11678;11847 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 106;107;143;145;189;190;234;549;550;934;999;1000;1057;1517;1666;1679;1738;1739;2105;2546;2547;2749;2757;2812;3054;3055;3389;3491;3681;3682;4403;4404;4574;4575;4576;4734;4735;4738;4739;4740;4874;5073;5106;5197;5255;5256;5353;5932;6004;7250;7525;7526;7527;7651;8140;8141;8142;8491;8492;8635;8894;8935;9736;9737;10140;10141;10196;10476;10639;10640;11205;11311;11312;11461;12101;12231;12232;12406 427;428;429;430;431;432;433;434;435;436;437;438;593;594;595;596;597;598;599;600;601;602;609;610;611;612;613;614;615;616;617;618;619;777;778;779;780;781;782;783;784;963;964;965;966;967;2243;2244;2245;2246;2247;2248;2249;2250;2251;2252;2253;2254;2255;2256;2257;3691;3692;3693;3694;3695;3696;3988;3989;3990;3991;3992;3993;3994;3995;3996;3997;3998;3999;4224;4225;4226;4227;4228;4229;4230;4231;4232;4233;4234;5826;5827;5828;6359;6360;6361;6362;6363;6395;6396;6397;6398;6595;6596;6597;6598;6599;6600;6601;6602;6603;6604;6605;7733;7734;7735;7736;7737;7738;7739;9319;9320;9321;9322;9323;9324;9325;9326;9327;9328;9329;9330;9331;9332;9333;9334;9993;9994;9995;9996;9997;9998;9999;10000;10001;10002;10003;10004;10005;10006;10007;10008;10009;10010;10011;10038;10039;10040;10041;10042;10043;10044;10045;10246;10247;10248;10249;10250;10251;10252;10253;10254;10255;11182;11183;11184;11185;12395;12396;12397;12398;12399;12400;12401;12402;12403;12404;12405;12406;12759;12760;12761;12762;12763;12764;12765;12766;12767;12768;13495;13496;13497;13498;13499;13500;13501;13502;13503;13504;13505;13506;13507;13508;13509;13510;13511;13512;13513;13514;13515;16070;16071;16072;16073;16074;16075;16076;16077;16078;16079;16080;16081;16082;16083;16084;16085;16086;16087;16687;16688;16689;16690;16691;16692;16693;16694;16695;16696;16697;16698;16699;16700;16701;16702;16703;16704;17297;17298;17299;17300;17301;17302;17303;17304;17305;17306;17307;17308;17309;17310;17311;17312;17313;17314;17315;17316;17317;17318;17319;17320;17325;17326;17327;17328;17329;17330;17331;17332;17333;17334;17335;17336;17337;17338;17773;17774;17775;17776;17777;17778;18537;18538;18539;18540;18541;18542;18543;18544;18545;18546;18547;18668;18669;18670;18671;18672;18673;18674;18675;18676;18677;18678;18989;19235;19236;19237;19238;19239;19622;19623;19624;19625;19626;19627;19628;19629;19630;21834;22061;26624;26625;26626;26627;26628;26629;27554;27555;27556;27557;27558;27559;27560;27561;27562;27984;27985;27986;27987;29780;29781;29782;29783;29784;29785;29786;29787;29788;29789;29790;29791;29792;29793;29794;29795;29796;29797;29798;29799;29800;29801;29802;29803;30981;30982;30983;30984;30985;30986;30987;30988;30989;30990;30991;31435;31436;31437;31438;31439;31440;32295;32296;32297;32298;32299;32300;32301;32302;32303;32453;32454;32455;32456;32457;32458;32459;32460;35553;35554;35555;35556;35557;35558;35559;35560;35561;35562;35563;35564;35565;35566;37043;37044;37045;37046;37047;37048;37049;37050;37051;37052;37053;37054;37055;37056;37057;37058;37254;37255;37256;37257;37258;37259;38312;38313;38314;38315;38316;38317;38907;38908;38909;38910;38911;38912;38913;38914;38915;38916;38917;38918;38919;38920;38921;38922;38923;40971;40972;40973;40974;40975;40976;40977;40978;40979;41538;41539;41540;41541;41542;41543;41544;41545;41546;41547;41548;42085;42086;42087;42088;44644;44645;44646;45184;45185;45186;45187;45188;45822;45823;45824;45825;45826;45827;45828;45829 428;429;430;431;432;433;434;435;436;437;438;439;594;595;596;597;598;599;600;601;602;603;610;611;612;613;614;615;616;617;618;619;620;778;779;780;781;782;783;784;785;965;966;967;968;969;2249;2250;2251;2252;2253;2254;2255;2256;2257;2258;2259;2260;2261;2262;2263;2264;3704;3705;3706;3707;3708;3709;4003;4004;4005;4006;4007;4008;4009;4010;4011;4012;4013;4014;4244;4245;4246;4247;4248;4249;4250;4251;4252;4253;4254;4255;5861;5862;5863;6395;6396;6397;6398;6399;6431;6432;6433;6434;6631;6632;6633;6634;6635;6636;6637;6638;6639;6640;6641;7775;7776;7777;7778;7779;7780;7781;9366;9367;9368;9369;9370;9371;9372;9373;9374;9375;9376;9377;9378;9379;9380;9381;10046;10047;10048;10049;10050;10051;10052;10053;10054;10055;10056;10057;10058;10059;10060;10061;10062;10063;10064;10091;10092;10093;10094;10095;10096;10097;10098;10300;10301;10302;10303;10304;10305;10306;10307;10308;10309;11259;11260;11261;11262;12480;12481;12482;12483;12484;12485;12486;12487;12488;12489;12490;12491;12845;12846;12847;12848;12849;12850;12851;12852;12853;12854;12855;13584;13585;13586;13587;13588;13589;13590;13591;13592;13593;13594;13595;13596;13597;13598;13599;13600;13601;13602;13603;13604;16179;16180;16181;16182;16183;16184;16185;16186;16187;16188;16189;16190;16191;16192;16193;16194;16195;16196;16798;16799;16800;16801;16802;16803;16804;16805;16806;16807;16808;16809;16810;16811;16812;16813;16814;16815;17411;17412;17413;17414;17415;17416;17417;17418;17419;17420;17421;17422;17423;17424;17425;17426;17427;17428;17429;17430;17431;17432;17433;17434;17439;17440;17441;17442;17443;17444;17445;17446;17447;17448;17449;17450;17451;17452;17888;17889;17890;17891;17892;17893;18655;18656;18657;18658;18659;18660;18661;18662;18663;18664;18665;18789;18790;18791;18792;18793;18794;18795;18796;18797;18798;18799;19111;19358;19359;19360;19361;19362;19745;19746;19747;19748;19749;19750;19751;19752;19753;21964;22191;26784;26785;26786;26787;26788;26789;27727;27728;27729;27730;27731;27732;27733;27734;27735;28158;28159;28160;28161;29966;29967;29968;29969;29970;29971;29972;29973;29974;29975;29976;29977;29978;29979;29980;29981;29982;29983;29984;29985;29986;29987;29988;29989;31173;31174;31175;31176;31177;31178;31179;31180;31181;31182;31183;31631;31632;31633;31634;31635;31636;32491;32492;32493;32494;32495;32496;32497;32498;32499;32649;32650;32651;32652;32653;32654;32655;32656;35761;35762;35763;35764;35765;35766;35767;35768;35769;35770;35771;35772;35773;35774;37262;37263;37264;37265;37266;37267;37268;37269;37270;37271;37272;37273;37274;37275;37276;37277;37475;37476;37477;37478;37479;37480;37481;38544;38545;38546;38547;38548;38549;39142;39143;39144;39145;39146;39147;39148;39149;39150;39151;39152;39153;39154;39155;39156;39157;39158;41218;41219;41220;41221;41222;41223;41224;41225;41226;41801;41802;41803;41804;41805;41806;41807;41808;41809;41810;41811;42377;42378;42379;42380;44950;44951;44952;45496;45497;45498;45499;45500;46138;46139;46140;46141;46142;46143;46144;46145 436;601;615;780;966;2251;2262;3707;4003;4012;4250;5862;6395;6431;6639;7778;9370;10063;10097;10300;11261;12483;12854;13593;16180;16185;16804;16813;17417;17426;17441;17444;17448;17891;18662;18797;19111;19361;19746;21964;22191;26785;27733;28160;29980;29988;31183;31631;32495;32654;35770;37276;37480;38548;39151;41226;41811;42377;44951;45500;46144 152;153;154;155;156;157;158;159;160;161;162;163;164;165;166;167;168 9;13;22;81;240;241;275;337;379;437;438;478;619;681;709;796;828 -1;-1
YDR388W YDR388W 13 13 13 YDR388W pep chromosome:R64-1-1:IV:1250186:1251634:1 gene:YDR388W transcript:YDR388W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RVS167 description:Calmodulin-binding actin-associated protein; roles in endocytic membrane t 1 13 13 13 5 8 10 7 5 10 5 8 10 7 5 10 5 8 10 7 5 10 35.5 35.5 35.5 52.774 482 482 0 85.117 13.9 22.4 31.5 23.9 16.4 29.3 1049600000 95864000 112090000 484570000 96090000 32115000 228830000 171910000 190120000 255970000 180420000 145150000 243000000 5 9 11 7 6 10 48 333 390;704;2557;3218;3612;4519;4520;4856;5073;7100;7241;9354;12301 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 415;744;2646;3332;3755;4712;4713;5059;5283;7407;7588;9811;12874 1702;1703;1704;1705;1706;1707;2926;9644;9645;9646;9647;12134;12135;12136;13789;17205;17206;17207;17208;17209;17210;17211;17212;17213;18474;19380;19381;19382;27119;27120;27121;27122;27754;27755;27756;35883;35884;35885;35886;35887;35888;35889;47599;47600;47601;47602;47603;47604;47605 1706;1707;1708;1709;1710;1711;2936;9693;9694;9695;9696;12219;12220;12221;13880;17319;17320;17321;17322;17323;17324;17325;17326;17327;18592;19503;19504;19505;27281;27282;27283;27284;27927;27928;27929;36093;36094;36095;36096;36097;36098;36099;47931;47932;47933;47934;47935;47936;47937 1709;2936;9696;12221;13880;17320;17323;18592;19503;27284;27929;36098;47932 -1
YDR392W YDR392W 1 1 1 YDR392W pep chromosome:R64-1-1:IV:1258696:1259709:1 gene:YDR392W transcript:YDR392W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SPT3 description:Subunit of the SAGA and SAGA-like transcriptional regulatory complexes; inte 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 4.5 4.5 4.5 38.8 337 337 0.008658 1.7858 4.5 4.5 0 0 0 4.5 7209600 2447100 1532100 0 0 0 3230400 0 0 0 0 0 3230400 1 1 0 0 0 1 3 334 5714 True 5955 21898;21899;21900 22028;22029;22030 22030 -1
YDR394W YDR394W 10 10 9 YDR394W pep chromosome:R64-1-1:IV:1261681:1262967:1 gene:YDR394W transcript:YDR394W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPT3 description:ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome; one of ATPases 1 10 10 9 3 5 4 5 3 3 3 5 4 5 3 3 2 4 3 4 2 2 26.4 26.4 23.6 47.893 428 428 0 20.471 11.2 14 13.1 14.5 9.1 10 133510000 20734000 16577000 40604000 20631000 7879900 27080000 23742000 36736000 20207000 31458000 26282000 27327000 4 5 4 5 3 4 25 335 1917;1918;3404;3885;7068;7247;8558;10004;11370;12348 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1990;1991;3529;4042;7372;7594;8982;10493;11907;12921 7398;7399;7400;7401;7402;7403;12914;12915;12916;12917;12918;12919;12920;12921;14770;27034;27035;27762;32643;32644;32645;38358;43882;43883;47767 7439;7440;7441;7442;7443;7444;13001;13002;13003;13004;13005;13006;13007;13008;14872;27196;27197;27935;32839;32840;32841;38590;44181;44182;48099 7439;7442;13001;14872;27196;27935;32840;38590;44181;48099 -1
YDR398W YDR398W 3 3 3 YDR398W pep chromosome:R64-1-1:IV:1267471:1269402:1 gene:YDR398W transcript:YDR398W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP5 description:Subunit of U3-containing Small Subunit (SSU) processome complex; involved in 1 3 3 3 1 0 2 1 2 1 1 0 2 1 2 1 1 0 2 1 2 1 7.5 7.5 7.5 72.001 643 643 0 3.7729 1.1 0 6.4 5.3 6.4 1.1 97563000 16981000 0 54759000 11148000 7055900 7619300 0 0 31840000 0 23755000 0 1 0 2 1 2 1 7 336 1890;5605;6116 True;True;True 1961;5842;6367 7336;7337;7338;21524;23482;23483;23484 7377;7378;7379;21651;23622;23623;23624 7378;21651;23624 -1
YDR405W YDR405W 3 3 3 YDR405W pep chromosome:R64-1-1:IV:1277646:1278437:1 gene:YDR405W transcript:YDR405W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRP20 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit [Source:SGD;Acc:S00000 1 3 3 3 0 1 2 0 2 3 0 1 2 0 2 3 0 1 2 0 2 3 17.9 17.9 17.9 30.566 263 263 0 8.4982 0 9.1 12.5 0 12.5 17.9 74584000 0 1811500 38120000 0 4856500 29795000 0 0 23471000 0 16411000 28433000 0 1 2 0 2 3 8 337 102;5629;6353 True;True;True 105;5866;6618 424;425;426;21615;24262;24263;24264;24265 425;426;427;21743;24410;24411;24412;24413 426;21743;24410 -1
YDR406W YDR406W 6 1 1 YDR406W pep chromosome:R64-1-1:IV:1279210:1283799:1 gene:YDR406W transcript:YDR406W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PDR15 description:Plasma membrane ATP binding cassette (ABC) transporter; multidrug transport 1 6 1 1 5 4 1 2 4 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.9 0.5 0.5 172.25 1529 1529 0.0065646 1.8642 3.1 2.7 0.9 1.1 2.7 0.9 62185000 3908200 32542000 0 15025000 10710000 0 0 0 0 0 35409000 0 1 1 0 1 1 0 4 338 2550;3112;8826;9042;10629;11029 False;False;False;False;False;True 2639;3222;9259;9486;11137;11556 9605;9606;9607;11782;11783;11784;33681;34589;34590;34591;34592;34593;40657;40658;42444;42445;42446;42447 9654;9655;9656;11865;11866;11867;33882;34797;34798;34799;34800;34801;40900;40901;42739;42740;42741;42742 9656;11867;33882;34799;40901;42739 -1
YDR408C YDR408C 2 2 2 YDR408C pep chromosome:R64-1-1:IV:1288215:1288859:-1 gene:YDR408C transcript:YDR408C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ADE8 description:Phosphoribosyl-glycinamide transformylase; catalyzes a step in the de novo 1 2 2 2 0 2 1 2 1 0 0 2 1 2 1 0 0 2 1 2 1 0 12.1 12.1 12.1 23.54 214 214 0 9.0692 0 12.1 7.9 12.1 7.9 0 31114000 0 7542300 11949000 7728100 3895200 0 0 16075000 0 16183000 0 0 0 2 1 2 1 0 6 339 5181;10862 True;True 5396;11382 19810;19811;19812;19813;41780;41781 19933;19934;19935;19936;42043;42044 19935;42044 -1
YEL054C;YDR418W YEL054C;YDR418W 11;11 11;11 11;11 YEL054C pep chromosome:R64-1-1:V:52721:53218:-1 gene:YEL054C transcript:YEL054C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL12A description:Ribosomal 60S subunit protein L12A; rpl12a rpl12b double mutant exhibits slow 2 11 11 11 9 8 8 7 9 5 9 8 8 7 9 5 9 8 8 7 9 5 69.1 69.1 69.1 17.822 165 165;165 0 66.342 68.5 53.9 63.6 53.9 53.3 39.4 6409200000 1311300000 1019200000 1834500000 706330000 508340000 1029500000 1269700000 1687700000 1425700000 1509700000 1868000000 1331900000 13 14 14 10 12 10 73 340 921;1732;3669;4046;5365;7789;8053;10291;10292;10875;11000 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 964;1799;3815;4211;5593;8185;8458;10790;10791;11395;11526 3835;3836;3837;3838;3839;3840;3841;3842;3843;3844;3845;3846;6866;6867;6868;6869;6870;13966;13967;13968;13969;13970;13971;13972;13973;13974;13975;13976;13977;13978;13979;13980;13981;13982;15367;15368;15369;15370;20554;20555;20556;29924;29925;29926;29927;29928;29929;29930;29931;29932;29933;29934;29935;30861;30862;39498;39499;39500;39501;39502;39503;41807;41808;41809;41810;41811;41812;41813;41814;41815;41816;42328;42329 3849;3850;3851;3852;3853;3854;3855;3856;3857;3858;3859;3860;3861;6906;6907;6908;6909;6910;14060;14061;14062;14063;14064;14065;14066;14067;14068;14069;14070;14071;14072;14073;14074;14075;14076;15475;15476;15477;15478;20681;20682;20683;30111;30112;30113;30114;30115;30116;30117;30118;30119;30120;30121;30122;31053;31054;39734;39735;39736;39737;39738;39739;42070;42071;42072;42073;42074;42075;42076;42077;42078;42079;42623;42624 3859;6910;14076;15476;20683;30117;31053;39734;39739;42076;42623 -1;-1
YDR429C YDR429C 11 11 11 YDR429C pep chromosome:R64-1-1:IV:1324477:1325301:-1 gene:YDR429C transcript:YDR429C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TIF35 description:eIF3g subunit of the eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3); su 1 11 11 11 8 7 7 10 7 3 8 7 7 10 7 3 8 7 7 10 7 3 56.2 56.2 56.2 30.501 274 274 0 80.107 37.2 39.1 31.8 48.9 33.2 16.8 910570000 163460000 114890000 286800000 124590000 78060000 142770000 166200000 253050000 127220000 235110000 296800000 162940000 9 9 9 13 7 6 53 341 262;1369;1370;1974;3090;3321;3462;4410;5795;8875;10215 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 274;1427;1428;2049;3199;3442;3593;4595;4596;6037;9311;10711 1151;5492;5493;5494;5495;5496;5497;5498;5499;5500;5501;7562;7563;7564;11681;11682;12587;12588;12589;12590;12591;12592;13172;13173;13174;16753;16754;16755;16756;16757;16758;16759;16760;16761;16762;16763;16764;16765;22194;22195;22196;22197;22198;22199;33837;33838;33839;33840;33841;39189;39190;39191;39192 1153;5527;5528;5529;5530;5531;5532;5533;5534;5535;5536;7604;7605;7606;11763;11764;12673;12674;12675;12676;12677;12678;13261;13262;13263;16864;16865;16866;16867;16868;16869;16870;16871;16872;16873;16874;16875;16876;16877;22324;22325;22326;22327;22328;22329;34038;34039;34040;34041;34042;39425;39426;39427;39428 1153;5528;5532;7604;11764;12677;13263;16870;22327;34041;39425 169 196 -1
YDR432W YDR432W 13 13 13 YDR432W pep chromosome:R64-1-1:IV:1328783:1330027:1 gene:YDR432W transcript:YDR432W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NPL3 description:RNA-binding protein; promotes elongation, regulates termination, and carries 1 13 13 13 9 9 7 10 8 9 9 9 7 10 8 9 9 9 7 10 8 9 37.9 37.9 37.9 45.407 414 414 0 141.33 34.1 34.1 28.7 34.1 26.1 34.1 2640400000 560180000 277030000 699510000 279280000 154300000 670110000 602470000 602210000 460130000 535730000 514600000 711240000 11 11 11 14 10 11 68 342 1118;1934;3340;4346;5769;5770;6413;7392;7697;7698;8110;8882;8883 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1168;2008;3462;4524;6010;6011;6012;6679;7761;8083;8084;8518;9318;9319 4579;4580;4581;4582;4583;4584;4585;4586;4587;4588;4589;4590;7438;7439;7440;7441;7442;7443;7444;7445;12643;12644;12645;12646;12647;16494;16495;16496;16497;16498;16499;16500;16501;16502;16503;16504;16505;22077;22078;22079;22080;22081;22082;22083;22084;22085;24475;24476;24477;24478;24479;28369;29500;29501;29502;29503;29504;29505;31072;31073;31074;33865;33866;33867;33868;33869;33870;33871 4605;4606;4607;4608;4609;4610;4611;4612;4613;4614;4615;4616;7479;7480;7481;7482;7483;7484;7485;7486;12729;12730;12731;12732;12733;16604;16605;16606;16607;16608;16609;16610;16611;16612;16613;16614;16615;22207;22208;22209;22210;22211;22212;22213;22214;22215;24623;24624;24625;24626;24627;28546;29684;29685;29686;29687;29688;29689;31265;31266;31267;34066;34067;34068;34069;34070;34071;34072 4613;7479;12730;16608;22207;22211;24624;28546;29687;29689;31266;34067;34071 170 151 -1
YDR440W YDR440W 4 4 4 YDR440W pep chromosome:R64-1-1:IV:1342493:1344241:1 gene:YDR440W transcript:YDR440W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DOT1 description:Nucleosomal histone H3-Lys79 methylase; methylation is required for telomeri 1 4 4 4 1 1 0 0 0 2 1 1 0 0 0 2 1 1 0 0 0 2 9.8 9.8 9.8 66.201 582 582 0 7.9069 3.8 1.7 0 0 0 4.3 40879000 2472300 31643000 0 0 0 6763500 3229300 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 2 4 343 4106;6566;8431;8898 True;True;True;True 4273;6843;8852;9334 15640;25081;32156;33922 15748;25231;32352;34123 15748;25231;32352;34123 -1
YML024W;YDR447C YML024W;YDR447C 10;10 10;10 10;10 YML024W pep chromosome:R64-1-1:XIII:225889:226697:1 gene:YML024W transcript:YML024W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS17A description:Ribosomal protein 51 (rp51) of the small (40s) subunit; homologous to mamm 2 10 10 10 9 9 7 10 8 7 9 9 7 10 8 7 9 9 7 10 8 7 59.6 59.6 59.6 15.788 136 136;136 0 82.994 58.1 58.1 58.1 59.6 57.4 58.1 6522200000 1241700000 916620000 1609800000 885640000 524940000 1343500000 1450800000 1848300000 1228200000 1708800000 1680400000 1501300000 14 14 10 15 13 11 77 344 1395;3744;4999;5590;6475;6784;6785;7614;9238;9387 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1453;3890;3891;5205;5827;6747;7067;7068;7994;9691;9849 5579;5580;5581;5582;5583;5584;5585;14226;14227;14228;14229;14230;14231;14232;14233;14234;14235;14236;19013;19014;19015;19016;19017;19018;19019;19020;21470;21471;21472;21473;21474;21475;24734;24735;24736;24737;24738;24739;24740;24741;24742;25912;25913;25914;25915;25916;25917;25918;25919;25920;25921;25922;25923;25924;25925;29212;35420;35421;35422;35423;35424;35425;35426;35427;35428;35429;35430;35431;36008;36009;36010;36011;36012;36013;36014;36015 5614;5615;5616;5617;5618;5619;5620;14324;14325;14326;14327;14328;14329;14330;14331;14332;14333;14334;19135;19136;19137;19138;19139;19140;19141;19142;19143;21597;21598;21599;21600;21601;21602;24883;24884;24885;24886;24887;24888;24889;24890;24891;26069;26070;26071;26072;26073;26074;26075;26076;26077;26078;26079;26080;26081;26082;29395;35628;35629;35630;35631;35632;35633;35634;35635;35636;35637;35638;35639;36219;36220;36221;36222;36223;36224;36225;36226 5618;14330;19139;21599;24891;26070;26078;29395;35638;36224 171 58 -1;-1
YDR448W YDR448W 2 2 2 YDR448W pep chromosome:R64-1-1:IV:1356065:1357369:1 gene:YDR448W transcript:YDR448W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ADA2 description:Transcription coactivator; component of the ADA and SAGA transcriptional ada 1 2 2 2 1 1 2 0 2 0 1 1 2 0 2 0 1 1 2 0 2 0 7.4 7.4 7.4 50.569 434 434 0.00084175 3.2862 2.3 2.3 7.4 0 7.4 0 16451000 2343000 0 11931000 0 2177200 0 0 0 6244500 0 7984200 0 1 1 2 0 2 0 6 345 2137;12394 True;True 2217;12969 8176;8177;8178;8179;47941;47942 8218;8219;8220;8221;48274;48275 8220;48274 -1
YDR449C YDR449C 5 5 5 YDR449C pep chromosome:R64-1-1:IV:1357580:1358902:-1 gene:YDR449C transcript:YDR449C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP6 description:Nucleolar protein; component of the small subunit (SSU) processome containi 1 5 5 5 2 2 1 3 2 2 2 2 1 3 2 2 2 2 1 3 2 2 9.8 9.8 9.8 52.418 440 440 0 13.433 4.3 3.6 2 5.5 4.3 3.6 30341000 6504500 6186200 3420200 5037700 2862800 6330000 0 14042000 0 9438800 0 6630900 2 2 1 3 2 2 12 346 4017;4268;7546;9868;12070 True;True;True;True;True 4180;4443;7924;10351;12633 15269;15270;15271;16218;16219;16220;16221;16222;28962;37891;46738;46739 15376;15377;15378;16327;16328;16329;16330;16331;29145;38121;47063;47064 15376;16328;29145;38121;47064 -1
YML026C;YDR450W YML026C;YDR450W 15;15 15;15 15;15 YML026C pep chromosome:R64-1-1:XIII:222987:223828:-1 gene:YML026C transcript:YML026C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS18B description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mam 2 15 15 15 9 10 13 7 10 12 9 10 13 7 10 12 9 10 13 7 10 12 75.3 75.3 75.3 17.037 146 146;146 0 96.889 63.7 63 75.3 57.5 69.2 61 6268900000 1067900000 410570000 2664200000 332890000 404740000 1388500000 1415000000 912290000 1331900000 1065400000 1049700000 1399500000 12 13 14 12 14 16 81 347 118;225;226;4485;4839;4863;4935;6260;6569;8303;8462;8655;9344;12291;12292 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 123;236;237;4677;5041;5042;5066;5141;6519;6846;8720;8884;9080;9801;12862;12863 500;501;969;970;971;972;973;974;17083;17084;17085;17086;17087;18382;18383;18384;18385;18386;18387;18388;18389;18390;18391;18392;18393;18394;18395;18396;18511;18512;18513;18514;18788;18789;18790;18791;23963;23964;23965;23966;23967;23968;25086;25087;25088;25089;25090;31722;31723;31724;31725;31726;32270;32974;32975;32976;35835;35836;35837;35838;35839;35840;35841;35842;35843;35844;35845;35846;35847;35848;35849;35850;35851;47551;47552;47553;47554;47555;47556;47557;47558;47559;47560 501;502;971;972;973;974;975;976;17197;17198;17199;17200;17201;18499;18500;18501;18502;18503;18504;18505;18506;18507;18508;18509;18510;18511;18512;18513;18629;18630;18631;18632;18909;18910;18911;18912;24108;24109;24110;24111;24112;24113;25236;25237;25238;25239;25240;31918;31919;31920;31921;31922;32466;33172;33173;33174;36043;36044;36045;36046;36047;36048;36049;36050;36051;36052;36053;36054;36055;36056;36057;36058;36059;36060;36061;47883;47884;47885;47886;47887;47888;47889;47890;47891;47892 502;974;976;17197;18511;18631;18912;24111;25236;31919;32466;33174;36046;47886;47892 172 73 -1;-1
YDR452W YDR452W 5 5 5 YDR452W pep chromosome:R64-1-1:IV:1362878:1364902:1 gene:YDR452W transcript:YDR452W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PPN1 description:Dual endo- and exopolyphosphatase with a role in phosphate metabolism; acts 1 5 5 5 4 2 2 1 2 4 4 2 2 1 2 4 4 2 2 1 2 4 11.7 11.7 11.7 78.343 674 674 0 16.853 9.9 4.2 3.1 2.8 4.2 10.4 129960000 39235000 11096000 42651000 2992900 10100000 23886000 34519000 30848000 0 0 44617000 22612000 4 3 2 2 3 4 18 348 1947;2438;7463;8722;12285 True;True;True;True;True 2021;2523;7837;9149;12856 7476;9253;9254;28667;28668;28669;28670;28671;33273;33274;47527;47528;47529;47530;47531;47532;47533 7517;9300;9301;28847;28848;28849;28850;28851;33472;33473;47858;47859;47860;47861;47862;47863;47864;47865 7517;9301;28850;33473;47865 -1
YDR454C YDR454C 2 2 2 YDR454C pep chromosome:R64-1-1:IV:1366264:1366827:-1 gene:YDR454C transcript:YDR454C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GUK1 description:Guanylate kinase; converts GMP to GDP; required for growth and mannose oute 1 2 2 2 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 15 15 15 20.637 187 187 0.001576 2.6645 0 7.5 0 0 7.5 7.5 8177300 0 3130700 0 0 1103800 3942800 0 0 0 0 0 3942800 0 1 0 0 0 1 2 349 2432;9539 True;True 2517;10007 9233;9234;36582 9280;9281;36798 9281;36798 -1
YDR457W YDR457W 2 2 2 YDR457W pep chromosome:R64-1-1:IV:1369790:1379596:1 gene:YDR457W transcript:YDR457W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TOM1 description:E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class; has a role in mRNA export from 1 2 2 2 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0.9 0.9 0.9 374.18 3268 3268 0.0079826 1.8134 0 0.5 0 0.5 0 0.5 7010500 0 1205200 0 1677100 0 4128300 0 0 0 3449900 0 0 0 1 0 1 0 1 3 350 3011;7663 True;True 3118;8044 11379;11380;29357 11458;11459;29540 11459;29540 -1
YDR458C YDR458C 3 3 3 YDR458C pep chromosome:R64-1-1:IV:1380055:1382046:-1 gene:YDR458C transcript:YDR458C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HEH2 description:Inner nuclear membrane (INM) protein; contains helix-extension-helix (HEH) 1 3 3 3 2 2 0 1 1 1 2 2 0 1 1 1 2 2 0 1 1 1 5.6 5.6 5.6 76.376 663 663 0 8.0448 4.2 3.5 0 2.1 2.1 2.1 28950000 4905400 17754000 0 1522100 898230 3870700 6407300 0 0 0 0 0 2 2 0 1 1 1 7 351 5703;9602;11332 True;True;True 5944;10071;11869 21860;36780;36781;36782;36783;36784;43686 21990;36999;37000;37001;37002;37003;43985 21990;37003;43985 -1
YDR462W YDR462W 3 3 3 YDR462W pep chromosome:R64-1-1:IV:1386073:1386516:1 gene:YDR462W transcript:YDR462W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL28 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; protein abundance in 1 3 3 3 3 0 0 0 1 1 3 0 0 0 1 1 3 0 0 0 1 1 22.4 22.4 22.4 17.342 147 147 0 7.2785 22.4 0 0 0 6.8 7.5 11155000 6811100 0 0 0 1043200 3300900 8896500 0 0 0 0 0 3 0 0 0 1 1 5 352 5721;9361;11702 True;True;True 5962;9820;12258 21920;21921;35910;35911;45301 22050;22051;36120;36121;45614 22050;36120;45614 -1
YDR465C YDR465C 4 4 4 YDR465C pep chromosome:R64-1-1:IV:1393336:1394574:-1 gene:YDR465C transcript:YDR465C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RMT2 description:Arginine N5 methyltransferase; methylates ribosomal protein Rpl12 (L12) on 1 4 4 4 0 2 2 3 1 3 0 2 2 3 1 3 0 2 2 3 1 3 17.5 17.5 17.5 47.469 412 412 0 19.726 0 8.5 9 12.1 5.3 12.1 76834000 0 8840400 34887000 12509000 1991700 18606000 0 21859000 0 22994000 0 18661000 0 2 2 3 1 3 11 353 3719;8849;8960;12287 True;True;True;True 3865;9284;9400;12858 14132;14133;14134;33761;33762;33763;33764;34155;47539;47540;47541 14229;14230;14231;33962;33963;33964;33965;34361;47871;47872;47873 14230;33965;34361;47873 -1
YDR473C YDR473C 2 2 2 YDR473C pep chromosome:R64-1-1:IV:1404445:1405854:-1 gene:YDR473C transcript:YDR473C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRP3 description:Splicing factor; component of the U4/U6-U5 snRNP complex [Source:SGD;Acc:S0 1 2 2 2 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 8.3 8.3 8.3 55.87 469 469 0 4.9666 0 3.4 0 0 0 4.9 5722900 0 1604400 0 0 0 4118500 0 3480200 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 2 354 5945;10325 True;True 6196;10825 22835;39611 22970;39847 22970;39847 -1
YDR476C YDR476C 2 2 2 YDR476C pep chromosome:R64-1-1:IV:1410453:1411127:-1 gene:YDR476C transcript:YDR476C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localiz 1 2 2 2 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 11.6 11.6 11.6 25.265 224 224 0 19.739 5.4 6.2 0 0 0 0 5370000 3110900 2259100 0 0 0 0 0 4900300 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2 355 2440;4190 True;True 2525;4362 9256;15950 9303;16059 9303;16059 -1
YDR481C YDR481C 1 1 1 YDR481C pep chromosome:R64-1-1:IV:1418550:1420250:-1 gene:YDR481C transcript:YDR481C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PHO8 description:Repressible vacuolar alkaline phosphatase; regulated by levels of Pi and by 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 4.6 4.6 4.6 63.003 566 566 0 5.5277 4.6 0 0 0 4.6 0 24080000 20538000 0 0 0 3541900 0 0 0 0 0 11711000 0 1 0 0 0 1 0 2 356 8916 True 9352 33983;33984 34185;34186 34186 -1
YDR483W YDR483W 2 2 2 YDR483W pep chromosome:R64-1-1:IV:1421157:1422485:1 gene:YDR483W transcript:YDR483W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KRE2 description:Alpha1,2-mannosyltransferase of the Golgi; involved in protein mannosylation 1 2 2 2 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 6.8 6.8 6.8 51.386 442 442 0 5.6907 3.8 0 2.9 0 0 2.9 14083000 2604800 0 8429500 0 0 3048900 0 0 0 0 0 3048900 1 0 1 0 0 1 3 357 10638;11783 True;True 11146;12342 40688;40689;45638 40931;40932;45953 40932;45953 -1
YDR487C YDR487C 1 1 1 YDR487C pep chromosome:R64-1-1:IV:1428354:1428980:-1 gene:YDR487C transcript:YDR487C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RIB3 description:3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase (DHBP synthase); required for 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 8.2 8.2 8.2 22.567 208 208 0 6.7961 8.2 8.2 0 8.2 0 0 5668700 1566900 1966200 0 2135600 0 0 0 0 0 4393200 0 0 1 0 0 1 0 0 2 358 3539 True 3676 13483;13484;13485 13572;13573;13574 13572 -1
YDR490C YDR490C 2 2 2 YDR490C pep chromosome:R64-1-1:IV:1431968:1434268:-1 gene:YDR490C transcript:YDR490C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PKH1 description:Serine/threonine protein kinase; involved in sphingolipid-mediated signalin 1 2 2 2 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 3.8 3.8 3.8 86.251 766 766 0.00086356 3.5815 2.7 1 2.7 2.7 0 2.7 14991000 3413100 2257800 3267900 1455600 0 4596000 0 0 0 0 0 4596000 1 1 1 1 0 1 5 359 5997;12383 True;True 6248;12958 23004;47909;47910;47911;47912 23139;48241;48242;48243;48244 23139;48244 -1
YDR494W YDR494W 6 6 6 YDR494W pep chromosome:R64-1-1:IV:1436930:1438015:1 gene:YDR494W transcript:YDR494W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSM28 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit; genetic interactions 1 6 6 6 1 0 3 1 1 5 1 0 3 1 1 5 1 0 3 1 1 5 21.3 21.3 21.3 41.215 361 361 0 15.325 2.5 0 10.5 3 3 16.3 146040000 4921300 0 73417000 3003900 3265500 61435000 0 0 50474000 0 0 54221000 1 0 3 1 1 5 11 360 1946;5232;6904;6919;9457;11062 True;True;True;True;True;True 2020;5450;7192;7207;9922;11589 7475;20012;26409;26410;26411;26412;26460;26461;26462;36278;42562 7516;20136;26568;26569;26570;26571;26620;26621;26622;36490;42857 7516;20136;26569;26622;36490;42857 -1
YDR496C YDR496C 16 16 16 YDR496C pep chromosome:R64-1-1:IV:1441433:1443403:-1 gene:YDR496C transcript:YDR496C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PUF6 description:Pumilio-homology domain protein; binds the 3 UTR of ASH1 mRNA and represse 1 16 16 16 8 5 9 8 8 10 8 5 9 8 8 10 8 5 9 8 8 10 25.6 25.6 25.6 75.105 656 656 0 54.688 17.2 8.1 14.8 14.6 13.1 17.5 836210000 105550000 34627000 354150000 79060000 42659000 220170000 190270000 136730000 167010000 137810000 128300000 185390000 9 5 9 9 8 11 51 361 508;1106;1645;1777;2015;2789;3334;3664;4759;4841;6678;7673;8386;8387;10855;11133 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 537;1156;1709;1844;2091;2888;3456;3810;4958;5044;6958;8055;8804;8805;11375;11667 2188;4548;4549;6497;6498;6499;6500;6501;7009;7010;7011;7012;7013;7691;7692;7693;7694;10567;10568;10569;12628;13952;18113;18114;18115;18116;18117;18118;18119;18120;18398;18399;18400;18401;18402;25479;29393;29394;29395;29396;29397;29398;32007;32008;32009;41761;41762;41763;41764;41765;42877 2194;4574;4575;6533;6534;6535;6536;6537;7049;7050;7051;7052;7053;7733;7734;7735;7736;10634;10635;10636;12714;14043;18230;18231;18232;18233;18234;18235;18236;18237;18515;18516;18517;18518;18519;25633;29577;29578;29579;29580;29581;29582;32203;32204;32205;42024;42025;42026;42027;42028;43174 2194;4575;6537;7052;7734;10636;12714;14043;18233;18518;25633;29580;32203;32205;42024;43174 -1
YDR500C YDR500C 4 3 3 YDR500C pep chromosome:R64-1-1:IV:1450198:1450853:-1 gene:YDR500C transcript:YDR500C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL37B description:Ribosomal 60S subunit protein L37B; required for processing of 27SB pre-r 1 4 3 3 4 2 2 1 1 2 3 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 44.3 33 33 9.8682 88 88 0 8.8941 44.3 23.9 23.9 12.5 12.5 23.9 522700000 59286000 29795000 240640000 43014000 31079000 118890000 74457000 0 0 94754000 99472000 0 4 1 1 2 2 1 11 362 2386;3069;8997;9977 True;False;True;True 2470;3178;9440;10466 9048;9049;9050;9051;9052;9053;9054;9055;9056;11617;11618;11619;11620;34430;38280 9094;9095;9096;9097;9098;9099;9100;9101;9102;11699;11700;11701;11702;34636;38512 9096;11701;34636;38512 -1
YDR502C YDR502C 16 3 3 YDR502C pep chromosome:R64-1-1:IV:1453310:1454464:-1 gene:YDR502C transcript:YDR502C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SAM2 description:S-adenosylmethionine synthetase; catalyzes transfer of the adenosyl group o 1 16 3 3 8 11 10 11 6 9 2 2 0 2 0 2 2 2 0 2 0 2 31.5 7 7 42.255 384 384 0 6.5377 26.3 22.7 24.2 28.6 13.5 20.6 32433000 6063900 7202300 0 6712100 0 12455000 7841800 15492000 0 14017000 0 0 2 2 0 2 0 2 8 363 759;1339;1340;2725;2726;4074;4184;5112;5113;5669;6406;7419;9328;9329;10533;11966 True;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;True;False 800;1394;1395;1396;1397;2819;2820;4240;4355;5322;5323;5908;6672;7789;9784;9785;11040;12529 3181;5375;5376;5377;5378;5379;5380;5381;5382;5383;5384;5385;10289;10290;10291;10292;10293;10294;10295;10296;10297;10298;10299;15490;15925;15926;19526;19527;19528;19529;21748;21749;21750;24451;24452;24453;24454;24455;24456;28474;28475;28476;28477;28478;28479;28480;28481;28482;28483;35780;35781;35782;35783;40357;40358;40359;40360;46300;46301;46302;46303 3192;5410;5411;5412;5413;5414;5415;5416;5417;5418;5419;5420;10343;10344;10345;10346;10347;10348;10349;10350;10351;10352;10353;10354;10355;10356;10357;15598;16034;16035;19649;19650;19651;19652;21877;21878;21879;24599;24600;24601;24602;24603;24604;28652;28653;28654;28655;28656;28657;28658;28659;28660;28661;35988;35989;35990;35991;40598;40599;40600;40601;46618;46619;46620;46621 3192;5412;5419;10350;10355;15598;16035;19650;19652;21879;24604;28653;35990;35991;40599;46619 173 224 -1
YDR507C YDR507C 12 12 12 YDR507C pep chromosome:R64-1-1:IV:1462358:1465786:-1 gene:YDR507C transcript:YDR507C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GIN4 description:Protein kinase involved in bud growth and assembly of the septin ring; prop 1 12 12 12 7 4 2 0 3 1 7 4 2 0 3 1 7 4 2 0 3 1 15.5 15.5 15.5 129.86 1142 1142 0 46.345 9.4 5.5 2.7 0 3.2 2 65819000 22119000 9122900 14433000 0 10770000 9373300 21629000 27052000 0 0 0 0 6 4 3 0 3 1 17 364 365;1985;2437;5640;5802;6465;6729;7564;8175;10410;10602;11691 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 386;2060;2522;5878;6045;6737;7009;7942;8586;10912;11110;12247 1608;1609;7596;9251;9252;21654;21655;21656;22234;24710;25657;25658;29011;31280;39910;40584;45258;45259 1611;1612;7638;9298;9299;21782;21783;21784;22364;24859;25811;25812;29194;31475;40147;40827;45571;45572 1611;7638;9298;21784;22364;24859;25811;29194;31475;40147;40827;45572 -1
YDR508C YDR508C 4 4 4 YDR508C pep chromosome:R64-1-1:IV:1466453:1468444:-1 gene:YDR508C transcript:YDR508C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GNP1 description:High-affinity glutamine permease; also transports Leu, Ser, Thr, Cys, Met a 1 4 4 4 0 4 1 3 1 0 0 4 1 3 1 0 0 4 1 3 1 0 8.6 8.6 8.6 73.597 663 663 0 17.483 0 8.6 2.7 6.6 2 0 58894000 0 23238000 20603000 11727000 3325500 0 0 43555000 0 30975000 0 0 0 5 1 2 1 0 9 365 1445;7543;8181;9663 True;True;True;True 1505;7921;8592;10135 5779;5780;28956;28957;28958;28959;31287;31288;37028;37029 5814;5815;29139;29140;29141;29142;31482;31483;37247;37248 5815;29139;31482;37248 -1
YDR513W YDR513W 1 1 1 YDR513W pep chromosome:R64-1-1:IV:1471017:1471448:1 gene:YDR513W transcript:YDR513W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GRX2 description:Cytoplasmic glutaredoxin; thioltransferase, glutathione-dependent disulfide 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 9.8 9.8 9.8 15.861 143 143 0.0086393 1.7758 0 9.8 0 0 0 0 1237300 0 1237300 0 0 0 0 0 2683800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 366 872 True 915 3620 3633 3633 -1
YDR514C YDR514C 1 1 1 YDR514C pep chromosome:R64-1-1:IV:1471548:1472999:-1 gene:YDR514C transcript:YDR514C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Protein of unknown function that localizes to mitochondria; overexpression affects endocytic 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1.4 1.4 1.4 55.489 483 483 1 -2 0 0 1.4 0 0 0 678920000 0 0 678920000 0 0 0 0 0 400050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 367 3192 True 3306 12055 12140 12140 174 51 -1
YEL002C YEL002C 5 5 5 YEL002C pep chromosome:R64-1-1:V:148722:150014:-1 gene:YEL002C transcript:YEL002C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:WBP1 description:Beta subunit of the oligosaccharyl transferase glycoprotein complex; required 1 5 5 5 1 4 3 2 2 2 1 4 3 2 2 2 1 4 3 2 2 2 14.2 14.2 14.2 49.391 430 430 0 16.801 3.3 13.5 7.7 5.1 5.1 5.1 76643000 29170000 12204000 20072000 2754400 3724200 8717700 0 15914000 10868000 9351000 14486000 14377000 1 4 3 2 2 2 14 368 1956;5717;5718;6948;10407 True;True;True;True;True 2031;5958;5959;7236;10909 7493;7494;7495;21908;21909;21910;21911;21912;21913;26582;26583;26584;26585;39904 7534;7535;7536;22038;22039;22040;22041;22042;22043;26742;26743;26744;26745;40141 7534;22038;22043;26744;40141 -1
YEL013W YEL013W 2 2 2 YEL013W pep chromosome:R64-1-1:V:128825:130561:1 gene:YEL013W transcript:YEL013W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VAC8 description:Phosphorylated and palmitoylated vacuolar membrane protein; interacts with Atg1 1 2 2 2 1 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 1 5.9 5.9 5.9 63.207 578 578 0 4.9718 4 0 5.9 4 0 4 23718000 3382000 0 13871000 2090900 0 4374300 0 0 8173300 0 0 0 1 0 2 1 0 1 5 369 6924;7584 True;True 7212;7963 26473;29106;29107;29108;29109 26633;29289;29290;29291;29292 26633;29290 -1
YEL015W YEL015W 4 4 4 YEL015W pep chromosome:R64-1-1:V:126629:128284:1 gene:YEL015W transcript:YEL015W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EDC3 description:Non-essential conserved protein with a role in mRNA decapping; specifically aff 1 4 4 4 1 1 0 1 2 1 1 1 0 1 2 1 1 1 0 1 2 1 8.3 8.3 8.3 61.339 551 551 0 9.9763 1.6 1.8 0 1.8 4.9 1.8 15469000 1194300 0 0 3631200 5853100 4790000 0 0 0 0 19352000 0 1 1 0 1 2 1 6 370 3171;3369;5860;8329 True;True;True;True 3284;3492;6105;8746 11990;12769;22456;22457;22458;31816 12075;12856;22590;22591;22592;32012 12075;12856;22592;32012 -1
YEL022W YEL022W 1 1 1 YEL022W pep chromosome:R64-1-1:V:111421:115800:1 gene:YEL022W transcript:YEL022W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GEA2 description:Guanine nucleotide exchange factor for ADP ribosylation factors (ARFs); involve 1 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0.9 0.9 0.9 165.67 1459 1459 0 5.1042 0 0.9 0 0.9 0 0 2897900 0 1770900 0 1126900 0 0 0 0 0 2318300 0 0 0 1 0 1 0 0 2 371 9727 True 10203 37282;37283 37504;37505 37504 -1
YEL026W YEL026W 8 8 8 YEL026W pep chromosome:R64-1-1:V:101943:102323:1 gene:YEL026W transcript:YEL026W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SNU13 description:RNA binding protein; part of U3 snoRNP involved in rRNA processing, part of U4 1 8 8 8 5 4 6 6 4 6 5 4 6 6 4 6 5 4 6 6 4 6 78.6 78.6 78.6 13.569 126 126 0 107.59 56.3 48.4 78.6 56.3 48.4 56.3 11543000000 1063300000 1129200000 5414800000 192130000 1061200000 2682600000 3812500000 1160900000 2214100000 1738300000 2566000000 2123600000 7 6 9 7 7 8 44 372 79;80;186;1241;3047;7979;10520;10521 True;True;True;True;True;True;True;True 82;83;196;1292;3156;8383;11027;11028 323;324;325;326;327;328;329;330;331;805;806;807;808;809;810;811;812;813;814;815;816;817;818;5002;11523;30608;30609;30610;30611;40297;40298;40299;40300;40301;40302;40303;40304;40305;40306;40307;40308;40309;40310 324;325;326;327;328;329;330;331;332;806;807;808;809;810;811;812;813;814;815;816;817;818;819;820;5030;11602;30798;30799;30800;30801;40538;40539;40540;40541;40542;40543;40544;40545;40546;40547;40548;40549;40550;40551 326;331;820;5030;11602;30798;40539;40549 175 54 -1
YEL031W YEL031W 11 11 11 YEL031W pep chromosome:R64-1-1:V:90258:93905:1 gene:YEL031W transcript:YEL031W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SPF1 description:P-type ATPase, ion transporter of the ER membrane; required to maintain normal li 1 11 11 11 4 3 1 8 0 3 4 3 1 8 0 3 4 3 1 8 0 3 12.9 12.9 12.9 135.27 1215 1215 0 21.033 6 2.8 0.7 10.5 0 3.5 63012000 19228000 8934800 3796600 22290000 0 8762600 23818000 19536000 0 41814000 0 13944000 4 3 1 8 0 3 19 373 1447;2482;2487;2561;5259;5529;6613;8929;10422;11820;11849 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1507;2568;2573;2650;5480;5766;6890;9366;10925;12379;12408 5789;9392;9401;9402;9403;9661;20099;20100;21286;21287;21288;25265;34025;34026;39947;45751;45752;45753;45832 5824;9440;9449;9450;9451;9711;20223;20224;21413;21414;21415;25419;34227;34228;40184;46067;46068;46069;46148 5824;9440;9449;9711;20224;21415;25419;34227;40184;46068;46148 176 275 -1
YEL032W YEL032W 10 10 10 YEL032W pep chromosome:R64-1-1:V:86937:89852:1 gene:YEL032W transcript:YEL032W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MCM3 description:Protein involved in DNA replication; component of the Mcm2-7 hexameric helicase c 1 10 10 10 6 3 3 3 0 3 6 3 3 3 0 3 6 3 3 3 0 3 16.8 16.8 16.8 107.52 971 971 0 42.704 10.6 4.2 4.3 6.7 0 5.1 87137000 22354000 7823700 41219000 6984300 0 8755100 25188000 0 23895000 18771000 0 0 5 3 3 3 0 2 16 374 1519;2554;2733;4141;4515;4766;9023;9229;10329;11134 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1579;2643;2827;4310;4708;4966;9466;9682;10829;11668 6048;6049;9616;10330;15744;15745;17194;17195;18157;34529;35390;35391;35392;35393;39623;39624;42878;42879;42880 6084;6085;9665;10388;15852;15853;17308;17309;18274;34736;35598;35599;35600;35601;39859;39860;43175;43176;43177 6084;9665;10388;15852;17309;18274;34736;35600;39859;43175 -1
YEL034W;YJR047C YEL034W 11;3 11;3 11;3 YEL034W pep chromosome:R64-1-1:V:85676:86149:1 gene:YEL034W transcript:YEL034W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HYP2 description:Translation elongation factor eIF-5A; required for translation of proteins contai 2 11 11 11 8 10 9 8 8 9 8 10 9 8 8 9 8 10 9 8 8 9 46.5 46.5 46.5 17.114 157 157;157 0 65.52 46.5 46.5 46.5 46.5 45.9 46.5 3179000000 265030000 284800000 1260300000 535010000 276070000 557810000 416100000 945630000 520740000 956010000 615970000 491450000 8 12 10 15 15 11 71 375 4783;5178;5179;5244;5675;5676;7479;8758;8759;11068;11069 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 4983;4984;5391;5392;5393;5394;5464;5914;5915;5916;7854;9187;9188;9189;9190;11595;11596 18201;18202;18203;18204;18205;18206;18207;18208;19789;19790;19791;19792;19793;19794;19795;19796;19797;19798;19799;19800;19801;19802;19803;19804;19805;19806;20058;20059;20060;20061;20062;20063;20064;20065;21774;21775;21776;21777;21778;21779;21780;21781;28726;28727;28728;28729;33424;33425;33426;33427;33428;33429;33430;33431;33432;33433;33434;33435;33436;33437;42581;42582;42583;42584;42585;42586;42587;42588;42589;42590;42591;42592 18318;18319;18320;18321;18322;18323;18324;18325;19912;19913;19914;19915;19916;19917;19918;19919;19920;19921;19922;19923;19924;19925;19926;19927;19928;19929;20182;20183;20184;20185;20186;20187;20188;20189;21903;21904;21905;21906;21907;21908;21909;21910;28906;28907;28908;28909;33624;33625;33626;33627;33628;33629;33630;33631;33632;33633;33634;33635;33636;33637;42876;42877;42878;42879;42880;42881;42882;42883;42884;42885;42886;42887 18325;19916;19928;20186;21903;21910;28909;33627;33630;42885;42886 177;178;179 21;44;80 -1;-1
YEL046C YEL046C 2 2 2 YEL046C pep chromosome:R64-1-1:V:67629:68792:-1 gene:YEL046C transcript:YEL046C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLY1 description:Threonine aldolase; catalyzes the cleavage of L-allo-threonine and L-threonine t 1 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 7.5 7.5 7.5 42.815 387 387 0 13.002 2.8 4.7 7.5 7.5 4.7 7.5 28416000 4166700 2534000 8603300 4190300 2012000 6910000 0 0 0 8678000 0 6852000 1 1 2 2 2 2 10 376 3039;7027 True;True 3148;7320 11488;11489;11490;11491;11492;11493;26850;26851;26852;26853 11567;11568;11569;11570;11571;11572;27011;27012;27013;27014 11572;27012 -1
YEL050C YEL050C 4 4 4 YEL050C pep chromosome:R64-1-1:V:59670:60851:-1 gene:YEL050C transcript:YEL050C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RML2 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit (L2); has similarity to E. 1 4 4 4 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 15 15 15 43.785 393 393 0 3.7486 0 0 2.3 2.3 3.6 6.9 16636000 0 0 10402000 1935100 962200 3336800 0 0 0 0 0 3336800 0 0 1 1 0 1 3 377 3193;9397;9450;11805 True;True;True;True 3307;9859;9915;12364 12056;36047;36262;45715 12141;36258;36474;46031 12141;36258;36474;46031 180 245 -1
YEL051W YEL051W 4 4 4 YEL051W pep chromosome:R64-1-1:V:58378:59148:1 gene:YEL051W transcript:YEL051W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VMA8 description:Subunit D of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase; part of the electroge 1 4 4 4 2 2 4 2 1 3 2 2 4 2 1 3 2 2 4 2 1 3 20.3 20.3 20.3 29.194 256 256 0 9.8117 12.9 12.9 20.3 12.9 4.3 17.6 209200000 15962000 9392900 122860000 8743600 1232200 51015000 24507000 24232000 71004000 20918000 0 41958000 2 1 4 1 1 2 11 378 2967;6071;10025;11350 True;True;True;True 3073;6322;10515;11887 11239;23300;23301;38422;38423;38424;38425;38426;43782;43783;43784;43785;43786;43787 11316;23436;23437;38654;38655;38656;38657;38658;44081;44082;44083;44084;44085;44086 11316;23437;38655;44084 -1
YEL055C YEL055C 13 13 13 YEL055C pep chromosome:R64-1-1:V:48471:51539:-1 gene:YEL055C transcript:YEL055C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:POL5 description:DNA Polymerase phi; has sequence similarity to the human MybBP1A and weak sequen 1 13 13 13 9 7 7 10 6 5 9 7 7 10 6 5 9 7 7 10 6 5 17.8 17.8 17.8 115.89 1022 1022 0 61.774 14.3 9.4 10.5 11.9 9.7 5.9 686300000 210180000 95136000 255210000 60635000 27886000 37256000 174040000 183130000 148080000 138160000 133690000 108370000 8 6 7 8 6 5 40 379 1556;1941;3114;3206;4681;5700;5982;6950;7006;7031;7888;10330;11452 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1619;2015;3224;3320;4878;5941;6233;7238;7295;7324;8288;10830;11991 6198;6199;6200;6201;6202;7462;11795;11796;11797;12089;12090;17786;17787;17788;17789;21848;21849;22944;22945;22946;26587;26762;26763;26764;26864;26865;26866;26867;26868;26869;30267;30268;30269;30270;30271;39625;39626;39627;39628;44227;44228;44229;44230;44231 6234;6235;6236;6237;6238;7503;11878;11879;11880;12174;12175;17901;17902;17903;17904;21978;21979;23079;23080;23081;26747;26923;26924;26925;27025;27026;27027;27028;27029;27030;30456;30457;30458;30459;30460;39861;39862;39863;39864;44532;44533;44534;44535;44536 6234;7503;11878;12175;17903;21979;23080;26747;26925;27028;30458;39861;44534 -1
YEL060C YEL060C 2 2 2 YEL060C pep chromosome:R64-1-1:V:40046:41953:-1 gene:YEL060C transcript:YEL060C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRB1 description:Vacuolar proteinase B (yscB) with H3 N-terminal endopeptidase activity; serine p 1 2 2 2 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 3.1 3.1 3.1 69.621 635 635 0 6.021 0 1.3 1.9 1.3 1.3 1.9 38930000 0 6580600 19279000 3545600 2679500 6845000 0 0 0 0 0 6845000 0 1 1 1 1 1 5 380 6396;9386 True;True 6662;9848 24417;24418;24419;36006;36007 24565;24566;24567;36217;36218 24567;36217 -1
YER002W YER002W 5 5 5 YER002W pep chromosome:R64-1-1:V:156803:157498:1 gene:YER002W transcript:YER002W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP16 description:Constituent of 66S pre-ribosomal particles; involved in 60S ribosomal subunit 1 5 5 5 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 2 2 20.8 20.8 20.8 26.901 231 231 0 29.796 14.7 14.7 14.7 14.7 10.4 9.5 103250000 11303000 8051700 55841000 8224400 5371300 14462000 14713000 17648000 27675000 16804000 0 19674000 3 3 3 3 2 2 16 381 1468;5180;7416;7417;9516 True;True;True;True;True 1528;5395;7786;7787;9984 5857;5858;5859;5860;5861;5862;19807;19808;19809;28463;28464;28465;28466;28467;28468;36503 5892;5893;5894;5895;5896;5897;19930;19931;19932;28641;28642;28643;28644;28645;28646;36719 5896;19931;28644;28646;36719 -1
YER006W YER006W 31 31 31 YER006W pep chromosome:R64-1-1:V:162723:164285:1 gene:YER006W transcript:YER006W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NUG1 description:GTPase that associates with nuclear 60S pre-ribosomes; required for export of 6 1 31 31 31 19 17 17 19 13 20 19 17 17 19 13 20 19 17 17 19 13 20 59.8 59.8 59.8 57.708 520 520 0 196.99 45.6 46.7 44.4 41.9 34.6 47.9 2008700000 421360000 215690000 527790000 279820000 132960000 431050000 499530000 534680000 411210000 529140000 443360000 357610000 21 17 20 20 15 21 114 382 81;306;829;1619;1620;2955;2956;3521;3573;4276;4277;4284;4285;4315;5217;5357;6707;6979;6980;8081;8082;8309;8764;9114;9147;9173;9653;9799;9800;10770;10922 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 84;322;871;1682;1683;3061;3062;3656;3713;3714;4452;4453;4460;4461;4492;5435;5584;6987;7268;7269;8487;8488;8726;9195;9561;9595;9623;10125;10280;10281;11286;11444 332;333;334;335;336;337;1360;1361;1362;1363;1364;3453;6410;6411;6412;6413;6414;6415;6416;11204;11205;11206;11207;11208;11209;13404;13405;13406;13407;13408;13617;13618;13619;13620;16249;16250;16251;16252;16253;16254;16255;16256;16286;16287;16288;16289;16290;16291;16388;16389;16390;16391;16392;19962;19963;19964;20509;25590;25591;25592;25593;25594;26682;26683;26684;26685;26686;26687;26688;30971;30972;30973;30974;30975;30976;30977;31741;33448;34869;34870;34871;34872;34873;35015;35016;35017;35131;35132;35133;35134;35135;35136;35137;35138;35139;36994;36995;36996;37586;37587;37588;37589;37590;37591;37592;37593;37594;37595;37596;37597;41428;41975;41976 333;334;335;336;337;338;1363;1364;1365;1366;1367;3466;6446;6447;6448;6449;6450;6451;6452;11281;11282;11283;11284;11285;11286;13493;13494;13495;13496;13497;13706;13707;13708;13709;16358;16359;16360;16361;16362;16363;16364;16365;16395;16396;16397;16398;16399;16400;16497;16498;16499;16500;16501;20086;20087;20088;20636;25744;25745;25746;25747;25748;26842;26843;26844;26845;26846;26847;26848;26849;31163;31164;31165;31166;31167;31168;31169;31937;33648;35077;35078;35079;35080;35081;35223;35224;35225;35339;35340;35341;35342;35343;35344;35345;35346;35347;37213;37214;37215;37815;37816;37817;37818;37819;37820;37821;37822;37823;37824;37825;37826;41688;42239;42240 333;1364;3466;6450;6452;11281;11284;13496;13708;16360;16364;16395;16400;16497;20087;20636;25745;26848;26849;31166;31169;31937;33648;35080;35225;35340;37213;37820;37825;41688;42239 181;182;183 378;518;519 -1
YER007C-A YER007C-A 8 8 8 YER007C-A pep chromosome:R64-1-1:V:166237:166885:-1 gene:YER007C-A transcript:YER007C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TMA20 description:Protein of unknown function that associates with ribosomes; has a putat 1 8 8 8 6 3 6 6 5 6 6 3 6 6 5 6 6 3 6 6 5 6 58 58 58 20.277 181 181 0 21.846 40.3 24.9 33.7 50.8 35.4 37.6 610120000 83145000 24850000 319470000 74572000 18093000 89995000 119420000 100590000 139370000 120500000 65344000 108760000 6 3 7 7 5 6 34 383 2181;2688;2735;2987;3877;5315;6876;8450 True;True;True;True;True;True;True;True 2261;2782;2829;3093;4034;5538;7164;8872 8324;8325;8326;10140;10141;10142;10143;10144;10333;11293;11294;11295;11296;11297;11298;11299;11300;14739;14740;14741;14742;14743;20327;20328;20329;20330;20331;26276;26277;26278;26279;26280;32215;32216 8367;8368;8369;10194;10195;10196;10197;10198;10391;11372;11373;11374;11375;11376;11377;11378;11379;14841;14842;14843;14844;14845;20453;20454;20455;20456;20457;26434;26435;26436;26437;26438;32411;32412 8368;10197;10391;11375;14845;20455;26435;32411 184 110 -1
YER008C YER008C 3 3 3 YER008C pep chromosome:R64-1-1:V:167808:171818:-1 gene:YER008C transcript:YER008C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC3 description:Subunit of the exocyst complex; the exocyst mediates polarized targeting and t 1 3 3 3 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 3.3 3.3 3.3 154.69 1336 1336 0 4.4907 1.6 0 0 0 1.6 0 11051000 9555600 0 0 0 1495200 0 12481000 0 0 0 0 0 2 0 0 0 1 0 3 384 4668;6213;7850 True;True;True 4865;6470;8250 17756;23820;30167 17871;23962;30355 17871;23962;30355 -1
YER019C-A YER019C-A 1 1 1 YER019C-A pep chromosome:R64-1-1:V:194273:194539:-1 gene:YER019C-A transcript:YER019C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SBH2 description:Ssh1p-Sss1p-Sbh2p complex component; involved in protein translocation i 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 14.8 14.8 14.8 9.606 88 88 0.0015686 2.6041 14.8 14.8 0 0 14.8 0 6808400 2732300 2651100 0 0 1425100 0 0 0 0 0 4711700 0 1 1 0 0 1 0 3 385 8066 True 8472 30914;30915;30916 31106;31107;31108 31107 -1
YER021W YER021W 1 1 1 YER021W pep chromosome:R64-1-1:V:196948:198519:1 gene:YER021W transcript:YER021W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPN3 description:Essential non-ATPase regulatory subunit of the 26S proteasome lid; similar to t 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 2.9 2.9 2.9 60.392 523 523 0 20.981 0 0 2.9 0 0 2.9 11096000 0 0 7318300 0 0 3777500 0 0 0 0 0 3777500 0 0 1 0 0 1 2 386 9573 True 10042 36696;36697 36914;36915 36915 -1
YER023W YER023W 2 2 2 YER023W pep chromosome:R64-1-1:V:201076:201936:1 gene:YER023W transcript:YER023W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRO3 description:Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase; catalyzes the last step in proline b 1 2 2 2 2 2 2 2 1 0 2 2 2 2 1 0 2 2 2 2 1 0 8.7 8.7 8.7 30.131 286 286 0 22.857 8.7 8.7 8.7 8.7 4.2 0 153130000 31763000 19861000 71032000 19877000 10594000 0 34241000 40311000 51686000 41079000 0 0 2 2 2 2 1 0 9 387 16;8956 True;True 18;9396 69;70;71;72;34142;34143;34144;34145;34146 69;70;71;72;34348;34349;34350;34351;34352 72;34351 -1
YER025W YER025W 27 27 27 YER025W pep chromosome:R64-1-1:V:205251:206834:1 gene:YER025W transcript:YER025W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GCD11 description:Gamma subunit of the translation initiation factor eIF2; involved in the ident 1 27 27 27 20 18 21 17 19 18 20 18 21 17 19 18 20 18 21 17 19 18 56.4 56.4 56.4 57.865 527 527 0 151.79 51 40.6 46.9 48 43.6 49.3 6939500000 1209700000 512330000 2643900000 542690000 433720000 1597200000 1423000000 1249000000 1618800000 1126700000 1323200000 1530000000 29 22 30 21 26 26 154 388 109;382;1132;1623;2160;2161;2366;2979;3352;3704;4529;5081;5185;5782;5959;5960;6075;6421;6538;6873;8086;8888;8904;10792;10893;10897;12200 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 114;405;1182;1183;1686;2240;2241;2450;3085;3474;3850;4723;5291;5400;5401;6024;6210;6211;6326;6687;6814;7161;8493;9324;9340;11310;11413;11414;11418;12769 475;1676;1677;1678;4632;4633;4634;4635;6430;6431;6432;6433;6434;6435;6436;6437;6438;6439;6440;6441;8249;8250;8251;8252;8977;8978;8979;8980;11263;12697;12698;12699;12700;12701;12702;12703;12704;12705;12706;14086;14087;14088;14089;14090;14091;17256;17257;17258;17259;17260;19427;19833;19834;19835;19836;19837;19838;19839;19840;19841;19842;19843;19844;22144;22145;22146;22147;22148;22149;22150;22151;22152;22153;22154;22866;22867;22868;22869;22870;22871;22872;22873;23311;23312;23313;23314;24511;24512;24513;24514;24515;24516;24517;24518;24519;24520;24521;24941;24942;24943;24944;24945;24946;24947;26266;26267;26268;30992;30993;30994;30995;30996;30997;30998;30999;33885;33886;33887;33938;33939;33940;33941;33942;33943;33944;33945;33946;33947;33948;33949;41531;41532;41533;41534;41535;41536;41537;41874;41875;41876;41877;41878;41879;41880;41881;41882;41883;41894;47212;47213;47214;47215;47216;47217 476;1680;1681;1682;4658;4659;4660;4661;6466;6467;6468;6469;6470;6471;6472;6473;6474;6475;6476;6477;8292;8293;8294;8295;9023;9024;9025;9026;11341;12783;12784;12785;12786;12787;12788;12789;12790;12791;12792;14183;14184;14185;14186;14187;14188;17370;17371;17372;17373;17374;19550;19956;19957;19958;19959;19960;19961;19962;19963;19964;19965;19966;19967;22274;22275;22276;22277;22278;22279;22280;22281;22282;22283;22284;23001;23002;23003;23004;23005;23006;23007;23008;23448;23449;23450;23451;24659;24660;24661;24662;24663;24664;24665;24666;24667;24668;24669;25091;25092;25093;25094;25095;25096;25097;26424;26425;26426;31184;31185;31186;31187;31188;31189;31190;31191;34086;34087;34088;34139;34140;34141;34142;34143;34144;34145;34146;34147;34148;34149;34150;34151;41794;41795;41796;41797;41798;41799;41800;42138;42139;42140;42141;42142;42143;42144;42145;42146;42147;42158;47541;47542;47543;47544;47545;47546 476;1680;4658;6474;8294;8295;9024;11341;12783;14183;17372;19550;19961;22274;23001;23007;23449;24661;25095;26424;31186;34088;34151;41798;42140;42158;47545 185;186;187 254;310;463 -1
YER029C YER029C 3 3 3 YER029C pep chromosome:R64-1-1:V:212587:213177:-1 gene:YER029C transcript:YER029C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SMB1 description:Core Sm protein Sm B; part of heteroheptameric complex (with Smd1p, Smd2p, Smd 1 3 3 3 0 2 0 3 2 0 0 2 0 3 2 0 0 2 0 3 2 0 14.3 14.3 14.3 22.379 196 196 0 6.755 0 10.2 0 14.3 10.2 0 15496000 0 4196300 0 7428100 3872000 0 0 10686000 0 12291000 14208000 0 0 2 0 3 2 0 7 389 5526;11242;12195 True;True;True 5763;11779;12764 21277;21278;43307;43308;47196;47197;47198 21404;21405;43605;43606;47525;47526;47527 21404;43606;47526 -1
YER031C YER031C 8 8 2 YER031C pep chromosome:R64-1-1:V:214076:214747:-1 gene:YER031C transcript:YER031C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YPT31 description:Rab family GTPase; involved in the exocytic pathway; mediates intra-Golgi tra 1 8 8 2 1 4 4 3 1 2 1 4 4 3 1 2 0 1 1 1 1 1 39 39 11.2 24.469 223 223 0 16.584 4.9 18.8 24.7 13 6.3 11.2 96561000 3586800 9265600 60500000 7416000 1552100 14240000 0 0 25810000 0 0 24080000 1 4 4 2 1 2 14 390 388;724;1915;2674;4818;8785;9571;9705 True;True;True;True;True;True;True;True 413;764;1988;2768;5020;9216;10040;10179 1700;3012;3013;3014;7392;10082;18326;18327;33513;33514;36683;36684;36685;36686;37186 1704;3022;3023;3024;7433;10135;18443;18444;33713;33714;36900;36901;36902;36903;37405 1704;3023;7433;10135;18444;33713;36903;37405 -1
