AlertDialogをボタンタップ等で閉じない ref: http://qiita.com/wasnot/items/3dd9d4cf1754562fa4bd

file0.java

    AlertDialog.Builder b = new AlertDialog.Builder(activity);
    b.setTitle("タイトル");
    b.setPositiveButton(android.R.string.ok, null);

    // ここでリスナーを実装しても渡されないので実装しなくても構いません。
    b.setNegativeButton(android.R.string.cancel, null);

    // AlertDialogを生成する前にgetButton等してもnullが返されます。
    final AlertDialog dialog = b.show();

    // 種類に応じてButtonを取得します
    Button button = dialog.getButton(DialogInterface.BUTTON_NEGATIVE);
    // dialog.getButton(DialogInterface.BUTTON_POSITIVE);
    // dialog.getButton(DialogInterface.BUTTON_NEUTRAL);

    // 通常のViewのように実装します。
    button.setOnClickListener(new View.OnClickListener() {
        @Override
        public void onClick(View v) {
                ...
                // 場合によっては自分で明示的に閉じる必要がある
                dialog.dismiss();
        }
    });

file1.java

    AlertDialog.Builder b = new AlertDialog.Builder(activity);
    b.setTitle("タイトル");

    // ここでリスナーを実装しても渡されないので実装しなくても構いません。
    b.setItems(new String[]{"1","2"}, null);            

    // AlertDialogを生成する前にgetListView等してもnullが返されます。
    AlertDialog dialog = b.show();

    // ListViewを取得します
    ListView list = dialog.getListView();

    // 通常のListViewのように実装します。
    button.setOnItemClickListener(new AdapterView.OnItemClickListener() {
        @Override
        public void onItemClick(AdapterView<?> parent, View view, int position, long id) {
                ...
        }
    });