module.js

(function (global) {
    
    "use strict";
    
    var $ = global.jQuery,
        module = YOUR_NAMESPACE.namespace('other.module');
        
    (function () {
       
       function hidden_function() {
           do_something();
           return;
       }
       
       function public_function() {
           hidden_function();
           return;
       }
       
       module.public_function = public_function;
       
    }());
    
}(this));

namespace.js

(function (global) {

    "use strict";

    // Глобальное пространство имен приложения
    var YOUR_NAMESPACE = global.YOUR_NAMESPACE || {};

    // Инициализация пространства имен
    YOUR_NAMESPACE.namespace = function (ns_string) {
        var parts = ns_string.split('.'),
            parent = YOUR_NAMESPACE,
            i;

        if (parts[0] === ' YOUR_NAMESPACE') {
            parts = parts.slice(1);
        }

        for (i = 0; i < parts.length; i += 1) {
            if (parent[parts[i]] === undefined) {
                parent[parts[i]] = {};
            }
            parent = parent[parts[i]];
        }

        return parent;
    };

    global.YOUR_NAMESPACE = YOUR_NAMESPACE;

}(this));