YER036C YER036C 44 44 44 YER036C pep chromosome:R64-1-1:V:223367:225199:-1 gene:YER036C transcript:YER036C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARB1 description:ATPase of the ATP-binding cassette (ABC) family; involved in 40S and 60S ribos 1 44 44 44 31 32 33 36 32 31 31 32 33 36 32 31 31 32 33 36 32 31 66.7 66.7 66.7 68.376 610 610 0 323.31 51.6 54.9 53.4 60.5 50.3 55.7 20909000000 2727100000 1783100000 8100300000 2227100000 1439600000 4631800000 3380600000 3803100000 5127900000 4059800000 4469600000 4743600000 43 46 49 54 41 49 282 391 44;1199;1258;1344;1523;2106;2107;2310;3773;3873;3874;4266;4267;4414;5147;5880;6134;6483;6545;6546;6727;6756;7054;7061;7062;8330;8331;8520;8521;8651;8695;8845;9955;10209;10210;10406;10546;11259;11260;11700;11770;12000;12008;12290 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 46;1250;1309;1401;1402;1583;2186;2187;2394;3922;4030;4031;4440;4441;4442;4600;4601;5359;6125;6387;6758;6759;6821;6822;7007;7036;7353;7354;7364;7365;7366;8747;8748;8944;8945;9076;9121;9278;9279;10444;10705;10706;10908;11053;11054;11796;11797;12256;12329;12563;12571;12861 186;187;188;189;190;191;192;193;4862;5054;5055;5056;5057;5058;5059;5060;5061;5062;5063;5064;5065;5389;5390;5391;5392;5393;6055;6056;6057;6058;6059;6060;8026;8027;8028;8029;8030;8031;8032;8033;8034;8035;8036;8801;8802;8803;8804;8805;8806;14350;14351;14352;14353;14354;14729;14730;14731;14732;14733;16192;16193;16194;16195;16196;16197;16198;16199;16200;16201;16202;16203;16204;16205;16206;16207;16208;16209;16210;16211;16212;16213;16214;16215;16216;16217;16773;16774;16775;16776;16777;16778;16779;16780;16781;16782;16783;19652;19653;19654;19655;19656;19657;19658;19659;19660;19661;19662;19663;19664;19665;19666;19667;19668;19669;19670;22519;22520;22521;22522;22523;22524;22525;22526;22527;22528;22529;23550;23551;23552;23553;24773;24774;24976;24977;24978;24979;24980;24981;24982;24983;24984;24985;24986;24987;24988;24989;24990;24991;24992;24993;24994;24995;24996;24997;25651;25652;25653;25654;25655;25778;25779;25780;25781;25782;25783;25784;25785;25786;25787;25788;25789;26965;26966;26967;26968;26969;26970;26971;26972;26973;26974;26975;26976;26977;27011;27012;27013;27014;27015;27016;27017;31817;31818;31819;31820;31821;31822;31823;31824;31825;31826;31827;32491;32492;32493;32494;32495;32496;32497;32498;32499;32500;32965;32966;32967;33147;33148;33149;33150;33151;33746;33747;33748;33749;33750;33751;38217;38218;39170;39171;39172;39173;39174;39175;39176;39177;39178;39179;39180;39181;39903;40401;40402;40403;40404;40405;43371;43372;43373;43374;43375;43376;43377;43378;43379;43380;43381;43382;43383;43384;43385;45289;45290;45291;45292;45293;45294;45603;45604;46436;46437;46438;46439;46440;46501;46502;46503;46504;46505;46506;46507;46508;46509;46510;47550 186;187;188;189;190;191;192;193;4888;5082;5083;5084;5085;5086;5087;5088;5089;5090;5091;5092;5093;5424;5425;5426;5427;5428;6091;6092;6093;6094;6095;6096;8068;8069;8070;8071;8072;8073;8074;8075;8076;8077;8078;8846;8847;8848;8849;8850;8851;14449;14450;14451;14452;14453;14831;14832;14833;14834;14835;16301;16302;16303;16304;16305;16306;16307;16308;16309;16310;16311;16312;16313;16314;16315;16316;16317;16318;16319;16320;16321;16322;16323;16324;16325;16326;16885;16886;16887;16888;16889;16890;16891;16892;16893;16894;16895;19775;19776;19777;19778;19779;19780;19781;19782;19783;19784;19785;19786;19787;19788;19789;19790;19791;19792;19793;22653;22654;22655;22656;22657;22658;22659;22660;22661;22662;22663;23690;23691;23692;23693;23694;24922;24923;25126;25127;25128;25129;25130;25131;25132;25133;25134;25135;25136;25137;25138;25139;25140;25141;25142;25143;25144;25145;25146;25147;25805;25806;25807;25808;25809;25933;25934;25935;25936;25937;25938;25939;25940;25941;25942;25943;25944;27127;27128;27129;27130;27131;27132;27133;27134;27135;27136;27137;27138;27139;27173;27174;27175;27176;27177;27178;27179;32013;32014;32015;32016;32017;32018;32019;32020;32021;32022;32023;32687;32688;32689;32690;32691;32692;32693;32694;32695;32696;33163;33164;33165;33346;33347;33348;33349;33350;33947;33948;33949;33950;33951;33952;38449;38450;39405;39406;39407;39408;39409;39410;39411;39412;39413;39414;39415;39416;40140;40642;40643;40644;40645;40646;43669;43670;43671;43672;43673;43674;43675;43676;43677;43678;43679;43680;43681;43682;43683;45602;45603;45604;45605;45606;45607;45917;45918;46757;46758;46759;46760;46761;46822;46823;46824;46825;46826;46827;46828;46829;46830;46831;47882 189;4888;5083;5425;6095;8068;8077;8848;14450;14832;14835;16303;16313;16895;19786;22662;23694;24922;25129;25140;25807;25938;27130;27173;27179;32013;32023;32688;32696;33164;33348;33948;38450;39415;39416;40140;40642;43672;43679;45603;45918;46757;46830;47882 188;189;190;191;192;193;194 194;227;296;323;363;420;441 -1
YER043C YER043C 14 14 14 YER043C pep chromosome:R64-1-1:V:235770:237119:-1 gene:YER043C transcript:YER043C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SAH1 description:S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase; catabolizes S-adenosyl-L-homocysteine whi 1 14 14 14 5 9 8 11 4 5 5 9 8 11 4 5 5 9 8 11 4 5 32.1 32.1 32.1 49.125 449 449 0 46.806 12.7 22 21.4 26.5 11.4 14.5 608210000 48428000 101990000 232300000 100600000 15573000 109330000 106020000 190200000 142760000 161630000 84412000 104100000 5 10 9 11 4 7 46 392 855;1002;1712;2302;3705;3728;4984;6104;9134;10130;10848;10849;11461;11462 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 898;1048;1779;2385;3851;3874;5190;6355;9582;10623;11368;11369;12000;12001 3558;3559;4184;6804;8771;8772;8773;8774;8775;14092;14161;14162;14163;14164;14165;14166;18961;23431;23432;23433;23434;34960;34961;34962;34963;34964;34965;34966;34967;34968;38829;38830;38831;41735;41736;41737;41738;41739;41740;44261;44262;44263;44264;44265;44266;44267;44268 3571;3572;4204;6844;8816;8817;8818;8819;8820;14189;14258;14259;14260;14261;14262;14263;19083;23568;23569;23570;23571;35168;35169;35170;35171;35172;35173;35174;35175;35176;39064;39065;39066;41998;41999;42000;42001;42002;42003;44566;44567;44568;44569;44570;44571;44572;44573 3571;4204;6844;8818;14189;14261;19083;23569;35169;39065;42000;42003;44567;44573 -1
YER049W YER049W 10 10 10 YER049W pep chromosome:R64-1-1:V:251728:253662:1 gene:YER049W transcript:YER049W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TPA1 description:Fe(II)/2-oxoglutarate-dependent dioxygenase family member; catalyzes the repair 1 10 10 10 6 4 0 4 2 2 6 4 0 4 2 2 6 4 0 4 2 2 25.6 25.6 25.6 74.041 644 644 0 28.242 15.8 8.9 0 11 4.7 5.1 81790000 39484000 16785000 0 7355500 2913800 15252000 38329000 34654000 0 22286000 0 23096000 6 4 0 4 2 2 18 393 1710;1992;4619;5751;6619;6911;7559;7777;8139;10002 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1776;2067;4815;5992;6896;7199;7937;8173;8549;10491 6777;6778;7613;7614;7615;17602;22020;25286;26442;26443;26444;28995;28996;29895;29896;31152;31153;38354 6817;6818;7655;7656;7657;17717;22150;25440;26602;26603;26604;29178;29179;30082;30083;31345;31346;38586 6818;7657;17717;22150;25440;26604;29178;30082;31345;38586 -1
YER052C YER052C 1 1 1 YER052C pep chromosome:R64-1-1:V:256375:257958:-1 gene:YER052C transcript:YER052C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HOM3 description:Aspartate kinase (L-aspartate 4-P-transferase); cytoplasmic enzyme that cataly 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 3.6 3.6 3.6 58.109 527 527 0 4.3271 3.6 0 0 3.6 0 0 3926100 1630300 0 0 2295900 0 0 0 0 0 4722900 0 0 1 0 0 1 0 0 2 394 2268 True 2350 8648;8649 8693;8694 8694 -1
YER055C YER055C 3 3 3 YER055C pep chromosome:R64-1-1:V:264892:265785:-1 gene:YER055C transcript:YER055C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HIS1 description:ATP phosphoribosyltransferase; a hexameric enzyme, catalyzes the first step in 1 3 3 3 1 0 3 2 1 2 1 0 3 2 1 2 1 0 3 2 1 2 12.5 12.5 12.5 32.266 297 297 0 11.93 6.1 0 12.5 8.4 6.1 8.4 51312000 4588100 0 27145000 5363400 2147500 12068000 0 0 13124000 12543000 0 13429000 1 0 3 2 1 2 9 395 2747;6181;11952 True;True;True 2842;6438;12515 10411;10412;10413;10414;10415;23711;23712;23713;46248 10475;10476;10477;10478;10479;23852;23853;23854;46565 10479;23852;46565 -1
YIL052C;YER056C-A YIL052C;YER056C-A 11;11 11;11 11;11 YIL052C pep chromosome:R64-1-1:IX:256226:257063:-1 gene:YIL052C transcript:YIL052C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL34B description:Ribosomal 60S subunit protein L34B; homologous to mammalian ribosomal prote 2 11 11 11 5 7 9 6 8 6 5 7 9 6 8 6 5 7 9 6 8 6 53.7 53.7 53.7 13.641 121 121;121 0 23.628 40.5 46.3 51.2 30.6 52.9 41.3 3685100000 681450000 491430000 1183400000 392950000 186220000 749700000 1098700000 950400000 639790000 733140000 649840000 755300000 5 8 9 7 8 7 44 396 171;172;173;1030;5419;8443;8600;10480;11671;11672;11673 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 178;179;180;1078;5652;8865;9024;10987;12224;12225;12226 733;734;735;736;737;738;739;740;741;742;743;744;745;4320;4321;4322;4323;4324;20826;20827;20828;20829;20830;20831;32193;32194;32195;32196;32197;32198;32770;32771;40163;40164;40165;40166;40167;45165;45166;45167;45168;45169;45170;45171 734;735;736;737;738;739;740;741;742;743;744;745;746;4342;4343;4344;4345;4346;20953;20954;20955;20956;20957;20958;32389;32390;32391;32392;32393;32394;32967;32968;40402;40403;40404;40405;40406;45477;45478;45479;45480;45481;45482;45483 738;744;746;4343;20957;32390;32968;40403;45477;45480;45482 -1;-1
YER068W YER068W 2 2 2 YER068W pep chromosome:R64-1-1:V:293050:294813:1 gene:YER068W transcript:YER068W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MOT2 description:Ubiquitin-protein ligase subunit of the CCR4-NOT complex; with Ubc4p, ubiquitin 1 2 2 2 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 3.9 3.9 3.9 65.353 587 587 0 12.428 2.2 2.2 0 2.2 0 1.7 12849000 4707500 3118000 0 2303100 0 2720000 0 0 0 4737800 0 0 1 2 0 1 0 0 4 397 7884;12369 True;True 8284;12943 30254;30255;30256;47836 30442;30443;30444;30445;48168 30443;48168 -1
YER070W;YIL066C YER070W;YIL066C 3;2 3;2 3;2 YER070W pep chromosome:R64-1-1:V:298950:301616:1 gene:YER070W transcript:YER070W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RNR1 description:Major isoform of large subunit of ribonucleotide-diphosphate reductase; the RNR 2 3 3 3 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 4.7 4.7 4.7 99.56 888 888;869 0 12.915 2.4 1.6 3.9 1.6 0 1.6 63213000 18601000 2775800 22465000 4429000 0 14943000 24307000 0 12251000 0 0 15918000 3 1 3 1 0 2 10 398 1274;9703;11643 True;True;True 1327;10177;12192 5129;5130;5131;5132;5133;5134;5135;5136;37183;45005 5159;5160;5161;5162;5163;5164;5165;5166;37402;45315 5166;37402;45315 195 339 -1;-1
YER072W YER072W 2 2 2 YER072W pep chromosome:R64-1-1:V:302806:303195:1 gene:YER072W transcript:YER072W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VTC1 description:Regulatory subunit of the vacuolar transporter chaperone (VTC) complex; VTC com 1 2 2 2 1 0 1 1 1 2 1 0 1 1 1 2 1 0 1 1 1 2 14 14 14 14.371 129 129 0.0015662 2.581 7.8 0 7.8 6.2 7.8 14 53182000 11378000 0 13415000 8249900 4450600 15689000 0 0 0 0 0 15689000 1 0 1 0 1 2 5 399 3761;9552 True;True 3909;10021 14286;14287;14288;14289;36629;36630 14384;14385;14386;14387;36846;36847 14387;36846 -1
YER073W YER073W 3 3 3 YER073W pep chromosome:R64-1-1:V:304030:305592:1 gene:YER073W transcript:YER073W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ALD5 description:Mitochondrial aldehyde dehydrogenase; involved in regulation or biosynthesis of 1 3 3 3 1 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 5.4 5.4 5.4 56.692 520 520 0 5.9871 2.1 3.3 2.1 3.8 2.1 0 16717000 2117400 6376000 4578100 3065400 580130 0 0 0 0 6305800 0 0 1 2 1 2 1 0 7 400 482;3748;11834 True;True;True 510;3895;12393 2080;2081;2082;2083;14247;45794;45795 2086;2087;2088;2089;14345;46110;46111 2087;14345;46111 -1
YIL069C;YER074W YIL069C;YER074W 15;15 15;15 15;15 YIL069C pep chromosome:R64-1-1:IX:231553:232369:-1 gene:YIL069C transcript:YIL069C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS24B description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mamma 2 15 15 15 13 12 12 10 11 9 13 12 12 10 11 9 13 12 12 10 11 9 71.1 71.1 71.1 15.329 135 135;135 0 63.315 64.4 60.7 64.4 60.7 60.7 52.6 12169000000 1617800000 858320000 4728300000 1133700000 1026400000 2805000000 2649700000 2228900000 2402200000 2553000000 2387700000 3057400000 16 19 20 15 19 14 103 401 131;650;1103;1775;5037;5275;5373;5490;5491;8140;8754;9790;10515;11144;11995 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 137;688;1153;1842;5246;5496;5601;5726;5727;8550;9183;10271;11022;11678;12558 556;557;558;2732;2733;2734;2735;2736;2737;2738;2739;2740;2741;4538;4539;4540;4541;4542;7001;7002;7003;19193;19194;19195;20146;20147;20148;20149;20150;20151;20152;20153;20154;20155;20156;20157;20158;20586;20587;20588;20589;20590;20591;20592;20593;20594;20595;20596;21141;21142;21143;21144;21145;21146;21147;21148;21149;21150;21151;21152;21153;21154;21155;21156;21157;21158;21159;21160;31154;31155;31156;31157;31158;31159;31160;31161;31162;31163;33410;33411;33412;33413;37553;37554;37555;37556;37557;37558;37559;37560;37561;37562;40284;42913;42914;42915;46412;46413;46414;46415;46416;46417;46418;46419 557;558;559;2741;2742;2743;2744;2745;2746;2747;2748;2749;2750;4564;4565;4566;4567;4568;7041;7042;7043;19316;19317;19318;20270;20271;20272;20273;20274;20275;20276;20277;20278;20279;20280;20281;20282;20713;20714;20715;20716;20717;20718;20719;20720;20721;20722;20723;21268;21269;21270;21271;21272;21273;21274;21275;21276;21277;21278;21279;21280;21281;21282;21283;21284;21285;21286;21287;31347;31348;31349;31350;31351;31352;31353;31354;31355;31356;33610;33611;33612;33613;37782;37783;37784;37785;37786;37787;37788;37789;37790;37791;40525;43210;43211;43212;46732;46733;46734;46735;46736;46737;46738;46739 557;2750;4566;7042;19317;20282;20719;21275;21283;31348;33611;37790;40525;43212;46735 -1;-1
YER080W YER080W 3 3 3 YER080W pep chromosome:R64-1-1:V:319963:321846:1 gene:YER080W transcript:YER080W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:AIM9 description:Protein of unknown function; the authentic, non-tagged protein is detected in h 1 3 3 3 0 2 1 2 2 1 0 2 1 2 2 1 0 2 1 2 2 1 5.9 5.9 5.9 72.413 627 627 0 12.975 0 4.3 2.2 3.8 3.8 2.2 20427000 0 5170900 6711700 2700500 2454800 3389400 0 0 0 5371600 8300100 0 0 2 1 1 2 1 7 402 4523;6027;7716 True;True;True 4716;6278;8102 17231;17232;17233;17234;17235;23130;23131;29581 17345;17346;17347;17348;17349;23266;23267;29765 17346;23267;29765 -1
YER082C YER082C 14 14 14 YER082C pep chromosome:R64-1-1:V:324272:325936:-1 gene:YER082C transcript:YER082C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP7 description:Nucleolar protein; component of the small subunit (SSU) processome containing 1 14 14 14 5 6 10 7 5 7 5 6 10 7 5 7 5 6 10 7 5 7 34.5 34.5 34.5 62.316 554 554 0 69.01 12.8 17 26.2 20.8 13.4 19.7 670620000 77822000 49278000 303520000 82781000 32521000 124690000 121820000 137100000 135580000 155690000 132250000 107470000 5 7 10 8 5 8 43 403 457;959;1264;3231;3241;6460;6636;8156;9649;10349;10468;10525;12028;12311 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 484;1004;1315;3347;3358;6732;6914;8567;10121;10849;10975;11032;12591;12884 1989;1990;1991;1992;1993;1994;4009;4010;4011;4012;4013;5078;5079;5080;5081;12206;12207;12208;12254;12255;12256;24698;24699;24700;25338;25339;31207;36973;39705;39706;39707;39708;39709;39710;39711;40110;40111;40112;40113;40326;46591;47627 1995;1996;1997;1998;1999;2000;4025;4026;4027;4028;4029;5106;5107;5108;5109;5110;12291;12292;12293;12339;12340;12341;24847;24848;24849;25492;25493;31401;37192;39942;39943;39944;39945;39946;39947;39948;40348;40349;40350;40351;40567;46912;47959 1999;4027;5106;12293;12341;24849;25493;31401;37192;39948;40349;40567;46912;47959 -1
YER086W YER086W 12 12 12 YER086W pep chromosome:R64-1-1:V:328477:330207:1 gene:YER086W transcript:YER086W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ILV1 description:Threonine deaminase, catalyzes first step in isoleucine biosynthesis; expressio 1 12 12 12 0 3 8 6 1 4 0 3 8 6 1 4 0 3 8 6 1 4 31.8 31.8 31.8 63.83 576 576 0 30.835 0 7.1 26.2 17 2.8 8.7 129450000 0 7233100 86372000 11474000 2397900 21976000 0 22490000 41679000 27072000 0 20922000 0 3 8 6 1 4 22 404 1602;3998;4173;7125;7811;7938;8482;9109;9661;9824;10491;10820 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1665;4161;4343;7439;8210;8339;8904;9555;10133;10305;10998;11340 6356;6357;6358;15204;15205;15873;15874;27250;30023;30024;30467;32336;34835;34836;37025;37026;37699;40204;40205;40206;40207;41638 6392;6393;6394;15311;15312;15982;15983;27415;30210;30211;30656;32532;35043;35044;37244;37245;37928;40445;40446;40447;40448;41901 6394;15312;15983;27415;30210;30656;32532;35043;37244;37928;40446;41901 -1
YER088C YER088C 2 2 2 YER088C pep chromosome:R64-1-1:V:333176:335188:-1 gene:YER088C transcript:YER088C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DOT6 description:Protein involved in rRNA and ribosome biogenesis; activated in stochastic puls 1 2 2 2 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 4.6 4.6 4.6 73.048 670 670 0 6.7886 0 0 0 2.5 2.1 0 2637800 0 0 0 1153400 1484400 0 0 0 0 0 4907900 0 0 0 0 1 1 0 2 405 9420;9933 True;True 9884;10422 36128;38130 36339;38361 36339;38361 -1
YER089C YER089C 1 1 1 YER089C pep chromosome:R64-1-1:V:335946:337340:-1 gene:YER089C transcript:YER089C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PTC2 description:Type 2C protein phosphatase (PP2C); dephosphorylates Hog1p to limit maximal os 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2.6 2.6 2.6 50.388 464 464 0 4.6879 2.6 0 0 2.6 0 0 4213300 2034000 0 0 2179200 0 0 0 0 0 4482900 0 0 1 0 0 1 0 0 2 406 496 True 524 2118;2119 2124;2125 2125 -1
YER091C YER091C 3 3 3 YER091C pep chromosome:R64-1-1:V:339864:342167:-1 gene:YER091C transcript:YER091C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MET6 description:Cobalamin-independent methionine synthase; involved in methionine biosynthesis 1 3 3 3 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 2 6.5 6.5 6.5 85.859 767 767 0 9.7728 0 0 1.3 0 2.5 5.2 12441000 0 0 4176800 0 1526100 6738100 0 0 0 0 5853000 5930900 0 0 1 0 2 3 6 407 1833;10967;11459 True;True;True 1902;11492;11998 7177;42220;42221;42222;42223;44256 7217;42515;42516;42517;42518;44561 7217;42516;44561 -1
YER094C YER094C 2 2 2 YER094C pep chromosome:R64-1-1:V:348729:349346:-1 gene:YER094C transcript:YER094C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PUP3 description:Beta 3 subunit of the 20S proteasome; involved in ubiquitin-dependent cataboli 1 2 2 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 16.6 16.6 16.6 22.605 205 205 0 8.2172 0 8.8 7.8 0 8.8 8.8 12107000 0 3029200 5132800 0 1336900 2607900 0 0 0 0 0 2607900 0 1 1 0 1 1 4 408 328;2287 True;True 346;2369 1457;1458;1459;8714 1460;1461;1462;8759 1462;8759 -1
YER095W YER095W 1 1 1 YER095W pep chromosome:R64-1-1:V:349980:351182:1 gene:YER095W transcript:YER095W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RAD51 description:Strand exchange protein; forms a helical filament with DNA that searches for h 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 4 4 4 42.963 400 400 0.0008285 3.1112 0 4 0 0 0 4 5758400 0 1903100 0 0 0 3855400 0 0 0 0 0 3855400 0 1 0 0 0 1 2 409 2278 True 2360 8686;8687 8731;8732 8732 -1
YER099C YER099C 5 4 4 YER099C pep chromosome:R64-1-1:V:358105:359061:-1 gene:YER099C transcript:YER099C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRS2 description:5-phospho-ribosyl-1(alpha)-pyrophosphate synthetase, synthesizes PRPP; which i 1 5 4 4 2 3 2 2 3 1 2 2 1 1 2 0 2 2 1 1 2 0 20.4 15.4 15.4 34.765 318 318 0 5.359 6.3 11.9 8.8 8.8 14.2 5 176000000 155160000 6133800 7861900 1990800 4851000 0 0 13305000 0 0 0 0 2 2 1 1 0 0 6 410 4711;5633;5901;6115;7175 True;True;False;True;True 4908;5871;6148;6366;7505 17896;17897;17898;17899;21630;22619;22620;22621;22622;22623;23481;27493;27494 18012;18013;18014;18015;21758;22754;22755;22756;22757;22758;23621;27665;27666 18013;21758;22757;23621;27666 -1
YER105C YER105C 5 5 5 YER105C pep chromosome:R64-1-1:V:367838:372013:-1 gene:YER105C transcript:YER105C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NUP157 description:Subunit of the inner ring of the nuclear pore complex (NPC); contributes to 1 5 5 5 1 2 1 1 3 1 1 2 1 1 3 1 1 2 1 1 3 1 5.6 5.6 5.6 156.65 1391 1391 0 12.057 1.7 2.3 1.6 1.6 4.9 1.6 73426000 17595000 7981700 15242000 11247000 12084000 9277300 0 0 0 0 39953000 0 1 2 1 1 3 1 9 411 4629;4630;8899;9400;12339 True;True;True;True;True 4825;4826;9335;9864;12912 17642;17643;33923;36063;47743;47744;47745;47746;47747 17757;17758;34124;36274;48075;48076;48077;48078;48079 17757;17758;34124;36274;48076 -1
YER107C YER107C 1 1 1 YER107C pep chromosome:R64-1-1:V:373448:374545:-1 gene:YER107C transcript:YER107C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLE2 description:RNA export factor associated with the nuclear pore complex (NPC); associates w 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3.3 3.3 3.3 40.522 365 365 0.00084246 3.2869 0 3.3 0 0 0 0 1510900 0 1510900 0 0 0 0 0 3277400 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 412 4872 True 5076 18552 18670 18670 -1
YER110C YER110C 28 28 28 YER110C pep chromosome:R64-1-1:V:378762:382103:-1 gene:YER110C transcript:YER110C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KAP123 description:Karyopherin beta; mediates nuclear import of ribosomal proteins prior to ass 1 28 28 28 9 21 18 19 14 13 9 21 18 19 14 13 9 21 18 19 14 13 38.5 38.5 38.5 122.6 1113 1113 0 216.24 13.4 29.4 27.2 26.3 19.2 18.4 1752300000 62059000 317520000 801880000 207570000 78752000 284560000 138860000 591520000 431220000 394030000 226690000 353080000 11 24 24 23 15 14 111 413 434;586;645;988;1694;1966;1987;2008;2037;2121;2698;3036;3715;5851;6111;6582;6999;7051;8751;8752;9311;9554;10373;10588;10589;10943;11288;11736 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 460;618;682;1034;1759;2041;2062;2084;2114;2201;2792;3145;3861;6095;6362;6859;7288;7348;7349;9180;9181;9767;10023;10875;11096;11097;11467;11825;12293 1901;2534;2715;2716;2717;2718;2719;2720;4105;4106;4107;6698;6699;6700;6701;7534;7535;7536;7537;7538;7539;7598;7599;7600;7664;7665;7666;7765;8110;10190;11474;11475;11476;11477;11478;11479;11480;11481;11482;11483;14124;14125;14126;22413;22414;22415;23470;25145;26749;26943;26944;26945;26946;26947;26948;26949;26950;26951;26952;26953;26954;26955;33403;33404;33405;33406;33407;35676;35677;35678;35679;35680;35681;35682;35683;35684;36633;36634;36635;36636;39771;39772;39773;40542;40543;40544;40545;40546;40547;40548;40549;40550;40551;40552;40553;42113;42114;42115;42116;42117;42118;43526;43527;43528;43529;43530;43531;45439;45440;45441;45442 1907;2541;2724;2725;2726;2727;2728;2729;4121;4122;4123;6738;6739;6740;6741;7576;7577;7578;7579;7580;7581;7640;7641;7642;7706;7707;7708;7807;8152;10244;11553;11554;11555;11556;11557;11558;11559;11560;11561;11562;14221;14222;14223;22546;22547;22548;23610;25295;26910;27105;27106;27107;27108;27109;27110;27111;27112;27113;27114;27115;27116;27117;33603;33604;33605;33606;33607;35884;35885;35886;35887;35888;35889;35890;35891;35892;36850;36851;36852;36853;40008;40009;40010;40785;40786;40787;40788;40789;40790;40791;40792;40793;40794;40795;40796;42405;42406;42407;42408;42409;42410;43824;43825;43826;43827;43828;43829;45753;45754;45755;45756 1907;2541;2726;4121;6740;7577;7640;7706;7807;8152;10244;11561;14223;22548;23610;25295;26910;27109;33603;33606;35891;36851;40010;40788;40793;42409;43826;45754 196;197 1;229 -1
YER114C YER114C 5 3 3 YER114C pep chromosome:R64-1-1:V:390590:393712:-1 gene:YER114C transcript:YER114C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BOI2 description:Protein implicated in polar growth, functionally redundant with Boi1p; interac 1 5 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 2 4.9 3.3 3.3 115.69 1040 1040 0 12.189 3.3 1.9 2.8 2.2 1.8 2.7 36593000 7609600 3398000 15533000 2381600 1421400 6249400 0 6935500 9463600 0 0 6374000 2 1 1 1 1 2 8 414 2248;3131;6752;9583;10446 False;False;True;True;True 2330;3242;7032;10052;10953 8567;8568;11868;11869;11870;25760;25761;25762;25763;25764;36718;36719;36720;40027;40028 8612;8613;11952;11953;11954;25914;25915;25916;25917;25918;36936;36937;36938;40264;40265 8613;11954;25917;36937;40265 -1
YER120W YER120W 3 3 3 YER120W pep chromosome:R64-1-1:V:401135:401869:1 gene:YER120W transcript:YER120W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SCS2 description:Integral ER membrane protein, regulates phospholipid metabolism; one of 6 prote 1 3 3 3 3 2 2 2 1 1 3 2 2 2 1 1 3 2 2 2 1 1 18 18 18 26.925 244 244 0 13.664 18 11.1 12.7 12.7 7 7 52843000 16895000 9947300 12292000 3777500 1454000 8477300 18474000 15686000 10787000 13711000 0 0 3 2 2 3 1 1 12 415 893;1239;8734 True;True;True 936;1290;9161 3698;3699;3700;3701;4996;4997;4998;4999;5000;33315;33316 3711;3712;3713;3714;5023;5024;5025;5026;5027;5028;33515;33516 3714;5025;33516 -1
YER122C YER122C 8 8 8 YER122C pep chromosome:R64-1-1:V:402871:404352:-1 gene:YER122C transcript:YER122C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLO3 description:ADP-ribosylation factor GTPase activating protein (ARF GAP); involved in ER-Go 1 8 8 8 5 6 1 4 2 2 5 6 1 4 2 2 5 6 1 4 2 2 18.9 18.9 18.9 55.093 493 493 0 25.851 13 12.8 2.2 9.5 3.9 4.5 92526000 18114000 29794000 13270000 17242000 5133000 8973100 34854000 44555000 0 34532000 26787000 0 5 5 1 4 2 1 18 416 384;1569;5807;5872;6448;8266;9473;9603 True;True;True;True;True;True;True;True 407;1632;6050;6117;6718;8683;9939;10072 1682;1683;6247;6248;22258;22259;22494;22495;24648;24649;24650;24651;24652;31618;31619;31620;36335;36785;36786;36787 1686;1687;6283;6284;22389;22390;22628;22629;24797;24798;24799;24800;24801;31814;31815;31816;36548;37004;37005;37006 1687;6283;22390;22628;24800;31815;36548;37004 -1
YER123W YER123W 1 1 1 YER123W pep chromosome:R64-1-1:V:404813:406387:1 gene:YER123W transcript:YER123W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YCK3 description:Palmitoylated vacuolar membrane-localized casein kinase I isoform; negatively r 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3.4 3.4 3.4 60.26 524 524 1 -2 0 3.4 0 0 0 0 2164200 0 2164200 0 0 0 0 0 4694500 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 + 417 1438 True 1498 5759 5794 5794 198 52 -1
YER125W YER125W 16 16 16 YER125W pep chromosome:R64-1-1:V:410189:412618:1 gene:YER125W transcript:YER125W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSP5 description:NEDD4 family E3 ubiquitin ligase; regulates processes including: MVB sorting, t 1 16 16 16 7 3 2 2 5 3 7 3 2 2 5 3 7 3 2 2 5 3 24.1 24.1 24.1 91.815 809 809 0 59.932 11.4 4 4.4 3.8 6.3 3.5 113240000 50284000 10880000 14446000 6909600 7674000 23048000 65680000 0 0 0 0 0 6 3 1 2 5 3 20 418 231;1001;1378;3212;3346;3469;4354;6040;6825;6826;7544;9003;9439;10656;10773;11734 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 242;1047;1436;3326;3468;3601;4533;6291;7112;7113;7922;9446;9903;11165;11289;12291 991;992;4182;4183;5524;12107;12662;13202;16530;23176;23177;26099;26100;28960;34467;36203;36204;36205;40761;41433;41434;45434 993;994;4202;4203;5559;12192;12748;13291;16640;23312;23313;26256;26257;29143;34673;36415;36416;36417;41004;41693;41694;45748 994;4202;5559;12192;12748;13291;16640;23312;26256;26257;29143;34673;36415;41004;41694;45748 199 473 -1
YER126C YER126C 9 9 9 YER126C pep chromosome:R64-1-1:V:413394:414179:-1 gene:YER126C transcript:YER126C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NSA2 description:Protein constituent of 66S pre-ribosomal particles; contributes to processing 1 9 9 9 5 6 7 6 4 4 5 6 7 6 4 4 5 6 7 6 4 4 41.4 41.4 41.4 29.722 261 261 0 22.256 24.9 31 31 32.2 20.7 20.3 333450000 40776000 38270000 138560000 46832000 21058000 47951000 78251000 81952000 59263000 87698000 64869000 59802000 5 6 6 6 4 4 31 419 101;651;2654;3046;3327;3692;4171;5252;8036 True;True;True;True;True;True;True;True;True 104;689;2748;3155;3448;3838;4341;5472;8441 421;422;423;2742;2743;2744;2745;9992;11518;11519;11520;11521;11522;12600;12601;12602;12603;14045;14046;14047;14048;14049;14050;15867;15868;15869;15870;15871;20083;20084;30816;30817 422;423;424;2751;2752;2753;2754;10045;11597;11598;11599;11600;11601;12686;12687;12688;12689;14140;14141;14142;14143;14144;14145;15976;15977;15978;15979;15980;20207;20208;31008;31009 424;2751;10045;11600;12686;14144;15977;20208;31009 -1
YER127W YER127W 2 2 2 YER127W pep chromosome:R64-1-1:V:414481:415554:1 gene:YER127W transcript:YER127W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LCP5 description:Essential protein involved in maturation of 18S rRNA; depletion leads to inhibi 1 2 2 2 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 4.8 4.8 4.8 40.794 357 357 0.00085251 3.4326 0 2.5 2.2 0 2.2 0 4414400 0 2541700 1336500 0 536120 0 0 0 0 0 1772600 0 0 1 1 0 1 0 3 420 7223;8852 True;True 7566;9287 27691;33771;33772 27864;33972;33973 27864;33972 -1
YER133W YER133W 6 6 6 YER133W pep chromosome:R64-1-1:V:432495:433958:1 gene:YER133W transcript:YER133W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GLC7 description:Type 1 S/T protein phosphatase (PP1) catalytic subunit; involved in glycogen me 1 6 6 6 2 2 2 0 1 3 2 2 2 0 1 3 2 2 2 0 1 3 26.6 26.6 26.6 35.907 312 312 0 19.843 8.7 6.1 10.9 0 4.5 14.4 103350000 17199000 12631000 17065000 0 3978800 52475000 0 0 0 0 0 52475000 2 3 2 0 1 3 11 421 297;3308;3427;3938;7055;7056 True;True;True;True;True;True 313;3429;3553;4097;7355;7356;7357 1310;12543;13012;14991;26978;26979;26980;26981;26982;26983;26984 1312;12629;13099;15097;27140;27141;27142;27143;27144;27145;27146 1312;12629;13099;15097;27145;27146 200 1 -1
YER134C YER134C 4 4 4 YER134C pep chromosome:R64-1-1:V:437267:437803:-1 gene:YER134C transcript:YER134C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YER134C description:Magnesium-dependent acid phosphatase; member of the haloacid dehalogenase s 1 4 4 4 1 2 1 2 0 0 1 2 1 2 0 0 1 2 1 2 0 0 27.5 27.5 27.5 20.441 178 178 0 5.4773 5.6 12.4 6.7 15.2 0 0 16244000 2018700 5088600 2262200 6874500 0 0 0 11038000 0 0 0 0 0 2 1 2 0 0 5 422 1155;2758;6998;10747 True;True;True;True 1206;2856;7287;11261 4709;10466;26747;26748;41332;41333 4735;10532;26908;26909;41592;41593 4735;10532;26909;41592 -1
YER145C YER145C 3 3 3 YER145C pep chromosome:R64-1-1:V:460526:461740:-1 gene:YER145C transcript:YER145C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FTR1 description:High affinity iron permease; involved in the transport of iron across the plas 1 3 3 3 0 3 0 2 0 0 0 3 0 2 0 0 0 3 0 2 0 0 6.4 6.4 6.4 45.722 404 404 0 5.0968 0 6.4 0 4.2 0 0 20346000 0 12463000 0 7883100 0 0 0 28421000 0 14830000 0 0 0 3 0 2 0 0 5 423 2834;3610;9333 True;True;True 2933;3753;9790 10762;13786;13787;35798;35799 10830;13877;13878;36006;36007 10830;13877;36006 -1
YER151C YER151C 11 11 11 YER151C pep chromosome:R64-1-1:V:469686:472424:-1 gene:YER151C transcript:YER151C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UBP3 description:Ubiquitin-specific protease involved in transport and osmotic response; negati 1 11 11 11 4 4 6 8 6 8 4 4 6 8 6 8 4 4 6 8 6 8 17 17 17 101.92 912 912 0 79.598 5.3 6.8 10.5 11.5 10 12 317490000 44718000 36287000 88855000 52595000 25076000 69959000 69397000 94728000 55423000 99613000 73956000 57428000 4 4 5 8 6 7 34 424 533;2428;2617;3833;5730;6128;7033;7604;9846;10691;11989 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 563;2513;2711;3988;5971;6379;7326;7984;10328;11202;12552 2326;2327;2328;2329;2330;2331;9223;9889;9890;9891;9892;9893;14569;14570;14571;14572;21956;23511;23512;26871;26872;29175;29176;29177;37782;37783;37784;37785;37786;37787;40962;40963;40964;40965;46383;46384 2333;2334;2335;2336;2337;2338;9270;9940;9941;9942;9943;9944;14668;14669;14670;14671;22086;23651;23652;27032;27033;29358;29359;29360;38012;38013;38014;38015;38016;38017;41209;41210;41211;41212;46703;46704 2333;9270;9943;14668;22086;23651;27033;29358;38017;41209;46703 201 432 -1
YER155C YER155C 24 24 24 YER155C pep chromosome:R64-1-1:V:476345:482848:-1 gene:YER155C transcript:YER155C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BEM2 description:Rho GTPase activating protein (RhoGAP); involved in the control of cytoskeleto 1 24 24 24 15 8 4 7 9 8 15 8 4 7 9 8 15 8 4 7 9 8 16.5 16.5 16.5 245.43 2167 2167 0 61.956 10.9 4.9 3 5.2 6.2 5.5 224840000 81288000 23198000 32450000 19555000 19958000 48393000 61030000 68645000 35969000 46720000 59467000 58396000 15 9 4 8 9 8 53 425 648;2319;2559;2640;3166;4307;4308;4547;4844;5189;5392;5779;6497;6745;7842;7927;7954;8002;8349;8584;9316;9749;10188;11121 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 686;2403;2648;2734;3279;4483;4484;4741;5047;5405;5620;6021;6773;7025;8242;8327;8357;8407;8766;9008;9772;10225;10684;11652 2730;8841;8842;8843;9649;9650;9651;9652;9653;9654;9655;9958;11977;11978;11979;16357;16358;16359;17339;17340;17341;17342;18409;18410;19857;20653;20654;22123;22124;22125;24832;24833;24834;25732;30144;30413;30521;30522;30523;30524;30693;31879;31880;32719;35705;37361;37362;37363;37364;37365;39087;39088;39089;42812 2739;8886;8887;8888;9698;9699;9700;9701;9702;9703;9704;9705;10009;12062;12063;12064;16466;16467;16468;17453;17454;17455;17456;18526;18527;19980;20780;20781;22253;22254;22255;24981;24982;24983;25886;30332;30602;30711;30712;30713;30714;30883;32075;32076;32916;35913;37583;37584;37585;37586;37587;39322;39323;39324;43107 2739;8888;9704;10009;12064;16466;16468;17455;18527;19980;20780;22254;24982;25886;30332;30602;30713;30883;32075;32916;35913;37586;39322;43107 -1
YER164W YER164W 45 45 45 YER164W pep chromosome:R64-1-1:V:505392:509798:1 gene:YER164W transcript:YER164W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CHD1 description:Chromatin remodeler that regulates various aspects of transcription; acts in in 1 45 45 45 22 15 21 19 12 16 22 15 21 19 12 16 22 15 21 19 12 16 35.4 35.4 35.4 168.24 1468 1468 0 271.28 19.6 12.1 17.2 16.5 10.7 12.9 900380000 112490000 50923000 404850000 84344000 40552000 207220000 155860000 155850000 205590000 146660000 153410000 192000000 23 15 22 18 13 16 107 426 609;804;819;1222;1223;1459;1471;2253;2284;2535;2862;2952;3228;3631;4329;4357;4637;5297;5621;6100;6322;6453;6695;6746;6923;7157;7170;7283;7316;7523;8125;8375;8547;8561;8622;9284;9365;9462;10023;10582;10905;10928;11256;11828;11843 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 644;845;861;1273;1274;1519;1531;2335;2366;2623;2963;3058;3344;3774;4506;4536;4833;5518;5858;6351;6583;6723;6975;7026;7211;7478;7479;7500;7644;7680;7901;8535;8793;8971;8985;9046;9740;9825;9927;10513;11090;11426;11450;11793;12387;12402 2595;2596;3339;3340;3341;3342;3343;3421;3422;3423;4937;4938;4939;4940;4941;4942;5830;5831;5865;8584;8585;8586;8706;8707;8708;9547;10870;11195;12195;12196;12197;12198;12199;13851;16436;16437;16535;16536;16537;17664;17665;17666;17667;20231;21585;23420;23421;23422;24163;24662;24663;25541;25542;25543;25544;25545;25733;26469;26470;26471;26472;27384;27385;27386;27387;27487;27488;27952;28064;28065;28066;28908;31111;31112;31113;31961;32587;32588;32589;32590;32591;32592;32593;32594;32657;32658;32659;32660;32837;32838;32839;32840;35580;35581;35582;35583;35936;36293;38417;40523;41911;41912;41913;41914;41915;41994;43362;45771;45772;45817 2602;2603;3351;3352;3353;3354;3355;3433;3434;3435;4964;4965;4966;4967;4968;4969;5865;5866;5900;8629;8630;8631;8751;8752;8753;9595;10941;11272;12280;12281;12282;12283;12284;13942;16545;16546;16645;16646;16647;17779;17780;17781;17782;20355;21712;23557;23558;23559;24311;24811;24812;25695;25696;25697;25698;25699;25887;26629;26630;26631;26632;27553;27554;27555;27556;27659;27660;28126;28238;28239;28240;29091;31304;31305;31306;32157;32783;32784;32785;32786;32787;32788;32789;32790;32853;32854;32855;32856;33034;33035;33036;33037;35788;35789;35790;35791;36146;36506;38649;40766;42175;42176;42177;42178;42179;42258;43660;46087;46088;46133 2602;3352;3435;4965;4968;5865;5900;8630;8753;9595;10941;11272;12281;13942;16546;16646;17779;20355;21712;23559;24311;24811;25695;25887;26632;27553;27660;28126;28239;29091;31304;32157;32786;32855;33037;35790;36146;36506;38649;40766;42176;42258;43660;46087;46133 202 723 -1
YER165W YER165W 13 13 13 YER165W pep chromosome:R64-1-1:V:510373:512106:1 gene:YER165W transcript:YER165W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PAB1 description:Poly(A) binding protein; part of the 3-end RNA-processing complex, mediates in 1 13 13 13 6 6 6 7 7 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 7 7 6 35 35 35 64.343 577 577 0 106.66 17.3 15.9 14.2 18.7 19.2 14.2 353740000 78696000 30416000 120690000 28723000 31949000 63269000 70632000 62209000 96566000 65095000 94744000 78629000 6 6 7 7 8 6 40 427 100;329;583;909;2285;2906;7339;7567;7641;7670;7823;9501;12253 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 103;347;615;952;2367;3009;7704;7945;8022;8052;8222;9968;12824 420;1460;1461;1462;1463;2527;3762;3763;8709;8710;8711;11030;11031;11032;11033;28139;29017;29018;29019;29020;29021;29022;29292;29293;29387;29388;30061;30062;30063;30064;30065;30066;36436;36437;36438;36439;36440;36441;47395;47396 421;1463;1464;1465;1466;2534;3776;3777;8754;8755;8756;11106;11107;11108;11109;28313;29200;29201;29202;29203;29204;29205;29475;29476;29571;29572;30249;30250;30251;30252;30253;30254;36650;36651;36652;36653;36654;36655;47725;47726 421;1464;2534;3777;8756;11106;28313;29203;29476;29572;30251;36653;47726 -1
YER168C YER168C 7 7 7 YER168C pep chromosome:R64-1-1:V:521029:522669:-1 gene:YER168C transcript:YER168C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCA1 description:ATP (CTP):tRNA-specific tRNA nucleotidyltransferase; different forms targeted 1 7 7 7 0 6 1 2 0 2 0 6 1 2 0 2 0 6 1 2 0 2 15.6 15.6 15.6 62.484 546 546 0 18.348 0 13.2 2.4 5.7 0 4 59713000 0 25931000 9547400 12227000 0 12008000 0 56248000 0 0 0 0 0 6 1 2 0 2 11 428 4455;6283;8380;10433;10856;11048;11827 True;True;True;True;True;True;True 4646;6542;8798;10940;11376;11575;12386 16965;24043;31982;31983;39988;41766;41767;41768;42510;45769;45770 17078;24188;32178;32179;40225;42029;42030;42031;42805;46085;46086 17078;24188;32178;40225;42029;42805;46085 -1
YER176W YER176W 11 11 11 YER176W pep chromosome:R64-1-1:V:541690:545055:1 gene:YER176W transcript:YER176W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ECM32 description:DNA dependent ATPase/DNA helicase; helicase belonging to the Dna2p- and Nam7p- 1 11 11 11 6 4 3 7 3 3 6 4 3 7 3 3 6 4 3 7 3 3 13.5 13.5 13.5 126.97 1121 1121 0 18.927 7.6 4.4 5.1 8.6 4.1 4.1 88137000 18551000 7946900 24804000 14782000 4029900 18023000 20400000 16797000 17483000 20080000 15684000 27396000 5 4 3 7 3 3 25 429 987;1305;2314;4610;5019;5254;6043;6262;6270;7460;8284 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1033;1359;2398;4806;5227;5474;6294;6521;6529;7834;8701 4103;4104;5239;5240;5241;8820;8821;8822;8823;8824;8825;17579;17580;19133;20088;23183;23184;23185;23970;23996;23997;28660;31673;31674;31675;31676 4119;4120;5270;5271;5272;8865;8866;8867;8868;8869;8870;17694;17695;19256;20212;23319;23320;23321;24115;24141;24142;28840;31869;31870;31871;31872 4119;5271;8868;17694;19256;20212;23320;24115;24141;28840;31870 -1
YER177W;YDR099W YER177W;YDR099W 10;8 10;8 10;8 YER177W pep chromosome:R64-1-1:V:545611:546414:1 gene:YER177W transcript:YER177W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BMH1 description:14-3-3 protein, major isoform; controls proteome at post-transcriptional level, 2 10 10 10 8 2 3 4 3 4 8 2 3 4 3 4 8 2 3 4 3 4 50.9 50.9 50.9 30.091 267 267;273 0 50.037 46.4 8.6 18.7 17.2 17.2 27 373850000 81003000 10009000 148850000 23320000 16301000 94361000 65743000 61724000 96463000 47887000 64545000 62065000 8 2 3 4 3 5 25 430 1606;4599;4847;5483;7682;8063;9143;9747;10673;12108 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1669;4795;5050;5719;8066;8468;8469;9591;10223;11183;12671 6371;6372;17546;17547;17548;17549;17550;18435;21117;21118;29438;30904;30905;30906;35006;37356;37357;37358;37359;40826;46878;46879;46880;46881;46882 6407;6408;17661;17662;17663;17664;17665;18553;21244;21245;29622;31096;31097;31098;35214;37578;37579;37580;37581;41069;47204;47205;47206;47207;47208 6408;17664;18553;21245;29622;31098;35214;37581;41069;47207 203 223 -1;-1
YER178W YER178W 8 8 8 YER178W pep chromosome:R64-1-1:V:546817:548079:1 gene:YER178W transcript:YER178W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PDA1 description:E1 alpha subunit of the pyruvate dehydrogenase (PDH) complex; catalyzes the dir 1 8 8 8 3 6 1 4 4 2 3 6 1 4 4 2 3 6 1 4 4 2 21.2 21.2 21.2 46.343 420 420 0 15.714 9 13.8 4.5 10 12.4 7.1 97028000 21705000 16098000 12216000 17992000 13140000 15878000 34960000 25468000 0 29869000 42670000 26637000 3 6 1 4 4 1 19 431 868;3236;3278;5444;6653;6654;9157;9550 True;True;True;True;True;True;True;True 911;3352;3397;5678;6931;6932;9607;10019 3614;3615;12227;12228;12229;12427;20930;20931;20932;20933;25393;25394;25395;25396;25397;35066;35067;35068;36626;36627 3627;3628;12312;12313;12314;12513;21057;21058;21059;21060;25547;25548;25549;25550;25551;35274;35275;35276;36843;36844 3628;12312;12513;21058;25550;25551;35276;36843 -1
YER183C YER183C 3 3 3 YER183C pep chromosome:R64-1-1:V:553334:553969:-1 gene:YER183C transcript:YER183C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FAU1 description:5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase; involved in folic acid biosynthesis 1 3 3 3 0 2 1 0 0 1 0 2 1 0 0 1 0 2 1 0 0 1 20.9 20.9 20.9 24.058 211 211 0 10.336 0 14.7 6.2 0 0 6.2 59327000 0 21629000 0 0 0 37698000 0 46918000 0 0 0 0 0 2 1 0 0 1 4 432 7659;9249;11124 True;True;True 8040;9702;11655 29346;29347;35478;42816 29529;29530;35686;43111 29530;35686;43111 -1
YFL002C YFL002C 3 3 3 YFL002C pep chromosome:R64-1-1:VI:145114:146934:-1 gene:YFL002C transcript:YFL002C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SPB4 description:Putative ATP-dependent RNA helicase; nucleolar protein required for synthesis 1 3 3 3 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 8.4 8.4 8.4 69.421 606 606 0 34.084 5.9 3.3 5.8 3.3 5.8 3.3 65194000 21147000 4690000 21987000 2061600 5830400 9478700 0 0 11637000 0 17785000 0 2 2 2 1 3 1 11 433 386;7560;9216 True;True;True 410;411;7938;9667 1691;1692;1693;1694;1695;1696;1697;1698;28997;28998;35320 1695;1696;1697;1698;1699;1700;1701;1702;29180;29181;35528 1701;29181;35528 204 386 -1
YFL004W YFL004W 19 18 18 YFL004W pep chromosome:R64-1-1:VI:131810:134296:1 gene:YFL004W transcript:YFL004W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VTC2 description:Regulatory subunit of the vacuolar transporter chaperone (VTC) complex; involv 1 19 18 18 7 13 6 13 8 6 6 12 6 12 8 6 6 12 6 12 8 6 27.7 26.6 26.6 95.44 828 828 0 95.199 10.9 16.1 10.3 21 13.6 7.1 520040000 92648000 93617000 122200000 88281000 35021000 88276000 114120000 208100000 136640000 116430000 109500000 96975000 6 13 6 12 8 6 51 434 447;1271;2343;2548;3343;4620;5525;6228;6429;6686;7324;8886;8887;9380;9910;9988;11217;11846;12210 True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 474;1323;2427;2637;3465;4816;5762;6486;6699;6966;7688;9322;9323;9841;10397;10477;11754;12405;12779 1947;5110;8906;8907;8908;9597;9598;9599;12653;17603;17604;17605;17606;17607;17608;21272;21273;21274;21275;21276;23860;23861;23862;23863;23864;24585;24586;24587;25519;25520;28079;33880;33881;33882;33883;33884;35970;35971;35972;35973;38044;38045;38318;38319;38320;43193;43194;43195;43196;43197;43198;43199;45821;47244 1953;5139;8951;8952;8953;9646;9647;9648;12739;17718;17719;17720;17721;17722;17723;21399;21400;21401;21402;21403;24002;24003;24004;24005;24006;24734;24735;24736;25673;25674;28253;34081;34082;34083;34084;34085;36181;36182;36183;36184;38275;38276;38550;38551;38552;43490;43491;43492;43493;43494;43495;43496;46137;47573 1953;5139;8953;9647;12739;17720;21400;24006;24735;25674;28253;34083;34085;36182;38276;38551;43493;46137;47573 -1
YFL005W YFL005W 9 9 8 YFL005W pep chromosome:R64-1-1:VI:130334:130981:1 gene:YFL005W transcript:YFL005W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC4 description:Rab family GTPase; essential for vesicle-mediated exocytic secretion and autop 1 9 9 8 6 4 6 6 3 8 6 4 6 6 3 8 5 3 5 5 2 7 48.4 48.4 43.3 23.505 215 215 0 38.997 45.1 27.9 33.5 36.3 22.8 48.4 477970000 84819000 51806000 143250000 60658000 17652000 119790000 80701000 118430000 124410000 103050000 70605000 92818000 7 4 6 7 3 8 35 435 1835;1836;2711;4335;6539;9849;10715;11697;11698 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1904;1905;2805;4512;6815;10331;11226;12253;12254 7180;7181;7182;7183;7184;7185;7186;10232;10233;10234;16454;16455;16456;16457;16458;24948;24949;24950;24951;24952;24953;24954;24955;37792;37793;41073;41074;41075;45281;45282;45283;45284;45285;45286;45287 7220;7221;7222;7223;7224;7225;7226;10286;10287;10288;16563;16564;16565;16566;16567;25098;25099;25100;25101;25102;25103;25104;25105;38022;38023;41321;41322;41323;45594;45595;45596;45597;45598;45599;45600 7220;7225;10287;16567;25100;38022;41323;45599;45600 -1
YFL007W YFL007W 1 1 1 YFL007W pep chromosome:R64-1-1:VI:123479:129910:1 gene:YFL007W transcript:YFL007W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BLM10 description:Proteasome activator; binds the core proteasome (CP) and stimulates proteasom 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.8 0.8 0.8 245.99 2143 2143 0.0015886 2.7453 0 0.8 0 0 0 0 1211500 0 1211500 0 0 0 0 0 2627800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 436 786 True 827 3273 3284 3284 -1
YFL008W YFL008W 61 61 61 YFL008W pep chromosome:R64-1-1:VI:119429:123106:1 gene:YFL008W transcript:YFL008W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SMC1 description:Subunit of the multiprotein cohesin complex; essential protein involved in chr 1 61 61 61 2 3 2 47 51 34 2 3 2 47 51 34 2 3 2 47 51 34 49.9 49.9 49.9 141.28 1225 1225 0 323.31 2.1 3.2 2 45.9 42 35.4 2765300000 4446200 3168500 14917000 974470000 737350000 1030900000 3519800 2217600 2666900 2432300000 1618400000 1404400000 2 2 2 59 66 36 167 437 420;725;754;1149;1247;1270;1555;1741;1879;1926;2042;2091;2092;2369;2385;2549;3077;3280;3406;3803;4019;4082;4722;5119;5167;5210;5668;5678;5679;5980;5981;6216;6366;6520;6521;6733;6869;6940;7438;7475;8001;8190;8359;8360;8753;9126;9127;9152;9189;9204;9391;10039;10530;10531;10731;11006;11915;12026;12030;12031;12157 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 445;765;766;795;1200;1298;1321;1322;1618;1808;1950;1999;2119;2169;2170;2171;2453;2469;2638;3186;3399;3531;3953;4182;4248;4919;5329;5379;5428;5907;5918;5919;6231;6232;6473;6632;6796;6797;7013;7157;7228;7808;7850;8406;8601;8776;8777;8778;9182;9573;9574;9602;9639;9654;9655;9853;10530;11037;11038;11245;11532;12478;12589;12593;12594;12721 1816;3015;3016;3017;3018;3156;3157;3158;4678;4679;4680;5019;5106;5107;5108;5109;6195;6196;6197;6885;6886;6887;6888;7308;7309;7421;7777;7778;7779;7780;7781;7983;7984;7985;7986;8992;9047;9600;9601;9602;9603;9604;11642;11643;12435;12436;12926;14459;14460;14461;14462;14463;15274;15519;15520;15521;15522;15523;15524;15525;15526;15527;15528;17946;17947;17948;19545;19546;19547;19548;19549;19743;19744;19940;19941;21747;21788;21789;21790;21791;21792;21793;21794;22939;22940;22941;22942;22943;23826;23827;23828;23829;24298;24299;24890;24891;24892;25679;26254;26255;26256;26257;26561;26562;26563;26564;26565;28559;28560;28561;28562;28563;28715;28716;30691;30692;31310;31311;31312;31919;31920;31921;31922;31923;31924;33408;33409;34919;34920;34921;34922;34923;34924;34925;35051;35052;35193;35258;35259;35260;35261;36026;36027;36028;38474;38475;38476;40350;40351;40352;41225;41226;41227;42347;42348;42349;46107;46108;46578;46579;46580;46598;46599;46600;46601;46602;46603;47050;47051 1822;3025;3026;3027;3028;3167;3168;3169;4704;4705;4706;5047;5135;5136;5137;5138;6231;6232;6233;6925;6926;6927;6928;7349;7350;7462;7819;7820;7821;7822;7823;8025;8026;8027;8028;9038;9093;9649;9650;9651;9652;9653;11724;11725;12521;12522;13013;14558;14559;14560;14561;14562;15382;15627;15628;15629;15630;15631;15632;15633;15634;15635;15636;18062;18063;18064;19668;19669;19670;19671;19672;19866;19867;20064;20065;21876;21917;21918;21919;21920;21921;21922;21923;23074;23075;23076;23077;23078;23968;23969;23970;23971;24446;24447;25040;25041;25042;25833;26412;26413;26414;26415;26721;26722;26723;26724;26725;28737;28738;28739;28740;28741;28895;28896;30881;30882;31505;31506;31507;32115;32116;32117;32118;32119;32120;33608;33609;35127;35128;35129;35130;35131;35132;35133;35259;35260;35401;35466;35467;35468;35469;36237;36238;36239;38706;38707;38708;40591;40592;40593;41478;41479;41480;42642;42643;42644;46424;46425;46899;46900;46901;46919;46920;46921;46922;46923;46924;47377;47378 1822;3026;3167;4704;5047;5138;6232;6925;7350;7462;7822;8025;8027;9038;9093;9651;11724;12521;13013;14559;15382;15635;18063;19672;19866;20064;21876;21917;21922;23074;23078;23968;24446;25041;25042;25833;26414;26721;28739;28895;30881;31506;32115;32117;33609;35127;35133;35260;35401;35469;36237;38707;40591;40593;41479;42643;46425;46901;46919;46921;47378 205;206;207;208 811;860;872;912 -1
YFL016C YFL016C 5 5 5 YFL016C pep chromosome:R64-1-1:VI:104701:106236:-1 gene:YFL016C transcript:YFL016C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MDJ1 description:Co-chaperone that stimulates HSP70 protein Ssc1p ATPase activity; involved in 1 5 5 5 2 2 1 1 4 3 2 2 1 1 4 3 2 2 1 1 4 3 15.9 15.9 15.9 55.56 511 511 0 10.546 5.5 5.7 3.3 3.3 9.8 11.5 82026000 11290000 4526000 21736000 3761000 9453100 31260000 20191000 14836000 0 0 29312000 22740000 2 2 1 1 4 3 13 438 4586;5696;7631;10242;11495 True;True;True;True;True 4782;5937;8012;10740;12036 17496;17497;21844;29270;39287;39288;39289;39290;39291;39292;44406;44407;44408 17611;17612;21974;29453;39523;39524;39525;39526;39527;39528;44712;44713;44714 17612;21974;29453;39526;44714 -1
YFL018C YFL018C 1 1 1 YFL018C pep chromosome:R64-1-1:VI:101628:103127:-1 gene:YFL018C transcript:YFL018C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LPD1 description:Dihydrolipoamide dehydrogenase; the lipoamide dehydrogenase component (E3) of 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 3.8 3.8 3.8 54.009 499 499 0.001542 2.4288 0 3.8 0 3.8 0 3.8 6873600 0 1020700 0 1322700 0 4530300 0 0 0 0 0 4530300 0 1 0 1 0 1 3 439 8987 True 9430 34260;34261;34262 34466;34467;34468 34468 -1
YFL022C YFL022C 12 12 12 YFL022C pep chromosome:R64-1-1:VI:93499:95010:-1 gene:YFL022C transcript:YFL022C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FRS2 description:Alpha subunit of cytoplasmic phenylalanyl-tRNA synthetase; forms a tetramer wit 1 12 12 12 5 5 5 7 6 4 5 5 5 7 6 4 5 5 5 7 6 4 27.2 27.2 27.2 57.511 503 503 0 43.956 13.3 11.7 10.7 14.1 17.1 7.8 363870000 109960000 82580000 48218000 76394000 29421000 17291000 99419000 198690000 56101000 126630000 91539000 50511000 5 5 5 7 7 4 33 440 2292;2393;2491;4718;6010;6541;6542;7353;7772;8770;11247;11514 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2374;2478;2577;4915;6261;6817;6818;7719;8168;9201;11784;12056 8726;8727;8728;8729;8730;9090;9410;9411;17936;23048;23049;23050;24962;24963;24964;24965;24966;24967;28198;28199;28200;28201;28202;29876;29877;29878;33466;43332;44471;44472;44473;44474;44475 8771;8772;8773;8774;8775;9136;9458;9459;18052;23184;23185;23186;25112;25113;25114;25115;25116;25117;28373;28374;28375;28376;28377;30063;30064;30065;33666;43630;44777;44778;44779;44780;44781 8774;9136;9458;18052;23184;25113;25117;28374;30063;33666;43630;44777 -1
YFL026W YFL026W 1 1 1 YFL026W pep chromosome:R64-1-1:VI:82580:83875:1 gene:YFL026W transcript:YFL026W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:STE2 description:Receptor for alpha-factor pheromone; seven transmembrane-domain GPCR that intera 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 5.8 5.8 5.8 47.848 431 431 0 9.362 0 0 0 5.8 0 5.8 8850900 0 0 0 3955700 0 4895200 0 0 0 0 0 4895200 0 0 0 1 0 1 2 441 10090 True 10582 38694;38695 38927;38928 38928 -1
YFL037W YFL037W 14 14 14 YFL037W pep chromosome:R64-1-1:VI:56336:57709:1 gene:YFL037W transcript:YFL037W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TUB2 description:Beta-tubulin; associates with alpha-tubulin (Tub1p and Tub3p) to form tubulin di 1 14 14 14 7 8 12 8 7 9 7 8 12 8 7 9 7 8 12 8 7 9 44.9 44.9 44.9 50.922 457 457 0 85.269 22.5 23.4 40.5 28.9 23 32.6 1183700000 68433000 57401000 710980000 64640000 47179000 235030000 102510000 137450000 358190000 144830000 152480000 261370000 7 7 14 8 8 11 55 442 1534;2041;2993;4570;5581;5890;6450;7189;7741;7843;9073;9327;10994;12163 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1594;1595;2118;3099;4766;5818;6135;6720;7524;8135;8243;9517;9783;11520;12727 6106;6107;6108;7776;11316;11317;11318;11319;11320;17434;17435;17436;17437;17438;17439;21445;21446;21447;22579;24655;24656;24657;24658;24659;27551;27552;27553;29767;29768;29769;30145;30146;30147;30148;30149;30150;30151;30152;34712;34713;34714;34715;34716;34717;34718;35773;35774;35775;35776;35777;35778;35779;42310;42311;42312;47070;47071 6142;6143;6144;7818;11395;11396;11397;11398;11399;17549;17550;17551;17552;17553;17554;21572;21573;21574;22714;24804;24805;24806;24807;24808;27724;27725;27726;29952;29953;29954;30333;30334;30335;30336;30337;30338;30339;30340;34920;34921;34922;34923;34924;34925;34926;35981;35982;35983;35984;35985;35986;35987;42605;42606;42607;47397;47398 6143;7818;11399;17554;21573;22714;24805;27726;29952;30333;34923;35981;42607;47397 209;210 147;330 -1
YFL038C YFL038C 2 2 2 YFL038C pep chromosome:R64-1-1:VI:55366:55986:-1 gene:YFL038C transcript:YFL038C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YPT1 description:Rab family GTPase; involved in the ER-to-Golgi step of the secretory pathway; c 1 2 2 2 0 0 2 0 0 1 0 0 2 0 0 1 0 0 2 0 0 1 10.2 10.2 10.2 23.214 206 206 0 3.8202 0 0 10.2 0 0 5.3 39263000 0 0 29439000 0 0 9824000 0 0 17347000 0 0 0 0 0 2 0 0 1 3 443 6233;7206 True;True 6491;7545 23879;23880;27609 24021;24022;27782 24022;27782 -1
YFL039C YFL039C 22 22 22 YFL039C pep chromosome:R64-1-1:VI:53260:54696:-1 gene:YFL039C transcript:YFL039C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ACT1 description:Actin; structural protein involved in cell polarization, endocytosis, and other 1 22 22 22 10 11 19 13 12 16 10 11 19 13 12 16 10 11 19 13 12 16 66.9 66.9 66.9 41.689 375 375 0 136.19 40.5 38.4 64.8 56.3 46.4 57.1 2914500000 255970000 371180000 1216400000 342030000 111530000 617450000 384260000 779230000 576790000 629940000 433580000 522480000 14 16 26 19 17 20 112 444 232;660;919;1328;1455;1456;1750;1902;2587;3471;3656;4102;4875;5018;7053;7225;8504;9853;10622;10817;12234;12235 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 243;698;962;1383;1515;1516;1817;1973;2680;2681;3603;3801;3802;4269;5079;5226;7351;7352;7568;8928;10335;11130;11336;11337;12804;12805 993;994;995;996;997;2770;3818;3819;3820;3821;3822;3823;3824;3825;5333;5813;5814;5815;5816;5817;5818;5819;5820;5821;5822;5823;5824;5825;6913;6914;7368;9776;9777;9778;9779;9780;9781;9782;9783;9784;9785;9786;9787;13204;13205;13206;13207;13208;13209;13923;13924;13925;13926;13927;13928;13929;13930;13931;13932;13933;13934;13935;13936;15617;15618;15619;15620;15621;15622;18555;19131;19132;26959;26960;26961;26962;26963;26964;27693;27694;32423;32424;32425;37808;37809;37810;37811;37812;37813;37814;37815;37816;37817;40631;40632;40633;40634;40635;40636;41626;41627;41628;41629;41630;41631;41632;41633;41634;47337;47338;47339;47340 995;996;997;998;999;2779;3832;3833;3834;3835;3836;3837;3838;3839;5365;5848;5849;5850;5851;5852;5853;5854;5855;5856;5857;5858;5859;5860;6953;6954;7409;9827;9828;9829;9830;9831;9832;9833;9834;9835;9836;9837;9838;13293;13294;13295;13296;13297;13298;14014;14015;14016;14017;14018;14019;14020;14021;14022;14023;14024;14025;14026;14027;15725;15726;15727;15728;15729;15730;18673;19254;19255;27121;27122;27123;27124;27125;27126;27866;27867;32619;32620;32621;38038;38039;38040;38041;38042;38043;38044;38045;38046;38047;40874;40875;40876;40877;40878;40879;41889;41890;41891;41892;41893;41894;41895;41896;41897;47666;47667;47668;47669 997;2779;3835;5365;5848;5854;6954;7409;9828;13296;14017;15730;18673;19255;27122;27867;32619;38045;40877;41892;47666;47669 211;212;213;214;215;216;217;218 1;16;44;47;110;283;305;325 -1
YFL045C YFL045C 7 7 7 YFL045C pep chromosome:R64-1-1:VI:43628:44392:-1 gene:YFL045C transcript:YFL045C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC53 description:Phosphomannomutase; involved in synthesis of GDP-mannose and dolichol-phosphat 1 7 7 7 3 3 6 3 3 3 3 3 6 3 3 3 3 3 6 3 3 3 29.9 29.9 29.9 29.063 254 254 0 18.495 13.4 14.2 27.2 16.5 14.2 16.5 216210000 7886300 9033400 126300000 18897000 5734800 48354000 0 25162000 58979000 40957000 22132000 52978000 3 3 5 3 3 3 20 445 1145;1780;5576;6818;7356;9010;10195 True;True;True;True;True;True;True 1196;1847;5813;7104;7722;9453;10691 4668;7016;7017;7018;7019;7020;7021;21431;26057;26058;26059;26060;26061;28214;34484;34485;34486;34487;39118;39119;39120 4694;7056;7057;7058;7059;7060;7061;21558;26214;26215;26216;26217;26218;28389;34691;34692;34693;34694;39353;39354;39355 4694;7059;21558;26217;28389;34691;39355 -1
