Here is a list of large Germany companies and organizations that operate a PKI and S/MIME infrastructure to send and receive encrypted mail. Pages may be in German.
(über die Bundestag.de CA)
Die Linke — Bundestagsfraktion, https://www.linksfraktion.de/kontakt/
VW
http://certdist.volkswagen.de
Siemens
http://www.siemens.com/corp/de/index/digital_id.htm
BASF
https://www.basf.com/en/products-and-industries/secure-e-mail.html
Bayer
http://pki.bayer.info/smime_en_index.htm
Commerzbank
http://ca.commerzbank.com/index.en.html
Allianz
http://rootca.allianz.com/en/index.htm
Deutsche Bank
https://www.db.com/securemail/en/gto_secure_email.htm
Deutsche Post DHL
http://keyserver.deutschepost.de/
Lufthansa:
https://www.lhsystems.de/unternehmen/public-key-infrastructure.html
Telekom:
https://www.telesec.de/en/pks-en
E.ON
http://www.eon.com/en/info-service/services/pki.html
Merck
http://www.merckgroup.com/en/imprint/email_encryption.html
Fintech Group AG/Flatex AG (Online Broker/Bank, info@ …)
http://www.flatex.de/
Vattenfall
http://www.vattenfall.com/itsecurity/pki/index_enu.html
Oldenburgische Landesbank
IKB
http://securemail.ikb.de/en/smime-and-pgp/
Deutsche Leasing
http://www.deutsche-leasing.com/s-mime.html
WGZBank
http://www.wgzbank.de/de/wgzbank/service-informationen/kontakt/secure-mail/faq/
DMG Mori Seiki / Gildemeister
http://ag.dmgmori.com/en/89-email-encryption?l=1
PPI AG
http://www.ppi.de/impressum/mail-verschluesselung/
SüdFactoring
http://www.suedfactoring.de/de/zertifikate/
Swiss Life
http://www.swisslife-weboffice.de/funktionen/toolbar/hilfe/emailencryption.html
ADS
http://www.ads-steuer.de/kontakt/faqs/
ATG Allgäuer Treuhand GmbH
http://www.atg.de/impressum.html
IQ-NET AG
http://www.iqnet-ag.de/impressum.html
ifb AG
http://www.ifb-group.com/impressum
Goldsteig Käserei
http://www.goldsteig.de/de/info/secure-e-mail.html
Carl Zeiss
http://corporate.zeiss.com/corporate/en_de/legal%20information/cert.html#certificates
ALDI
https://www.aldi-sued.com/cert/download/information_on_secure_e-mail_communication.pdf
Gematik
http://www.gematik.de/cms/de/header_navigation/kontakt/sicherekommunikation/sicherekommunikation.jsp
ETAS
http://www.etas.com/de/regPage/germany_de/de/3744-4808
Deutscher Bundestag http://www.bundestag.de/service/kontakt/
Deutsche Bundesbank http://www.bundesbank.de/Navigation/DE/Service/Services_Banken_und_Unternehmen/PKI/pki.html
DFN https://www.pki.dfn.de/
BaFin, Bonn http://www.bafin.de/SharedDocs/Standardartikel/DE/Veroeffentlichung/Hinweise_elektronische_komm.html
Federal State Institutions
Freistaat Bayern https://www.pki.bayern.de/
(Darüber 800 Poststellen der kommunalen Verwaltung!)
Landesverwaltung Brandenburg, Steuerverwaltung, PDF http://www.bravors.brandenburg.de/sixcms/media.php/15/Amtsblatt%2029_06.pdf
Landeswohlfahrtsverband Hessen http://www.lwv-hessen.de/webcom/show_article.php/_c-466/_nr-5/i.html
Hamburg Hafenpolizei http://www.hamburg.de/portsecurity/ & http://www.hamburg.de/hafenpolizei/
Investitionsbank SH http://www.ib-sh.de/service/verschluesselte-e-mail-kommunikation-mit-der-ibsh/
PKI Info http://www.it.nrw.de/informationstechnik/Services/IT_Veroeffentlichungen/Ausgabenarchiv/ausgabe1_2001/schwerpunkte/z091200151_s3.pdf
Landesbetrieb fuer Statistik und Kommunikationstechnologie, Niedersachsen
Stadt Zwickau http://www.zwickau.de/de/service/eSignatur.php?shortcut=esignatur
Stadt Iserlohn http://www.iserlohn.de/buergerservice-politik/buergerservice/umgang-mit-e-mails.html
Stadt Stuttgart http://www.stuttgart.de/item/show/173112
Stadt Bad Oyenhausen http://www.badoeynhausen.de/index.php?id=1305
Stadt Krefeld http://www.krefeld.de/C1257455004E4FBF/html/6AF5537DDFAE65CBC12576BD002BCDC2?opendocument
Stadt Paderborn https://www.paderborn.de/microsite/rathaus/poststelle/
Stadt Borgentreich http://www.borgentreich.de/impressum/showcal/1/month/9/year/2023/
Stadt Viersen http://www.viersen.de/C125704A004B545A/html/90B06F584EDCCE87C125768E0035B91C?opendocument
Stadt Hagen http://www.hagen.de/web/de/hagen05/impressum-rules.html
Stadt Hamm http://www.hamm.de/impressum/verwendung-von-emails.html
Stadt Lügde http://luegde.net/posts/18466
Stadt Coesfeld http://www.coesfeld.de/?id=1099
Stadt Verl http://www.verl.de/index.php?id=93
Stadt Lüneburg http://www.lueneburg.de/desktopdefault.aspx/tabid-135/412_read-8049/
Stadt Gütersloh http://www.guetersloh.de/Z3VldGVyc2xvaGQ0Y21zOjMwNjI3.x4s
Stadt Bottropp http://www.bottrop.de/misc/kontakt/mail-bedingungen.php
Stadt Solingen http://www2.solingen.de/www/www.nsf/html/Impressum
Stadt Frankfurt am Main
Stadtwerke Hameln https://www.stadtwerke-hameln.de/index.php/produkte/strom/netz/e-mail-zertifikate
Stadtwerke München SWM (only b2b) http://www.swm.de/privatkunden/info/datenaustausch.html
Sparkassen PKI https://www.s-trust.de/index.htm & https://localhosting.s-trust.de/SichereEmail/
EBCA (global directory of federal and commercial CAs) https://www.ebca.de/tools/zertifikate-finden/
see https://info.pca.dfn.de/ for more info!
