以下の設定を.git/hooks/以下のpost-checkoutファイルに書いてchmod +x post-checkoutしておけばブランチ切り替えごとにPodfileの更新があれば自動的にpod installするようになる。

post-checkout

#!/bin/sh

# parse this format
# x3de1b0 HEAD@{0}: checkout: moving from xxxx to yyyyy
BEFORE_BRANCH=`git reflog | head -1 | cut -f 6 -d ' '`
AFTER_BRANCH=`git reflog | head -1 | cut -f 8 -d ' '`
DIFF=`git diff ${BEFORE_BRANCH} ${AFTER_BRANCH} --name-only | grep Podfile`

if [ -n "${DIFF}" ]; then
  bundle exec pod install # pod install
fi