YFR001W YFR001W 4 4 4 YFR001W pep chromosome:R64-1-1:VI:149110:149724:1 gene:YFR001W transcript:YFR001W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LOC1 description:Nuclear protein involved in asymmetric localization of ASH1 mRNA; binds double 1 4 4 4 4 3 3 2 4 1 4 3 3 2 4 1 4 3 3 2 4 1 27.5 27.5 27.5 23.59 204 204 0 15.982 27.5 18.1 21.6 12.3 27.5 6.4 196450000 52578000 24200000 67453000 16745000 24085000 11388000 41270000 64299000 45854000 66302000 57272000 0 4 3 3 2 4 1 17 446 2036;2308;6034;7816 True;True;True;True 2113;2391;6285;8215 7759;7760;7761;7762;7763;7764;8793;8794;8795;8796;8797;23154;23155;23156;30042;30043;30044 7801;7802;7803;7804;7805;7806;8838;8839;8840;8841;8842;23290;23291;23292;30230;30231;30232 7804;8838;23292;30230 -1
YFR002W YFR002W 1 1 1 YFR002W pep chromosome:R64-1-1:VI:150016:152535:1 gene:YFR002W transcript:YFR002W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NIC96 description:Linker nucleoporin component of the nuclear pore complex (NPC); also part of 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.2 1.2 1.2 96.173 839 839 0.0015349 2.3942 0 1.2 0 0 0 0 1212600 0 1212600 0 0 0 0 0 2630300 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 447 6447 True 6717 24647 24796 24796 -1
YFR003C YFR003C 1 1 1 YFR003C pep chromosome:R64-1-1:VI:152657:153124:-1 gene:YFR003C transcript:YFR003C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YPI1 description:Regulatory subunit of the type I protein phosphatase (PP1) Glc7p; Glc7p parti 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 9 9 9 18.187 155 155 0 3.8968 0 9 0 0 0 0 912470 0 912470 0 0 0 0 0 1979300 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 448 10730 True 11244 41224 41477 41477 -1
YFR009W YFR009W 38 38 38 YFR009W pep chromosome:R64-1-1:VI:162488:164746:1 gene:YFR009W transcript:YFR009W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GCN20 description:Positive regulator of the Gcn2p kinase activity; forms a complex with Gcn1p; 1 38 38 38 23 14 18 13 15 21 23 14 18 13 15 21 23 14 18 13 15 21 62.6 62.6 62.6 85.026 752 752 0 131.45 41.2 20.2 35 22.7 27.5 39.1 1907600000 337890000 170200000 751100000 92513000 112280000 443580000 370760000 371710000 445760000 356630000 278390000 423810000 21 16 22 13 16 21 109 449 70;72;176;478;553;554;796;797;2090;2732;3245;3246;3600;3617;3618;3711;3764;4075;4370;4405;4406;4931;5994;6057;6058;6133;6846;7084;7227;8109;8269;8288;8412;8489;8779;10766;11171;12009 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 72;74;183;505;506;584;585;837;838;2168;2826;3362;3363;3743;3760;3761;3857;3913;4241;4549;4590;4591;5137;6245;6308;6309;6386;7133;7389;7570;8517;8686;8705;8833;8912;9210;11282;11706;12572 290;292;750;751;752;2071;2072;2073;2413;2414;2415;2416;2417;2418;2419;2420;2421;2422;2423;3316;3317;7978;7979;7980;7981;7982;10329;12268;12269;12270;12271;12272;12273;12274;12275;12276;12277;13756;13801;13802;13803;13804;13805;13806;14110;14111;14112;14113;14114;14324;15491;16583;16584;16745;16746;16747;18771;18772;22992;22993;22994;22995;23233;23234;23235;23236;23237;23238;23239;23240;23241;23242;23547;23548;23549;26159;26160;26161;27068;27698;27699;27700;27701;31071;31623;31624;31682;32101;32102;32103;32104;32364;32365;32366;33490;41414;41415;41416;43014;43015;43016;43017;43018;43019;43020;43021;43022;43023;46511;46512;46513;46514;46515;46516 291;293;751;752;753;2077;2078;2079;2420;2421;2422;2423;2424;2425;2426;2427;2428;2429;2430;3328;3329;8020;8021;8022;8023;8024;10387;12353;12354;12355;12356;12357;12358;12359;12360;12361;12362;13847;13892;13893;13894;13895;13896;13897;14207;14208;14209;14210;14211;14422;15599;16693;16694;16856;16857;16858;18892;18893;23127;23128;23129;23130;23369;23370;23371;23372;23373;23374;23375;23376;23377;23378;23687;23688;23689;26316;26317;26318;27230;27871;27872;27873;27874;31264;31819;31820;31878;32297;32298;32299;32300;32560;32561;32562;33690;41674;41675;41676;43311;43312;43313;43314;43315;43316;43317;43318;43319;43320;46832;46833;46834;46835;46836;46837 291;293;752;2078;2425;2429;3328;3329;8020;10387;12354;12360;13847;13892;13897;14208;14422;15599;16694;16857;16858;18893;23129;23370;23375;23687;26318;27230;27872;31264;31820;31878;32297;32560;33690;41676;43313;46835 219;220 133;397 -1
YFR013W YFR013W 6 6 6 YFR013W pep chromosome:R64-1-1:VI:169922:172285:1 gene:YFR013W transcript:YFR013W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IOC3 description:Subunit of the Isw1a complex; Isw1a has nucleosome-stimulated ATPase activity 1 6 6 6 3 0 2 3 2 1 3 0 2 3 2 1 3 0 2 3 2 1 11.9 11.9 11.9 90.896 787 787 0 9.4522 4.7 0 3.3 7.9 3.4 1.4 37102000 10819000 0 14782000 8077000 3424800 0 15675000 0 0 15072000 0 0 3 0 2 3 2 1 11 450 5597;8339;10580;10818;11412;12316 True;True;True;True;True;True 5834;8756;11088;11338;11949;12889 21494;31852;40519;40520;40521;41635;44085;44086;47648;47649;47650 21621;32048;40762;40763;40764;41898;44384;44385;47980;47981;47982 21621;32048;40764;41898;44384;47980 -1
YFR015C YFR015C 2 2 1 YFR015C pep chromosome:R64-1-1:VI:174265:176391:-1 gene:YFR015C transcript:YFR015C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GSY1 description:Glycogen synthase; expression induced by glucose limitation, nitrogen starvat 1 2 2 1 0 0 2 0 0 1 0 0 2 0 0 1 0 0 1 0 0 1 3.7 3.7 2.7 80.509 708 708 0.0052122 2.0853 0 0 3.7 0 0 2.7 22569000 0 0 17317000 0 0 5252000 0 0 10204000 0 0 0 0 0 2 0 0 1 3 451 7105;12233 True;True 7413;12803 27137;47335;47336 27299;47664;47665 27299;47665 -1
YFR024C-A YFR024C-A 15 15 12 YFR024C-A pep chromosome:R64-1-1:VI:201960:203433:-1 gene:YFR024C-A transcript:YFR024C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LSB3 description:Protein containing a C-terminal SH3 domain; binds Las17p, which is a ho 1 15 15 12 7 12 7 9 8 8 7 12 7 9 8 8 6 10 4 7 8 6 43.1 43.1 37.3 49.343 459 459 0 120.81 16.3 31.8 18.7 24.8 23.7 25.1 718610000 111530000 92434000 261950000 85254000 51558000 115890000 178620000 152080000 169180000 143140000 183810000 135440000 7 12 7 9 7 9 51 452 183;896;1662;2657;2773;3033;3091;4247;4582;4683;8806;9263;10254;11759;12310 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 193;939;1726;2751;2871;3141;3200;4421;4778;4880;9238;9717;10752;12316;12883 795;796;797;798;3708;6561;6562;6563;10013;10014;10015;10512;10513;10514;10515;10516;11451;11452;11453;11454;11455;11683;11684;11685;11686;16142;16143;16144;16145;16146;17487;17488;17489;17490;17795;17796;17797;17798;17799;17800;33601;33602;33603;33604;35504;39344;39345;39346;45527;47624;47625;47626 796;797;798;799;3721;6597;6598;6599;10066;10067;10068;10578;10579;10580;10581;10582;11530;11531;11532;11533;11534;11765;11766;11767;11768;16251;16252;16253;16254;16255;17602;17603;17604;17605;17910;17911;17912;17913;17914;17915;33801;33802;33803;33804;35712;39580;39581;39582;45841;47956;47957;47958 798;3721;6599;10067;10581;11532;11768;16255;17602;17914;33804;35712;39582;45841;47957 -1
YFR028C YFR028C 11 11 11 YFR028C pep chromosome:R64-1-1:VI:208413:210068:-1 gene:YFR028C transcript:YFR028C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC14 description:Protein phosphatase required for mitotic exit; required for rDNA segregation 1 11 11 11 7 2 3 3 2 3 7 2 3 3 2 3 7 2 3 3 2 3 33.2 33.2 33.2 61.906 551 551 0 61.574 21.1 6.4 10.9 8.3 6 9.4 201580000 67708000 15244000 65365000 16655000 8955800 27658000 70239000 36090000 32507000 31243000 53813000 0 7 2 3 3 2 3 20 453 970;2159;2352;3511;4653;7066;7461;7887;9555;9833;10819 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1015;2239;2436;3645;4850;7370;7835;8287;10024;10314;11339 4046;8246;8247;8248;8941;13355;17717;17718;17719;17720;17721;27025;28661;30266;36637;36638;36639;37751;41636;41637 4062;8289;8290;8291;8987;13444;17832;17833;17834;17835;17836;27187;28841;30455;36854;36855;36856;37980;41899;41900 4062;8290;8987;13444;17833;27187;28841;30455;36856;37980;41899 -1
YIL018W;YFR031C-A YIL018W;YFR031C-A 24;24 24;24 24;24 YIL018W pep chromosome:R64-1-1:IX:316768:317932:1 gene:YIL018W transcript:YIL018W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL2B description:Ribosomal 60S subunit protein L2B; homologous to mammalian ribosomal protein 2 24 24 24 21 19 21 20 19 18 21 19 21 20 19 18 21 19 21 20 19 18 72.8 72.8 72.8 27.408 254 254;254 0 103.18 69.3 64.2 70.1 70.1 64.2 61.4 23060000000 3701500000 2136200000 7902600000 2600900000 1853300000 4865500000 4664900000 5238000000 4713400000 5188700000 5491300000 5086900000 34 30 30 34 30 28 186 454 246;790;791;811;812;2801;3371;3393;3394;4967;5053;5375;6574;6575;6597;6598;8205;10305;10888;11146;11474;11475;11653;11654 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 257;831;832;852;853;2900;3494;3495;3518;3519;5173;5263;5603;6851;6852;6874;6875;8618;10805;11408;11680;12013;12014;12202;12203 1080;1081;1082;3287;3288;3289;3290;3291;3292;3293;3294;3295;3296;3297;3298;3299;3300;3301;3302;3303;3304;3305;3306;3307;3308;3309;3310;3371;3372;3373;3374;3375;3376;3377;3378;3379;3380;3381;3382;3383;3384;3385;3386;3387;3388;3389;3390;10611;10612;10613;10614;10615;10616;10617;10618;12772;12773;12774;12775;12776;12777;12778;12779;12780;12781;12782;12783;12784;12869;12870;12871;12872;12873;12874;12875;12876;12877;12878;12879;12880;12881;12882;12883;12884;12885;12886;12887;12888;12889;18891;18892;18893;18894;18895;18896;18897;18898;18899;18900;18901;18902;18903;18904;19254;19255;19256;19257;19258;19259;19260;19261;19262;19263;19264;19265;20599;20600;20601;25107;25108;25109;25110;25111;25112;25113;25114;25115;25116;25117;25118;25119;25120;25121;25122;25123;25124;25125;25126;25127;25128;25202;25203;25204;25205;25206;25207;25208;25209;25210;25211;31377;31378;31379;39534;39535;39536;39537;39538;39539;41859;41860;41861;41862;41863;41864;42919;44305;44306;44307;44308;44309;44310;44311;44312;44313;44314;45057;45058;45059;45060;45061;45062;45063;45064;45065;45066 1082;1083;1084;3298;3299;3300;3301;3302;3303;3304;3305;3306;3307;3308;3309;3310;3311;3312;3313;3314;3315;3316;3317;3318;3319;3320;3321;3322;3383;3384;3385;3386;3387;3388;3389;3390;3391;3392;3393;3394;3395;3396;3397;3398;3399;3400;3401;3402;10678;10679;10680;10681;10682;10683;10684;10685;12859;12860;12861;12862;12863;12864;12865;12866;12867;12868;12869;12870;12871;12956;12957;12958;12959;12960;12961;12962;12963;12964;12965;12966;12967;12968;12969;12970;12971;12972;12973;12974;12975;12976;19013;19014;19015;19016;19017;19018;19019;19020;19021;19022;19023;19024;19025;19026;19377;19378;19379;19380;19381;19382;19383;19384;19385;19386;19387;19388;20726;20727;20728;25257;25258;25259;25260;25261;25262;25263;25264;25265;25266;25267;25268;25269;25270;25271;25272;25273;25274;25275;25276;25277;25278;25352;25353;25354;25355;25356;25357;25358;25359;25360;25361;31572;31573;31574;39770;39771;39772;39773;39774;39775;42123;42124;42125;42126;42127;42128;43216;44611;44612;44613;44614;44615;44616;44617;44618;44619;44620;45367;45368;45369;45370;45371;45372;45373;45374;45375;45376;45377 1083;3307;3320;3391;3400;10685;12870;12957;12973;19026;19386;20728;25265;25276;25352;25355;31572;39770;42127;43216;44611;44619;45367;45372 221 204 -1;-1
YFR032C-A YFR032C-A 3 3 3 YFR032C-A pep chromosome:R64-1-1:VI:223258:223437:-1 gene:YFR032C-A transcript:YFR032C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL29 description:Ribosomal 60S subunit protein L29; not essential for translation, but 1 3 3 3 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 39 39 39 6.6687 59 59 0 5.3297 13.6 13.6 27.1 13.6 25.4 13.6 214980000 6895400 16211000 130620000 0 14471000 46781000 0 37524000 81618000 0 45223000 42396000 1 2 3 1 3 2 12 455 433;3482;10761 True;True;True 459;3616;11277 1900;13260;41392;41393;41394;41395;41396;41397;41398;41399;41400;41401 1906;13349;41652;41653;41654;41655;41656;41657;41658;41659;41660;41661 1906;13349;41659 -1
YFR037C YFR037C 12 12 12 YFR037C pep chromosome:R64-1-1:VI:227513:229186:-1 gene:YFR037C transcript:YFR037C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSC8 description:Component of the RSC chromatin remodeling complex; essential for viability an 1 12 12 12 6 4 8 8 3 5 6 4 8 8 3 5 6 4 8 8 3 5 27.5 27.5 27.5 63.167 557 557 0 84.221 16.2 11.1 18.7 20.5 8.6 13.8 209980000 38923000 13052000 77133000 35296000 7642300 37938000 48527000 33053000 46752000 53634000 35440000 43012000 6 4 9 8 3 5 35 456 1746;4480;6329;6543;7994;8186;8385;9203;9411;11020;11789;12048 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1813;4672;6591;6819;8398;8597;8803;9653;9875;11547;12348;12611 6903;17063;17064;17065;17066;24188;24189;24190;24968;24969;30659;30660;30661;30662;31298;31299;32001;32002;32003;32004;32005;32006;35255;35256;35257;36099;36100;36101;42407;42408;42409;42410;45669;46675;46676 6943;17177;17178;17179;17180;24336;24337;24338;25118;25119;30849;30850;30851;30852;31493;31494;32197;32198;32199;32200;32201;32202;35463;35464;35465;36310;36311;36312;42702;42703;42704;42705;45984;46998;46999 6943;17180;24336;25118;30851;31494;32201;35465;36310;42704;45984;46998 -1
YFR041C YFR041C 1 1 1 YFR041C pep chromosome:R64-1-1:VI:237368:238255:-1 gene:YFR041C transcript:YFR041C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERJ5 description:Type I membrane protein with a J domain; required to preserve the folding cap 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 9.2 9.2 9.2 34.191 295 295 0 10.801 0 9.2 9.2 9.2 0 9.2 27330000 0 3163900 11691000 3551800 0 8923100 0 0 0 0 0 8923100 0 1 1 1 0 1 4 457 2613 True 2707 9880;9881;9882;9883 9931;9932;9933;9934 9932 -1
YFR051C YFR051C 9 9 9 YFR051C pep chromosome:R64-1-1:VI:250163:251803:-1 gene:YFR051C transcript:YFR051C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RET2 description:Delta subunit of the coatomer complex (COPI); COPI coats Golgi-derived transp 1 9 9 9 5 2 3 4 6 6 5 2 3 4 6 6 5 2 3 4 6 6 20.1 20.1 20.1 60.627 546 546 0 23.518 12.6 4.9 5.3 11.4 13.6 14.3 454730000 123780000 8603700 45370000 60484000 43762000 172730000 153720000 103950000 0 130550000 125710000 108250000 5 2 3 4 6 7 27 458 184;1164;2058;4420;4535;7608;10164;11225;11674 True;True;True;True;True;True;True;True;True 194;1215;2135;4607;4729;7988;10660;11762;12227 799;800;801;802;803;4750;7856;7857;16796;17280;17281;17282;17283;29191;29192;29193;39003;39004;39005;39006;39007;43240;43241;43242;43243;45172;45173 800;801;802;803;804;4776;7898;7899;16908;17394;17395;17396;17397;29374;29375;29376;39238;39239;39240;39241;39242;43537;43538;43539;43540;45484;45485 804;4776;7898;16908;17396;29374;39242;43537;45485 -1
YFR053C YFR053C 8 8 8 YFR053C pep chromosome:R64-1-1:VI:253592:255049:-1 gene:YFR053C transcript:YFR053C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HXK1 description:Hexokinase isoenzyme 1; a cytosolic protein that catalyzes phosphorylation of 1 8 8 8 3 0 5 1 2 2 3 0 5 1 2 2 3 0 5 1 2 2 33 33 33 53.738 485 485 0 17.594 10.9 0 19.6 5.4 9.5 7.2 150180000 13043000 0 88062000 10414000 2451300 36214000 30967000 0 36318000 0 0 37856000 3 0 4 1 2 2 12 459 1872;2899;3870;6893;7111;7271;10111;10280 True;True;True;True;True;True;True;True 1943;3002;4027;7181;7419;7624;10603;10779 7294;7295;11010;11011;11012;14720;26367;26368;27157;27872;27873;38770;39447 7335;7336;11086;11087;11088;14822;26525;26526;27319;28045;28046;39005;39683 7335;11087;14822;26525;27319;28046;39005;39683 222 228 -1
YGL001C YGL001C 4 4 4 YGL001C pep chromosome:R64-1-1:VII:495453:496502:-1 gene:YGL001C transcript:YGL001C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERG26 description:C-3 sterol dehydrogenase; catalyzes the second of three steps required to r 1 4 4 4 1 1 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 20.3 20.3 20.3 38.706 349 349 0 10.777 6.9 8 2.6 6.9 0 5.4 32795000 5121200 4508400 10078000 3679600 0 9407600 0 0 0 0 0 9407600 1 1 1 1 0 2 6 460 610;2563;8137;11015 True;True;True;True 645;2652;8547;11541 2597;2598;9665;31150;42384;42385 2604;2605;9715;31343;42679;42680 2604;9715;31343;42680 -1
YGL008C;YPL036W YGL008C;YPL036W 48;35 48;35 48;35 YGL008C pep chromosome:R64-1-1:VII:479910:482666:-1 gene:YGL008C transcript:YGL008C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PMA1 description:Plasma membrane P2-type H+-ATPase; pumps protons out of cell; major regulato 2 48 48 48 39 42 37 39 35 35 39 42 37 39 35 35 39 42 37 39 35 35 49.9 49.9 49.9 99.618 918 918;947 0 323.31 47.8 46 42.8 43.6 43.5 42.5 43502000000 6565700000 6823300000 13092000000 5414200000 2637600000 8970200000 7631100000 12242000000 8660500000 10363000000 9109500000 8784500000 62 73 65 66 60 63 389 461 5;112;399;1159;2822;2877;3098;3099;3460;3461;4851;4852;4934;5069;5274;5401;5402;5833;6342;6605;6606;6668;6669;7185;7296;7623;8048;8049;8250;8500;8660;8661;9777;10008;10288;10289;10688;10689;10789;11218;11219;11544;11556;11557;11647;12103;12104;12274 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 6;117;424;1210;2921;2978;2979;3207;3208;3589;3590;3591;3592;5054;5055;5140;5279;5495;5629;5630;6076;6077;6607;6882;6883;6946;6947;6948;6949;7518;7519;7659;8003;8004;8453;8454;8665;8923;8924;9085;9086;10254;10255;10256;10497;10787;10788;11199;11200;11307;11755;11756;12086;12099;12100;12196;12666;12667;12845 29;30;483;484;485;486;487;1732;4718;4719;4720;4721;4722;4723;10685;10686;10687;10688;10689;10934;10935;10936;10937;10938;10939;10940;10941;10942;10943;10944;11708;11709;11710;11711;11712;11713;11714;11715;11716;11717;11718;11719;13138;13139;13140;13141;13142;13143;13144;13145;13146;13147;13148;13149;13150;13151;13152;13153;13154;13155;13156;13157;13158;13159;13160;13161;13162;13163;13164;13165;13166;13167;13168;13169;13170;13171;18457;18458;18459;18460;18461;18462;18463;18464;18465;18466;18776;18777;18778;18779;18780;18781;18782;18783;18784;18785;18786;18787;19356;19357;19358;19359;19360;20143;20144;20145;20704;20705;20706;20707;20708;20709;20710;20711;20712;20713;20714;20715;20716;20717;20718;20719;20720;22335;22336;22337;22338;22339;22340;22341;22342;22343;22344;22345;22346;22347;22348;22349;22350;22351;22352;22353;22354;22355;22356;24231;24232;24233;24234;25233;25234;25235;25236;25237;25238;25239;25240;25241;25242;25243;25244;25245;25246;25247;25248;25249;25250;25435;25436;25437;25438;25439;25440;25441;25442;25443;25444;25445;25446;25447;25448;25449;25450;25451;25452;25453;25454;25455;27533;27534;27535;27536;27537;27538;27539;27540;27541;27542;27543;27544;28005;29242;29243;29244;29245;29246;29247;29248;29249;29250;30842;30843;30844;30845;30846;30847;30848;30849;30850;30851;30852;30853;31541;31542;31543;31544;31545;31546;32405;32406;32407;32408;32409;32410;32411;32995;32996;32997;32998;32999;33000;33001;33002;33003;33004;33005;33006;33007;33008;33009;33010;33011;33012;37458;37459;37460;37461;37462;37463;37464;37465;37466;37467;37468;37469;37470;37471;37472;37473;37474;37475;37476;37477;37478;38366;39472;39473;39474;39475;39476;39477;39478;39479;39480;39481;39482;39483;39484;39485;39486;39487;39488;39489;39490;39491;40935;40936;40937;40938;40939;40940;40941;40942;40943;40944;40945;40946;40947;40948;40949;40950;40951;40952;40953;40954;40955;40956;40957;40958;40959;40960;41522;41523;41524;43200;43201;43202;43203;43204;43205;43206;43207;43208;43209;43210;43211;43212;43213;43214;43215;43216;43217;43218;43219;43220;44571;44572;44573;44574;44575;44576;44577;44578;44579;44633;44634;44635;44636;44637;44638;44639;44640;44641;44642;44643;45020;45021;45022;45023;45024;46860;46861;46862;46863;46864;46865;46866;46867;46868;46869;46870;46871;46872;46873;46874;47487;47488;47489;47490;47491;47492;47493 29;30;484;485;486;487;488;1738;4744;4745;4746;4747;4748;4749;10753;10754;10755;10756;10757;11010;11011;11012;11013;11014;11015;11016;11017;11018;11019;11020;11790;11791;11792;11793;11794;11795;11796;11797;11798;11799;11800;11801;13226;13227;13228;13229;13230;13231;13232;13233;13234;13235;13236;13237;13238;13239;13240;13241;13242;13243;13244;13245;13246;13247;13248;13249;13250;13251;13252;13253;13254;13255;13256;13257;13258;13259;13260;18575;18576;18577;18578;18579;18580;18581;18582;18583;18584;18897;18898;18899;18900;18901;18902;18903;18904;18905;18906;18907;18908;19479;19480;19481;19482;19483;20267;20268;20269;20831;20832;20833;20834;20835;20836;20837;20838;20839;20840;20841;20842;20843;20844;20845;20846;20847;22468;22469;22470;22471;22472;22473;22474;22475;22476;22477;22478;22479;22480;22481;22482;22483;22484;22485;22486;22487;22488;22489;24379;24380;24381;24382;25387;25388;25389;25390;25391;25392;25393;25394;25395;25396;25397;25398;25399;25400;25401;25402;25403;25404;25589;25590;25591;25592;25593;25594;25595;25596;25597;25598;25599;25600;25601;25602;25603;25604;25605;25606;25607;25608;25609;27705;27706;27707;27708;27709;27710;27711;27712;27713;27714;27715;27716;27717;28179;29425;29426;29427;29428;29429;29430;29431;29432;29433;31034;31035;31036;31037;31038;31039;31040;31041;31042;31043;31044;31045;31737;31738;31739;31740;31741;31742;32601;32602;32603;32604;32605;32606;32607;33193;33194;33195;33196;33197;33198;33199;33200;33201;33202;33203;33204;33205;33206;33207;33208;33209;33210;37680;37681;37682;37683;37684;37685;37686;37687;37688;37689;37690;37691;37692;37693;37694;37695;37696;37697;37698;37699;37700;38598;39708;39709;39710;39711;39712;39713;39714;39715;39716;39717;39718;39719;39720;39721;39722;39723;39724;39725;39726;39727;41182;41183;41184;41185;41186;41187;41188;41189;41190;41191;41192;41193;41194;41195;41196;41197;41198;41199;41200;41201;41202;41203;41204;41205;41206;41207;41785;41786;41787;43497;43498;43499;43500;43501;43502;43503;43504;43505;43506;43507;43508;43509;43510;43511;43512;43513;43514;43515;43516;43517;44877;44878;44879;44880;44881;44882;44883;44884;44885;44939;44940;44941;44942;44943;44944;44945;44946;44947;44948;44949;45330;45331;45332;45333;45334;47186;47187;47188;47189;47190;47191;47192;47193;47194;47195;47196;47197;47198;47199;47200;47818;47819;47820;47821;47822;47823;47824 30;486;1738;4746;10753;11014;11790;11795;13226;13258;18580;18583;18908;19481;20267;20836;20844;22476;24380;25389;25394;25605;25608;27715;28179;29432;31040;31045;31742;32602;33202;33210;37691;38598;39711;39726;41193;41195;41787;43504;43517;44881;44943;44949;45332;47194;47200;47821 223;224;225;226;227;228;229 258;405;556;592;631;904;907 -1;-1
YGL009C YGL009C 21 21 21 YGL009C pep chromosome:R64-1-1:VII:476313:478652:-1 gene:YGL009C transcript:YGL009C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LEU1 description:Isopropylmalate isomerase; catalyzes the second step in the leucine biosynth 1 21 21 21 16 10 8 17 8 9 16 10 8 17 8 9 16 10 8 17 8 9 35.7 35.7 35.7 85.793 779 779 0 70.705 28.9 17.6 15.1 29.5 15.8 17.1 531820000 126780000 43244000 169070000 66289000 19154000 107290000 119280000 88541000 143440000 103760000 80872000 130110000 16 10 8 17 8 9 68 462 256;446;965;1691;3120;3494;3630;4275;5273;5518;5519;5598;5651;6225;8061;8122;8621;9048;10940;10959;11747 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 267;473;1010;1756;3230;3628;3773;4451;5494;5755;5756;5835;5889;6483;8466;8531;9045;9492;11464;11484;12304 1112;1113;1114;1115;1116;1941;1942;1943;1944;1945;1946;4031;6691;11813;11814;13284;13849;13850;16243;16244;16245;16246;16247;16248;20141;20142;21245;21246;21247;21248;21249;21250;21495;21496;21497;21498;21684;21685;23852;30897;30898;30899;30900;31103;31104;31105;32832;32833;32834;32835;32836;34612;34613;34614;34615;34616;42096;42097;42181;42182;42183;42184;45482;45483;45484;45485;45486;45487 1114;1115;1116;1117;1118;1947;1948;1949;1950;1951;1952;4047;6731;11897;11898;13373;13940;13941;16352;16353;16354;16355;16356;16357;20265;20266;21372;21373;21374;21375;21376;21377;21622;21623;21624;21625;21813;21814;23994;31089;31090;31091;31092;31296;31297;31298;33029;33030;33031;33032;33033;34820;34821;34822;34823;34824;42388;42389;42476;42477;42478;42479;45796;45797;45798;45799;45800;45801 1114;1948;4047;6731;11897;13373;13941;16355;20265;21376;21377;21624;21814;23994;31091;31297;33033;34823;42388;42479;45801 -1
YGL012W YGL012W 5 5 5 YGL012W pep chromosome:R64-1-1:VII:472855:474276:1 gene:YGL012W transcript:YGL012W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERG4 description:C-24(28) sterol reductase; catalyzes the final step in ergosterol biosynthesi 1 5 5 5 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 2 8 8 8 56.039 473 473 0 5.1452 5.3 3 2.3 2.5 2.5 3 34901000 5914800 3393900 7269000 4329900 3974400 10019000 0 0 0 0 0 10019000 2 1 1 2 1 2 9 463 3495;5325;9168;10073;10074 True;True;True;True;True 3629;5548;9618;10565;10566 13285;20359;35109;38618;38619;38620;38621;38622;38623 13374;20486;35317;38851;38852;38853;38854;38855;38856 13374;20486;35317;38851;38856 -1
YGL013C YGL013C 4 4 4 YGL013C pep chromosome:R64-1-1:VII:469092:472298:-1 gene:YGL013C transcript:YGL013C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PDR1 description:Transcription factor that regulates the pleiotropic drug response; zinc clus 1 4 4 4 0 1 1 3 1 0 0 1 1 3 1 0 0 1 1 3 1 0 7.9 7.9 7.9 121.79 1068 1068 0 10.173 0 1.7 1.5 6 1.9 0 12039000 0 888570 5430100 4501400 1218500 0 0 0 0 9259900 0 0 0 1 1 2 1 0 5 464 1373;1485;9004;10146 True;True;True;True 1431;1545;9447;10641 5508;5921;5922;34468;34469;38924 5543;5956;5957;34674;34675;39159 5543;5956;34674;39159 -1
YGL016W YGL016W 4 4 4 YGL016W pep chromosome:R64-1-1:VII:461666:464911:1 gene:YGL016W transcript:YGL016W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KAP122 description:Karyopherin beta; responsible for import of the Toa1p-Toa2p complex into th 1 4 4 4 0 1 3 1 1 1 0 1 3 1 1 1 0 1 3 1 1 1 7.8 7.8 7.8 123.53 1081 1081 0 14.769 0 1.4 6.4 1.5 1.8 1.8 296400000 0 3100500 245770000 1021800 13487000 33021000 0 0 144820000 0 0 0 0 0 3 1 1 1 6 465 3500;6621;7596;9598 True;True;True;True 3634;6898;7975;10067 13308;25290;25291;29140;36769;36770;36771 13397;25444;25445;29323;36987;36988;36989 13397;25444;29323;36988 -1
YGL019W YGL019W 2 2 2 YGL019W pep chromosome:R64-1-1:VII:458156:458992:1 gene:YGL019W transcript:YGL019W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CKB1 description:Beta regulatory subunit of casein kinase 2 (CK2); a Ser/Thr protein kinase wi 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 9.7 9.7 9.7 32.264 278 278 0 17.783 6.1 9.7 9.7 6.1 9.7 9.7 109390000 16583000 9972900 46882000 6738700 8064100 21152000 25410000 22807000 25678000 0 25161000 19676000 2 2 3 1 3 2 13 466 4419;9049 True;True 4606;9493 16792;16793;16794;16795;34617;34618;34619;34620;34621;34622;34623;34624;34625 16904;16905;16906;16907;34825;34826;34827;34828;34829;34830;34831;34832;34833 16906;34825 -1
YGL022W YGL022W 3 3 3 YGL022W pep chromosome:R64-1-1:VII:452404:454560:1 gene:YGL022W transcript:YGL022W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:STT3 description:Subunit of the oligosaccharyltransferase complex of the ER lumen; complex cat 1 3 3 3 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 0 0 2 6 6 6 81.528 718 718 0 7.8787 0 0 3.9 0 0 4.6 36653000 0 0 22554000 0 0 14099000 0 0 0 0 0 14099000 0 0 1 0 0 2 3 467 1142;2460;7258 True;True;True 1193;2545;7606 4658;9318;27804;27805 4684;9365;27977;27978 4684;9365;27978 -1
YGL026C YGL026C 5 5 5 YGL026C pep chromosome:R64-1-1:VII:446412:448535:-1 gene:YGL026C transcript:YGL026C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRP5 description:Tryptophan synthase; catalyzes the last step of tryptophan biosynthesis; reg 1 5 5 5 2 0 4 0 1 3 2 0 4 0 1 3 2 0 4 0 1 3 10.3 10.3 10.3 76.625 707 707 0 18.665 4.2 0 8.6 0 1.6 5.8 49956000 5423000 0 31387000 0 1066600 12079000 0 0 15203000 0 0 15371000 2 0 4 0 0 3 9 468 2117;2255;4452;4854;10670 True;True;True;True;True 2197;2337;4643;5057;11180 8084;8085;8086;8588;8589;8590;16959;18471;18472;40814 8126;8127;8128;8633;8634;8635;17072;18589;18590;41057 8127;8633;17072;18590;41057 -1
YGL030W YGL030W 13 13 13 YGL030W pep chromosome:R64-1-1:VII:439091:439638:1 gene:YGL030W transcript:YGL030W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL30 description:Ribosomal 60S subunit protein L30; involved in pre-rRNA processing in the nu 1 13 13 13 11 9 9 10 8 8 11 9 9 10 8 8 11 9 9 10 8 8 83.8 83.8 83.8 11.415 105 105 0 201.26 79 69.5 69.5 80 69.5 67.6 10284000000 1145100000 1611700000 3159200000 1518900000 1000100000 1849300000 2803800000 2711200000 2570000000 2202900000 2365700000 2376300000 16 16 14 18 14 15 93 469 698;5305;5970;5971;8846;8962;9153;9154;9486;10278;11054;11751;11752 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 738;5527;5528;6221;6222;9280;9281;9402;9603;9604;9952;10777;11581;12308;12309 2908;20273;20274;20275;20276;20277;20278;20279;20280;20281;20282;20283;20284;20285;20286;20287;20288;20289;20290;20291;20292;22901;22902;22903;22904;22905;22906;22907;22908;22909;22910;22911;22912;22913;22914;22915;33752;33753;33754;33755;33756;33757;34157;34158;34159;34160;34161;34162;34163;34164;34165;34166;35053;35054;35055;35056;35057;35058;35059;35060;36370;36371;39438;39439;39440;39441;39442;39443;39444;39445;42521;42522;42523;42524;42525;42526;42527;42528;42529;42530;42531;45496;45497;45498;45499;45500;45501;45502;45503;45504;45505;45506;45507 2918;20399;20400;20401;20402;20403;20404;20405;20406;20407;20408;20409;20410;20411;20412;20413;20414;20415;20416;20417;20418;23036;23037;23038;23039;23040;23041;23042;23043;23044;23045;23046;23047;23048;23049;23050;33953;33954;33955;33956;33957;33958;34363;34364;34365;34366;34367;34368;34369;34370;34371;34372;35261;35262;35263;35264;35265;35266;35267;35268;36583;36584;39674;39675;39676;39677;39678;39679;39680;39681;42816;42817;42818;42819;42820;42821;42822;42823;42824;42825;42826;45810;45811;45812;45813;45814;45815;45816;45817;45818;45819;45820;45821 2918;20418;23036;23045;33957;34366;35263;35268;36583;39679;42823;45817;45821 230 61 -1
YGL031C YGL031C 13 2 2 YGL031C pep chromosome:R64-1-1:VII:437467:437934:-1 gene:YGL031C transcript:YGL031C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL24A description:Ribosomal 60S subunit protein L24A; not essential for translation but may 1 13 2 2 9 8 9 10 11 11 1 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 41.9 7.7 7.7 17.613 155 155 0 5.7644 40 36.1 41.3 41.9 41.9 41.9 632840000 124630000 84648000 163390000 90704000 55819000 113640000 0 195030000 108870000 190300000 148390000 107790000 1 3 3 3 4 2 16 470 739;740;3053;3360;3806;3807;5068;7152;8516;8517;8606;9262;10924 False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;True 780;781;3162;3482;3957;3958;5278;7470;7471;8940;8941;9030;9716;11446 3068;3069;3070;3071;3072;3073;3074;3075;3076;3077;3078;3079;3080;3081;3082;3083;11548;11549;11550;12726;12727;12728;12729;12730;12731;14475;14476;14477;14478;14479;14480;14481;14482;14483;14484;19348;19349;19350;19351;19352;19353;19354;19355;27347;27348;27349;27350;27351;27352;27353;27354;27355;27356;27357;27358;27359;32473;32474;32475;32476;32477;32478;32479;32785;32786;32787;32788;35502;35503;41978;41979;41980 3079;3080;3081;3082;3083;3084;3085;3086;3087;3088;3089;3090;3091;3092;3093;3094;11629;11630;11631;12812;12813;12814;12815;12816;12817;14574;14575;14576;14577;14578;14579;14580;14581;14582;14583;19471;19472;19473;19474;19475;19476;19477;19478;27515;27516;27517;27518;27519;27520;27521;27522;27523;27524;27525;27526;27527;27528;32669;32670;32671;32672;32673;32674;32675;32982;32983;32984;32985;35710;35711;42242;42243;42244 3082;3091;11630;12815;14576;14580;19471;27519;32674;32675;32982;35710;42243 231 1 -1
YGL037C YGL037C 3 3 3 YGL037C pep chromosome:R64-1-1:VII:427297:427947:-1 gene:YGL037C transcript:YGL037C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PNC1 description:Nicotinamidase that converts nicotinamide to nicotinic acid; part of the NAD 1 3 3 3 1 1 1 2 2 3 1 1 1 2 2 3 1 1 1 2 2 3 24.5 24.5 24.5 24.993 216 216 0 10.437 5.6 9.3 9.3 14.8 14.8 24.5 114620000 4893400 5171100 49563000 9974800 6256500 38764000 0 0 0 21126000 22381000 36463000 1 1 1 2 2 3 10 471 852;2874;10661 True;True;True 895;2975;11171 3541;3542;3543;3544;10910;40778;40779;40780;40781;40782 3554;3555;3556;3557;10981;41021;41022;41023;41024;41025 3554;10981;41023 -1
YGL039W YGL039W 1 1 1 YGL039W pep chromosome:R64-1-1:VII:423961:425007:1 gene:YGL039W transcript:YGL039W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Aldehyde reductase; reduces aliphatic aldehyde substrates using NADH as cofactor; shown to red 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 4.3 4.3 4.3 38.259 348 348 0 3.9007 0 4.3 4.3 4.3 0 4.3 19259000 0 3623100 7463600 3459600 0 4713000 0 0 0 0 0 4713000 0 1 1 1 0 1 4 472 3790 True 3939 14399;14400;14401;14402 14498;14499;14500;14501 14499 -1
YGL043W YGL043W 12 12 12 YGL043W pep chromosome:R64-1-1:VII:417483:418412:1 gene:YGL043W transcript:YGL043W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DST1 description:General transcription elongation factor TFIIS; enables RNA polymerase II to r 1 12 12 12 5 9 3 6 4 5 5 9 3 6 4 5 5 9 3 6 4 5 42.4 42.4 42.4 34.843 309 309 0 81.017 22.7 33 16.8 28.5 18.8 23.3 345120000 80295000 65490000 83205000 57754000 19061000 39320000 91996000 103470000 62872000 106360000 85414000 67004000 5 9 3 6 4 5 32 473 584;1262;2065;3765;4193;7627;7864;8310;9370;11049;11381;11551 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 616;1313;2142;3914;4365;8008;8264;8727;9830;11576;11918;12094 2528;2529;5072;5073;5074;7888;14325;14326;14327;14328;14329;14330;15953;15954;15955;29260;30194;31742;31743;31744;31745;31746;35946;35947;35948;35949;35950;42511;43931;44607;44608;44609 2535;2536;5100;5101;5102;7930;14423;14424;14425;14426;14427;14428;16062;16063;16064;29443;30382;31938;31939;31940;31941;31942;36156;36157;36158;36159;36160;42806;44230;44913;44914;44915 2535;5100;7930;14423;16064;29443;30382;31942;36156;42806;44230;44914 -1
YGL048C YGL048C 13 13 13 YGL048C pep chromosome:R64-1-1:VII:410069:411286:-1 gene:YGL048C transcript:YGL048C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPT6 description:ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome; one of six ATPa 1 13 13 13 7 9 7 6 5 6 7 9 7 6 5 6 7 9 7 6 5 6 43.2 43.2 43.2 45.271 405 405 0 94.99 27.4 33.1 25.9 24.4 17.8 24.2 365180000 63120000 50094000 133230000 36860000 21142000 60739000 69562000 82256000 93433000 88201000 84519000 55661000 7 10 7 6 5 6 41 474 1690;1728;2056;2332;3373;5624;6274;7808;9894;10427;10921;11496;12083 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1755;1795;2133;2416;3497;5861;6533;8207;10380;10930;10931;11443;12037;12646 6689;6690;6860;7850;7851;7852;7853;8878;12786;12787;21593;24008;24009;24010;24011;24012;24013;30010;30011;30012;30013;37986;37987;37988;37989;37990;39960;39961;39962;39963;39964;39965;41973;41974;44409;44410;44411;44412;44413;46792;46793 6729;6730;6900;7892;7893;7894;7895;8923;12873;12874;21720;24153;24154;24155;24156;24157;24158;30197;30198;30199;30200;38217;38218;38219;38220;38221;40197;40198;40199;40200;40201;40202;42237;42238;44715;44716;44717;44718;44719;47117;47118 6730;6900;7895;8923;12874;21720;24155;30197;38218;40202;42238;44719;47118 232 272 -1
YGL049C YGL049C 12 9 9 YGL049C pep chromosome:R64-1-1:VII:406860:409604:-1 gene:YGL049C transcript:YGL049C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TIF4632 description:Translation initiation factor eIF4G; subunit of the mRNA cap-binding prot 1 12 9 9 7 5 8 6 4 6 4 3 5 3 2 4 4 3 5 3 2 4 16.2 13.7 13.7 103.9 914 914 0 14.139 6.9 7.2 10.8 7.5 4.8 8.6 180460000 24907000 13341000 72788000 17005000 11712000 40710000 39726000 24669000 32723000 36739000 49059000 35861000 4 3 5 3 2 4 21 475 23;734;1581;4809;5359;5737;6890;7743;10227;10496;12328;12329 True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;False;False 25;775;1644;5010;5586;5978;7178;8137;10723;11003;12901;12902 89;90;3054;3055;6278;6279;18282;20518;20519;20520;20521;21976;21977;26334;26335;26336;26337;26338;26339;26340;26341;29771;39227;39228;39229;39230;39231;39232;40220;47691;47692;47693;47694;47695;47696;47697;47698;47699;47700 89;90;3065;3066;6314;6315;18399;20645;20646;20647;20648;22106;22107;26492;26493;26494;26495;26496;26497;26498;26499;29956;39463;39464;39465;39466;39467;39468;40461;48023;48024;48025;48026;48027;48028;48029;48030;48031;48032 89;3065;6314;18399;20648;22106;26494;29956;39467;40461;48027;48032 -1
YGL050W YGL050W 2 2 2 YGL050W pep chromosome:R64-1-1:VII:405776:406597:1 gene:YGL050W transcript:YGL050W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TYW3 description:tRNA methyltransferase required for synthesis of wybutosine; a modified guano 1 2 2 2 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 9.2 9.2 9.2 30.806 273 273 0 16.225 0 9.2 0 0 0 0 1397800 0 1397800 0 0 0 0 0 3032000 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 476 355;11110 True;True 374;11641 1578;42786 1581;43081 1581;43081 -1
YGL054C YGL054C 1 1 1 YGL054C pep chromosome:R64-1-1:VII:400871:401287:-1 gene:YGL054C transcript:YGL054C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERV14 description:COPII-coated vesicle protein; involved in vesicle formation and incorporati 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 8 8 8 15.93 138 138 0.0037965 2.2871 8 0 0 0 0 0 2132600 2132600 0 0 0 0 0 2785500 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 477 11446 True 11983 44190 44495 44495 -1
YGL055W YGL055W 9 9 9 YGL055W pep chromosome:R64-1-1:VII:398628:400160:1 gene:YGL055W transcript:YGL055W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OLE1 description:Delta(9) fatty acid desaturase; required for monounsaturated fatty acid synth 1 9 9 9 5 5 4 6 6 3 5 5 4 6 6 3 5 5 4 6 6 3 24.1 24.1 24.1 58.402 510 510 0 35.035 16.1 17.5 14.3 17.6 19.8 9 422400000 41099000 53549000 184030000 52796000 36672000 54254000 64764000 119280000 83629000 115960000 89837000 85434000 4 5 6 7 8 3 33 478 194;2641;2642;3179;3674;4479;4830;6164;12308 True;True;True;True;True;True;True;True;True 204;2735;2736;3292;3820;4670;4671;5032;6419;12881 851;9959;9960;9961;9962;12012;12013;12014;12015;12016;12017;12018;13994;13995;17056;17057;17058;17059;17060;17061;17062;18364;18365;18366;23646;23647;23648;23649;23650;23651;23652;23653;47619;47620;47621 853;10010;10011;10012;10013;10014;12097;12098;12099;12100;12101;12102;12103;14089;14090;17170;17171;17172;17173;17174;17175;17176;18481;18482;18483;23787;23788;23789;23790;23791;23792;23793;23794;47951;47952;47953 853;10013;10014;12102;14090;17175;18482;23789;47951 233 411 -1
YGL056C YGL056C 1 1 1 YGL056C pep chromosome:R64-1-1:VII:396035:397618:-1 gene:YGL056C transcript:YGL056C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SDS23 description:Protein involved in cell separation during budding; one of two S. cerevisia 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3 3 3 58.097 527 527 0 15.025 0 3 0 0 0 0 4317600 0 4317600 0 0 0 0 0 9365600 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 479 5958 True 6209 22865 23000 23000 -1
YGL065C YGL065C 3 3 3 YGL065C pep chromosome:R64-1-1:VII:379760:381271:-1 gene:YGL065C transcript:YGL065C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ALG2 description:Mannosyltransferase in the N-linked glycosylation pathway; catalyzes two con 1 3 3 3 0 1 0 2 2 0 0 1 0 2 2 0 0 1 0 2 2 0 9.5 9.5 9.5 58.046 503 503 0 29.747 0 2.8 0 6.8 6.8 0 17986000 0 2111900 0 10402000 5471600 0 0 0 0 21185000 18306000 0 0 1 0 2 2 0 5 480 151;5826;10168 True;True;True 158;6069;10664 663;22311;22312;39023;39024 664;22442;22443;39258;39259 664;22442;39259 -1
YGL066W YGL066W 1 1 1 YGL066W pep chromosome:R64-1-1:VII:377609:379582:1 gene:YGL066W transcript:YGL066W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SGF73 description:Subunit of DUBm module of SAGA and SLIK; has roles in anchoring deubiquitina 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 2.3 2.3 2.3 72.877 657 657 0.00081699 2.9918 0 0 0 2.3 0 0 778230 0 0 0 778230 0 0 0 0 0 1600900 0 0 0 0 0 1 0 0 1 481 8918 True 9354 33988 34190 34190 -1
YGL068W YGL068W 5 5 5 YGL068W pep chromosome:R64-1-1:VII:375087:375671:1 gene:YGL068W transcript:YGL068W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MNP1 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; has similarity to E. co 1 5 5 5 2 2 4 1 2 4 2 2 4 1 2 4 2 2 4 1 2 4 30.9 30.9 30.9 20.65 194 194 0 13.324 12.4 12.4 20.1 6.7 17.5 25.3 275300000 15629000 5086400 120570000 3578500 14843000 115590000 52044000 22992000 93449000 0 33403000 65273000 2 2 3 1 3 4 15 482 3145;4838;5655;10307;11267 True;True;True;True;True 3256;5040;5893;10807;11804 11903;11904;11905;18380;18381;21707;21708;39541;39542;43401;43402;43403;43404;43405;43406;43407 11987;11988;11989;18497;18498;21836;21837;39777;39778;43699;43700;43701;43702;43703;43704;43705 11988;18497;21836;39778;43705 -1
YGL076C;YPL198W YGL076C;YPL198W 24;23 24;23 24;23 YGL076C pep chromosome:R64-1-1:VII:364335:365996:-1 gene:YGL076C transcript:YGL076C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL7A description:Ribosomal 60S subunit protein L7A; required for processing of 27SA3 pre-rRN 2 24 24 24 22 19 18 18 14 19 22 19 18 18 14 19 22 19 18 18 14 19 75 75 75 27.638 244 244;244 0 182.68 75 73.4 73.8 70.5 66.8 64.8 18888000000 2786200000 2005900000 6576800000 1755900000 991440000 4772100000 3274900000 3975000000 3504400000 4235900000 3893000000 4644900000 27 24 22 20 17 24 134 483 42;866;2093;2379;3032;3520;4379;4380;4471;4472;5380;5944;6688;6689;7306;8078;8079;8354;8355;8463;9904;11419;11420;11992 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 44;909;2172;2463;3140;3655;4558;4559;4662;4663;5608;6195;6968;6969;7670;8484;8485;8771;8772;8885;10391;11956;11957;12555 174;175;176;177;178;179;180;181;182;183;184;3602;3603;3604;3605;3606;3607;7987;7988;7989;9014;9015;9016;9017;9018;11445;11446;11447;11448;11449;11450;13395;13396;13397;13398;13399;13400;13401;13402;13403;16621;16622;16623;16624;16625;16626;16627;16628;16629;16630;16631;16632;16633;16634;17027;17028;17029;17030;17031;17032;17033;17034;20615;20616;20617;20618;20619;20620;22826;22827;22828;22829;22830;22831;22832;22833;22834;25523;25524;25525;25526;25527;25528;25529;28029;28030;28031;28032;28033;28034;28035;28036;28037;30963;30964;30965;30966;30967;30968;30969;31898;31899;31900;31901;31902;31903;31904;31905;32271;32272;32273;38027;38028;38029;38030;38031;38032;44102;44103;44104;44105;44106;44107;44108;44109;46393;46394;46395;46396;46397;46398;46399;46400;46401;46402 174;175;176;177;178;179;180;181;182;183;184;3615;3616;3617;3618;3619;3620;8029;8030;8031;9060;9061;9062;9063;9064;11524;11525;11526;11527;11528;11529;13484;13485;13486;13487;13488;13489;13490;13491;13492;16731;16732;16733;16734;16735;16736;16737;16738;16739;16740;16741;16742;16743;16744;17141;17142;17143;17144;17145;17146;17147;17148;20742;20743;20744;20745;20746;20747;22961;22962;22963;22964;22965;22966;22967;22968;22969;25677;25678;25679;25680;25681;25682;25683;28203;28204;28205;28206;28207;28208;28209;28210;28211;31155;31156;31157;31158;31159;31160;31161;32094;32095;32096;32097;32098;32099;32100;32101;32467;32468;32469;38258;38259;38260;38261;38262;38263;44401;44402;44403;44404;44405;44406;44407;44408;46713;46714;46715;46716;46717;46718;46719;46720;46721;46722 177;3615;8030;9064;11524;13486;16732;16740;17146;17147;20746;22963;25677;25682;28209;31155;31161;32098;32101;32468;38262;44402;44404;46716 -1;-1
YGL078C YGL078C 39 39 39 YGL078C pep chromosome:R64-1-1:VII:360288:361859:-1 gene:YGL078C transcript:YGL078C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DBP3 description:RNA-Dependent ATPase, member of DExD/H-box family; involved in cleavage of s 1 39 39 39 27 27 27 24 26 17 27 27 27 24 26 17 27 27 27 24 26 17 67.9 67.9 67.9 58.826 523 523 0 302.42 62.3 56 53.3 50.1 53.2 43.6 8832300000 1846500000 1817900000 2270300000 1075200000 695620000 1126800000 2344500000 3006500000 1474300000 2092300000 2313000000 1455100000 35 41 32 36 33 23 200 484 260;261;1481;1505;1697;1698;1800;1801;1802;2540;2900;2901;3044;3104;3583;4751;5149;5203;5316;5410;6137;6138;6167;7164;7678;8395;9401;9526;10033;10034;10261;10510;10705;11028;11254;11255;11505;11625;12196 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 272;273;1541;1565;1762;1763;1867;1868;1869;1870;2629;3003;3004;3153;3213;3725;4950;5361;5421;5539;5639;6390;6391;6392;6422;7490;8062;8814;8815;9865;9994;10523;10524;10525;10759;11017;11216;11555;11791;11792;12047;12174;12765 1142;1143;1144;1145;1146;1147;1148;1149;1150;5905;5906;5987;5988;5989;5990;6708;6709;6710;6711;6712;6713;6714;6715;7072;7073;7074;7075;7076;7077;7078;7079;7080;7081;7082;7083;7084;7085;7086;7087;7088;7089;7090;7091;7092;7093;9566;11013;11014;11015;11016;11017;11018;11019;11020;11021;11022;11511;11512;11513;11514;11515;11516;11734;11735;11736;13670;13671;13672;13673;13674;13675;13676;13677;18087;18088;18089;18090;18091;18092;18093;18094;18095;19673;19674;19907;19908;19909;19910;19911;19912;19913;19914;19915;20332;20333;20334;20335;20769;23563;23564;23565;23566;23567;23568;23569;23570;23571;23572;23573;23574;23575;23576;23577;23578;23579;23580;23581;23582;23583;23584;23585;23656;27430;29422;29423;29424;29425;29426;32038;32039;32040;32041;32042;32043;36064;36065;36066;36067;36068;36530;36531;36532;36533;38447;38448;38449;38450;38451;38452;38453;38454;38455;38456;38457;38458;39385;40256;40257;40258;40259;41027;41028;41029;41030;41031;41032;41033;41034;41035;41036;41037;41038;41039;41040;42443;43358;43359;43360;43361;44441;44442;44443;44444;44445;44446;44447;44448;44923;44924;44925;44926;47199;47200;47201;47202;47203;47204;47205;47206 1144;1145;1146;1147;1148;1149;1150;1151;1152;5940;5941;6022;6023;6024;6025;6748;6749;6750;6751;6752;6753;6754;6755;7112;7113;7114;7115;7116;7117;7118;7119;7120;7121;7122;7123;7124;7125;7126;7127;7128;7129;7130;7131;7132;7133;9614;11089;11090;11091;11092;11093;11094;11095;11096;11097;11098;11590;11591;11592;11593;11594;11595;11816;11817;11818;13759;13760;13761;13762;13763;13764;13765;13766;18203;18204;18205;18206;18207;18208;18209;18210;18211;18212;19796;19797;20031;20032;20033;20034;20035;20036;20037;20038;20039;20458;20459;20460;20461;20896;23704;23705;23706;23707;23708;23709;23710;23711;23712;23713;23714;23715;23716;23717;23718;23719;23720;23721;23722;23723;23724;23725;23726;23797;27599;29606;29607;29608;29609;29610;32234;32235;32236;32237;32238;32239;36275;36276;36277;36278;36279;36746;36747;36748;36749;38679;38680;38681;38682;38683;38684;38685;38686;38687;38688;38689;38690;39621;40497;40498;40499;40500;41274;41275;41276;41277;41278;41279;41280;41281;41282;41283;41284;41285;41286;41287;41288;42738;43656;43657;43658;43659;44747;44748;44749;44750;44751;44752;44753;44754;45231;45232;45233;45234;47528;47529;47530;47531;47532;47533;47534;47535 1148;1150;5940;6025;6748;6755;7115;7127;7133;9614;11091;11097;11591;11816;13765;18212;19796;20037;20459;20896;23704;23721;23797;27599;29609;32237;36279;36748;38686;38690;39621;40500;41286;42738;43656;43658;44753;45231;47532 234;235;236;237 175;267;292;309 -1
YGL082W YGL082W 9 9 9 YGL082W pep chromosome:R64-1-1:VII:355827:356972:1 gene:YGL082W transcript:YGL082W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; predicted prenylation/proteolysis target of Afc1p and Rc 1 9 9 9 4 7 5 2 3 1 4 7 5 2 3 1 4 7 5 2 3 1 28.3 28.3 28.3 43.321 381 381 0 90.107 11 20.7 17.8 5.2 10.8 2.6 138570000 25410000 31213000 58395000 8421900 7693900 7437700 26405000 61689000 24191000 34532000 31252000 0 4 6 5 2 3 1 21 485 64;1211;6517;7060;7757;7981;8731;9814;11339 True;True;True;True;True;True;True;True;True 66;1262;6793;7363;8153;8385;9158;10295;11876 263;4898;4899;4900;24887;27010;29830;30615;30616;30617;30618;30619;33303;33304;37651;37652;37653;43724;43725;43726;43727;43728 264;4924;4925;4926;25037;27172;30017;30805;30806;30807;30808;30809;33503;33504;37880;37881;37882;44023;44024;44025;44026;44027 264;4924;25037;27172;30017;30809;33503;37880;44024 -1
YGL084C YGL084C 1 1 1 YGL084C pep chromosome:R64-1-1:VII:350616:352298:-1 gene:YGL084C transcript:YGL084C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GUP1 description:Plasma membrane protein involved in remodeling GPI anchors; member of the MB 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 3.2 3.2 3.2 65.339 560 560 0 12.302 3.2 0 3.2 3.2 3.2 0 27494000 5664900 0 12681000 5280200 3868100 0 0 0 0 0 12789000 0 1 0 1 1 1 0 4 486 9256 True 9710 35490;35491;35492;35493 35698;35699;35700;35701 35700 -1
YGL097W YGL097W 15 15 15 YGL097W pep chromosome:R64-1-1:VII:321782:323230:1 gene:YGL097W transcript:YGL097W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SRM1 description:Nucleotide exchange factor for Gsp1p; localizes to the nucleus, required for 1 15 15 15 9 9 6 8 6 7 9 9 6 8 6 7 9 9 6 8 6 7 36.7 36.7 36.7 53.013 482 482 0 37.545 28.8 21.8 19.9 24.3 17 20.1 663220000 154270000 84526000 136080000 121290000 38966000 128080000 166110000 162960000 145730000 205000000 126420000 165240000 10 10 7 10 7 7 51 487 1046;4223;5512;5630;5631;6098;6419;6420;6611;6933;8545;10302;10509;10674;12040 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1094;4396;5748;5867;5868;6349;6685;6686;6888;7221;8969;10802;11016;11184;12603 4360;16034;21215;21216;21217;21616;21617;21618;21619;21620;21621;21622;23415;23416;24506;24507;24508;24509;24510;25259;25260;25261;25262;25263;26518;26519;26520;26521;26522;26523;26524;26525;32579;32580;32581;32582;32583;39521;39522;39523;39524;39525;40253;40254;40255;40827;40828;46638;46639;46640 4383;16143;21342;21343;21344;21744;21745;21746;21747;21748;21749;21750;23552;23553;24654;24655;24656;24657;24658;25413;25414;25415;25416;25417;26678;26679;26680;26681;26682;26683;26684;26685;32775;32776;32777;32778;32779;39757;39758;39759;39760;39761;40494;40495;40496;41070;41071;46959;46960;46961;46962 4383;16143;21343;21744;21750;23553;24654;24658;25414;26684;32779;39760;40494;41070;46962 -1
YGL099W YGL099W 12 12 12 YGL099W pep chromosome:R64-1-1:VII:314631:316553:1 gene:YGL099W transcript:YGL099W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LSG1 description:Putative GTPase involved in 60S ribosomal subunit biogenesis; required for th 1 12 12 12 7 7 6 8 6 6 7 7 6 8 6 6 7 7 6 8 6 6 25.2 25.2 25.2 72.727 640 640 0 48.854 15.2 16.6 13 19.4 14.8 14.8 460940000 83873000 53794000 150630000 60009000 22842000 89789000 96607000 108060000 89093000 110390000 94726000 104880000 7 7 6 9 6 6 41 488 1313;1314;2691;3000;4367;8055;8796;9174;9529;9643;9826;12064 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1368;1369;2785;3107;4546;8460;9228;9624;9997;10115;10307;12627 5274;5275;5276;10157;10158;11337;11338;11339;16577;16578;30872;30873;30874;30875;30876;30877;33567;35140;36536;36537;36538;36539;36540;36541;36956;36957;36958;36959;36960;36961;37706;37707;37708;37709;46725;46726;46727;46728;46729;46730;46731 5305;5306;5307;10211;10212;11416;11417;11418;16687;16688;31064;31065;31066;31067;31068;31069;33767;35348;36752;36753;36754;36755;36756;36757;37175;37176;37177;37178;37179;37180;37935;37936;37937;37938;47050;47051;47052;47053;47054;47055;47056 5305;5307;10211;11416;16687;31067;33767;35348;36756;37177;37938;47053 -1
YGL100W YGL100W 1 1 1 YGL100W pep chromosome:R64-1-1:VII:313234:314283:1 gene:YGL100W transcript:YGL100W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEH1 description:Subunit of the Nup84 nuclear pore and SEACAT subcomplexes; involved in nucleo 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 3.2 3.2 3.2 39.122 349 349 0.0008547 3.4656 0 0 3.2 0 0 0 7768200 0 0 7768200 0 0 0 0 0 4577400 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 489 6973 True 7262 26670 26830 26830 -1
YGL103W YGL103W 10 10 10 YGL103W pep chromosome:R64-1-1:VII:310967:311927:1 gene:YGL103W transcript:YGL103W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL28 description:Ribosomal 60S subunit protein L28; homologous to mammalian ribosomal protein 1 10 10 10 7 6 8 8 6 7 7 6 8 8 6 7 7 6 8 8 6 7 52.3 52.3 52.3 16.721 149 149 0 38.574 35.6 28.9 45.6 42.3 28.9 35.6 6693900000 984560000 679400000 2305400000 649920000 500710000 1573900000 1235700000 1630900000 1351400000 1531000000 1577300000 1265600000 11 10 12 11 12 12 68 490 36;1393;2009;3185;3279;4448;4508;6970;8724;12034 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 38;1451;2085;3298;3398;4636;4637;4701;7259;9151;12597 146;5574;7667;7668;7669;7670;7671;7672;7673;7674;7675;12028;12428;12429;12430;12431;12432;12433;12434;16923;16924;16925;16926;16927;16928;16929;16930;16931;16932;16933;16934;16935;16936;16937;16938;16939;16940;16941;17165;17166;17167;17168;17169;17170;26649;26650;26651;26652;26653;26654;33276;33277;33278;33279;33280;33281;33282;33283;33284;33285;33286;33287;46619;46620;46621;46622;46623;46624;46625 146;5609;7709;7710;7711;7712;7713;7714;7715;7716;7717;12113;12514;12515;12516;12517;12518;12519;12520;17036;17037;17038;17039;17040;17041;17042;17043;17044;17045;17046;17047;17048;17049;17050;17051;17052;17053;17054;17279;17280;17281;17282;17283;17284;26809;26810;26811;26812;26813;26814;33475;33476;33477;33478;33479;33480;33481;33482;33483;33484;33485;33486;46940;46941;46942;46943;46944;46945;46946 146;5609;7716;12113;12517;17049;17283;26813;33486;46940 238 45 -1
YGL105W YGL105W 27 27 27 YGL105W pep chromosome:R64-1-1:VII:307437:308567:1 gene:YGL105W transcript:YGL105W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARC1 description:Protein that binds tRNA and methionyl- and glutamyl-tRNA synthetases; involve 1 27 27 27 18 16 18 22 16 20 18 16 18 22 16 20 18 16 18 22 16 20 80.3 80.3 80.3 42.083 376 376 0 219.27 63.8 47.6 51.9 60.9 44.9 53.7 9319400000 1149600000 1501900000 3057700000 1011000000 516430000 2082800000 1497900000 2074800000 2075000000 2001700000 1622700000 2274400000 29 29 30 35 27 31 181 491 217;347;656;657;661;1360;1968;2219;2220;3078;3523;3647;4873;4962;5143;5224;6794;8794;8795;8970;9669;9758;10823;10954;11793;12238;12374 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 227;228;366;694;695;699;1418;2043;2301;2302;3187;3658;3659;3792;5077;5168;5355;5442;7077;9226;9227;9411;10142;10234;11343;11478;11479;12352;12808;12948;12949 932;933;934;935;936;937;938;939;940;941;942;943;944;945;946;947;948;949;950;1542;1543;1544;1545;1546;1547;1548;1549;1550;1551;1552;1553;2756;2757;2758;2759;2760;2761;2762;2771;2772;2773;2774;2775;5466;7543;7544;7545;7546;7547;7548;7549;8470;8471;8472;8473;8474;11644;11645;13412;13413;13414;13415;13416;13417;13418;13419;13420;13421;13422;13423;13897;13898;13899;13900;13901;18553;18875;18876;18877;18878;18879;19632;19633;19634;19635;19983;19984;19985;25960;25961;25962;25963;25964;25965;25966;25967;25968;33551;33552;33553;33554;33555;33556;33557;33558;33559;33560;33561;33562;33563;33564;33565;33566;34195;34196;34197;34198;34199;34200;34201;34202;34203;34204;37059;37060;37061;37062;37063;37064;37065;37066;37387;37388;37389;41652;41653;41654;41655;41656;42151;42152;42153;42154;42155;42156;42157;42158;42159;42160;42161;42162;42163;42164;45678;47346;47347;47348;47851;47852;47853;47854;47855;47856;47857;47858;47859;47860;47861;47862;47863;47864;47865;47866;47867;47868;47869;47870;47871 934;935;936;937;938;939;940;941;942;943;944;945;946;947;948;949;950;951;952;1545;1546;1547;1548;1549;1550;1551;1552;1553;1554;1555;1556;2765;2766;2767;2768;2769;2770;2771;2780;2781;2782;2783;2784;5501;7585;7586;7587;7588;7589;7590;7591;8513;8514;8515;8516;8517;11726;11727;13501;13502;13503;13504;13505;13506;13507;13508;13509;13510;13511;13512;13988;13989;13990;13991;13992;18671;18997;18998;18999;19000;19001;19755;19756;19757;19758;20107;20108;20109;26117;26118;26119;26120;26121;26122;26123;26124;26125;33751;33752;33753;33754;33755;33756;33757;33758;33759;33760;33761;33762;33763;33764;33765;33766;34401;34402;34403;34404;34405;34406;34407;34408;34409;34410;37278;37279;37280;37281;37282;37283;37284;37285;37609;37610;37611;41915;41916;41917;41918;41919;42443;42444;42445;42446;42447;42448;42449;42450;42451;42452;42453;42454;42455;42456;42457;42458;42459;45993;47675;47676;47677;48183;48184;48185;48186;48187;48188;48189;48190;48191;48192;48193;48194;48195;48196;48197;48198;48199;48200;48201;48202;48203 937;1554;2765;2770;2783;5501;7588;8513;8517;11726;13511;13990;18671;19001;19757;20107;26120;33758;33765;34402;37282;37609;41915;42453;45993;47677;48200 239;240;241 257;273;317 -1
YGL110C YGL110C 3 3 3 YGL110C pep chromosome:R64-1-1:VII:301537:303411:-1 gene:YGL110C transcript:YGL110C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CUE3 description:Protein of unknown function; has a CUE domain that binds ubiquitin, which ma 1 3 3 3 2 2 0 1 0 0 2 2 0 1 0 0 2 2 0 1 0 0 6.7 6.7 6.7 72.042 624 624 0 7.0402 5 4.5 0 2.2 0 0 13018000 5045600 4975500 0 2997200 0 0 6590400 0 0 0 0 0 2 2 0 1 0 0 5 492 1436;4172;11089 True;True;True 1496;4342;11617 5752;5753;15872;42695;42696 5787;5788;15981;42990;42991 5788;15981;42991 -1
YGL111W YGL111W 16 16 16 YGL111W pep chromosome:R64-1-1:VII:299978:301369:1 gene:YGL111W transcript:YGL111W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NSA1 description:Constituent of 66S pre-ribosomal particles; involved in 60S ribosomal subunit 1 16 16 16 4 7 6 4 4 5 4 7 6 4 4 5 4 7 6 4 4 5 49.7 49.7 49.7 51.906 463 463 0 46.122 11.2 20.3 21.4 14.3 11.7 16.4 283480000 18776000 36066000 123830000 41139000 8567600 55102000 54932000 58747000 64238000 51331000 45372000 69163000 4 7 6 4 4 5 30 493 1444;2060;2429;3076;3605;5261;5403;6316;6839;6857;7859;7952;9313;11432;11560;12144 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1504;2137;2514;3185;3748;5482;5631;6577;7126;7144;8259;8355;9769;11969;12104;12708 5776;5777;5778;7866;9224;11641;13768;20102;20721;20722;20723;20724;20725;20726;24155;26147;26214;26215;26216;26217;26218;30185;30517;35691;35692;44151;44152;44654;44655;47024 5811;5812;5813;7908;9271;11723;13859;20226;20848;20849;20850;20851;20852;20853;24303;26304;26372;26373;26374;26375;26376;30373;30707;35899;35900;44455;44456;44960;44961;47351 5812;7908;9271;11723;13859;20226;20853;24303;26304;26374;30373;30707;35900;44455;44960;47351 -1
