telatin/demo.sam Secret

## demo.sam
@HD	VN:1.0	SO:unsorted
@SQ	SN:ctg01	LN:4311805
@SQ	SN:ctg02	LN:66004
@SQ	SN:ctg04	LN:1036550
@SQ	SN:ctg05	LN:256226
@SQ	SN:ctg07	LN:150530
@SQ	SN:ctg08	LN:138168
@PG	ID:bowtie2	PN:bowtie2	VN:2.3.2	CL:"bowtie2-align-s -S jb418.sam -1 r1.fastq -2 r2.fastq"
Read:1219:2200	73	ctg01	3359004	42	100M	=	3359004	0	CCTGNGTGACGAAGACCACC	DDDD#<<EHHHIIHIIIIII	AS:i:-2	XN:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:2	MD:Z:4G86A8	YT:Z:UP
Read:1219:2200	133	ctg01	3359004	0	*	=	3359004	0	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	####################	YT:Z:UP	YF:Z:NS
Read:1586:2191	83	ctg01	1869973	42	100M	=	1869729	-344	NGNNAACNNNNNNNCGNGNG	###################H	AS:i:-15	XN:i:0	XM:i:15	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:15	MD:Z:0A1A0A3C0G0A0A0A0T0C2C1G8G6G35G29	YS:i:-5	YT:Z:CP
Read:1586:2191	163	ctg01	1869729	42	100M	=	1869973	344	CGGCCAACTTACGAGAACTA	DDDDDIIIIIIIGIIIIIII	AS:i:-5	XN:i:0	XM:i:5	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:5	MD:Z:95C0G0A0A0G0	YS:i:-15	YT:Z:CP
Read:1648:2203	99	ctg08	10554	42	100M	=	10777	323	TGGTGATCTCGGTCTGATTC	DDDDDIIIHIHIIHIIIIII	AS:i:-1	XN:i:0	XM:i:1	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:1	MD:Z:91C8	YS:i:0	YT:Z:CP
Read:1648:2203	147	ctg08	10777	42	100M	=	10554	-323	GTCGAAGGAGTAGAAACCGC	HHGIIIIHIHEIIIIHIIGH	AS:i:0	XN:i:0	XM:i:0	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:0	MD:Z:100	YS:i:-1	YT:Z:CP
Read:1884:2197	81	ctg04	291365	0	10M3I65M1D22M	=	291376	108	TGNNCTTCNGATCTTCGGCA	####GE<<#EIIIIHIHHII	AS:i:-40	XN:i:0	XM:i:7	XO:i:2	XG:i:4	NM:i:11	MD:Z:0C1G0T1A0A0G0G66^T22	YS:i:-49	YT:Z:DP
Read:1884:2197	161	ctg04	291376	0	64M1D23M1D4M5I4M	=	291365	-108	TCGGCATCAACCCTGACATA	DDDDDIIIIIIIIIIIHIII	AS:i:-49	XN:i:0	XM:i:3	XO:i:3	XG:i:7	NM:i:10	MD:Z:64^T23^C0T3T0A2	YS:i:-40	YT:Z:DP
Read:2042:2220	99	ctg01	1863089	42	100M	=	1863350	360	ATCTGATGGCCGCCATGCTG	DDDDDIIIIIIIGIHHHIII	AS:i:0	XN:i:0	XM:i:0	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:0	MD:Z:100	YS:i:-8	YT:Z:CP
Read:2042:2220	147	ctg01	1863350	42	31M1I68M	=	1863089	-360	GCTACGTTGTGCGCTGGATC	HIIIGIIHIIHDIFIIIIII	AS:i:-8	XN:i:0	XM:i:0	XO:i:1	XG:i:1	NM:i:1	MD:Z:99	YS:i:0	YT:Z:CP
Read:2006:2231	83	ctg01	4120349	42	100M	=	4120241	-208	AAAGAATTTCTTTTTGATTG	IHHIIGIIIHIIHIHIHIII	AS:i:0	XN:i:0	XM:i:0	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:0	MD:Z:100	YS:i:0	YT:Z:CP
Read:2006:2231	163	ctg01	4120241	42	100M	=	4120349	208	AGGGCTGGATATGCGTCATT	DDDDCECHHII1CHHHHHHH	AS:i:0	XN:i:0	XM:i:0	XO:i:0	XG:i:0	NM:i:0	MD:Z:100	YS:i:0	YT:Z:CP
