mult99-1.py

import csv

# 書き込み用ファイルオープン
wf = open('mult99-1.csv', 'w')
writer = csv.writer(wf, lineterminator='\n')

# 例として 1x1 ~ 3x3 までを想定
for i in range(1, 4):
  for j in range(1, 4):
    file = '{0}x{1}.dat'.format(i, j)
    # 読み込み用ファイルオープン
    rf = open(file, 'r')
    reader = csv.reader(rf)

    list1 = []
    for row in reader:
      # 例：'N1:3\n' => ['N1', '3\n']
      list2 = row[0].split(':')
      # 改行を取り除いてリストに追加
      list1.append(list2[1].rstrip('\n'))

    # 例：['3', '2', '6']
    writer.writerow(list1)
    
    rf.close()
wf.close

実行結果

➜  ~ python mult99-1.py
➜  ~ tail mult99-1.csv
1,1,1
1,2,2
1,3,3
2,1,1
2,2,4
2,3,6
3,1,3
3,2,6
3,3,9

入力ファイル： 1x1.dat

N1:1
N2:1
ANS:1