YGL112C YGL112C 3 3 3 YGL112C pep chromosome:R64-1-1:VII:298178:299728:-1 gene:YGL112C transcript:YGL112C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TAF6 description:Subunit (60 kDa) of TFIID and SAGA complexes; involved in transcription init 1 3 3 3 0 1 3 1 1 0 0 1 3 1 1 0 0 1 3 1 1 0 7 7 7 57.901 516 516 0 27.363 0 3.5 7 3.5 3.5 0 28688000 0 2343600 22960000 2089300 1295400 0 0 0 13529000 0 0 0 0 1 3 1 1 0 6 494 1878;4293;11293 True;True;True 1949;4469;11830 7307;16315;43556;43557;43558;43559 7348;16424;43855;43856;43857;43858 7348;16424;43855 -1
YGL119W YGL119W 1 1 1 YGL119W pep chromosome:R64-1-1:VII:284442:285947:1 gene:YGL119W transcript:YGL119W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:COQ8 description:ATPase required for ubiquinone biosynthesis and respiratory growth; maintains 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 4 4 4 56.741 501 501 0.0015723 2.6228 0 0 4 0 0 4 8837200 0 0 6210900 0 0 2626300 0 0 0 0 0 2626300 0 0 1 0 0 1 2 495 5104 True 5314 19502;19503 19625;19626 19626 -1
YGL120C;YNR011C YGL120C 40;1 40;1 40;1 YGL120C pep chromosome:R64-1-1:VII:281634:283937:-1 gene:YGL120C transcript:YGL120C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRP43 description:RNA helicase in the DEAH-box family; functions in both RNA polymerase I and 2 40 40 40 31 21 23 25 24 28 31 21 23 25 24 28 31 21 23 25 24 28 62.2 62.2 62.2 87.561 767 767;876 0 265.58 54 43.3 37 43.9 45.4 48.9 4103100000 963200000 305530000 1484000000 277810000 219700000 852840000 1013700000 687880000 987100000 674830000 605220000 868240000 38 24 32 28 32 37 191 496 442;464;1174;1357;1515;1557;1842;2646;3548;3549;3952;4587;4649;5194;5796;5817;7002;7010;7011;7542;8171;8619;8757;9310;9402;9403;10293;10650;10738;10767;10768;10786;10899;10933;11958;11967;12183;12207;12208;12277 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 468;469;491;1225;1415;1575;1620;1911;2740;3686;3687;4112;4783;4845;5410;5411;6038;6060;7291;7299;7300;7920;8582;9043;9186;9766;9866;9867;10792;10793;11158;11159;11252;11283;11284;11304;11420;11456;12521;12530;12750;12776;12777;12848 1932;1933;1934;1935;1936;2014;2015;2016;2017;2018;2019;2020;2021;2022;2023;2024;2025;4788;4789;4790;4791;5454;5455;5456;5457;6028;6029;6030;6031;6203;6204;6205;6206;7204;7205;7206;7207;7208;7209;9974;9975;9976;9977;9978;13528;13529;13530;13531;13532;15050;15051;15052;15053;17498;17499;17500;17501;17502;17503;17504;17505;17690;19869;19870;19871;22200;22201;22202;22285;22286;22287;22288;26756;26757;26776;26777;26778;26779;26780;26781;26782;26783;26784;26785;26786;26787;28955;31251;31252;31253;31254;31255;31256;31257;31258;32823;32824;32825;32826;32827;32828;32829;33420;33421;33422;33423;35673;35674;35675;36069;36070;36071;36072;36073;36074;36075;39504;39505;39506;39507;39508;39509;40730;40731;40732;40733;40734;40735;40736;40737;40738;40739;40740;40741;40742;40743;40744;40745;40746;40747;40748;40749;41261;41262;41263;41264;41265;41266;41267;41268;41269;41270;41417;41418;41419;41420;41421;41422;41423;41424;41425;41511;41512;41513;41897;42006;42007;42008;42009;46270;46304;46305;46306;46307;46308;46309;46310;46311;47143;47144;47145;47146;47235;47236;47237;47238;47239;47502;47503;47504;47505 1938;1939;1940;1941;1942;2020;2021;2022;2023;2024;2025;2026;2027;2028;2029;2030;2031;4814;4815;4816;4817;5489;5490;5491;5492;6064;6065;6066;6067;6239;6240;6241;6242;7244;7245;7246;7247;7248;7249;10027;10028;10029;10030;10031;13617;13618;13619;13620;13621;15156;15157;15158;15159;17613;17614;17615;17616;17617;17618;17619;17620;17805;19992;19993;19994;22330;22331;22332;22416;22417;22418;22419;26917;26918;26937;26938;26939;26940;26941;26942;26943;26944;26945;26946;26947;26948;29138;31446;31447;31448;31449;31450;31451;31452;31453;33020;33021;33022;33023;33024;33025;33026;33620;33621;33622;33623;35881;35882;35883;36280;36281;36282;36283;36284;36285;36286;39740;39741;39742;39743;39744;39745;40973;40974;40975;40976;40977;40978;40979;40980;40981;40982;40983;40984;40985;40986;40987;40988;40989;40990;40991;40992;41515;41516;41517;41518;41519;41520;41521;41522;41523;41524;41677;41678;41679;41680;41681;41682;41683;41684;41685;41774;41775;41776;42161;42270;42271;42272;42273;46587;46622;46623;46624;46625;46626;46627;46628;46629;46630;47470;47471;47472;47473;47474;47564;47565;47566;47567;47568;47833;47834;47835;47836 1938;2025;4815;5490;6067;6240;7249;10031;13617;13619;15157;17614;17805;19994;22331;22418;26917;26942;26946;29138;31452;33024;33622;35882;36280;36286;39741;40989;41519;41677;41684;41774;42161;42272;46587;46625;47471;47564;47568;47835 242;243;244;245;246;247 135;228;483;491;492;658 -1;-1
YGL121C YGL121C 2 2 2 YGL121C pep chromosome:R64-1-1:VII:280777:281157:-1 gene:YGL121C transcript:YGL121C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GPG1 description:Proposed gamma subunit of the heterotrimeric G protein; interacts with the r 1 2 2 2 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 21.4 21.4 21.4 14.922 126 126 0.00082713 3.1086 0 0 21.4 0 0 0 10991000 0 0 10991000 0 0 0 0 0 6476200 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 497 2078;9983 True;True 2156;10472 7938;38300 7980;38532 7980;38532 -1
YGL123W YGL123W 23 23 23 YGL123W pep chromosome:R64-1-1:VII:277617:278381:1 gene:YGL123W transcript:YGL123W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS2 description:Protein component of the small (40S) subunit; essential for control of transl 1 23 23 23 20 19 18 16 16 20 20 19 18 16 16 20 20 19 18 16 16 20 78.3 78.3 78.3 27.449 254 254 0 268.12 78.3 72.8 70.9 74 70.1 74.8 16562000000 2490900000 1913900000 5449300000 1871000000 745190000 4091400000 3701000000 3642900000 3646700000 3788100000 2737100000 3317900000 30 31 29 27 23 33 173 498 30;31;977;1033;1642;2034;2365;3300;3301;3449;3475;4761;4762;5205;6279;6740;6741;7908;8715;8716;9927;10313;10549 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 32;33;1023;1081;1705;1706;2111;2449;3420;3421;3577;3607;4960;4961;4962;5423;6538;7020;7021;8308;9142;9143;10415;10813;11057 105;106;107;108;109;110;111;112;113;114;115;116;117;118;119;120;121;122;123;124;125;126;127;128;129;130;131;132;4073;4074;4075;4076;4077;4078;4079;4080;4081;4082;4329;4330;6477;6478;6479;6480;6481;6482;6483;6484;6485;6486;6487;6488;7753;7754;7755;7756;8973;8974;8975;8976;12498;12499;12500;12501;12502;12503;12504;12505;12506;12507;12508;12509;12510;12511;12512;13083;13084;13220;13221;13222;13223;13224;13225;13226;13227;13228;13229;13230;18123;18124;18125;18126;18127;18128;18129;18130;18131;18132;18133;18134;18135;18136;18137;18138;18139;18140;18141;19919;19920;19921;19922;19923;19924;19925;19926;19927;19928;19929;19930;24024;24025;24026;24027;24028;24029;24030;24031;24032;24033;24034;25698;25699;25700;25701;25702;25703;25704;25705;25706;25707;25708;25709;25710;25711;25712;30321;30322;30323;30324;30325;30326;30327;30328;30329;30330;30331;33240;33241;33242;33243;33244;33245;33246;33247;33248;33249;33250;33251;38110;38111;38112;39572;39573;39574;40410 105;106;107;108;109;110;111;112;113;114;115;116;117;118;119;120;121;122;123;124;125;126;127;128;129;130;131;132;4089;4090;4091;4092;4093;4094;4095;4096;4097;4098;4351;4352;6513;6514;6515;6516;6517;6518;6519;6520;6521;6522;6523;6524;7795;7796;7797;7798;9019;9020;9021;9022;12584;12585;12586;12587;12588;12589;12590;12591;12592;12593;12594;12595;12596;12597;12598;13171;13172;13309;13310;13311;13312;13313;13314;13315;13316;13317;13318;13319;18240;18241;18242;18243;18244;18245;18246;18247;18248;18249;18250;18251;18252;18253;18254;18255;18256;18257;18258;20043;20044;20045;20046;20047;20048;20049;20050;20051;20052;20053;20054;24169;24170;24171;24172;24173;24174;24175;24176;24177;24178;24179;25852;25853;25854;25855;25856;25857;25858;25859;25860;25861;25862;25863;25864;25865;25866;30510;30511;30512;30513;30514;30515;30516;30517;30518;30519;30520;33439;33440;33441;33442;33443;33444;33445;33446;33447;33448;33449;33450;38341;38342;38343;39808;39809;39810;40651 118;126;4093;4352;6518;7795;9019;12586;12593;13171;13310;18247;18257;20044;24178;25852;25861;30512;33443;33445;38341;39810;40651 248 81 -1
YGL129C YGL129C 2 2 2 YGL129C pep chromosome:R64-1-1:VII:267723:269075:-1 gene:YGL129C transcript:YGL129C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSM23 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit; has similarity to mam 1 2 2 2 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 4 4 4 50.866 450 450 0.00082645 3.1022 2.4 0 0 1.6 0 0 3758100 2691200 0 0 1066900 0 0 3515200 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 2 499 2329;2717 True;True 2413;2811 8875;10245 8920;10299 8920;10299 -1
YPL220W;YGL135W YPL220W;YGL135W 18;18 18;18 18;18 YPL220W pep chromosome:R64-1-1:XVI:135790:136443:1 gene:YPL220W transcript:YPL220W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL1A description:Ribosomal 60S subunit protein L1A; N-terminally acetylated; homologous to ma 2 18 18 18 14 12 11 12 16 11 14 12 11 12 16 11 14 12 11 12 16 11 62.7 62.7 62.7 24.485 217 217;217 0 121 58.1 47.5 50.2 47.5 55.8 51.2 6243800000 1080500000 413220000 2522900000 420420000 437260000 1369500000 1557000000 825600000 1398100000 1098900000 1037000000 1244000000 18 18 18 19 26 20 119 500 241;242;1699;2545;2546;2620;4757;5439;6479;6480;7433;7998;8576;8746;8747;9618;9707;12185 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 252;253;1764;2634;2635;2714;4956;5673;6752;6753;6754;6755;7803;8403;9000;9174;9175;9176;10087;10088;10181;12753 1046;1047;1048;1049;1050;1051;1052;1053;1054;1055;1056;1057;1058;1059;1060;6716;6717;6718;6719;6720;6721;6722;6723;6724;6725;6726;9586;9587;9588;9589;9590;9591;9592;9896;18110;18111;20902;20903;20904;20905;20906;20907;20908;20909;20910;20911;20912;24751;24752;24753;24754;24755;24756;24757;24758;24759;24760;24761;24762;24763;24764;28521;28522;28523;28524;28525;28526;28527;28528;28529;28530;28531;28532;28533;28534;28535;28536;28537;28538;28539;28540;28541;28542;28543;30675;30676;30677;30678;30679;32698;33372;33373;33374;33375;33376;33377;33378;33379;33380;33381;33382;33383;33384;33385;33386;33387;33388;33389;33390;36841;36842;36843;36844;36845;37189;47155;47156;47157;47158;47159;47160;47161;47162;47163;47164;47165 1048;1049;1050;1051;1052;1053;1054;1055;1056;1057;1058;1059;1060;1061;1062;6756;6757;6758;6759;6760;6761;6762;6763;6764;6765;6766;9635;9636;9637;9638;9639;9640;9641;9947;18227;18228;21029;21030;21031;21032;21033;21034;21035;21036;21037;21038;21039;24900;24901;24902;24903;24904;24905;24906;24907;24908;24909;24910;24911;24912;24913;28699;28700;28701;28702;28703;28704;28705;28706;28707;28708;28709;28710;28711;28712;28713;28714;28715;28716;28717;28718;28719;28720;28721;30865;30866;30867;30868;30869;32895;33572;33573;33574;33575;33576;33577;33578;33579;33580;33581;33582;33583;33584;33585;33586;33587;33588;33589;33590;37060;37061;37062;37063;37064;37408;47483;47484;47485;47486;47487;47488;47489;47490;47491;47492;47493;47494 1052;1062;6757;9636;9641;9947;18228;21036;24909;24911;28701;30869;32895;33572;33588;37061;37408;47485 249;250;251 63;85;210 -1;-1
YGL137W YGL137W 15 15 15 YGL137W pep chromosome:R64-1-1:VII:249869:252738:1 gene:YGL137W transcript:YGL137W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC27 description:Essential beta-coat protein of the COPI coatomer; involved in ER-to-Golgi a 1 15 15 15 8 6 8 7 5 6 8 6 8 7 5 6 8 6 8 7 5 6 23.7 23.7 23.7 99.444 889 889 0 80.384 13.9 11.8 12.9 12.1 8.9 8.8 275900000 49065000 24420000 106480000 35091000 15519000 45317000 67096000 50240000 52081000 64329000 60267000 54606000 7 5 8 7 5 5 37 501 489;1306;1838;1914;2423;2996;3195;5258;5759;6949;7299;9087;10972;11038;11626 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 517;1360;1907;1987;2508;3102;3309;5479;6000;7237;7662;9532;11497;11565;12175 2097;5242;5243;5244;7190;7191;7192;7193;7194;7195;7391;9205;9206;9207;9208;9209;11327;11328;11329;12060;12061;12062;20098;22043;22044;26586;28009;28010;34763;34764;34765;42232;42480;42481;42482;42483;44927;44928;44929;44930 2103;5273;5274;5275;7230;7231;7232;7233;7234;7235;7432;9252;9253;9254;9255;9256;11406;11407;11408;12145;12146;12147;20222;22173;22174;26746;28183;28184;34971;34972;34973;42527;42775;42776;42777;42778;45235;45236;45237;45238 2103;5275;7230;7432;9252;11406;12147;20222;22173;26746;28183;34971;42527;42776;45238 -1
YGL147C YGL147C 13 13 5 YGL147C pep chromosome:R64-1-1:VII:227754:228329:-1 gene:YGL147C transcript:YGL147C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL9A description:Ribosomal 60S subunit protein L9A; homologous to mammalian ribosomal protei 1 13 13 5 8 11 12 10 9 9 8 11 12 10 9 9 2 3 4 2 2 2 52.9 52.9 19.4 21.569 191 191 0 128.54 39.3 48.7 49.2 44.5 44.5 38.2 7791300000 1024800000 777590000 3245700000 608420000 278210000 1856600000 1252800000 1352600000 1955200000 1219800000 1256100000 1900800000 13 17 16 13 12 15 86 502 2413;2915;3557;5045;7155;7435;9332;10844;10845;11388;12076;12376;12377 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2498;3020;3695;5254;7475;7476;7805;9788;9789;11364;11365;11925;12639;12951;12952 9164;9165;9166;9167;9168;9169;9170;9171;9172;11067;11068;13565;13566;13567;13568;13569;19223;19224;19225;19226;19227;19228;19229;19230;19231;19232;19233;19234;27378;27379;27380;27381;27382;28550;28551;28552;28553;28554;35790;35791;35792;35793;35794;35795;35796;35797;41730;41731;41732;43974;43975;43976;43977;43978;43979;46761;46762;46763;46764;46765;46766;46767;46768;46769;46770;46771;46772;47875;47876;47877;47878;47879;47880;47881;47882;47883;47884;47885;47886;47887;47888;47889;47890;47891;47892;47893 9211;9212;9213;9214;9215;9216;9217;9218;9219;11144;11145;13654;13655;13656;13657;13658;19346;19347;19348;19349;19350;19351;19352;19353;19354;19355;19356;19357;27547;27548;27549;27550;27551;28728;28729;28730;28731;28732;35998;35999;36000;36001;36002;36003;36004;36005;41993;41994;41995;44273;44274;44275;44276;44277;44278;47086;47087;47088;47089;47090;47091;47092;47093;47094;47095;47096;47097;48207;48208;48209;48210;48211;48212;48213;48214;48215;48216;48217;48218;48219;48220;48221;48222;48223;48224;48225 9216;11144;13657;19354;27550;28730;36002;41994;41995;44273;47097;48207;48224 252;253 1;78 -1
YGL148W YGL148W 5 5 5 YGL148W pep chromosome:R64-1-1:VII:226399:227529:1 gene:YGL148W transcript:YGL148W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARO2 description:Bifunctional chorismate synthase and flavin reductase; catalyzes the conversi 1 5 5 5 3 3 4 3 2 2 3 3 4 3 2 2 3 3 4 3 2 2 20.7 20.7 20.7 40.838 376 376 0 17.072 13.6 13.6 18.1 13.6 6.9 9.8 89982000 13116000 8915900 38805000 11379000 3636500 14129000 18004000 18466000 18830000 21889000 0 19687000 3 3 4 3 2 2 17 503 370;1412;2902;9764;9958 True;True;True;True;True 391;392;1470;3005;10240;10447 1620;1621;1622;1623;1624;5655;5656;5657;5658;5659;5660;11023;37407;38222;38223;38224;38225 1623;1624;1625;1626;1627;5690;5691;5692;5693;5694;5695;11099;37629;38454;38455;38456;38457 1626;5690;11099;37629;38454 254 353 -1
YGL150C YGL150C 2 2 2 YGL150C pep chromosome:R64-1-1:VII:221104:225573:-1 gene:YGL150C transcript:YGL150C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:INO80 description:ATPase and nucleosome spacing factor; subunit of complex containing actin a 1 2 2 2 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1.9 1.9 1.9 171.45 1489 1489 0 10.624 1.2 1.2 1.9 1.2 1.9 1.2 45851000 4418400 2344000 26599000 2826600 4223100 5440500 0 0 15413000 0 14224000 0 1 1 2 1 2 1 8 504 9185;10239 True;True 9635;10737 35170;35171;35172;35173;35174;35175;39282;39283 35378;35379;35380;35381;35382;35383;39518;39519 35378;39519 -1
YGL162W YGL162W 1 1 1 YGL162W pep chromosome:R64-1-1:VII:198138:199037:1 gene:YGL162W transcript:YGL162W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SUT1 description:Zn(II)2Cys6 family transcription factor; positively regulates sterol uptake g 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 2.7 2.7 2.7 33.191 299 299 1 -2 0 2.7 2.7 2.7 2.7 0 138030000 0 20268000 68540000 24114000 25112000 0 0 0 0 0 83027000 0 0 1 2 1 1 0 5 + 505 7254 True 7602 27790;27791;27792;27793;27794 27963;27964;27965;27966;27967 27964 255 1 -1
YGL167C YGL167C 3 3 3 YGL167C pep chromosome:R64-1-1:VII:187616:190468:-1 gene:YGL167C transcript:YGL167C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PMR1 description:High affinity Ca2+/Mn2+ P-type ATPase; required for Ca2+ and Mn2+ transport 1 3 3 3 0 2 0 2 1 1 0 2 0 2 1 1 0 2 0 2 1 1 3.8 3.8 3.8 104.57 950 950 0 12.508 0 2.7 0 2.7 1.1 1.1 105130000 0 4040100 0 3484600 95195000 2410900 0 8709700 0 7222200 0 0 0 2 0 2 1 1 6 506 4303;5660;9584 True;True;True 4479;5899;10053 16351;16352;16353;21728;36721;36722 16460;16461;16462;21857;36939;36940 16461;21857;36940 -1
YGL171W YGL171W 14 14 14 YGL171W pep chromosome:R64-1-1:VII:182390:184084:1 gene:YGL171W transcript:YGL171W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ROK1 description:RNA-dependent ATPase; involved in pre-rRNA processing at sites A0, A1, and A2 1 14 14 14 6 4 7 7 3 7 6 4 7 7 3 7 6 4 7 7 3 7 34.4 34.4 34.4 63.652 564 564 0 42.145 16.3 9 18.6 14.2 6.6 19.7 452970000 84575000 32502000 227370000 31495000 7612200 69415000 100220000 78819000 91803000 81722000 45990000 75766000 7 5 8 7 2 6 35 507 387;588;2398;3223;3416;3602;4476;5429;5924;5947;5948;8290;8362;8966 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 412;620;2483;3337;3542;3745;4667;5663;6173;6198;6199;8707;8780;9406 1699;2536;2537;2538;9108;9109;12160;12968;12969;12970;12971;13760;17044;17045;17046;17047;17048;17049;20876;22726;22727;22728;22729;22730;22731;22732;22733;22734;22735;22840;22841;22842;22843;31686;31687;31929;31930;31931;34172 1703;2543;2544;2545;9154;9155;9156;12245;13055;13056;13057;13058;13851;17158;17159;17160;17161;17162;17163;21003;22861;22862;22863;22864;22865;22866;22867;22868;22869;22870;22975;22976;22977;22978;31882;31883;32125;32126;32127;34378 1703;2544;9154;12245;13058;13851;17158;21003;22863;22975;22978;31882;32127;34378 -1
YGL173C YGL173C 53 53 53 YGL173C pep chromosome:R64-1-1:VII:175527:180113:-1 gene:YGL173C transcript:YGL173C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:XRN1 description:Evolutionarily-conserved 5-3 exonuclease; component of cytoplasmic process 1 53 53 53 32 29 27 40 34 30 32 29 27 40 34 30 32 29 27 40 34 30 41.4 41.4 41.4 175.46 1528 1528 0 254.11 28.8 23.8 21.3 34 29.7 26.2 3501600000 624650000 289150000 1093100000 464970000 280630000 749180000 795120000 731010000 773350000 835850000 677280000 767750000 35 28 31 45 38 36 213 508 281;282;325;1134;1290;1405;1585;2192;2264;2311;2418;2419;2493;2601;3111;3232;3444;3568;3569;3819;4047;4861;5061;5111;5197;5929;5956;6080;6540;6693;7042;7043;7708;7735;7809;8127;8241;8348;8381;8557;9207;9451;9578;9581;10081;10249;10464;10567;11098;11277;11711;11873;12001 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 294;295;342;343;1185;1343;1463;1648;2272;2346;2395;2503;2504;2579;2580;2695;3220;3221;3348;3572;3708;3709;3970;4212;4213;5064;5271;5321;5415;6178;6207;6331;6816;6973;7336;7337;7338;8094;8125;8208;8537;8656;8765;8799;8981;9658;9916;10047;10050;10573;10747;10971;11075;11629;11814;12267;12435;12564 1211;1212;1213;1214;1215;1216;1217;1218;1219;1220;1221;1222;1223;1224;1442;1443;1444;1445;1446;1447;1448;1449;4639;5181;5182;5183;5184;5185;5186;5620;6295;6296;8363;8364;8365;8366;8625;8626;8627;8628;8629;8630;8631;8632;8633;8807;8808;8809;8810;8811;9184;9185;9186;9187;9188;9189;9190;9191;9192;9193;9194;9195;9414;9415;9416;9417;9418;9842;9843;9844;11773;11774;11775;11776;11777;11778;11779;11780;11781;12209;12210;12211;12212;12213;12214;13064;13065;13593;13594;13595;13596;13597;13598;13599;14509;15371;15372;15373;15374;15375;15376;18502;18503;18504;19300;19301;19525;19890;19891;22749;22750;22751;22752;22753;22754;22862;22863;23339;24956;24957;24958;24959;24960;24961;25537;26898;26899;26900;26901;26902;26903;26904;26905;26906;26907;26908;29543;29544;29545;29546;29547;29678;29679;29680;29681;29682;29683;29684;29685;30014;30015;30016;30017;30018;31120;31506;31507;31508;31876;31877;31878;31984;31985;31986;31987;32642;35268;36263;36703;36704;36705;36706;36707;36714;36715;38649;38650;38651;38652;38653;38654;39330;39331;40095;40096;40097;40098;40471;40472;40473;40474;40475;40476;40477;40478;40479;40480;42745;42746;42747;42748;43471;43472;43473;43474;43475;45335;45336;45337;45338;45925;45926;45927;45928;46441 1213;1214;1215;1216;1217;1218;1219;1220;1221;1222;1223;1224;1225;1226;1445;1446;1447;1448;1449;1450;1451;1452;4665;5212;5213;5214;5215;5216;5217;5655;6331;6332;8406;8407;8408;8409;8670;8671;8672;8673;8674;8675;8676;8677;8678;8852;8853;8854;8855;8856;9231;9232;9233;9234;9235;9236;9237;9238;9239;9240;9241;9242;9462;9463;9464;9465;9466;9893;9894;9895;11856;11857;11858;11859;11860;11861;11862;11863;11864;12294;12295;12296;12297;12298;12299;13152;13153;13682;13683;13684;13685;13686;13687;13688;14608;15479;15480;15481;15482;15483;15484;18620;18621;18622;19423;19424;19648;20014;20015;22884;22885;22886;22887;22888;22889;22997;22998;23476;25106;25107;25108;25109;25110;25111;25691;27059;27060;27061;27062;27063;27064;27065;27066;27067;27068;27069;27070;29727;29728;29729;29730;29731;29862;29863;29864;29865;29866;29867;29868;29869;30201;30202;30203;30204;30205;31313;31702;31703;31704;32072;32073;32074;32180;32181;32182;32183;32838;35476;36475;36921;36922;36923;36924;36925;36932;36933;38882;38883;38884;38885;38886;38887;39566;39567;40333;40334;40335;40336;40714;40715;40716;40717;40718;40719;40720;40721;40722;40723;43040;43041;43042;43043;43769;43770;43771;43772;43773;45648;45649;45650;45651;46241;46242;46243;46244;46762 1213;1223;1445;4665;5216;5655;6332;8407;8675;8855;9233;9241;9466;9894;11858;12296;13152;13682;13688;14608;15482;18620;19423;19648;20014;22888;22997;23476;25107;25691;27059;27069;29731;29864;30203;31313;31703;32072;32181;32838;35476;36475;36924;36933;38882;39567;40335;40720;43042;43769;45651;46242;46762 256;257;258;259;260 140;457;593;864;1006 -1
YGL189C;YER131W YGL189C;YER131W 5;4 5;4 5;4 YGL189C pep chromosome:R64-1-1:VII:148229:148588:-1 gene:YGL189C transcript:YGL189C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS26A description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mamm 2 5 5 5 5 3 3 3 3 3 5 3 3 3 3 3 5 3 3 3 3 3 44.5 44.5 44.5 13.505 119 119;119 0 11.501 44.5 27.7 27.7 27.7 27.7 27.7 3261400000 650740000 502740000 807140000 454670000 247500000 598600000 944610000 1069000000 455910000 758120000 914770000 625940000 6 3 4 4 5 3 25 509 1323;5906;7597;7832;11523 True;True;True;True;True 1378;6153;7976;8231;12065 5302;5303;5304;5305;5306;5307;5308;5309;5310;5311;22636;29141;29142;29143;29144;29145;29146;30100;30101;30102;30103;30104;30105;44500 5333;5334;5335;5336;5337;5338;5339;5340;5341;5342;5343;22771;29324;29325;29326;29327;29328;29329;30288;30289;30290;30291;30292;30293;44806 5336;22771;29327;30292;44806 -1;-1
YGL190C YGL190C 4 4 4 YGL190C pep chromosome:R64-1-1:VII:145809:147389:-1 gene:YGL190C transcript:YGL190C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC55 description:Regulatory subunit B of protein phosphatase 2A (PP2A); Zds1p/2p-dependent l 1 4 4 4 2 0 1 1 2 2 2 0 1 1 2 2 2 0 1 1 2 2 12.9 12.9 12.9 59.661 526 526 0 21.619 7.6 0 2.3 3 7.8 7.8 146050000 44038000 0 22838000 3509000 12131000 63536000 0 0 0 0 40261000 63384000 2 0 1 1 2 2 8 510 2474;4871;6926;10041 True;True;True;True 2560;5075;7214;10532 9363;9364;9365;18551;26478;38481;38482;38483 9411;9412;9413;18669;26638;38713;38714;38715 9412;18669;26638;38713 -1
YGL191W YGL191W 1 1 1 YGL191W pep chromosome:R64-1-1:VII:144808:145197:1 gene:YGL191W transcript:YGL191W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:COX13 description:Subunit VIa of cytochrome c oxidase; present in a subclass of cytochrome c o 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 16.3 16.3 16.3 15.021 129 129 0.0016013 2.8318 0 0 16.3 0 0 16.3 35835000 0 0 25962000 0 0 9873100 0 0 0 0 0 9873100 0 0 1 0 0 1 2 511 9163 True 9613 35085;35086 35293;35294 35294 -1
YGL195W YGL195W 57 57 57 YGL195W pep chromosome:R64-1-1:VII:131525:139543:1 gene:YGL195W transcript:YGL195W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GCN1 description:Positive regulator of the Gcn2p kinase activity; forms a complex with Gcn20p; 1 57 57 57 29 27 36 33 18 29 29 27 36 33 18 29 29 27 36 33 18 29 26.9 26.9 26.9 296.69 2672 2672 0 240.88 14.2 13.2 16.8 16.6 7.9 15.5 1646500000 190920000 185380000 638830000 209380000 62784000 359210000 268040000 428470000 363280000 327170000 292130000 346330000 29 29 38 33 17 28 174 512 12;193;358;422;488;766;907;1287;1527;2094;2230;2262;2481;2794;3455;3623;4078;4238;4242;4322;4642;5198;5215;5301;5738;5794;5957;6003;6009;6150;6234;6255;6256;6661;6852;6921;7400;7525;7662;7672;8364;8629;8637;8818;9006;9225;9312;9708;9922;9932;10176;10896;10995;11070;11410;11682;12295 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 14;203;377;447;516;807;950;1340;1587;2173;2312;2344;2567;2893;3584;3766;4244;4411;4415;4499;4838;5416;5433;5523;5979;6036;6208;6254;6260;6405;6492;6514;6515;6939;7139;7209;7769;7903;8043;8054;8782;9053;9061;9250;9449;9676;9768;10182;10409;10421;10672;11417;11521;11597;11947;12237;12868 59;60;61;848;849;850;1587;1588;1589;1827;1828;1829;2096;3206;3749;3750;3751;3752;3753;5177;6075;6076;6077;6078;7990;7991;7992;7993;8502;8503;8618;8619;8620;9387;9388;9389;9390;9391;10592;10593;13107;13108;13109;13110;13830;15496;15497;16109;16122;16123;16124;16411;16412;16413;16414;16415;17678;17679;17680;19892;19893;19894;19895;19896;19956;19957;19958;20243;21978;21979;21980;22189;22190;22191;22192;22193;22864;23018;23019;23020;23021;23043;23044;23045;23046;23047;23606;23607;23608;23609;23610;23881;23882;23883;23954;23955;23956;25422;26176;26177;26178;26179;26180;26466;28392;28910;28911;28912;28913;28914;29356;29390;29391;29392;31934;31935;31936;32866;32867;32899;32900;32901;32902;32903;32904;32905;32906;33644;34475;35361;35362;35363;35685;35686;35687;35688;35689;35690;37190;37191;37192;37193;38097;38098;38099;38128;38129;39043;39044;39045;39046;39047;39048;41888;41889;41890;41891;41892;41893;42313;42314;42593;42594;42595;42596;42597;44075;44076;44077;44078;44079;45218;45219;45220;45221;47581 59;60;61;850;851;852;1590;1591;1592;1833;1834;1835;2102;3217;3763;3764;3765;3766;3767;5208;6111;6112;6113;6114;8032;8033;8034;8035;8545;8546;8663;8664;8665;9435;9436;9437;9438;9439;10659;10660;13195;13196;13197;13198;13921;15604;15605;16218;16231;16232;16233;16520;16521;16522;16523;16524;17793;17794;17795;20016;20017;20018;20019;20020;20080;20081;20082;20367;22108;22109;22110;22319;22320;22321;22322;22323;22999;23153;23154;23155;23156;23178;23179;23180;23181;23182;23183;23747;23748;23749;23750;23751;24023;24024;24025;24099;24100;24101;25576;26333;26334;26335;26336;26337;26626;28569;29093;29094;29095;29096;29097;29539;29574;29575;29576;32130;32131;32132;33063;33064;33096;33097;33098;33099;33100;33101;33102;33103;33844;34682;35569;35570;35571;35893;35894;35895;35896;35897;35898;37409;37410;37411;37412;38328;38329;38330;38359;38360;39278;39279;39280;39281;39282;39283;42152;42153;42154;42155;42156;42157;42608;42609;42888;42889;42890;42891;42892;44374;44375;44376;44377;44378;45530;45531;45532;45533;47913 61;850;1590;1833;2102;3217;3763;5208;6111;8035;8546;8664;9438;10660;13197;13921;15604;16218;16233;16521;17794;20017;20082;20367;22108;22322;22999;23155;23181;23748;24024;24100;24101;25576;26336;26626;28569;29095;29539;29575;32130;33063;33099;33844;34682;35570;35898;37410;38328;38359;39280;42155;42609;42890;44374;45530;47913 261;262 1068;1343 -1
YGL197W YGL197W 2 2 2 YGL197W pep chromosome:R64-1-1:VII:124698:129161:1 gene:YGL197W transcript:YGL197W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MDS3 description:Putative component of the TOR regulatory pathway; negative regulator of early 1 2 2 2 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 2.4 2.4 2.4 166.97 1487 1487 0.00080775 2.9127 1 2.4 0 0 0 0 3144800 1172700 1972000 0 0 0 0 0 4277700 0 0 0 0 1 2 0 0 0 0 3 513 4211;4594 True;True 4383;4790 15998;17527;17528 16107;17642;17643 16107;17643 -1
YGL201C YGL201C 4 4 4 YGL201C pep chromosome:R64-1-1:VII:117854:120907:-1 gene:YGL201C transcript:YGL201C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MCM6 description:Protein involved in DNA replication; component of the Mcm2-7 hexameric helic 1 4 4 4 2 0 1 0 1 0 2 0 1 0 1 0 2 0 1 0 1 0 5.4 5.4 5.4 112.98 1017 1017 0 7.339 2.7 0 1.5 0 1.3 0 7912300 3572900 0 3496900 0 842530 0 4666800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 2 514 4538;10571;10618;10973 True;True;True;True 4732;11079;11126;11498 17292;40495;40625;42233 17406;40738;40868;42528 17406;40738;40868;42528 -1
YGL202W YGL202W 3 3 3 YGL202W pep chromosome:R64-1-1:VII:116059:117561:1 gene:YGL202W transcript:YGL202W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARO8 description:Aromatic aminotransferase I; expression is regulated by general control of am 1 3 3 3 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 1 1 7.6 7.6 7.6 56.177 500 500 0 9.1335 0 5 2.8 0 2.6 2.8 14010000 0 3047600 6594000 0 898010 3470800 0 6610800 0 0 0 0 0 2 1 0 1 1 5 515 3407;5789;9182 True;True;True 3532;6031;9632 12927;22175;35159;35160;35161 13014;22305;35367;35368;35369 13014;22305;35368 -1
YGL206C YGL206C 25 25 25 YGL206C pep chromosome:R64-1-1:VII:102543:107504:-1 gene:YGL206C transcript:YGL206C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CHC1 description:Clathrin heavy chain; subunit of the major coat protein involved in intracel 1 25 25 25 16 4 13 4 12 12 16 4 13 4 12 12 16 4 13 4 12 12 22.9 22.9 22.9 187.23 1653 1653 0 118.8 13.4 5.1 13.2 6 10.8 11.9 700690000 117480000 12072000 332640000 46755000 35826000 155920000 146340000 36379000 174320000 100790000 122280000 166090000 15 4 14 5 12 12 62 516 546;627;1165;1371;2445;2610;4119;4336;4708;4721;4744;4896;5021;5600;7359;7734;8800;8927;9065;9751;11230;11815;11985;11991;12046 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 577;663;1216;1429;2530;2704;4287;4513;4905;4918;4943;5100;5229;5837;7726;8124;9232;9364;9509;10227;11767;12374;12548;12554;12609 2388;2389;2661;4751;4752;5502;9271;9272;9870;9871;9872;15683;16459;16460;17885;17945;18059;18060;18644;18645;18646;18647;19138;21506;28224;28225;28226;29677;33581;33582;33583;33584;33585;33586;34016;34017;34018;34019;34674;34675;34676;34677;34678;34679;37367;37368;37369;37370;43271;43272;43273;43274;43275;43276;43277;45741;46366;46367;46389;46390;46391;46392;46669 2395;2396;2668;4777;4778;5537;9318;9319;9921;9922;9923;15791;16568;16569;18001;18061;18175;18176;18765;18766;18767;18768;19261;21633;28399;28400;28401;29861;33781;33782;33783;33784;33785;33786;34218;34219;34220;34221;34882;34883;34884;34885;34886;34887;37589;37590;37591;37592;43569;43570;43571;43572;43573;43574;43575;46057;46686;46687;46709;46710;46711;46712;46992 2395;2668;4777;5537;9319;9921;15791;16569;18001;18061;18176;18767;19261;21633;28399;29861;33786;34219;34887;37591;43574;46057;46686;46712;46992 -1
YGL207W YGL207W 54 54 54 YGL207W pep chromosome:R64-1-1:VII:98969:102076:1 gene:YGL207W transcript:YGL207W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SPT16 description:Subunit of the heterodimeric FACT complex (Spt16p-Pob3p); FACT associates wit 1 54 54 54 30 29 38 37 32 35 30 29 38 37 32 35 30 29 38 37 32 35 53.3 53.3 53.3 118.63 1035 1035 0 323.31 37.7 29.8 41.4 37.5 35.3 37.3 4448300000 714780000 368440000 1672500000 508640000 300230000 883710000 916560000 918960000 942670000 971550000 974580000 916750000 37 34 43 42 36 38 230 517 50;312;435;436;905;1279;1430;1435;1572;1573;1755;2086;2479;2490;2515;2516;2604;2843;2936;2937;3290;4533;4734;4952;5129;5191;5195;5358;5432;5649;5712;6368;6614;7069;7070;7397;7503;7548;8283;8522;8549;8639;9499;9520;9625;9725;10066;10702;10912;11427;11951;11980;12190;12212 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 52;328;461;462;948;1332;1490;1495;1635;1636;1822;2164;2565;2576;2603;2604;2698;2943;3041;3042;3409;3410;4727;4931;5158;5340;5407;5412;5585;5666;5887;5953;6634;6891;7373;7374;7375;7766;7880;7926;8700;8946;8973;9063;9966;9988;10096;10201;10557;11213;11433;11964;12514;12543;12758;12781 216;217;1387;1388;1389;1390;1391;1392;1393;1902;1903;1904;1905;1906;1907;1908;1909;1910;1911;1912;1913;3739;3740;3741;3742;3743;3744;3745;3746;3747;5147;5148;5149;5150;5718;5719;5720;5721;5747;5748;5749;5750;5751;6253;6254;6255;6256;6257;6258;6259;6260;6261;6928;6929;6930;7961;7962;7963;7964;9380;9381;9382;9383;9409;9474;9475;9476;9477;9853;9854;9855;9856;9857;9858;10791;10792;11126;11127;11128;11129;11130;11131;12461;12462;17273;17274;17275;17276;17277;17278;18007;18008;18009;18010;18011;18845;18846;18847;18848;18849;18850;18851;18852;19589;19864;19872;20510;20511;20512;20513;20514;20515;20516;20517;20882;20883;20884;20885;21675;21676;21677;21678;21679;21886;21887;21888;21889;21890;21891;21892;21893;21894;21895;21896;24305;24306;24307;24308;24309;24310;25266;25267;25268;25269;27036;27037;27038;27039;27040;28380;28381;28820;28821;28822;28823;28824;28825;28970;28971;28972;28973;28974;28975;31672;32501;32601;32602;32603;32604;32605;32911;32912;32913;32914;32915;32916;36431;36432;36515;36516;36861;36862;36863;36864;36865;36866;36867;36868;37273;37274;37275;37276;38598;41017;41018;41019;41020;41021;41022;41023;41942;41943;41944;44129;44130;44131;44132;44133;46237;46238;46239;46240;46241;46242;46243;46244;46245;46246;46247;46354;46355;46356;46357;46358;47175;47176;47246;47247;47248;47249;47250;47251 217;218;1390;1391;1392;1393;1394;1395;1396;1908;1909;1910;1911;1912;1913;1914;1915;1916;1917;1918;1919;3753;3754;3755;3756;3757;3758;3759;3760;3761;5177;5178;5179;5180;5753;5754;5755;5756;5782;5783;5784;5785;5786;6289;6290;6291;6292;6293;6294;6295;6296;6297;6968;6969;6970;8003;8004;8005;8006;9428;9429;9430;9431;9457;9522;9523;9524;9525;9904;9905;9906;9907;9908;9909;10859;10860;11203;11204;11205;11206;11207;11208;12547;12548;17387;17388;17389;17390;17391;17392;18123;18124;18125;18126;18127;18966;18967;18968;18969;18970;18971;18972;18973;19712;19987;19995;20637;20638;20639;20640;20641;20642;20643;20644;21009;21010;21011;21012;21803;21804;21805;21806;21807;22016;22017;22018;22019;22020;22021;22022;22023;22024;22025;22026;24453;24454;24455;24456;24457;24458;25420;25421;25422;25423;27198;27199;27200;27201;27202;28557;28558;29000;29001;29002;29003;29004;29005;29153;29154;29155;29156;29157;29158;31868;32697;32797;32798;32799;32800;32801;33108;33109;33110;33111;33112;33113;36645;36646;36731;36732;37080;37081;37082;37083;37084;37085;37086;37087;37495;37496;37497;37498;38831;41264;41265;41266;41267;41268;41269;41270;42206;42207;42208;44428;44429;44430;44431;44432;46554;46555;46556;46557;46558;46559;46560;46561;46562;46563;46564;46674;46675;46676;46677;46678;47504;47505;47575;47576;47577;47578;47579;47580 217;1392;1909;1912;3757;5178;5754;5785;6293;6295;6970;8003;9430;9457;9522;9523;9905;10860;11204;11205;12547;17388;18127;18971;19712;19987;19995;20642;21011;21806;22022;24454;25423;27199;27202;28557;29001;29158;31868;32697;32801;33108;36646;36731;37085;37498;38831;41269;42206;44430;46556;46675;47504;47577 263;264;265 1;202;313 -1
YGL228W YGL228W 2 2 2 YGL228W pep chromosome:R64-1-1:VII:67598:69331:1 gene:YGL228W transcript:YGL228W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SHE10 description:Protein involved in outer spore wall assembly; likely involved directly in dit 1 2 2 2 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 5.2 5.2 5.2 66.862 577 577 0.00085911 3.5464 2.1 0 0 3.1 0 0 3706300 2917000 0 0 789290 0 0 3810100 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 2 518 8980;12186 True;True 9421;12754 34229;47166 34435;47495 34435;47495 -1
YGL232W YGL232W 2 2 2 YGL232W pep chromosome:R64-1-1:VII:62075:63002:1 gene:YGL232W transcript:YGL232W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TAN1 description:Putative tRNA acetyltransferase; RNA-binding protein required for the formation 1 2 2 2 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 8 8 8 33.55 289 289 0 8.3122 0 8 0 0 0 0 3192800 0 3192800 0 0 0 0 0 6925700 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 519 8057;12226 True;True 8462;12796 30883;47308 31075;47637 31075;47637 -1
YGL233W YGL233W 1 1 1 YGL233W pep chromosome:R64-1-1:VII:59122:61854:1 gene:YGL233W transcript:YGL233W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC15 description:Essential 113 kDa subunit of the exocyst complex; the exocyst mediates polariz 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1.2 1.2 1.2 105.06 910 910 1 -2 0 0 0 0 0 1.2 3045800 0 0 0 0 0 3045800 0 0 0 0 0 3045800 0 0 0 0 0 0 0 + 520 5331 True 5556 20387 20514 20514 266 344 -1
YGL234W YGL234W 23 23 23 YGL234W pep chromosome:R64-1-1:VII:56482:58890:1 gene:YGL234W transcript:YGL234W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ADE5,7 description:Enzyme of the de novo purine nucleotide biosynthetic pathway; contains amin 1 23 23 23 7 13 9 15 5 7 7 13 9 15 5 7 7 13 9 15 5 7 48.9 48.9 48.9 86.067 802 802 0 174.76 17.3 27.6 23.1 34.4 11.5 18.8 474820000 33571000 72322000 169030000 94233000 12356000 93305000 59051000 153230000 113950000 141990000 58762000 101360000 7 14 9 17 5 8 60 521 369;2257;3395;3639;3942;4168;4426;4922;5544;6231;7178;8267;8305;8585;9962;10175;10322;10467;10806;10895;11130;11323;11777 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 390;2339;3520;3783;4101;4102;4338;4613;5128;5781;6489;7509;8684;8722;9009;10451;10671;10822;10974;11325;11416;11664;11860;12336 1618;1619;8593;8594;8595;8596;8597;8598;12890;13870;14999;15000;15001;15002;15003;15004;15859;16824;16825;16826;18752;18753;21341;21342;23868;23869;23870;23871;23872;27501;27502;27503;31621;31728;32720;32721;32722;32723;32724;38233;38234;38235;39041;39042;39603;40103;40104;40105;40106;40107;40108;40109;41588;41589;41590;41887;42873;42874;43663;45617 1621;1622;8638;8639;8640;8641;8642;8643;12977;13961;15105;15106;15107;15108;15109;15110;15968;16936;16937;16938;18873;18874;21468;21469;24010;24011;24012;24013;24014;27673;27674;27675;31817;31924;32917;32918;32919;32920;32921;38465;38466;38467;39276;39277;39839;40341;40342;40343;40344;40345;40346;40347;41851;41852;41853;42151;43170;43171;43962;45932 1621;8641;12977;13961;15110;15968;16936;18873;21469;24014;27674;31817;31924;32920;38466;39276;39839;40345;41851;42151;43170;43962;45932 267;268 237;623 -1
YGL238W YGL238W 4 4 4 YGL238W pep chromosome:R64-1-1:VII:49552:52434:1 gene:YGL238W transcript:YGL238W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CSE1 description:Nuclear envelope protein that acts as a recycling factor; mediates the nuclear 1 4 4 4 1 1 3 0 0 1 1 1 3 0 0 1 1 1 3 0 0 1 7.2 7.2 7.2 109.35 960 960 0 11.187 1.2 1.2 5.9 0 0 2.3 29373000 1496900 2333900 22193000 0 0 3349100 0 0 13077000 0 0 0 1 1 3 0 0 1 6 522 2407;6887;6922;11850 True;True;True;True 2492;7175;7210;12409 9150;9151;26320;26467;26468;45833 9197;9198;26478;26627;26628;46149 9197;26478;26628;46149 -1
YGL244W YGL244W 8 8 8 YGL244W pep chromosome:R64-1-1:VII:41498:43174:1 gene:YGL244W transcript:YGL244W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RTF1 description:Subunit of RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex; regulates gene 1 8 8 8 6 5 4 4 3 2 6 5 4 4 3 2 6 5 4 4 3 2 16.7 16.7 16.7 65.868 558 558 0 14.76 14.3 10.8 9.1 8.6 7.5 3.4 188070000 56209000 24411000 62721000 23419000 11152000 10158000 60889000 39264000 28129000 42765000 54301000 33186000 6 4 4 4 3 2 23 523 458;2066;2165;6407;6640;9704;10263;11754 True;True;True;True;True;True;True;True 485;2143;2245;6673;6918;10178;10761;12311 1995;1996;1997;1998;7889;8269;8270;8271;8272;8273;24457;24458;24459;24460;25352;25353;25354;25355;25356;37184;37185;39387;45511;45512 2001;2002;2003;2004;7931;8312;8313;8314;8315;8316;24605;24606;24607;24608;25506;25507;25508;25509;25510;37403;37404;39623;45825;45826 2004;7931;8316;24607;25510;37404;39623;45826 -1
YGL245W YGL245W 61 61 61 YGL245W pep chromosome:R64-1-1:VII:39023:41149:1 gene:YGL245W transcript:YGL245W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GUS1 description:Glutamyl-tRNA synthetase (GluRS); forms a complex with methionyl-tRNA synthetas 1 61 61 61 41 44 41 43 41 42 41 44 41 43 41 42 41 44 41 43 41 42 73.7 73.7 73.7 80.842 708 708 0 323.31 59 61.6 58.3 59.7 57.8 61.6 25464000000 2867800000 3590100000 9228600000 2663200000 1226700000 5887600000 3303900000 6853600000 5980200000 5363900000 3709700000 6391000000 53 63 53 54 57 57 337 524 54;619;653;671;991;1153;1397;1401;1507;1769;2014;2119;2179;3191;3577;3579;3580;3685;3686;3984;3985;3986;4003;4004;4090;4826;4908;5087;5241;5368;5369;5602;5606;5607;6392;6393;6565;6706;6821;6838;7038;7101;7102;7351;7462;7507;7628;7957;8042;8043;8505;9269;9384;9781;10061;10375;10904;11067;11858;11872;12275 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 56;654;691;709;1037;1204;1455;1459;1567;1836;2090;2199;2259;3305;3719;3721;3722;3831;3832;4145;4146;4147;4148;4166;4167;4256;5028;5113;5297;5461;5596;5597;5839;5843;5844;6658;6659;6841;6842;6986;7107;7125;7331;7332;7408;7409;7410;7716;7717;7836;7884;8009;8360;8447;8448;8929;9723;9845;9846;10260;10552;10877;11425;11594;12417;12433;12434;12846 223;224;225;226;227;228;2629;2630;2631;2632;2633;2634;2752;2809;2810;2811;2812;2813;2814;2815;4112;4113;4114;4115;4116;4700;4701;4702;4703;5588;5589;5590;5591;5592;5604;5605;5606;5607;5608;5609;5610;5994;5995;5996;5997;5998;5999;6000;6984;6985;6986;6987;6988;6989;6990;6991;7689;7690;8097;8098;8099;8100;8101;8102;8103;8104;8105;8106;8107;8321;12053;12054;13632;13633;13636;13637;13638;13639;13640;13641;13642;13643;13644;13645;13646;13647;13648;13649;14018;14019;14020;14021;14022;14023;14024;14025;14026;14027;14028;15145;15146;15147;15148;15149;15150;15151;15152;15153;15154;15232;15233;15234;15235;15236;15237;15238;15239;15240;15241;15242;15243;15553;15554;15555;15556;15557;15558;15559;15560;15561;15562;15563;18343;18344;18345;18346;18347;18348;18349;18350;18698;18699;18700;18701;18702;18703;19448;20055;20561;20562;20563;20564;20565;20566;20567;20568;21511;21512;21513;21514;21515;21516;21525;21526;21527;21528;21529;21530;21531;21532;21533;21534;21535;21536;21537;21538;21539;21540;21541;21542;24401;24402;24403;24404;24405;24406;24407;24408;24409;24410;24411;24412;25070;25071;25072;25073;25074;25075;25076;25077;25078;25079;25080;25578;25579;25580;25581;25582;25583;25584;25585;25586;25587;25588;25589;26065;26066;26067;26068;26069;26070;26071;26072;26073;26074;26143;26144;26145;26146;26887;26888;26889;26890;26891;26892;27123;27124;27125;27126;27127;27128;27129;27130;28182;28183;28184;28185;28186;28187;28188;28189;28190;28191;28192;28193;28194;28662;28663;28664;28665;28666;28834;28835;28836;28837;28838;28839;28840;28841;28842;28843;29261;29262;30527;30528;30830;30831;32426;32427;35514;35515;35996;35997;35998;35999;36000;37489;37490;37491;37492;38582;38583;38584;38585;38586;39775;39776;39777;39778;39779;39780;39781;39782;39783;39784;39785;41906;41907;41908;41909;41910;42572;42573;42574;42575;42576;42577;42578;42579;42580;45845;45846;45915;45916;45917;45918;45919;45920;45921;45922;45923;45924;47494;47495;47496;47497;47498;47499;47500 224;225;226;227;228;229;2636;2637;2638;2639;2640;2641;2761;2818;2819;2820;2821;2822;2823;2824;4128;4129;4130;4131;4132;4726;4727;4728;4729;5623;5624;5625;5626;5627;5639;5640;5641;5642;5643;5644;5645;6029;6030;6031;6032;6033;6034;6035;7024;7025;7026;7027;7028;7029;7030;7031;7731;7732;8139;8140;8141;8142;8143;8144;8145;8146;8147;8148;8149;8364;12138;12139;13721;13722;13725;13726;13727;13728;13729;13730;13731;13732;13733;13734;13735;13736;13737;13738;14113;14114;14115;14116;14117;14118;14119;14120;14121;14122;14123;15252;15253;15254;15255;15256;15257;15258;15259;15260;15261;15339;15340;15341;15342;15343;15344;15345;15346;15347;15348;15349;15350;15661;15662;15663;15664;15665;15666;15667;15668;15669;15670;15671;18460;18461;18462;18463;18464;18465;18466;18467;18819;18820;18821;18822;18823;18824;19571;20179;20688;20689;20690;20691;20692;20693;20694;20695;21638;21639;21640;21641;21642;21643;21652;21653;21654;21655;21656;21657;21658;21659;21660;21661;21662;21663;21664;21665;21666;21667;21668;21669;24549;24550;24551;24552;24553;24554;24555;24556;24557;24558;24559;24560;25220;25221;25222;25223;25224;25225;25226;25227;25228;25229;25230;25732;25733;25734;25735;25736;25737;25738;25739;25740;25741;25742;25743;26222;26223;26224;26225;26226;26227;26228;26229;26230;26231;26300;26301;26302;26303;27048;27049;27050;27051;27052;27053;27285;27286;27287;27288;27289;27290;27291;27292;28357;28358;28359;28360;28361;28362;28363;28364;28365;28366;28367;28368;28369;28842;28843;28844;28845;28846;29015;29016;29017;29018;29019;29020;29021;29022;29023;29024;29444;29445;30717;30718;31022;31023;32622;32623;35722;35723;36207;36208;36209;36210;36211;37711;37712;37713;37714;38815;38816;38817;38818;38819;40012;40013;40014;40015;40016;40017;40018;40019;40020;40021;40022;42170;42171;42172;42173;42174;42867;42868;42869;42870;42871;42872;42873;42874;42875;46161;46162;46231;46232;46233;46234;46235;46236;46237;46238;46239;46240;47825;47826;47827;47828;47829;47830;47831 226;2638;2761;2822;4128;4727;5625;5640;6029;7025;7732;8144;8364;12139;13722;13726;13729;14117;14123;15253;15257;15259;15343;15349;15670;18463;18823;19571;20179;20692;20695;21638;21654;21659;24549;24557;25229;25743;26226;26300;27052;27286;27291;28367;28845;29017;29444;30718;31022;31023;32622;35722;36209;37712;38817;40021;42172;42873;46162;46235;47830 269;270;271;272;273;274;275;276 133;155;199;308;331;414;446;592 -1
YGL252C YGL252C 7 7 7 YGL252C pep chromosome:R64-1-1:VII:25718:27484:-1 gene:YGL252C transcript:YGL252C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RTG2 description:Sensor of mitochondrial dysfunction; regulates the subcellular location of Rtg 1 7 7 7 2 1 5 1 2 2 2 1 5 1 2 2 2 1 5 1 2 2 18.7 18.7 18.7 65.571 588 588 0 12.443 6.1 3.2 12.9 3.2 5.1 5.4 133130000 13415000 2949700 92774000 4242000 10665000 9081100 0 0 42097000 0 47833000 0 2 1 5 1 2 2 13 525 708;3769;7639;8371;10572;11026;12298 True;True;True;True;True;True;True 748;3918;8020;8789;11080;11553;12871 2937;2938;2939;2940;2941;14343;29289;31953;40496;40497;42439;47590;47591 2947;2948;2949;2950;2951;14442;29472;32149;40739;40740;42734;47922;47923 2950;14442;29472;32149;40739;42734;47922 -1
YGL253W YGL253W 10 10 10 YGL253W pep chromosome:R64-1-1:VII:23935:25395:1 gene:YGL253W transcript:YGL253W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HXK2 description:Hexokinase isoenzyme 2; phosphorylates glucose in cytosol; predominant hexokina 1 10 10 10 5 1 2 2 2 6 5 1 2 2 2 6 5 1 2 2 2 6 30 30 30 53.942 486 486 0 24.37 16.9 4.3 3.3 7.2 7.4 16.3 111960000 41825000 2017500 15188000 7669300 14784000 30478000 56747000 0 0 0 43507000 33736000 5 1 2 1 3 5 17 526 1230;1986;2898;4835;5511;6738;7253;7569;9792;12266 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1281;2061;3001;5037;5747;7018;7601;7947;10273;12837 4960;7597;11009;18374;21213;21214;25696;27789;29027;29028;29029;29030;29031;37566;37567;47450;47451;47452;47453 4987;7639;11085;18491;21340;21341;25850;27962;29210;29211;29212;29213;29214;37795;37796;47781;47782;47783;47784 4987;7639;11085;18491;21340;25850;27962;29213;37795;47782 -1
YGR001C YGR001C 3 3 3 YGR001C pep chromosome:R64-1-1:VII:497133:498034:-1 gene:YGR001C transcript:YGR001C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EFM5 description:S-adenosylmethionine-dependent lysine methyltransferase; involved in the tri 1 3 3 3 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 15.7 15.7 15.7 28.582 248 248 0 5.1095 0 0 4 6.9 6.9 4.8 19669000 0 0 2027800 10481000 3561200 3598300 0 0 0 0 11774000 0 0 0 0 1 1 1 3 527 1043;4760;6974 True;True;True 1091;4959;7263 4355;18121;18122;26671 4378;18238;18239;26831 4378;18238;26831 -1
YGR002C YGR002C 1 1 1 YGR002C pep chromosome:R64-1-1:VII:498476:499906:-1 gene:YGR002C transcript:YGR002C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SWC4 description:Component of the Swr1p complex that incorporates Htz1p into chromatin; compo 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 3.4 3.4 3.4 55.212 476 476 0 6.0655 3.4 3.4 0 3.4 3.4 0 7011800 1724700 1768200 0 1518800 2000100 0 0 0 0 0 6613000 0 1 1 0 1 2 0 5 528 1831 True 1900 7171;7172;7173;7174;7175 7211;7212;7213;7214;7215 7211 -1
YGR005C YGR005C 3 3 3 YGR005C pep chromosome:R64-1-1:VII:504657:505859:-1 gene:YGR005C transcript:YGR005C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TFG2 description:TFIIF (Transcription Factor II) middle subunit; involved in both transcripti 1 3 3 3 2 0 1 2 2 1 2 0 1 2 2 1 2 0 1 2 2 1 14.8 14.8 14.8 46.605 400 400 0 39.155 8.8 0 6 11 8.8 6 65708000 11214000 0 28831000 9610000 4281400 11772000 14816000 0 0 0 13987000 0 2 0 1 2 2 1 8 529 4736;9593;11648 True;True;True 4933;10062;12197 18018;18019;18020;36751;36752;36753;45025;45026 18134;18135;18136;36969;36970;36971;45335;45336 18135;36970;45336 -1
YGR024C YGR024C 2 2 2 YGR024C pep chromosome:R64-1-1:VII:531883:532596:-1 gene:YGR024C transcript:YGR024C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:THG1 description:tRNAHis guanylyltransferase; adds a guanosine residue to the 5 end of tRNAH 1 2 2 2 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 13.1 13.1 13.1 27.757 237 237 0.0015385 2.4069 7.2 0 0 0 5.9 5.9 11212000 1601600 0 0 0 1558100 8052600 2092000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 3 530 1054;2771 True;True 1102;2869 4386;10509;10510 4409;10575;10576 4409;10575 -1
YLR333C;YGR027C YLR333C;YGR027C 11;11 11;11 11;11 YLR333C pep chromosome:R64-1-1:XII:795573:795899:-1 gene:YLR333C transcript:YLR333C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS25B description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mamm 2 11 11 11 7 8 8 7 7 9 7 8 8 7 7 9 7 8 8 7 7 9 60.2 60.2 60.2 12.009 108 108;108 0 49.729 51.9 50.9 60.2 41.7 42.6 50.9 3606900000 716420000 380070000 1165800000 283860000 338430000 722340000 764900000 913800000 856570000 779100000 788120000 762640000 10 12 12 9 9 11 63 531 0;1;719;720;1664;3595;4025;4327;6078;12366;12367 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 0;1;759;760;1728;3738;4189;4504;6329;12940;12941 0;1;2;2983;2984;2985;2986;2987;2988;2989;2990;2991;2992;2993;2994;2995;2996;2997;2998;6565;6566;6567;6568;6569;6570;13733;13734;13735;13736;13737;13738;13739;13740;13741;13742;13743;13744;13745;15294;15295;15296;15297;16428;16429;16430;16431;16432;16433;16434;23330;23331;23332;23333;23334;23335;47822;47823;47824;47825;47826;47827;47828;47829;47830 0;1;2;2993;2994;2995;2996;2997;2998;2999;3000;3001;3002;3003;3004;3005;3006;3007;3008;6601;6602;6603;6604;6605;6606;13824;13825;13826;13827;13828;13829;13830;13831;13832;13833;13834;13835;13836;15402;15403;15404;15405;16537;16538;16539;16540;16541;16542;16543;23467;23468;23469;23470;23471;23472;48154;48155;48156;48157;48158;48159;48160;48161;48162 0;1;2995;3001;6601;13831;15404;16543;23467;48160;48162 -1;-1
YGR033C YGR033C 1 1 1 YGR033C pep chromosome:R64-1-1:VII:554248:554967:-1 gene:YGR033C transcript:YGR033C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TIM21 description:Nonessential component of the TIM23 complex; interacts with the Translocase 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 5 5 5 27.205 239 239 0.00084674 3.3459 0 5 0 0 0 0 909160 0 909160 0 0 0 0 0 1972100 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 532 9277 True 9731 35542 35750 35750 -1
YGR034W YGR034W 20 20 3 YGR034W pep chromosome:R64-1-1:VII:555812:556672:1 gene:YGR034W transcript:YGR034W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL26B description:Ribosomal 60S subunit protein L26B; binds to 5.8S rRNA; non-essential even 1 20 20 3 13 18 15 17 15 18 13 18 15 17 15 18 1 3 3 2 2 3 69.3 69.3 9.4 14.235 127 127 0 63.893 59.1 69.3 59.1 63 59.1 59.1 6927600000 765280000 690390000 2347500000 794140000 583260000 1747000000 1221800000 1453000000 1396200000 1725800000 1884000000 1508800000 18 27 20 25 20 25 135 533 426;427;541;999;1109;1787;2162;2163;4981;4982;5895;6066;6067;8366;8367;8475;8632;11281;11368;11369 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 451;452;571;1045;1159;1854;2242;2243;5187;5188;6140;6317;6318;8784;8785;8897;9056;11818;11905;11906 1846;1847;1848;1849;1850;1851;1852;1853;1854;1855;1856;1857;1858;1859;1860;1861;1862;1863;1864;1865;1866;1867;1868;2368;2369;2370;2371;2372;2373;2374;2375;2376;2377;2378;4172;4173;4174;4175;4176;4559;4560;4561;4562;4563;7034;7035;7036;7037;7038;7039;7040;7041;7042;7043;8253;8254;8255;8256;8257;8258;8259;8260;8261;8262;8263;8264;8265;8266;8267;18939;18940;18941;18942;18943;18944;18945;18946;18947;18948;22590;23278;23279;23280;23281;23282;23283;23284;23285;23286;23287;23288;23289;23290;23291;23292;23293;23294;23295;31940;31941;31942;31943;31944;31945;31946;31947;32319;32320;32321;32322;32323;32324;32882;32883;32884;32885;32886;32887;32888;43487;43488;43868;43869;43870;43871;43872;43873;43874;43875;43876;43877;43878;43879;43880;43881 1852;1853;1854;1855;1856;1857;1858;1859;1860;1861;1862;1863;1864;1865;1866;1867;1868;1869;1870;1871;1872;1873;1874;2375;2376;2377;2378;2379;2380;2381;2382;2383;2384;2385;4192;4193;4194;4195;4196;4585;4586;4587;4588;4589;7074;7075;7076;7077;7078;7079;7080;7081;7082;7083;8296;8297;8298;8299;8300;8301;8302;8303;8304;8305;8306;8307;8308;8309;8310;19061;19062;19063;19064;19065;19066;19067;19068;19069;19070;22725;23414;23415;23416;23417;23418;23419;23420;23421;23422;23423;23424;23425;23426;23427;23428;23429;23430;23431;32136;32137;32138;32139;32140;32141;32142;32143;32515;32516;32517;32518;32519;32520;33079;33080;33081;33082;33083;33084;33085;43785;43786;44167;44168;44169;44170;44171;44172;44173;44174;44175;44176;44177;44178;44179;44180 1853;1872;2379;4195;4588;7081;8297;8308;19062;19068;22725;23419;23425;32137;32143;32520;33084;43786;44168;44180 -1
YGR040W YGR040W 4 4 3 YGR040W pep chromosome:R64-1-1:VII:575398:576504:1 gene:YGR040W transcript:YGR040W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KSS1 description:Mitogen-activated protein kinase (MAPK); involved in signal transduction path 1 4 4 3 0 0 3 0 0 2 0 0 3 0 0 2 0 0 3 0 0 1 15.2 15.2 13 42.692 368 368 0 5.9708 0 0 13 0 0 5.2 30600000 0 0 25975000 0 0 4625100 0 0 15306000 0 0 0 0 0 3 0 0 2 5 534 6843;9998;10234;10853 True;True;True;True 7130;10487;10730;11373 26154;38346;39256;39257;41754 26311;38578;39492;39493;42017 26311;38578;39493;42017 -1
YGR054W YGR054W 30 30 30 YGR054W pep chromosome:R64-1-1:VII:596693:598621:1 gene:YGR054W transcript:YGR054W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Eukaryotic initiation factor eIF2A; associates specifically with both 40S subunits and 80 S ri 1 30 30 30 22 14 12 19 14 15 22 14 12 19 14 15 22 14 12 19 14 15 65 65 65 71.304 642 642 0 176.72 50.9 34 27.7 46 30.8 37.1 2665300000 692650000 201430000 831030000 323900000 122320000 493970000 675660000 400880000 576170000 587190000 554480000 531830000 27 15 13 21 16 17 109 535 234;331;799;1108;1135;2170;2410;2960;3224;4671;5329;5639;5733;6601;6618;8090;8121;9517;9580;9629;9881;10222;10311;10596;10597;10979;11265;11517;11723;11836 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 245;349;840;1158;1186;2250;2495;3066;3338;4868;5552;5877;5974;6878;6895;8497;8529;8530;9985;10049;10100;10364;10718;10811;11104;11105;11504;11802;12059;12279;12395 1004;1474;1475;1476;1477;1478;3322;4553;4554;4555;4556;4557;4558;4640;8290;9159;9160;9161;11221;11222;11223;11224;12161;12162;12163;12164;12165;12166;12167;12168;12169;17760;20374;20375;21651;21652;21653;21961;21962;21963;21964;21965;25224;25281;25282;25283;25284;25285;31008;31009;31010;31011;31012;31013;31014;31015;31016;31094;31095;31096;31097;31098;31099;31100;31101;31102;36504;36505;36506;36507;36508;36509;36713;36890;36891;37925;39213;39563;39564;39565;39566;39567;40569;40570;40571;40572;40573;40574;40575;40576;42254;42255;43398;44480;44481;44482;44483;44484;44485;44486;45386;45387;45388;45389;45390;45391;45799;45800;45801 1006;1477;1478;1479;1480;1481;3334;4579;4580;4581;4582;4583;4584;4666;8333;9206;9207;9208;11298;11299;11300;11301;12246;12247;12248;12249;12250;12251;12252;12253;12254;17875;20501;20502;21779;21780;21781;22091;22092;22093;22094;22095;25378;25435;25436;25437;25438;25439;31200;31201;31202;31203;31204;31205;31206;31207;31208;31287;31288;31289;31290;31291;31292;31293;31294;31295;36720;36721;36722;36723;36724;36725;36931;37109;37110;38155;39449;39799;39800;39801;39802;39803;40812;40813;40814;40815;40816;40817;40818;40819;42549;42550;43696;44786;44787;44788;44789;44790;44791;44792;45700;45701;45702;45703;45704;45705;46115;46116;46117 1006;1479;3334;4582;4666;8333;9207;11299;12253;17875;20502;21780;22095;25378;25438;31203;31295;36725;36931;37109;38155;39449;39800;40815;40819;42549;43696;44790;45703;46116 277;278 69;313 -1
YGR056W YGR056W 1 1 1 YGR056W pep chromosome:R64-1-1:VII:601661:604447:1 gene:YGR056W transcript:YGR056W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSC1 description:Component of the RSC chromatin remodeling complex; required for expression of 1 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1.1 1.1 1.1 106.67 928 928 0.005189 2.0289 0 0 0 1.1 1.1 0 2733300 0 0 0 1671300 1062000 0 0 0 0 0 3511400 0 0 0 0 1 1 0 2 536 11083 True 11610 42652;42653 42947;42948 42948 -1
