マウスでクリックしたところからScreenToRayを使わずにRayを発射する。

Ray.cs

using UnityEngine;
using System.Collections;

public class Ray : MonoBehaviour {

	// Use this for initialization
	void Start () {
	
	}
	
	// Update is called once per frame
	void Update () {
        if (Input.GetMouseButtonDown(0))
        {
            Vector3 mouse = Camera.main.ScreenToWorldPoint(Input.mousePosition);
            RaycastHit2D hit = Physics2D.Raycast(mouse, new Vector3(0, 0, 1), 100);
            
            // 可視化
            Debug.DrawRay(mouse, new Vector3(0, 0, 100), Color.blue, 1);
            
            // コンソール
            Debug.Log(hit.collider);
        }
    }
}

なぜわざわざそうしたか：
2Dのゲームを作るときに、「○○の座標にgameObjectがあるか」を調べられるようにしたかったから。
mouse変数の部分を、好きな座標にすれば、「○○の座標にgameObjectがあるか」がわかる。