updating a json array via jq

input.json

{ "arr" : [
    { "id": 3, "bar": "x", "fum": 3.14 },
    { "id": 77, "bar": "y", "fum": 0 },
    { "id": 9, "bar": "z", "fum": -1 }
  ]
}

output.json

{
  "arr": [
    {
      "id": 3,
      "bar": "q",
      "fum": 3.14
    },
    {
      "id": 77,
      "bar": "w",
      "fum": 0,
      "foo": "555"
    },
    {
      "id": 9,
      "bar": "z",
      "fum": -1
    }
  ]
}

process.sh

#!/bin/bash

cp input.json tmp.json

while read -r LINE;
do
  IFS=", " read -ra ADDR <<< $LINE
  jq --arg id ${ADDR[0]} --arg bar "${ADDR[1]}" --arg foo "${ADDR[2]}" \
  '.arr | map(if .id == ($id | tonumber) then .bar = $bar else . end) | if $foo != "" then map(if .id == ($id | tonumber) then .foo = $foo else . end) else . end | {"arr": .}' tmp.json > tmp2.json
  mv tmp2.json tmp.json
done <updates
mv tmp.json output.json

updates

77, w, 555
3, q