YGR072W YGR072W 4 4 4 YGR072W pep chromosome:R64-1-1:VII:634304:635467:1 gene:YGR072W transcript:YGR072W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UPF3 description:Component of the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway; along with Nam7p 1 4 4 4 2 0 4 2 2 3 2 0 4 2 2 3 2 0 4 2 2 3 15.5 15.5 15.5 44.924 387 387 0 12.936 7.8 0 15.5 8 8.5 12.1 94720000 9582500 0 53108000 6092800 3378500 22558000 15107000 0 18423000 16285000 16831000 23426000 2 0 4 2 3 3 14 537 2316;7879;8273;11325 True;True;True;True 2400;8279;8690;11862 8830;8831;8832;8833;30228;30229;30230;30231;31637;31638;31639;31640;31641;43668 8875;8876;8877;8878;30416;30417;30418;30419;31833;31834;31835;31836;31837;43967 8878;30416;31833;43967 -1
YGR074W YGR074W 1 1 1 YGR074W pep chromosome:R64-1-1:VII:635712:636152:1 gene:YGR074W transcript:YGR074W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SMD1 description:Core Sm protein Sm D1; part of heteroheptameric complex (with Smb1p, Smd2p, S 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 12.3 12.3 12.3 16.275 146 146 0.0045147 2.2033 0 12.3 0 0 0 0 2050100 0 2050100 0 0 0 0 0 4447100 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 538 8184 True 8595 31295 31490 31490 -1
YGR076C YGR076C 2 2 2 YGR076C pep chromosome:R64-1-1:VII:637104:637577:-1 gene:YGR076C transcript:YGR076C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL25 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit; mutation confers inc 1 2 2 2 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 19.7 19.7 19.7 18.587 157 157 0.0015588 2.5402 0 8.9 10.8 8.9 0 10.8 57241000 0 807090 37353000 536080 0 18544000 0 0 0 1102800 0 0 0 1 1 1 0 1 4 539 364;12020 True;True 385;12583 1606;1607;46557;46558 1609;1610;46878;46879 1610;46878 -1
YGR083C YGR083C 12 12 12 YGR083C pep chromosome:R64-1-1:VII:644860:646815:-1 gene:YGR083C transcript:YGR083C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GCD2 description:Delta subunit of the translation initiation factor eIF2B; the guanine-nucleo 1 12 12 12 8 6 3 5 4 3 8 6 3 5 4 3 8 6 3 5 4 3 24.6 24.6 24.6 70.851 651 651 0 53.746 19.2 14.1 5.5 9.1 9.7 8.4 266830000 55459000 32945000 85938000 30096000 21597000 40792000 77221000 57142000 70928000 51517000 63772000 48073000 8 6 3 5 4 4 30 540 269;762;865;2809;7573;8077;8088;9713;11159;11324;11443;11444 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 282;803;908;2908;7952;8483;8495;10187;11693;11861;11980;11981 1182;1183;1184;3192;3598;3599;3600;3601;10655;10656;10657;29066;29067;29068;29069;29070;29071;30962;31001;31002;37211;42947;43664;43665;43666;43667;44183;44184;44185;44186 1184;1185;1186;3203;3611;3612;3613;3614;10723;10724;10725;29249;29250;29251;29252;29253;29254;31154;31193;31194;37430;43244;43963;43964;43965;43966;44488;44489;44490;44491 1185;3203;3614;10725;29253;31154;31193;37430;43244;43963;44489;44491 -1
YPR102C;YGR085C YPR102C;YGR085C 11;11 11;11 11;11 YPR102C pep chromosome:R64-1-1:XVI:731224:731748:-1 gene:YPR102C transcript:YPR102C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL11A description:Ribosomal 60S subunit protein L11A; expressed at twice the level of Rpl11B 2 11 11 11 10 11 9 9 11 10 10 11 9 9 11 10 10 11 9 9 11 10 43.7 43.7 43.7 19.719 174 174;174 0 99.964 43.7 43.7 39.1 43.7 43.7 43.7 4826300000 514080000 510270000 1778200000 670430000 423630000 929690000 862950000 1185600000 1056600000 1169100000 1136700000 1074000000 14 13 13 14 15 13 82 541 126;1607;3233;3801;6896;6897;8222;10628;11174;11228;11910 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 131;1670;3349;3951;7184;7185;8636;11136;11709;11765;12473 536;537;538;539;6373;6374;6375;12215;12216;12217;12218;12219;12220;12221;12222;14450;14451;14452;14453;14454;26371;26372;26373;26374;26375;26376;26377;26378;26379;26380;26381;26382;26383;26384;26385;26386;26387;26388;26389;26390;26391;26392;31441;31442;31443;31444;31445;31446;31447;31448;31449;31450;31451;31452;40649;40650;40651;40652;40653;40654;40655;40656;43031;43032;43033;43034;43035;43036;43037;43038;43039;43255;43256;43257;43258;43259;43260;43261;43262;46077;46078;46079;46080;46081;46082 537;538;539;540;6409;6410;6411;12300;12301;12302;12303;12304;12305;12306;12307;14549;14550;14551;14552;14553;26529;26530;26531;26532;26533;26534;26535;26536;26537;26538;26539;26540;26541;26542;26543;26544;26545;26546;26547;26548;26549;26550;26551;31637;31638;31639;31640;31641;31642;31643;31644;31645;31646;31647;31648;40892;40893;40894;40895;40896;40897;40898;40899;43328;43329;43330;43331;43332;43333;43334;43335;43336;43552;43553;43554;43555;43556;43557;43558;43559;43560;46394;46395;46396;46397;46398;46399 539;6411;12303;14550;26537;26545;31637;40894;43330;43557;46398 -1;-1
YGR086C YGR086C 15 15 13 YGR086C pep chromosome:R64-1-1:VII:649598:650617:-1 gene:YGR086C transcript:YGR086C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PIL1 description:Eisosome core component; eisosomes are large immobile cell cortex structures 1 15 15 13 11 9 10 9 12 9 11 9 10 9 12 9 10 8 9 9 12 7 45.7 45.7 43.7 38.349 339 339 0 64.952 38.1 34.2 35.4 31 43.4 36.3 1140800000 147870000 83491000 547040000 65054000 123920000 173390000 178770000 187130000 330990000 177280000 263950000 262690000 12 9 12 9 15 10 67 542 29;121;519;693;1178;1243;2961;3759;3926;3927;4719;5216;8662;9355;9356 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 31;126;548;733;1229;1294;3067;3907;4085;4086;4916;5434;9087;9812;9813;9814 101;102;103;104;509;510;511;2234;2235;2236;2237;2238;2239;2240;2241;2242;2881;2882;2883;2884;2885;2886;2887;4805;4806;4807;4808;4809;4810;5009;5010;11225;14281;14282;14283;14284;14944;14945;14946;14947;14948;14949;14950;14951;14952;14953;17937;17938;17939;17940;17941;17942;19959;19960;19961;33013;33014;33015;33016;35890;35891;35892;35893;35894;35895;35896;35897 101;102;103;104;510;511;512;2240;2241;2242;2243;2244;2245;2246;2247;2248;2891;2892;2893;2894;2895;2896;2897;4831;4832;4833;4834;4835;4836;5037;5038;11302;14379;14380;14381;14382;15048;15049;15050;15051;15052;15053;15054;15055;15056;15057;18053;18054;18055;18056;18057;18058;20083;20084;20085;33211;33212;33213;33214;36100;36101;36102;36103;36104;36105;36106;36107 102;511;2244;2895;4834;5038;11302;14379;15051;15054;18053;20083;33211;36103;36106 279 72 -1
YGR090W YGR090W 37 37 37 YGR090W pep chromosome:R64-1-1:VII:662358:666071:1 gene:YGR090W transcript:YGR090W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP22 description:Component of the small-subunit processome; required for nuclear export of tR 1 37 37 37 22 16 21 14 14 19 22 16 21 14 14 19 22 16 21 14 14 19 38.2 38.2 38.2 140.48 1237 1237 0 139.01 23.9 19.2 21.3 16.9 17.4 22.9 925330000 142500000 63228000 376090000 85158000 46287000 212060000 182010000 125810000 225790000 157480000 173610000 220480000 21 16 23 14 14 19 107 543 240;723;1969;2194;2303;2603;2855;3042;3229;3681;4534;4598;4849;4965;5284;6039;6525;6526;6783;6975;7274;7386;7405;7958;8046;8768;9062;9179;9557;10310;10608;11326;11377;11743;11823;12041;12074 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 251;763;2044;2274;2386;2697;2956;3151;3345;3827;4728;4794;5052;5171;5505;6290;6801;6802;7066;7264;7628;7755;7774;8361;8451;9199;9506;9629;10026;10810;11116;11863;11914;12300;12382;12604;12637 1040;1041;1042;1043;1044;1045;3008;3009;3010;3011;7550;7551;7552;7553;7554;8369;8776;8777;9851;9852;10834;10835;11509;12200;12201;14007;17279;17542;17543;17544;17545;18447;18448;18449;18450;18451;18886;20184;23175;24903;24904;24905;24906;24907;24908;24909;25910;25911;26672;26673;26674;26675;27878;27879;28345;28346;28347;28348;28414;28415;28416;28417;28418;30529;30530;30531;30837;33457;33458;33459;34667;34668;34669;35150;35151;35152;35153;35154;36642;36643;36644;39557;39558;39559;39560;39561;39562;40593;40594;40595;43669;43670;43917;43918;45472;45473;45474;45475;45476;45477;45757;46641;46642;46643;46644;46645;46753;46754 1042;1043;1044;1045;1046;1047;3018;3019;3020;3021;7592;7593;7594;7595;7596;8412;8821;8822;9902;9903;10902;10903;11588;12285;12286;14102;17393;17657;17658;17659;17660;18565;18566;18567;18568;18569;19008;20308;23311;25053;25054;25055;25056;25057;25058;25059;26067;26068;26832;26833;26834;26835;28051;28052;28522;28523;28524;28525;28591;28592;28593;28594;28595;30719;30720;30721;31029;33657;33658;33659;34875;34876;34877;35358;35359;35360;35361;35362;36859;36860;36861;39793;39794;39795;39796;39797;39798;40836;40837;40838;43968;43969;44216;44217;45786;45787;45788;45789;45790;45791;46073;46963;46964;46965;46966;46967;47078;47079 1045;3018;7594;8412;8822;9902;10903;11588;12285;14102;17393;17658;18567;19008;20308;23311;25058;25059;26067;26833;28052;28522;28591;30720;31029;33658;34876;35358;36860;39797;40838;43969;44217;45788;46073;46963;47078 -1
YGR094W YGR094W 77 77 77 YGR094W pep chromosome:R64-1-1:VII:672186:675500:1 gene:YGR094W transcript:YGR094W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VAS1 description:Mitochondrial and cytoplasmic valyl-tRNA synthetase; human homolog VARS2 impl 1 77 77 77 50 66 40 67 51 49 50 66 40 67 51 49 50 66 40 67 51 49 65.3 65.3 65.3 125.77 1104 1104 0 323.31 55.6 60.4 48.8 60.3 51.7 55.6 23847000000 2376400000 7036800000 3323200000 5236300000 1175900000 4698100000 2577900000 15508000000 2602700000 10098000000 3785900000 4771900000 66 104 50 105 72 66 463 544 309;310;845;846;1014;1092;1158;1209;1419;1462;1538;2005;2043;2044;2045;2141;2349;2989;3085;3640;3641;4388;4745;4746;4828;5122;5127;5239;5370;5637;5638;5778;5781;5886;5964;5966;5967;6276;6277;6439;6440;6776;6908;7127;7300;7301;7481;7482;7725;8293;8692;8704;8939;9150;9151;9158;9159;9242;9243;9278;9353;9569;9900;10102;10103;10150;10353;10354;10711;10918;10982;10983;11093;11690;11717;12137;12138 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 325;326;888;889;1061;1142;1209;1260;1478;1522;1599;2080;2081;2120;2121;2122;2221;2433;3095;3194;3784;3785;3786;4567;4944;4945;5030;5332;5337;5338;5459;5598;5875;5876;6020;6023;6131;6215;6217;6218;6535;6536;6709;6710;7059;7196;7441;7663;7664;7856;7857;8112;8113;8710;9118;9130;9378;9379;9600;9601;9608;9609;9695;9696;9732;9810;10038;10387;10594;10595;10646;10853;10854;11222;11440;11508;11509;11621;12246;12273;12701;12702 1373;1374;1375;1376;1377;1378;1379;1380;1381;3504;3505;3506;3507;3508;3509;3510;3511;3512;3513;3514;3515;3516;3517;3518;4245;4246;4247;4248;4249;4250;4251;4252;4253;4254;4255;4256;4509;4510;4511;4713;4714;4715;4716;4717;4891;4892;4893;4894;4895;4896;5672;5673;5841;6114;6115;6116;6117;6118;6119;7655;7656;7657;7658;7659;7660;7782;7783;7784;7785;7786;7787;7788;7789;7790;7791;7792;7793;8195;8196;8197;8925;8926;8927;8928;8929;8930;8931;8932;8933;8934;8935;8936;11302;11303;11304;11305;11306;11307;11308;11309;11310;11658;11659;11660;11661;13871;13872;13873;13874;13875;13876;13877;13878;13879;13880;16663;16664;16665;16666;16667;16668;18061;18062;18063;18064;18065;18066;18067;18068;18069;18070;18071;18072;18352;18353;18354;18355;18356;18357;18358;18359;18360;18361;19555;19556;19557;19558;19568;19569;19570;19571;19572;19573;19574;19575;19576;19577;19578;19579;19580;19581;19582;19583;19584;19585;19586;19587;20046;20047;20048;20569;20570;20571;21639;21640;21641;21642;21643;21644;21645;21646;21647;21648;21649;21650;22117;22118;22119;22120;22121;22122;22133;22134;22135;22136;22137;22138;22139;22140;22141;22142;22143;22556;22557;22558;22559;22560;22561;22562;22563;22564;22565;22878;22882;22883;22884;22885;22886;22887;22888;22889;22890;22891;22892;22893;22894;22895;24015;24016;24017;24018;24019;24020;24021;24617;24618;24619;24620;24621;24622;24623;24624;24625;24626;24627;24628;24629;24630;24631;24632;24633;25893;26437;26438;26439;27253;28011;28012;28013;28014;28733;28734;28735;28736;28737;28738;28739;28740;28741;28742;28743;28744;28745;29632;29633;29634;29635;29636;29637;29638;29639;29640;29641;29642;29643;29644;29645;31695;33135;33136;33137;33138;33139;33140;33188;33189;33190;33191;33192;33193;33194;34072;34073;34074;34075;34076;34077;34078;34079;34080;34081;34082;34083;34084;34085;34086;35039;35040;35041;35042;35043;35044;35045;35046;35047;35048;35049;35050;35069;35070;35071;35072;35073;35074;35075;35076;35436;35437;35438;35439;35440;35441;35442;35443;35444;35445;35446;35447;35448;35449;35450;35451;35452;35543;35544;35545;35546;35547;35548;35882;36673;36674;36675;36676;36677;36678;38015;38016;38017;38018;38019;38020;38021;38724;38725;38726;38727;38728;38729;38730;38731;38732;38733;38734;38735;38736;38737;38738;38739;38740;38741;38742;38939;38940;38941;38942;38943;38944;39716;39717;39718;39719;39720;39721;39722;41056;41057;41058;41059;41060;41061;41062;41063;41064;41065;41066;41964;41965;41966;41967;42266;42267;42268;42269;42270;42271;42272;42273;42274;42275;42276;42277;42278;42706;42707;42708;42709;42710;42711;42712;42713;42714;42715;42716;45254;45255;45256;45257;45357;45358;45359;45360;45361;45362;45363;47008;47009;47010;47011;47012 1376;1377;1378;1379;1380;1381;1382;1383;1384;3517;3518;3519;3520;3521;3522;3523;3524;3525;3526;3527;3528;3529;3530;3531;4266;4267;4268;4269;4270;4271;4272;4273;4274;4275;4276;4277;4534;4535;4536;4739;4740;4741;4742;4743;4917;4918;4919;4920;4921;4922;5707;5708;5876;6150;6151;6152;6153;6154;6155;7697;7698;7699;7700;7701;7702;7824;7825;7826;7827;7828;7829;7830;7831;7832;7833;7834;7835;8237;8238;8239;8971;8972;8973;8974;8975;8976;8977;8978;8979;8980;8981;8982;11381;11382;11383;11384;11385;11386;11387;11388;11389;11740;11741;11742;11743;13962;13963;13964;13965;13966;13967;13968;13969;13970;13971;16774;16775;16776;16777;16778;16779;18177;18178;18179;18180;18181;18182;18183;18184;18185;18186;18187;18188;18469;18470;18471;18472;18473;18474;18475;18476;18477;18478;19678;19679;19680;19681;19691;19692;19693;19694;19695;19696;19697;19698;19699;19700;19701;19702;19703;19704;19705;19706;19707;19708;19709;19710;20170;20171;20172;20696;20697;20698;21767;21768;21769;21770;21771;21772;21773;21774;21775;21776;21777;21778;22247;22248;22249;22250;22251;22252;22263;22264;22265;22266;22267;22268;22269;22270;22271;22272;22273;22690;22691;22692;22693;22694;22695;22696;22697;22698;22699;22700;23013;23017;23018;23019;23020;23021;23022;23023;23024;23025;23026;23027;23028;23029;23030;24160;24161;24162;24163;24164;24165;24166;24766;24767;24768;24769;24770;24771;24772;24773;24774;24775;24776;24777;24778;24779;24780;24781;24782;26050;26596;26597;26598;27418;28185;28186;28187;28188;28913;28914;28915;28916;28917;28918;28919;28920;28921;28922;28923;28924;28925;29816;29817;29818;29819;29820;29821;29822;29823;29824;29825;29826;29827;29828;29829;31891;33334;33335;33336;33337;33338;33339;33387;33388;33389;33390;33391;33392;33393;34275;34276;34277;34278;34279;34280;34281;34282;34283;34284;34285;34286;34287;34288;34289;34290;34291;35247;35248;35249;35250;35251;35252;35253;35254;35255;35256;35257;35258;35277;35278;35279;35280;35281;35282;35283;35284;35644;35645;35646;35647;35648;35649;35650;35651;35652;35653;35654;35655;35656;35657;35658;35659;35660;35751;35752;35753;35754;35755;35756;36092;36890;36891;36892;36893;36894;36895;38246;38247;38248;38249;38250;38251;38252;38957;38958;38959;38960;38961;38962;38963;38964;38965;38966;38967;38968;38969;38970;38971;38972;38973;38974;38975;38976;38977;39174;39175;39176;39177;39178;39179;39953;39954;39955;39956;39957;39958;39959;41304;41305;41306;41307;41308;41309;41310;41311;41312;41313;41314;42228;42229;42230;42231;42561;42562;42563;42564;42565;42566;42567;42568;42569;42570;42571;42572;42573;43001;43002;43003;43004;43005;43006;43007;43008;43009;43010;43011;45567;45568;45569;45570;45671;45672;45673;45674;45675;45676;45677;47335;47336;47337;47338;47339 1376;1383;3521;3523;4276;4534;4743;4919;5708;5876;6154;7700;7826;7833;7835;8239;8978;11385;11743;13964;13965;16776;18178;18182;18478;19678;19696;20171;20697;21767;21773;22250;22270;22691;23013;23018;23024;24165;24166;24766;24773;26050;26597;27418;28185;28188;28916;28917;29820;31891;33336;33390;34289;35248;35258;35277;35280;35644;35654;35752;36092;36893;38252;38968;38970;39177;39953;39958;41305;42230;42563;42569;43006;45568;45672;47337;47339 280;281;282;283;284 428;477;504;531;763 -1
YGR097W YGR097W 1 1 1 YGR097W pep chromosome:R64-1-1:VII:678695:682135:1 gene:YGR097W transcript:YGR097W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ASK10 description:Regulator of the Fps1p glycerol channel; under nonstress conditions, binds t 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1.8 1.8 1.8 126.86 1146 1146 0.00083195 3.1806 1.8 1.8 0 0 1.8 0 7334200 2808700 2695200 0 0 1830300 0 0 0 0 0 6051700 0 1 1 0 0 1 0 3 545 1632 True 1695 6460;6461;6462 6496;6497;6498 6497 -1
YGR103W YGR103W 15 15 15 YGR103W pep chromosome:R64-1-1:VII:695417:697234:1 gene:YGR103W transcript:YGR103W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP7 description:Component of several different pre-ribosomal particles; forms a complex with 1 15 15 15 11 10 10 10 8 12 11 10 10 10 8 12 11 10 10 10 8 12 26.3 26.3 26.3 69.876 605 605 0 85.644 20.3 17.2 23.1 21.8 18.3 25 1761500000 228530000 185190000 694940000 201290000 115440000 336100000 341700000 367550000 367110000 337050000 443770000 384400000 11 12 12 12 10 13 70 546 1217;1242;3333;3817;4174;5211;5643;5681;6562;6563;7129;8107;10759;11580;12280 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1268;1293;3455;3968;4344;5429;5881;5921;6838;6839;7443;8515;11275;12126;12851 4923;4924;4925;4926;4927;5003;5004;5005;5006;5007;5008;12622;12623;12624;12625;12626;12627;14504;14505;15875;15876;15877;15878;15879;15880;19942;19943;19944;19945;19946;19947;19948;19949;19950;21661;21797;21798;25063;25064;25065;25066;27258;27259;31065;31066;31067;31068;31069;41380;41381;41382;41383;41384;41385;44743;44744;44745;44746;44747;44748;44749;44750;44751;44752;47512;47513;47514;47515;47516;47517;47518 4949;4950;4951;4952;4953;5031;5032;5033;5034;5035;5036;12708;12709;12710;12711;12712;12713;14603;14604;15984;15985;15986;15987;15988;15989;20066;20067;20068;20069;20070;20071;20072;20073;20074;21789;21927;21928;25213;25214;25215;25216;27423;27424;31258;31259;31260;31261;31262;41640;41641;41642;41643;41644;41645;45049;45050;45051;45052;45053;45054;45055;45056;45057;45058;47843;47844;47845;47846;47847;47848;47849 4952;5033;12711;14603;15989;20070;21789;21927;25213;25216;27424;31259;41644;45054;47848 -1
YGR116W YGR116W 13 13 13 YGR116W pep chromosome:R64-1-1:VII:720409:724764:1 gene:YGR116W transcript:YGR116W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SPT6 description:Nucleosome remodeling protein; functions in various aspects of transcription, 1 13 13 13 7 2 6 4 8 1 7 2 6 4 8 1 7 2 6 4 8 1 12.8 12.8 12.8 168.29 1451 1451 0 34.294 7.3 1.7 6.8 4.3 8.3 1.7 138280000 33051000 6178200 67685000 6526800 12783000 12052000 34902000 21139000 36345000 18567000 41193000 0 7 2 7 4 8 1 29 547 311;415;2363;2765;3314;4659;4696;5503;5625;6246;8476;11127;12388 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 327;440;2447;2863;3435;4856;4893;5739;5862;6505;8898;11661;12963 1382;1383;1384;1385;1386;1809;8969;8970;10483;12568;17742;17743;17744;17840;17841;17842;17843;17844;21188;21189;21594;21595;21596;21597;23922;23923;32325;42863;47923 1385;1386;1387;1388;1389;1815;9015;9016;10549;12654;17857;17858;17859;17955;17956;17957;17958;17959;21315;21316;21721;21722;21723;21724;24067;24068;32521;43160;48255 1389;1815;9015;10549;12654;17857;17957;21315;21722;24067;32521;43160;48255 -1
YPR132W;YGR118W YPR132W;YGR118W 9;9 9;9 9;9 YPR132W pep chromosome:R64-1-1:XVI:794965:795767:1 gene:YPR132W transcript:YPR132W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS23B description:Ribosomal protein 28 (rp28) of the small (40S) ribosomal subunit; required 2 9 9 9 7 7 9 6 7 8 7 7 9 6 7 8 7 7 9 6 7 8 51.7 51.7 51.7 16.038 145 145;145 0 48.15 44.1 37.9 51.7 45.5 45.5 51 4029600000 605750000 426150000 1354400000 548370000 151230000 943750000 968900000 967410000 621590000 896730000 780860000 850020000 9 9 11 8 10 9 56 548 409;5399;5400;6202;8559;9626;11502;11552;11761 True;True;True;True;True;True;True;True;True 434;5627;5628;6459;8983;10097;12044;12095;12318 1796;1797;1798;1799;1800;20690;20691;20692;20693;20694;20695;20696;20697;20698;20699;20700;20701;20702;20703;23799;23800;23801;23802;32646;32647;32648;32649;36869;36870;36871;36872;36873;36874;36875;36876;36877;36878;36879;44433;44434;44435;44436;44610;44611;44612;44613;44614;44615;44616;44617;44618;45530;45531;45532;45533;45534 1802;1803;1804;1805;1806;20817;20818;20819;20820;20821;20822;20823;20824;20825;20826;20827;20828;20829;20830;23941;23942;23943;23944;32842;32843;32844;32845;37088;37089;37090;37091;37092;37093;37094;37095;37096;37097;37098;44739;44740;44741;44742;44916;44917;44918;44919;44920;44921;44922;44923;44924;45844;45845;45846;45847;45848 1806;20818;20827;23944;32845;37098;44741;44916;45845 -1;-1
YGR122W YGR122W 1 1 1 YGR122W pep chromosome:R64-1-1:VII:733935:735143:1 gene:YGR122W transcript:YGR122W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Protein that may be involved in pH regulation; probable ortholog of A. nidulans PalC, which is 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 3.7 3.7 3.7 45.304 402 402 0 6.4992 3.7 0 0 0 0 0 5269000 5269000 0 0 0 0 0 6882300 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 549 9607 True 10076 36799 37018 37018 -1
YGR124W YGR124W 3 3 2 YGR124W pep chromosome:R64-1-1:VII:739944:741662:1 gene:YGR124W transcript:YGR124W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ASN2 description:Asparagine synthetase; catalyzes the synthesis of L-asparagine from L-asparta 1 3 3 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 0 0 6.1 6.1 4.4 64.592 572 572 0 6.0606 3.5 4.4 4.4 4.4 1.7 1.7 41882000 9282200 6100000 11508000 5175700 1867900 7947900 0 0 0 10647000 0 0 2 1 1 1 1 1 7 550 6068;9630;11973 True;True;True 6319;10101;12536 23296;36892;36893;36894;46321;46322;46323;46324;46325;46326 23432;37111;37112;37113;46640;46641;46642;46643;46644;46645 23432;37113;46641 -1
YGR128C YGR128C 8 8 8 YGR128C pep chromosome:R64-1-1:VII:747950:750091:-1 gene:YGR128C transcript:YGR128C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP8 description:Nucleolar protein required for export of tRNAs from the nucleus; also copuri 1 8 8 8 3 5 4 5 2 3 3 5 4 5 2 3 3 5 4 5 2 3 16.8 16.8 16.8 80.19 713 713 0 39.969 4.6 12.6 10.5 9.3 2.8 8.1 141340000 10479000 34644000 48540000 11895000 3652100 32131000 22643000 39375000 23719000 39706000 34636000 26034000 3 5 3 5 2 2 20 551 545;1018;6608;6769;7500;7681;8040;10395 True;True;True;True;True;True;True;True 575;576;1066;6885;7050;7876;8065;8445;10897 2385;2386;2387;4268;4269;4270;4271;4272;25252;25253;25254;25863;25864;25865;28803;28804;28805;29437;30821;30822;30823;39872 2392;2393;2394;4289;4290;4291;4292;4293;25406;25407;25408;26020;26021;26022;28983;28984;28985;29621;31013;31014;31015;40109 2394;4293;25408;26020;28985;29621;31014;40109 285 708 -1
YGR132C YGR132C 1 1 1 YGR132C pep chromosome:R64-1-1:VII:755589:756452:-1 gene:YGR132C transcript:YGR132C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PHB1 description:Subunit of the prohibitin complex (Phb1p-Phb2p); prohibitin is a 1.2 MDa rin 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 3.1 3.1 3.1 31.427 287 287 0.00086957 3.6433 3.1 3.1 3.1 0 3.1 3.1 16260000 3109900 2098300 4592000 0 2223900 4235900 0 0 0 0 0 4235900 1 1 1 0 1 1 5 552 10988 True 11514 42294;42295;42296;42297;42298 42589;42590;42591;42592;42593 42591 -1
YGR135W YGR135W 2 2 2 YGR135W pep chromosome:R64-1-1:VII:761392:762168:1 gene:YGR135W transcript:YGR135W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRE9 description:Alpha 3 subunit of the 20S proteasome; the only nonessential 20S subunit; may 1 2 2 2 0 1 1 2 0 0 0 1 1 2 0 0 0 1 1 2 0 0 10.1 10.1 10.1 28.714 258 258 0 4.3727 0 5 5 10.1 0 0 8715700 0 1264200 3947700 3503800 0 0 0 0 0 7207700 0 0 0 1 1 2 0 0 4 553 3967;10763 True;True 4127;11279 15097;41406;41407;41408 15204;41666;41667;41668 15204;41668 -1
YGR145W YGR145W 12 12 12 YGR145W pep chromosome:R64-1-1:VII:781767:783890:1 gene:YGR145W transcript:YGR145W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ENP2 description:Component of the SSU; required for pre-18S rRNA processing, biogenesis of the 1 12 12 12 4 4 8 6 5 3 4 4 8 6 5 3 4 4 8 6 5 3 22.2 22.2 22.2 81.733 707 707 0 130.71 7.5 7.9 13.6 12.6 10.9 6.9 263820000 24978000 14078000 134010000 35485000 12336000 42930000 44520000 34798000 67952000 54366000 39216000 57990000 4 4 9 6 5 3 31 554 3687;4189;4870;5207;6988;9055;9083;9377;9586;9740;10559;11354 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3833;4361;5074;5425;7277;9499;9527;9838;10055;10216;11067;11891 14029;14030;14031;15947;15948;15949;18548;18549;18550;19932;26717;26718;34651;34652;34653;34654;34655;34755;34756;35963;36726;36727;37319;37320;37321;37322;37323;40451;40452;40453;43798 14124;14125;14126;16056;16057;16058;18666;18667;18668;20056;26878;26879;34859;34860;34861;34862;34863;34963;34964;36173;36944;36945;37541;37542;37543;37544;37545;40694;40695;40696;44097 14125;16056;18666;20056;26878;34862;34964;36173;36944;37541;40696;44097 -1
YGR148C YGR148C 14 14 3 YGR148C pep chromosome:R64-1-1:VII:787312:787779:-1 gene:YGR148C transcript:YGR148C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL24B description:Ribosomal 60S subunit protein L24B; not essential for translation but may 1 14 14 3 9 7 10 10 12 11 9 7 10 10 12 11 1 1 2 2 3 1 47.1 47.1 12.9 17.547 155 155 0 64.721 40 36.1 46.5 41.9 47.1 41.9 5817800000 1086700000 571200000 1661500000 296910000 477400000 1724000000 1377700000 1596200000 1015200000 1192800000 1173400000 1178300000 11 8 12 10 16 14 71 555 739;740;3053;3360;3806;3807;5068;7154;8516;8517;8606;8682;9262;10935 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 780;781;3162;3482;3957;3958;5278;7473;7474;8940;8941;9030;9107;9716;11459 3068;3069;3070;3071;3072;3073;3074;3075;3076;3077;3078;3079;3080;3081;3082;3083;11548;11549;11550;12726;12727;12728;12729;12730;12731;14475;14476;14477;14478;14479;14480;14481;14482;14483;14484;19348;19349;19350;19351;19352;19353;19354;19355;27366;27367;27368;27369;27370;27371;27372;27373;27374;27375;27376;27377;32473;32474;32475;32476;32477;32478;32479;32785;32786;32787;32788;33098;33099;35502;35503;42074;42075 3079;3080;3081;3082;3083;3084;3085;3086;3087;3088;3089;3090;3091;3092;3093;3094;11629;11630;11631;12812;12813;12814;12815;12816;12817;14574;14575;14576;14577;14578;14579;14580;14581;14582;14583;19471;19472;19473;19474;19475;19476;19477;19478;27535;27536;27537;27538;27539;27540;27541;27542;27543;27544;27545;27546;32669;32670;32671;32672;32673;32674;32675;32982;32983;32984;32985;33297;33298;35710;35711;42366;42367 3082;3091;11630;12815;14576;14580;19471;27545;32674;32675;32982;33297;35710;42367 286 1 -1
YGR152C YGR152C 5 5 5 YGR152C pep chromosome:R64-1-1:VII:794674:795492:-1 gene:YGR152C transcript:YGR152C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSR1 description:GTP-binding protein of the Ras superfamily; required for bud site selection, 1 5 5 5 3 0 3 1 2 3 3 0 3 1 2 3 3 0 3 1 2 3 21.7 21.7 21.7 30.39 272 272 0 10.247 12.1 0 12.5 4 8.5 14 100280000 16455000 0 38647000 6991900 8168000 30022000 22181000 0 22689000 0 30821000 25603000 4 0 2 1 2 4 13 556 4204;6946;8368;9425;11411 True;True;True;True;True 4376;7234;8786;9889;11948 15982;26579;31948;36139;36140;36141;36142;36143;44080;44081;44082;44083;44084 16091;26739;32144;36350;36351;36352;36353;36354;36355;44379;44380;44381;44382;44383 16091;26739;32144;36351;44383 -1
YGR155W YGR155W 18 18 18 YGR155W pep chromosome:R64-1-1:VII:798543:800066:1 gene:YGR155W transcript:YGR155W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CYS4 description:Cystathionine beta-synthase; catalyzes synthesis of cystathionine from serine 1 18 18 18 8 11 6 12 7 8 8 11 6 12 7 8 8 11 6 12 7 8 44.6 44.6 44.6 56.021 507 507 0 162.48 23.7 31.4 14.4 31.6 17.2 23.5 426170000 49090000 101850000 91764000 110050000 15579000 57843000 75465000 218160000 51903000 186510000 68949000 73864000 9 12 6 15 7 8 57 557 487;491;967;1283;2200;2334;2706;3645;3646;5925;6410;6639;7766;7882;8238;9366;9715;10501 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 515;519;1012;1336;2280;2418;2800;3790;3791;6174;6676;6917;8162;8282;8653;9826;10189;11008 2093;2094;2095;2103;2104;2105;4036;4037;4038;4039;5156;5157;5158;5159;5160;8388;8881;8882;10210;13888;13889;13890;13891;13892;13893;13894;13895;13896;22736;24465;24466;25351;29864;30238;30239;30240;30241;31495;31496;31497;31498;31499;31500;31501;35937;35938;35939;37213;37214;37215;37216;37217;37218;37219;37220;40231;40232;40233;40234;40235 2099;2100;2101;2109;2110;2111;4052;4053;4054;4055;5186;5187;5188;5189;5190;8431;8926;8927;10264;13979;13980;13981;13982;13983;13984;13985;13986;13987;22871;24613;24614;25505;30051;30426;30427;30428;30429;31691;31692;31693;31694;31695;31696;31697;36147;36148;36149;37432;37433;37434;37435;37436;37437;37438;37439;40472;40473;40474;40475;40476 2101;2111;4054;5190;8431;8926;10264;13983;13986;22871;24614;25505;30051;30429;31695;36149;37437;40476 -1
YGR157W YGR157W 7 7 7 YGR157W pep chromosome:R64-1-1:VII:802440:805049:1 gene:YGR157W transcript:YGR157W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CHO2 description:Phosphatidylethanolamine methyltransferase (PEMT); catalyzes the first step i 1 7 7 7 2 3 3 2 0 3 2 3 3 2 0 3 2 3 3 2 0 3 11.5 11.5 11.5 101.2 869 869 0 17.752 3.1 5.6 5.6 2.3 0 4.9 54120000 4015500 11818000 17030000 4342000 0 16915000 0 21271000 14399000 0 0 0 2 3 3 2 0 4 14 558 3354;3904;7217;8432;8633;9624;10634 True;True;True;True;True;True;True 3476;4062;7560;8853;9057;10095;11142 12711;14848;14849;27673;27674;27675;32157;32158;32889;36860;40672;40673;40674;40675 12797;14952;14953;27846;27847;27848;32353;32354;33086;37079;40915;40916;40917;40918 12797;14952;27848;32354;33086;37079;40915 -1
YGR159C YGR159C 29 29 29 YGR159C pep chromosome:R64-1-1:VII:806412:807656:-1 gene:YGR159C transcript:YGR159C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NSR1 description:Nucleolar protein that binds nuclear localization sequences; required for pr 1 29 29 29 26 24 21 23 19 20 26 24 21 23 19 20 26 24 21 23 19 20 53.9 53.9 53.9 44.535 414 414 0 195.13 53.9 53.9 47.3 53.6 47.3 49 12324000000 2709400000 1541000000 3756300000 1315900000 683240000 2318100000 3242900000 2422600000 2824300000 2771100000 2277400000 2787500000 39 36 28 29 27 24 183 559 374;448;1070;1625;1707;2259;2912;2913;2944;3456;3531;3532;4513;4514;4955;5014;5041;5302;5616;6749;6750;6751;7399;7901;7902;8219;8830;8831;9535 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 396;397;475;1118;1688;1772;1773;2341;3016;3017;3018;3049;3585;3668;3669;4706;4707;5161;5221;5250;5524;5853;7029;7030;7031;7768;8301;8302;8633;9263;9264;10003 1646;1647;1648;1649;1650;1651;1652;1653;1654;1948;1949;1950;1951;1952;1953;1954;1955;1956;1957;1958;4430;6446;6761;6762;6763;6764;6765;6766;6767;6768;6769;6770;6771;6772;8603;8604;8605;8606;8607;8608;8609;8610;8611;11046;11047;11048;11049;11050;11051;11052;11053;11054;11055;11056;11057;11058;11059;11060;11061;11164;11165;11166;11167;11168;11169;11170;13111;13112;13113;13114;13115;13116;13451;13452;13453;13454;13455;13456;13457;13458;17180;17181;17182;17183;17184;17185;17186;17187;17188;17189;17190;17191;17192;17193;18857;19072;19073;19074;19075;19076;19077;19078;19079;19080;19081;19082;19083;19084;19085;19086;19207;19208;19209;20244;20245;20246;20247;20248;20249;20250;20251;20252;20253;21570;21571;21572;21573;25742;25743;25744;25745;25746;25747;25748;25749;25750;25751;25752;25753;25754;25755;25756;25757;25758;25759;28386;28387;28388;28389;28390;28391;30303;30304;30305;30306;30307;31425;31426;31427;31428;31429;31430;33688;33689;33690;33691;33692;33693;33694;33695;33696;33697;33698;33699;33700;33701;36561;36562;36563;36564;36565;36566 1649;1650;1651;1652;1653;1654;1655;1656;1657;1658;1954;1955;1956;1957;1958;1959;1960;1961;1962;1963;1964;4455;6482;6801;6802;6803;6804;6805;6806;6807;6808;6809;6810;6811;6812;8648;8649;8650;8651;8652;8653;8654;8655;8656;11123;11124;11125;11126;11127;11128;11129;11130;11131;11132;11133;11134;11135;11136;11137;11138;11241;11242;11243;11244;11245;11246;11247;13199;13200;13201;13202;13203;13204;13540;13541;13542;13543;13544;13545;13546;13547;17294;17295;17296;17297;17298;17299;17300;17301;17302;17303;17304;17305;17306;17307;18978;19195;19196;19197;19198;19199;19200;19201;19202;19203;19204;19205;19206;19207;19208;19209;19330;19331;19332;20368;20369;20370;20371;20372;20373;20374;20375;20376;20377;20378;21697;21698;21699;21700;25896;25897;25898;25899;25900;25901;25902;25903;25904;25905;25906;25907;25908;25909;25910;25911;25912;25913;28563;28564;28565;28566;28567;28568;30492;30493;30494;30495;30496;31621;31622;31623;31624;31625;31626;33889;33890;33891;33892;33893;33894;33895;33896;33897;33898;33899;33900;33901;33902;36777;36778;36779;36780;36781;36782 1653;1956;4455;6482;6804;8648;11123;11134;11242;13200;13540;13545;17296;17305;18978;19209;19331;20378;21699;25900;25904;25909;28567;30492;30493;31623;33891;33901;36780 287;288;289 229;243;318 -1
YGR162W YGR162W 31 31 28 YGR162W pep chromosome:R64-1-1:VII:824059:826917:1 gene:YGR162W transcript:YGR162W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TIF4631 description:Translation initiation factor eIF4G; subunit of the mRNA cap-binding prote 1 31 31 28 25 17 18 20 19 15 25 17 18 20 19 15 22 15 15 17 17 13 38.7 38.7 36.2 107.1 952 952 0 253.5 32.5 21.1 24.5 26.9 24.8 21.8 2039800000 356730000 184960000 792390000 224550000 159520000 321640000 384340000 417020000 513010000 475040000 407260000 448430000 27 18 21 23 21 15 125 560 85;828;929;1088;1098;1327;1413;1868;1960;2070;3473;4808;5530;6063;6338;6890;8116;8945;9469;9757;9984;10021;10134;10225;10226;10640;10641;11327;11670;12328;12329 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 88;870;972;1138;1148;1382;1471;1939;2035;2148;3605;5009;5767;6314;6603;7178;8524;9385;9935;10233;10473;10511;10627;10721;10722;11148;11149;11864;12223;12901;12902 352;353;354;355;356;357;3451;3452;3861;3862;4501;4502;4523;4524;4525;4526;5328;5329;5330;5331;5332;5661;5662;5663;7281;7282;7283;7284;7285;7286;7511;7512;7513;7514;7515;7516;7905;7906;7907;7908;13211;13212;13213;18280;18281;21289;23259;23260;23261;23262;23263;23264;24221;24222;24223;24224;24225;24226;26334;26335;26336;26337;26338;26339;26340;26341;31081;34103;34104;34105;34106;34107;34108;34109;34110;36317;36318;36319;36320;36321;36322;37385;37386;38301;38302;38303;38304;38414;38851;38852;38853;38854;39217;39218;39219;39220;39221;39222;39223;39224;39225;39226;40694;40695;40696;40697;40698;40699;43671;43672;43673;43674;43675;45163;45164;47691;47692;47693;47694;47695;47696;47697;47698;47699;47700 353;354;355;356;357;358;3464;3465;3876;3877;4526;4527;4548;4549;4550;4551;5360;5361;5362;5363;5364;5696;5697;5698;7322;7323;7324;7325;7326;7327;7552;7553;7554;7555;7556;7557;7947;7948;7949;7950;13300;13301;13302;18397;18398;21416;23395;23396;23397;23398;23399;23400;24369;24370;24371;24372;24373;24374;26492;26493;26494;26495;26496;26497;26498;26499;31274;34308;34309;34310;34311;34312;34313;34314;34315;36530;36531;36532;36533;36534;36535;37607;37608;38533;38534;38535;38536;38646;39086;39087;39088;39089;39453;39454;39455;39456;39457;39458;39459;39460;39461;39462;40937;40938;40939;40940;40941;40942;43970;43971;43972;43973;43974;45475;45476;48023;48024;48025;48026;48027;48028;48029;48030;48031;48032 357;3465;3877;4526;4548;5360;5696;7323;7555;7950;13301;18398;21416;23398;24374;26494;31274;34314;36533;37607;38536;38646;39088;39454;39461;40937;40941;43972;45476;48027;48032 290 772 -1
YGR165W YGR165W 1 1 1 YGR165W pep chromosome:R64-1-1:VII:829116:830153:1 gene:YGR165W transcript:YGR165W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPS35 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit; null mutant does not 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 8.4 8.4 8.4 39.575 345 345 0.00081967 3.028 0 0 0 0 8.4 0 9949500 0 0 0 0 9949500 0 0 0 0 0 32897000 0 0 0 0 0 1 0 1 561 2475 True 2561 9366 9414 9414 -1
YGR173W YGR173W 7 7 7 YGR173W pep chromosome:R64-1-1:VII:843854:844960:1 gene:YGR173W transcript:YGR173W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RBG2 description:Protein with a role in translation; forms a complex with Gir2p; has similarit 1 7 7 7 1 4 3 2 2 5 1 4 3 2 2 5 1 4 3 2 2 5 26.4 26.4 26.4 41.006 368 368 0 21.664 3.3 12 12.2 9.2 9.5 20.7 84012000 4759700 16350000 35282000 4675500 3968200 18977000 0 31263000 19003000 22084000 0 12502000 1 5 3 2 2 5 18 562 320;805;3424;3823;9897;11676;12252 True;True;True;True;True;True;True 336;846;3550;3974;10383;12229;12823 1419;3344;3345;3346;13008;14520;14521;14522;14523;14524;38000;45177;45178;45179;47391;47392;47393;47394 1422;3356;3357;3358;13095;14619;14620;14621;14622;14623;38231;45489;45490;45491;47721;47722;47723;47724 1422;3356;13095;14623;38231;45491;47724 -1
YGR175C YGR175C 6 6 6 YGR175C pep chromosome:R64-1-1:VII:846933:848423:-1 gene:YGR175C transcript:YGR175C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERG1 description:Squalene epoxidase; catalyzes the epoxidation of squalene to 2,3-oxidosquale 1 6 6 6 2 2 4 6 4 4 2 2 4 6 4 4 2 2 4 6 4 4 20.2 20.2 20.2 55.125 496 496 0 28.619 10.1 10.1 15.1 20.2 14.7 14.7 162220000 12462000 25497000 55256000 26981000 12561000 29463000 26919000 61732000 29317000 41746000 38873000 32052000 2 3 4 6 4 4 23 563 292;4800;7587;8738;9309;11204 True;True;True;True;True;True 308;5001;7966;9166;9765;11739 1298;18256;18257;18258;18259;18260;18261;29115;29116;29117;29118;33338;33339;33340;33341;33342;33343;33344;35671;35672;43139;43140;43141 1300;18373;18374;18375;18376;18377;18378;29298;29299;29300;29301;33538;33539;33540;33541;33542;33543;33544;35879;35880;43436;43437;43438 1300;18376;29300;33538;35880;43437 -1
YGR178C YGR178C 10 10 10 YGR178C pep chromosome:R64-1-1:VII:851047:853215:-1 gene:YGR178C transcript:YGR178C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PBP1 description:Component of glucose deprivation induced stress granules; involved in P-body 1 10 10 10 5 2 4 5 5 6 5 2 4 5 5 6 5 2 4 5 5 6 20.6 20.6 20.6 78.78 722 722 0 60.436 11.1 4 7.3 9.7 8.9 11.5 244850000 37962000 10347000 85273000 16184000 17420000 77662000 44512000 41072000 56988000 39855000 53198000 55205000 5 2 4 5 5 6 27 564 460;1716;2848;3020;8976;9689;10054;10727;10785;11848 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 487;1783;2948;3128;9417;10162;10545;11241;11303;12407 2005;6817;10804;10805;10806;10807;11411;34211;34212;34213;34214;34215;37120;38558;38559;41207;41208;41209;41210;41211;41212;41507;41508;41509;41510;45830;45831 2011;6857;10872;10873;10874;10875;11490;34417;34418;34419;34420;34421;37339;38791;38792;41460;41461;41462;41463;41464;41465;41770;41771;41772;41773;46146;46147 2011;6857;10872;11490;34420;37339;38792;41464;41771;46146 -1
YGR180C YGR180C 2 2 2 YGR180C pep chromosome:R64-1-1:VII:855264:856301:-1 gene:YGR180C transcript:YGR180C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RNR4 description:Ribonucleotide-diphosphate reductase (RNR) small subunit; the RNR complex ca 1 2 2 2 1 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 8.7 8.7 8.7 40.054 345 345 0 5.1093 2.6 0 8.7 0 0 0 25244000 6014800 0 19230000 0 0 0 0 0 11331000 0 0 0 1 0 2 0 0 0 3 565 4177;7063 True;True 4347;7367 15887;27018;27019 15996;27180;27181 15996;27180 -1
YGR185C YGR185C 34 34 34 YGR185C pep chromosome:R64-1-1:VII:866336:867520:-1 gene:YGR185C transcript:YGR185C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TYS1 description:Cytoplasmic tyrosyl-tRNA synthetase; required for cytoplasmic protein synthe 1 34 34 34 21 21 23 22 22 20 21 21 23 22 22 20 21 21 23 22 22 20 81.7 81.7 81.7 44.019 394 394 0 229.46 65 53.8 56.3 61.2 52 62.4 7036900000 869330000 809290000 1816400000 1069100000 550790000 1922100000 1269700000 1978200000 1358900000 1751000000 1624200000 1781900000 33 30 31 37 30 29 190 566 213;214;291;432;675;2266;2295;2754;3468;3848;3849;3992;3993;4070;4071;4469;5110;5124;5492;6070;6682;6683;6697;7016;7238;7239;7613;7702;7703;7704;9074;9547;10448;12385 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 223;224;305;306;307;458;713;2348;2377;2850;2851;3600;4005;4006;4155;4156;4236;4237;4660;5320;5334;5728;6321;6962;6963;6977;7305;7306;7583;7584;7585;7586;7993;8088;8089;8090;9518;10016;10955;12960 925;926;1285;1286;1287;1288;1289;1290;1291;1292;1293;1294;1295;1296;1297;1893;1894;1895;1896;1897;1898;1899;2832;2833;8638;8639;8640;8641;8642;8736;8737;8738;8739;8740;8741;8742;8743;8744;10429;10430;10431;10432;10433;10434;10435;10436;10437;10438;10439;10440;10441;10442;10443;10444;10445;13196;13197;13198;13199;13200;13201;14629;14630;14631;14632;14633;14634;14635;14636;15174;15175;15176;15177;15178;15179;15180;15181;15182;15183;15184;15185;15475;15476;15477;15478;15479;15480;15481;15482;15483;15484;17023;17024;17025;19519;19520;19521;19522;19523;19524;19561;21161;21162;21163;23298;23299;25492;25493;25494;25495;25496;25497;25498;25499;25500;25501;25502;25503;25504;25547;25548;26807;26808;26809;27726;27727;27728;27729;27730;27731;27732;27733;27734;27735;27736;27737;27738;27739;27740;27741;27742;27743;27744;27745;27746;27747;27748;27749;29211;29510;29511;29512;29513;29514;29515;29516;29517;29518;29519;29520;29521;29522;29523;29524;29525;29526;29527;29528;29529;29530;29531;34719;34720;36613;36614;36615;40032;40033;40034;40035;40036;40037;40038;40039;40040;40041;40042;40043;47914;47915;47916 927;928;1287;1288;1289;1290;1291;1292;1293;1294;1295;1296;1297;1298;1299;1899;1900;1901;1902;1903;1904;1905;2841;2842;8683;8684;8685;8686;8687;8781;8782;8783;8784;8785;8786;8787;8788;8789;10493;10494;10495;10496;10497;10498;10499;10500;10501;10502;10503;10504;10505;10506;10507;10508;10509;13285;13286;13287;13288;13289;13290;14730;14731;14732;14733;14734;14735;14736;14737;14738;15281;15282;15283;15284;15285;15286;15287;15288;15289;15290;15291;15292;15583;15584;15585;15586;15587;15588;15589;15590;15591;15592;17137;17138;17139;19642;19643;19644;19645;19646;19647;19684;21288;21289;21290;23434;23435;25646;25647;25648;25649;25650;25651;25652;25653;25654;25655;25656;25657;25658;25701;25702;26968;26969;26970;27899;27900;27901;27902;27903;27904;27905;27906;27907;27908;27909;27910;27911;27912;27913;27914;27915;27916;27917;27918;27919;27920;27921;27922;29394;29694;29695;29696;29697;29698;29699;29700;29701;29702;29703;29704;29705;29706;29707;29708;29709;29710;29711;29712;29713;29714;29715;34927;34928;36830;36831;36832;40269;40270;40271;40272;40273;40274;40275;40276;40277;40278;40279;40280;40281;48246;48247;48248 927;928;1296;1902;2841;8686;8783;10509;13288;14731;14738;15285;15292;15586;15589;17138;19647;19684;21289;23434;25646;25651;25702;26970;27900;27919;29394;29694;29699;29710;34927;36831;40281;48246 291;292;293;294;295 60;135;215;218;228 -1
YGR186W YGR186W 5 5 5 YGR186W pep chromosome:R64-1-1:VII:867774:869981:1 gene:YGR186W transcript:YGR186W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TFG1 description:TFIIF (Transcription Factor II) largest subunit; involved in both transcripti 1 5 5 5 2 2 1 4 0 1 2 2 1 4 0 1 2 2 1 4 0 1 6.7 6.7 6.7 82.193 735 735 0 10.962 3 3 1.1 6.3 0 1.1 46281000 11803000 6206700 9940300 12156000 0 6174500 15240000 13641000 0 0 0 0 2 2 1 4 0 1 10 567 3587;3588;4463;7705;11166 True;True;True;True;True 3730;3731;4654;8091;11701 13701;13702;13703;16990;29532;29533;29534;29535;29536;42980 13792;13793;13794;17104;29716;29717;29718;29719;29720;43277 13792;13794;17104;29720;43277 -1
YGR192C YGR192C 40 40 10 YGR192C pep chromosome:R64-1-1:VII:882812:883810:-1 gene:YGR192C transcript:YGR192C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TDH3 description:Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), isozyme 3; involved in gly 1 40 40 10 32 33 28 32 37 24 32 33 28 32 37 24 8 8 5 9 10 7 91.9 91.9 45.5 35.746 332 332 0 247.67 89.5 87.3 80.4 91.9 91.9 83.1 27312000000 4759000000 4983600000 6458000000 3944000000 3440700000 3726200000 5142300000 8843400000 4417900000 7286200000 9774000000 3937800000 54 66 45 69 66 47 347 568 1367;1819;1820;1821;2026;2027;3550;3551;3762;3763;3793;3795;3796;4845;5098;5416;5417;6073;6387;6388;6773;6774;6775;6934;9951;10679;10680;10804;11125;11298;11429;11430;11480;11637;11638;11665;11666;11880;11881;11927 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1425;1888;1889;1890;2103;2104;3688;3689;3910;3911;3912;3943;3945;3946;5048;5308;5645;5646;5647;5648;5649;5650;6324;6653;6654;7054;7055;7056;7057;7058;7222;10440;11190;11191;11323;11656;11657;11835;11966;11967;12021;12186;12187;12214;12215;12216;12217;12218;12219;12442;12443;12490 5485;7144;7145;7146;7147;7148;7149;7150;7151;7152;7725;7726;7727;7728;7729;7730;7731;7732;13533;13534;13535;13536;13537;13538;13539;13540;14290;14291;14292;14293;14294;14295;14296;14297;14298;14299;14300;14301;14302;14303;14304;14305;14306;14307;14308;14309;14310;14311;14312;14313;14314;14315;14316;14317;14318;14319;14320;14321;14322;14323;14410;14411;14412;14413;14414;14415;14419;14420;14421;14422;14423;14424;14425;14426;14427;14428;14429;14430;14431;14432;14433;14434;14435;14436;14437;18411;18412;18413;18414;18415;18416;18417;18418;18419;18420;18421;18422;19480;19481;19482;19483;19484;20787;20788;20789;20790;20791;20792;20793;20794;20795;20796;20797;20798;20799;20800;20801;20802;20803;20804;20805;20806;20807;20808;20809;20810;20811;20812;20813;20814;20815;23304;23305;23306;23307;23308;24384;24385;24386;24387;24388;24389;24390;24391;24392;24393;24394;24395;24396;24397;25877;25878;25879;25880;25881;25882;25883;25884;25885;25886;25887;25888;25889;25890;25891;25892;26526;26527;26528;26529;26530;26531;26532;26533;26534;26535;38200;38201;38202;38203;38204;38205;38206;38207;38208;38209;40900;40901;40902;40903;40904;40905;40906;40907;40908;40909;40910;40911;40912;40913;41578;41579;41580;41581;41582;42817;42818;42819;42820;42821;42822;42823;42824;42825;42826;42827;42828;42829;42830;42831;42832;42833;42834;42835;42836;42837;42838;42839;42840;42841;42842;42843;42844;42845;43570;43571;43572;44136;44137;44138;44139;44140;44141;44142;44143;44144;44145;44146;44147;44148;44149;44341;44342;44343;44344;44345;44346;44347;44348;44349;44350;44351;44966;44967;44968;44969;44970;44971;44972;44973;44974;44975;44976;44977;44978;44979;44980;44981;44982;44983;44984;44985;44986;44987;45102;45103;45104;45105;45106;45107;45108;45109;45110;45111;45112;45113;45114;45115;45116;45117;45118;45119;45120;45121;45122;45123;45124;45125;45126;45127;45128;45129;45130;45131;45132;45133;45134;45135;45136;45137;45138;45944;45945;45946;45947;45948;45949;45950;45951;45952;45953;45954;45955;45956;45957;45958;45959;45960;45961;45962;45963;46147;46148;46149;46150 5520;7184;7185;7186;7187;7188;7189;7190;7191;7192;7767;7768;7769;7770;7771;7772;7773;7774;13622;13623;13624;13625;13626;13627;13628;13629;14388;14389;14390;14391;14392;14393;14394;14395;14396;14397;14398;14399;14400;14401;14402;14403;14404;14405;14406;14407;14408;14409;14410;14411;14412;14413;14414;14415;14416;14417;14418;14419;14420;14421;14509;14510;14511;14512;14513;14514;14518;14519;14520;14521;14522;14523;14524;14525;14526;14527;14528;14529;14530;14531;14532;14533;14534;14535;14536;18528;18529;18530;18531;18532;18533;18534;18535;18536;18537;18538;18539;18540;19603;19604;19605;19606;19607;20914;20915;20916;20917;20918;20919;20920;20921;20922;20923;20924;20925;20926;20927;20928;20929;20930;20931;20932;20933;20934;20935;20936;20937;20938;20939;20940;20941;20942;23440;23441;23442;23443;23444;23445;24532;24533;24534;24535;24536;24537;24538;24539;24540;24541;24542;24543;24544;24545;26034;26035;26036;26037;26038;26039;26040;26041;26042;26043;26044;26045;26046;26047;26048;26049;26686;26687;26688;26689;26690;26691;26692;26693;26694;26695;38432;38433;38434;38435;38436;38437;38438;38439;38440;38441;41147;41148;41149;41150;41151;41152;41153;41154;41155;41156;41157;41158;41159;41160;41841;41842;41843;41844;41845;43112;43113;43114;43115;43116;43117;43118;43119;43120;43121;43122;43123;43124;43125;43126;43127;43128;43129;43130;43131;43132;43133;43134;43135;43136;43137;43138;43139;43140;43141;43142;43869;43870;43871;44435;44436;44437;44438;44439;44440;44441;44442;44443;44444;44445;44446;44447;44448;44449;44450;44451;44452;44453;44647;44648;44649;44650;44651;44652;44653;44654;44655;44656;44657;45274;45275;45276;45277;45278;45279;45280;45281;45282;45283;45284;45285;45286;45287;45288;45289;45290;45291;45292;45293;45294;45295;45296;45297;45413;45414;45415;45416;45417;45418;45419;45420;45421;45422;45423;45424;45425;45426;45427;45428;45429;45430;45431;45432;45433;45434;45435;45436;45437;45438;45439;45440;45441;45442;45443;45444;45445;45446;45447;45448;45449;45450;46260;46261;46262;46263;46264;46265;46266;46267;46268;46269;46270;46271;46272;46273;46274;46275;46276;46277;46278;46279;46464;46465;46466;46467 5520;7184;7186;7191;7767;7771;13626;13629;14395;14420;14512;14526;14531;18533;19606;20921;20933;23444;24532;24541;26037;26046;26049;26686;38434;41147;41156;41841;43134;43871;44449;44451;44652;45284;45290;45426;45438;46261;46271;46467 296;297;298;299;300 44;128;131;173;229 -1
YGR202C YGR202C 5 5 5 YGR202C pep chromosome:R64-1-1:VII:903474:904748:-1 gene:YGR202C transcript:YGR202C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PCT1 description:Cholinephosphate cytidylyltransferase; a rate-determining enzyme of the CDP- 1 5 5 5 1 1 3 2 1 2 1 1 3 2 1 2 1 1 3 2 1 2 18.4 18.4 18.4 49.406 424 424 0 10.213 2.1 2.8 11.8 7.3 2.8 8 41819000 2104400 3412000 17732000 5245000 1874700 11450000 0 0 8718300 0 0 13181000 1 1 3 2 1 2 10 569 187;4883;8115;10453;11851 True;True;True;True;True 197;5087;8523;10960;12410 819;18576;31080;40052;40053;40054;40055;40056;45834;45835 821;18694;31273;40290;40291;40292;40293;40294;46150;46151 821;18694;31273;40291;46151 -1
YGR204W YGR204W 9 9 9 YGR204W pep chromosome:R64-1-1:VII:905934:908774:1 gene:YGR204W transcript:YGR204W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ADE3 description:Cytoplasmic trifunctional enzyme C1-tetrahydrofolate synthase; involved in si 1 9 9 9 5 3 3 2 3 3 5 3 3 2 3 3 5 3 3 2 3 3 14 14 14 102.2 946 946 0 22.134 7.6 4 4 3.1 4.4 4.8 116450000 25510000 13229000 46736000 6687900 7828700 16456000 25157000 32696000 30813000 0 26772000 0 5 3 3 2 3 3 19 570 6002;6309;6373;7295;8201;8783;9296;10740;12066 True;True;True;True;True;True;True;True;True 6253;6570;6639;7658;8614;9214;9752;11254;12629 23017;24130;24131;24132;24133;24134;24326;24327;24328;28004;31368;33499;33500;33501;33502;35625;41275;41276;46733 23152;24275;24276;24277;24278;24279;24474;24475;24476;28178;31563;33699;33700;33701;33702;35833;41529;41530;47058 23152;24276;24475;28178;31563;33701;35833;41530;47058 -1
YGR207C YGR207C 4 4 4 YGR207C pep chromosome:R64-1-1:VII:910843:911628:-1 gene:YGR207C transcript:YGR207C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CIR1 description:Mitochondrial protein that interacts with frataxin (Yfh1p); putative ortholo 1 4 4 4 0 4 0 2 2 0 0 4 0 2 2 0 0 4 0 2 2 0 19.9 19.9 19.9 28.758 261 261 0 12.079 0 19.9 0 10 12.6 0 16042000 0 10202000 0 3704700 2135700 0 0 16260000 0 9354300 11198000 0 0 4 0 2 2 0 8 571 2623;5622;6437;11627 True;True;True;True 2717;5859;6707;12176 9902;9903;9904;21586;21587;24614;24615;44931 9953;9954;9955;21713;21714;24763;24764;45239 9955;21714;24764;45239 -1
YGR211W YGR211W 3 3 3 YGR211W pep chromosome:R64-1-1:VII:915241:916701:1 gene:YGR211W transcript:YGR211W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ZPR1 description:Essential protein with two zinc fingers; present in nucleus of growing cells, 1 3 3 3 0 1 2 1 1 2 0 1 2 1 1 2 0 1 2 1 1 2 9.9 9.9 9.9 55.071 486 486 0 5.7648 0 5.3 7.8 5.3 5.3 7.4 47657000 0 3153400 26441000 3912500 2073500 12077000 0 0 0 0 0 12077000 0 1 2 1 1 2 7 572 2715;6239;11044 True;True;True 2809;6497;11571 10241;23897;42499;42500;42501;42502;42503 10295;24042;42794;42795;42796;42797;42798 10295;24042;42798 -1
YGR215W YGR215W 2 2 2 YGR215W pep chromosome:R64-1-1:VII:922175:922507:1 gene:YGR215W transcript:YGR215W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSM27 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit [Source:SGD;Acc:S000003 1 2 2 2 0 1 2 1 0 2 0 1 2 1 0 2 0 1 2 1 0 2 25.5 25.5 25.5 12.392 110 110 0 13.187 0 14.5 25.5 10.9 0 25.5 31476000 0 928040 16112000 2003800 0 12432000 0 0 10562000 0 0 11364000 0 1 2 1 0 2 6 573 3944;10415 True;True 4104;10917 15013;15014;15015;39920;39921;39922;39923 15119;15120;15121;40157;40158;40159;40160 15120;40160 -1
YGR218W YGR218W 6 6 6 YGR218W pep chromosome:R64-1-1:VII:932541:935795:1 gene:YGR218W transcript:YGR218W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CRM1 description:Major karyopherin; involved in export of proteins, RNAs, and ribosomal subuni 1 6 6 6 3 4 3 1 1 1 3 4 3 1 1 1 3 4 3 1 1 1 6.1 6.1 6.1 124.1 1084 1084 0 13.854 3.4 4.4 3.1 1.4 1.4 1.4 67568000 6820600 21929000 27936000 3201500 2050700 5629900 14634000 36349000 21954000 0 0 0 3 4 3 1 1 1 13 574 1980;2552;4023;6862;8790;10612 True;True;True;True;True;True 2055;2641;4187;7149;9222;11120 7586;7587;9609;15290;15291;26236;33541;40612;40613;40614;40615;40616;40617 7628;7629;9658;15398;15399;26394;33741;40855;40856;40857;40858;40859;40860 7628;9658;15399;26394;33741;40855 -1
YGR220C YGR220C 2 2 2 YGR220C pep chromosome:R64-1-1:VII:936074:936883:-1 gene:YGR220C transcript:YGR220C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL9 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit [Source:SGD;Acc:S00000 1 2 2 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 10 10 10 29.79 269 269 0 5.3136 0 0 0 5.2 0 10 28383000 0 0 0 2213100 0 26170000 0 0 0 0 0 26170000 0 0 0 1 0 2 3 575 3535;11271 True;True 3672;11808 13462;43432;43433 13551;43730;43731 13551;43731 -1
YGR223C YGR223C 1 1 1 YGR223C pep chromosome:R64-1-1:VII:940869:942215:-1 gene:YGR223C transcript:YGR223C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HSV2 description:Phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate-binding protein; plays a role in micro 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 2.5 2.5 2.5 51.235 448 448 0.001581 2.6801 0 2.5 0 0 0 0 1718400 0 1718400 0 0 0 0 0 2581000 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 576 4292 True 4468 16313;16314 16422;16423 16422 -1
YGR231C YGR231C 6 6 6 YGR231C pep chromosome:R64-1-1:VII:952548:953480:-1 gene:YGR231C transcript:YGR231C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PHB2 description:Subunit of the prohibitin complex (Phb1p-Phb2p); prohibitin is a 1.2 MDa rin 1 6 6 6 4 3 4 4 2 4 4 3 4 4 2 4 4 3 4 4 2 4 28.4 28.4 28.4 34.406 310 310 0 32.262 20 13.9 21 21 8.4 18.7 167700000 40531000 12168000 72184000 21997000 5889700 14930000 35093000 42605000 27378000 28968000 40026000 27452000 4 4 5 4 2 4 23 577 3974;4248;8112;8671;11116;11319 True;True;True;True;True;True 4134;4422;8520;9096;11647;11856 15112;15113;15114;16147;31076;33048;33049;33050;33051;33052;33053;42796;42797;42798;42799;42800;42801;43648;43649;43650;43651;43652;43653 15219;15220;15221;16256;31269;33246;33247;33248;33249;33250;33251;43091;43092;43093;43094;43095;43096;43947;43948;43949;43950;43951;43952 15219;16256;31269;33251;43092;43950 301 241 -1
YGR233C YGR233C 2 2 2 YGR233C pep chromosome:R64-1-1:VII:954674:958210:-1 gene:YGR233C transcript:YGR233C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PHO81 description:Cyclin-dependent kinase (CDK) inhibitor; regulates Pho80p-Pho85p and Pcl7p- 1 2 2 2 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 2.1 2.1 2.1 134.03 1178 1178 0 7.4377 1 0 1.1 1 0 0 7813600 2634500 0 3310700 1868400 0 0 0 0 0 3843500 0 0 1 0 1 1 0 0 3 578 4739;5732 True;True 4936;5973 18023;21959;21960 18139;22089;22090 18139;22090 -1
YGR234W YGR234W 8 8 8 YGR234W pep chromosome:R64-1-1:VII:959904:961103:1 gene:YGR234W transcript:YGR234W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YHB1 description:Nitric oxide oxidoreductase; flavohemoglobin that plays role in oxidative and 1 8 8 8 3 3 4 3 5 3 3 3 4 3 5 3 3 3 4 3 5 3 33.8 33.8 33.8 44.646 399 399 0 38.46 16.8 11 15.8 16.8 23.1 16.8 250070000 28799000 19202000 99464000 38277000 14086000 50241000 30114000 70598000 71520000 64128000 36488000 40587000 3 3 4 4 5 3 22 579 888;2291;3721;6609;7293;7529;7740;10986 True;True;True;True;True;True;True;True 931;2373;3867;6886;7656;7907;8134;11512 3681;3682;3683;3684;3685;3686;8722;8723;8724;8725;14136;25255;27999;28923;29766;42286;42287;42288;42289;42290;42291;42292 3694;3695;3696;3697;3698;3699;8767;8768;8769;8770;14233;25409;28173;29106;29951;42581;42582;42583;42584;42585;42586;42587 3698;8769;14233;25409;28173;29106;29951;42581 302 32 -1
YGR237C YGR237C 2 2 2 YGR237C pep chromosome:R64-1-1:VII:963298:965655:-1 gene:YGR237C transcript:YGR237C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localize 1 2 2 2 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 2.4 2.4 2.4 89.24 785 785 0 3.7368 0 1.1 1.1 1.1 1.3 0 4938600 0 1215000 2757600 965950 0 0 0 0 0 1987100 0 0 0 1 1 1 1 0 4 580 4543;6564 True;True 4737;6840 17324;25067;25068;25069 17438;25217;25218;25219 17438;25219 -1
