複雑なスプライトをUVスクロールしたい場合の例。textureのread/writeにチェックが入っていることが必須条件

ScrollTexture.cs

using UnityEngine;
using System.Collections;

public class ScrollTexture : MonoBehaviour
{
	public Vector2 UVDirection;

	private Texture2D tex2d;
	private Vector2 currentUVOffset = new Vector2 (0, 1);

	void Start ()
	{
	  // ①：テクスチャをロード
		Texture2D t1 = Resources.Load<Texture2D> ("Texture1");
		Texture2D t2 = Resources.Load<Texture2D> ("Texture2");

    // ②：①で取得したテクスチャが全部入る大きさのテクスチャを生成
		tex2d = new Texture2D (t1.width, t1.height + t2.height);

    // ③：②で作成したテクスチャの色を塗る
		tex2d.SetPixels (0, 0, t1.width, t1.height, t1.GetPixels ());
		tex2d.SetPixels (0, t1.height, t2.width, t2.height, t2.GetPixels ());

    // ④：①でロードしたテクスチャを破棄
		Resources.UnloadAsset (t1);
		Resources.UnloadAsset (t2);

    // ⑤：色を実際に塗る
		tex2d.Apply ();

    // ⑥：テクスチャからスプライトを生成
		var sprite = Sprite.Create (tex2d, new Rect (0, 0, tex2d.width, tex2d.height), new Vector2 (0.5f, 0.5f), 10);
		GetComponent<SpriteRenderer> ().sprite = sprite;
	}

	void OnDestroy ()
	{
		Destroy (tex2d);
	}
	
	void Update ()
	{
	  // UVでスクロール
		currentUVOffset += UVDirection * Time.deltaTime;
		renderer.material.SetTextureOffset ("_MainTex", currentUVOffset);
	}
}