	@HD VN:1.0 SO:unsorted
	@SQ SN:ctg01 LN:4311805
	@SQ SN:ctg02 LN:66004
	@SQ SN:ctg04 LN:1036550
	@SQ SN:ctg05 LN:256226
	@SQ SN:ctg07 LN:150530
	@SQ SN:ctg08 LN:138168
	@PG ID:bowtie2 PN:bowtie2 VN:2.3.2 CL:"bowtie2-align-s -S jb418.sam -1 r1.fastq -2 r2.fastq"
	Read:1219:2200 73 ctg01 3359004 42 100M = 3359004 0 CCTGNGTGACGAAGACCACC DDDD#<<EHHHIIHIIIIII AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G86A8 YT:Z:UP
	Read:1219:2200 133 ctg01 3359004 0 * = 3359004 0 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN #################### YT:Z:UP YF:Z:NS
	Read:1586:2191 83 ctg01 1869973 42 100M = 1869729 -344 NGNNAACNNNNNNNCGNGNG ###################H AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0A1A0A3C0G0A0A0A0T0C2C1G8G6G35G29 YS:i:-5 YT:Z:CP
	Read:1586:2191 163 ctg01 1869729 42 100M = 1869973 344 CGGCCAACTTACGAGAACTA DDDDDIIIIIIIGIIIIIII AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:95C0G0A0A0G0 YS:i:-15 YT:Z:CP
	Read:1648:2203 99 ctg08 10554 42 100M = 10777 323 TGGTGATCTCGGTCTGATTC DDDDDIIIHIHIIHIIIIII AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91C8 YS:i:0 YT:Z:CP
	Read:1648:2203 147 ctg08 10777 42 100M = 10554 -323 GTCGAAGGAGTAGAAACCGC HHGIIIIHIHEIIIIHIIGH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-1 YT:Z:CP
	Read:1884:2197 81 ctg04 291365 0 10M3I65M1D22M = 291376 108 TGNNCTTCNGATCTTCGGCA ####GE<<#EIIIIHIHHII AS:i:-40 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:2 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:0C1G0T1A0A0G0G66^T22 YS:i:-49 YT:Z:DP
	Read:1884:2197 161 ctg04 291376 0 64M1D23M1D4M5I4M = 291365 -108 TCGGCATCAACCCTGACATA DDDDDIIIIIIIIIIIHIII AS:i:-49 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:3 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:64^T23^C0T3T0A2 YS:i:-40 YT:Z:DP
	Read:2042:2220 99 ctg01 1863089 42 100M = 1863350 360 ATCTGATGGCCGCCATGCTG DDDDDIIIIIIIGIHHHIII AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-8 YT:Z:CP
	Read:2042:2220 147 ctg01 1863350 42 31M1I68M = 1863089 -360 GCTACGTTGTGCGCTGGATC HIIIGIIHIIHDIFIIIIII AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:99 YS:i:0 YT:Z:CP
	Read:2006:2231 83 ctg01 4120349 42 100M = 4120241 -208 AAAGAATTTCTTTTTGATTG IHHIIGIIIHIIHIHIHIII AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:0 YT:Z:CP
	Read:2006:2231 163 ctg01 4120241 42 100M = 4120349 208 AGGGCTGGATATGCGTCATT DDDDCECHHII1CHHHHHHH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:0 YT:Z:CP