YGR240C YGR240C 32 32 31 YGR240C pep chromosome:R64-1-1:VII:970771:973734:-1 gene:YGR240C transcript:YGR240C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PFK1 description:Alpha subunit of heterooctameric phosphofructokinase; involved in glycolysis 1 32 32 31 19 18 18 18 13 21 19 18 18 18 13 21 18 17 17 17 12 20 41.4 41.4 40.5 107.97 987 987 0 247.27 28.4 25.7 24.8 24.5 17.8 28.4 1457500000 293270000 139650000 542150000 124740000 66484000 291220000 353980000 292530000 287020000 293500000 269880000 276180000 21 19 20 20 14 23 117 581 145;203;827;937;1887;2321;2671;2976;3446;3508;3529;3530;3804;3813;3844;3845;6375;7219;7230;7409;7410;7617;9053;9762;9763;9924;9925;10114;10200;11585;11804;11826 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 151;213;869;980;1958;2405;2765;3082;3574;3642;3666;3667;3954;3964;4001;4002;6641;7562;7573;7574;7779;7780;7997;9497;10238;10239;10411;10412;10606;10696;12131;12363;12385 631;632;633;634;874;875;876;877;878;879;3445;3446;3447;3448;3449;3450;3912;3913;3914;3915;3916;3917;3918;3919;3920;3921;3922;3923;7328;8849;8850;8851;10075;10076;10077;11254;13068;13069;13070;13071;13072;13343;13344;13345;13346;13449;13450;14464;14465;14466;14467;14468;14496;14497;14498;14615;14616;14617;14618;14619;14620;14621;14622;14623;14624;24334;24335;24336;24337;27678;27679;27705;27706;28432;28433;28434;28435;28436;28437;28438;28439;28440;29219;29220;29221;29222;29223;29224;34648;34649;37398;37399;37400;37401;37402;37403;37404;37405;37406;38102;38103;38104;38775;38776;39141;44768;44769;44770;44771;44772;45709;45710;45711;45712;45713;45714;45766;45767;45768 632;633;634;635;876;877;878;879;880;881;3458;3459;3460;3461;3462;3463;3927;3928;3929;3930;3931;3932;3933;3934;3935;3936;3937;3938;7369;8894;8895;8896;10128;10129;10130;11332;13156;13157;13158;13159;13160;13432;13433;13434;13435;13538;13539;14563;14564;14565;14566;14567;14595;14596;14597;14716;14717;14718;14719;14720;14721;14722;14723;14724;14725;24482;24483;24484;24485;27851;27852;27878;27879;28610;28611;28612;28613;28614;28615;28616;28617;28618;29402;29403;29404;29405;29406;29407;34856;34857;37620;37621;37622;37623;37624;37625;37626;37627;37628;38333;38334;38335;39010;39011;39376;45074;45075;45076;45077;45078;46025;46026;46027;46028;46029;46030;46082;46083;46084 632;876;3459;3934;7369;8895;10129;11332;13156;13434;13538;13539;14567;14596;14718;14725;24484;27852;27878;28617;28618;29405;34857;37624;37628;38333;38334;39010;39376;45074;46025;46083 -1
YGR241C YGR241C 1 1 1 YGR241C pep chromosome:R64-1-1:VII:974875:976581:-1 gene:YGR241C transcript:YGR241C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YAP1802 description:Protein of the AP180 family, involved in clathrin cage assembly; binds Pa 1 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 2.3 2.3 2.3 64.328 568 568 0.0015361 2.4006 0 2.3 0 2.3 0 0 6016000 0 4132300 0 1883700 0 0 0 0 0 3874900 0 0 0 1 0 1 0 0 2 582 12336 True 12909 47729;47730 48061;48062 48062 -1
YGR245C YGR245C 13 13 13 YGR245C pep chromosome:R64-1-1:VII:979765:982068:-1 gene:YGR245C transcript:YGR245C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SDA1 description:Protein required for actin organization and passage through Start; highly co 1 13 13 13 8 8 3 8 7 8 8 8 3 8 7 8 8 8 3 8 7 8 21.3 21.3 21.3 86.617 767 767 0 117.69 15.9 12.9 6.9 15.8 11.5 11.2 510990000 185660000 86298000 34364000 74212000 35623000 94837000 182050000 188740000 47956000 113890000 162610000 119980000 9 10 3 10 7 8 47 583 57;673;674;1613;4196;4378;5096;5114;6514;7498;7499;9247;9734 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 59;711;712;1676;4368;4557;5306;5324;6790;7874;7875;9700;10210 238;239;240;241;2819;2820;2821;2822;2823;2824;2825;2826;2827;2828;2829;2830;2831;6389;6390;6391;6392;15959;15960;15961;15962;15963;16619;16620;19474;19475;19476;19477;19530;19531;19532;24873;24874;28800;28801;28802;35465;35466;35467;37306;37307;37308;37309 239;240;241;242;2828;2829;2830;2831;2832;2833;2834;2835;2836;2837;2838;2839;2840;6425;6426;6427;6428;16068;16069;16070;16071;16072;16729;16730;19597;19598;19599;19600;19653;19654;19655;25023;25024;28980;28981;28982;35673;35674;35675;37528;37529;37530;37531 240;2831;2837;6428;16071;16730;19597;19653;25024;28980;28982;35674;37531 303 9 -1
YGR253C YGR253C 4 4 4 YGR253C pep chromosome:R64-1-1:VII:998358:999140:-1 gene:YGR253C transcript:YGR253C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PUP2 description:Alpha 5 subunit of the 20S proteasome; involved in ubiquitin-dependent catab 1 4 4 4 0 0 3 1 0 1 0 0 3 1 0 1 0 0 3 1 0 1 16.9 16.9 16.9 28.617 260 260 0 10.818 0 0 13.1 3.8 0 5 48758000 0 0 38557000 1352800 0 8848500 0 0 22720000 0 0 0 0 0 3 1 0 1 5 584 882;2261;3431;5873 True;True;True;True 925;2343;3557;6118 3655;3656;8617;13022;22496 3668;3669;8662;13109;22630 3669;8662;13109;22630 -1
YGR254W YGR254W 14 2 2 YGR254W pep chromosome:R64-1-1:VII:1000927:1002240:1 gene:YGR254W transcript:YGR254W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ENO1 description:Enolase I, a phosphopyruvate hydratase; catalyzes conversion of 2-phosphogl 1 14 2 2 11 3 8 5 9 8 1 0 0 0 1 2 1 0 0 0 1 2 44.2 7.8 7.8 46.816 437 437 0 4.1196 33.6 13.5 29.7 22 29.1 32.5 21177000 4488100 0 0 0 2380400 14308000 0 0 0 0 0 14308000 1 0 0 0 1 1 3 585 14;3208;3209;3786;3882;4037;4058;4929;7969;8654;8946;9111;11393;11978 False;False;False;False;True;False;False;False;True;False;False;False;False;False 16;3322;3323;3935;4039;4202;4224;5135;8372;9079;9386;9557;11930;12541 63;64;65;66;67;12093;12094;12095;12096;12097;12098;12099;14392;14766;15336;15431;15432;15433;18768;18769;30564;30565;30566;32970;32971;32972;32973;34111;34847;34848;34849;34850;34851;34852;44002;44003;44004;44005;46336;46337;46338;46339;46340;46341;46342;46343;46344;46345;46346;46347 63;64;65;66;67;12178;12179;12180;12181;12182;12183;12184;14491;14868;15444;15539;15540;15541;18889;18890;30754;30755;30756;33168;33169;33170;33171;34316;35055;35056;35057;35058;35059;35060;44301;44302;44303;44304;46656;46657;46658;46659;46660;46661;46662;46663;46664;46665;46666;46667 66;12180;12182;14491;14868;15444;15540;18890;30756;33169;34316;35056;44301;46658 -1
YGR261C YGR261C 13 13 13 YGR261C pep chromosome:R64-1-1:VII:1014321:1016750:-1 gene:YGR261C transcript:YGR261C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:APL6 description:Beta3-like subunit of the yeast AP-3 complex; functions in transport of al 1 13 13 13 8 5 8 5 1 2 8 5 8 5 1 2 8 5 8 5 1 2 21.5 21.5 21.5 91.606 809 809 0 64.093 14.7 10.9 10.9 9.6 1.9 3.1 176280000 45341000 17676000 72957000 19771000 2975000 17556000 55835000 31598000 45743000 38451000 0 27156000 9 5 7 5 1 2 29 586 2125;2318;5705;5801;5962;6015;6301;6550;6551;6771;7132;8925;9314 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2205;2402;5946;6044;6213;6266;6562;6826;6827;7052;7446;9362;9770 8127;8128;8839;8840;21868;22231;22232;22233;22875;22876;23067;23068;24099;24100;24101;25006;25007;25008;25009;25010;25011;25871;25872;25873;25874;27265;27266;34014;35693;35694 8169;8170;8884;8885;21998;22361;22362;22363;23010;23011;23203;23204;24244;24245;24246;25156;25157;25158;25159;25160;25161;26028;26029;26030;26031;27430;27431;34216;35901;35902 8169;8884;21998;22362;23010;23203;24244;25156;25160;26030;27431;34216;35902 304 613 -1
YGR264C YGR264C 30 30 30 YGR264C pep chromosome:R64-1-1:VII:1019598:1021853:-1 gene:YGR264C transcript:YGR264C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MES1 description:Methionyl-tRNA synthetase; forms a complex with glutamyl-tRNA synthetase ( 1 30 30 30 17 13 22 16 11 18 17 13 22 16 11 18 17 13 22 16 11 18 54.6 54.6 54.6 85.677 751 751 0 138.9 30.8 23.7 40.3 31.6 20.4 33 2224800000 252120000 289390000 819700000 231190000 84920000 547450000 304700000 666380000 441470000 537820000 326770000 457920000 18 17 22 18 14 18 107 587 150;463;774;1042;1156;1208;1335;1409;1873;3210;3388;3755;3831;4524;5093;5396;6434;7176;7557;7677;7771;7926;8909;10240;10653;11522;11780;12278;12358;12389 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 157;490;815;1090;1207;1259;1390;1467;1944;3324;3513;3903;3986;4717;5303;5624;6704;7506;7935;8060;8061;8167;8326;9345;10738;11162;12064;12339;12849;12931;12964 661;662;2009;2010;2011;2012;2013;3237;3238;4354;4710;4890;5368;5369;5370;5371;5634;5635;5636;5637;5638;5639;5640;5641;5642;7296;7297;7298;7299;12100;12845;12846;12847;12848;12849;12850;12851;12852;12853;12854;14271;14272;14273;14274;14275;14276;14559;14560;14561;17236;17237;17238;17239;17240;17241;17242;17243;19461;19462;19463;20667;20668;20669;24597;24598;24599;24600;24601;24602;27495;28992;28993;29412;29413;29414;29415;29416;29417;29418;29419;29420;29421;29872;29873;29874;29875;30410;30411;30412;33968;33969;33970;33971;39284;39285;40754;40755;40756;40757;44497;44498;44499;45634;47506;47507;47508;47509;47510;47799;47924;47925 662;663;2015;2016;2017;2018;2019;3248;3249;4377;4736;4916;5403;5404;5405;5406;5669;5670;5671;5672;5673;5674;5675;5676;5677;7337;7338;7339;7340;12185;12932;12933;12934;12935;12936;12937;12938;12939;12940;12941;14369;14370;14371;14372;14373;14374;14658;14659;14660;17350;17351;17352;17353;17354;17355;17356;17357;19584;19585;19586;20794;20795;20796;24746;24747;24748;24749;24750;24751;27667;29175;29176;29596;29597;29598;29599;29600;29601;29602;29603;29604;29605;30059;30060;30061;30062;30599;30600;30601;34170;34171;34172;34173;39520;39521;40997;40998;40999;41000;44803;44804;44805;45949;47837;47838;47839;47840;47841;48131;48256;48257 663;2016;3248;4377;4736;4916;5406;5669;7337;12185;12938;14373;14658;17355;19586;20796;24750;27667;29176;29603;30060;30599;34171;39520;40999;44805;45949;47837;48131;48256 305;306 47;69 -1
YGR266W YGR266W 1 1 1 YGR266W pep chromosome:R64-1-1:VII:1022656:1024761:1 gene:YGR266W transcript:YGR266W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Protein of unknown function; predicted to contain a single transmembrane domain; mutant has 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 2.1 2.1 2.1 81.19 701 701 0.0093391 1.7372 0 0 0 0 2.1 0 710220 0 0 0 0 710220 0 0 0 0 0 2348200 0 0 0 0 0 1 0 1 588 10992 True 11518 42308 42603 42603 -1
YGR270W YGR270W 3 3 3 YGR270W pep chromosome:R64-1-1:VII:1027370:1031509:1 gene:YGR270W transcript:YGR270W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YTA7 description:Protein that localizes to chromatin; has a role in regulation of histone ge 1 3 3 3 1 2 1 0 3 1 1 2 1 0 3 1 1 2 1 0 3 1 2.1 2.1 2.1 157.41 1379 1379 0 13.526 0.7 2 1.4 0 2.1 1.4 19281000 2443200 3305800 4887600 0 4506200 4138100 0 8762100 0 0 13308000 0 1 2 1 0 3 1 8 589 5752;8552;10447 True;True;True 5993;8976;10954 22021;22022;22023;22024;32620;40029;40030;40031 22151;22152;22153;22154;32816;40266;40267;40268 22154;32816;40266 -1
YGR271C-A YGR271C-A 2 2 2 YGR271C-A pep chromosome:R64-1-1:VII:1037800:1038501:-1 gene:YGR271C-A transcript:YGR271C-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EFG1 description:Essential protein required for maturation of 18S rRNA; null mutant i 1 2 2 2 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 13.3 13.3 13.3 27.121 233 233 0 31.876 0 13.3 0 6.4 0 0 10740000 0 8416200 0 2324000 0 0 0 18256000 0 0 0 0 0 2 0 1 0 0 3 590 1814;12038 True;True 1883;12601 7128;46635;46636 7168;46956;46957 7168;46956 -1
YGR271W YGR271W 9 9 9 YGR271W pep chromosome:R64-1-1:VII:1031791:1037694:1 gene:YGR271W transcript:YGR271W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SLH1 description:Putative RNA helicase related to Ski2p; involved in translation inhibition 1 9 9 9 4 1 7 2 2 4 4 1 7 2 2 4 4 1 7 2 2 4 6.7 6.7 6.7 224.85 1967 1967 0 19.305 2.7 0.5 5.3 1.4 0.9 3.3 98696000 17445000 2842400 54566000 3738200 4584700 15519000 13948000 0 29834000 12221000 18099000 19205000 4 1 7 2 2 4 20 591 263;1927;2678;4088;4657;6306;6953;10244;10894 True;True;True;True;True;True;True;True;True 275;2000;2772;4254;4854;6567;7241;10742;11415 1152;1153;7422;10103;10104;10105;10106;10107;15549;15550;17737;24120;24121;24122;26595;26596;39297;41884;41885;41886 1154;1155;7463;10157;10158;10159;10160;10161;15657;15658;17852;24265;24266;24267;26755;26756;39533;42148;42149;42150 1155;7463;10161;15658;17852;24265;26755;39533;42150 -1
YGR274C YGR274C 4 4 4 YGR274C pep chromosome:R64-1-1:VII:1039895:1043095:-1 gene:YGR274C transcript:YGR274C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TAF1 description:TFIID subunit, involved in RNA pol II transcription initiation; possesses 1 4 4 4 1 1 3 2 1 2 1 1 3 2 1 2 1 1 3 2 1 2 5.4 5.4 5.4 120.69 1066 1066 0 21.266 1 1 4.4 3.2 1 3.2 53256000 4311100 3779200 24500000 6226100 2307300 12132000 0 0 0 12813000 0 12127000 1 1 3 2 1 2 10 592 6282;7565;7761;10233 True;True;True;True 6541;7943;8157;10729 24038;24039;24040;24041;24042;29012;29013;29014;29844;39255 24183;24184;24185;24186;24187;29195;29196;29197;30031;39491 24183;29195;30031;39491 -1
YGR276C YGR276C 5 5 5 YGR276C pep chromosome:R64-1-1:VII:1043819:1045480:-1 gene:YGR276C transcript:YGR276C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RNH70 description:3-5 exoribonuclease; required for maturation of 3 ends of 5S rRNA and 1 5 5 5 0 2 3 3 2 1 0 2 3 3 2 1 0 2 3 3 2 1 14.1 14.1 14.1 62.848 553 553 0 11.524 0 4.3 6.5 10.7 4.7 1.6 53501000 0 6159500 20024000 20115000 3381200 3821500 0 0 9019200 0 13959000 0 0 2 3 3 2 1 11 593 218;4663;7268;8777;12153 True;True;True;True;True 229;4860;7619;7620;9208;12717 951;952;17751;27852;27853;27854;33485;33486;47039;47040;47041 953;954;17866;28025;28026;28027;33685;33686;47366;47367;47368 953;17866;28026;33686;47367 307 150 -1
YGR278W YGR278W 2 2 2 YGR278W pep chromosome:R64-1-1:VII:1046731:1048464:1 gene:YGR278W transcript:YGR278W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CWC22 description:Spliceosome-associated protein that is required for pre-mRNA splicing; nec 1 2 2 2 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 4.5 4.5 4.5 67.293 577 577 0 10.449 0 1.4 0 0 0 3.1 10035000 0 1962200 0 0 0 8073100 0 0 0 0 0 8073100 0 1 0 0 0 1 2 594 2433;9443 True;True 2518;9907 9235;36223 9282;36435 9282;36435 -1
YGR280C YGR280C 11 11 11 YGR280C pep chromosome:R64-1-1:VII:1050910:1051725:-1 gene:YGR280C transcript:YGR280C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PXR1 description:Essential protein involved in rRNA and snoRNA maturation; competes with TL 1 11 11 11 9 5 5 8 7 9 9 5 5 8 7 9 9 5 5 8 7 9 44.6 44.6 44.6 31.311 271 271 0 58.655 41 26.2 18.1 32.8 25.5 37.3 596590000 186470000 24345000 160610000 44265000 38310000 142590000 181390000 76187000 110820000 133880000 138990000 104720000 10 5 5 8 7 9 44 595 532;1244;2272;2297;2889;4608;4609;6097;7903;9579;11507 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 561;562;1295;2354;2379;2380;2991;4804;4805;6348;8303;10048;12049 2320;2321;2322;2323;2324;2325;5011;8657;8658;8659;8660;8661;8662;8749;8750;8751;8752;8753;10974;10975;10976;10977;17576;17577;17578;23409;23410;23411;23412;23413;23414;30308;30309;30310;36708;36709;36710;36711;36712;44451;44452;44453;44454;44455 2327;2328;2329;2330;2331;2332;5039;8702;8703;8704;8705;8706;8707;8794;8795;8796;8797;8798;11050;11051;11052;11053;17691;17692;17693;23546;23547;23548;23549;23550;23551;30497;30498;30499;36926;36927;36928;36929;36930;44757;44758;44759;44760;44761 2329;5039;8707;8797;11051;17692;17693;23550;30497;36929;44760 308;309 49;267 -1
YGR282C YGR282C 2 2 2 YGR282C pep chromosome:R64-1-1:VII:1057783:1058724:-1 gene:YGR282C transcript:YGR282C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BGL2 description:Endo-beta-1,3-glucanase; major protein of the cell wall, involved in cell 1 2 2 2 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 9.3 9.3 9.3 34.118 313 313 0 20.909 5.1 0 0 0 0 4.2 8039500 2531200 0 0 0 0 5508300 0 0 0 0 0 5508300 1 0 0 0 0 1 2 596 7381;9742 True;True 7749;10218 28327;37327 28504;37549 28504;37549 -1
YGR283C YGR283C 7 7 7 YGR283C pep chromosome:R64-1-1:VII:1059015:1060040:-1 gene:YGR283C transcript:YGR283C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative methyltransferase; may interact with ribosomes, based on co-purification experimen 1 7 7 7 3 3 4 3 4 4 3 3 4 3 4 4 3 3 4 3 4 4 19.4 19.4 19.4 38.546 341 341 0 59.981 12.6 9.1 13.2 9.1 11.7 16.1 193720000 31477000 20457000 60378000 19431000 22975000 39004000 38683000 53249000 31728000 44147000 69786000 38414000 5 3 4 3 3 4 22 597 2084;3082;4399;5027;7029;7814;8755 True;True;True;True;True;True;True 2162;3191;4582;5236;7322;8213;9184 7959;11649;11650;11651;11652;16723;19161;26857;26858;26859;30033;30034;30035;30036;30037;30038;30039;33414;33415;33416;33417;33418 8001;11731;11732;11733;11734;16834;19284;27018;27019;27020;30220;30221;30222;30223;30224;30225;30226;30227;33614;33615;33616;33617;33618 8001;11732;16834;19284;27018;30223;33614 -1
YGR284C YGR284C 2 2 2 YGR284C pep chromosome:R64-1-1:VII:1060658:1061590:-1 gene:YGR284C transcript:YGR284C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERV29 description:Protein localized to COPII-coated vesicles; involved in vesicle formation 1 2 2 2 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 7.7 7.7 7.7 35.012 310 310 0 10.054 3.9 3.9 0 0 3.9 0 13291000 5685500 4948000 0 0 2657900 0 0 0 0 0 8788100 0 1 1 0 0 1 0 3 598 3886;9417 True;True 4043;9881 14771;36119;36120 14873;36330;36331 14873;36330 -1
YGR285C YGR285C 34 34 34 YGR285C pep chromosome:R64-1-1:VII:1061852:1063153:-1 gene:YGR285C transcript:YGR285C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ZUO1 description:Ribosome-associated chaperone; zuotin functions in ribosome biogenesis and 1 34 34 34 28 25 26 29 26 25 28 25 26 29 26 25 28 25 26 29 26 25 71.1 71.1 71.1 49.019 433 433 0 237.52 68.6 60.7 61.9 65.1 60 61.9 19612000000 3934800000 1796200000 5842000000 2109200000 1586100000 4343300000 4808000000 4107200000 4437800000 4417700000 4121800000 4395900000 40 34 38 41 39 37 229 599 158;397;743;744;745;884;1441;1532;1533;1540;2046;2063;2239;2588;3349;5026;5080;5333;6489;7095;7098;7521;7522;8356;8591;9898;10043;10044;10045;10245;10483;10677;10678;12032 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 165;422;784;785;786;927;1501;1592;1593;1601;2123;2140;2321;2682;3471;5235;5290;5558;6765;7400;7404;7405;7899;7900;8773;9015;10384;10385;10534;10535;10536;10743;10990;11188;11189;12595 678;679;680;681;682;683;684;685;686;687;688;1726;3093;3094;3095;3096;3097;3098;3099;3100;3101;3102;3103;3104;3105;3106;3107;3108;3109;3110;3660;3661;3662;5765;5766;5767;5768;6093;6094;6095;6096;6097;6098;6099;6100;6101;6102;6103;6104;6105;6122;6123;7794;7795;7796;7797;7798;7799;7800;7801;7802;7803;7804;7880;7881;7882;8538;8539;8540;8541;8542;8543;8544;8545;9788;9789;9790;9791;9792;9793;9794;9795;9796;9797;9798;12672;12673;12674;12675;12676;12677;12678;12679;12680;12681;12682;12683;19160;19422;19423;19424;19425;19426;20390;20391;20392;20393;20394;24800;24801;24802;24803;24804;24805;27087;27104;27105;27106;27107;27108;27109;27110;27111;27112;27113;27114;27115;27116;28896;28897;28898;28899;28900;28901;28902;28903;28904;28905;28906;28907;31906;31907;31908;31909;31910;31911;32734;32735;32736;32737;38001;38002;38003;38004;38005;38006;38007;38008;38009;38010;38011;38012;38485;38486;38487;38488;38489;38490;38491;38492;38493;38494;38495;38496;38497;38498;38499;38500;38501;38502;38503;38504;38505;38506;38507;38508;38509;39298;39299;39300;39301;39302;39303;39304;39305;39306;39307;40180;40181;40182;40183;40184;40883;40884;40885;40886;40887;40888;40889;40890;40891;40892;40893;40894;40895;40896;40897;40898;40899;46604;46605;46606;46607;46608;46609;46610;46611;46612;46613;46614 679;680;681;682;683;684;685;686;687;688;689;1732;3104;3105;3106;3107;3108;3109;3110;3111;3112;3113;3114;3115;3116;3117;3118;3119;3120;3121;3673;3674;3675;5800;5801;5802;5803;6129;6130;6131;6132;6133;6134;6135;6136;6137;6138;6139;6140;6141;6158;6159;7836;7837;7838;7839;7840;7841;7842;7843;7844;7845;7846;7922;7923;7924;8581;8582;8583;8584;8585;8586;8587;8588;8589;8590;9839;9840;9841;9842;9843;9844;9845;9846;9847;9848;9849;12758;12759;12760;12761;12762;12763;12764;12765;12766;12767;12768;12769;19283;19545;19546;19547;19548;19549;20517;20518;20519;20520;20521;24949;24950;24951;24952;24953;24954;27249;27266;27267;27268;27269;27270;27271;27272;27273;27274;27275;27276;27277;27278;29079;29080;29081;29082;29083;29084;29085;29086;29087;29088;29089;29090;32102;32103;32104;32105;32106;32107;32931;32932;32933;32934;38232;38233;38234;38235;38236;38237;38238;38239;38240;38241;38242;38243;38717;38718;38719;38720;38721;38722;38723;38724;38725;38726;38727;38728;38729;38730;38731;38732;38733;38734;38735;38736;38737;38738;38739;38740;38741;38742;39534;39535;39536;39537;39538;39539;39540;39541;39542;39543;40421;40422;40423;40424;40425;41130;41131;41132;41133;41134;41135;41136;41137;41138;41139;41140;41141;41142;41143;41144;41145;41146;46925;46926;46927;46928;46929;46930;46931;46932;46933;46934;46935 689;1732;3109;3113;3118;3673;5802;6129;6135;6158;7842;7923;8586;9846;12764;19283;19548;20519;24953;27249;27271;29086;29090;32104;32932;38243;38717;38724;38736;39537;40424;41138;41143;46935 310;311 1;102 -1
YHL001W YHL001W 12 1 1 YHL001W pep chromosome:R64-1-1:VIII:104277:105091:1 gene:YHL001W transcript:YHL001W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL14B description:Ribosomal 60S subunit protein L14B; homologous to mammalian ribosomal prot 1 12 1 1 9 11 11 9 9 7 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 57.2 6.5 6.5 15.153 138 138 0.0045011 2.1772 47.1 52.2 57.2 45.7 46.4 41.3 190560000 40264000 28691000 71132000 0 13496000 36980000 0 0 0 0 0 36980000 1 1 1 0 1 1 5 600 56;2583;2584;5377;5455;5456;8069;8458;9956;11253;11757;11758 False;False;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False 58;2673;2674;2675;2676;5605;5691;5692;8475;8880;10445;11790;12314;12315 234;235;236;237;9753;9754;9755;9756;9757;9758;9759;9760;9761;9762;9763;9764;9765;9766;9767;20606;20607;20608;20609;21002;21003;21004;21005;21006;21007;21008;21009;21010;21011;21012;21013;21014;21015;21016;21017;21018;21019;21020;21021;21022;30920;30921;30922;30923;30924;30925;30926;30927;30928;30929;30930;30931;30932;32243;32244;32245;32246;32247;32248;32249;32250;32251;38219;43355;43356;43357;45518;45519;45520;45521;45522;45523;45524;45525;45526 235;236;237;238;9804;9805;9806;9807;9808;9809;9810;9811;9812;9813;9814;9815;9816;9817;9818;20733;20734;20735;20736;21129;21130;21131;21132;21133;21134;21135;21136;21137;21138;21139;21140;21141;21142;21143;21144;21145;21146;21147;21148;21149;31112;31113;31114;31115;31116;31117;31118;31119;31120;31121;31122;31123;31124;32439;32440;32441;32442;32443;32444;32445;32446;32447;38451;43653;43654;43655;45832;45833;45834;45835;45836;45837;45838;45839;45840 238;9804;9814;20735;21130;21143;31124;32443;38451;43653;45836;45838 312 121 -1
YHL003C YHL003C 2 2 2 YHL003C pep chromosome:R64-1-1:VIII:100648:101883:-1 gene:YHL003C transcript:YHL003C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LAG1 description:Ceramide synthase component; involved in synthesis of ceramide from C26(acy 1 2 2 2 0 0 2 1 0 1 0 0 2 1 0 1 0 0 2 1 0 1 9.7 9.7 9.7 48.454 411 411 0.0072674 1.8187 0 0 9.7 5.8 0 5.8 135890000 0 0 128190000 2895200 0 4808000 0 0 75535000 0 0 0 0 0 2 1 0 1 4 601 3846;8034 True;True 4003;8439 14625;14626;14627;30814 14726;14727;14728;31006 14726;31006 -1
YHL004W YHL004W 2 2 2 YHL004W pep chromosome:R64-1-1:VIII:99219:100403:1 gene:YHL004W transcript:YHL004W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRP4 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit [Source:SGD;Acc:S0000009 1 2 2 2 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 8.6 8.6 8.6 44.151 394 394 0 3.9442 0 0 0 5.8 0 2.8 5302600 0 0 0 1879500 0 3423100 0 0 0 0 0 3423100 0 0 0 1 0 1 2 602 9214;9812 True;True 9665;10293 35316;37649 35524;37878 35524;37878 -1
YHL007C YHL007C 8 8 8 YHL007C pep chromosome:R64-1-1:VIII:95118:97937:-1 gene:YHL007C transcript:YHL007C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:STE20 description:Cdc42p-activated signal transducing kinase; involved in pheromone response, 1 8 8 8 5 4 0 3 2 3 5 4 0 3 2 3 5 4 0 3 2 3 13.8 13.8 13.8 102.36 939 939 0 62.023 9.3 7 0 4.6 4.2 6.4 73677000 31887000 11307000 0 6622000 5633200 18228000 33503000 26193000 0 0 21787000 21547000 5 4 0 2 3 3 17 603 771;831;877;3661;6365;9468;10104;10624 True;True;True;True;True;True;True;True 812;873;920;3807;6631;9934;10596;11132 3223;3224;3225;3226;3227;3455;3628;3629;13947;24297;36314;36315;36316;38743;38744;40642;40643;40644 3234;3235;3236;3237;3238;3468;3641;3642;14038;24445;36527;36528;36529;38978;38979;40885;40886;40887 3238;3468;3642;14038;24445;36528;38979;40885 -1
YHL009C YHL009C 1 1 1 YHL009C pep chromosome:R64-1-1:VIII:84068:85060:-1 gene:YHL009C transcript:YHL009C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YAP3 description:Basic leucine zipper (bZIP) transcription factor [Source:SGD;Acc:S000001001] 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 4.2 4.2 4.2 37.955 330 330 0.00084962 3.3772 4.2 0 0 0 4.2 4.2 5411500 1652600 0 0 0 821200 2937700 0 0 0 0 0 2937700 1 0 0 0 1 1 3 604 9250 True 9703 35479;35480;35481 35687;35688;35689 35688 -1
YHL011C YHL011C 16 16 15 YHL011C pep chromosome:R64-1-1:VIII:80654:81616:-1 gene:YHL011C transcript:YHL011C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRS3 description:5-phospho-ribosyl-1(alpha)-pyrophosphate synthetase; synthesizes PRPP, which 1 16 16 15 8 8 12 10 10 9 8 8 12 10 10 9 8 8 12 9 9 9 48.4 48.4 45.3 35.123 320 320 0 69.511 23.4 26.6 42.5 34.4 31.2 29.1 766530000 79826000 71424000 349100000 86880000 41905000 137390000 137670000 159020000 187530000 161970000 144860000 128520000 8 9 13 11 10 10 61 605 22;326;749;3089;4710;5577;5578;5628;5840;5900;6120;8532;8553;9798;11622;12061 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 24;344;790;3198;4907;5814;5815;5865;6084;6147;6371;8956;8977;10279;12171;12624 83;84;85;86;87;88;1450;1451;1452;1453;1454;3131;11675;11676;11677;11678;11679;11680;17890;17891;17892;17893;17894;17895;21432;21433;21434;21435;21436;21437;21613;21614;22379;22380;22381;22382;22383;22615;22616;22617;22618;23489;23490;23491;23492;23493;32542;32621;32622;32623;37582;37583;37584;37585;44910;44911;44912;44913;44914;44915;46707 83;84;85;86;87;88;1453;1454;1455;1456;1457;3142;11757;11758;11759;11760;11761;11762;18006;18007;18008;18009;18010;18011;21559;21560;21561;21562;21563;21564;21741;21742;22512;22513;22514;22515;22516;22750;22751;22752;22753;23629;23630;23631;23632;23633;32738;32817;32818;32819;37811;37812;37813;37814;45218;45219;45220;45221;45222;45223;47032 86;1455;3142;11757;18010;21559;21564;21741;22514;22752;23633;32738;32817;37812;45219;47032 -1
YHL015W YHL015W 10 10 10 YHL015W pep chromosome:R64-1-1:VIII:75412:75777:1 gene:YHL015W transcript:YHL015W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS20 description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; overproduction suppre 1 10 10 10 8 5 9 5 8 8 8 5 9 5 8 8 8 5 9 5 8 8 57.9 57.9 57.9 13.907 121 121 0 93.022 57 43 50.4 37.2 49.6 44.6 1170400000 197750000 109460000 471030000 66018000 78842000 247280000 236680000 233970000 234050000 202340000 270010000 235670000 9 6 10 6 9 10 50 606 1786;4740;7315;8242;8769;10749;10915;11189;12042;12043 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1853;4937;7679;8657;9200;11263;11264;11437;11724;12605;12606 7030;7031;7032;7033;18024;18025;18026;18027;28062;28063;31509;31510;31511;31512;31513;33460;33461;33462;33463;33464;33465;41337;41338;41339;41340;41341;41956;41957;41958;41959;41960;43087;43088;43089;43090;43091;43092;43093;43094;46646;46647;46648;46649;46650;46651;46652;46653;46654;46655;46656;46657 7070;7071;7072;7073;18140;18141;18142;18143;28236;28237;31705;31706;31707;31708;31709;33660;33661;33662;33663;33664;33665;41597;41598;41599;41600;41601;42220;42221;42222;42223;42224;43384;43385;43386;43387;43388;43389;43390;43391;46968;46969;46970;46971;46972;46973;46974;46975;46976;46977;46978;46979 7072;18143;28237;31709;33664;41598;42223;43389;46970;46979 313 84 -1
YHL020C YHL020C 2 2 2 YHL020C pep chromosome:R64-1-1:VIII:66242:67456:-1 gene:YHL020C transcript:YHL020C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OPI1 description:Transcriptional regulator of a variety of genes; phosphorylation by protein k 1 2 2 2 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 9.4 9.4 9.4 46.064 404 404 0.0058867 1.956 0 4.5 0 0 5 0 421940000 0 589780 0 0 421350000 0 0 0 0 0 1393100000 0 0 0 0 0 1 0 1 607 4176;5842 True;True 4346;6086 15886;22389 15995;22522 15995;22522 -1
YHL030W YHL030W 7 7 7 YHL030W pep chromosome:R64-1-1:VIII:40084:45690:1 gene:YHL030W transcript:YHL030W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ECM29 description:Scaffold protein; assists in association of the proteasome core particle with 1 7 7 7 1 3 0 3 2 0 1 3 0 3 2 0 1 3 0 3 2 0 4.9 4.9 4.9 210.43 1868 1868 0 12.516 0.4 2.2 0 2.1 1.4 0 143250000 132050000 4229400 0 4237300 2730700 0 0 8931700 0 8959100 0 0 1 3 0 2 2 0 8 608 2405;4228;6257;6532;8052;11658;12069 True;True;True;True;True;True;True 2490;4401;6516;6808;8457;12207;12632 9143;16066;23957;23958;24918;30860;45081;45082;46737 9190;16175;24102;24103;25068;31052;45392;45393;47062 9190;16175;24103;25068;31052;45392;47062 -1
YHL033C YHL033C 33 6 6 YHL033C pep chromosome:R64-1-1:VIII:35255:36025:-1 gene:YHL033C transcript:YHL033C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL8A description:Ribosomal 60S subunit protein L8A; required for processing of 27SA3 pre-rRNA 1 33 6 6 25 26 23 28 23 27 5 5 4 5 3 5 5 5 4 5 3 5 80.9 17.2 17.2 28.124 256 256 0 26.593 69.5 75.8 70.7 74.2 71.1 71.1 1439200000 204290000 83118000 401740000 92067000 55036000 603000000 320520000 161470000 370650000 208650000 252370000 344570000 9 6 7 7 5 9 43 609 125;417;760;1528;3714;5095;5235;5346;5875;6105;6106;6891;6892;6930;6931;7112;7427;7791;7897;7898;8095;9166;10544;10555;10556;10815;11423;11424;12003;12004;12268;12269;12350 False;False;False;True;False;False;True;False;False;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;False;True;False;False;False;False;False;True;True;False;False;False 130;442;801;1588;3860;5305;5454;5572;6120;6356;6357;7179;7180;7218;7219;7420;7797;8187;8297;8298;8503;9616;11051;11063;11064;11334;11960;11961;12566;12567;12839;12840;12923 530;531;532;533;534;535;1812;3182;3183;3184;3185;6079;14117;14118;14119;14120;14121;14122;14123;19466;19467;19468;19469;19470;19471;19472;19473;20024;20025;20026;20027;20028;20029;20030;20031;20458;20459;22498;22499;22500;22501;22502;23435;23436;23437;23438;23439;23440;23441;23442;23443;23444;23445;23446;23447;23448;23449;23450;23451;23452;23453;23454;23455;26342;26343;26344;26345;26346;26347;26348;26349;26350;26351;26352;26353;26354;26355;26356;26357;26358;26359;26360;26361;26362;26363;26364;26365;26366;26494;26495;26496;26497;26498;26499;26500;26501;26502;26503;26504;26505;26506;26507;26508;26509;26510;26511;26512;26513;26514;27158;27159;27160;28502;28503;28504;28505;28506;28507;29937;29938;29939;29940;29941;29942;29943;29944;30295;30296;30297;30298;30299;30300;31036;31037;35098;35099;35100;35101;35102;35103;35104;35105;35106;35107;40388;40389;40390;40391;40392;40393;40394;40395;40427;40428;40429;40430;40431;40432;40433;40434;40435;40436;40437;40438;40439;40440;40441;40442;40443;41613;41614;41615;41616;44114;44115;44116;44117;44118;44119;44120;44121;46452;46453;46454;46455;46456;46457;46458;46459;46460;46461;46462;46463;46464;46465;46466;46467;46468;46469;46470;46471;46472;46473;46474;47455;47456;47457;47458;47459;47460;47461;47462;47463;47771;47772;47773;47774;47775;47776;47777;47778 531;532;533;534;535;536;1818;3193;3194;3195;3196;6115;14214;14215;14216;14217;14218;14219;14220;19589;19590;19591;19592;19593;19594;19595;19596;20148;20149;20150;20151;20152;20153;20154;20155;20585;20586;22632;22633;22634;22635;22636;23572;23573;23574;23575;23576;23577;23578;23579;23580;23581;23582;23583;23584;23585;23586;23587;23588;23589;23590;23591;23592;23593;23594;23595;26500;26501;26502;26503;26504;26505;26506;26507;26508;26509;26510;26511;26512;26513;26514;26515;26516;26517;26518;26519;26520;26521;26522;26523;26524;26654;26655;26656;26657;26658;26659;26660;26661;26662;26663;26664;26665;26666;26667;26668;26669;26670;26671;26672;26673;26674;27320;27321;27322;28680;28681;28682;28683;28684;28685;30124;30125;30126;30127;30128;30129;30130;30131;30484;30485;30486;30487;30488;30489;31228;31229;35306;35307;35308;35309;35310;35311;35312;35313;35314;35315;40629;40630;40631;40632;40633;40634;40635;40636;40668;40669;40670;40671;40672;40673;40674;40675;40676;40677;40678;40679;40680;40681;40682;40683;40684;40685;41876;41877;41878;41879;44413;44414;44415;44416;44417;44418;44419;44420;46773;46774;46775;46776;46777;46778;46779;46780;46781;46782;46783;46784;46785;46786;46787;46788;46789;46790;46791;46792;46793;46794;46795;47786;47787;47788;47789;47790;47791;47792;47793;47794;48103;48104;48105;48106;48107;48108;48109;48110 535;1818;3196;6115;14217;19596;20152;20586;22632;23582;23593;26504;26518;26659;26672;27320;28681;30128;30487;30489;31228;35311;40636;40668;40678;41878;44413;44419;46776;46788;47787;47793;48110 -1
YHL034C YHL034C 5 5 5 YHL034C pep chromosome:R64-1-1:VIII:33193:34077:-1 gene:YHL034C transcript:YHL034C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SBP1 description:Protein that binds eIF4G and has a role in repression of translation; has an 1 5 5 5 1 3 1 3 1 1 1 3 1 3 1 1 1 3 1 3 1 1 16.7 16.7 16.7 32.989 294 294 0 9.0104 3.1 13.6 3.1 13.3 4.4 3.1 42971000 2824000 10496000 6774700 17348000 983020 4546300 0 0 0 35686000 0 0 1 3 1 3 1 1 10 610 1774;2544;3834;3988;9124 True;True;True;True;True 1841;2633;3989;4150;9571 7000;9584;9585;14573;15158;15159;15160;15161;34915;34916 7040;9633;9634;14672;15265;15266;15267;15268;35123;35124 7040;9634;14672;15268;35124 -1
YHR001W YHR001W 2 2 1 YHR001W pep chromosome:R64-1-1:VIII:106055:107368:1 gene:YHR001W transcript:YHR001W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OSH7 description:Oxysterol-binding protein; part of family with seven members in S. cerevisia 1 2 2 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 4.1 4.1 1.8 49.804 437 437 0.0030511 2.3128 2.3 0 0 0 1.8 0 3016500 2162300 0 0 0 854210 0 2824400 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 2 611 4737;10880 True;True 4934;11400 18021;41831 18137;42094 18137;42094 -1
YHR007C YHR007C 5 5 5 YHR007C pep chromosome:R64-1-1:VIII:120091:121683:-1 gene:YHR007C transcript:YHR007C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERG11 description:Lanosterol 14-alpha-demethylase; catalyzes C-14 demethylation of lanostero 1 5 5 5 4 2 2 2 2 2 4 2 2 2 2 2 4 2 2 2 2 2 12.6 12.6 12.6 60.719 530 530 0 8.9283 10.4 4.7 6 5.7 6.2 6 103220000 37270000 14168000 25046000 6715600 5760800 14261000 37441000 0 17676000 19754000 18219000 17473000 4 2 2 2 2 2 14 612 3398;3429;5473;9878;11981 True;True;True;True;True 3523;3555;5709;10361;12544 12894;12895;13017;13018;13019;21087;21088;21089;21090;21091;37915;37916;37917;46359 12981;12982;13104;13105;13106;21214;21215;21216;21217;21218;38145;38146;38147;46679 12982;13104;21216;38147;46679 -1
YHR010W;YDR471W YHR010W;YDR471W 15;11 15;11 15;11 YHR010W pep chromosome:R64-1-1:VIII:126521:127492:1 gene:YHR010W transcript:YHR010W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL27A description:Ribosomal 60S subunit protein L27A; homologous to mammalian ribosomal prot 2 15 15 15 13 13 12 11 12 12 13 13 12 11 12 12 13 13 12 11 12 12 59.6 59.6 59.6 15.531 136 136;136 0 109.86 58.8 58.8 59.6 56.6 58.8 56.6 12655000000 1536300000 1003600000 5310400000 1143700000 837820000 2823000000 2624300000 1719900000 3261700000 2247400000 2809400000 2595800000 19 19 22 21 20 21 122 613 5418;7831;8999;9000;9001;9829;9830;9831;11668;11669;11687;11688;12236;12237;12318 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 5651;8230;9442;9443;9444;10310;10311;10312;12221;12222;12243;12244;12806;12807;12891 20816;20817;20818;20819;20820;20821;20822;20823;20824;20825;30094;30095;30096;30097;30098;30099;34433;34434;34435;34436;34437;34438;34439;34440;34441;34442;34443;34444;34445;34446;34447;34448;34449;34450;34451;34452;34453;34454;34455;34456;34457;34458;34459;34460;37717;37718;37719;37720;37721;37722;37723;37724;37725;37726;37727;37728;37729;37730;37731;37732;37733;37734;37735;37736;37737;37738;37739;37740;37741;37742;37743;37744;37745;37746;37747;37748;37749;45143;45144;45145;45146;45147;45148;45149;45150;45151;45152;45153;45154;45155;45156;45157;45158;45159;45160;45161;45162;45234;45235;45236;45237;45238;45239;45240;45241;45242;45243;45244;45245;45246;45247;45248;45249;47341;47342;47343;47344;47345;47659;47660;47661;47662;47663;47664 20943;20944;20945;20946;20947;20948;20949;20950;20951;20952;30282;30283;30284;30285;30286;30287;34639;34640;34641;34642;34643;34644;34645;34646;34647;34648;34649;34650;34651;34652;34653;34654;34655;34656;34657;34658;34659;34660;34661;34662;34663;34664;34665;34666;37946;37947;37948;37949;37950;37951;37952;37953;37954;37955;37956;37957;37958;37959;37960;37961;37962;37963;37964;37965;37966;37967;37968;37969;37970;37971;37972;37973;37974;37975;37976;37977;37978;45455;45456;45457;45458;45459;45460;45461;45462;45463;45464;45465;45466;45467;45468;45469;45470;45471;45472;45473;45474;45547;45548;45549;45550;45551;45552;45553;45554;45555;45556;45557;45558;45559;45560;45561;45562;47670;47671;47672;47673;47674;47991;47992;47993;47994;47995;47996 20948;30282;34641;34659;34666;37949;37965;37974;45461;45473;45554;45561;47672;47674;47996 -1;-1
YHR013C YHR013C 8 8 8 YHR013C pep chromosome:R64-1-1:VIII:130730:131446:-1 gene:YHR013C transcript:YHR013C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ARD1 description:Subunit of protein N-terminal acetyltransferase NatA; NatA comprises Nat1p, 1 8 8 8 5 7 4 6 5 6 5 7 4 6 5 6 5 7 4 6 5 6 39.1 39.1 39.1 27.603 238 238 0 24.863 29.4 33.2 24.8 36.1 21.8 34 394890000 58770000 41364000 126960000 39799000 19661000 108340000 72775000 61587000 112120000 69050000 59294000 121690000 5 8 5 6 4 7 35 614 1460;5647;6059;7104;8074;9882;10205;11269 True;True;True;True;True;True;True;True 1520;5885;6310;7412;8480;10365;10701;11806 5832;5833;5834;21672;21673;23243;23244;23245;23246;23247;23248;23249;27132;27133;27134;27135;27136;30942;30943;30944;37926;37927;37928;37929;37930;39153;39154;39155;39156;39157;39158;43412;43413;43414;43415;43416;43417 5867;5868;5869;21800;21801;23379;23380;23381;23382;23383;23384;23385;27294;27295;27296;27297;27298;31134;31135;31136;38156;38157;38158;38159;38160;39388;39389;39390;39391;39392;39393;43710;43711;43712;43713;43714;43715 5868;21800;23384;27295;31134;38160;39392;43712 -1
YHR016C YHR016C 8 5 5 YHR016C pep chromosome:R64-1-1:VIII:136881:138455:-1 gene:YHR016C transcript:YHR016C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YSC84 description:Actin-binding protein; involved in bundling of actin filaments and endocyt 1 8 5 5 3 3 5 3 1 5 2 1 2 1 1 3 2 1 2 1 1 3 22.4 16.7 16.7 50.901 468 468 0 16.041 11.3 6.2 12.4 8.8 4.7 13.7 91472000 22783000 1453100 39286000 3929100 3276400 20745000 0 0 25662000 0 0 18232000 2 1 2 1 1 3 10 615 1663;3033;3092;3472;8806;8928;9263;9541 True;False;True;True;False;True;False;True 1727;3141;3201;3604;9238;9365;9717;10009 6564;11451;11452;11453;11454;11455;11687;11688;13210;33601;33602;33603;33604;34020;34021;34022;34023;34024;35504;36588 6600;11530;11531;11532;11533;11534;11769;11770;13299;33801;33802;33803;33804;34222;34223;34224;34225;34226;35712;36804 6600;11532;11769;13299;33804;34226;35712;36804 -1
YHR019C YHR019C 37 37 37 YHR019C pep chromosome:R64-1-1:VIII:141894:143558:-1 gene:YHR019C transcript:YHR019C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DED81 description:Cytosolic asparaginyl-tRNA synthetase; required for protein synthesis, cat 1 37 37 37 25 31 21 27 25 22 25 31 21 27 25 22 25 31 21 27 25 22 64.4 64.4 64.4 62.206 554 554 0 313.98 58.3 60.6 50.7 55.4 56.5 49.3 9705000000 1651000000 2163600000 2316600000 1232500000 583880000 1757400000 1778300000 3836200000 1721100000 2535600000 1854700000 2131200000 37 48 34 45 36 36 236 616 1052;1073;1107;1579;1659;1660;2842;3584;3734;3827;3828;4255;4891;5056;5237;5238;5436;5767;7262;8274;8275;8280;8644;9616;9617;9816;9942;9943;10013;10014;10476;11100;11194;11503;11564;11727;12017 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1100;1121;1157;1642;1723;1724;2941;2942;3726;3727;3880;3978;3979;3980;3981;3982;3983;4429;5095;5266;5456;5457;5458;5670;6008;7610;7611;8691;8692;8697;9068;9069;10085;10086;10297;10431;10432;10503;10504;10983;11631;11729;12045;12108;12109;12110;12283;12284;12580 4383;4384;4436;4437;4438;4439;4440;4441;4442;4443;4444;4445;4446;4447;4448;4550;4551;4552;6273;6274;6275;6547;6548;6549;6550;6551;6552;6553;6554;6555;6556;6557;6558;6559;10787;10788;10789;10790;13678;13679;13680;13681;13682;13683;13684;13685;13686;13687;13688;13689;13690;13691;14186;14187;14188;14189;14190;14191;14534;14535;14536;14537;14538;14539;14540;14541;14542;14543;14544;14545;14546;14547;14548;14549;14550;14551;14552;14553;14554;14555;16166;16167;16168;16169;18630;18631;18632;18633;18634;19275;20033;20034;20035;20036;20037;20038;20039;20040;20041;20042;20043;20044;20045;20896;20897;20898;20899;22070;22071;27815;27816;27817;27818;27819;27820;27821;27822;27823;27824;27825;27826;27827;27828;27829;27830;27831;27832;31642;31643;31644;31645;31646;31647;31662;31663;31664;31665;31666;31667;31668;31669;32934;32935;32936;32937;32938;32939;36830;36831;36832;36833;36834;36835;36836;36837;36838;36839;36840;37659;37660;37661;37662;37663;37664;37665;37666;37667;37668;37669;37670;38158;38159;38160;38392;38393;38394;38395;38396;38397;38398;40140;40141;40142;40143;40144;40145;42752;42753;42754;43111;43112;43113;43114;44437;44662;44663;44664;44665;44666;44667;44668;44669;44670;44671;44672;44673;44674;44675;44676;44677;44678;44679;44680;45398;45399;45400;45401;45402;45403;45404;45405;45406;45407;45408;45409;45410;45411;45412;46542;46543;46544;46545;46546;46547;46548;46549 4406;4407;4461;4462;4463;4464;4465;4466;4467;4468;4469;4470;4471;4472;4473;4576;4577;4578;6309;6310;6311;6583;6584;6585;6586;6587;6588;6589;6590;6591;6592;6593;6594;6595;10855;10856;10857;10858;13767;13768;13769;13770;13771;13772;13773;13774;13775;13776;13777;13778;13779;13780;13781;13782;14284;14285;14286;14287;14288;14289;14633;14634;14635;14636;14637;14638;14639;14640;14641;14642;14643;14644;14645;14646;14647;14648;14649;14650;14651;14652;14653;14654;16275;16276;16277;16278;18751;18752;18753;18754;18755;19398;20157;20158;20159;20160;20161;20162;20163;20164;20165;20166;20167;20168;20169;21023;21024;21025;21026;22200;22201;27988;27989;27990;27991;27992;27993;27994;27995;27996;27997;27998;27999;28000;28001;28002;28003;28004;28005;31838;31839;31840;31841;31842;31843;31858;31859;31860;31861;31862;31863;31864;31865;33131;33132;33133;33134;33135;33136;33137;37049;37050;37051;37052;37053;37054;37055;37056;37057;37058;37059;37888;37889;37890;37891;37892;37893;37894;37895;37896;37897;37898;37899;38389;38390;38391;38392;38624;38625;38626;38627;38628;38629;38630;40378;40379;40380;40381;40382;40383;43047;43048;43049;43408;43409;43410;43411;44743;44968;44969;44970;44971;44972;44973;44974;44975;44976;44977;44978;44979;44980;44981;44982;44983;44984;44985;44986;45712;45713;45714;45715;45716;45717;45718;45719;45720;45721;45722;45723;45724;45725;45726;46863;46864;46865;46866;46867;46868;46869;46870 4406;4471;4576;6309;6584;6595;10857;13773;14288;14643;14652;16275;18751;19398;20161;20169;21024;22200;27995;31840;31842;31864;33137;37051;37059;37888;38390;38392;38624;38629;40380;43048;43410;44743;44986;45722;46868 314;315;316;317;318;319;320 251;278;433;472;483;488;492 -1
YHR020W YHR020W 53 53 53 YHR020W pep chromosome:R64-1-1:VIII:143996:146062:1 gene:YHR020W transcript:YHR020W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Prolyl-tRNA synthetase; N-terminal domain shows weak homology to prokaryotic posttransfer edi 1 53 53 53 38 36 38 42 27 32 38 36 38 42 27 32 38 36 38 42 27 32 79.2 79.2 79.2 77.385 688 688 0 323.31 60.8 58.9 66.1 63.7 56.7 60.9 8429100000 1529500000 956020000 2993600000 1007100000 496860000 1446000000 1796900000 2405600000 1780900000 1818400000 1420700000 1548700000 46 47 48 53 33 40 267 617 161;163;265;267;268;341;452;1059;1172;1181;1318;1766;1770;1828;2132;2457;2458;2643;3037;3038;3040;3651;3805;3898;3899;3937;4493;4494;4988;5445;5545;5599;5954;6425;7096;7828;7829;7955;8050;8064;8730;9186;11155;11156;11221;11526;11527;11628;11629;11630;11771;11776;12373 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 168;170;277;278;280;281;359;479;1107;1223;1232;1373;1833;1837;1897;2212;2542;2543;2737;3146;3147;3149;3796;3955;3956;4056;4057;4096;4685;4686;4687;5194;5679;5782;5836;6205;6691;7401;7402;8227;8228;8358;8455;8470;9157;9636;11689;11690;11758;12068;12069;12177;12178;12179;12330;12335;12947 699;700;701;702;703;704;711;1155;1156;1157;1158;1159;1160;1161;1162;1163;1164;1165;1166;1167;1170;1171;1172;1173;1174;1175;1176;1177;1178;1179;1180;1181;1508;1509;1510;1511;1973;1974;1975;1976;1977;1978;4398;4785;4786;4815;4816;5282;5283;5284;5285;5286;5287;6967;6968;6969;6970;6971;6972;6973;6974;6975;6976;6977;6992;6993;7164;7165;8144;8145;8146;8147;8148;8149;8150;8151;8152;8153;8154;9311;9312;9313;9314;9315;9963;9964;9965;9966;9967;9968;11484;11485;11486;11487;11494;11495;11496;11497;11498;11499;11500;11501;11502;13914;14469;14470;14471;14472;14473;14474;14834;14835;14836;14837;14838;14839;14840;14986;14987;14988;14989;14990;17105;17106;17107;17108;17109;17110;17111;17112;17113;17114;17115;17116;17117;17118;17119;17120;18978;18979;18980;18981;18982;18983;18984;18985;18986;20934;20935;20936;20937;21343;21344;21345;21346;21347;21348;21499;21500;21501;21502;21503;21504;21505;22854;22855;24537;24538;24539;24540;24541;27088;27089;27090;27091;27092;27093;27094;27095;27096;27097;27098;27099;27100;27101;30083;30084;30085;30086;30087;30088;30089;30525;30854;30855;30856;30857;30858;30907;30908;30909;30910;30911;33297;33298;33299;33300;33301;33302;35176;35177;35178;35179;35180;35181;35182;35183;42937;42938;42939;42940;42941;42942;42943;42944;43231;43232;43233;43234;44508;44509;44510;44511;44512;44513;44514;44515;44516;44517;44518;44519;44520;44932;44933;44934;44935;44936;44937;44938;44939;44940;44941;44942;44943;44944;44945;44946;44947;45605;45606;45607;45608;45609;45616;47847;47848;47849;47850 700;701;702;703;704;705;712;1157;1158;1159;1160;1161;1162;1163;1164;1165;1166;1167;1168;1169;1172;1173;1174;1175;1176;1177;1178;1179;1180;1181;1182;1183;1511;1512;1513;1514;1979;1980;1981;1982;1983;1984;4422;4811;4812;4841;4842;5313;5314;5315;5316;5317;5318;7007;7008;7009;7010;7011;7012;7013;7014;7015;7016;7017;7032;7033;7204;7205;8186;8187;8188;8189;8190;8191;8192;8193;8194;8195;8196;9358;9359;9360;9361;9362;10015;10016;10017;10018;10019;10020;10021;11563;11564;11565;11566;11573;11574;11575;11576;11577;11578;11579;11580;11581;14005;14568;14569;14570;14571;14572;14573;14938;14939;14940;14941;14942;14943;14944;15091;15092;15093;15094;15095;15096;17219;17220;17221;17222;17223;17224;17225;17226;17227;17228;17229;17230;17231;17232;17233;17234;19100;19101;19102;19103;19104;19105;19106;19107;19108;21061;21062;21063;21064;21470;21471;21472;21473;21474;21475;21626;21627;21628;21629;21630;21631;21632;22989;22990;24685;24686;24687;24688;24689;27250;27251;27252;27253;27254;27255;27256;27257;27258;27259;27260;27261;27262;27263;30271;30272;30273;30274;30275;30276;30277;30715;31046;31047;31048;31049;31050;31099;31100;31101;31102;31103;33496;33497;33498;33499;33500;33501;33502;35384;35385;35386;35387;35388;35389;35390;35391;43234;43235;43236;43237;43238;43239;43240;43241;43528;43529;43530;43531;44814;44815;44816;44817;44818;44819;44820;44821;44822;44823;44824;44825;44826;45240;45241;45242;45243;45244;45245;45246;45247;45248;45249;45250;45251;45252;45253;45254;45255;45919;45920;45921;45922;45923;45931;48179;48180;48181;48182 703;712;1168;1177;1180;1512;1980;4422;4811;4842;5318;7010;7033;7205;8194;9359;9362;10016;11564;11566;11575;14005;14571;14942;14943;15095;17225;17229;19108;21063;21473;21630;22989;24687;27251;30271;30276;30715;31049;31100;33500;35386;43235;43238;43529;44815;44826;45240;45246;45253;45923;45931;48182 321;322;323;324;325 123;297;422;580;683 -1
YKL156W;YHR021C YKL156W;YHR021C 5;5 5;5 5;5 YKL156W pep chromosome:R64-1-1:XI:158613:159212:1 gene:YKL156W transcript:YKL156W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS27A description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; homologous to mammal 2 5 5 5 2 4 3 4 4 3 2 4 3 4 4 3 2 4 3 4 4 3 48.8 48.8 48.8 8.8793 82 82;82 0 13.393 29.3 40.2 36.6 48.8 29.3 36.6 763540000 96333000 56202000 353500000 91592000 37513000 128400000 158470000 100970000 176590000 170280000 144900000 145680000 3 4 4 5 4 3 23 618 6099;6623;9856;10408;11338 True;True;True;True;True 6350;6900;10338;10910;11875 23417;23418;23419;25293;25294;25295;25296;37827;37828;37829;37830;39905;39906;39907;39908;43716;43717;43718;43719;43720;43721;43722;43723 23554;23555;23556;25447;25448;25449;25450;38057;38058;38059;38060;40142;40143;40144;40145;44015;44016;44017;44018;44019;44020;44021;44022 23556;25449;38058;40145;44022 -1;-1
YHR027C YHR027C 6 6 6 YHR027C pep chromosome:R64-1-1:VIII:161730:164711:-1 gene:YHR027C transcript:YHR027C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPN1 description:Non-ATPase base subunit of the 19S RP of the 26S proteasome; may participat 1 6 6 6 1 3 4 3 1 3 1 3 4 3 1 3 1 3 4 3 1 3 7.9 7.9 7.9 109.49 993 993 0 16.051 1.7 4.4 5.1 4.4 1.7 3.8 95740000 15164000 16503000 27954000 17432000 1874100 16814000 0 24052000 22484000 28287000 0 30120000 1 3 4 4 1 3 16 619 2335;5591;5792;6293;6624;11036 True;True;True;True;True;True 2419;5828;6034;6553;6901;11563 8883;8884;8885;21476;21477;22182;24078;24079;24080;24081;24082;24083;25297;25298;25299;42473 8928;8929;8930;21603;21604;22312;24223;24224;24225;24226;24227;24228;25451;25452;25453;42768 8929;21604;22312;24224;25453;42768 -1
YHR034C YHR034C 1 1 1 YHR034C pep chromosome:R64-1-1:VIII:176965:177999:-1 gene:YHR034C transcript:YHR034C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PIH1 description:Component of the conserved R2TP complex (Rvb1-Rvb2-Tah1-Pih1); R2TP complex 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 2.6 2.6 2.6 39.519 344 344 0.00083963 3.2611 2.6 2.6 2.6 2.6 2.6 0 10033000 1555600 1662700 4013000 1669200 1132100 0 0 0 0 0 3743200 0 1 1 1 1 1 0 5 620 92 True 95 379;380;381;382;383 380;381;382;383;384 382 -1
YHR035W YHR035W 1 1 1 YHR035W pep chromosome:R64-1-1:VIII:178219:180111:1 gene:YHR035W transcript:YHR035W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NEL1 description:Activator of Sar1p GTPase activity; paralog of Sec23 but does not associate 1 1 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1.1 1.1 1.1 72.306 630 630 1 -2 0 0 0 0 1.1 0 3089000 0 0 0 0 3089000 0 0 0 0 0 10213000 0 0 0 0 0 1 0 1 + 621 3694 True 3840 14052 14147 14147 326 446 -1
YHR039C YHR039C 1 1 1 YHR039C pep chromosome:R64-1-1:VIII:184875:186809:-1 gene:YHR039C transcript:YHR039C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MSC7 description:Protein of unknown function; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 2.8 2.8 2.8 71.32 644 644 0 4.097 2.8 0 0 0 0 0 2115800 2115800 0 0 0 0 0 2763600 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 622 11200 True 11735 43131 43428 43428 -1
YHR042W YHR042W 6 6 6 YHR042W pep chromosome:R64-1-1:VIII:190543:192618:1 gene:YHR042W transcript:YHR042W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NCP1 description:NADP-cytochrome P450 reductase; involved in ergosterol biosynthesis; associa 1 6 6 6 4 2 2 1 2 1 4 2 2 1 2 1 4 2 2 1 2 1 13.5 13.5 13.5 76.771 691 691 0 36.971 9.1 4.1 4.9 3.8 4.5 3.8 58680000 22289000 3355600 17904000 4805800 3341800 6984400 19075000 17317000 0 0 0 0 4 2 2 1 3 1 13 623 3430;3563;3624;7308;7576;7905 True;True;True;True;True;True 3556;3701;3767;7672;7955;8305 13020;13021;13579;13831;13832;28039;28040;29078;29079;29080;29081;30316;30317 13107;13108;13668;13922;13923;28213;28214;29261;29262;29263;29264;30505;30506 13107;13668;13922;28214;29264;30505 -1
YHR049W YHR049W 5 5 5 YHR049W pep chromosome:R64-1-1:VIII:206462:207193:1 gene:YHR049W transcript:YHR049W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FSH1 description:Putative serine hydrolase; localizes to both the nucleus and cytoplasm; sequ 1 5 5 5 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 26.7 26.7 26.7 27.339 243 243 0 13.39 4.9 11.9 4.9 9.1 7.8 9.9 90491000 3339900 37974000 16281000 9334800 10261000 13300000 0 82372000 0 0 0 0 1 2 1 3 1 2 10 624 1195;2589;4615;6185;9177 True;True;True;True;True 1246;2683;4811;6442;9627 4853;4854;9799;17592;23722;23723;23724;35145;35146;35147 4879;4880;9850;17707;23863;23864;23865;35353;35354;35355 4879;9850;17707;23863;35353 -1
YHR052W YHR052W 11 11 11 YHR052W pep chromosome:R64-1-1:VIII:210848:211978:1 gene:YHR052W transcript:YHR052W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CIC1 description:Essential protein that interacts with proteasome components; has a potential 1 11 11 11 7 7 7 7 7 8 7 7 7 7 7 8 7 7 7 7 7 8 52.4 52.4 52.4 42.529 376 376 0 65.699 28.7 30.1 36.7 30.1 31.4 39.9 1256400000 122990000 66175000 596930000 104820000 85208000 280260000 216070000 194420000 257040000 251230000 248640000 219810000 8 12 10 10 10 10 60 625 944;1013;2690;3152;3367;7318;7679;9466;9631;10153;11739 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 987;1060;2784;3263;3264;3490;7682;8063;9931;10102;10649;12296 3941;3942;3943;4237;4238;4239;4240;4241;4242;4243;4244;10150;10151;10152;10153;10154;10155;10156;11922;11923;11924;11925;11926;11927;11928;11929;11930;11931;12757;12758;28069;29427;29428;29429;29430;29431;29432;29433;29434;36301;36302;36303;36304;36305;36306;36307;36308;36309;36895;36896;36897;36898;36899;36900;36901;38961;45462;45463;45464 3956;3957;3958;4258;4259;4260;4261;4262;4263;4264;4265;10204;10205;10206;10207;10208;10209;10210;12006;12007;12008;12009;12010;12011;12012;12013;12014;12015;12016;12843;12844;28243;29611;29612;29613;29614;29615;29616;29617;29618;36514;36515;36516;36517;36518;36519;36520;36521;36522;37114;37115;37116;37117;37118;37119;37120;39196;45776;45777;45778 3958;4263;10208;12011;12844;28243;29616;36515;37117;39196;45777 327 334 -1
YHR054W-A;YHR052W-A YHR054W-A;YHR052W-A 1;1 1;1 1;1 YHR054W-A pep chromosome:R64-1-1:VIII:214508:214702:1 gene:YHR054W-A transcript:YHR054W-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Dubious open reading frame; unlikely to encode a functional protein, based on available 2 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 12.5 12.5 12.5 7.5167 64 64;64 1 -2 0 12.5 0 0 0 0 36820000 0 36820000 0 0 0 0 0 79867000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 + 626 7200 True 7538 27591 27764 27764 328 1 -1;-1
YHR056C YHR056C 1 1 1 YHR056C pep chromosome:R64-1-1:VIII:215183:217834:-1 gene:YHR056C transcript:YHR056C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSC30 description:Component of the RSC chromatin remodeling complex; non-essential gene requ 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1.1 1.1 1.1 101.33 883 883 0.00082919 3.1369 1.1 0 0 1.1 0 1.1 10777000 3928600 0 0 2759400 0 4088900 0 0 0 0 0 4088900 1 0 0 1 0 0 2 627 6141 True 6395 23589;23590;23591 23730;23731;23732 23731 -1
YHR060W YHR060W 1 1 1 YHR060W pep chromosome:R64-1-1:VIII:220725:221270:1 gene:YHR060W transcript:YHR060W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VMA22 description:Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function; periph 1 1 1 1 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 9.4 9.4 9.4 21.077 181 181 0 7.119 0 9.4 9.4 0 9.4 0 5678100 0 685320 4343600 0 649150 0 0 0 0 0 2146300 0 0 1 1 0 1 0 3 628 5936 True 6187 22790;22791;22792 22925;22926;22927 22925 -1