Uni-Wuppertal Bergische Universitaet
Hochschule Anhalt (FH)
Fachhochschule Stralsund
Technische Universitaet Dresden
FernUniversitaet in Hagen
Universitaet Siegen
Universitaet Duisburg-Essen
Helmholtz-Zentrum fuer Umweltforschung GmbH
Westsaechsische Hochschule Zwickau
Technische Universitaet Chemnitz
Technische Universitaet Bergakademie Freiberg
Universitaet Wuerzburg
Universitaet Ulm
Universitaet Tuebingen
Universitaet Potsdam
Universitaet Muenster
Universitaet Karlsruhe
Universitaet Jena
Uni Hohenheim
Universitaet des Saarlandes
Universitaet der Kuenste Berlin
Universitaet der Bundeswehr Muenchen
Universitaet Bremen
Universitaet Bielefeld
Technische Universitaet Muenchen
Karlsruhe Institute of Technology
Ruhr-Universitaet Bochum
Leibniz Universitaet Hannover
Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern
Uni-Osnabrueck
Universitaet Freiburg
Universitaet Rostock
Otto-Friedrich-Universitaet Bamberg
Technische Universitaet Clausthal
Universitaet Mannheim
Hochschule Furtwangen
Hochschule Esslingen
Hochschule Biberach
Hochschule fuer angewandte Wissenschaften FH Ingolstadt
Fachhochschule Braunschweig/Wolfenbuettel
Fachhochschule Rosenheim
Fachhochschule Neu-Ulm
Fachhochschule Landshut
Fachhochschule Hannover
Ernst Moritz Arndt Universitaet Greifswald
Brandenburgische Technische Universitaet Cottbus
Leuphana Universitaet Lueneburg
Otto-von-Guericke-Universitaet Magdeburg
Technische Universitaet Dortmund
Universitaet Dortmund
Charite - Universitaetsmedizin Berlin
Fachhochschule Wiesbaden
Universitaet zu Luebeck
Universitaet Paderborn
IFW Dresden e.V
Humboldt-Universitaet zu Berlin
HS-Harz
Universitaet Bonn
Universitaet Marburg
Hochschule Wismar
Hochschule Ravensburg-Weingarten
Hochschule Magdeburg Stendal
Hochschule fuer Kuenste Bremen
Hochschule fuer Angewandte Wissenschaften Hamburg
Hochschule Darmstadt
Hochschule Bremen
Hochschule Aalen
Helmut-Schmidt-Universitaet Universitaet der Bundeswehr Hamburg
Georg-August-Universitaet Goettingen
GeoForschungsZentrum Potsdam
Fachhochschule Giessen-Friedberg
Fachhochschule Dortmund
Fachhochschule Aachen
Duale Hochschule Baden-Wuerttemberg
Campus Berlin-Buch
Max-Planck-Institut zur Erforschung von Gemeinschaftsguetern
Deutsches Elektronen-Synchrotron DESY http://dv-zeuthen.desy.de/services/mail/mail_service/
Leibniz-Rechenzentrum, München
Gesellschaft fuer wissenschaftliche Datenverarbeitung Goettingen
Fraunhofer
Forschungszentrum Juelich GmbH
Institut fuer Photonische Technologien e.V, Jena
Deutsches Zentrum fuer Luft- und Raumfahrt e.V. (DLR) http://www.kp.dlr.de/profi/ip.htm
Hahn-Meitner-Institut Berlin GmbH
Flatex.de uses S/MIME and is able/will reply encrypted if you sign our mail (StartCom Cert is fine)