Kozo Nishida kozo2

## rdatasets-datasets.md

      
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                heronshoes
                / rdatasets-datasets.md
            
            
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              December 4, 2022 16:31
            
              
                Dataset preview of package 'datasets' of 'Rdatasets' in red-datasets
              
          
    Package 'datasets'

[1/84] ability.cov

Ability and Intelligence Tests

name: Rdatasets: datasets: ability.cov
licenses: GPL-3

RedAmber::DataFrame : 6 x 8 Vectors
Vectors : 8 numeric

  
## smi_inchikeys.groovy
@Grab(group='org.openscience.cdk', module='cdk-bundle', version='2.5')

// Copyright (C) 2021 Egon Willighagen <0000-0001-7542-0286@orcid.org>
//
// MIT license
//
// If you use this script, please cite the CDK 2.0 article:
// https://jcheminf.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13321-017-0220-4

import org.openscience.cdk.interfaces.*;

## causalpath_total_protein_example_large_nodes.format
# COLUMNS: For entries "all-nodes and color": obj_type    all-nodes    obj_subtype    color
# COLUMNS: For entries "all-nodes and bordercolor": obj_type    all-nodes    obj_subtype    color
# COLUMNS: For entries "node and color": obj_type    node_label    obj_subtype    color
# COLUMNS: For entries "node and rppasite": obj_type    node_label    obj_subtype    subtype_info|subtype_label|subtype_bkgrd_color|subtype_border_color
# COLUMNS: For entries "node and tooltip": obj_type    node_label    obj_subtype    tooltip_information_onmousehover
# NOTE: "subtype_info" is also tooltip information for onmousehover for individual rppasite
node	all-nodes	color	255 255 255
node	all-nodes	bordercolor	50 50 50
node	FOXA1	color	40 80 255
node	FOXA1	tooltip	FOXA1, -24.349700502698532

## conda_docker.md

      
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                kokitsuyuzaki
                / conda_docker.md
            
            
              Created
              December 1, 2020 01:20
            
              
                Anacondaか、Dockerか
              
          
    この記事はWorkflow Advent Calendar 2020の二日目の記事です。
自分は最近Snakemakeでワークフローを書いている。それまではシェルスクリプト → make → Rakeという風に、色々なやり方でワークフローを書いてきてたが、環境構築・再現性や分散処理の対応がしやすいSnakemakeに現在のところは落ち着いている。Snakemakeでコードの再現性に関わる技術はAnacondaとDocker（Singularity）である。ここでは、両方の技術は一長一短であり、両技術共に痒いところに手が届かない状況があるという話しをする。なお、自分はデータ解析を生業としており、データを前処理、解析、可視化しては、使うパッケージを適宜加えたり、減らしたりする探索的データ解析（EDA）の過程でSnakemakeを使っているため、事前に処理が決まっていて、あとはワークフロー化するだけの人とは状況がかなり違っている可能性があるので注意されたし。
Anacondaのメリット

Snakemake内でのAnacondaの使い方は簡単で、Snakemakeを実行する上で必要なSnakefileの中で、実行するruleにcondaタグを追加する。condaタグの中では、conda環境を構築する上で必要な共有ライブラリやらR,Pythonのパッケージやらを記述する。
https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/snakefiles/deployment.html#integrated-package-management
あとは、snakemakeコマンドを実行する際に、--use-condaオプションを加えるだけで良い。

  
## Google Colab SSH with X11 Forwarding
#CODE

#Generate root password
import random, string
password = ''.join(random.choice(string.ascii_letters + string.digits) for i in range(20))

#Download ngrok
! wget -q -c -nc https://bin.equinox.io/c/4VmDzA7iaHb/ngrok-stable-linux-amd64.zip
! unzip -qq -n ngrok-stable-linux-amd64.zip
#Setup sshd

## colab_xface_vnc.ipynb

      
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                ahmedengu
                / colab_xface_vnc.ipynb
            
            
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              October 8, 2022 16:53
            