YHR064C YHR064C 46 46 46 YHR064C pep chromosome:R64-1-1:VIII:225525:227141:-1 gene:YHR064C transcript:YHR064C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSZ1 description:Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog); interacts with Zu 1 46 46 46 34 27 32 33 32 37 34 27 32 33 32 37 34 27 32 33 32 37 88.1 88.1 88.1 58.237 538 538 0 323.31 76.6 70.8 70.8 78.3 78.1 75.1 25724000000 4966700000 2237800000 7990200000 2407800000 1944100000 6177700000 5945100000 4884500000 5336500000 5490200000 6076000000 5873100000 48 45 47 49 51 57 297 629 133;372;373;1022;1124;1125;1298;1492;1586;1587;1778;2849;2875;2876;2879;4041;4042;5267;5449;5450;5451;6019;6020;6046;6047;6081;6331;6816;6817;7013;7234;7235;7341;7342;7354;7389;7484;7921;7922;8749;9627;10385;10939;11008;11944;11945 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 139;394;395;1070;1174;1175;1351;1552;1649;1650;1845;2949;2976;2977;2981;4206;4207;5488;5683;5684;5685;6270;6271;6297;6298;6332;6593;6594;7102;7103;7302;7578;7579;7706;7707;7720;7758;7859;8321;8322;9178;10098;10887;11463;11534;12507;12508 563;564;565;566;567;568;569;570;571;572;573;574;1627;1628;1629;1630;1631;1632;1633;1634;1635;1636;1637;1638;1639;1640;1641;1642;1643;1644;1645;4299;4300;4301;4302;4303;4609;4610;4611;4612;4613;4614;4615;4616;5223;5936;5937;6297;6298;6299;6300;6301;6302;6303;6304;6305;6306;6307;6308;6309;7014;10808;10809;10810;10811;10812;10813;10814;10815;10816;10817;10818;10819;10820;10911;10912;10913;10914;10915;10916;10917;10918;10919;10920;10921;10922;10923;10924;10925;10926;10927;10928;10929;10930;10931;10932;10933;10947;10948;10949;15346;15347;15348;15349;15350;15351;15352;15353;15354;15355;15356;15357;20120;20121;20122;20123;20124;20946;20947;20948;20949;20950;20951;20952;23076;23077;23078;23079;23080;23081;23082;23083;23084;23085;23086;23087;23088;23089;23090;23091;23092;23093;23094;23095;23096;23097;23098;23099;23100;23101;23102;23103;23104;23105;23106;23107;23108;23109;23110;23111;23193;23194;23195;23196;23197;23340;23341;23342;23343;23344;23345;23346;23347;23348;23349;23350;24192;24193;24194;24195;24196;24197;24198;26044;26045;26046;26047;26048;26049;26050;26051;26052;26053;26054;26055;26056;26791;26792;26793;26794;26795;27712;27713;27714;27715;27716;27717;27718;28144;28145;28146;28147;28148;28149;28150;28151;28152;28153;28154;28155;28156;28157;28158;28159;28203;28204;28205;28206;28207;28208;28209;28210;28211;28212;28353;28354;28355;28356;28357;28358;28359;28749;28750;30373;30374;30375;30376;30377;30378;30379;30380;30381;30382;30383;30384;30385;30386;30387;30388;30389;33395;33396;33397;33398;33399;36880;36881;36882;36883;36884;36885;36886;36887;39821;39822;39823;39824;39825;39826;42090;42091;42092;42093;42094;42095;42356;42357;42358;42359;46222;46223;46224;46225 564;565;566;567;568;569;570;571;572;573;574;575;1630;1631;1632;1633;1634;1635;1636;1637;1638;1639;1640;1641;1642;1643;1644;1645;1646;1647;1648;4321;4322;4323;4324;4325;4635;4636;4637;4638;4639;4640;4641;4642;5254;5971;5972;6333;6334;6335;6336;6337;6338;6339;6340;6341;6342;6343;6344;6345;7054;10876;10877;10878;10879;10880;10881;10882;10883;10884;10885;10886;10887;10888;10982;10983;10984;10985;10986;10987;10988;10989;10990;10991;10992;10993;10994;10995;10996;10997;10998;10999;11000;11001;11002;11003;11004;11005;11006;11007;11008;11009;11023;11024;11025;15454;15455;15456;15457;15458;15459;15460;15461;15462;15463;15464;15465;20244;20245;20246;20247;20248;21073;21074;21075;21076;21077;21078;21079;23212;23213;23214;23215;23216;23217;23218;23219;23220;23221;23222;23223;23224;23225;23226;23227;23228;23229;23230;23231;23232;23233;23234;23235;23236;23237;23238;23239;23240;23241;23242;23243;23244;23245;23246;23247;23329;23330;23331;23332;23333;23477;23478;23479;23480;23481;23482;23483;23484;23485;23486;23487;24340;24341;24342;24343;24344;24345;24346;26201;26202;26203;26204;26205;26206;26207;26208;26209;26210;26211;26212;26213;26952;26953;26954;26955;26956;27885;27886;27887;27888;27889;27890;27891;28318;28319;28320;28321;28322;28323;28324;28325;28326;28327;28328;28329;28330;28331;28332;28333;28334;28378;28379;28380;28381;28382;28383;28384;28385;28386;28387;28530;28531;28532;28533;28534;28535;28536;28929;28930;30562;30563;30564;30565;30566;30567;30568;30569;30570;30571;30572;30573;30574;30575;30576;30577;30578;33595;33596;33597;33598;33599;37099;37100;37101;37102;37103;37104;37105;37106;40058;40059;40060;40061;40062;40063;42382;42383;42384;42385;42386;42387;42651;42652;42653;42654;46539;46540;46541;46542 567;1640;1646;4324;4635;4637;5254;5972;6337;6342;7054;10880;10989;11005;11024;15455;15462;20247;21075;21078;21079;23214;23238;23329;23330;23487;24341;26208;26212;26955;27889;27891;28321;28328;28386;28533;28930;30569;30576;33596;37104;40059;42387;42654;46539;46542 329;330 299;499 -1
YHR065C YHR065C 18 18 18 YHR065C pep chromosome:R64-1-1:VIII:227532:229037:-1 gene:YHR065C transcript:YHR065C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RRP3 description:Protein involved in rRNA processing; required for maturation of the 35S pri 1 18 18 18 11 7 13 11 9 11 11 7 13 11 9 11 11 7 13 11 9 11 43.7 43.7 43.7 55.968 501 501 0 111.35 30.9 19.8 33.1 29.3 22.4 29.1 1182500000 170650000 76524000 551520000 118850000 57700000 207280000 247450000 204360000 254140000 215820000 229660000 204980000 13 9 15 12 11 15 75 630 371;605;815;1448;1931;2001;3106;3883;4959;5266;6325;6638;7109;7695;9066;9673;9885;10667 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 393;639;857;1508;2004;2005;2076;3215;4040;5165;5487;6586;6916;7417;8081;9510;10146;10370;11177 1625;1626;2583;3399;3400;3401;3402;5790;5791;7429;7430;7641;7642;7643;7644;7645;11747;11748;11749;11750;11751;11752;11753;11754;11755;11756;11757;14767;14768;18872;20115;20116;20117;20118;20119;24171;24172;24173;25342;25343;25344;25345;25346;25347;25348;25349;25350;27148;27149;27150;27151;27152;27153;29488;29489;29490;29491;29492;29493;29494;29495;29496;34680;34681;34682;34683;34684;34685;37072;37073;37074;37960;37961;37962;40796 1628;1629;2590;3411;3412;3413;3414;5825;5826;7470;7471;7683;7684;7685;7686;7687;11829;11830;11831;11832;11833;11834;11835;11836;11837;11838;11839;11840;14869;14870;18994;20239;20240;20241;20242;20243;24319;24320;24321;25496;25497;25498;25499;25500;25501;25502;25503;25504;27310;27311;27312;27313;27314;27315;29672;29673;29674;29675;29676;29677;29678;29679;29680;34888;34889;34890;34891;34892;34893;37291;37292;37293;38191;38192;38193;41039 1629;2590;3412;5826;7470;7686;11833;14869;18994;20241;24321;25501;27313;29677;34889;37292;38192;41039 331;332 496;498 -1
YHR066W YHR066W 12 12 3 YHR066W pep chromosome:R64-1-1:VIII:229335:230696:1 gene:YHR066W transcript:YHR066W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SSF1 description:Constituent of 66S pre-ribosomal particles; required for ribosomal large sub 1 12 12 3 6 7 7 7 9 6 6 7 7 7 9 6 1 1 2 2 2 1 33.8 33.8 8.2 51.763 453 453 0 111.72 22.5 21.2 18.1 23 24.1 15.7 516770000 67708000 55105000 207540000 34944000 40903000 110580000 87867000 149470000 69870000 132700000 117160000 90887000 6 8 7 7 9 6 43 631 1601;3717;6766;8191;8942;9291;9292;10155;10495;10590;11043;11250 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1664;3863;7047;8602;9382;9747;9748;10651;11002;11098;11570;11787 6352;6353;6354;6355;14128;14129;14130;25858;25859;31313;34094;34095;34096;34097;35605;35606;35607;35608;35609;35610;35611;35612;35613;35614;35615;35616;38963;38964;38965;38966;40217;40218;40219;40554;40555;40556;40557;42496;42497;42498;43347;43348;43349 6388;6389;6390;6391;14225;14226;14227;26015;26016;31508;34299;34300;34301;34302;35813;35814;35815;35816;35817;35818;35819;35820;35821;35822;35823;35824;39198;39199;39200;39201;40458;40459;40460;40797;40798;40799;40800;42791;42792;42793;43645;43646;43647 6391;14227;26015;31508;34301;35817;35820;39198;40458;40800;42792;43645 -1
YHR068W YHR068W 1 1 1 YHR068W pep chromosome:R64-1-1:VIII:232133:233296:1 gene:YHR068W transcript:YHR068W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DYS1 description:Deoxyhypusine synthase; catalyzes formation of deoxyhypusine, the first step 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 4.4 4.4 4.4 42.892 387 387 0.00087566 3.7117 0 4.4 0 4.4 0 4.4 5549600 0 1790800 0 660000 0 3098800 0 0 0 0 0 3098800 0 1 0 1 0 1 3 632 8778 True 9209 33487;33488;33489 33687;33688;33689 33688 -1
YHR069C YHR069C 2 2 2 YHR069C pep chromosome:R64-1-1:VIII:233579:234658:-1 gene:YHR069C transcript:YHR069C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RRP4 description:Exosome non-catalytic core component; involved in 3-5 RNA processing and 1 2 2 2 0 0 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 2 1 0 0 11.7 11.7 11.7 39.427 359 359 0 6.2004 0 0 11.7 7.5 0 0 16782000 0 0 13444000 3337700 0 0 0 0 7921800 0 0 0 0 0 2 1 0 0 3 633 7965;8910 True;True 8368;9346 30558;33972;33973 30748;34174;34175 30748;34175 -1
YHR070W YHR070W 3 3 3 YHR070W pep chromosome:R64-1-1:VIII:234881:236380:1 gene:YHR070W transcript:YHR070W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRM5 description:tRNA(m(1)G37)methyltransferase; methylates a tRNA base adjacent to the antic 1 3 3 3 0 3 0 1 0 0 0 3 0 1 0 0 0 3 0 1 0 0 7.8 7.8 7.8 56.514 499 499 0 12.179 0 7.8 0 2.6 0 0 7616600 0 5185500 0 2431200 0 0 0 11248000 0 0 0 0 0 3 0 1 0 0 4 634 1487;8915;9513 True;True;True 1547;9351;9981 5924;33982;36497;36498 5959;34184;36713;36714 5959;34184;36714 -1
YHR072W-A YHR072W-A 7 7 7 YHR072W-A pep chromosome:R64-1-1:VIII:241664:241840:1 gene:YHR072W-A transcript:YHR072W-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP10 description:Subunit of box H/ACA snoRNP complex; required for pseudouridylation a 1 7 7 7 2 4 4 4 3 4 2 4 4 4 3 4 2 4 4 4 3 4 70.7 70.7 70.7 6.6356 58 58 0 29.046 39.7 55.2 70.7 70.7 53.4 67.2 3221100000 369750000 479520000 1544100000 280160000 80218000 467360000 801970000 438640000 950340000 276360000 305860000 856470000 5 9 9 8 7 6 44 635 2282;2634;5291;5404;7113;7114;11563 True;True;True;True;True;True;True 2364;2728;5512;5632;7421;7422;7423;7424;12107 8704;9938;9939;9940;9941;9942;9943;20204;20205;20206;20727;20728;20729;20730;20731;20732;20733;20734;20735;27161;27162;27163;27164;27165;27166;27167;27168;27169;27170;27171;27172;27173;27174;27175;27176;27177;27178;27179;27180;27181;27182;27183;44661 8749;9989;9990;9991;9992;9993;9994;20328;20329;20330;20854;20855;20856;20857;20858;20859;20860;20861;20862;27323;27324;27325;27326;27327;27328;27329;27330;27331;27332;27333;27334;27335;27336;27337;27338;27339;27340;27341;27342;27343;27344;27345;27346;44967 8749;9992;20329;20861;27323;27326;44967 333;334 1;4 -1
YHR073W YHR073W 7 7 7 YHR073W pep chromosome:R64-1-1:VIII:242582:245572:1 gene:YHR073W transcript:YHR073W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OSH3 description:Member of an oxysterol-binding protein family; this family has seven members 1 7 7 7 3 1 1 2 1 0 3 1 1 2 1 0 3 1 1 2 1 0 10.3 10.3 10.3 113.76 996 996 0 11.146 5.1 0.8 1.1 3.7 1.5 0 22417000 9602900 2777600 7562100 1981500 492890 0 0 0 0 4076300 0 0 3 1 0 2 0 0 6 636 2399;5264;8573;9031;9874;10607;12150 True;True;True;True;True;True;True 2484;5485;8997;9475;10357;11115;12714 9110;20112;32694;32695;34557;37906;40592;47035 9157;20236;32891;32892;34764;38136;40835;47362 9157;20236;32891;34764;38136;40835;47362 -1
YHR077C YHR077C 7 7 7 YHR077C pep chromosome:R64-1-1:VIII:252374:255756:-1 gene:YHR077C transcript:YHR077C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NMD2 description:Protein involved in the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway; interac 1 7 7 7 4 3 3 3 2 2 4 3 3 3 2 2 4 3 3 3 2 2 7.5 7.5 7.5 126.75 1089 1089 0 20.599 5 3.3 3.2 3.3 3.1 2.5 129850000 12732000 7435000 92019000 6169100 4056000 7441900 9026400 15249000 0 14333000 17138000 10555000 4 3 3 3 2 2 17 637 986;2448;4362;6571;7193;8858;10236 True;True;True;True;True;True;True 1032;2533;4541;6848;7530;9294;10732 4099;4100;4101;4102;9281;16552;25097;25098;27570;27571;33789;33790;33791;33792;33793;33794;39263 4115;4116;4117;4118;9328;16662;25247;25248;27743;27744;33990;33991;33992;33993;33994;33995;39499 4118;9328;16662;25248;27744;33994;39499 -1
YHR082C YHR082C 4 4 4 YHR082C pep chromosome:R64-1-1:VIII:268459:271548:-1 gene:YHR082C transcript:YHR082C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KSP1 description:Serine/threonine protein kinase; associates with TORC1 and likely involved 1 4 4 4 2 1 1 2 0 1 2 1 1 2 0 1 2 1 1 2 0 1 5.9 5.9 5.9 117.08 1029 1029 0 6.8385 2.9 1.3 1.6 2.7 0 1.7 20380000 3900100 1491500 6420100 6655900 0 1912600 0 0 0 13692000 0 0 2 1 1 2 0 1 7 638 1202;2242;9585;12182 True;True;True;True 1253;2324;10054;12749 4865;4866;8549;36723;36724;36725;47142 4891;4892;8594;36941;36942;36943;47469 4891;8594;36942;47469 -1
YHR085W YHR085W 1 1 1 YHR085W pep chromosome:R64-1-1:VIII:276764:277768:1 gene:YHR085W transcript:YHR085W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IPI1 description:Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes; requir 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3.9 3.9 3.9 37.866 334 334 0.0093257 1.7272 0 3.9 0 0 0 0 965530 0 965530 0 0 0 0 0 2094400 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 639 4976 True 5182 18927 19049 19049 -1
YHR088W YHR088W 10 10 10 YHR088W pep chromosome:R64-1-1:VIII:281495:282382:1 gene:YHR088W transcript:YHR088W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPF1 description:Protein involved in assembly and export of the large ribosomal subunit; nucl 1 10 10 10 8 3 5 9 4 6 8 3 5 9 4 6 8 3 5 9 4 6 45.1 45.1 45.1 35.121 295 295 0 67.249 33.2 12.5 25.8 42.7 20 29.2 580810000 109700000 54087000 217400000 77313000 32444000 89866000 114790000 136880000 140450000 104610000 128990000 119180000 8 3 5 9 5 5 35 640 492;5754;5862;6060;8418;8742;11025;11576;11729;12340 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 520;5995;6107;6311;8839;9170;11552;12122;12286;12913 2106;2107;2108;2109;22027;22028;22029;22030;22464;23250;23251;23252;23253;23254;32119;32120;33360;42432;42433;42434;42435;42436;42437;42438;44729;44730;44731;44732;44733;45414;45415;45416;45417;47748;47749;47750 2112;2113;2114;2115;22157;22158;22159;22160;22598;23386;23387;23388;23389;23390;32315;32316;33560;42727;42728;42729;42730;42731;42732;42733;45035;45036;45037;45038;45039;45728;45729;45730;45731;48080;48081;48082 2113;22158;22598;23390;32315;33560;42729;45036;45728;48081 -1
YHR089C YHR089C 9 9 9 YHR089C pep chromosome:R64-1-1:VIII:282681:283298:-1 gene:YHR089C transcript:YHR089C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GAR1 description:Protein component of the H/ACA snoRNP pseudouridylase complex; involved in 1 9 9 9 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 45.9 45.9 45.9 21.48 205 205 0 75.126 45.9 40.5 45.9 40.5 40.5 43.4 7488300000 1749900000 535920000 2541500000 720310000 539230000 1401500000 1912800000 1235600000 1756100000 1512300000 1777700000 1372700000 13 12 12 12 12 13 74 641 1031;1649;2775;4521;4522;8921;9072;10528;10873 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1079;1713;2873;4714;4715;9357;9358;9516;11035;11393 4325;4326;4327;6515;6516;6517;6518;6519;6520;6521;6522;6523;6524;6525;6526;10520;10521;10522;10523;10524;10525;10526;10527;17214;17215;17216;17217;17218;17219;17220;17221;17222;17223;17224;17225;17226;17227;17228;17229;17230;33995;33996;33997;33998;33999;34000;34001;34002;34003;34004;34005;34707;34708;34709;34710;34711;40336;40337;40338;40339;40340;40341;40342;40343;40344;40345;40346;41797;41798;41799;41800;41801;41802;41803 4347;4348;4349;6551;6552;6553;6554;6555;6556;6557;6558;6559;6560;6561;6562;10586;10587;10588;10589;10590;10591;10592;10593;17328;17329;17330;17331;17332;17333;17334;17335;17336;17337;17338;17339;17340;17341;17342;17343;17344;34197;34198;34199;34200;34201;34202;34203;34204;34205;34206;34207;34915;34916;34917;34918;34919;40577;40578;40579;40580;40581;40582;40583;40584;40585;40586;40587;42060;42061;42062;42063;42064;42065;42066 4349;6558;10587;17338;17341;34200;34918;40578;42064 335 40 -1
YHR094C YHR094C 3 2 2 YHR094C pep chromosome:R64-1-1:VIII:290913:292625:-1 gene:YHR094C transcript:YHR094C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HXT1 description:Low-affinity glucose transporter of the major facilitator superfamily; expr 1 3 2 2 0 2 0 3 0 1 0 1 0 2 0 1 0 1 0 2 0 1 6.5 4.4 4.4 63.261 570 570 0 4.087 0 5.3 0 6.5 0 3.2 21814000 0 7490500 0 9795500 0 4527800 0 0 0 20151000 0 0 0 1 0 2 0 1 4 642 2798;7207;12165 True;False;True 2897;7546;12729 10605;10606;10607;27610;27611;47077 10672;10673;10674;27783;27784;47404 10674;27783;47404 -1
YHR097C YHR097C 1 1 1 YHR097C pep chromosome:R64-1-1:VIII:297385:298609:-1 gene:YHR097C transcript:YHR097C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative protein of unknown function; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localiz 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 4.6 4.6 4.6 40.662 366 366 0.00082508 3.0884 4.6 4.6 0 0 0 0 5175000 2541200 2633700 0 0 0 0 0 5713000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 643 10194 True 10690 39116;39117 39351;39352 39352 -1
YHR098C YHR098C 3 3 3 YHR098C pep chromosome:R64-1-1:VIII:299145:301934:-1 gene:YHR098C transcript:YHR098C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SFB3 description:Component of the Sec23p-Sfb3p heterodimer of the COPII vesicle coat; COPII 1 3 3 3 2 0 1 0 1 1 2 0 1 0 1 1 2 0 1 0 1 1 3.7 3.7 3.7 103.95 929 929 0 7.4291 2.3 0 1.1 0 1.4 1.4 18535000 4282900 0 9547500 0 1270500 3433800 0 0 0 0 0 3433800 1 0 0 0 1 0 2 644 2208;5507;10366 True;True;True 2290;5743;10867 8437;8438;21198;21199;39752 8480;8481;21325;21326;39989 8480;21326;39989 -1
YHR099W YHR099W 4 4 4 YHR099W pep chromosome:R64-1-1:VIII:302761:313995:1 gene:YHR099W transcript:YHR099W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRA1 description:Subunit of SAGA and NuA4 histone acetyltransferase complexes; interacts with 1 4 4 4 1 1 0 3 2 3 1 1 0 3 2 3 1 1 0 3 2 3 1.5 1.5 1.5 433.17 3744 3744 0 15.209 0.4 0.3 0 1.1 0.8 1.2 20433000 1900700 1866600 0 4487500 2635200 9543000 0 0 0 10312000 9224600 7951000 1 1 0 3 3 4 12 645 2652;4921;9082;9322 True;True;True;True 2746;5127;9526;9778 9988;18750;18751;34750;34751;34752;34753;34754;35733;35734;35735;35736 10041;18871;18872;34958;34959;34960;34961;34962;35941;35942;35943;35944 10041;18872;34962;35943 -1
YHR103W YHR103W 3 3 3 YHR103W pep chromosome:R64-1-1:VIII:320414:322972:1 gene:YHR103W transcript:YHR103W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SBE22 description:Protein involved in bud growth; involved in the transport of cell wall comp 1 3 3 3 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 4.2 4.2 4.2 96.397 852 852 0 3.7401 1.8 1.3 1.2 1.8 1.8 0 7786200 1245600 2018300 2390500 996920 1134900 0 0 4378000 0 0 0 0 1 1 1 1 1 0 5 646 8007;9559;9710 True;True;True 8412;10028;10184 30705;30706;30707;36646;37199 30895;30896;30897;36863;37418 30895;36863;37418 -1
YHR107C YHR107C 10 10 10 YHR107C pep chromosome:R64-1-1:VIII:326813:328036:-1 gene:YHR107C transcript:YHR107C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CDC12 description:Component of the septin ring that is required for cytokinesis; septins are 1 10 10 10 6 6 2 4 2 5 6 6 2 4 2 5 6 6 2 4 2 5 30.5 30.5 30.5 46.667 407 407 0 88.214 21.6 20.9 6.6 14.5 6.6 16.5 140110000 35524000 20642000 12331000 16656000 7219100 47740000 42859000 35384000 29115000 34271000 0 38816000 6 5 2 4 2 5 24 647 114;3987;4583;5033;8254;8977;10620;10621;11400;11971 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 119;4149;4779;5242;8670;9418;11128;11129;11937;12534 491;492;493;494;495;15155;15156;15157;17491;19181;31561;31562;31563;34216;34217;34218;34219;40627;40628;40629;40630;44041;44042;44043;46319 492;493;494;495;496;15262;15263;15264;17606;19304;31757;31758;31759;34422;34423;34424;34425;40870;40871;40872;40873;44340;44341;44342;46638 494;15263;17606;19304;31757;34424;40870;40872;44341;46638 -1
YHR108W YHR108W 3 3 3 YHR108W pep chromosome:R64-1-1:VIII:328303:330060:1 gene:YHR108W transcript:YHR108W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GGA2 description:Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking; binds p 1 3 3 3 0 1 1 2 0 1 0 1 1 2 0 1 0 1 1 2 0 1 6.8 6.8 6.8 64.346 585 585 0 9.4957 0 1.9 1.4 5.5 0 1.4 23144000 0 2138600 12106000 2950700 0 5948600 0 0 0 6069900 0 0 0 1 1 2 0 1 5 648 1057;2510;7246 True;True;True 1105;2598;7593 4395;4396;9453;9454;27761 4419;4420;9501;9502;27934 4419;9502;27934 336 36 -1
YHR114W YHR114W 3 3 3 YHR114W pep chromosome:R64-1-1:VIII:338083:339984:1 gene:YHR114W transcript:YHR114W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BZZ1 description:SH3 domain protein implicated in regulating actin polymerization; able to re 1 3 3 3 0 0 1 1 2 1 0 0 1 1 2 1 0 0 1 1 2 1 7.9 7.9 7.9 71.17 633 633 0 13.991 0 0 3.5 1.6 4.4 1.6 11015000 0 0 7361300 1311700 2341600 0 0 0 0 0 7742300 0 0 0 1 1 2 1 5 649 2770;4454;10318 True;True;True 2868;4645;10818 10508;16964;39585;39586;39587 10574;17077;39821;39822;39823 10574;17077;39822 -1
YHR117W YHR117W 7 7 7 YHR117W pep chromosome:R64-1-1:VIII:342349:344268:1 gene:YHR117W transcript:YHR117W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TOM71 description:Mitochondrial outer membrane protein; probable minor component of the TOM ( 1 7 7 7 2 5 1 4 0 2 2 5 1 4 0 2 2 5 1 4 0 2 13.3 13.3 13.3 71.855 639 639 0 19.268 2.8 10.5 1.7 6.1 0 2.8 62857000 9012300 20302000 9712900 13823000 0 10007000 0 34280000 0 24584000 0 23615000 2 4 1 4 0 2 13 650 4035;4097;6500;6567;7003;7078;8944 True;True;True;True;True;True;True 4200;4263;6776;6844;7292;7383;9384 15332;15333;15334;15588;15589;15590;15591;24839;24840;25082;25083;26758;27058;34102 15440;15441;15442;15696;15697;15698;15699;24989;24990;25232;25233;26919;27220;34307 15441;15696;24989;25232;26919;27220;34307 -1
YHR121W YHR121W 8 8 8 YHR121W pep chromosome:R64-1-1:VIII:352756:353319:1 gene:YHR121W transcript:YHR121W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LSM12 description:Protein of unknown function that may function in RNA processing; interacts 1 8 8 8 2 4 2 1 3 3 2 4 2 1 3 3 2 4 2 1 3 3 49.7 49.7 49.7 21.313 187 187 0 19.055 18.7 21.4 13.9 9.1 21.9 17.6 51045000 7430300 7026200 13171000 2827400 5724300 14866000 0 15739000 0 0 18428000 0 2 3 2 1 3 3 14 651 1194;3070;3425;4236;7005;8335;9822;9839 True;True;True;True;True;True;True;True 1245;3179;3551;4409;7294;8752;10303;10320 4852;11621;11622;11623;13009;13010;16105;16106;26761;31840;31841;31842;37693;37761;37762 4878;11703;11704;11705;13096;13097;16214;16215;26922;32036;32037;32038;37922;37990;37991 4878;11704;13097;16215;26922;32037;37922;37990 -1
YHR127W YHR127W 5 5 5 YHR127W pep chromosome:R64-1-1:VIII:360913:361644:1 gene:YHR127W transcript:YHR127W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YHR127W description:Protein of unknown function; localizes to the nucleus; required for asymm 1 5 5 5 0 2 3 1 2 2 0 2 3 1 2 2 0 2 3 1 2 2 22.2 22.2 22.2 27.132 243 243 0 11.934 0 7.8 15.6 4.9 8.6 7.8 100580000 0 8429700 48046000 4375100 26967000 12763000 0 0 28311000 0 0 0 0 2 3 1 2 2 10 652 1567;5589;6928;7457;7962 True;True;True;True;True 1630;5826;7216;7831;8365 6243;21469;26484;26485;26486;26487;26488;28652;28653;30551 6279;21596;26644;26645;26646;26647;26648;28832;28833;30741 6279;21596;26646;28833;30741 -1
YHR128W YHR128W 10 10 10 YHR128W pep chromosome:R64-1-1:VIII:362115:362765:1 gene:YHR128W transcript:YHR128W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FUR1 description:Uracil phosphoribosyltransferase; synthesizes UMP from uracil; involved in t 1 10 10 10 2 3 7 7 3 3 2 3 7 7 3 3 2 3 7 7 3 3 45.4 45.4 45.4 24.594 216 216 0 31.199 10.2 13 37 35.6 12 14.4 210160000 7492500 13671000 113680000 48267000 8264500 18784000 0 35661000 54376000 86957000 37293000 27757000 2 3 6 8 3 3 25 653 230;1114;3814;4323;4853;4893;5772;6314;7931;12025 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 241;1164;3965;4500;5056;5097;6014;6575;8331;12588 989;990;4571;14499;14500;16416;18467;18468;18469;18470;18636;18637;18638;18639;18640;22087;22088;22089;24151;24152;24153;30421;30422;46576;46577 991;992;4597;14598;14599;16525;18585;18586;18587;18588;18757;18758;18759;18760;18761;22217;22218;22219;24298;24299;24300;24301;30610;30611;46897;46898 991;4597;14598;16525;18587;18758;22218;24300;30611;46898 -1
YHR133C YHR133C 2 2 2 YHR133C pep chromosome:R64-1-1:VIII:370722:371597:-1 gene:YHR133C transcript:YHR133C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NSG1 description:Protein involved in regulation of sterol biosynthesis; specifically stabili 1 2 2 2 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 14.8 14.8 14.8 32.214 291 291 0.0015873 2.7227 12 2.7 2.7 12 0 12 41377000 11978000 0 3793300 14306000 0 11300000 0 0 2235200 0 0 0 1 1 1 1 0 1 5 654 2854;5867 True;True 2955;6112 10832;10833;22478;22479;22480 10900;10901;22612;22613;22614 10901;22614 -1
YHR135C YHR135C 5 3 3 YHR135C pep chromosome:R64-1-1:VIII:372694:374310:-1 gene:YHR135C transcript:YHR135C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:YCK1 description:Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform; shares r 1 5 3 3 1 3 0 4 1 1 1 1 0 3 1 0 1 1 0 3 1 0 15.2 11.3 11.3 61.714 538 538 0 14.587 3.2 7.1 0 13.2 3.2 2 17611000 2780300 5978900 0 7386500 1465300 0 0 12969000 0 0 0 0 1 2 0 3 1 0 7 655 1112;4011;5646;9730;12181 False;True;True;True;False 1162;4174;5884;10206;12748 4566;4567;15258;21671;37291;37292;37293;37294;37295;47140;47141 4592;4593;15365;21799;37513;37514;37515;37516;37517;47467;47468 4592;15365;21799;37516;47468 337 89 -1
YNL162W;YHR141C YNL162W;YHR141C 8;8 8;8 8;8 YNL162W pep chromosome:R64-1-1:XIV:331322:332154:1 gene:YNL162W transcript:YNL162W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL42A description:Ribosomal 60S subunit protein L42A; homologous to mammalian ribosomal prote 2 8 8 8 6 3 2 3 3 3 6 3 2 3 3 3 6 3 2 3 3 3 34 34 34 12.211 106 106;106 0 15.169 26.4 22.6 16 22.6 17 10.4 640870000 131710000 79345000 165080000 44696000 30154000 189880000 92270000 173230000 126950000 96261000 100070000 234160000 6 4 3 3 4 3 23 656 731;806;1040;1041;3515;3516;5420;11679 True;True;True;True;True;True;True;True 772;847;1088;1089;3649;3650;5653;12233 3049;3050;3347;3348;3349;4351;4352;4353;13371;13372;13373;13374;13375;13376;20832;45189;45190;45191;45192;45193;45194;45195;45196;45197 3060;3061;3359;3360;3361;4374;4375;4376;13460;13461;13462;13463;13464;13465;20959;45501;45502;45503;45504;45505;45506;45507;45508;45509 3061;3359;4374;4376;13460;13464;20959;45504 -1;-1
YHR143W-A YHR143W-A 2 2 2 YHR143W-A pep chromosome:R64-1-1:VIII:387233:387445:1 gene:YHR143W-A transcript:YHR143W-A_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPC10 description:RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III; 1 2 2 2 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 0 2 0 1 0 0 38.6 38.6 38.6 7.7159 70 70 0 26.137 0 38.6 0 28.6 0 0 13787000 0 9089700 0 4697500 0 0 0 19717000 0 0 0 0 0 2 0 1 0 0 3 657 1655;6914 True;True 1719;7202 6536;6537;26449 6572;6573;26609 6572;26609 -1
YHR146W YHR146W 8 8 8 YHR146W pep chromosome:R64-1-1:VIII:390300:391697:1 gene:YHR146W transcript:YHR146W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CRP1 description:Protein that binds to cruciform DNA structures; CRP1 has a paralog, MDG1, th 1 8 8 8 5 4 4 2 4 2 5 4 4 2 4 2 5 4 4 2 4 2 27.7 27.7 27.7 51.115 465 465 0 26.047 17.8 14.8 13.8 5.8 11.2 5.8 207420000 62442000 30980000 59698000 13026000 19799000 21478000 69824000 59149000 35085000 48233000 45885000 39496000 5 5 4 2 4 2 22 658 412;1701;1997;3197;4491;6389;6476;9437 True;True;True;True;True;True;True;True 437;1766;2072;3311;4683;6655;6748;9901 1806;6729;6730;7627;12064;17099;17100;17101;17102;17103;24398;24743;24744;24745;24746;24747;36188;36189;36190;36191;36192;36193 1812;6769;6770;7669;12149;17213;17214;17215;17216;17217;24546;24892;24893;24894;24895;24896;36400;36401;36402;36403;36404;36405 1812;6769;7669;12149;17214;24546;24895;36404 -1
YHR148W YHR148W 6 6 6 YHR148W pep chromosome:R64-1-1:VIII:393534:394085:1 gene:YHR148W transcript:YHR148W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IMP3 description:Component of the SSU processome; SSU processome is required for pre-18S rRNA 1 6 6 6 1 5 3 3 3 2 1 5 3 3 3 2 1 5 3 3 3 2 35.5 35.5 35.5 21.885 183 183 0 28.854 5.5 29.5 14.2 14.2 15.8 9.8 127900000 5354500 36654000 46990000 10201000 8454600 20245000 0 50053000 34417000 35200000 25042000 31667000 1 5 3 3 3 2 17 659 2320;5352;7021;7731;11035;12267 True;True;True;True;True;True 2404;5578;7314;8121;11562;12838 8844;8845;8846;8847;8848;20481;20482;20483;26832;26833;26834;26835;26836;26837;29673;42472;47454 8889;8890;8891;8892;8893;20608;20609;20610;26993;26994;26995;26996;26997;26998;29857;42767;47785 8893;20608;26995;29857;42767;47785 -1
YHR154W YHR154W 3 3 3 YHR154W pep chromosome:R64-1-1:VIII:402966:406178:1 gene:YHR154W transcript:YHR154W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RTT107 description:Protein implicated in Mms22-dependent DNA repair during S phase; involved 1 3 3 3 1 0 0 1 0 2 1 0 0 1 0 2 1 0 0 1 0 2 4.3 4.3 4.3 123.02 1070 1070 0 6.7407 1.9 0 0 1.2 0 2.4 13105000 3105300 0 0 2419300 0 7580400 0 0 0 0 0 7580400 1 0 0 1 0 2 4 660 1035;2146;5903 True;True;True 1083;2226;6150 4333;8206;22626;22627 4355;8248;22761;22762 4355;8248;22761 -1
YHR158C YHR158C 5 5 5 YHR158C pep chromosome:R64-1-1:VIII:413685:417179:-1 gene:YHR158C transcript:YHR158C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KEL1 description:Protein required for proper cell fusion and cell morphology; forms a comple 1 5 5 5 2 0 0 4 1 0 2 0 0 4 1 0 2 0 0 4 1 0 5.7 5.7 5.7 131.09 1164 1164 0 16.232 2.4 0 0 4.7 1.5 0 11246000 6209200 0 0 4327700 709340 0 0 0 0 8902700 0 0 3 0 0 3 1 0 7 661 1826;2416;3357;4512;5914 True;True;True;True;True 1895;2501;3479;4705;6161 7162;9177;9178;9179;9180;12718;17179;22666 7202;9224;9225;9226;9227;12804;17293;22801 7202;9224;12804;17293;22801 -1
YHR165C YHR165C 2 2 2 YHR165C pep chromosome:R64-1-1:VIII:429707:436948:-1 gene:YHR165C transcript:YHR165C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRP8 description:Component of U4/U6-U5 snRNP complex; involved in second catalytic step of s 1 2 2 2 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 0 0.6 0.6 0.6 279.5 2413 2413 0.0065934 1.9026 0 0.3 0.3 0 0.3 0 14724000 0 2758600 7434400 0 4530800 0 0 0 4380700 0 0 0 0 1 1 0 0 0 2 662 169;2886 True;True 176;2988 728;729;10969 729;730;11045 729;11045 -1
YHR169W YHR169W 12 12 12 YHR169W pep chromosome:R64-1-1:VIII:442181:443476:1 gene:YHR169W transcript:YHR169W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DBP8 description:ATPase, putative RNA helicase of the DEAD-box family; component of 90S preri 1 12 12 12 6 2 8 7 7 8 6 2 8 7 7 8 6 2 8 7 7 8 33.6 33.6 33.6 47.878 431 431 0 43.359 15.3 4.4 23.4 18.1 19 21.6 543280000 57136000 16584000 239130000 57127000 39452000 133850000 116980000 63989000 125450000 97397000 112150000 117350000 6 2 8 7 6 8 37 663 1989;3107;4000;4321;4526;4752;5265;5501;9306;10167;11549;11816 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 2064;3216;4163;4498;4719;4951;5486;5737;9762;10663;12091;12375 7603;7604;11758;11759;11760;11761;15213;15214;15215;15216;15217;16405;16406;16407;16408;16409;16410;17247;18096;18097;18098;18099;18100;20113;20114;21186;35660;35661;35662;35663;35664;35665;39021;39022;44596;45742;45743;45744 7645;7646;11841;11842;11843;11844;15320;15321;15322;15323;15324;16514;16515;16516;16517;16518;16519;17361;18213;18214;18215;18216;18217;20237;20238;21313;35868;35869;35870;35871;35872;35873;39256;39257;44902;46058;46059;46060 7646;11842;15322;16514;17361;18216;20237;21313;35871;39256;44902;46059 -1
YHR170W YHR170W 3 3 3 YHR170W pep chromosome:R64-1-1:VIII:443828:445384:1 gene:YHR170W transcript:YHR170W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NMD3 description:Protein involved in nuclear export of the large ribosomal subunit; acts as a 1 3 3 3 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 1 1 0 2 1 1 1 1 8.7 8.7 8.7 59.095 518 518 0 13.98 0 6.4 2.3 3.7 3.7 3.7 16652000 0 3442400 4494400 1596800 1072400 6046300 0 7467100 0 0 0 0 0 3 1 1 1 1 7 664 132;7119;10558 True;True;True 138;7430;11066 559;560;561;562;27211;40450 560;561;562;563;27374;40692;40693 562;27374;40692 -1
YHR174W YHR174W 22 22 10 YHR174W pep chromosome:R64-1-1:VIII:451327:452640:1 gene:YHR174W transcript:YHR174W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ENO2 description:Enolase II, a phosphopyruvate hydratase; catalyzes conversion of 2-phosphogl 1 22 22 10 20 7 12 11 13 13 20 7 12 11 13 13 10 4 4 6 5 7 68.6 68.6 36.4 46.914 437 437 0 197.54 63.2 28.8 44.9 45.3 46.7 52.6 2289800000 673630000 76908000 716520000 177540000 197320000 447850000 684300000 289940000 543310000 424030000 518130000 471720000 24 7 15 15 17 15 93 665 14;65;904;3208;3209;3409;3786;3880;3881;4037;4058;4929;5774;7975;8654;8946;9111;9112;9915;11393;11817;11978 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 16;67;947;3322;3323;3534;3535;3935;4037;4038;4202;4224;5135;6016;8379;9079;9386;9557;9558;10402;11930;12376;12541 63;64;65;66;67;264;265;266;3730;3731;3732;3733;3734;3735;3736;3737;3738;12093;12094;12095;12096;12097;12098;12099;12930;12931;12932;12933;12934;12935;12936;12937;12938;12939;12940;12941;14392;14760;14761;14762;14763;14764;14765;15336;15431;15432;15433;18768;18769;22096;22097;22098;22099;22100;22101;30591;30592;32970;32971;32972;32973;34111;34847;34848;34849;34850;34851;34852;34853;38066;38067;38068;38069;38070;38071;38072;44002;44003;44004;44005;45745;45746;46336;46337;46338;46339;46340;46341;46342;46343;46344;46345;46346;46347 63;64;65;66;67;265;266;267;3744;3745;3746;3747;3748;3749;3750;3751;3752;12178;12179;12180;12181;12182;12183;12184;13017;13018;13019;13020;13021;13022;13023;13024;13025;13026;13027;13028;14491;14862;14863;14864;14865;14866;14867;15444;15539;15540;15541;18889;18890;22226;22227;22228;22229;22230;22231;30781;30782;33168;33169;33170;33171;34316;35055;35056;35057;35058;35059;35060;35061;38297;38298;38299;38300;38301;38302;38303;44301;44302;44303;44304;46061;46062;46656;46657;46658;46659;46660;46661;46662;46663;46664;46665;46666;46667 66;267;3748;12180;12182;13023;14491;14862;14866;15444;15540;18890;22227;30781;33169;34316;35056;35061;38297;44301;46062;46658 338 63 -1
YHR183W;YGR256W YHR183W 7;2 7;2 7;2 YHR183W pep chromosome:R64-1-1:VIII:470960:472429:1 gene:YHR183W transcript:YHR183W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GND1 description:6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating); catalyzes an NADPH regen 2 7 7 7 1 2 0 5 2 0 1 2 0 5 2 0 1 2 0 5 2 0 22.9 22.9 22.9 53.543 489 489;492 0 33.994 4.7 5.5 0 16.2 6.3 0 29118000 6855700 5641700 0 12527000 4094100 0 0 0 0 21208000 18097000 0 1 1 0 4 2 0 8 666 1016;3025;5812;6461;9050;10881;11840 True;True;True;True;True;True;True 1064;3133;6055;6733;9494;11401;12399 4265;11430;11431;11432;22266;24701;34626;34627;41832;45806 4286;11509;11510;11511;22397;24850;34834;34835;42095;46122 4286;11509;22397;24850;34835;42095;46122 -1;-1
YHR186C YHR186C 3 3 3 YHR186C pep chromosome:R64-1-1:VIII:475999:480672:-1 gene:YHR186C transcript:YHR186C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KOG1 description:Subunit of TORC1; TORC1 is a rapamycin-sensitive complex involved in growth 1 3 3 3 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 2.7 2.7 2.7 177.61 1557 1557 0 13.836 1.2 0.8 0 1.2 0 0.8 8987300 3269200 1434800 0 1579100 0 2704200 0 0 0 3248400 0 0 1 1 0 1 0 1 4 667 3690;7701;9699 True;True;True 3836;8087;10172 14037;14038;29509;37163 14132;14133;29693;37382 14133;29693;37382 -1
YHR187W YHR187W 1 1 1 YHR187W pep chromosome:R64-1-1:VIII:480990:481919:1 gene:YHR187W transcript:YHR187W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IKI1 description:Subunit of hexameric RecA-like ATPase Elp456 Elongator subcomplex; which is 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 3.2 3.2 3.2 35.219 309 309 0.0008244 3.0835 0 3.2 0 3.2 3.2 0 5421600 0 2382400 0 1634600 1404600 0 0 0 0 0 4644100 0 0 1 0 1 1 0 3 668 3156 True 3268 11945;11946;11947 12030;12031;12032 12030 -1
YHR190W YHR190W 2 2 2 YHR190W pep chromosome:R64-1-1:VIII:484845:486179:1 gene:YHR190W transcript:YHR190W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ERG9 description:Farnesyl-diphosphate farnesyl transferase (squalene synthase); joins two far 1 2 2 2 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 6.1 6.1 6.1 51.719 444 444 0.0015432 2.4303 2.7 0 2.7 3.4 3.4 0 12088000 3557000 0 6486400 1394200 650810 0 0 0 3822100 0 0 0 1 0 1 1 1 0 4 669 940;6280 True;True 983;6539 3929;3930;24035;24036 3944;3945;24180;24181 3945;24181 -1
YHR193C YHR193C 3 3 3 YHR193C pep chromosome:R64-1-1:VIII:487712:488236:-1 gene:YHR193C transcript:YHR193C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EGD2 description:Alpha subunit of the nascent polypeptide-associated complex (NAC); involved 1 3 3 3 1 3 1 2 2 2 1 3 1 2 2 2 1 3 1 2 2 2 25.9 25.9 25.9 18.709 174 174 0 14.943 9.8 25.9 7.5 17.2 16.1 17.2 80228000 6497700 29249000 8941200 17303000 4978800 13259000 0 61190000 0 36955000 0 14154000 1 3 1 2 2 2 11 670 293;8681;8690 True;True;True 309;9106;9116 1299;1300;33093;33094;33095;33096;33097;33124;33125;33126;33127 1301;1302;33292;33293;33294;33295;33296;33323;33324;33325;33326 1301;33295;33325 -1
YHR196W YHR196W 4 4 4 YHR196W pep chromosome:R64-1-1:VIII:491931:493658:1 gene:YHR196W transcript:YHR196W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP9 description:Nucleolar protein; component of the small subunit (SSU) processome containin 1 4 4 4 4 2 2 2 1 2 4 2 2 2 1 2 4 2 2 2 1 2 10.8 10.8 10.8 65.271 575 575 0 13.459 10.8 6.4 4.3 5.2 2.6 4.3 105570000 19050000 9027600 39358000 12617000 4992900 20524000 17608000 0 17908000 0 27892000 21699000 4 3 3 2 2 3 17 671 1730;5168;6018;9572 True;True;True;True 1797;5380;6269;10041 6862;6863;19745;19746;23073;23074;23075;36687;36688;36689;36690;36691;36692;36693;36694;36695 6902;6903;19868;19869;23209;23210;23211;36904;36905;36906;36907;36908;36909;36910;36911;36912;36913 6902;19869;23211;36908 -1
YHR197W YHR197W 1 1 1 YHR197W pep chromosome:R64-1-1:VIII:493896:496187:1 gene:YHR197W transcript:YHR197W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RIX1 description:Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes; requir 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.6 1.6 1.6 86.738 763 763 0.0052239 2.1016 0 1.6 0 0 0 0 1591500 0 1591500 0 0 0 0 0 3452200 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 672 8833 True 9266 33711 33912 33912 -1
YJR145C;YHR203C YJR145C;YHR203C 36;36 36;36 36;36 YJR145C pep chromosome:R64-1-1:X:702027:703068:-1 gene:YJR145C transcript:YJR145C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPS4A description:Protein component of the small (40S) ribosomal subunit; mutation affects 20S 2 36 36 36 25 25 30 25 24 25 25 25 30 25 24 25 25 25 30 25 24 25 80.1 80.1 80.1 29.41 261 261;261 0 181.8 65.5 68.6 77.4 65.5 68.2 69 16052000000 3180000000 1565400000 5227000000 1904800000 635500000 3539700000 2989300000 3144300000 3528100000 3549900000 3271300000 3354700000 33 36 40 41 32 36 218 673 1423;1976;1977;1990;2168;3422;3497;3498;3707;3843;4068;4069;4713;4714;4716;4717;5086;5390;5459;5460;6108;6415;6583;6634;6635;6647;6648;6952;8051;8543;10011;10228;10229;11478;12230;12231 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1482;2051;2052;2065;2248;3548;3631;3632;3853;4000;4234;4235;4910;4911;4913;4914;5296;5618;5695;5696;6359;6681;6860;6912;6913;6925;6926;7240;8456;8967;10500;10501;10724;10725;12018;12019;12800;12801 5689;5690;5691;5692;7572;7573;7574;7575;7576;7577;7578;7605;7606;7607;7608;7609;7610;8281;8282;8283;8284;8285;8286;8287;8288;12997;12998;12999;13000;13001;13002;13003;13004;13288;13289;13290;13291;13292;13293;13294;13295;13296;13297;13298;13299;13300;13301;13302;13303;13304;13305;13306;14094;14612;14613;14614;15464;15465;15466;15467;15468;15469;15470;15471;15472;15473;15474;17905;17906;17907;17908;17909;17910;17911;17912;17913;17914;17915;17917;17918;17919;17920;17921;17922;17923;17924;17925;17926;17927;17928;17929;17930;17931;17932;17933;17934;17935;19443;19444;19445;19446;19447;20649;20650;20651;21036;21037;21038;21039;21040;21041;21042;21043;21044;23457;23458;23459;23460;24483;24484;24485;24486;24487;24488;24489;24490;24491;24492;24493;24494;24495;25146;25147;25148;25149;25150;25151;25152;25153;25154;25334;25335;25336;25337;25373;25374;25375;25376;25377;25378;25379;25380;25381;25382;25383;26589;26590;26591;26592;26593;26594;30859;32574;32575;32576;38370;38371;38372;38373;38374;38375;38376;38377;38378;38379;38380;38381;38382;38383;38384;38385;38386;38387;38388;39233;39234;39235;39236;39237;39238;39239;39240;39241;39242;39243;39244;39245;44320;44321;44322;44323;44324;44325;44326;44327;44328;44329;44330;44331;44332;44333;44334;47326;47327;47328;47329;47330;47331;47332 5724;5725;5726;5727;7614;7615;7616;7617;7618;7619;7620;7647;7648;7649;7650;7651;7652;8324;8325;8326;8327;8328;8329;8330;8331;13084;13085;13086;13087;13088;13089;13090;13091;13377;13378;13379;13380;13381;13382;13383;13384;13385;13386;13387;13388;13389;13390;13391;13392;13393;13394;13395;14191;14711;14712;14713;14714;14715;15572;15573;15574;15575;15576;15577;15578;15579;15580;15581;15582;18021;18022;18023;18024;18025;18026;18027;18028;18029;18030;18031;18033;18034;18035;18036;18037;18038;18039;18040;18041;18042;18043;18044;18045;18046;18047;18048;18049;18050;18051;19566;19567;19568;19569;19570;20776;20777;20778;21163;21164;21165;21166;21167;21168;21169;21170;21171;23597;23598;23599;23600;24631;24632;24633;24634;24635;24636;24637;24638;24639;24640;24641;24642;24643;25296;25297;25298;25299;25300;25301;25302;25303;25304;25488;25489;25490;25491;25527;25528;25529;25530;25531;25532;25533;25534;25535;25536;25537;26749;26750;26751;26752;26753;26754;31051;32770;32771;32772;38602;38603;38604;38605;38606;38607;38608;38609;38610;38611;38612;38613;38614;38615;38616;38617;38618;38619;38620;39469;39470;39471;39472;39473;39474;39475;39476;39477;39478;39479;39480;39481;44626;44627;44628;44629;44630;44631;44632;44633;44634;44635;44636;44637;44638;44639;44640;47655;47656;47657;47658;47659;47660;47661 5727;7614;7620;7648;8329;13090;13377;13384;14191;14713;15572;15579;18022;18028;18040;18051;19570;20778;21163;21171;23597;24632;25299;25488;25491;25529;25535;26749;31051;32770;38606;39470;39481;44631;47655;47660 339 87 -1;-1
YHR205W YHR205W 1 1 1 YHR205W pep chromosome:R64-1-1:VIII:509363:511837:1 gene:YHR205W transcript:YHR205W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SCH9 description:AGC family protein kinase; functional ortholog of mammalian S6 kinase; phosp 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1.7 1.7 1.7 91.81 824 824 0 5.7702 1.7 1.7 0 1.7 1.7 0 7878800 3174700 1680200 0 3023800 0 0 0 0 0 6220400 0 0 1 1 0 1 1 0 4 674 295 True 311 1302;1303;1304;1305 1304;1305;1306;1307 1306 -1
YHR208W YHR208W 6 6 4 YHR208W pep chromosome:R64-1-1:VIII:517532:518713:1 gene:YHR208W transcript:YHR208W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BAT1 description:Mitochondrial branched-chain amino acid (BCAA) aminotransferase; preferentia 1 6 6 4 2 4 1 4 3 0 2 4 1 4 3 0 1 2 0 3 2 0 21.9 21.9 15.3 43.596 393 393 0 20.921 4.8 12.5 4.3 11.5 10.9 0 63439000 8066800 20938000 12483000 11594000 10357000 0 21954000 33020000 0 27851000 31224000 0 2 4 1 4 3 0 14 675 1246;1898;3126;3816;5673;12397 True;True;True;True;True;True 1297;1969;3236;3967;5912;12972 5018;7359;7360;11828;14502;14503;21761;21762;21763;21764;47948;47949;47950;47951 5046;7400;7401;11912;14601;14602;21890;21891;21892;21893;48281;48282;48283;48284 5046;7401;11912;14602;21891;48284 -1
YHR216W;YAR073W;YAR075W YHR216W;YAR073W 8;5;1 1;1;0 1;1;0 YHR216W pep chromosome:R64-1-1:VIII:554396:555967:1 gene:YHR216W transcript:YHR216W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IMD2 description:Inosine monophosphate dehydrogenase; catalyzes the rate-limiting step in GTP 3 8 1 1 4 2 5 5 1 4 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 20.1 1.5 1.5 56.529 523 523;403;157 1 -2 12 6.3 14.7 13 4.8 11.5 2783000 0 0 0 0 0 2783000 0 0 0 0 0 2783000 0 0 0 0 0 0 0 + 676 1949;3187;7017;7799;7821;8003;9949;11187 False;False;True;False;False;False;False;False 2023;3301;7307;8195;8220;8408;10438;11722 7478;7479;12035;12036;12037;26810;29972;30057;30058;30694;30695;30696;38184;38185;38186;38187;43078;43079;43080;43081;43082 7519;7520;12120;12121;12122;26971;30159;30245;30246;30884;30885;30886;38416;38417;38418;38419;43375;43376;43377;43378;43379 7519;12121;26971;30159;30246;30886;38417;43376 340 1 -1;-1;-1
YIL009W YIL009W 4 4 4 YIL009W pep chromosome:R64-1-1:IX:339344:341428:1 gene:YIL009W transcript:YIL009W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FAA3 description:Long chain fatty acyl-CoA synthetase; activates imported fatty acids with a pr 1 4 4 4 3 0 0 1 1 0 3 0 0 1 1 0 3 0 0 1 1 0 7.3 7.3 7.3 77.946 694 694 0 7.9126 5.9 0 0 2 1.4 0 15909000 9942000 0 0 3940800 2026000 0 12986000 0 0 0 0 0 3 0 0 1 1 0 5 677 2442;8867;10096;10360 True;True;True;True 2527;9303;10588;10861 9262;9263;33823;38704;39736 9309;9310;34024;38937;39973 9310;34024;38937;39973 -1
YIL010W YIL010W 4 4 4 YIL010W pep chromosome:R64-1-1:IX:334882:335529:1 gene:YIL010W transcript:YIL010W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DOT5 description:Nuclear thiol peroxidase; functions as an alkyl-hydroperoxide reductase during 1 4 4 4 2 3 0 2 1 0 2 3 0 2 1 0 2 3 0 2 1 0 18.6 18.6 18.6 24.119 215 215 0 10.867 8.4 14.4 0 10.2 4.2 0 22202000 7442900 7703900 0 5770400 1284900 0 0 16711000 0 0 0 0 2 3 0 2 1 0 8 678 1630;3637;8990;11706 True;True;True;True 1693;3781;9433;12262 6454;6455;13867;13868;34269;45312;45313;45314 6490;6491;13958;13959;34475;45625;45626;45627 6491;13958;34475;45625 -1
YIL016W YIL016W 1 1 1 YIL016W pep chromosome:R64-1-1:IX:321454:321933:1 gene:YIL016W transcript:YIL016W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SNL1 description:Ribosome-associated protein; proposed to act in protein synthesis and nuclear 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.7 10.7 10.7 18.306 159 159 0 6.551 10.7 10.7 10.7 10.7 10.7 10.7 39335000 4303100 7398600 11033000 2988500 4089200 9523100 0 14804000 0 0 14167000 10122000 1 2 1 1 2 2 9 679 700 True 740 2910;2911;2912;2913;2914;2915;2916;2917;2918 2920;2921;2922;2923;2924;2925;2926;2927;2928 2922 -1
YIL022W YIL022W 9 9 9 YIL022W pep chromosome:R64-1-1:IX:311165:312460:1 gene:YIL022W transcript:YIL022W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TIM44 description:Essential component of the TIM23 complex; tethers the import motor and regula 1 9 9 9 6 5 2 2 2 3 6 5 2 2 2 3 6 5 2 2 2 3 22.3 22.3 22.3 48.854 431 431 0 20.445 15.1 12.3 5.3 5.3 5.3 9 72259000 22119000 9555800 16731000 4526300 2312500 17015000 15013000 16399000 16213000 15056000 12373000 18396000 6 5 2 2 2 3 20 680 710;984;3965;4898;5170;6121;6327;9454;11986 True;True;True;True;True;True;True;True;True 750;1030;4125;5102;5383;6372;6589;9919;12549 2944;2945;2946;2947;2948;4097;15087;18651;18652;19756;23494;23495;23496;23497;23498;23499;24185;36274;46368;46369 2954;2955;2956;2957;2958;4113;15194;18772;18773;19879;23634;23635;23636;23637;23638;23639;24333;36486;46688;46689 2956;4113;15194;18773;19879;23635;24333;36486;46689 -1
YIL026C YIL026C 3 3 3 YIL026C pep chromosome:R64-1-1:IX:304477:307929:-1 gene:YIL026C transcript:YIL026C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:IRR1 description:Subunit of the cohesin complex; which is required for sister chromatid cohesi 1 3 3 3 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 0 0 0 2 2 0 4 4 4 133.01 1150 1150 0 8.6095 0 0 0 2.9 2.4 0 12675000 0 0 0 7046500 5628100 0 0 0 0 14496000 0 0 0 0 0 2 2 0 4 681 4355;4776;7186 True;True;True 4534;4976;7520 16531;18176;18177;27545 16641;18293;18294;27718 16641;18293;27718 341 584 -1
YIL035C YIL035C 2 2 2 YIL035C pep chromosome:R64-1-1:IX:287790:288908:-1 gene:YIL035C transcript:YIL035C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CKA1 description:Alpha catalytic subunit of casein kinase 2 (CK2); a Ser/Thr protein kinase wi 1 2 2 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 0 0 0 1 0 2 6.5 6.5 6.5 44.667 372 372 0 4.1241 0 0 0 4.6 0 6.5 65625000 0 0 0 8028200 0 57597000 0 0 0 0 0 57597000 0 0 0 1 0 2 3 682 2342;3625 True;True 2426;3768 8905;13833;13834 8950;13924;13925 8950;13924 -1
YIL038C YIL038C 6 6 6 YIL038C pep chromosome:R64-1-1:IX:280142:282652:-1 gene:YIL038C transcript:YIL038C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOT3 description:Component of the CCR4-NOT core complex, involved in mRNA decapping; involved 1 6 6 6 3 2 2 2 2 1 3 2 2 2 2 1 3 2 2 2 2 1 10 10 10 94.402 836 836 0 56.958 5.7 3.2 3.7 3.2 3.8 2.2 52440000 9513500 5864500 23499000 5785600 2732900 5044400 0 12722000 0 11901000 0 0 3 2 2 2 2 1 12 683 4056;6117;6863;10503;11347;11606 True;True;True;True;True;True 4222;6368;7150;11010;11884;12154 15428;15429;23485;26237;26238;26239;26240;26241;26242;40239;43776;44866 15536;15537;23625;26395;26396;26397;26398;26399;26400;40480;44075;45174 15536;23625;26396;40480;44075;45174 -1
YIL041W YIL041W 1 1 1 YIL041W pep chromosome:R64-1-1:IX:276525:277505:1 gene:YIL041W transcript:YIL041W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:GVP36 description:BAR domain protein that localizes to early and late Golgi vesicles; required 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 3.1 3.1 3.1 36.67 326 326 0.00081103 2.9336 3.1 0 0 0 0 0 2220000 2220000 0 0 0 0 0 2899800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 684 4558 True 4753 17394 17509 17509 -1
YIL043C YIL043C 9 9 9 YIL043C pep chromosome:R64-1-1:IX:274072:274926:-1 gene:YIL043C transcript:YIL043C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CBR1 description:Cytochrome b reductase; not essential for viability; also detected in mitocho 1 9 9 9 5 6 6 4 4 6 5 6 6 4 4 6 5 6 6 4 4 6 44 44 44 31.493 284 284 0 33.787 27.1 30.3 34.5 22.2 18.7 33.1 382830000 53298000 38060000 113000000 36946000 24425000 117100000 84957000 65915000 79048000 75586000 81933000 105180000 6 8 6 5 4 6 35 685 301;2280;3198;4006;4867;8572;8994;9875;10216 True;True;True;True;True;True;True;True;True 317;2362;3312;4169;5070;8996;9437;10358;10712 1321;1322;1323;8689;8690;8691;8692;8693;8694;8695;8696;8697;12065;12066;15246;15247;18523;18524;18525;18526;18527;32691;32692;32693;34425;34426;37907;37908;37909;37910;37911;37912;39193;39194;39195 1323;1324;1325;8734;8735;8736;8737;8738;8739;8740;8741;8742;12150;12151;15353;15354;18641;18642;18643;18644;18645;32888;32889;32890;34631;34632;38137;38138;38139;38140;38141;38142;39429;39430;39431 1324;8734;12151;15353;18641;32889;34631;38141;39431 -1
YIL053W;YER062C YIL053W;YER062C 5;3 5;3 5;3 YIL053W pep chromosome:R64-1-1:IX:255115:255867:1 gene:YIL053W transcript:YIL053W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Constitutively expressed DL-glycerol-3-phosphate phosphatase; also known as glycerol-1-phosphat 2 5 5 5 4 3 3 3 0 1 4 3 3 3 0 1 4 3 3 3 0 1 26.4 26.4 26.4 27.947 250 250;250 0 15.427 20 15.6 16.4 15.6 0 6 112530000 27777000 13363000 47844000 13406000 0 10137000 33079000 30695000 26562000 30703000 0 0 4 3 4 3 0 1 15 686 4801;5593;7494;8153;11705 True;True;True;True;True 5002;5830;7870;8564;12261 18262;21480;21481;21482;21483;28786;28787;28788;31203;45306;45307;45308;45309;45310;45311 18379;21607;21608;21609;21610;28966;28967;28968;31396;45619;45620;45621;45622;45623;45624 18379;21607;28967;31396;45619 -1;-1
YIL068C YIL068C 1 1 1 YIL068C pep chromosome:R64-1-1:IX:233057:235474:-1 gene:YIL068C transcript:YIL068C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC6 description:Essential 88kDa subunit of the exocyst complex; the exocyst mediates polarize 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 2 2 2 93.427 805 805 1 -2 2 0 0 0 0 0 19637000 19637000 0 0 0 0 0 25650000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 + 687 7730 True 8120 29672 29856 29856 342;343 783;795 -1
YIL070C YIL070C 2 2 2 YIL070C pep chromosome:R64-1-1:IX:230272:231072:-1 gene:YIL070C transcript:YIL070C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MAM33 description:Specific translational activator for the mitochondrial COX1 mRNA; acidic pro 1 2 2 2 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 2 0 6.4 6.4 6.4 30.132 266 266 0 3.9859 0 0 0 0 6.4 0 4726100 0 0 0 0 4726100 0 0 0 0 0 15626000 0 0 0 0 0 2 0 2 688 2626;2627 True;True 2720;2721 9911;9912 9962;9963 9962;9963 -1
YIL074C YIL074C 1 1 1 YIL074C pep chromosome:R64-1-1:IX:221081:222490:-1 gene:YIL074C transcript:YIL074C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SER33 description:3-phosphoglycerate dehydrogenase and alpha-ketoglutarate reductase; 3PG dehy 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 3.2 3.2 3.2 51.188 469 469 0 10.044 3.2 0 0 0 0 0 1263200 1263200 0 0 0 0 0 1650000 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 689 9761 True 10237 37397 37619 37619 -1
YIL075C;YJR137C YIL075C 18;1 18;1 18;1 YIL075C pep chromosome:R64-1-1:IX:217863:220700:-1 gene:YIL075C transcript:YIL075C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPN2 description:Subunit of the 26S proteasome; substrate of the N-acetyltransferase Nat1p; pr 2 18 18 18 11 7 7 8 7 6 11 7 7 8 7 6 11 7 7 8 7 6 22.1 22.1 22.1 104.23 945 945;1442 0 88.697 13.1 9.7 10.3 11.3 9.4 8.3 397940000 98320000 38919000 120670000 44510000 24817000 70703000 110580000 74366000 70855000 98828000 80884000 92758000 11 7 7 7 6 6 44 690 636;1396;1490;2251;2378;2567;3162;3655;4840;6207;7294;8113;8298;9324;9488;10834;11753;12077 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 673;1454;1550;2333;2462;2656;3274;3800;5043;6464;7657;8521;8715;9780;9954;11354;12310;12640 2691;5586;5587;5929;5930;5931;8577;8578;8579;8580;9013;9678;9679;9680;11960;11961;13922;18397;23811;28000;28001;28002;28003;31077;31713;35743;35744;35745;35746;35747;35748;36375;36376;36377;41705;41706;41707;41708;41709;45508;45509;45510;46773;46774;46775;46776 2699;5621;5622;5964;5965;5966;8622;8623;8624;8625;9059;9728;9729;9730;12045;12046;14013;18514;23953;28174;28175;28176;28177;31270;31909;35951;35952;35953;35954;35955;35956;36588;36589;36590;41968;41969;41970;41971;41972;45822;45823;45824;47098;47099;47100;47101 2699;5621;5966;8625;9059;9728;12046;14013;18514;23953;28176;31270;31909;35956;36588;41968;45824;47101 344 923 -1;-1
YIL076W YIL076W 2 2 2 YIL076W pep chromosome:R64-1-1:IX:216658:217548:1 gene:YIL076W transcript:YIL076W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC28 description:Epsilon-COP subunit of the coatomer; regulates retrograde Golgi-to-ER protein 1 2 2 2 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 9.8 9.8 9.8 33.829 296 296 0 12.068 4.4 0 5.4 4.4 0 0 15250000 4033600 0 6774600 4441300 0 0 0 0 3991900 0 0 0 1 0 1 1 0 0 3 691 10335;10522 True;True 10835;11029 39636;40311;40312 39872;40552;40553 39872;40552 -1
YIL078W YIL078W 55 55 55 YIL078W pep chromosome:R64-1-1:IX:212499:214703:1 gene:YIL078W transcript:YIL078W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:THS1 description:Threonyl-tRNA synthetase; essential cytoplasmic protein; human homolog TARS ca 1 55 55 55 37 33 35 41 34 40 37 33 35 41 34 40 37 33 35 41 34 40 64.2 64.2 64.2 84.519 734 734 0 323.31 54.4 44.1 51.8 54 46.7 54.2 7857000000 1447400000 1121800000 2114300000 975570000 538130000 1659800000 1973000000 2153300000 1343900000 2012600000 1809200000 1651700000 47 43 40 48 41 48 267 692 354;1143;1219;1372;1429;1443;1489;1582;1953;2104;2406;3450;3840;3923;3924;4034;4819;4820;4905;5884;5917;6323;6529;6902;6961;7077;7261;7360;7401;7619;7620;7834;7883;8347;8426;8513;8720;8721;9123;9169;9873;10728;10762;10782;10783;11404;11416;11417;11737;11786;11824;12102;12194;12254;12341 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 373;1194;1270;1430;1488;1489;1503;1549;1645;2027;2028;2184;2491;3578;3997;4082;4083;4198;4199;5021;5022;5109;6129;6164;6584;6805;7190;7249;7382;7609;7727;7770;7999;8000;8233;8234;8283;8764;8847;8937;9147;9148;9570;9619;10356;11242;11278;11300;11301;11941;11953;11954;12294;12345;12383;12665;12762;12763;12825;12914 1576;1577;4659;4660;4661;4662;4663;4929;5503;5504;5505;5506;5507;5706;5707;5708;5709;5710;5711;5712;5713;5714;5715;5716;5717;5774;5775;5928;6280;6281;6282;6283;6284;6285;7486;7487;7488;7489;7490;8024;9144;9145;9146;9147;9148;9149;13085;13086;13087;13088;13089;13090;14600;14601;14602;14603;14604;14927;14928;14929;14930;14931;14932;14933;14934;14935;14936;14937;15325;15326;15327;15328;15329;15330;15331;18328;18329;18330;18681;18682;18683;18684;18685;18686;22540;22541;22542;22672;22673;22674;22675;22676;22677;22678;24164;24165;24166;24167;24168;24912;26402;26403;26404;26405;26406;26407;26623;27056;27057;27812;27813;27814;28227;28228;28229;28230;28231;28232;28393;28394;28395;28396;28397;29231;29232;29233;30108;30109;30110;30111;30112;30242;30243;30244;30245;30246;30247;30248;30249;30250;30251;30252;30253;31867;31868;31869;31870;31871;31872;31873;31874;31875;32138;32464;32465;33262;33263;33264;33265;33266;33267;33268;33269;33270;33271;33272;34908;34909;34910;34911;34912;34913;34914;35110;35111;35112;35113;35114;35115;37905;41213;41214;41215;41216;41217;41218;41219;41220;41402;41403;41404;41405;41489;41490;41491;41492;41493;41494;41495;41496;41497;41498;41499;41500;41501;41502;41503;41504;41505;44053;44054;44055;44056;44057;44058;44091;44092;44093;44094;44095;44096;45443;45444;45445;45446;45447;45448;45449;45450;45451;45452;45652;45653;45654;45655;45656;45657;45658;45758;45759;45760;45761;45762;46852;46853;46854;46855;46856;46857;46858;46859;47185;47186;47187;47188;47189;47190;47191;47192;47193;47194;47195;47397;47398;47399;47400;47401;47751;47752;47753 1579;1580;4685;4686;4687;4688;4689;4955;5538;5539;5540;5541;5542;5741;5742;5743;5744;5745;5746;5747;5748;5749;5750;5751;5752;5809;5810;5963;6316;6317;6318;6319;6320;6321;7527;7528;7529;7530;7531;8066;9191;9192;9193;9194;9195;9196;13173;13174;13175;13176;13177;13178;14699;14700;14701;14702;14703;15031;15032;15033;15034;15035;15036;15037;15038;15039;15040;15041;15433;15434;15435;15436;15437;15438;15439;18445;18446;18447;18802;18803;18804;18805;18806;18807;22674;22675;22676;22807;22808;22809;22810;22811;22812;22813;24312;24313;24314;24315;24316;25062;26561;26562;26563;26564;26565;26566;26783;27218;27219;27985;27986;27987;28402;28403;28404;28405;28406;28407;28570;28571;28572;28573;28574;29414;29415;29416;30296;30297;30298;30299;30300;30430;30431;30432;30433;30434;30435;30436;30437;30438;30439;30440;30441;32063;32064;32065;32066;32067;32068;32069;32070;32071;32334;32660;32661;33461;33462;33463;33464;33465;33466;33467;33468;33469;33470;33471;35116;35117;35118;35119;35120;35121;35122;35318;35319;35320;35321;35322;35323;38135;41466;41467;41468;41469;41470;41471;41472;41473;41662;41663;41664;41665;41752;41753;41754;41755;41756;41757;41758;41759;41760;41761;41762;41763;41764;41765;41766;41767;41768;44352;44353;44354;44355;44356;44357;44390;44391;44392;44393;44394;44395;45757;45758;45759;45760;45761;45762;45763;45764;45765;45766;45967;45968;45969;45970;45971;45972;45973;46074;46075;46076;46077;46078;47178;47179;47180;47181;47182;47183;47184;47185;47514;47515;47516;47517;47518;47519;47520;47521;47522;47523;47524;47727;47728;47729;47730;47731;48083;48084;48085 1580;4685;4955;5542;5744;5809;5963;6319;7531;8066;9194;13173;14703;15031;15035;15436;18445;18447;18803;22676;22809;24314;25062;26564;26783;27218;27986;28404;28574;29415;29416;30300;30440;32063;32334;32661;33465;33468;35120;35323;38135;41467;41662;41758;41765;44353;44390;44395;45762;45967;46078;47180;47515;47729;48085 345;346;347;348 189;345;689;702 -1
