This is a fork of Mike Bostock's example of a D3,js force-directed gpaph.
Each node represemts a hypothetical project ID. The values attached to the linkages between projects is the correlation multiplied by 100 and rounded to the nearest integer.
For example, a value of 35 represents a correlation of between .345 and .349
use this URL to run: https://bl.ocks.org/owendall/93e0ac09e4e436e6d01825333768e51c
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| var svg = d3.select("svg"), | |
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| height = +svg.attr("height"); | |
| var color = d3.scaleOrdinal(d3.schemeCategory20); | |
| var simulation = d3.forceSimulation() | |
| .force("link", d3.forceLink().id(function(d) { return d.id; })) | |
| .force("charge", d3.forceManyBody()) | |
| .force("center", d3.forceCenter(width / 2, height / 2)); | |
| d3.json("projects.json", function(error, graph) { | |
| if (error) throw error; | |
| var link = svg.append("g") | |
| .attr("class", "links") | |
| .selectAll("line") | |
| .data(graph.links) | |
| .enter().append("line") | |
| .attr("stroke-width", function(d) { return Math.sqrt(d.value/100); }); // 2016-07-18 OD Modified | |
| var node = svg.append("g") | |
| .attr("class", "nodes") | |
| .selectAll("circle") | |
| .data(graph.nodes) | |
| .enter().append("circle") | |
| .attr("r", 5) // 2016-07-18 OD: Change from 5 to 10 | |
| .attr("fill", function(d) { return color(d.group); }) | |
| .call(d3.drag() | |
| .on("start", dragstarted) | |
| .on("drag", dragged) | |
| .on("end", dragended)); | |
| node.append("title") | |
| .text(function(d) { return d.id; }); | |
| simulation | |
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| simulation.force("link") | |
| .links(graph.links); | |
| function ticked() { | |
| link | |
| .attr("x1", function(d) { return d.source.x; }) | |
| .attr("y1", function(d) { return d.source.y; }) | |
| .attr("x2", function(d) { return d.target.x; }) | |
| .attr("y2", function(d) { return d.target.y; }); | |
| node | |
| .attr("cx", function(d) { return d.x; }) | |
| .attr("cy", function(d) { return d.y; }); | |
| } | |
| }); | |
| function dragstarted(d) { | |
| if (!d3.event.active) simulation.alphaTarget(0.3).restart(); | |
| d.fx = d.x; | |
| d.fy = d.y; | |
| } | |
| function dragged(d) { | |
| d.fx = d3.event.x; | |
| d.fy = d3.event.y; | |
| } | |
| function dragended(d) { | |
| if (!d3.event.active) simulation.alphaTarget(0); | |
| d.fx = null; | |
| d.fy = null; | |
| } | |
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Changed data to hypothetical NIH project connections