              
                Use google colab as a remote machine with the help of ngrok, vnc server and xface desktop you can change the configurations and desktop environment as you please it's just a start
              
          
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## helix_keyboard_build_tool_memo.md

      
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                mtei
                / helix_keyboard_build_tool_memo.md
            
            
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              August 24, 2023 08:19
            
              
                キーボード自作、特に Helix キーボードキットの製作に最低必要な工具のメモ
              
          
    Helix キーボードキットの製作に必要な工具メモ

目次


最低必要な工具

温度調整機能付きハンダゴテ
コテ台
コテ先
ハンダ
精密ピンセット


フラックス


## rust-cross-sparc64-linux-different-ld-versions.log
/home/tatsuya% docker run -it ubuntu:trusty
root@1ce8acf4991d:/# cd
root@1ce8acf4991d:~# uname -a
Linux 1ce8acf4991d 4.11.9-1-ARCH #1 SMP PREEMPT Wed Jul 5 18:23:08 CEST 2017 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
root@1ce8acf4991d:~# cat /etc/lsb-release
DISTRIB_ID=Ubuntu
DISTRIB_RELEASE=14.04
DISTRIB_CODENAME=trusty
DISTRIB_DESCRIPTION="Ubuntu 14.04.5 LTS"

## chainer-som.py
# -*- coding: utf-8 -*-

import cv2
import numpy as np
import chainer
import chainer.links as L
from chainer import Chain, Variable
from chainer import datasets

class SOM(Chain):

## LaTeX.ipynb

      
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                kaizu
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              April 28, 2017 08:41
            
          
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	@Grab(group='org.openscience.cdk', module='cdk-bundle', version='2.5')

	// Copyright (C) 2021 Egon Willighagen <0000-0001-7542-0286@orcid.org>
	//
	// MIT license
	//
	// If you use this script, please cite the CDK 2.0 article:
	// https://jcheminf.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13321-017-0220-4

	import org.openscience.cdk.interfaces.*;
	# COLUMNS: For entries "all-nodes and color": obj_type all-nodes obj_subtype color
	# COLUMNS: For entries "all-nodes and bordercolor": obj_type all-nodes obj_subtype color
	# COLUMNS: For entries "node and color": obj_type node_label obj_subtype color
	# COLUMNS: For entries "node and rppasite": obj_type node_label obj_subtype subtype_info\|subtype_label\|subtype_bkgrd_color\|subtype_border_color
	# COLUMNS: For entries "node and tooltip": obj_type node_label obj_subtype tooltip_information_onmousehover
	# NOTE: "subtype_info" is also tooltip information for onmousehover for individual rppasite
	node all-nodes color 255 255 255
	node all-nodes bordercolor 50 50 50
	node FOXA1 color 40 80 255
	node FOXA1 tooltip FOXA1, -24.349700502698532
	#CODE

	#Generate root password
	import random, string
	password = ''.join(random.choice(string.ascii_letters + string.digits) for i in range(20))

	#Download ngrok
	! wget -q -c -nc https://bin.equinox.io/c/4VmDzA7iaHb/ngrok-stable-linux-amd64.zip
	! unzip -qq -n ngrok-stable-linux-amd64.zip
	#Setup sshd
	/home/tatsuya% docker run -it ubuntu:trusty
	root@1ce8acf4991d:/# cd
	root@1ce8acf4991d:~# uname -a
	Linux 1ce8acf4991d 4.11.9-1-ARCH #1 SMP PREEMPT Wed Jul 5 18:23:08 CEST 2017 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
	root@1ce8acf4991d:~# cat /etc/lsb-release
	DISTRIB_ID=Ubuntu
	DISTRIB_RELEASE=14.04
	DISTRIB_CODENAME=trusty
	DISTRIB_DESCRIPTION="Ubuntu 14.04.5 LTS"
	# -- coding: utf-8 --

	import cv2
	import numpy as np
	import chainer
	import chainer.links as L
	from chainer import Chain, Variable
	from chainer import datasets

	class SOM(Chain):