YIL091C YIL091C 4 4 4 YIL091C pep chromosome:R64-1-1:IX:191030:193195:-1 gene:YIL091C transcript:YIL091C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP25 description:Nucleolar protein; required for 35S pre-RNA processing and 40S ribosomal sub 1 4 4 4 1 1 3 0 1 1 1 1 3 0 1 1 1 1 3 0 1 1 7.1 7.1 7.1 83.99 721 721 0 14.035 2.1 1.4 4.6 0 2.5 1.1 25580000 2058200 1969800 15881000 0 1385300 4285600 0 0 9357700 0 0 0 1 1 3 0 1 1 7 693 6507;11109;11263;11726 True;True;True;True 6783;11640;11800;12282 24862;42784;42785;43392;43393;45396;45397 25012;43079;43080;43690;43691;45710;45711 25012;43079;43690;45710 -1
YIL093C YIL093C 1 1 1 YIL093C pep chromosome:R64-1-1:IX:187990:188784:-1 gene:YIL093C transcript:YIL093C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RSM25 description:Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit [Source:SGD;Acc:S000001 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 4.2 4.2 4.2 30.513 264 264 0 4.2268 0 0 0 4.2 0 0 1421600 0 0 0 1421600 0 0 0 0 0 2924300 0 0 0 0 0 1 0 0 1 694 4561 True 4756 17398 17513 17513 -1
YIL094C YIL094C 8 8 8 YIL094C pep chromosome:R64-1-1:IX:186517:187632:-1 gene:YIL094C transcript:YIL094C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LYS12 description:Homo-isocitrate dehydrogenase; an NAD-linked mitochondrial enzyme required f 1 8 8 8 3 3 7 2 1 3 3 3 7 2 1 3 3 3 7 2 1 3 25.3 25.3 25.3 40.068 371 371 0 31.402 11.6 11.6 22.1 8.4 5.7 12.1 150950000 10043000 14466000 94993000 5007600 1877800 24560000 18737000 32023000 44100000 15847000 0 24626000 3 3 8 2 1 3 20 695 840;1908;2995;3791;5309;9323;9427;12192 True;True;True;True;True;True;True;True 882;1981;3101;3940;5532;9779;9891;12760 3483;3484;3485;7381;11322;11323;11324;11325;11326;14403;14404;20307;35737;35738;35739;35740;35741;35742;36145;47183 3496;3497;3498;7422;11401;11402;11403;11404;11405;14502;14503;20433;35945;35946;35947;35948;35949;35950;36357;47512 3497;7422;11404;14502;20433;35947;36357;47512 -1
YIL103W YIL103W 2 2 2 YIL103W pep chromosome:R64-1-1:IX:171751:173028:1 gene:YIL103W transcript:YIL103W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:DPH1 description:Protein required for synthesis of diphthamide; required along with Dph2p, Kti1 1 2 2 2 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 6.6 6.6 6.6 48.31 425 425 0.00082781 3.1091 0 0 4 0 2.6 0 4099600 0 0 3750300 0 349270 0 0 0 0 0 1154800 0 0 0 0 0 1 0 1 696 2301;10957 True;True 2384;11482 8770;42175 8815;42470 8815;42470 -1
YIL104C YIL104C 4 4 4 YIL104C pep chromosome:R64-1-1:IX:169982:171505:-1 gene:YIL104C transcript:YIL104C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SHQ1 description:Chaperone protein; required for the assembly of box H/ACA snoRNPs and thus fo 1 4 4 4 1 2 0 2 2 1 1 2 0 2 2 1 1 2 0 2 2 1 10.5 10.5 10.5 59.15 507 507 0 24.1 2.6 6.5 0 4.7 5.9 3.4 22884000 2752300 4246500 0 6641000 3925400 5318400 0 9211300 0 0 0 0 1 2 0 2 3 1 9 697 5595;9180;10199;12012 True;True;True;True 5832;9630;10695;12575 21489;21490;21491;35155;39140;46527;46528;46529;46530 21616;21617;21618;35363;39375;46848;46849;46850;46851 21616;35363;39375;46851 -1
YIL105C YIL105C 5 5 5 YIL105C pep chromosome:R64-1-1:IX:167581:169641:-1 gene:YIL105C transcript:YIL105C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SLM1 description:Phosphoinositide PI4,5P(2) binding protein, forms a complex with Slm2p; acts 1 5 5 5 2 0 1 0 1 1 2 0 1 0 1 1 2 0 1 0 1 1 9.9 9.9 9.9 77.994 686 686 0 15.747 3.8 0 2.9 0 1.6 1.6 19483000 6302500 0 8235800 0 4944700 0 8232100 0 0 0 0 0 2 0 1 0 1 1 5 698 3476;5543;7870;9455;12248 True;True;True;True;True 3608;5780;8270;9920;12819 13231;21340;30211;36275;47371 13320;21467;30399;36487;47701 13320;21467;30399;36487;47701 -1
YIL109C YIL109C 12 12 12 YIL109C pep chromosome:R64-1-1:IX:157385:160165:-1 gene:YIL109C transcript:YIL109C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SEC24 description:Component of the Sec23p-Sec24p heterodimer of the COPII vesicle coat; requir 1 12 12 12 9 3 2 5 3 2 9 3 2 5 3 2 9 3 2 5 3 2 14 14 14 103.63 926 926 0 23.507 10.9 3.1 2.3 5.7 3.8 3 90094000 41891000 11381000 13695000 9639700 5074400 8412900 31379000 21886000 12320000 21723000 24507000 20681000 9 3 2 4 2 2 22 699 536;767;1636;2648;2656;2774;2826;4188;4349;6955;7551;9720 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 566;808;1699;2742;2750;2872;2925;4360;4528;7243;7929;10194 2335;2336;2337;3207;3208;3209;3210;3211;6467;9983;10012;10517;10518;10519;10717;15944;15945;15946;16510;26602;26603;28980;37247;37248 2342;2343;2344;3218;3219;3220;3221;3222;6503;10036;10065;10583;10584;10585;10785;16053;16054;16055;16620;26762;26763;29163;37468;37469 2342;3219;6503;10036;10065;10584;10785;16053;16620;26762;29163;37469 -1
YIL118W YIL118W 8 8 8 YIL118W pep chromosome:R64-1-1:IX:139752:140447:1 gene:YIL118W transcript:YIL118W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RHO3 description:Non-essential small GTPase of the Rho/Rac family of Ras-like proteins; involve 1 8 8 8 4 5 7 4 3 7 4 5 7 4 3 7 4 5 7 4 3 7 43.7 43.7 43.7 25.312 231 231 0 50.756 25.5 26.8 39.8 22.5 14.3 38.1 342640000 15287000 30236000 191630000 17828000 10768000 76891000 31815000 60683000 98686000 41590000 43188000 71676000 4 5 8 4 3 7 31 700 3412;3572;6899;7676;8906;10587;10811;11852 True;True;True;True;True;True;True;True 3538;3712;7187;8059;9342;11095;11330;12411 12946;12947;12948;12949;12950;12951;13612;13613;13614;13615;13616;26395;26396;29408;29409;29410;29411;33951;33952;33953;33954;40538;40539;40540;40541;41601;41602;41603;41604;45836;45837 13033;13034;13035;13036;13037;13038;13701;13702;13703;13704;13705;26554;26555;29592;29593;29594;29595;34153;34154;34155;34156;40781;40782;40783;40784;41864;41865;41866;41867;46152;46153 13034;13705;26554;29595;34155;40784;41865;46152 -1
YIL125W YIL125W 4 4 4 YIL125W pep chromosome:R64-1-1:IX:122689:125733:1 gene:YIL125W transcript:YIL125W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KGD1 description:Subunit of the mitochondrial alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex; cataly 1 4 4 4 2 2 0 2 1 1 2 2 0 2 1 1 2 2 0 2 1 1 5.9 5.9 5.9 114.41 1014 1014 0 14.455 3.6 3.3 0 3.6 2.3 2.3 27013000 6073200 5233100 0 4922600 3220700 7563200 0 0 0 10126000 0 0 2 2 0 2 1 1 8 701 2279;2465;3916;12360 True;True;True;True 2361;2551;4075;12934 8688;9341;14900;47807;47808;47809;47810;47811 8733;9388;15004;48139;48140;48141;48142;48143 8733;9388;15004;48139 -1
YIL126W YIL126W 19 19 15 YIL126W pep chromosome:R64-1-1:IX:117992:122071:1 gene:YIL126W transcript:YIL126W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:STH1 description:ATPase component of the RSC chromatin remodeling complex; required for express 1 19 19 15 6 7 7 11 4 7 6 7 7 11 4 7 5 7 5 9 4 7 14.8 14.8 12.1 156.74 1359 1359 0 54.581 4.6 6.2 5.7 8.4 2.5 6.4 227040000 27688000 31755000 70581000 45016000 14224000 37775000 46039000 62059000 37984000 85986000 52714000 39263000 6 7 7 11 4 6 41 702 319;3213;4304;4473;4474;5868;6001;6012;6033;6146;8399;9237;9371;9553;9931;10799;11030;11135;11310 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 335;3327;4480;4664;4665;6113;6252;6263;6284;6401;8820;9690;9831;10022;10420;11318;11557;11669;11847 1418;12108;12109;12110;16354;17035;17036;17037;17038;17039;17040;22481;22482;23016;23058;23059;23149;23150;23151;23152;23153;23599;23600;32055;35418;35419;35951;35952;35953;35954;35955;36631;36632;38126;38127;41563;42448;42449;42450;42451;42881;43615 1421;12193;12194;12195;16463;17149;17150;17151;17152;17153;17154;22615;22616;23151;23194;23195;23285;23286;23287;23288;23289;23740;23741;32251;35626;35627;36161;36162;36163;36164;36165;36848;36849;38357;38358;41826;42743;42744;42745;42746;43178;43914 1421;12193;16463;17149;17153;22616;23151;23195;23287;23741;32251;35627;36165;36849;38358;41826;42746;43178;43914 -1
YIL127C YIL127C 2 2 2 YIL127C pep chromosome:R64-1-1:IX:117024:117644:-1 gene:YIL127C transcript:YIL127C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RRT14 description:Putative protein of unknown function; identified in a screen for mutants wit 1 2 2 2 1 1 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 1 1 0 2 1 0 24.8 24.8 24.8 23.845 206 206 0 6.5153 9.7 9.7 0 24.8 9.7 0 145220000 27414000 65136000 0 43840000 8831100 0 0 141290000 0 0 0 0 1 2 0 2 1 0 6 703 9836;12244 True;True 10317;12814 37758;47359;47360;47361;47362;47363 37987;47689;47690;47691;47692;47693 37987;47689 -1
YIL129C YIL129C 1 1 1 YIL129C pep chromosome:R64-1-1:IX:106107:113237:-1 gene:YIL129C transcript:YIL129C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TAO3 description:Component of the RAM signaling network; is involved in regulation of Ace2p ac 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.6 0.6 0.6 269.85 2376 2376 1 -2 0 0 0 0 0 0.6 5325000 0 0 0 0 0 5325000 0 0 0 0 0 5325000 0 0 0 0 0 1 1 + 704 9146 True 9594 35014 35222 35222 349 2062 -1
YIL130W YIL130W 1 1 1 YIL130W pep chromosome:R64-1-1:IX:102782:105676:1 gene:YIL130W transcript:YIL130W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:ASG1 description:Zinc cluster protein proposed to be a transcriptional regulator; regulator inv 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1.1 1.1 1.1 108.78 964 964 0 9.6934 1.1 0 1.1 0 1.1 1.1 10459000 2017700 0 5128700 0 0 3312400 0 0 0 0 0 3312400 1 0 1 0 1 1 4 705 10764 True 11280 41409;41410;41411;41412 41669;41670;41671;41672 41672 -1
YIL131C YIL131C 3 3 3 YIL131C pep chromosome:R64-1-1:IX:100781:102235:-1 gene:YIL131C transcript:YIL131C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:FKH1 description:Forkhead family transcription factor; rate-limiting replication origin activa 1 3 3 3 0 1 0 1 3 0 0 1 0 1 3 0 0 1 0 1 3 0 9.3 9.3 9.3 53.489 484 484 0 3.8751 0 2.1 0 2.1 9.3 0 15506000 0 6455800 0 5013100 4037600 0 0 0 0 0 13350000 0 0 1 0 1 2 0 4 706 7550;7907;9301 True;True;True 7928;8307;9757 28977;28978;28979;30320;35648 29160;29161;29162;30509;35856 29161;30509;35856 -1
YIL133C YIL133C 27 27 16 YIL133C pep chromosome:R64-1-1:IX:98527:99416:-1 gene:YIL133C transcript:YIL133C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:RPL16A description:Ribosomal 60S subunit protein L16A; N-terminally acetylated, binds 5.8 S rRNA 1 27 27 16 22 22 19 21 23 17 22 22 19 21 23 17 13 13 12 12 12 11 71.9 71.9 51.3 22.201 199 199 0 94.934 62.3 62.8 63.8 64.3 64.8 57.8 7388000000 1132600000 903290000 2448200000 982490000 791670000 1129700000 1605500000 1563100000 1842000000 1908600000 1933400000 1711600000 27 26 20 27 29 21 150 707 127;4968;5296;5347;5397;5562;6102;6103;6109;6110;6730;6731;8227;8265;8541;8643;9785;9786;10540;10822;10949;10950;11529;11707;11933;11934;12027 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 132;5174;5517;5573;5625;5799;6353;6354;6360;6361;7010;7011;8641;8682;8965;9067;10265;10266;10267;11047;11342;11473;11474;12071;12263;12496;12497;12590 540;541;542;543;18905;18906;18907;18908;20227;20228;20229;20230;20460;20461;20462;20463;20464;20465;20466;20467;20670;20671;20672;20673;20674;20675;20676;20677;20678;20679;20680;21379;21380;21381;21382;21383;23424;23425;23426;23427;23428;23429;23430;23461;23462;23463;23464;23465;23466;23467;23468;23469;25659;25660;25661;25662;25663;25664;25665;25666;25667;25668;25669;25670;25671;25672;25673;25674;31466;31467;31468;31615;31616;31617;32567;32568;32569;32570;32571;32922;32923;32924;32925;32926;32927;32928;32929;32930;32931;32932;32933;37529;37530;37531;37532;37533;37534;37535;37536;37537;37538;37539;37540;37541;37542;37543;37544;40376;40377;40378;40379;40380;40381;41645;41646;41647;41648;41649;41650;41651;42137;42138;42139;42140;44525;44526;44527;44528;44529;44530;45315;45316;45317;45318;45319;46173;46174;46175;46176;46177;46178;46179;46180;46181;46182;46183;46581;46582;46583;46584;46585;46586;46587;46588;46589;46590 541;542;543;544;19027;19028;19029;19030;20351;20352;20353;20354;20587;20588;20589;20590;20591;20592;20593;20594;20797;20798;20799;20800;20801;20802;20803;20804;20805;20806;20807;21506;21507;21508;21509;21510;23561;23562;23563;23564;23565;23566;23567;23601;23602;23603;23604;23605;23606;23607;23608;23609;25813;25814;25815;25816;25817;25818;25819;25820;25821;25822;25823;25824;25825;25826;25827;25828;31662;31663;31664;31811;31812;31813;32763;32764;32765;32766;32767;33119;33120;33121;33122;33123;33124;33125;33126;33127;33128;33129;33130;37758;37759;37760;37761;37762;37763;37764;37765;37766;37767;37768;37769;37770;37771;37772;37773;40617;40618;40619;40620;40621;40622;41908;41909;41910;41911;41912;41913;41914;42429;42430;42431;42432;44831;44832;44833;44834;44835;44836;45628;45629;45630;45631;45632;46490;46491;46492;46493;46494;46495;46496;46497;46498;46499;46500;46902;46903;46904;46905;46906;46907;46908;46909;46910;46911 541;19028;20351;20594;20803;21506;23562;23566;23601;23607;25814;25819;31664;31813;32766;33121;37764;37771;40619;41910;42429;42431;44833;45631;46491;46500;46906 -1
YIL136W YIL136W 1 1 1 YIL136W pep chromosome:R64-1-1:IX:93619:94800:1 gene:YIL136W transcript:YIL136W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OM45 description:Mitochondrial outer membrane protein of unknown function; major constituent of t 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 3.1 3.1 3.1 44.58 393 393 0.0086705 1.7888 3.1 3.1 0 0 3.1 0 30444000 10763000 15482000 0 0 4198800 0 0 0 0 0 13883000 0 1 1 0 0 1 0 3 708 11916 True 12479 46109;46110;46111 46426;46427;46428 46426 -1
YIL137C YIL137C 9 9 9 YIL137C pep chromosome:R64-1-1:IX:89948:92788:-1 gene:YIL137C transcript:YIL137C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TMA108 description:Ribosome-associated, nascent chain binding factor; binds N-terminal region of 1 9 9 9 4 4 5 5 3 2 4 4 5 5 3 2 4 4 5 5 3 2 16.2 16.2 16.2 107.72 946 946 0 31.377 7.5 7.5 9.9 7.7 6.2 4.3 115850000 23000000 11780000 53739000 10022000 8220000 9091800 26930000 21592000 25884000 21935000 28063000 19742000 4 4 5 5 4 2 24 709 958;2346;2527;3116;5861;6390;7918;9035;9304 True;True;True;True;True;True;True;True;True 1003;2430;2615;3226;6106;6656;8318;9479;9760 4007;4008;8913;8914;8915;8916;8917;9507;11799;11800;11801;11802;11803;22459;22460;22461;22462;22463;24399;30366;34567;34568;34569;35657 4023;4024;8959;8960;8961;8962;8963;9555;11882;11883;11884;11885;11886;22593;22594;22595;22596;22597;24547;30555;34775;34776;34777;35865 4023;8963;9555;11883;22597;24547;30555;34776;35865 -1
YIL142W YIL142W 8 8 8 YIL142W pep chromosome:R64-1-1:IX:83302:84885:1 gene:YIL142W transcript:YIL142W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCT2 description:Subunit beta of the cytosolic chaperonin Cct ring complex; related to Tcp1p, req 1 8 8 8 4 2 1 5 7 3 4 2 1 5 7 3 4 2 1 5 7 3 19 19 19 57.203 527 527 0 58.254 9.9 4.4 2.7 12.1 16.7 7.6 95090000 18713000 7989300 9166800 16411000 16753000 26056000 28400000 35987000 0 29966000 35785000 26842000 4 2 1 5 7 3 22 710 221;2273;2827;4320;5548;6616;8277;9184 True;True;True;True;True;True;True;True 232;2355;2926;4497;5785;6893;8694;9634 960;8663;8664;8665;10718;16403;16404;21355;21356;25273;25274;25275;25276;25277;25278;31652;31653;31654;35166;35167;35168;35169 962;8708;8709;8710;10786;16512;16513;21482;21483;25427;25428;25429;25430;25431;25432;31848;31849;31850;35374;35375;35376;35377 962;8710;10786;16512;21482;25427;31848;35375 -1
YIL159W YIL159W 1 1 1 YIL159W pep chromosome:R64-1-1:IX:41825:45952:1 gene:YIL159W transcript:YIL159W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BNR1 description:Formin; nucleates the formation of linear actin filaments; involved in processes 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.9 0.9 156.85 1375 1375 1 -2 0 0 0.9 0 0 0 14314000 0 0 14314000 0 0 0 0 0 8434500 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 + 711 1614 True 1677 6393 6429 6429 350 1013 -1
YIR008C YIR008C 3 3 3 YIR008C pep chromosome:R64-1-1:IX:373077:374306:-1 gene:YIR008C transcript:YIR008C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRI1 description:Subunit of DNA primase; DNA primase is required for DNA synthesis and double- 1 3 3 3 1 3 1 2 2 1 1 3 1 2 2 1 1 3 1 2 2 1 6.8 6.8 6.8 47.69 409 409 0 7.0509 2.4 6.8 2.4 4.2 4.2 2.4 44170000 1517600 14980000 7382700 7579000 7657000 5053700 0 30225000 0 17016000 26161000 0 1 3 0 2 2 1 9 712 7961;8106;12217 True;True;True 8364;8514;12787 30545;30546;30547;30548;30549;30550;31062;31063;31064;47270 30735;30736;30737;30738;30739;30740;31255;31256;31257;47599 30735;31257;47599 -1
YIR034C YIR034C 1 1 1 YIR034C pep chromosome:R64-1-1:IX:419615:420736:-1 gene:YIR034C transcript:YIR034C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:LYS1 description:Saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming); catalyzes the conversion 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 5.6 5.6 5.6 41.464 373 373 0.0015898 2.7479 0 0 0 5.6 0 0 1037800 0 0 0 1037800 0 0 0 0 0 2134900 0 0 0 0 0 1 0 0 1 713 1574 True 1637 6262 6298 6298 -1
YJL001W YJL001W 2 2 2 YJL001W pep chromosome:R64-1-1:X:435163:435926:1 gene:YJL001W transcript:YJL001W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PRE3 description:Beta 1 subunit of the 20S proteasome; responsible for cleavage after acidic res 1 2 2 2 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 9.8 9.8 9.8 23.547 215 215 0 7.2967 0 0 4.7 5.1 0 0 10056000 0 0 8807700 1248100 0 0 0 0 5189900 0 0 0 0 0 1 1 0 0 2 714 5952;10654 True;True 6203;11163 22850;40758 22985;41001 22985;41001 -1
YJL002C YJL002C 1 1 1 YJL002C pep chromosome:R64-1-1:X:433221:434651:-1 gene:YJL002C transcript:YJL002C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:OST1 description:Alpha subunit of the oligosaccharyltransferase complex of the ER lumen; comple 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 3.4 3.4 3.4 54.071 476 476 0.00083542 3.21 3.4 0 0 0 0 3.4 7360100 3064500 0 0 0 0 4295600 0 0 0 0 0 4295600 1 0 0 0 0 1 2 715 625 True 661 2656;2657 2663;2664 2663 -1
YJL005W YJL005W 4 4 4 YJL005W pep chromosome:R64-1-1:X:425157:431237:1 gene:YJL005W transcript:YJL005W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CYR1 description:Adenylate cyclase; required for cAMP production and cAMP-dependent protein kina 1 4 4 4 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 2 1 2 1 0 1 3.1 3.1 3.1 227.83 2026 2026 0 12.714 1.7 0.6 1.8 1 0 1 27144000 7669300 1266800 11245000 1615200 0 5347400 0 0 6626200 0 0 0 2 1 2 1 0 1 7 716 4365;5662;8901;10440 True;True;True;True 4544;5901;9337;10947 16571;21731;33925;33926;33927;33928;40002 16681;21860;34126;34127;34128;34129;40239 16681;21860;34128;40239 -1
YJL006C YJL006C 2 2 2 YJL006C pep chromosome:R64-1-1:X:423138:424109:-1 gene:YJL006C transcript:YJL006C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CTK2 description:Beta subunit of C-terminal domain kinase I (CTDK-I); which phosphorylates both 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 13.3 13.3 13.3 37.904 323 323 0 6.1128 5.3 13.3 5.3 5.3 5.3 5.3 20533000 2827500 4634700 5604000 1705100 2425200 3336100 0 10053000 0 0 0 0 1 2 1 1 1 1 7 717 7322;8041 True;True 7686;8446 28077;30824;30825;30826;30827;30828;30829 28251;31016;31017;31018;31019;31020;31021 28251;31019 -1
YJL008C YJL008C 17 17 17 YJL008C pep chromosome:R64-1-1:X:419957:421663:-1 gene:YJL008C transcript:YJL008C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCT8 description:Subunit of the cytosolic chaperonin Cct ring complex; related to Tcp1p, requir 1 17 17 17 5 10 11 9 6 8 5 10 11 9 6 8 5 10 11 9 6 8 43.7 43.7 43.7 61.662 568 568 0 82.507 11.6 24.3 30.6 24.5 18 20.8 620390000 33330000 71286000 253030000 70169000 32014000 160560000 84666000 163180000 147620000 124140000 119890000 116570000 5 10 11 9 8 8 51 718 307;685;1809;1810;2138;2828;4143;4401;5435;5776;6264;6485;8167;9308;10481;10842;10857 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 323;725;1877;1878;2218;2927;4312;4585;4586;5669;6018;6523;6761;8578;9764;10988;11362;11377 1365;1366;1367;2855;7112;7113;8180;10719;10720;10721;10722;15747;15748;16731;16732;16733;16734;16735;16736;16737;20892;20893;20894;20895;22107;22108;22109;22110;22111;22112;23974;23975;23976;24780;31228;31229;35667;35668;35669;35670;40168;40169;40170;40171;40172;40173;41726;41727;41728;41769;41770 1368;1369;1370;2865;7152;7153;8222;10787;10788;10789;10790;15855;15856;16842;16843;16844;16845;16846;16847;16848;21019;21020;21021;21022;22237;22238;22239;22240;22241;22242;24119;24120;24121;24929;31422;31423;35875;35876;35877;35878;40407;40408;40409;40410;40411;40412;40413;40414;41989;41990;41991;42032;42033 1370;2865;7152;7153;8222;10789;15855;16846;21019;22241;24121;24929;31422;35878;40413;41991;42032 351;352 213;546 -1
YJL010C YJL010C 13 13 13 YJL010C pep chromosome:R64-1-1:X:417562:419562:-1 gene:YJL010C transcript:YJL010C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NOP9 description:Essential subunit of U3-containing 90S preribosome; involved in production of 1 13 13 13 7 5 5 5 3 8 7 5 5 5 3 8 7 5 5 5 3 8 19.5 19.5 19.5 77.721 666 666 0 70.804 12.9 8.9 9.8 8.9 4.7 13.2 394220000 64982000 33692000 145330000 33981000 19110000 97127000 81917000 73591000 85511000 75211000 82519000 75063000 7 5 5 5 3 8 33 719 578;579;1197;1469;2110;2562;2932;6944;8062;8150;8782;8854;10830 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 610;611;1248;1529;2190;2651;3037;7232;8467;8561;9213;9289;11350 2510;2511;2512;2513;4857;5863;8046;9662;9663;9664;11115;11116;26571;26572;26573;26574;26575;26576;30901;30902;30903;31190;33494;33495;33496;33497;33498;33774;33775;41689;41690;41691;41692 2517;2518;2519;2520;4883;5898;8088;9712;9713;9714;11192;11193;26731;26732;26733;26734;26735;26736;31093;31094;31095;31383;33694;33695;33696;33697;33698;33975;33976;41952;41953;41954;41955 2517;2520;4883;5898;8088;9712;11192;26735;31094;31383;33694;33976;41952 -1
YJL012C YJL012C 16 16 16 YJL012C pep chromosome:R64-1-1:X:411234:413399:-1 gene:YJL012C transcript:YJL012C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:VTC4 description:Vacuolar membrane polyphosphate polymerase; subunit of the vacuolar transporte 1 16 16 16 6 6 7 7 9 8 6 6 7 7 9 8 6 6 7 7 9 8 29.4 29.4 29.4 83.154 721 721 0 39.075 9 8.5 14.1 11.9 13.6 13.3 810810000 68488000 47732000 244130000 51085000 51632000 347750000 139780000 188620000 163380000 151310000 171660000 145650000 6 6 8 7 9 8 44 720 1667;2547;3087;3365;4648;4682;5656;6148;6457;9990;10105;10566;11172;12326;12381;12384 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 1731;2636;3196;3488;4844;4879;5894;6403;6727;10479;10597;11074;11707;12899;12956;12959 6581;9593;9594;9595;9596;11664;11665;11666;11667;11668;12750;17689;17790;17791;17792;17793;17794;21709;21710;21711;21712;21713;21714;23603;24678;24679;38322;38745;38746;38747;38748;38749;38750;38751;40470;43024;47680;47681;47682;47900;47901;47902;47903;47913 6617;9642;9643;9644;9645;11746;11747;11748;11749;11750;12836;17804;17905;17906;17907;17908;17909;21838;21839;21840;21841;21842;21843;23744;24827;24828;38554;38980;38981;38982;38983;38984;38985;38986;40713;43321;48012;48013;48014;48232;48233;48234;48235;48245 6617;9642;11746;12836;17804;17908;21840;23744;24827;38554;38986;40713;43321;48012;48233;48245 353 329 -1
YJL014W YJL014W 12 12 12 YJL014W pep chromosome:R64-1-1:X:407558:409162:1 gene:YJL014W transcript:YJL014W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCT3 description:Subunit of the cytosolic chaperonin Cct ring complex; related to Tcp1p, require 1 12 12 12 4 5 5 3 4 1 4 5 5 3 4 1 4 5 5 3 4 1 26.6 26.6 26.6 58.814 534 534 0 35.701 10.5 12.5 11.4 6.4 8.4 2.1 119500000 17727000 11411000 59969000 9344800 10415000 10633000 22071000 25816000 29086000 26941000 32988000 0 4 5 5 3 4 1 22 721 2973;3403;3426;4498;7966;8083;9359;9920;10331;10867;10868;11677 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 3079;3528;3552;4691;8369;8489;9818;10407;10831;11387;11388;12230 11249;11250;12911;12912;12913;13011;17137;17138;17139;30559;30978;35907;38091;39629;39630;39631;41789;41790;45180;45181;45182;45183 11327;11328;12998;12999;13000;13098;17251;17252;17253;30749;31170;36117;38322;39865;39866;39867;42052;42053;45492;45493;45494;45495 11327;12999;13098;17251;30749;31170;36117;38322;39867;42052;42053;45492 354 407 -1
YJL020C YJL020C 4 4 4 YJL020C pep chromosome:R64-1-1:X:398937:402410:-1 gene:YJL020C transcript:YJL020C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:BBC1 description:Protein possibly involved in assembly of actin patches; interacts with an acti 1 4 4 4 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 4.2 4.2 4.2 128.29 1157 1157 0 12.51 0.8 1.8 1 0 0.7 1 9366000 649610 6440400 0 0 720180 1555900 0 13970000 0 0 0 0 1 1 1 0 1 1 5 722 3760;3884;7464;11428 True;True;True;True 3908;4041;7838;11965 14285;14769;28672;44134;44135 14383;14871;28852;44433;44434 14383;14871;28852;44433 -1
YJL024C YJL024C 3 3 3 YJL024C pep chromosome:R64-1-1:X:395931:396592:-1 gene:YJL024C transcript:YJL024C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:APS3 description:Small subunit of the clathrin-associated adaptor complex AP-3; involved in vac 1 3 3 3 0 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 0 1 2 0 0 1 28.9 28.9 28.9 21.938 194 194 0 10.399 0 12.9 16 0 0 9.3 69577000 0 10324000 55471000 0 0 3782800 0 0 32686000 0 0 0 0 1 3 0 0 1 5 723 4773;6230;6814 True;True;True 4973;6488;7100 18172;18173;23866;23867;26042 18289;18290;24008;24009;26199 18289;24009;26199 -1
YJL033W YJL033W 19 19 19 YJL033W pep chromosome:R64-1-1:X:383837:386149:1 gene:YJL033W transcript:YJL033W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:HCA4 description:DEAD box RNA helicase; component of the SSU; interacts with Bfr2p and Enp2p; hi 1 19 19 19 9 7 6 8 7 5 9 7 6 8 7 5 9 7 6 8 7 5 34.2 34.2 34.2 87.192 770 770 0 53.024 15.5 11.8 13.9 19.9 12.2 9.5 411510000 79567000 35888000 168640000 43372000 25097000 58950000 93770000 82973000 96275000 84403000 82747000 72129000 9 7 5 8 7 5 41 724 611;702;738;1317;1978;2236;5107;6674;6765;7228;7825;8229;8414;9056;9252;9253;10284;10300;10685 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 646;742;779;1372;2053;2318;5317;6954;7046;7571;8224;8643;8835;9500;9705;9706;9707;10783;10800;11196 2599;2923;2924;3067;5281;7579;7580;8532;8533;19512;19513;25468;25469;25470;25852;25853;25854;25855;25856;25857;27702;30068;30069;30070;30071;31470;32111;34656;34657;35483;35484;35485;35486;39459;39460;39461;39462;39463;39464;39518;40929;40930 2606;2933;2934;3078;5312;7621;7622;8575;8576;19635;19636;25622;25623;25624;26009;26010;26011;26012;26013;26014;27875;30256;30257;30258;30259;31666;32307;34864;34865;35691;35692;35693;35694;39695;39696;39697;39698;39699;39700;39754;41176;41177 2606;2933;3078;5312;7621;8575;19635;25624;26012;27875;30258;31666;32307;34864;35693;35694;39695;39754;41176 355 396 -1
YJL034W YJL034W 39 35 35 YJL034W pep chromosome:R64-1-1:X:381327:383375:1 gene:YJL034W transcript:YJL034W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:KAR2 description:ATPase involved in protein import into the ER; also acts as a chaperone to medi 1 39 35 35 24 24 23 27 24 24 23 22 20 25 23 21 23 22 20 25 23 21 51 48.7 48.7 74.467 682 682 0 310.64 42.5 32.4 39.4 37.5 37.4 39.7 3832700000 691940000 471390000 1174200000 479990000 347210000 668010000 789470000 884760000 914080000 798590000 1024400000 899230000 30 28 28 32 32 22 172 725 405;406;559;1068;1152;1354;1356;1478;2211;3538;3614;3615;3893;4748;4749;5364;5953;6803;6804;6984;7151;7491;7618;7826;7827;7900;8087;8465;8869;9495;10018;10851;10980;11306;11307;11308;11455;11456;11578 True;True;True;False;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 430;431;590;591;1116;1203;1412;1414;1538;2293;3675;3757;3758;4051;4947;4948;5592;6204;7087;7088;7089;7273;7469;7867;7998;8225;8226;8300;8494;8887;9305;9961;9962;10508;11371;11505;11506;11843;11844;11845;11994;11995;12124 1767;1768;1769;1770;1771;1772;1773;1774;1775;1776;1777;1778;1779;1780;1781;1782;1783;1784;1785;1786;1787;2432;2433;2434;2435;2436;2437;4418;4419;4420;4421;4422;4423;4424;4699;5449;5450;5453;5894;5895;5896;5897;5898;5899;8446;8447;8448;13478;13479;13480;13481;13482;13796;13797;13798;13799;14820;14821;14822;14823;14824;14825;14826;18074;18075;18076;18077;18078;18079;18080;18081;18082;18083;20551;20552;20553;22851;22852;22853;25997;25998;25999;26000;26001;26002;26003;26004;26005;26006;26007;26008;26009;26700;26701;27343;27344;27345;27346;28778;28779;28780;28781;28782;29225;29226;29227;29228;29229;29230;30072;30073;30074;30075;30076;30077;30078;30079;30080;30081;30082;30302;31000;32275;33826;33827;36399;36400;36401;36402;36403;36404;36405;36406;36407;36408;36409;36410;36411;36412;38404;41743;41744;41745;41746;41747;42256;42257;42258;42259;42260;42261;43598;43599;43600;43601;43602;43603;43604;43605;43606;43607;43608;43609;43610;43611;43612;44238;44239;44240;44241;44242;44243;44244;44245;44246;44247;44248;44249;44736;44737;44738;44739;44740;44741 1773;1774;1775;1776;1777;1778;1779;1780;1781;1782;1783;1784;1785;1786;1787;1788;1789;1790;1791;1792;1793;2439;2440;2441;2442;2443;2444;4443;4444;4445;4446;4447;4448;4449;4725;5484;5485;5488;5929;5930;5931;5932;5933;5934;8489;8490;8491;13567;13568;13569;13570;13571;13887;13888;13889;13890;14923;14924;14925;14926;14927;14928;14929;14930;18190;18191;18192;18193;18194;18195;18196;18197;18198;18199;20678;20679;20680;22986;22987;22988;26154;26155;26156;26157;26158;26159;26160;26161;26162;26163;26164;26165;26166;26861;26862;27511;27512;27513;27514;28958;28959;28960;28961;28962;29408;29409;29410;29411;29412;29413;30260;30261;30262;30263;30264;30265;30266;30267;30268;30269;30270;30491;31192;32471;34027;34028;36612;36613;36614;36615;36616;36617;36618;36619;36620;36621;36622;36623;36624;36625;36626;38636;42006;42007;42008;42009;42010;42551;42552;42553;42554;42555;42556;43897;43898;43899;43900;43901;43902;43903;43904;43905;43906;43907;43908;43909;43910;43911;44543;44544;44545;44546;44547;44548;44549;44550;44551;44552;44553;44554;45042;45043;45044;45045;45046;45047 1778;1784;2442;4445;4725;5484;5488;5931;8490;13569;13888;13889;14925;18193;18199;20678;22987;26154;26158;26861;27512;28960;29409;30261;30269;30491;31192;32471;34027;36612;38636;42010;42554;43898;43904;43909;44544;44551;45044 356;357;358;359 168;323;482;561 -1
YJL039C YJL039C 1 1 1 YJL039C pep chromosome:R64-1-1:X:368748:373799:-1 gene:YJL039C transcript:YJL039C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NUP192 description:Essential subunit of inner ring of nuclear pore complex (NPC); plays a role 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 191.53 1683 1683 0 6.3896 0 0 1 0 0 0 6454200 0 0 6454200 0 0 0 0 0 3803100 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 726 11574 True 12120 44724 45030 45030 -1
YJL050W YJL050W 22 22 22 YJL050W pep chromosome:R64-1-1:X:342522:345743:1 gene:YJL050W transcript:YJL050W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MTR4 description:ATP-dependent 3-5 RNA helicase of the DExD/H family; involved in nuclear RNA 1 22 22 22 15 10 8 14 10 10 15 10 8 14 10 10 15 10 8 14 10 10 26.2 26.2 26.2 122.05 1073 1073 0 113.4 18.7 12.6 11.5 16.1 12.4 11.6 568020000 159790000 57441000 183340000 69278000 29119000 69049000 149000000 142880000 123860000 123340000 116090000 94018000 16 11 8 16 10 10 71 727 592;1366;3172;3541;3564;3977;4617;4618;5103;5615;5680;5805;6086;6721;7265;7311;8435;8493;9014;10739;11708;11709 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 624;1424;3285;3678;3702;4137;4813;4814;5313;5852;5920;6048;6337;7001;7615;7675;8856;8916;9457;11253;12264;12265 2547;5483;5484;11991;11992;11993;13490;13491;13580;15123;15124;15125;15126;15127;15128;17594;17595;17596;17597;17598;17599;17600;17601;19500;19501;21569;21795;21796;22249;22250;22251;22252;22253;22254;23361;23362;23363;23364;23365;23366;25633;25634;25635;25636;25637;25638;27844;28047;28048;32162;32163;32164;32377;34502;34503;34504;41271;41272;41273;41274;45320;45321;45322;45323;45324;45325;45326;45327;45328;45329 2554;5518;5519;12076;12077;12078;13579;13580;13669;15230;15231;15232;15233;15234;15235;17709;17710;17711;17712;17713;17714;17715;17716;19623;19624;21696;21924;21925;21926;22380;22381;22382;22383;22384;22385;23498;23499;23500;23501;23502;23503;25787;25788;25789;25790;25791;25792;28017;28221;28222;32358;32359;32360;32573;34709;34710;34711;41525;41526;41527;41528;45633;45634;45635;45636;45637;45638;45639;45640;45641;45642 2554;5519;12076;13579;13669;15234;17711;17716;19624;21696;21924;22380;23501;25789;28017;28222;32359;32573;34711;41528;45634;45641 -1
YJL052W YJL052W 20 4 4 YJL052W pep chromosome:R64-1-1:X:338271:339269:1 gene:YJL052W transcript:YJL052W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TDH1 description:Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), isozyme 1; involved in glycol 1 20 4 4 16 12 16 13 16 9 4 0 3 0 2 2 4 0 3 0 2 2 50.3 15.1 15.1 35.75 332 332 0 11.783 47.9 33.1 48.2 37.7 47 38.3 149160000 21451000 0 104950000 0 4562300 18201000 23144000 0 52416000 0 28134000 19449000 4 0 3 0 2 2 11 728 1819;1820;1821;3550;3551;3793;3794;4845;5415;6773;6774;9951;10679;10680;11126;11298;11429;11635;11664;11927 False;False;False;False;False;False;True;False;True;False;False;False;False;False;False;False;False;True;True;False 1888;1889;1890;3688;3689;3943;3944;5048;5644;7054;7055;7056;7057;10440;11190;11191;11658;11659;11660;11835;11966;12184;12213;12490 7144;7145;7146;7147;7148;7149;7150;7151;7152;13533;13534;13535;13536;13537;13538;13539;13540;14410;14411;14412;14413;14414;14415;14416;14417;14418;18411;18412;18413;18414;18415;18416;18417;18418;18419;18420;18421;18422;20786;25877;25878;25879;25880;25881;25882;25883;25884;25885;25886;25887;25888;25889;25890;25891;38200;38201;38202;38203;38204;38205;38206;38207;38208;38209;40900;40901;40902;40903;40904;40905;40906;40907;40908;40909;40910;40911;40912;40913;42846;42847;42848;42849;42850;42851;42852;42853;42854;42855;42856;42857;42858;42859;42860;42861;42862;43570;43571;43572;44136;44137;44138;44139;44140;44141;44142;44143;44144;44145;44146;44961;44962;44963;45098;45099;45100;45101;46147;46148;46149;46150 7184;7185;7186;7187;7188;7189;7190;7191;7192;13622;13623;13624;13625;13626;13627;13628;13629;14509;14510;14511;14512;14513;14514;14515;14516;14517;18528;18529;18530;18531;18532;18533;18534;18535;18536;18537;18538;18539;18540;20913;26034;26035;26036;26037;26038;26039;26040;26041;26042;26043;26044;26045;26046;26047;26048;38432;38433;38434;38435;38436;38437;38438;38439;38440;38441;41147;41148;41149;41150;41151;41152;41153;41154;41155;41156;41157;41158;41159;41160;43143;43144;43145;43146;43147;43148;43149;43150;43151;43152;43153;43154;43155;43156;43157;43158;43159;43869;43870;43871;44435;44436;44437;44438;44439;44440;44441;44442;44443;44444;44445;44446;44447;44448;44449;44450;45269;45270;45271;45409;45410;45411;45412;46464;46465;46466;46467 7184;7186;7191;13626;13629;14512;14516;18533;20913;26037;26046;38434;41147;41156;43146;43871;44449;45271;45411;46467 360;361;362 173;179;229 -1
YJL063C YJL063C 2 2 2 YJL063C pep chromosome:R64-1-1:X:315759:316475:-1 gene:YJL063C transcript:YJL063C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL8 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit [Source:SGD;Acc:S0000035 1 2 2 2 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 9.2 9.2 9.2 26.945 238 238 0 19.124 0 3.4 0 0 0 5.9 8856100 0 1349700 0 0 0 7506400 0 0 0 0 0 7506400 0 1 0 0 0 1 2 729 389;5758 True;True 414;5999 1701;22042 1705;22172 1705;22172 -1
YJL069C YJL069C 7 7 7 YJL069C pep chromosome:R64-1-1:X:310922:312706:-1 gene:YJL069C transcript:YJL069C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP18 description:Small-subunit processome protein involved in pre-18S rRNA maturation; part of 1 7 7 7 5 5 6 5 5 5 5 5 6 5 5 5 5 5 6 5 5 5 20.2 20.2 20.2 66.423 594 594 0 58.584 14 13.3 16.7 13.5 13.5 13.5 285210000 44432000 28184000 109430000 26320000 18677000 58170000 57306000 66165000 49599000 54938000 72564000 57148000 5 5 6 5 5 5 31 730 2721;4375;4436;4564;6877;11608;12179 True;True;True;True;True;True;True 2815;4554;4623;4760;7165;12157;12745;12746 10272;10273;10274;10275;10276;10277;16608;16609;16610;16611;16612;16863;16864;16865;16866;16867;16868;17418;17419;17420;17421;17422;26281;26282;26283;26284;44872;44873;47136;47137;47138 10326;10327;10328;10329;10330;10331;16718;16719;16720;16721;16722;16976;16977;16978;16979;16980;16981;17533;17534;17535;17536;17537;26439;26440;26441;26442;45180;45181;47463;47464;47465 10329;16721;16978;17537;26439;45180;47465 363 321 -1
YJL074C YJL074C 69 69 69 YJL074C pep chromosome:R64-1-1:X:299157:302849:-1 gene:YJL074C transcript:YJL074C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SMC3 description:Subunit of the multiprotein cohesin complex; required for sister chromatid coh 1 69 69 69 2 2 1 53 56 42 2 2 1 53 56 42 2 2 1 53 56 42 57.1 57.1 57.1 141.33 1230 1230 0 323.31 2.3 2.3 1.4 46 46.6 41.5 3914400000 11085000 4429900 8351000 1141100000 1106400000 1643000000 34337000 23613000 0 427070000 4728700000 2377000000 2 2 1 64 70 47 186 731 778;1715;1724;1744;1824;1866;1906;2734;2846;2847;3257;3316;3578;3856;3857;4206;4220;4286;4287;4571;4676;4695;4771;4910;4911;5142;5220;5288;5395;5617;5618;5984;5985;6008;6079;6350;6351;6359;6360;6386;6441;6442;6531;6534;6560;6581;6626;6628;6629;6663;6664;6719;6796;7166;7243;7645;7646;7970;7988;8452;9181;9379;10001;10703;10769;11353;11493;11518;12247 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 819;1782;1791;1811;1893;1937;1978;1979;2828;2946;2947;3374;3437;3720;4013;4014;4378;4393;4462;4463;4767;4873;4892;4971;5115;5116;5117;5354;5438;5509;5623;5854;5855;6235;6236;6259;6330;6615;6616;6624;6625;6626;6652;6711;6712;6807;6810;6836;6858;6903;6904;6906;6907;6941;6942;6999;7080;7492;7493;7590;8026;8027;8373;8374;8392;8874;9631;9840;10490;11214;11285;11890;12034;12060;12817;12818 3244;3245;3246;3247;3248;6813;6814;6815;6816;6849;6850;6900;7160;7276;7377;7378;7379;10331;10332;10801;10802;10803;12332;12333;12334;12571;12572;13634;13635;14679;14680;14681;14682;14683;15988;15989;15990;16029;16030;16031;16292;16293;16294;16295;16296;16297;16298;16299;16300;16301;17440;17441;17442;17443;17444;17772;17837;17838;17839;18169;18707;18708;18709;18710;18711;18712;19631;19971;19972;19973;20196;20665;20666;21574;21575;21576;22948;22949;22950;22951;22952;22953;22954;22955;23041;23042;23336;23337;23338;24254;24255;24256;24257;24258;24279;24280;24281;24282;24283;24284;24381;24382;24383;24634;24635;24636;24637;24638;24915;24916;24917;24929;24930;24931;24932;25052;25053;25054;25055;25056;25057;25058;25059;25060;25140;25141;25142;25143;25144;25308;25309;25310;25311;25314;25315;25316;25317;25318;25319;25424;25425;25426;25427;25428;25629;25630;25631;25978;25979;25980;27433;27434;27435;27436;27758;29303;29304;29305;29306;29307;29308;29309;30567;30568;30645;30646;32224;32225;35156;35157;35158;35969;38351;38352;38353;41024;41025;41426;41427;43796;43797;44402;44403;44487;47367;47368;47369;47370 3255;3256;3257;3258;3259;6853;6854;6855;6856;6889;6890;6940;7200;7317;7418;7419;7420;10389;10390;10869;10870;10871;12417;12418;12419;12657;12658;13723;13724;14781;14782;14783;14784;14785;16097;16098;16099;16138;16139;16140;16401;16402;16403;16404;16405;16406;16407;16408;16409;16410;17555;17556;17557;17558;17559;17887;17952;17953;17954;18286;18828;18829;18830;18831;18832;18833;19754;20095;20096;20097;20320;20792;20793;21701;21702;21703;23083;23084;23085;23086;23087;23088;23089;23090;23176;23177;23473;23474;23475;24402;24403;24404;24405;24406;24427;24428;24429;24430;24431;24432;24529;24530;24531;24783;24784;24785;24786;24787;25065;25066;25067;25079;25080;25081;25082;25202;25203;25204;25205;25206;25207;25208;25209;25210;25290;25291;25292;25293;25294;25462;25463;25464;25465;25468;25469;25470;25471;25472;25473;25578;25579;25580;25581;25582;25783;25784;25785;26135;26136;26137;27602;27603;27604;27605;27931;29486;29487;29488;29489;29490;29491;29492;30757;30758;30835;30836;32420;32421;35364;35365;35366;36180;38583;38584;38585;41271;41272;41686;41687;44095;44096;44708;44709;44793;47697;47698;47699;47700 3256;6854;6890;6940;7200;7317;7418;10390;10869;10871;12418;12657;13724;14782;14785;16099;16138;16404;16410;17558;17887;17953;18286;18829;18832;19754;20095;20320;20792;21701;21703;23085;23090;23177;23474;24403;24405;24428;24431;24531;24785;24786;25066;25082;25208;25294;25462;25470;25472;25579;25582;25785;26136;27605;27931;29487;29492;30757;30836;32420;35365;36180;38585;41272;41686;44096;44709;44793;47699 364;365;366;367;368;369;370;371;372;373 131;139;200;210;246;273;368;511;855;984 -1
YJL076W YJL076W 31 31 31 YJL076W pep chromosome:R64-1-1:X:295245:298814:1 gene:YJL076W transcript:YJL076W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:NET1 description:Core subunit of the RENT complex; involved in nucleolar silencing and telophase 1 31 31 31 24 7 10 9 7 8 24 7 10 9 7 8 24 7 10 9 7 8 33.8 33.8 33.8 128.53 1189 1189 0 157.73 27.6 9.5 11.9 11.3 8.2 11.7 619770000 208160000 21530000 268900000 25223000 20562000 75387000 220450000 81134000 110650000 66919000 97580000 89745000 27 8 10 8 7 8 68 732 66;1220;1676;2447;3342;4418;4611;4616;4836;4837;5293;5391;6294;7121;7269;7747;8035;8304;8570;8642;8707;8712;8740;8912;9155;9474;9519;9604;10460;11119;11589 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 68;1271;1741;2532;3464;4605;4807;4812;5038;5039;5514;5619;6554;7432;7433;7621;8143;8440;8721;8994;9066;9133;9139;9168;9348;9605;9940;9987;10073;10967;11650;12135 267;268;269;4930;6608;6609;9277;9278;9279;9280;12651;12652;16790;16791;17581;17593;18375;18376;18377;18378;18379;20221;20222;20223;20224;20652;24084;27213;27214;27215;27216;27217;27218;27219;27220;27855;29804;30815;31727;32687;32921;33200;33228;33229;33230;33231;33232;33348;33977;35061;35062;35063;35064;36336;36337;36513;36514;36788;36789;36790;36791;36792;40075;40076;42804;42805;42806;42807;44782 268;269;270;4956;6644;6645;9324;9325;9326;9327;12737;12738;16902;16903;17696;17708;18492;18493;18494;18495;18496;20345;20346;20347;20348;20779;24229;27376;27377;27378;27379;27380;27381;27382;27383;28028;29990;29991;31007;31923;32884;33118;33399;33427;33428;33429;33430;33431;33548;34179;35269;35270;35271;35272;36549;36550;36729;36730;37007;37008;37009;37010;37011;40313;40314;43099;43100;43101;43102;45088 269;4956;6645;9326;12737;16903;17696;17708;18495;18496;20347;20779;24229;27383;28028;29990;31007;31923;32884;33118;33399;33431;33548;34179;35270;36550;36729;37007;40313;43099;45088 374 624 -1
YJL080C YJL080C 87 87 87 YJL080C pep chromosome:R64-1-1:X:285558:289226:-1 gene:YJL080C transcript:YJL080C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SCP160 description:Essential RNA-binding G protein effector of mating response pathway; ligand- 1 87 87 87 62 48 55 54 59 42 62 48 55 54 59 42 62 48 55 54 59 42 65.7 65.7 65.7 134.81 1222 1222 0 323.31 55.1 45.9 52 50 52.4 39 7459700000 1546500000 641700000 2667500000 740590000 570920000 1292400000 1868700000 1658600000 1513200000 1507800000 1650200000 1432600000 69 54 61 64 65 47 360 733 62;149;227;514;618;668;686;687;798;1254;1255;1319;1348;1529;1745;1851;1923;2522;2523;2560;2668;3113;3318;3953;4241;4343;4344;4658;4728;4729;4810;5054;5055;5118;5223;5246;5270;5300;5412;5413;5425;5556;5557;5558;5904;5905;5991;6782;6945;7044;7273;7282;7473;7474;7517;7674;8243;8244;8491;8626;8627;8756;8940;9110;9156;9160;9774;9879;10070;10071;10174;10267;10274;10573;10574;10695;10753;10858;10932;10998;11358;11550;12106;12222;12223;12224;12225 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 64;156;238;543;653;706;726;727;839;1305;1306;1374;1406;1589;1812;1920;1996;2610;2611;2649;2762;3223;3439;4113;4414;4521;4522;4855;4925;4926;5011;5264;5265;5328;5441;5466;5491;5522;5641;5642;5658;5793;5794;5795;6151;6152;6242;7065;7233;7339;7626;7627;7642;7643;7848;7849;7895;8056;8057;8658;8659;8914;9050;9051;9185;9380;9556;9606;9610;10250;10362;10562;10563;10670;10765;10766;10773;11081;11082;11206;11268;11378;11455;11524;11895;12092;12093;12669;12792;12793;12794;12795 253;254;255;256;257;258;259;657;658;659;660;975;976;977;2211;2212;2213;2214;2624;2625;2626;2627;2628;2792;2793;2794;2795;2796;2856;2857;2858;2859;2860;2861;2862;2863;2864;2865;2866;3318;3319;3320;3321;5039;5040;5041;5042;5043;5044;5045;5046;5047;5048;5049;5050;5288;5289;5290;5291;5292;5293;5414;5415;5416;5417;5418;6080;6081;6082;6083;6084;6901;6902;7229;7230;7231;7232;7418;9492;9493;9494;9495;9496;9497;9498;9499;9500;9656;9657;9658;9659;9660;10061;10062;11785;11786;11787;11788;11789;11790;11791;11792;11793;11794;12574;12575;12576;12577;15054;15055;15056;15057;15058;15059;16113;16114;16115;16116;16117;16118;16119;16120;16121;16482;16483;16484;16485;16486;16487;16488;16489;16490;16491;17738;17739;17740;17741;17973;17974;17975;17976;17977;17978;17979;17980;17981;18283;18284;18285;18286;18287;18288;19266;19267;19268;19269;19270;19271;19272;19273;19274;19543;19544;19977;19978;19979;19980;19981;19982;20067;20068;20069;20070;20129;20130;20131;20132;20133;20134;20135;20242;20773;20774;20775;20859;21366;21367;21368;21369;21370;22628;22629;22630;22631;22632;22633;22634;22635;22978;22979;22980;22981;22982;22983;25906;25907;25908;25909;26577;26578;26909;26910;26911;27875;27876;27877;27948;27949;27950;27951;28708;28709;28710;28711;28712;28713;28714;28884;28885;28886;28887;28888;29399;29400;29401;31514;31515;31516;31517;31518;32368;32369;32370;32371;32372;32850;32851;32852;32853;32854;32855;32856;32857;32858;32859;33419;34087;34088;34089;34090;34091;34092;34837;34838;34839;34840;34841;34842;34843;34844;34845;34846;35065;35077;37437;37438;37439;37440;37441;37918;37919;37920;37921;37922;37923;38611;38612;38613;38614;38615;39039;39040;39397;39398;39399;39400;39401;39402;39403;39404;39425;40498;40499;40500;40501;40502;40503;40504;40980;40981;40982;40983;40984;40985;40986;41355;41356;41357;41358;41359;41360;41771;41772;41773;42004;42005;42317;42318;42319;42320;42321;42322;43826;43827;43828;43829;43830;44597;44598;44599;44600;44601;44602;44603;44604;44605;44606;46876;47292;47293;47294;47295;47296;47297;47298;47299;47300;47301;47302;47303;47304;47305;47306;47307 254;255;256;257;258;259;260;658;659;660;661;977;978;979;2217;2218;2219;2220;2631;2632;2633;2634;2635;2801;2802;2803;2804;2805;2866;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;2874;2875;2876;3330;3331;3332;3333;5067;5068;5069;5070;5071;5072;5073;5074;5075;5076;5077;5078;5319;5320;5321;5322;5323;5324;5449;5450;5451;5452;5453;6116;6117;6118;6119;6120;6941;6942;7269;7270;7271;7272;7459;9540;9541;9542;9543;9544;9545;9546;9547;9548;9706;9707;9708;9709;9710;10114;10115;11868;11869;11870;11871;11872;11873;11874;11875;11876;11877;12660;12661;12662;12663;15160;15161;15162;15163;15164;15165;15166;16222;16223;16224;16225;16226;16227;16228;16229;16230;16592;16593;16594;16595;16596;16597;16598;16599;16600;16601;17853;17854;17855;17856;18089;18090;18091;18092;18093;18094;18095;18096;18097;18400;18401;18402;18403;18404;18405;19389;19390;19391;19392;19393;19394;19395;19396;19397;19666;19667;20101;20102;20103;20104;20105;20106;20191;20192;20193;20194;20253;20254;20255;20256;20257;20258;20259;20366;20900;20901;20902;20986;21493;21494;21495;21496;21497;22763;22764;22765;22766;22767;22768;22769;22770;23113;23114;23115;23116;23117;23118;26063;26064;26065;26066;26737;26738;27071;27072;27073;28048;28049;28050;28122;28123;28124;28125;28888;28889;28890;28891;28892;28893;28894;29065;29066;29067;29068;29069;29583;29584;29585;31710;31711;31712;31713;31714;32564;32565;32566;32567;32568;33047;33048;33049;33050;33051;33052;33053;33054;33055;33056;33619;34292;34293;34294;34295;34296;34297;35045;35046;35047;35048;35049;35050;35051;35052;35053;35054;35273;35285;37659;37660;37661;37662;37663;38148;38149;38150;38151;38152;38153;38844;38845;38846;38847;38848;39274;39275;39633;39634;39635;39636;39637;39638;39639;39640;39661;40741;40742;40743;40744;40745;40746;40747;41227;41228;41229;41230;41231;41232;41233;41615;41616;41617;41618;41619;41620;42034;42035;42036;42268;42269;42612;42613;42614;42615;42616;42617;44125;44126;44127;44128;44129;44903;44904;44905;44906;44907;44908;44909;44910;44911;44912;47202;47621;47622;47623;47624;47625;47626;47627;47628;47629;47630;47631;47632;47633;47634;47635;47636 258;658;977;2220;2635;2805;2869;2874;3332;5068;5073;5321;5453;6120;6942;7271;7459;9542;9548;9708;10114;11871;12663;15162;16223;16593;16597;17854;18089;18093;18401;19393;19397;19666;20106;20191;20256;20366;20900;20902;20986;21493;21495;21497;22766;22770;23116;26065;26737;27073;28048;28125;28891;28894;29067;29584;31710;31714;32567;33047;33053;33619;34292;35051;35273;35285;37662;38148;38845;38847;39275;39640;39661;40741;40746;41230;41619;42034;42268;42614;44129;44910;47202;47622;47626;47629;47636 375;376;377;378;379 78;412;637;785;1098 -1
YJL085W YJL085W 2 2 2 YJL085W pep chromosome:R64-1-1:X:272827:274698:1 gene:YJL085W transcript:YJL085W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:EXO70 description:Subunit of the exocyst complex; the exocyst mediates polarized targeting and t 1 2 2 2 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 4.2 4.2 4.2 71.293 623 623 0.00084104 3.2628 0 1.8 0 2.4 0 0 1402500 0 779780 0 622710 0 0 0 0 0 1281000 0 0 0 0 0 1 0 0 1 734 2512;12322 True;True 2600;12895 9460;47672 9508;48004 9508;48004 -1
YJL087C YJL087C 2 2 2 YJL087C pep chromosome:R64-1-1:X:270002:272485:-1 gene:YJL087C transcript:YJL087C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:TRL1 description:tRNA ligase; required for tRNA splicing and for both splicing and translation 1 2 2 2 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 2.9 2.9 2.9 95.336 827 827 0 8.6681 1 1.9 1.9 1.9 0 0 11830000 1844100 2597500 4245200 3143100 0 0 0 0 0 6465700 0 0 1 1 1 2 0 0 5 735 2909;3118 True;True 3013;3228 11041;11807;11808;11809 11118;11890;11891;11892;11893 11118;11893 -1
YJL092W YJL092W 1 1 1 YJL092W pep chromosome:R64-1-1:X:257423:260947:1 gene:YJL092W transcript:YJL092W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:SRS2 description:DNA helicase and DNA-dependent ATPase; involved in DNA repair and checkpoint re 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.6 1.6 1.6 134.3 1174 1174 0.0022936 2.3313 0 1.6 0 0 0 0 1502400 0 1502400 0 0 0 0 0 3258800 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 736 9622 True 10093 36858 37077 37077 -1
YJL096W YJL096W 4 4 4 YJL096W pep chromosome:R64-1-1:X:246490:246975:1 gene:YJL096W transcript:YJL096W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:MRPL49 description:Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit [Source:SGD;Acc:S0000036 1 4 4 4 3 0 2 0 1 3 3 0 2 0 1 3 3 0 2 0 1 3 23.6 23.6 23.6 18.387 161 161 0 8.2001 19.3 0 14.9 0 8.7 19.3 68835000 11197000 0 29295000 0 3924800 24418000 13869000 0 21830000 0 0 20608000 2 0 2 0 1 3 8 737 4614;6679;6868;10009 True;True;True;True 4810;6959;7156;10498 17591;25480;25481;25482;26250;26251;26252;26253;38367 17706;25634;25635;25636;26408;26409;26410;26411;38599 17706;25634;26411;38599 -1
YJL109C YJL109C 26 26 26 YJL109C pep chromosome:R64-1-1:X:212000:217309:-1 gene:YJL109C transcript:YJL109C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:UTP10 description:Nucleolar protein; component of the small subunit (SSU) processome containing 1 26 26 26 15 8 13 14 12 16 15 8 13 14 12 16 15 8 13 14 12 16 18.8 18.8 18.8 200.08 1769 1769 0 121.41 11.6 6.8 9.4 10.5 7 12.7 536230000 97115000 33158000 162140000 59472000 36924000 147420000 130530000 102370000 98857000 116470000 120870000 117070000 15 7 12 14 13 17 78 738 339;465;4369;4687;5222;6022;6107;6237;7983;8281;8732;9100;9338;9465;9612;9613;9827;9893;10217;10320;10449;11318;11586;11649;11650;11867 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 357;492;4548;4884;5440;6273;6358;6495;8387;8698;9159;9546;9795;9930;10081;10082;10308;10379;10713;10820;10956;11855;12132;12198;12199;12428 1502;1503;1504;1505;2026;16581;16582;17814;19975;19976;23124;23125;23456;23890;23891;23892;23893;23894;23895;30622;30623;30624;31670;33305;33306;34812;34813;35816;35817;35818;35819;36300;36811;36812;36813;36814;36815;36816;36817;36818;36819;36820;37710;37711;37980;37981;37982;37983;37984;37985;39196;39197;39198;39199;39599;39600;39601;40044;40045;40046;40047;43642;43643;43644;43645;43646;43647;44773;44774;44775;45027;45028;45029;45030;45031;45890;45891;45892;45893 1505;1506;1507;1508;2032;16691;16692;17929;20099;20100;23260;23261;23596;24032;24033;24034;24035;24036;24037;24038;24039;24040;30812;30813;30814;31866;33505;33506;35020;35021;36024;36025;36026;36027;36513;37030;37031;37032;37033;37034;37035;37036;37037;37038;37039;37939;37940;38211;38212;38213;38214;38215;38216;39432;39433;39434;39435;39835;39836;39837;40282;40283;40284;40285;43941;43942;43943;43944;43945;43946;45079;45080;45081;45337;45338;45339;45340;45341;46206;46207;46208;46209 1508;2032;16692;17929;20099;23261;23596;24038;30814;31866;33506;35020;36025;36513;37035;37039;37940;38213;39434;39836;40284;43943;45079;45337;45338;46208 -1
YJL111W YJL111W 3 3 3 YJL111W pep chromosome:R64-1-1:X:207877:209529:1 gene:YJL111W transcript:YJL111W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:CCT7 description:Subunit of the cytosolic chaperonin Cct ring complex; related to Tcp1p, require 1 3 3 3 0 2 1 1 2 0 0 2 1 1 2 0 0 2 1 1 2 0 6.5 6.5 6.5 59.735 550 550 0 4.7448 0 4.4 2.2 1.8 4 0 20583000 0 3957300 10644000 3022900 2958400 0 0 0 0 0 9781700 0 0 1 1 1 2 0 5 739 6153;7198;10627 True;True;True 6408;7535;11135 23614;23615;23616;27576;40647;40648 23755;23756;23757;27749;40890;40891 23756;27749;40890 380 1 -1
YJL117W YJL117W 5 5 5 YJL117W pep chromosome:R64-1-1:X:192531:193466:1 gene:YJL117W transcript:YJL117W_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PHO86 description:Endoplasmic reticulum (ER) resident protein; required for ER exit of the high- 1 5 5 5 3 1 2 2 2 1 3 1 2 2 2 1 3 1 2 2 2 1 24.1 24.1 24.1 34.881 311 311 0 11.178 14.1 4.5 10.6 10 9 5.5 59831000 18595000 1244200 24084000 2546200 8492900 4869000 19221000 0 19259000 0 0 0 3 1 2 2 2 1 11 740 3507;4466;6209;7919;8955 True;True;True;True;True 3641;4657;6466;8319;9395 13339;13340;13341;13342;17008;17009;23814;30367;30368;34140;34141 13428;13429;13430;13431;17122;17123;23956;30556;30557;34346;34347 13428;17122;23956;30556;34346 -1
YJL128C YJL128C 1 1 1 YJL128C pep chromosome:R64-1-1:X:178097:180103:-1 gene:YJL128C transcript:YJL128C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PBS2 description:MAP kinase kinase of the HOG signaling pathway; activated under severe osmotic 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 3.3 3.3 3.3 72.719 668 668 0 4.2007 3.3 3.3 3.3 3.3 3.3 0 22367000 4582900 2842200 10145000 2592300 2204500 0 0 0 0 0 7288900 0 1 1 1 1 0 0 4 741 4731 True 4928 17993;17994;17995;17996;17997 18109;18110;18111;18112;18113 18109 -1
YJL130C YJL130C 72 72 71 YJL130C pep chromosome:R64-1-1:X:165723:172367:-1 gene:YJL130C transcript:YJL130C_mRNA gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:URA2 description:Bifunctional carbamoylphosphate synthetase/aspartate transcarbamylase; catalyz 1 72 72 71 38 34 48 42 32 52 38 34 48 42 32 52 37 33 47 41 31 51 39.8 39.8 39.3 245.04 2214 2214 0 323.31 23.3 22.8 28.8 26.4 19.7 30.4 3805300000 446930000 319660000 1565600000 348300000 150140000 974680000 658830000 744420000 849600000 728260000 586560000 819620000 39 38 49 42 35 54 257 742 249;359;504;860;1067;1166;1342;1427;1511;1686;1713;1723;1891;1892;1930;2420;2421;2530;2624;2985;2990;3088;3559;3665;4240;4314;4684;4726;4833;4948;5065;5575;5838;6052;6210;6240;6463;6690;7161;7378;7379;7592;7593;7616;8249;8677;8767;9094;9471;9472;9789;9896;9978;10012;10040;10218;10235;10281;10938;11245;11362;11510;11541;11554;11555;11659;11713;11735;11814;12050;12297;12324 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 260;378;533;903;1115;1217;1399;1486;1571;1751;1780;1790;1962;1963;2003;2505;2506;2618;2718;3091;3096;3197;3697;3811;4413;4491;4881;4923;5035;5154;5275;5812;6082;6303;6467;6498;6735;6970;7487;7746;7747;7971;7972;7996;8664;9102;9198;9540;9937;9938;10270;10382;10467;10502;10531;10714;10731;10780;11462;11782;11899;12052;12083;12097;12098;12208;12269;12292;12373;12613;12870;12897 1091;1092;1093;1094;1095;1096;1097;1590;2150;2151;2152;3579;3580;3581;3582;3583;3584;4416;4417;4753;4754;4755;4756;4757;5387;5697;5698;5699;6012;6639;6805;6848;7339;7340;7341;7342;7343;7344;7345;7346;7347;7348;7349;7350;7425;7426;7427;7428;9196;9197;9198;9199;9200;9201;9202;9203;9524;9525;9526;9527;9528;9529;9905;9906;9907;9908;9909;11281;11282;11311;11669;11670;11671;11672;11673;11674;13571;13572;13573;13574;13953;16111;16112;16384;16385;16386;16387;17801;17802;17961;17962;17963;17964;17965;17966;18369;18370;18371;18372;18823;19326;19327;19328;19329;19330;19331;21427;21428;21429;21430;22371;22372;22373;22374;22375;22376;23210;23211;23212;23213;23214;23815;23816;23898;24706;24707;24708;25530;25531;25532;25533;27420;27421;27422;27423;27424;28320;28321;28322;28323;28324;29132;29133;29134;29135;29217;29218;31538;31539;31540;33073;33074;33075;33076;33077;33078;33079;33080;33081;33082;33083;33084;33455;33456;34792;34793;34794;34795;34796;34797;36327;36328;36329;36330;36331;36332;36333;36334;37549;37550;37551;37552;37995;37996;37997;37998;37999;38281;38389;38390;38391;38477;38478;38479;38480;39200;39201;